全 文 :植物生理学报 Plant Physiology Journal 2014, 50 (9): 1353~1366 doi: 10.13592/j.cnki.ppj.2014.0280 1353
收稿 2014-06-16 修定 2014-08-14
资助 浙江省自然科学基金(LY14C020003)。
* 通讯作者(E-mail: xiaorong@zju.edu.cn; Tel: 0571-
88206133)。
高等植物铁氧还蛋白-NADP+氧化还原酶研究进展
杨超, 胡红涛, 吴平, 莫肖蓉*
浙江大学生命科学学院, 植物生理学与生物化学国家重点实验室, 杭州310058
摘要: 高等植物叶绿体定位的铁氧还蛋白-NADP+氧化还原酶(LFNR)负责催化光合线性电子传递的最后一步反应, 催化电
子由还原态的铁氧还蛋白(Fd)传递给NADP+。LFNR分布在叶绿体的3个不同的组分中, 即叶绿体基质中、类囊体膜上和
叶绿体内膜上。最近的研究表明, 大多数膜定位的LFNR并非光合作用所必需的, 叶绿体基质中的LFNR足以维持光合作用
的正常进行。叶绿体中的两个蛋白——Tic62和TROL作为LFNR的锚定蛋白, 可以与LFNR在类囊体膜上形成高分子量的
蛋白复合体。Tic62-LFNR复合体主要负责在夜间保护LFNR的活性, 但它不直接在光合作用中起作用。然而, TROL-LFNR
复合体对植物的光合作用有一定的影响。本文将概述植物LFNR的最新研究进展。
关键词: 高等植物; 光合作用; 电子传递; 铁氧还蛋白-NADP+氧化还原酶
Advances in the Research of Ferredoxin-NADP+ Oxidoreductase in Higher Plants
YANG Chao, HU Hong-Tao, WU Ping, MO Xiao-Rong*
State Key Laboratory of Plant Physiology and Biochemistry, College of Life Sciences, Zhejing University, Hangzhou 310058, China
Abstract: The chloroplast-targeted ferredoxin-NADP+ oxidoreductase (LFNR) in higher plants mediates the fi-
nal step of photosynthetic linear electron flow by transferring electrons from reduced ferredoxin (Fd) to NADP+.
LFNR has been detected from three distinct chloroplast compartments, the chloroplast stroma, the thylakoid
membrane and the chloroplast inner envelope. Recent studies have indicated that vast majority of the mem-
brane-bound LFNR is not necessary for photosynthesis, whereas the stroma LFNR is enough to maintain nor-
mal photosynthesis. Two chloroplast proteins, Tic62 and TROL, which act as LFNR membrane anchored pro-
teins, were recently identified and shown to form high molecular weight protein complexes with LFNR at the
thylakoid membrane. Tic62 protects LFNR from inactivation during dark, but Tic62-LFNR complexes are not
directly involved in photosynthetic reactions. TROL-LFNR complexes, however, have certain impact on photo-
synthesis in plants. In the present paper, we reviews the latest progress in LFNR in higher plants.
Key words: higher plants; photosynthesis; electron transfer; ferredoxin-NADP+ oxidoreductase
综 述 Reviews
铁氧还蛋白-NADP+氧化还原酶(ferredoxin-
NADP+ oxidoreductase, FNR)广泛存在于各种生物
中, 如自养的光合细菌、各种藻类和高等植物(Ce-
ccarelli等2004)。FNR以一分子非共价结合的黄素
腺嘌呤二核苷酸(FAD)作为辅基(Shin和Arnon
1965; Arakaki等1997)。植物中FNR蛋白根据其功
能和定位不同可以分为两大类: 一类是存在于光
合组织(主要是植物叶片的叶绿体)的LFNR (leaf-
type FNR); 另一类是存在于非光合组织(主要是根
的质体)的RFNR (root-type FNR)。这两类FNR都
各自有多个同源蛋白(Green等1991; Morigasaki等
1993; Hanke等2004; Okutani等2005)。LFNR主要
负责催化光合线性电子传递(linear electron trans-
port, LET)的最后一步反应(图1-A), 催化电子从还
原态的铁氧还蛋白(ferredoxin, Fd)传递给NADP+,
生成的还原力NADPH主要用于卡尔文循环中CO2
的固定和叶绿体的其他代谢过程(Arakaki等1997;
Carrillo和Ceccarelli 2003)。反应式为: 2Fdred+NADP
++
H+→2Fdox+NADPH。除此之外, 还原态的Fd也可
将电子用于其他反应, 如氮同化、硫同化、脂质
和叶绿素的合成等。与LFNR相比, RFNR负责催
化电子向Fd还原的方向传递(Carrillo和Ceccarelli
2003), 即由NADPH传递给氧化态的Fd。近年来,
植物生理学报1354
图1 LFNR参与不同的电子传递途经
Fig.1 LFNR functions in various electron transfer pathways
参考Mulo (2011)文献并修改。A: LFNR参与光合线性电子传递(实线箭头表示)。水光解产生的电子依次通过光系统II (PSII)、质体
醌库(PQ)、细胞色素b6f复合体(Cyt b6f)、光系统I (PSI)、铁氧还蛋白(Fd)、LFNR, 最后将电子传递给NADP
+, 生成NADPH。NADPH可以
用于碳固定(卡尔文循环)、蛋白质合成、脂质合成、叶绿素合成和抗坏血酸-谷胱甘肽循环等代谢过程。LFNR在叶绿体基质或类囊体
膜上发挥功能。B: LFNR可能参与的环式电子传递(CET)途径(虚线表示)。在Fd依赖的CET中, 电子从Fd传递给PQ、Cyt b6f复合体, 最后
又回到PSI。该途径受到PGR5和PGRL1的调控, 还可能受LFNR或铁氧还蛋白-质体醌氧化还原酶(FQR)的催化。该途径会受到抗霉素A
(antimycin A)的抑制。在NADPH脱氢酶(NDH)复合体依赖的CET途径中, 电子在NDH复合体的作用下将电子从NADPH传递给PQ, 然后传
递给Cyt b6f复合体, 最后回到PSI。
植物中对FNR的研究主要集中在LFNR的蛋白功
能及其表达调控, 如不同类型LFNR的功能及其在
逆境条件下发挥不同的生理功能研究, LFNR的膜
锚定蛋白Tic62和TROL (thylakoid rhodanese-like
protein)的发现等。本文将系统总结植物LFNR在
蛋白结构、功能和调控机制方面的最新研究成果,
同时对该领域存在的问题和前景进行探讨。
1 LFNR的结构
LFNR在植物中广泛存在, 不同物种的LFNR
之间的相似性从40%~97%不等(Arakaki等1997)。
它属于一类亲水性的蛋白, 大小约35 kDa。LFNR
包含2个典型的结构域 : FAD结合结构域(FAD
binding domain)和NADP+结合结构域(NADP+ bind-
ing domain) (图2)。在不同物种之间2个结构域有
着高度的保守性。到目前为止, 已经有很多物种
的LFNR蛋白三维结构得到解析(Correll等1993;
Bruns和Karplus 1995; Deng等1999; Dorowski等
2001; Kurisu等2001; Hermoso等2002; Karplus和
Faber 2004; Peregrina等2009)。它的2个保守的结
构域之间通过一个loop区连接起来, 这段无规则的
loop区在不同物种的LFNR之间有最大的变异性
(Dorowski等2001)。LFNR的N-端主要包含FAD结
合结构域 , 而C-端则主要包含NADP+结合结构
域。FAD结合结构域是由6个反向平行的β-折叠构
成的β-桶, 外加1个α-螺旋的帽子构成; NADP+结合
图2 LFNR的结构
Fig.2 Structure of LFNR
参考Mulo (2011)文献。红色表示FAD结合结构域, 蓝色表示
NADP+结合结构域, 黄色表示Fd, 4个小圆球表示Fd的铁硫聚簇。
杨超等: 高等植物铁氧还蛋白-NADP+氧化还原酶研究进展 1355
结构域是由中心5个平行的β-片层, 外周环绕6个α-
螺旋构成。NADP+结合结构域可以进一步细分为2
个亚结构域(Lee等2007)。C-端亚结构域的构象会
随着叶绿体基质中pH的改变而发生变化。在白天
基质的pH升高导致C-端亚结构域构象改变, 增加
与NADP+的结合能力。因此, 随着周围环境光照的
改变, 植物可以利用这种机制对LFNR的功能适时
调控, 从而调节整个光合作用的进行(Lee等2007)。
已知叶绿体中Fd与LFNR之间是紧密互作的,
在四级结构中 , F d结合在FA D结合结构域和
NADP+结合结构域折成的浅的裂隙之间(De Pasca-
lis等1993) (图2)。Fd与LFNR是通过LFNR的一些
中性氨基酸残基和Fd的酸性氨基酸残基结合在一
起的, 同时还包括范德华力、疏水作用力和氢键
的作用(Medina和Gomez-Moreno 2004)。目前, 根
据连续的静电能计算和对Fd、LFNR的多个定点
氨基酸突变分析结果, Fd-LFNR复合体形成所必需
的氨基酸已经基本鉴定, 尤其在蓝藻中最为清楚
(Aliverti等1994; Gomez-Moreno等1998; Marti-
nez-Julvez等1998a, 1998b, 2001; Medina等1998;
Deng等1999; Medina等2001; Hurley等2002)。核磁
共振(NMR)及定点氨基酸突变的研究证明LFNR
多变的N-端也在Fd-LFNR复合体的形成中起作用
(Maeda等2005)。
2 LFNR基因家族和LFNR基因表达调控
2.1 LFNR基因家族
高等植物中叶绿体定位的LFNR是由一小组
核基因家族编码, 通常编码2~3个同源的LFNR, 同
源性达到80%左右(Green等1991; Morigasaki等
1993; Hanke等2005; Okutani等2005; Gummadova
等2007; Grzyb等2008; Higuchi-Takeuchi等2011)。
到目前为止, 所有研究过的植物中都包含2种性质
不同的LFNR (表1), 一种相对偏酸性, 另一种相对
偏中性(Hanke等2005)。如拟南芥(Arabidopsis
thaliana)和水稻(Oryza sativa)的叶绿体中各自含有
一个偏中性或偏酸性的LFNR, 玉米(Zea mays)的
叶绿体中含有1个偏酸性的和2个偏中性的LFNR。
这些不同的LFNR在一定程度上存在功能冗余, 但
它们又各自具有自己独特的功能特性, 而这种特
性对于植物在复杂多变的环境中对叶绿体的代谢
做出适时的调整是必不可少的。以下将分别对已
经研究较多的双子叶C3植物拟南芥、单子叶C3植
物小麦、水稻和单子叶C4植物玉米的LFNR家族的
特征逐一介绍。拟南芥、小麦、水稻和玉米不同
的LFNR命名和分类参照表1。
2.1.1 拟南芥LFNR基因 拟南芥的叶绿体中有2个
不同的LFNR蛋白, 大小约32 kDa, 分别命名为At-
LFNR1和AtLFNR2, 分别由基因At5g66190和
At1g20020编码(Lintala等2007; Hanke等2008)。在
所有LFNR转录本中LFNR1的mRNA占了68%,
LFNR2的mRNA仅占了32% (Lintala等2009)。2个
LFNR基因都主要在拟南芥的叶片中表达, 而在
茎、花和果荚中仅能检测到少量的mRNA (Hanke
等2005)。叶绿体中的LFNR转录的mRNA和LFNR
都不能在根中检测到(Hanke等2005)。在拟南芥
lfnr突变体中, 不论LFNR1突变, 还是LFNR2突变,
表1 不同物种LFNR的分类和特点
Table 1 Classification and characteristics of LFNR in different species
物种 基因号 基因名称 等电点 分类 参考文献
拟南芥 TAIR: At5g66190 AtLFNR1 5.54 偏酸性 Hanke等2005
TAIR: At1g20020 AtLFNR2 6.19 偏中性
小麦 GenBank: CAD30025 TaLFNRI 5.90~6.20 偏中性 Gummadova等2007
TaLFNR-B Grzyb等2008
GenBank: CAD30024 TaLFNRII 5.30~5.50 偏酸性 Gummadova等2007
TaLFNR-A Grzyb等2008
水稻 TIGR: LOC_Os06g01850 OsLFNR1 5.65 偏酸性 Higuchi-Takeuchi等2011
TIGR: LOC_Os02g01340 OsLFNR2 7.69 偏中性
玉米 GenBank: AB035644 ZmLFNR1 6.76 偏中性 Okutani等2005
GenBank: AB035645 ZmLFNR2 5.50 偏酸性
GenBank: ACF85815 ZmLFNE3 6.10 偏中性
植物生理学报1356
另一个同源的LFNR在转录水平和蛋白水平上都不
会被诱导表达(Lintala等2007, 2009)。因为成熟的
LFNR1的等电点(pI 5.54)要比LFNR2的(pI 6.19)偏
酸性一些, 因此, 可以使用非变性聚丙烯酰胺凝胶
电泳(native-PAGE)将2个蛋白分开(Hanke等2008;
Lintala等2012)。在双向聚丙烯酰胺凝胶电泳
(2D-PAGE)中发现每个LFNR都有2个不同的蛋白
斑点, 表明LFNR可能存在转录后的蛋白修饰(Lin-
tala等2007), 这可能是蛋白N-端加工或者是蛋白磷
酸化修饰(Moolna和Bowsher 2010)。2个LFNR都
定位于叶绿体类囊体膜、叶绿体基质和叶绿体内
膜上(Lintala等2007)。
lfnr1突变体植株矮小, 并且叶片颜色变浅, 叶
绿素含量降低, 叶片呈淡绿色, 捕光色素蛋白复合
体减少(Lintala等2007)。叶绿素荧光动力学参数
的测定结果显示, lfnr1中光系统(photosystem, PS)
I/PSII的活性显著降低, Fv/Fm没有发生明显的变化,
但PSII的激发能与野生型相比显著降低(Lintala等
2007)。在lfnr1突变体中, P700的再还原速率大大
降低, 说明LFNR1在PSI依赖的环式电子传递(cy-
clic electron transport, CET)中起着重要的作用。另
外, lfnr1植株碳固定的能力降低, 但是氮代谢的能
力有所提高(Lintala等2009; Hanke等2008)。由于
LFNR1缺失, 电子在类囊体膜上的传递受阻, Fd处
于更加还原的状态(Hanke等2008)。
lfnr2突变体与lfnr1有相似的一些光合特征,
如较低的叶绿素含量, 类囊体膜上光合蛋白复合
体减少以及碳同化速率降低等(Lintala等2009)。
虽然LFNR1与LFNR2存在一些功能上的冗余, 但
两者的功能也不完全相同。研究发现在正常的生
长条件下, lfnr1和lfnr2有类似的表型, 但当把2种突
变体种植在低温环境中时, lfnr2表现出比lfnr1和野
生型更好的耐低温能力与抗氧化胁迫的能力, 这
与lfnr2突变体中抗坏血酸含量提高、清除活性氧
的酶上调等有着紧密的关联。由此推断 , 与
LFNR1相比, LFNR2对于光合电子再分配到其他
氧化还原反应代谢过程中具有重要的作用(Lintala
等2009)。
在lfnr2突变体中, LFNR1依然在叶绿体基质
和膜上存在, 但在lfnr1突变体中, LFNR2只存在于
叶绿体基质中, 膜组分上的LFNR全部消失, 说明
LFNR2结合到类囊体膜或叶绿体内膜上要通过与
LFNR1形成异源二聚体, LFNR2自己本身不能结
合到膜上(Lintala等2009)。
2.1.2 小麦LFNR基因 根据等电聚焦和SDS-PAGE
的结果, 小麦中有4个不同的LFNR同源蛋白。这
些LFNR可以划分成2个组: LFNRI和LFNRII, 每组
都包括2个不同的LFNR, 2个蛋白之间只是在N-端
存在几个氨基酸的差异 (Gummadova等2007;
Grzyb等2008)。还有研究发现, 在2D-PAGE中发现
了另外的4个LFNR蛋白斑点, 推测这4个蛋白斑点
很可能是磷酸化的LFNR, 因为它们与预测的磷酸
化LFNR等电聚焦的位置是一致的(Moolna和Bow-
sher 2010)。LFNR可变的加工方式或磷酸化修饰
会对其等电点有显著的影响 , 但不会明显改变
LFNR的电泳迁移率。小麦LFNR蛋白N-端的差异
可能会导致LFNR活性、叶绿体内分布以及对不
同Fd亲和力的改变(Gummadova等2007; Moolna和
Bowsher 2010)。
2.1.3 水稻LFNR基因 水稻中也有2个同源的
LFNR, 分别命名为OsLFNR1 (LOC_Os06g01850)
和OsLFNR2 (LOC_Os02g01340), 两者的相似性达
到80%。与拟南芥一致, OsLFNR1 (pI 5.65)的等电
点比OsLFNR2 (pI 7.69)更偏酸性(Higuchi-Takeuchi
等2011)。Higuchi-Takeuchi等人(2011)利用水稻
LFNR1/2超表达的转基因水稻材料初步研究了
LFNR1/2在水稻中的功能。在正常条件下, LFNR1
超表达没有影响水稻光合作用的效率, 但LFNR2超
表达影响了水稻的LET速率和围绕PSI的Fd依赖的
CET速率。LFNR1/2的超表达转基因水稻植株在
土壤中都表现为植株矮小 , 生长严重受抑。但
LFNR1超表达植株在氮源丰富的营养液中, 表型几
乎可以完全恢复, 生长也不会受抑, 表明在LFNR1
超表达植株中, 由Fd至硝酸盐还原酶的电子传递
通路遭到了破坏; 而LFNR2超表达植株在氮源丰
富的培养基中, 表型并没有恢复(Higuchi-Takeuchi
等2011)。总之, 在LFNR1/2超表达植株中, 电子由
Fd至氮同化或NADP+的分配平衡受到影响, 从而
在土壤中产生生长受抑的表型。另外, 2个LFNR基
因的表达具有相互拮抗的现象 , 即当其中一个
LFNR超表达时, 另一个LFNR的表达不管是在转录
水平还是蛋白水平都会受到明显的抑制(Higuchi-
杨超等: 高等植物铁氧还蛋白-NADP+氧化还原酶研究进展 1357
Takeuchi等2011)。
2.1.4 玉米LFNR基因 玉米作为单子叶C4植物, 在
高等植物中具有独特的特征, 表现在其基因组中
含有3个同源的LFNR基因 , 分别命名为ZmLF-
NR1、ZmLFNR2和ZmLFNR3。这3个LFNR之间有
83%~92%的相似性, 并且在叶片中3种LFNR的含
量大致相同(Okutani等2005)。有趣的是, 3个LFNR
具有不同的膜结合特征(Okutani等2005), 表现在
LFNR1特异地定位在类囊体膜上, LFNR3蛋白作
为非膜结合蛋白 , 只存在于叶绿体基质中 , 而
LFNR2蛋白具有双定位, 既与膜结合, 又存在于叶
绿体基质中。与LFNR1和LFNR2相比 , 虽然
LFNR3在介导电子从NADPH到Fd的非光合电子
传递中效率更高, 但关于LFNR3特异存在于溶解
性的基质中发挥怎样的生理功能还不清楚。另外,
额外添加NH4
+或NO3
-离子, 会诱导LFNR3的表达
(Okutani等2005)。玉米作为C4植物包含不同的参
与光合作用的细胞类型(Schuster等1985)。叶肉细
胞主要负责执行LET, 而维管束鞘细胞PSII的活性
很低, 主要负责执行CET。叶肉细胞和维管束鞘细
胞中都存在膜结合的LFNR, 并且LFNR1/LFNR2的
比值在维管束鞘细胞中更高。而非膜结合LFNR
只存在于叶肉细胞中, 并且LFNR2的含量是最丰
富的(Twachtmann等2012)。这种不同细胞中LFNR
的组成、比例和定位的不同, 主要决定了细胞执
行LET还是CET。LFNR蛋白N-端的结构决定了不
同LFNR与膜结合的活性差异及Tic62或TROL (详
见4.4和4.5小节)把LFNR锚定到类囊体膜上的不同
(Twachtmann等2012)。
2.2 LFNR基因表达调控
虽然许多编码叶绿体定位蛋白的基因都会受
到昼夜节律的调控, 但LFNR的表达并不受其调
控。光照可以通过Ca2+和cGMP依赖的光敏色素转
导途径控制LFNR的表达(Neuhaus等1993, 1997;
Oelmuller等1993; Lubberstedt等1994; Pfannschmidt
等2001)。然而, 光质和光合电子传递链的抑制剂
DCMU (二氯苯基二甲脲)和DBMIB (2,5-二溴-3-
甲基-6-异丙基-对苯醌)对菠菜LFNR的转录水平没
有任何影响(Pfannschmidt等2001)。另外, 高浓度
的硝酸盐处理会诱导编码偏中性LFNR的基因表
达, 但编码偏酸性LFNR的基因表达不会受到外源
氮源的影响(Hanke等2005; Gummadova等2007)。
LFNR的前体蛋白是在细胞质基质中合成的,
在前体蛋白的N-端包含一段叶绿体的转导肽, 这
段转导肽可以介导LFNR转运进入叶绿体(New-
man和Gray 1988)。负责转运叶绿体定位蛋白的装
置主要是由2个膜定位的易位子(translocon)组成
的: 位于叶绿体外膜的Toc和位于叶绿体内膜的
Tic。Tic易位子包含7个功能特异的亚基: Tic10、
Tic40、Tic62、Tic55、Tic32、Tic20和Tic22 (Benz
等2009)。人们普遍认为, 叶绿体定位的蛋白转运
进入叶绿体的过程受到氧化还原水平的调节。在
体外利用影响NAD结合或干扰NAD(P)/NAD(P)H
的化合物来检测不同L F N R的转运情况发现 ,
LFNR1主要在NAD(P)/NAD(P)H的比值较高时转
入叶绿体, 而LFNR2的转运不会受到氧化还原水
平的影响(Kuchler等2002)。另外, 玉米中不同的Fd
和LFNR前体蛋白具有不同的转运特点。例如, FdI
前体需要依赖光照转入叶绿体, 而FdIII和LFNR前
体只有在黑暗中才会转入叶绿体(Hirohashi等
2001)。以上这些结果说明, 随日照的改变, 叶绿体
的氧化水平会发生变化, 这种变化很可能控制着
叶绿体定位的许多蛋白转入叶绿体。因为Tic62本
身具有根据叶绿体氧化还原状态变化而在叶绿体
内膜、类囊体膜和基质中穿梭的特性及其本身所
固有的脱氢酶活性, Tic62一直被认为是Tic易位子
复合体的氧化还原感应器。更有趣的是, Tic62可
以与LFNR紧密互作(Kuchler等2002; Balsera等
2007; Stengel等2008; Benz等2009)。Tic62的N-端
包含结合NAD/NADP的结构域, 而暴露在叶绿体
基质中的C-端包含重复的高度保守的LFNR结合
结构域(Kuchler等2002)。目前, 人们普遍认为,
LFNR对叶绿体内膜上Tic62复合体的作用与叶绿
体定位的蛋白转入叶绿体的氧化还原调节有关。
有趣的是, LFNR与Tic62一样, 都表现为在叶绿体
内膜、类囊体膜和基质之间穿梭, 而这种穿梭正
是由叶绿体内的氧化还原水平控制的 , 所以
Tic62-LFNR的互作也很可能是受到叶绿体的氧化
还原状态影响(Stengel等2008)。综上, 通过叶绿体
氧化还原水平的改变来控制叶绿体前体蛋白的转
运是控制叶绿体定位的蛋白表达的重要途径, 也
可以推断出LFNR作为可以感应叶绿体氧化还原
植物生理学报1358
状态改变的感受器, 在叶绿体定位蛋白转运进入
叶绿体的过程中发挥一定的功能 ( K u c h l e r等
2002)。
LFNR转入叶绿体后的第一步就是在叶绿体
基质中的蛋白酶作用下剪去转导肽(Robinson和El-
lis 1984); 随后, 辅酶FAD结合到LFNR上来保持其
活性结构, 与FAD的结合也是LFNR结合到膜上的
前提条件(Onda和Hase 2004); 最后, 对LFNR酶活
性的调节是通过将LFNR锚定到类囊体膜上来实
现的。虽然不管是在基质中还是在类囊体膜上,
LFNR都可以与Fd结合, 并且具有相同的解离常数,
但体外NADP +的光还原实验证明与膜结合的
LFNR具有更高的酶活性(Forti和Bracale 1984)。然
而, 在拟南芥lfnr1突变体中, LFNR完全丧去了与膜
的结合能力, 所有的LFNR (LFNR2)只存在叶绿体
基质中, 但是lfnr1突变体的很多光合作用表现却跟
野生型差不多(Lintala等2007), 因此可以推断, 叶
绿体基质中的LFNR对光合作用的正常进行是至
关重要的, 而LFNR与膜结合与否对其酶活性来说
并不是关键的决定因素。
3 LFNR在叶绿体中的定位
很早以前, 人们就知道LFNR存在于叶绿体基
质中 , 也有的松散或紧密地与类囊体膜结合
(Bohme 1977; Matthijs等1986)。近来, 人们发现
LFNR也可以通过Tic62结合到叶绿体的内膜上
(Kuchler等2002; Balsera等2007; Stengel等2008)。
因此, LFNR定位于叶绿体的内膜、基质和类囊体
膜上。在拟南芥与膜结合的LFNR中, LFNR1更加
丰富(Hanke和Hase 2008), 尤其是在基质类囊体膜
上(Benz等2009)。然而, LFNR2更多积累在叶绿体
基质中(Hanke和Hase 2008)。对LFNR2来说 ,
LFNR1对其结合到膜上是必需的, 因为在lfnr1突
变体中, 所有的LFNR (LFNR2)仅仅在叶绿体基质
中存在(Lintala等2007)。因此, 可以推测在植物体
内LFNR1与LFNR2很可能是以二聚体的形式存在
的。这种可能性也得到了很多实验的证明, 例如
对LFNR的结构分析(Serre等1996; Morales等1999;
Kurisu等2001; Lintala等2007), 还有许多生物化学
研究表明植物体内存在高分子质量的LFNR复合
体形式(Schneeman和Krogmann 1975; Shin和Oshi-
no 1978; Andersen等1992; Shin 2004)。近来人们还
发现了不包含其他蛋白的LFNR的寡聚物(约330
kDa)形式(Grzyb等2008)。
4 LFNR的互作蛋白
LFNR在类囊体膜上与叶绿体基质间的动态
分布受到光照的调控, 光照下类囊体膜上会释放
一部分LFNR到基质中 , 黑暗下基质中的部分
LFNR则又重新结合到膜上。到目前为止, 虽然对
LFNR的定位及其锚定到类囊体膜上的机制已经
有非常多的研究, 但是关于此问题还是存在很大
的争议。早期的研究表明, LFNR结合到类囊体膜
上是通过特殊的LFNR结合蛋白(base protein和
connectein)。还有很多研究表明, LFNR与许多光
合作用的复合体——细胞色素(cytochrome, Cyt)
b6f复合体、PSI和NAD(P)H脱氢酶[NAD(P)H de-
hydrogenase, NDH]复合体互作, 也有研究表明
L F N R与甘油醛 - 3 -磷酸脱氢酶 ( g l y c e r a l d e -
hyde-3-phosphate dehydrogenase, GAPD)互作或
LFNR直接结合到类囊体膜上。最近几年, 人们发
现了2个新的LFNR互作蛋白Tic62和TROL (图3)。
在拟南芥tic62和trol突变体中, FNR在类囊体膜上
的含量都显著降低; BN (blue native)-gel结果显示,
类囊体膜上的LFNR大分子复合体在2个突变体中
都减少。在tic62trol双突变体中, LFNR总量大大降
低, 并且LFNR在类囊体膜上完全消失, 只在叶绿
体基质中可以被检测到(Lintala等2014)。下面对
LFNR可能的互作蛋白逐一介绍。
4.1 Base蛋白和connectein蛋白
最早期的研究表明LFNR通过一种叫做“bind-
ing”或“base”的蛋白结合到类囊体膜上。Base蛋白
大小为16.5~17.5 kDa, 它可以通过三聚体的形式帮
助LFNR结合到类囊体膜上(Vallejos等1984)。Base
蛋白与16.5 kDa的放氧复合体(oxygen-evolving
complex, OEC) PsbQ (like)蛋白有很高的相似性,
Base蛋白定位于类囊体膜的基质侧, 但PsbQ却是
定位在类囊体腔面, 这似乎是相互矛盾的(Soncini
和Vallejos 1989; Pessino等1994)。然而, 有趣的是,
L F N R有时会与O E C共同纯化出来 ( G r z y b等
2008)。另外, 还有研究认为一种叫做“connectein”
的10 kDa热稳定蛋白可以结合2个分子的LFNR
(Shin 2004)。虽然在没有connectein蛋白的情况下,
LFNR依然可以结合到类囊体膜上, 但是研究认为
杨超等: 高等植物铁氧还蛋白-NADP+氧化还原酶研究进展 1359
connectein蛋白对于指引LFNR结合到类囊体膜的
正确位置是必需的, 因为结合到正确的位置有利
于LFNR获得最大的NADP+光还原酶活性。然而
遗憾的是, 关于该蛋白的分子特征至今仍不清楚
(Shin 2004)。
4.2 光合作用复合体
已有研究表明, LFNR可以与Cyt b6f复合体共
同纯化出来(Clark等1984; Zhang等2001)。虽然额
外添加LFNR并不会影响菠菜Cyt b6f复合体的活
性, 但只有在Fd和LFNR共同存在的情况下, Cyt b6
才能够被NADPH还原(Zhang等2001; Yamashita等
2007)。在体外测定质体醌(plastoquinone, PQ)的还
原实验结果表明, LFNR确实可以为PQ的还原提供
电子, 该过程可能通过NDH复合体(即叶绿体呼吸
作用)或Cyt b6f复合体(即Fd/FQR依赖的CET)进行
(Bojko等2003)。关于LFNR-Cyt b6f复合体形式的
作用和重要性依然存在许多矛盾之处(Breyton等
2006)。除Cyt b6f复合体以外, 也有研究证明LFNR
与PSI的一个亚基PsaE存在互作(Andersen等1992),
但是也有一些研究结果并不支持LFNR与PsaE的
互作(Cassan等2005)。
叶绿体中N D H复合体是由多个亚基构成
(Suorsa等2009), 它在叶绿体呼吸作用和围绕PSI的
CET过程中起作用 (Asada等1992; Ravenel等
1994)。与大肠杆菌的NDH复合体不同, 在蓝藻和
高等植物中的NDH复合体都缺少催化亚基, 也没
有编码催化亚基基因, 因此, 有人推测LFNR可能
会与NDH复合体结合后, 起到催化作用来氧化NA-
DPH。确实有研究发现在土豆和大麦中LFNR与
NDH复合体可以结合在一起(Guedeney等1996;
Quiles和Cuello 1998), 同时又有一些研究不支持两
者可以一直紧密地结合在一起 (Benz等2009 ;
Corneille等1998; Sazanov等1998a), 但是依然不能
排除两者存在瞬时和动态的互作(Benz等2009)。
4.3 GAPD
有研究认为LFNR可能与卡尔文循环中的
GAPD互作, LFNR与GAPD是共定位的, 两者既在
叶绿体基质中又在类囊体膜上共定位 (Negi等
2008)。这样的好处可能是在就近的位置为卡尔文
循环的进行保持充足的NADPH供应。
4.4 Tic62
在南芥中Tic62是由单个核基因(At3g18890)
编码的蛋白, 大小62 kDa, 该蛋白有2个结构和功能
不同的功能域(Kuchler等2002; Stengel等2008; Bal-
sera等2009)。Tic62属于叶绿体内膜Tic复合体的
亚基, 因为其本身所固有的脱氢酶活性以及可以
在叶绿体内膜、类囊体膜和叶绿体基质中穿梭,
该蛋白被认为是Tic复合体的氧化还原感应蛋白。
Tic复合体与叶绿体外膜上的Toc复合体共同作用,
负责将核基因编码的前体蛋白穿过双层叶绿体膜,
进入叶绿体(Kuchler等2002; Stengel等2008; Benz
等2009)。Tic62的N-端含有一个NADPH结合位点,
图3 LFNR与Tic62和TROL互作
Fig.3 LFNR interact with Tic62 and TROL
参考Mulo (2011)文献并修改。LFNR定位在叶绿体内膜、基质和类囊体膜上。在黑暗中, LFNR会在Tic62和TROL的作用下锚定到类
囊体膜和内膜上; 在光照下, Tic62-LFNR、TROL-LFNR复合体解聚, 释放部分LFNR到叶绿体基质中。Pre-TROL表示TROL前体蛋白, Pre-
TROL会部分定位在叶绿体内膜上。
植物生理学报1360
属于保守的NADPH依赖的脱氢酶结构, 而C-端含
有4个由30个氨基酸组成的非完全重复序列, 该序
列包含高度保守的KPPSSP基序(Kuchler等2002;
Balsera等2009)。有趣的是, 研究发现Tic62在类囊
体膜上可以形成大小不等的高分子复合体
(250~500 kDa), 并且Tic62与2个LFNR之间是紧密
互作的(Benz等2009) (图3), 两者的互作就是靠
Tic62 C-端保守的重复序列(Kuchler等2002; Bals-
era等2009)。Tic62结合在LFNR催化亚基的背面,
这样就避免了与Fd或NADP+竞争结合位点(Benz
等2009)。采用Blue Native方法研究发现, LFNR-
Tic62复合体不会与PSI、Cyt b6f复合体或NDH复
合体共同迁移(Benz等2009)。拟南芥tic62突变体
中, LFNR蛋白总量大量减少, 类囊体膜上LFNR-
Tic62高分子复合体完全消失, LFNR形成的高分子
复合体仅剩下了190 kDa的LFNR-TROL复合体(详
见4.5小节)。然而tic62突变体中叶绿体基质中的
LFNR含量反而有所增加(Lintala等2014)。研究还
发现 , 不管哪个LFNR突变 , 类囊体膜上LFNR-
Tic62复合体都会消失, 说明LFNR-Tic62复合体必
须包含LFNR1、LFNR2和Tic62 (Benz等2009)。
tic62突变体中LFNR基因的表达和LFNR前体蛋白
转运进入叶绿体都没有受到影响, 因此推测突变
体中LFNR总量的大量降低是由于LFNR在叶绿体
中的穿梭受到影响及稳定降低的缘故(Benz等
2009)。
关于类囊体膜上Tic62-LFNR复合体的功能,
人们一开始认为该复合体在光合电子传递中起重
要作用, 因为有证据表明与膜结合的LFNR酶活性
更高(Forti和Bracale 1984)。然而, 在tic62突变体中
Tic62-LFNR复合体完全消失, 但与野生型相比, 不
管突变体的表型和还是LET或CET速率等光合作
用参数都没有任何改变(Benz等2009)。这说明
LFNR-Tic62复合体并不是在光合作用过程中起作
用, 而是具有其他功能。有趣的是, 虽然LFNR-
Tic62复合体对光合作用不起作用, 但是该复合体
会受到光照的调控。随着光照的增加会导致
LFNR- Tic62复合体的解聚, 在黑暗中该复合体又
会在类囊体膜上积累(图2)。体外实验也证明, 碱
性条件下会导致LFNR与Tic62的解聚(Benz等
2009)。值得注意的是, Tic62与LFNR的结合可以
显著地稳定LFNR的酶活性(Benz等2009), 并且
LFNR的酶活性在酸性环境要比中性环境下低许
多(Lee等2007)。以上这些结果说明Tic62作为
LFNR的互作蛋白, 主要是在不进行光合作用时(如
夜间)保护LFNR的稳定性(Benz等2009)。
4.5 TROL
在拟南芥中, TROL是类囊体膜上特有的蛋白,
由一个单拷贝核基因(At4g01050)编码, 大小66
kDa, 也有少量未加工的蛋白存在于叶绿体的内膜
上(Juric等2009)。TROL与类囊体膜的结合非常紧
密, 在高盐、尿素或高pH条件下都不能将其从类
囊体膜上洗下来(Juric等2009)。TROL主要含有2
个不同的结构单元: 在蛋白中央位置有一个硫氰
酸酶类似的结构域(rhodanese-like domain); C-端含
有一个富含丝氨酸/脯氨酸的FNR结合序列 , 与
Tic62 C-端的LFNR结合序列高度保守。TROL同
样可以与LFNR在类囊体膜上形成大分子复合体
(图3), 但与LFNR-Tic62复合体(250~500 kDa)相比,
LFNR-TROL复合体(190 kDa)要小得多。这或许
是因为Tic62有4个LFNR结合位点, 而TROL只有一
个。体外实验表明TROL与LFNR的结合强度要比
Tic62与LFNR的结合强度大(Juric等2009), 但当把
拟南芥暴露在强光下, LFNR-TROL复合体要比
Tic62-LFNR复合体解聚得更快(Benz等2009)。
在拟南芥trol突变体中, LFNR的总量减少, 类
囊体膜上LFNR-TROL复合体消失(Juric等2009)。
与tic62突变体不同, trol突变体与野生型相比有明
显的表型(Juric等2009)。trol突变体植株比野生型
稍微小一点, 光合色素的组成没有明显变化。然
而, trol突变体的叶绿体偏小, 形态异常, 类囊体结
构有所破损膨胀。叶绿体结构的异常导致了电子
传递的改变, 表现在: 当trol突变体种植在光强较
低的环境中时, PSII驱动的电子传递速率与野生
型相比并无明显差异 ; 但在高光强 ( 5 0 0 ~ 8 0 0
µmol·m-2·s-1)下, 突变体电子传递速率显著低于野
生型, 同时非光化学猝灭(NPQ)显著提高(Juric等
2009)。这说明与野生型相比, 在trol突变体中, 叶
绿素吸收的光能有较少部分参与到电子传递链中,
更多的能量会通过热能的形式(NPQ)散失掉。
近来的研究结果表明, 在拟南芥tic62trol双突
变体中, LFNR蛋白总量大量减少, 类囊体膜上
杨超等: 高等植物铁氧还蛋白-NADP+氧化还原酶研究进展 1361
LFNR全部消失, LFNR仅存在叶绿体基质中(Linta-
la等2014)。有趣的是, tic62trol双突变体与野生型
相比无任何表型, CO2固定能力也无差别, 这进一
步说明类囊体膜上的LFNR对光合作用来说不是
必需的, 叶绿体基质中的LFNR足够满足光合作用
的需要。然而双突变体中NADPH/NADP+的比率
降低, 苹果酸脱氢酶活性下降, 很多叶绿体代谢过
程都受到了影响, 说明叶绿体处于一种更加氧化
的状态(Lintala等2014)。
5 LFNR的功能
5.1 LFNR在CET中的功能
LFNR最重要的功能就是在光合作用LET过
程中起作用, 为卡尔文循环等过程提供还原力NA-
DPH。但除此以外, 研究表明LFNR也在围绕PSI
的CET过程中起作用(图1-B)。CET对植物正常的
生长发育和抵御逆境是非常重要的。在CET过程
中, 电子从PSI经Fd后又传回给Cyt b6f复合体, 同时
伴随产生跨膜质子梯度。CET只能产生ATP, 不能
合成NADPH (Shikanai 2014)。有研究表明, CET产
生的ATP可以为C4植物细胞提高CO2的浓度提供能
量(Rumeau等2007)。拟南芥pgr5crr2-2双突变体中
CET严重缺陷, 其生长发育受到很大影响, 光合作
用被严重破坏(Munekage等2004), 这说明CET对C3
植物的正常生长发育同样具有非常重要的作用。
目前至少有2条CET途径被报道(Shikanai 2014),
LFNR可能都参与其中。
(1) Fd或Fd-质体醌氧化还原酶(ferredoxin-
plastoquinone oxidoreductase, FQR)依赖的CET途
径。在此途径中, 可能在FQR的作用下电子从Fd
传递到PQ, 然后传递给Cyt b6f复合体, 最后重新传
递给PSI, 但是关于FQR的分子特征至今没有明确
报道(Johnson 2005; Shikanai 2007)。另外, 该途径
会受到抗霉素A (antimycin A)抑制(Shikanai
2014)。迄今为止, 在Fd依赖的CET途径中仅发现
了2个调节蛋白PGR5 (Munekage等2002; Takaba-
yashi等2009)和PGRL1 (DalCorso等2008)。在拟南
芥中已经发现PGRL1可以与LFNR、Fd、PsaD和
Cyt b6互作(DalCorso等2008), 这说明在PGR5、
PGRL1和LFNR协调作用下, Cyt b6f确实可以接受
来自PSI的电子。这些蛋白之间的互作可能是瞬时
的, 因为到目前为止还没有发现它们在类囊体膜
上形成的大分子复合体(Breyton等2006; DalCorso
等2008)。然而, 近年来有人从衣藻(Chlamydomo-
nas reinhardtii)中分离到了类囊体膜上的一个超级
大分子复合体 , 它包括PSI、捕光色素复合体
(LHC) I, LHC II、Cyt b6f、LFNR和PGRL1, 其完
全可以形成能够进行CET的复合体, 但是该复合体
中依然没有发现FQR (Iwai等2010)。早期的研究
还发现, LFNR可以贴在Cyt b6f复合体上(Clark等
1984; Dorowski等2001), 这为LFNR氧化Fd从而为
Cyt b6f复合体提供电子提供了可能(Shahak等1981;
Joliot和Joliot 2002; Laisk等2007)。
(2) NDH复合体依赖的CET途径。在此途径
中, LFNR氧化还原状态的Fd, 将电子交给NADP+,
生成NADPH, 然后NADPH可能被类囊体膜上的
NDH复合体氧化, 将电子交给PQ, 最后重新传递给
PSI (Shikanai 2014)。已经报道NDH复合体本身缺
少催化亚基, LFNR可能会结合到NDH复合体上起
到催化亚基的功能(Guedeney等1996; Endo等1998;
Quiles和Cuello 1998; Quiles等2000)。然而也有研
究认为NDH复合体可以直接氧化Fd (Peng等2008,
2009)。与Fd依赖的CET途径不同, 该途径不会受
到抗霉素A的抑制(Shikanai 2014)。因为NDH复合
体在C3植物的类囊体膜上含量很低, 所以关于正常
条件下NDH复合体依赖的CET途径在C3植物中的
生理功能还存在许多争议(Sazanov等1998b; Joet等
2002)。然而在C4植物维管束鞘细胞中, NDH复合
体含量特别丰富, 而与叶肉细胞相比, 维管束鞘细
胞需要更多的ATP供应, 因此丰富的NDH复合体有
利于保证维管束鞘细胞充足的ATP供应(Shikanai
2007; Majeran和van Wijk 2009)。
5.2 LFNR在抵抗氧化胁迫中的功能
在正常条件下, 植物代谢过程中会不断产生
活性氧(reactive oxygen species, ROS)。在环境胁
迫条件下, ROS产生会倍增。叶绿体是植物体内
ROS产生的重要结构, ROS会导致膜脂过氧化, 严
重时会导致植物死亡。在大肠杆菌中, FNR是ROS
清除所必需的(Bianchi等1995; Krapp等2002)。在
甲基紫腈(一种衰老诱导剂)抗性的衣藻中, 与野生
型相比, LFNR的转录水平明显增强。还有研究发
现, 植物LFNR蛋白可以互补大肠杆菌的氧化压力
敏感突变体(Krapp和Carrillo 1995; Krapp等1997)。
植物生理学报1362
小麦受甲基紫腈诱导后, 超氧自由基大量增
加, H2O2含量升高, 但LFNR的转录并不像衣藻那
样升高, 其LFNR转录水平反而是降低的(Palatnik
等1997)。然而, ROS水平的升高, 导致类囊体膜上
LFNR的大量释放, 随之带来的就是NADP+光还原
能力的下降, 这可能有利于维持植物在氧化胁迫
条降下NADP+/NADPH的平衡(Palatnik等1997)。
近来也有研究发现 , 在干旱胁迫条件下 , 会有
LFNR从类囊体膜上释放(Lehtimaki等2010); 在强
光条件下, 类囊体膜上LFNR的复合体解聚合, 释
放到基质中(Benz等2009)。
在lfnr突变体中, 植物叶片变黄, 光合作用受
到破坏, 最终影响了植物正常的生长发育(Lintala
等2007)。虽然lfnr突变体中NADP(H)的总量没有
显著变化, 但是NADPH/NADP+的比值显著下降
(Hajirezaei等2002; Lintala等2012)。这些突变体由
于自身较高的氧化压力和较差的ROS清除能力, 更
容易受到强光氧化损伤(Palatnik等2003; Hanke和
Hase 2008)。叶绿体内ROS的清除和氧化还原平
衡的维持需要NADPH (Asada 1999), 在这些突变
体中NADPH的浓度明显受到了抑制。总之, 很多
研究已经表明, LFNR在植物抵抗氧化胁迫过程中
起到重要作用, 但是关于LFNR在这些过程中所扮
演的角色需要进一步的研究。
6 结论与展望
近年来, 对植物LFNR蛋白的研究结果为深入
研究光合电子传递过程及植物抵抗氧化胁迫提供
了重要信息。目前已知LFNR锚定到类囊体膜上
主要靠2个蛋白: Tic62和TROL。Tic62和TROL都
含有高度保守的LFNR结合序列, 在黑暗中, Tic62
和TROL将LFNR锚定到类囊体膜上。Tic62-LFNR
复合体不在光合作用过程中起作用, 它的主要作
用是在夜间把LFNR锚定到类囊体膜上保护起来;
而TROL-LFNR复合体会影响光合作用。在光照
下, 类囊体膜上的LFNR复合体会解聚, 释放部分
LFNR到叶绿体基质中。叶绿体基质中的LFNR用
于光合作用产生还原力NADPH, NADPH用于碳固
定、氧化还原水平的调节和其他一些合成代谢过
程中。LFNR可能在围绕PSI的CET中扮演重要角
色。在叶绿体的内膜上, LFNR可能会作为叶绿体
氧化还原状态的感应器, 在调控叶绿体定位的前
体蛋白转运进入叶绿体的过程中起作用。
目前, 关于LFNR参与叶绿体代谢过程的很多
细节还不清楚: 叶绿体内膜或基质中是否存在新
的LFNR互作蛋白; FQR是否真实存在, 其分子特
征是什么; 早期报道的类囊体膜上LFNR结合蛋白
base和connectein是否会结合 (或瞬时结合 )到
LFNR-Tic62或LFNR-TROL复合体中; 类囊体膜定
位的LFNR与叶绿体基质定位的LFNR的不同功
能。植物所处的自然环境每时每刻都在发生着变
化, 在特定环境下, LFNR可能会瞬时地结合到其
他类囊体膜上的大分子复合体(例如Cyt b6f)上, 来
满足叶绿体代谢和光合作用的需要, 该问题也值
得深入研究。关于LFNR蛋白结构的动态变化及
各种LFNR复合体的具体功能是现在也是未来进
一步研究的热点问题。
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