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CLONING, SUBCELLULAR LOCALIZATION AND TRANSFORMATION OF EBF2 GENE IN TOMATO

番茄EBF2基因的克隆、亚细胞定位与遗传转化



全 文 :核 农 学 报 2010,24(3):490 ~ 494
Journal of Nuclear Agricultural Sciences
文章编号:1000-8551(2010)03-0490-05
番茄 EBF2 基因的克隆、亚细胞定位与遗传转化
吴 玉1,2 杨迎伍1,2 邓 伟1,2 李正国1,2
(1. 重庆大学生物工程学院基因工程研究中心,重庆 400030;2. 重庆市高校功能基因与调控新技术重点实验室,重庆 400030)
摘 要:为研究番茄 EBF2 基因的功能,利用 RT-PCR 技术从番茄果实 cDNA 中扩增了全长 EBF2 基因,
将其与绿色荧光蛋白(GFP)构建成融合表达载体,在烟草原生质体中进行瞬时表达。结果表明,该基因
定位于细胞核内。将该基因定向克隆到植物表达载体 pCambia1301,构建成由组成型启动子 CaMV35S
启动的植物表达载体 pCambia1301-EBF2,通过农杆菌介导方法转化 Micro Tom 番茄。经 PCR 及 GUS 组
织染色检测,外源基因已整合到番茄基因组中。
关键词:EBF2 基因;亚细胞定位;载体构建;遗传转化;番茄
CLONING,SUBCELLULAR LOCALIZATION AND TRANSFORMATION OF EBF2 GENE IN TOMATO
WU Yu1,2 YANG Ying-wu1,2 DENG Wei1,2 LI Zheng-guo1,2
(1 . Genetic Engineering Research Center,Bio-Engineering College,Chongqing University,Chongqing 400030;
2 . Key Lab of Functional Gene and New Regulation Technologies under Chongqing Municipal Education Commission,Chongqing 400030)
Abstract:In order to study the function of EBF2 cDNA in tomato,EBF2 full length gene from tomato fruit was amplified
by RT-PCR. The transient expression of EBF2-GFP fusion protein in tobacco protoplast revealed its nuclear localization,
and sense recombinant vector of pCambia1301-EBF2 which EBF2 gene driven by the constitutive promoter CaMV35S
was constructed. Then the transgenic tomatoes cv. Micro Tom were obtained via Agrobacterium-mediated transformation
and confirmed by PCR and GUS histochemical staining.
Key words:EBF2 gene;subcellular localization;construction of expression vector;transformation;tomato
收稿日期:2009-10-12 接受日期:2009-12-28
基金项目:国家自然科学基金(编号 30600422)
作者简介:吴 玉(1984-),女,新疆乌鲁木齐人,硕士研究生,主要从事分子生物学研究。Tel:023-65120483;E-mail:20071902049@ cqu. edu. cn
通讯作者:李正国(1964-),男,四川大邑人,教授,主要从事植物分子生物学研究。Tel:023-65120483;E-mail:zhengguoli@ cqu. edu. cn
果实的生长发育和成熟是一个非常复杂的生理生
化过程,受到植物激素、环境条件和基因表达等多方面
因素的影响和调控,伴随着大量程序化基因的表达过
程[1]。乙烯是一种植物激素,对植物生长发育的影响
包括种子萌发、对茎和根伸长的抑制、开花、衰老和脱
落、性别分化、果实成熟、胁迫反应等[1,2]。乙烯作为
跃变型果实成熟的重要调控因子,其信号转导途径一
直是国内外研究的热点,现已鉴定出乙烯受体及下游
几个元件,取得了较大进展[2 ~ 4]。最近的研究进一步
表明,几个 F-box 蛋白在植物生长和发育等多方面起
作用,尤其是植物激素信号可能依赖于 SCF 调控[5]。
在拟南芥中研究表明,2 个 F-box 蛋白,即 EBF1 和
EBF2(EIN3-Binding F box protein 1 and 2),可与 EIN3
(ethylene insesitive 3)相互作用,从而参与乙烯信号的
调控反应[6 ~ 8]。在缺乏乙烯的情况下,EIN3 蛋白被
EBF1 和 EBF2 介导的泛素 /蛋白酶体途径迅速降解。
拟南芥中 ebf1 和 ebf2 任一基因突变,导致 EIN3 的稳
定性增强,从而增强植株对乙烯的反应;且 ebf1 和 ebf2
的双突变型拟南芥植株对外源乙烯显示出组成型乙烯
反应。而任一 EBF1 和 EBF2 基因的超表达降低拟南
芥对外源乙烯的敏感性,并使 EIN3 不稳定。基因上
位性分析表明,EBF1 和 EBF2 作用于 EIN2 下游,并独
立于 EIN2,直接控制 EIN3 蛋白的水平。
由于拟南芥缺乏果实发育与成熟的典型特征,因
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3 期 番茄 EBF2 基因的克隆、亚细胞定位与遗传转化
此在拟南芥上的研究结果不能揭示 EBF1 和 EBF2 对
果实发育及成熟过程的影响。番茄果实为肉质浆果,
是一种典型的呼吸跃变型果实,果实成熟过程中伴随
着大量结构和生理生化的变化,是研究果实发育与成
熟过程的重要模式植物。另外,番茄也是一种世界性
种植的重要鲜食和加工原料。本研究从番茄中分离
EBF2 的全长编码序列,构建番茄 EBF2 植物超表达载
体,并转化番茄,对进一步阐明 EBF2 在果实发育与成
熟过程的功能具有重要意义。
1 材料与方法
1. 1 材料
番茄(Solanum lycopersicum,cv. Micro Tom)、大肠
杆 菌 (Escherichia coli ) JM109 菌 株、农 杆 菌
(Agrobacterium)菌 株 GV3101 及 植 物 表 达 载 体
pCambia1301 均为本实验室保存;pGreenⅡ-35S-EGFP
载体由法国图卢兹大学惠赠。该载体由 pGreen 载
体[9]衍生而来,是含有绿色荧光蛋白(GFP)序列和
35S 启动子序列的表达载体。
1. 2 方法
1. 2. 1 SLEBF2 目的基因的克隆 根据拟南芥
(Arabidopsis thaliana)EBF2 序列及番茄 EST 序列进行
同 源 性 分 析, 设 计 引 物 P1 (5 ’-
ATGCCTACTCTTGTTAATTACAGTG-3’)和 P2 (5 ’-
TCGTTTTGACCATTTCGAATGCATT-3’),通过 TaKaRa
高保真 DNA 聚合酶从番茄绿熟期果实 cDNA 中 PCR
扩增 EBF2 基因,PCR 条件:98℃ 5min;98℃ 20s,56℃
20s,72℃ 150s,40 个循环;72℃ 10min。产物经过回
收,送上海生工生物技术有限公司测序验证。
1. 2. 2 SLEBF2 的亚细胞定位 以引物 P1、R1(5’-
GGAGAGGATGTCACACCTCCACAAAGC-3’)、高保真
酶扩增获得的 EBF2 全长编码片段(去除终止密码子
TAA)与经限制性内切酶 SmaⅠ酶切的 pGreenⅡ-35S-
EGFP 载体连接构建 pGreenⅡ-35S-EBF2::EGFP 融合
表达载体。将所得连接产物转化大肠杆菌感受态细
胞,用 pGreenⅡ-35S-EGFP 载体上的一段特异引物 F1
(5’-CGGAGAGGTACGTATTTTTAC-3’)与 R1,PCR 筛
选正向连接的阳性菌落,提取质粒,并测序验证。
按照 Axelos 等[10]的方法制备烟草原生质体,在
PEG 介导下将 pGreenⅡ-35S-EBF2::EGFP 转入烟草
原生质体。25℃ 振荡培养 16h,激光共聚焦显微镜
(ZEISS LSM-510 META,Germany)观察其亚细胞定位。
1. 2. 3 植物表达载体的构建 将 EBF2 基因同上述
方法先构建到中间载体 pDH51[11]上,以 CaMV35S 前
引物 F (5’-GCTCCTACAAATGCCATCATTGC-3’)与
EBF2 基因后引物 P2,PCR 筛选正向连接的转化子,再
经 EcoRⅠ酶切并与 pCambia1301 载体连接,转化大肠
杆菌感受态细胞,构建重组质粒 pCambia1301-EBF2,
并经测序验证。
1. 2. 4 番茄的遗传转化及转基因植株的鉴定 将重
组质粒 pCambia1301-EBF2 通过冻融法导入农杆菌
GV3101,利用叶盘法转化番茄,经过 100mg /L 卡那霉
素筛选的抗性植株移入温室培养[12]。
以具卡那霉素抗性的番茄转化苗叶片为材料,用
改良 CTAB 法小量提取番茄基因组 DNA。以 DNA 为
模版,pCambia1301-EBF2 质粒为阳性对照,同时用野
生型番茄 DNA 作为阴性对照,以 CaMV35S 前引物 F
与 EBF2 基因特异引物 R2(5’-AGGTATCCATCACAT-
TCAACT-3’)(扩增产物约为 700bp)进行转基因植株
的 PCR 鉴定,PCR 反应条件:95℃ 5min;95℃ 1min,
53℃ 45s,72℃ 1min,35 个循环;72℃ 10min。
2 结果与分析
2. 1 SLEBF2 基因的分离及序列分析
以番茄果实 cDNA 为模板,以 P1、P2 为引物进行
PCR 扩增,扩出 1 条约 2000bp 的条带(图 1),与预期
目标片段大小一致。测序结果显示该基因全长
2884bp,编码 637 个氨基酸。
图 1 番茄 EBF2 基因的 PCR 扩增
Fig. 1 Amplification of EBF2 gene by
PCR from tomato
M:DNA 分子量标准;1:EBF2 基因
M:DNA marker;1:EBF2 gene
根据测序结果进行相关生物信息学分析表明,该
基因与拟南芥中的 EBF2 基因有 64%的核苷酸序列相
似性。用 DNAMAN 软件对番茄 EBF2 与拟南芥 EBF2
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核 农 学 报 24 卷
蛋白(其 GenBank 登录号为 NP197917)进行蛋白质比
对(图 2),显示二者氨基酸序列相似性为 53. 88%。
图中黑实线框出的部分 F-box 保守区域,箭头所示
LRRs(leucine-rich repeats)是蛋白质泛素化作用的底
物(如 EIN3)识别并结合的必需结构[7,13]。将该基因
在 GenBank 中登录,其登录号为 GQ144956,编码的蛋
白登录号为 ACS44350。
图 2 番茄与拟南芥 EBF2 基因的氨基酸序列比对
Fig. 2 Alignment of deduced amino acid sequences of EBF2 gene between Solanum
lycopersicum and Arabidopsis thaliana
黑框示 F-box 保守区;箭头示 LRRs 结构
The F-box sequences are boxed;LRRs are indicated by arrows above the sequences
2. 2 SLEBF2 的亚细胞定位分析
将所获得的番茄 EBF2 基因定向克隆入 pGreen
Ⅱ-35S-EGFP 载体后,PCR 筛选得到正向连接的转化
子,经酶切及测序验证序列正确。将 pGreenⅡ-35S-
EBF2::EGFP 重组质粒转化烟草原生质体,经激光共
聚焦显微镜观察其亚细胞定位(图 3)。由激光共聚焦
扫描显微图与可见光显微图叠加后的效果图可清楚地
看出,未转化目的基因的空质粒并没有明确的核定位,
而含有 EBF2 的重组质粒定位于细胞核内。
2. 3 SLEBF2 转基因番茄植株的获得及鉴定
为研究 EBF2 基因的功能,将 EBF2 基因克隆入
植物表达载体 pCambia1301 中,构建成重组质粒
pCambia1301-EBF2,并通过冻融法将重组质粒转化农
杆菌 GV3101。通过农杆菌介导的叶盘法转化获得的
番茄抗性植株移栽成活后,以叶片为材料提取基因组
DNA,对抗性苗进行 PCR 初步鉴定,检测结果如图 4
所示。由图 4 可见,待测抗性苗中有 3 株是阳性植株。
进一步通过 GUS 组织染色证实,3 株 PCR 检测阳性株
系为转基因番茄植株(结果未列出)。
3 结语
通过泛素 /26S 蛋白酶体途径的蛋白质降解是所
有真核生物一个重要的转录后调节机制,这样能使真
核细胞对信号分子和环境条件的改变作出迅速反
应[14]。F-box 蛋白是参与该途径的重要元件。最近在
拟南芥中发现的 EBF1 和 EBF2(EIN3-binding F box
protein 1 and 2)是通过调节 EIN3(ethylene insesitive
3)蛋白的降解,从而在植物对乙烯信号的反应中起着
重要的调控作用。
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3 期 番茄 EBF2 基因的克隆、亚细胞定位与遗传转化
图 3 EBF2 的亚细胞定位
Fig. 3 Subcellular localization of EBF2
上部为 pGreen 空质粒,下部为 EBF2 基因的融合载体
A、D:激光共聚焦扫描显微图;B、E:可见光显微图;C、F:二者叠加图
Upper panel represents the pGreen empty vector,the lower panel represents EBF2 fusion vector
A,D:confocal laser scanning micrographs;B,E:visible light micrographs;C,F:merged images
图 4 转基因番茄植株中 EBF2 基因的 PCR 检测
Fig. 4 PCR analysis of EBF2 gene in
putative transgenic tomatoes
M:DNA 标准分子质量;N:空白对照;
P:阳性对照;W:野生型番茄植株;1 ~ 5:转基因番茄植株
M:DNA marker;N:negative control;P:positive control;
W:wild type tomato;1 ~ 5:transgenic tomatoes
本研究以番茄为材料,成功克隆了 EBF2 基因,并
构建了 pGreenⅡ-35S-EGFP-EBF2 融合载体,通过亚细
胞结构观察,证实 EBF2 定位于核内,符合转录因子特
性。同时构建了 pCambia1301-EBF2 植物超表达载体,
并由农杆菌介导的叶盘法转入 Micro Tom 番茄,经
PCR 及 GUS 组织化学染色鉴定,已获得转基因阳性植
株,为揭示番茄 EBF2 对果实发育和成熟的调控作用
奠定了基础。后续工作将对转基因植株及子代进一步
观察鉴定,并通过添加乙烯合成前体物质[15]或施用外
源乙烯观察植株的乙烯反应(如根、下胚轴、顶勾的生
长状况,果实发育及植株衰老的进程等),同时通过分
子生物学方法检测 EIN3 等相关基因的表达状况,以
期进一步明确 EBF2 基因超表达所引起的乙烯信号转
导通路的变化及对植株生长发育造成的影响。该结果
可为明确 EBF 基因在番茄果实发育和成熟中的调控
作用提供参考。
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