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CLONING AND EVOLUTIONARY ANALYSIS OF HOMOLOGOUS SEQUENCES OF A NOVEL GENE ENCODING C2H2 ZINC FINGER PROTEIN IN CRUCIFERAE

十字花科植物C2H2型锌指蛋白新基因BcMF20同源序列克隆与进化分析



全 文 :摇 核 农 学 报摇 圆园员员袁圆缘渊缘冤院园怨员远 耀 园怨圆员允燥怎则灶葬造 燥枣 晕怎糟造藻葬则 粤早则蚤糟怎造贼怎则葬造 杂糟蚤藻灶糟藻泽
文章编号院员园园园鄄愿缘缘员渊圆园员员冤园缘鄄园怨员远鄄园远
十字花科植物 悦圆匀圆型锌指蛋白新基因 月糟酝云圆园
同源序列克隆与进化分析
韩莹琰员袁圆 摇 张爱红员摇 范双喜圆 摇 曹家树员
渊员郾 浙江大学蔬菜研究所袁浙江 杭州摇 猿员园园圆怨曰 圆郾 北京农学院植物科学技术学院袁北京摇 员园圆圆园远冤
摘摇 要院为获取 悦圆匀圆 型锌指蛋白基因在物种间的分类和进化关系袁分析其在基因结构上的保守性袁更好
地研究该基因在植物花粉发育中的功能袁根据白菜花粉发育相关基因 月糟酝云圆园 阅晕粤 序列设计引物袁运
用 孕悦砸技术分别从十字花科芸薹属和萝卜属 员愿 种材料中克隆了 悦圆匀圆 型锌指蛋白基因 月糟酝云圆园 的同
源序列遥 经序列比对分析袁月糟酝云圆园 同源基因在 阅晕粤 序列上的相似性为 愿远郾 怨豫 耀 员园园豫 袁所推导的氨
基酸序列相似性为 苑苑郾 远豫 耀员园园豫 袁在锌指的保守区域袁氨基酸序列完全相同遥 这些结果表明该基因具
有较好的保守性袁可能在十字花科植物的花粉发育中行使重要的功能遥
关键词院十字花科曰悦圆匀圆 锌指蛋白曰月糟酝云圆园曰克隆曰系统发育
悦蕴韵晕陨晕郧 粤晕阅 耘灾韵蕴哉栽陨韵晕粤砸再 粤晕粤蕴再杂陨杂 韵云 匀韵酝韵蕴韵郧韵哉杂 杂耘匝哉耘晕悦耘杂 韵云
粤 晕韵灾耘蕴 郧耘晕耘 耘晕悦韵阅陨晕郧 悦圆匀圆 在陨晕悦 云陨晕郧耘砸 孕砸韵栽耘陨晕 陨晕 悦砸哉悦陨云耘砸粤耘
匀粤晕 再蚤灶早鄄赠葬灶员袁 圆 摇 在匀粤晕郧 粤蚤鄄澡燥灶早员 摇 云粤晕 杂澡怎葬灶早鄄曾蚤圆 摇 悦粤韵 允蚤葬鄄泽澡怎员
渊员郾 陨灶泽贼蚤贼怎贼藻 燥枣 灾藻早藻贼葬遭造藻 杂糟蚤藻灶糟藻袁 在澡藻躁蚤葬灶早 哉灶蚤增藻则泽蚤贼赠袁 匀葬灶早扎澡燥怎袁 在澡藻躁蚤葬灶早摇 猿员园园圆怨曰
圆郾 阅藻责葬则贼皂藻灶贼 燥枣 孕造葬灶贼 杂糟蚤藻灶糟藻 葬灶凿 栽藻糟澡灶燥造燥早赠袁 哉灶蚤增藻则泽蚤贼赠 燥枣 月藻蚤躁蚤灶早 粤早则蚤糟怎造贼怎则葬造袁 月藻蚤躁蚤灶早摇 员园圆圆园远冤
粤遭泽贼则葬糟贼院陨灶 燥则凿藻则 贼燥 藻造怎糟蚤凿葬贼藻 糟葬贼藻早燥则蚤扎葬贼蚤燥灶 藻增燥造增藻皂藻灶贼 燥枣 悦圆匀圆 扎蚤灶糟 枣蚤灶早藻则 责则燥贼藻蚤灶袁 葬灶凿 糟造葬则蚤枣赠 皂藻糟澡葬灶蚤泽皂 燥灶 悦圆匀圆
扎蚤灶糟 枣蚤灶早藻则 责则燥贼藻蚤灶 蚤灶 责燥造造藻灶 凿藻增藻造燥责皂藻灶贼 葬皂燥灶早 责造葬灶贼泽 葬贼 皂燥造藻糟怎造葬则 造藻增藻造袁 贼澡藻 早藻灶藻泽 藻灶糟燥凿蚤灶早 悦圆匀圆 扎蚤灶糟 枣蚤灶早藻则 责则燥贼藻蚤灶
葬灶葬造燥早怎藻泽 枣则燥皂 员愿 泽责藻糟蚤藻泽 燥枣 早藻灶藻则葬 月则葬泽泽蚤糟葬 葬灶凿 砸葬责澡葬灶怎泽 蚤灶 悦怎糟蚤枣藻则葬藻 憎藻则藻 燥遭贼葬蚤灶藻凿 遭赠 孕悦砸 泽贼则葬贼藻早赠 怎泽蚤灶早 泽责藻糟蚤枣蚤糟
责则蚤皂藻则泽 凿藻泽蚤早灶藻凿 枣则燥皂 贼澡藻 枣怎造造 造藻灶早贼澡 燥枣 月糟酝云圆园袁 葬 责怎贼葬贼蚤增藻 早藻灶藻 藻灶糟燥凿蚤灶早 悦圆匀圆 扎蚤灶糟 枣蚤灶早藻则 责则燥贼藻蚤灶 憎澡蚤糟澡 憎葬泽 则藻造葬贼藻凿 贼燥
贼澡藻 皂葬造藻 泽贼藻则蚤造蚤贼赠援 栽澡藻 责澡赠造燥早藻灶藻贼蚤糟 则藻造葬贼蚤燥灶泽澡蚤责泽 燥枣 贼澡藻泽藻 泽责藻糟蚤藻泽 遭藻造燥灶早蚤灶早 贼燥 贼澡藻 枣葬皂蚤造赠 悦则怎糟蚤枣藻则葬藻 憎藻则藻 蚤灶增藻泽贼蚤早葬贼藻凿
贼澡则燥怎早澡 糟燥皂责葬则蚤泽燥灶 燥枣 贼澡藻 泽藻择怎藻灶糟藻泽援 匀燥皂燥造燥早燥怎泽 泽藻择怎藻灶糟藻泽 燥枣 月糟酝云圆园 糟燥皂责葬则蚤泽燥灶 蚤灶凿蚤糟葬贼藻凿 贼澡葬贼 贼澡藻 泽蚤皂蚤造葬则蚤贼蚤藻泽
葬皂燥灶早 贼澡藻 早藻灶藻泽 葬贼 灶怎糟造藻燥贼蚤凿藻 葬灶凿 葬皂蚤灶燥 葬糟蚤凿 造藻增藻造泽 憎藻则藻 愿远郾 怨豫 耀 员园园豫 葬灶凿 苑苑郾 远豫 耀 员园园豫 袁 则藻泽责藻糟贼蚤增藻造赠援 陨灶 贼澡藻
扎蚤灶糟 枣蚤灶早藻则 则藻早蚤燥灶泽 燥枣 澡燥皂燥造燥早燥怎泽 泽藻择怎藻灶糟藻泽袁 贼澡藻 葬皂蚤灶燥 葬糟蚤凿 泽藻择怎藻灶糟藻泽 憎藻则藻 蚤凿藻灶贼蚤糟葬造援 栽澡藻泽藻 则藻泽怎造贼泽 泽澡燥憎藻凿 贼澡葬贼 贼澡藻
月糟酝云圆园 憎葬泽 则藻造葬贼蚤增藻 糟燥灶泽藻则增葬贼蚤燥灶 蚤灶 藻增燥造怎贼蚤燥灶 蚤灶 悦则怎糟蚤枣藻则葬藻袁 葬灶凿 月糟酝云圆园 皂葬赠 责造葬赠 葬灶 蚤皂责燥则贼葬灶贼 则燥造藻 蚤灶 责燥造造藻灶
凿藻增藻造燥责皂藻灶贼援
运藻赠 憎燥则凿泽院悦则怎糟蚤枣藻则葬藻曰 悦圆匀圆 扎蚤灶糟 枣蚤灶早藻则 责则燥贼藻蚤灶曰 月糟酝云圆园曰 蚤泽燥造葬贼藻凿曰 责澡赠造燥早藻灶蚤糟 凿藻增藻造燥责皂藻灶贼
收稿日期院圆园员园鄄园员鄄员愿摇 接受日期院圆园员员鄄园圆鄄圆源
基金项目院国家自然科学基金渊猿园愿苑员苑员缘冤袁浙江省重大科技项目渊圆园员园悦员圆园园源冤袁北京市教委科技项目渊运酝圆园员员员园园圆园园园源冤袁北京市科技新星项目
渊圆园员园月园圆园冤
作者简介院韩莹琰渊员怨苑怨鄄冤袁女袁陕西延安人袁博士袁讲师袁研究方向为植物基因功能鉴定与调控遥 栽藻造院园员园鄄愿园苑怨怨源愿怨曰耘鄄皂葬蚤造院 澡赠赠遭葬糟岳 员圆远援 糟燥皂
通讯作者院曹家树渊员怨缘愿鄄冤袁男袁湖南芷江人袁博士生导师袁研究方向为植物基因功能鉴定与调控遥 栽藻造院园缘苑员鄄愿远怨苑员员愿愿曰耘鄄皂葬蚤造院 躁泽澡糟葬燥岳 扎躁怎援 藻凿怎援 糟灶
摇 摇 自从在矮牵牛中分离了第一个植物 悦圆匀圆 锌指蛋
白基因 在孕栽圆鄄员 以来咱员暂 袁已经在矮牵牛尧拟南芥尧小麦尧
棉花尧水稻等植物中相继分离了近百个植物 悦圆匀圆 型
锌指蛋白基因遥 植物 悦圆匀圆 锌指蛋白参与植物各个时
期的生长发育以及环境胁迫下基因的表达调控咱圆暂 遥
本实验室在前期研究中袁成功构建了 猿 种共享同
远员怨
摇 缘 期 十字花科植物 悦圆匀圆 型锌指蛋白新基因 月糟酝云圆园 同源序列克隆与进化分析
一保持系的白菜 耶矮脚黄爷核不育 葬躁澡郧酝杂 两用系
耶月糟葬躁澡怨苑鄄园员粤 辕 月爷尧耶孕燥造蚤皂葬爷 核质互作不育 责燥造郧鄄悦酝杂
系耶月糟责燥造怨苑鄄园缘粤爷以及耶韵早怎则葬爷细胞质不育 燥早怎悦酝杂 系
耶月糟燥早怎怨苑鄄园远粤爷材料体系袁之后袁又采用 糟阅晕粤鄄粤云蕴孕 和
拟南芥基因芯片表达谱分析 猿 种不育系与其保持系花
蕾转录组差异咱猿暂 袁在此研究过程中袁我们发现一条在 猿
种不育系花蕾中均下调表达的 悦圆匀圆 锌指蛋白新基因
月糟酝云圆园渊登录号院匀酝缘远园怨远远冤遥 该基因最大开放阅读
框为 员猿缘怨遭责袁无内含子和外显子袁与拟南芥中的同源
基因的相似性为 愿圆豫 遥 具有 悦圆匀圆 锌指蛋白基因的典
型特征袁编码一个 酝酝月 型的 猿 锌指蛋白遥 时空表达
模式分析发现该基因在可育系 源 耀 缘 级花蕾中具有高
表达曰原位杂交信号出现在单核小孢子时期的小孢子
和绒毡层细胞中袁在花粉成熟早期的小孢子和绒毡层
细胞中继续表达袁说明该基因可能在花粉发育后期与
绒毡层和花粉发育有关咱源暂 遥
图 员摇 员愿 种十字花科植物材料 月糟酝云圆园 同源基因扩增结果
云蚤早援 员摇 粤早葬则燥泽藻 早藻造 藻造藻糟贼则燥责澡燥则藻泽蚤泽 枣燥则 糟阅晕粤 葬皂责造蚤枣蚤糟葬贼蚤燥灶泽 燥枣 月糟酝云圆园 枣则燥皂 员愿 皂葬贼藻则蚤葬造泽 遭赠 澡燥皂燥造燥早赠 糟造燥灶蚤灶早
酝院郧藻灶藻砸怎造藻则栽酝员园园遭责 造葬凿凿藻则的 阅晕粤标准分子量遥 泳道 员 耀 员愿 分别表示耶大股子爷紫菜薹尧耶温州盘菜爷芜菁尧耶矮抗青爷白菜尧耶中花爷芥蓝尧
裂叶水菜尧耶马耳头爷分蘖菜尧耶大头 员爷芜菁甘蓝尧耶浙 苑圆鄄员爷甘蓝型油菜尧埃塞俄比亚芥尧耶黄芽 员源爷大白菜尧耶小杂 缘远爷大白菜尧板叶水菜尧耶浙
桐 员 号爷茎瘤芥尧黑芥尧耶圆白爷萝卜尧耶樱叶爷萝卜尧耶雪里蕻爷分蘖芥和耶鸡心甘蓝爷结球甘蓝遥
酝院郧藻灶藻砸怎造藻则栽酝员园园 遭责 造葬凿凿藻则 责造怎泽 酝 皂葬则噪藻则援 蕴葬灶藻 员 耀 员愿 蚤灶凿蚤糟葬贼藻凿 月援 糟葬皂责藻泽贼则蚤泽 泽泽责援 糟澡蚤灶藻灶泽蚤泽 增葬则援 责怎则责怎则藻葬 糟增援 阅葬早怎扎蚤袁 月援 糟葬皂责藻泽贼则蚤泽 泽泽责援
则葬蚤枣藻则葬 糟增援 宰藻灶扎澡燥怎鄄责葬灶糟葬蚤袁 月援 糟葬皂责藻泽贼则蚤泽 泽泽责援 糟澡蚤灶藻灶泽蚤泽 增葬则援 糟燥皂皂怎灶蚤泽 糟增援 粤蚤噪葬灶早择蚤灶早袁 月援 燥造藻则葬糟藻葬 增葬则援 粤造遭燥早则葬遭则葬 糟增援 在澡燥灶早澡怎葬袁 月援 糟葬皂责藻泽贼则蚤泽
泽泽责援 躁葬责燥灶蚤糟葬 糟增援 悦澡蚤泽怎扎蚤鄄噪赠燥皂蚤扎怎灶葬袁 月援 糟葬皂责藻泽贼则蚤泽 泽泽责援 糟澡蚤灶藻灶泽蚤泽 增葬则援 皂怎造贼蚤糟藻责 糟增援 酝葬藻则贼燥怎袁 月援 灶葬责怎泽 增葬则援 灶葬责燥遭则葬泽泽蚤糟葬 糟增援 阅葬贼燥怎 员袁 月援 灶葬责怎泽 糟增援
在澡藻苑圆鄄员袁 月援 糟葬则蚤灶葬贼葬袁 月援 糟葬皂责藻泽贼则蚤泽 泽泽责援 责藻噪蚤灶藻灶泽蚤泽 糟增援 匀怎葬灶早赠葬 员源袁 月援 糟葬皂责藻泽贼则蚤泽 泽泽责援 责藻噪蚤灶藻灶泽蚤泽 糟增援 载蚤葬燥扎葬 缘远袁 月援 糟葬皂责藻泽贼则蚤泽 泽泽责援 躁葬责燥灶蚤糟葬 糟增援
运赠燥怎噪蚤灶袁 月援 躁怎灶糟藻葬 增葬则援 贼怎皂蚤凿葬 糟增援 在澡藻贼燥灶早 员袁 月援 灶蚤早则葬袁 砸援 泽葬贼蚤增怎泽 糟增援 再怎葬灶遭葬蚤袁 砸援 泽葬贼蚤增怎泽 糟增援 杂葬运怎则葬 杂澡蚤皂葬凿葬 运燥灶袁 月援 躁怎灶糟藻葬 增葬则援 皂怎造贼蚤糟藻责泽
糟增援 载怎藻造蚤澡燥灶早 葬灶凿 月援 燥造藻则葬糟藻葬 增葬则援 糟葬责蚤贼葬贼葬 糟增援 允蚤曾蚤灶援
为进一步研究该基因结构特征尧分子进化特性以
及在植物花粉发育中的作用袁本研究以十字花科芸薹
属和萝卜属的植物为材料进行 月糟酝云圆园 基因同源序列
克隆与鉴定袁在 月糟酝云圆园 基因同源序列比对的基础上
构建分子进化树曰探讨不同物种 月糟酝云圆园 基因的进化
关系袁分析基因结构上的保守性以及在不同物种间的
变异袁从而了解该基因在十字花科植物中的普遍作用袁
为更好的研究该基因的功能奠定理论基础遥
员摇 材料与方法
员郾 员摇 材料
所用十字花科芸薹属和萝卜属的 员愿 份材料渊表
员冤由浙江大学蔬菜研究所细胞与分子生物学实验室
提供遥 孕悦砸试剂盒购自鼎国生物技术有限公司曰限制
性内切酶尧栽葬择 阅晕粤聚合酶和 员园园遭责 阅晕粤 蕴葬凿凿藻则 购自
上海生物工程公司曰孕悦砸 产物回收试剂盒购自 灾鄄早藻灶藻
公司曰栽源 阅晕粤 连接酶和 责郧耘酝鄄栽 藻葬泽赠 灾藻糟贼燥则试剂盒购
自美国 孕则燥皂藻早葬 公司曰大肠杆菌 渊 耘泽糟澡藻则蚤糟澡蚤葬 糟燥造蚤冤
阅匀缘琢菌株为本实验室保存遥
员郾 圆摇 方法
员郾 圆郾 员摇 阅晕粤提取摇 上述 员愿 份材料分单株取材袁在莲
座期取 圆 耀 猿 片心叶遥 在田间用 苑缘豫的酒精擦拭干
净袁做好标记后投入液氮固定袁然后按曹家树等咱缘暂的
方法提取植物材料的基因组 阅晕粤并检测遥
员郾 圆郾 圆摇 目的基因的 孕悦砸 扩增尧克隆和测序 摇 以十字
花科芸薹属和萝卜属 员愿 个材料的 阅晕粤 为模板袁根据
月糟酝云圆园 的 阅晕粤 序列设计引物袁孕缘 缘忆鄄粤栽郧 郧粤郧 悦粤郧
栽栽悦 粤粤粤 郧粤郧 粤郧郧 粤 鄄猿忆和 孕猿 缘忆鄄栽悦粤 悦栽悦 粤栽悦 粤粤栽
粤郧郧 粤郧悦 粤郧郧 粤 鄄猿忆遥
孕悦砸的反应体系为 圆缘滋造院糟阅晕粤 模板 员滋造渊员园灶早窑
滋蕴鄄员冤袁员园 伊 孕悦砸 缓冲溶液渊含 圆园皂皂燥造窑蕴 原员 酝早圆 垣 冤 猿
滋造袁员园皂皂燥造窑蕴 原员 凿晕栽孕泽 员滋造袁栽葬择 酶渊缘哉窑滋造 原员 冤园郾 缘滋造袁
加 凿凿匀圆韵 至总体积为 圆缘滋造遥 孕悦砸 程序曰怨源益预变性源皂蚤灶袁怨源益变性 猿园泽袁缘缘益退火 源缘泽袁苑圆益延伸 怨园泽袁猿猿 个
循环曰苑圆益延伸 苑皂蚤灶袁源益保存遥
扩增得到的目的片段经琼脂糖凝胶电泳袁回收纯
化袁用 栽源 连接酶连接到 责郧耘酝鄄栽 耘葬泽赠 灾藻糟贼燥则上渊源益过
夜冤袁转化进大肠杆菌感受态 阅匀 缘琢感受态细胞袁培养
愿澡袁挑取单菌落袁用裂解法提质粒袁经限制性内切酶酶
切鉴定后袁送上海英俊生物技术有限公司测序遥
员郾 圆郾 猿摇 序列差异分析和系统进化分析 摇 使用
苑员怨
核摇 农摇 学摇 报 圆缘 卷
摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 表 员摇 同源基因扩增所用的植物材料
栽葬遭造藻 员摇 悦怎造贼蚤增葬则泽 怎泽藻凿 蚤灶 澡燥皂燥造燥早赠 糟造燥灶蚤灶早

早藻灶藻则葬

泽责藻糟蚤藻泽
品种
糟怎造贼蚤增葬则泽
基因名称
早藻灶藻 灶葬皂藻
芸薹属 普通白菜 矮抗青 月糟酝云圆园葬
月援 糟葬皂责藻泽贼则蚤泽 泽泽责援 糟澡蚤灶藻灶泽蚤泽 增葬则援 糟燥皂皂怎灶蚤泽 粤蚤噪葬灶早择蚤灶早
分蘖菜 马耳头 月糟酝云圆园皂
月援 糟葬皂责藻泽贼则蚤泽 泽泽责援 糟澡蚤灶藻灶泽蚤泽 增葬则援 皂怎造贼蚤糟藻责 酝葬藻则贼燥怎
紫菜薹 大股子 月糟酝云圆园凿
月援 糟葬皂责藻泽贼则蚤泽 泽泽责援 糟澡蚤灶藻灶泽蚤泽 增葬则援 责怎则责怎则藻葬 阅葬早怎扎蚤
大白菜 黄芽 员源 月糟酝云圆园澡
月援 糟葬皂责藻泽贼则蚤泽 泽泽责援 责藻噪蚤灶藻灶泽蚤泽 匀怎葬灶早赠葬 员源
小杂 缘远 月糟酝云圆园曾
载蚤葬燥扎葬 缘远
水菜 裂叶水菜 月糟酝云圆园糟
月援 糟葬皂责藻泽贼则蚤泽 泽泽责援 躁葬责燥灶蚤糟葬 悦澡蚤泽怎扎蚤鄄噪赠燥皂蚤扎怎灶葬
板叶水菜 月糟酝云圆园噪
运赠燥怎噪蚤灶
芜菁 温州盘菜 月糟酝云圆园憎
月援 糟葬皂责藻泽贼则蚤泽 泽泽责援 则葬蚤枣藻则葬 宰藻灶扎澡燥怎鄄责葬灶糟葬蚤
茎瘤芥 浙桐 员 号 月躁酝云圆园扎
月援 躁怎灶糟藻葬 增葬则援 贼怎皂蚤凿葬 在澡藻贼燥灶早 员
分蘖芥 雪里蕻 月躁酝云圆园曾
月援 躁怎灶糟藻葬 增葬则援 皂怎造贼蚤糟藻责泽 载怎藻造蚤澡燥灶早
结球甘蓝 鸡心甘蓝 月燥酝云圆园躁
月援 燥造藻则葬糟藻葬 增葬则援 糟葬责蚤贼葬贼葬 允蚤曾蚤灶 糟葬遭遭葬早藻
芜菁甘蓝 大头 员 月灶酝云圆园凿
月援 灶葬责怎泽 增葬则援 灶葬责燥遭则葬泽泽蚤糟葬 阅葬贼燥怎 员
甘蓝型油菜 浙 苑圆鄄员 月灶酝云圆园扎
月援 灶葬责怎泽 在澡藻苑圆鄄员
芥蓝 中花 月燥酝云圆园扎
月援 燥造藻则葬糟藻葬 增葬则援 葬造遭燥早则葬遭则葬 在澡燥灶早澡怎葬
埃塞俄比亚芥 要 月糟葬则酝云圆园
月援 糟葬则蚤灶葬贼葬 要
黑芥 要 月灶蚤酝云圆园
月援 灶蚤早则葬 要
萝卜属 萝卜 圆白 砸泽酝云圆园赠
砸援 泽葬贼蚤增怎泽 再怎葬灶遭葬蚤
樱叶 砸泽酝云圆园泽
杂葬运怎则葬 杂澡蚤皂葬凿葬 运燥灶
阅晕粤杂贼葬则 软件中的 酝藻早粤造蚤早灶 程序比较十字花科植物
月糟酝云圆园 同源基因 阅晕粤序列的相似性遥 使用 悦造怎泽贼葬造载
软件将 月糟酝云圆园 和 员愿 条同源基因 阅晕粤序列和推断出
的蛋白质进行同源序列比对袁邻接法 渊 晕藻蚤早澡遭燥则鄄
躁燥蚤灶蚤灶早袁晕允冤构建系统树遥
圆摇 结果与分析
圆郾 员摇 月糟酝云圆园 同源基因的克隆
利用引物 孕缘尧孕猿 对十字花科芸薹属和萝卜属的
员愿 份材料的基因组 阅晕粤 进行 孕悦砸 扩增袁结果在不同
材料中扩增得到的均是单一条带袁序列大小基本一致
渊图 员冤遥 孕悦砸产物回收后与 栽鄄藻葬泽赠 灾藻糟贼燥则 连接袁转化
大肠杆菌袁经蓝白斑筛选袁挑选阳性克隆袁单酶切鉴定
后测序遥 测序得到 月糟酝云圆园 同源基因的 阅晕粤 序列袁分
别命名袁见表 员 中基因名称遥 扩增所得 阅晕粤序列全长
在 员圆苑缘遭责 耀 员猿远愿遭责之间袁均为最大开放阅读框袁能推
导出完整的氨基酸序列袁起始密码子 粤栽郧袁终止密码
子 栽郧粤遥 均裂叶水菜尧甘蓝型油菜尧埃塞俄比亚芥尧结
球甘蓝中同源基因的长度为 员猿源员遭责袁芜菁甘蓝和耶圆
白爷萝卜中同源基因的长度为 员圆苑缘遭责袁耶樱叶爷萝卜同
源基因的长度为 员猿远愿遭责袁其余的都与 月糟酝云圆园 的长度
一致袁为 员猿缘怨遭责遥
圆郾 圆摇 十字花科 月糟酝云圆园 同源基因核苷酸序列相似性
愿员怨
摇 缘 期 十字花科植物 悦圆匀圆 型锌指蛋白新基因 月糟酝云圆园 同源序列克隆与进化分析
图 圆摇 月糟酝云圆园 同源基因蛋白质比对
云蚤早援 圆摇 粤造蚤早灶皂藻灶贼 燥枣 月糟酝云圆园 澡燥皂燥造燥早 责则燥贼藻蚤灶
黑体部分为保守序列遥
砸藻泽蚤凿怎藻泽 澡蚤早澡造蚤早澡贼藻凿 蚤灶 遭造葬糟噪 葬则藻 糟燥灶泽藻则增藻凿 蚤灶 葬造造 燥枣 贼澡藻 泽藻择怎藻灶糟藻泽 凿藻责蚤糟贼藻凿援
怨员怨
核摇 农摇 学摇 报 圆缘 卷
运用 悦造葬泽贼葬造 宰 软件将上述 员愿 份材料中扩增获得
的 月糟酝云圆园 同源基因与白菜中的 月糟酝云圆园 共 员怨 条同
源基因进行核苷酸序列比对袁发现耶大股子爷紫菜薹尧
耶温州盘菜爷芜菁尧耶矮抗青爷白菜尧耶中花爷芥蓝尧耶马耳
头爷分蘖菜尧尧耶黄芽 员源爷大白菜尧耶小杂 缘远爷大白菜尧板
叶水菜尧耶浙桐 员 号爷茎瘤芥尧黑芥尧耶雪里蕻爷分蘖芥这
员圆 份材料之间相似性很高遥 使用 阅晕粤杂贼葬则 软件中的
酝藻早粤造蚤早灶 程序袁对十字花科植物 月糟酝云圆园 同源基因
阅晕粤 序列进行核苷酸同源序列比对袁发现 月糟酝云圆园 同
源基因在 阅晕粤 序列上的相似性为 愿远郾 怨豫 耀 员园园豫 遥
这说明不同材料中 月糟酝云圆园 同源基因较保守遥 耶大头
员爷 芜菁甘蓝与耶圆白爷萝卜相似程度较高袁为 怨怨郾 苑豫 袁
耶浙桐 员 号爷茎瘤芥与板叶水菜间的相似程度达到了
员园园豫 袁但与其他材料之间的相似度均在 愿苑豫左右遥
圆郾 猿摇 月糟酝云圆园 同源基因蛋白质的序列比对
本研究对 月糟酝云圆园 所有同源基因编码的蛋白质进
行了比对渊图 圆冤袁结果发现袁它们所编码的蛋白质同源
性高达 苑苑郾 远豫 耀 员园园豫 袁尽管 员怨 条基因编码的氨基酸
长度不同袁但均为 猿 锌指的 悦圆匀圆 转录因子袁依据
运怎遭燥咱远暂对锌指结构的分类袁这 员怨 条基因编码的 猿 锌
指类型一样袁均为 酝酝月 型遥 在锌指的保守区域袁氨基
酸序列完全相同遥
圆郾 源摇 月糟酝云圆园 同源基因的进化关系
从构建的进化树渊图 猿冤可见袁 耶大头 员爷芜菁甘蓝
与耶圆白爷萝卜尧耶樱叶爷萝卜聚成一类遥 裂叶水菜尧耶浙
苑圆鄄员爷甘蓝型油菜尧埃塞俄比亚芥尧耶鸡心甘蓝爷结球甘
蓝聚成一类袁其余聚成一大类遥
猿摇 讨论
对 月糟酝云圆园 同源基因进化分析表明袁裂叶水菜与
甘蓝型油菜聚为一类袁裂叶水菜为 粤粤 型基因组袁甘蓝
型油菜为 粤粤悦悦型基因组曰埃塞俄比亚芥与结球甘蓝
聚为一类袁埃塞俄比亚芥是 月月悦悦型基因组袁结球甘蓝
是 悦悦型曰板叶水菜与耶浙桐 员 号爷茎瘤芥聚为一类袁板
叶水菜是 粤粤 型基因组袁茎瘤芥是 粤粤月月 型曰耶小杂
缘远爷大白菜与耶雪里蕻爷分蘖芥聚为一类袁耶小杂 缘远爷大
白菜为 粤粤型基因组袁耶雪里蕻爷分蘖芥属于 粤粤月月型袁
这些都完全符合禹氏三角的理论咱苑暂 遥
植物 悦圆匀圆 型锌指蛋白的结构与其他真核生物相
比具有的典型特征是其 琢 螺旋区一般都有一个
匝粤蕴郧郧匀的高度保守序列袁这段保守序列是植物锌指
蛋白所特有的袁在已发现的所有动物锌指蛋白中都没
有这一段序列袁表明植物 悦圆匀圆 锌指蛋白家族可能涉
图 猿摇 十字花科 月糟酝云圆园 同源基
因 阅晕粤序列的分子系统树
云蚤早援 猿摇 酝燥造藻糟怎造葬则 责澡赠造燥早藻灶藻贼蚤糟 贼则藻藻 燥枣
月糟酝云圆园 澡燥皂燥造燥早 蚤灶 枣葬皂蚤造赠 悦则怎糟蚤枣藻则葬泽藻
及到控制植物所特有的生命过程咱圆暂 遥 在本研究中袁员怨
份不同材料中 月糟酝云圆园 同源基因编码的蛋白质尽管氨
基酸长度不同袁但均为 猿 锌指的 悦圆匀圆 转录因子袁且锌
指类型一样袁均为 酝酝月 型遥 在锌指的保守区域袁氨基
酸序列完全相同遥 锌指区域的高度保守性同样暗示了
我们植物 悦圆匀圆 锌指蛋白家族对于植物行使某些功能
可能具有重要作用遥
另外袁十字花科植物种类繁多袁并且在器官发育上
存在多态现象袁例如袁有些发育成肥嫩的花球袁有些发
育成硕大的叶球袁有些则有膨大的地下肉质根袁还有的
以散生的叶片为食用器官等等遥 由于形态差异大袁又
有许多中间过渡类型袁因而很难对其中的各类物种进
行细致分类和进化定位遥 近年来袁迅速增加的 阅晕粤序
列分析为系统发育研究提供了较为客观的证据遥 本实
验室已对多条基因在十字花科不同物种中进行了同源
序列的分离克隆咱愿鄄员园暂 袁通过核酸序列的差异比较分析袁
研究了基因在不同物种中的进化关系袁为十字花科植
物的物种分类提供了一些有价值的分子数据遥
源摇 结论
十字花科芸薹属和萝卜属共 员怨 份不同材料中
园圆怨
允燥怎则灶葬造 燥枣 晕怎糟造藻葬则 粤早则蚤糟怎造贼怎则葬造 杂糟蚤藻灶糟藻泽
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