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Rapid detection of cyclic lipopeptide metabolites from Bacillus

芽孢杆菌环脂肽类次生代谢产物的快速检测



全 文 :植物病理学报
ACTA PHYTOPATHOLOGICA SINICA  44(6): 718 ̄722(2014)
收稿日期: 2013 ̄09 ̄22ꎻ 修回日期: 2014 ̄08 ̄02
基金项目: 农业部公益性行业 (农业)科研专项 ( 201003029)ꎻ云南省自然科学基金重点项目 ( 2008CC024)ꎻ云南省科技强省专项
(2009EB060)
通讯作者: 何月秋ꎬ教授ꎬ博士生导师ꎬ主要从事植物病理学及生物农药研究ꎻE ̄mail:ynfh2007@163.comꎮ
doi:10.13926 / j.cnki.apps.2014.06.022
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研究简报
芽孢杆菌环脂肽类次生代谢产物的快速检测
李兴玉1ꎬ3ꎬ 毛自朝2ꎬ 吴毅歆2ꎬ 何月秋1ꎬ2∗
( 1云南农业大学农业生物多样性应用技术国家工程中心ꎬ昆明 650201ꎻ
2云南农业大学农学与生物技术学院ꎬ昆明 650201ꎻ 3云南农业大学基础与信息工程学院ꎬ昆明 650201)
Rapid detection of cyclic lipopeptide metabolites from Bacillus   LI Xing ̄yu1ꎬ3ꎬ MAO
Zi ̄chao2ꎬ WU Yi ̄xin2ꎬ HE Yue ̄qiu1ꎬ2   ( 1National Engineering Center of Application Technologies for Agricultural Di ̄
versityꎬ Yunnan Agricultural University (YAU)ꎬ Kunming 650201ꎬ Chinaꎻ 2Faculty of Agronomy and Biotechnologyꎬ YAUꎬ
Kunming 650201ꎬ Chinaꎻ 3Faculty of Science and Information Engineeringꎬ YAUꎬ Kunming 650201ꎬ China)
Abstract: Cyclic lipopeptides produced by Bacillus are bioactive compounds with the promising application
potential. A study was conducted to detect the secondary metabolites produced by B. amyloliquefaciens FZB42ꎬ
B. subtilis XF ̄1ꎬ B. amyloliquefaciens B9601 ̄Y2 and B. subtilis 168 in situ using MALDI ̄TOF ̄MS. It was
showed that strains FZB42 and XF ̄1 produced fengycinsꎬ surfactins and iturins. Y2 mainly produced fengycins
and iturins. Strain 168 produced a small amount of iturins only. Other four strains of Bacillus secreted surfactins
and iturins. These results suggested that the whole cell in situ MALDI ̄TOF ̄MS is a simpleꎬ rapidꎬ sensitive and
accurate technique for analyzing cyclic lipopeptides from Bacillus.
Key words: whole cellꎻ MALDI ̄TOF ̄MSꎻ fengyicnꎻ furfactinꎻ iturin
文章编号: 0412 ̄0914(2014)06 ̄0718 ̄05
    许多芽孢杆菌能分泌多种抗生素而被用于生
物防治ꎬ其中环脂肽(CLPS)类化合物因其结构多
样和广谱抑菌而倍受关注ꎮ 其结构包括一个环肽
和一条 β ̄羟基或 β ̄氨基脂肪酸支链ꎬ是一类具有
两亲特性的化合物ꎬ在多领域具有开发潜力ꎮ 如表
面活性素(Surfactins)具有超强的表面活性、卓越
的乳化和起泡性ꎬ是目前最好的生物表面活性剂ꎮ
因这类物质具两性特点ꎬ能快速接近并嵌入细胞脂
质层ꎬ在一定剂量下会破坏细胞生物膜的完整性ꎬ
从而具有溶血、抗病毒和抗支原体等活性ꎻ伊枯草
菌素( Iturins)有较强的溶血、抗细菌活性、广谱的
抗丝状真菌和抗酵母活性ꎬ没有抗病毒活性ꎻ丰源
素(Fengycins)的溶血活性弱ꎬ但具有超强抗丝状
真菌活性ꎮ CLPS类物质能不同层次地参与菌体居
群游动、生物膜和子实体形成等复杂的工作网络ꎬ如
表面活性素能影响枯草芽孢杆菌独立鞭毛的蠕动ꎬ
其表面活性减小了表面张力ꎬ从而减小细胞群体移
动摩擦力ꎬ促进枯草芽孢杆菌的有效定殖ꎮ 此外ꎬ表
面活性素和丰源素还可诱导植物产生抗性[1]ꎮ
    本研究利用 MALDI ̄TOF ̄MS 全细胞原位技
术检测了 8株芽孢杆菌ꎬ其中 4个菌株的基因及次
生代谢产物研究已较为透彻ꎬ分别为生防菌 Bacil ̄
lus amyloliquefaciens FZB42 ( FZB42)ꎬ B. subtilis
XF ̄1 (XF ̄1)ꎬ B. amyloliquefaciens Y2 (Y2)和枯草
芽孢杆菌模式菌株 B. subtilis 168 (B168)ꎮ 旨在证
实并推广MALDI ̄TOF ̄MS 全细胞原位检测技术作
 
  6期 李兴玉ꎬ等:芽孢杆菌环脂肽类次生代谢产物的快速检测
为一种简单、快速、准确、灵敏的环脂肽化合物检测
方法ꎬ为生防芽孢杆菌防病机制研究提供技术支撑ꎮ
1  材料与方法
1.1  菌株
    4个对照菌株:B168(模式菌株)ꎬ其基因序列
包含环脂肽化合物合成基因ꎬ但是野生型菌株不产
丰源素和表面活性素ꎬ其他脂肽类化合物产量也很
低[2]ꎻFZB42为植物根际促生防病细菌ꎬ是德国洪
堡大学用于生产“德国根宝(RhizoVital® 42)”产
品的菌株ꎬ其次生代谢产物主要含有表面活性素
(脂肪酸链由 13~15个碳原子组成ꎬ文章中均标记
为 C13~15的格式)、丰源素 A (C15~17 )、丰源素 B
(C15~17)和杆菌抗霉素 D (Bacillomycin D C14~17)
及聚酮类化合物[3]ꎻXF ̄1 和 Y2 为本实验室的专
利菌株ꎬXF ̄1具有很好防治十字花科根肿病的能
力ꎬ其次生代谢产物主要包括丰源素 A (C14~19)
[4]ꎬ 表 面 活 性 素 ( C13~17 ) 和 伊 枯 草 菌 素 C
(C15ꎬ17~18)ꎮ Y2 具有促进植物生长ꎬ插条生根ꎬ抑
制真菌性、细菌性和线虫性病害的作用ꎮ 有 9个基
因簇参与合成脂肽化合物杆菌抗霉素 D 和丰源
素、聚酮化合物杆菌烯 ( Bacillaene)、地菲西丁
(Difficidin)和大环内酯(Macrolactin)ꎬ以及二肽溶
杆菌素(Bacilysin)等次生代谢产物[5]ꎮ
    4 个测试菌株: Bacillus sp. 041ꎬBacillus sp.
285ꎬBacillus sp. 355和 Bacillus sp. 033(以下分别
称为 B041ꎬ B285ꎬ B355和 B033)均为本实验室分
离保存的生防菌株ꎮ
1.2  培养基
    LB培养基和 Landy培养基ꎮ
1.3  试剂与仪器
    乙腈(色谱纯)ꎬ三氟醋酸(TFA) (色谱纯)ꎬ
α ̄氰基 ̄4 ̄羟基肉桂酸(CHCA)(色谱纯)ꎬ重蒸水ꎮ
    基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱仪:
Bruker Autoflex Speed MALDI ̄TOF ̄MS ( Bruker
Daltonicsꎬ Billericaꎬ MAꎬ USA)、高压灭菌锅、冷
冻离心机、恒温摇床、冰箱、超净工作台ꎮ
    提取溶剂配制:70 mL 乙腈加入 0.1 mL TFA
定容至 100 mLꎮ
    辅助基质溶液配制:常温下 CHCA 溶于提取
溶剂配成饱和溶液ꎮ
1.4  菌株培养
    将各芽孢杆菌菌株划线于 LB 固体培养基上
37℃恒温培养 24 hꎬ活化后的各菌株按 5%接种于
LB液体培养基中ꎬ30℃ꎬ180 rpmꎬ振荡培养 24 hꎬ
作为一级种子液ꎬ按 5%接种于 Landy 培养基ꎬ同
样条件下培养二级种子液ꎬ后者以无菌水稀释后涂
布于 Landy固体培养基 37℃恒温培养 48 hꎮ
1.5  MALDI ̄TOF ̄MS检测
    各芽孢杆菌挑取 2个单菌落于目标板孔靶上ꎬ
加 2 μL提取溶剂、2 μL 辅助基质混匀ꎬ自然风干
后 MALDI ̄TOF ̄MS检测ꎮ 仪器参数为:反射操作
模式ꎬ正离子检测ꎬ检测范围 100 ~ 2 000 Daꎬ激光
点击数每图谱 50ꎬ激光频率 30.0 Hzꎬ离子源加速
电压 20 kVꎬ反射电压 23.5 kV脉冲离子ꎮ
2  结果与分析
    图 1展示了 8株芽孢杆菌经 MALDI ̄TOF ̄MS
检测所得的 CLPs 化合物的质谱图 (m / z 800 ~
2 000)ꎬ表面活性素和伊枯草菌素的分子离子峰集
中于 m / z 1 000~1 100ꎻm / z 1 400~1 500属于丰源
素化合物信号ꎬ如图 1中 FZB42所示ꎬm/ z (1 031.8ꎬ
1 053.5ꎬ 1 069.5ꎻ 1 067.5ꎬ 1 083.5ꎻ 1 081.5ꎬ 1 097.5ꎻ
1 095.5ꎬ 1 111.6ꎻ 1 109.5ꎻ 1 063.6ꎻ 1 099.6)为伊枯
草菌素家族的化合物C11Bacillomycin D ([M+H]
+ꎬ
[M+Na] +ꎬ [M+K] +)ꎻC1 2杆菌抗霉素 D ([M+
Na] +ꎬ [M+K] +)ꎻC13杆菌抗霉素 D ([M+Na]
+ꎬ
[M+K] +)ꎻC1 4杆菌抗霉素 D ([M+Na]
+ꎬ [M+
K] +)ꎻC15杆菌抗霉素 D ([M+Na]
+)ꎻC14杆菌抗
霉素 LC ([M+H] +)和 C15杆菌抗霉素 LC ([M+
Na] +)ꎮ m / z (1 030.6ꎬ 1 046.6ꎻ 1 044.6ꎬ 1 060.6ꎻ
1 058.7ꎬ 1 074.6ꎻ 1 088.7)为表面活性素家族的化
合物 C11表面活性素([M+Na]
+ꎬ [M+K] +)ꎻ C12
表面活性素([M+Na] +ꎬ [M+K] +)ꎻ C13表面活性
素([M+Na] +ꎬ [M+K] +)ꎻ C1 4表面活性素([M+
K] +)ꎬ但是ꎬ由于该族化合物存在多种同分异构现
象ꎬ如 C11 表面活性素ꎬ C10 Esprinꎬ C10 地衣素
(Lichenysin)BꎬC10Pumilacidin 和 C19Bamylocin A
为一组同分异构体[1]ꎬ因此不能确定为何种结构ꎬ
便于叙述ꎬ表 1中记为表面活性素ꎮ m / z (1 473.7ꎬ
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植物病理学报 44卷
Fig. 1  Ms Chromatograms of cyclic lipopeptides from eight Bacillus
strains by whole cell in situ MALDI ̄TOF ̄MS
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  6期 李兴玉ꎬ等:芽孢杆菌环脂肽类次生代谢产物的快速检测
Table 1  Iturinsꎬ fengycins and surfactins from Bacillus strains
m / z Ionic type Compound B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8
( Iturins) [1 ꎬ 3]
1 031.8ꎬ 1 053.5ꎬ 1 069.5 [M+H] +ꎬ [M+Na] +ꎬ [M+K] + Bacillomycin D (C11) + + + +
1 067.5ꎬ 1 083.5 [M+Na] +ꎬ [M+K] + Bacillomycin D (C12) + + + + +
1 081.5ꎬ 1 097.5 [M+Na] +ꎬ [M+K] + Bacillomycin D (C13) + + +
1 095.5ꎬ 1 111.6 [M+Na] +ꎬ [M+K] + Bacillomycin D (C14) + + +
1 109.5 [M+Na] + Bacillomycin D (C15) +
1 066.7ꎬ 1 082.6 [M+Na] +ꎬ [M+K] + Itutin C (C11) + +
1 080.7ꎬ 1 096.6 [M+Na] +ꎬ [M+K] + Itutin C (C12) + + + +
1 094.6 [M+Na] + Itutin C (C13) +
1 136.6 [M+Na] + Itutin C (C16) +
1 150.6 [M+Na] + Itutin C (C17) +
1 063.6 [M+H] + Bacillomycin LC (C14) +
1 099.6 [M+Na] + Bacillomycin LC (C15) + +
1 098.6ꎬ 1 120.6 [M+H] +ꎬ [M+Na] + Itutin C (C15含一个双键) + +
1 112.6ꎬ 1 134.6 [M+H] +ꎬ [M+Na] + Itutin C (C16含一个双键) + + + +
(Fengycins) [1ꎬ 3ꎬ 4]
1 473.7ꎬ 1 435.8ꎬ 1 457.8 [M+K] +ꎬ [M+H] +ꎬ [M+Na] + Fengycin A (C1 4) + + +
1 449.8ꎬ 1 487.7ꎬ 1 471.7 [M+H] +ꎬ [M+K] +ꎬ [M+Na] + Fengycin A (C15) + + +
1 463.8ꎬ 1 485.8ꎬ 1 501.7 [M+H] +ꎬ [M+Na] +ꎬ [M+K] + Fengycin A (C16) + + + + +
1 477.8ꎬ 1 499.8ꎬ 1 515.6 [M+H] +ꎬ [M+Na] +ꎬ [M+K] + Fengycin A (C17) + + + + +
1 491.9ꎬ 1 513.8ꎬ 1 529.8 [M+H] +ꎬ [M+Na] +ꎬ [M+K] + Fengycin A (C18) + + + +
1 505.8ꎬ 1 527.8ꎬ 1 543.8 [M+H] +ꎬ [M+Na] +ꎬ [M+K] + Fengycin A (C19) + + + +
1 519.7ꎬ 1 557.8 [M+H] +ꎬ [M+K] + Fengycin A (C20) + +
1 533.8ꎬ 1 571.8 [M+H] +ꎬ [M+K] + Fengycin A (C21) + +
1 547.8 [M+H] + Fengycin A (C22) +
(Surfactins) [1ꎬ 3]
1 030.6ꎬ 1 046.6 [M+Na] +ꎬ [M+K] + Surfactin (C11) + + + + +
1 044.6ꎬ 1 060.6 [M+Na] +ꎬ [M+K] + Surfactin (C12) + + + + +
1 058.7ꎬ 1 074.6 [M+Na] +ꎬ [M+K] + Surfactin (C13) + + + + +
1 088.7 [M+K] + Surfactin (C14) + + + + +
1 102.7 [M+K] + Surfactin (C15) + + + +
  Note: B1  ̄B8 means B. amyloliquefaciens FZB42ꎬ B. subtilis XF ̄1ꎬ B. amyloliquefaciens B9601 ̄Y2ꎬ B. subtilis 168ꎬ B041ꎬ
B285ꎬ B355 and B033ꎬ respectively.
  “+”means that the compound was detected and the blank means no signal in this strain.
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植物病理学报 44卷
1 435. 8ꎬ 1 457. 8ꎻ 1 449. 8ꎬ 1 487. 7ꎬ 1 471. 7ꎻ
1 463.8ꎬ 1 485. 8ꎬ 1 501. 7ꎻ 1 477. 8ꎬ 1 499.8ꎬ
1 515.6ꎻ 1 491. 9ꎬ 1 513. 8ꎬ 1 529. 8ꎻ 1 505.8ꎬ
1 527.8ꎬ 1 543. 8ꎻ 1 519. 7ꎬ 1 557. 8ꎻ 1 533.8ꎬ
1 571.8)为丰源素家族的化合物ꎬ该族化合物也存
在多种同分异构现象 (丰源素 Aꎬ Bꎬ Cꎬ E 和
S) [4]ꎬ便于叙述ꎬ记为丰源素 Aꎬ以上信号对应 C14
~ C21丰源素 A的分子离子峰[M+K]
+ꎬ [M+H] +
和[M+Na] +ꎮ 其余菌株的 CLPs 化合物如表 1 所
示ꎬ其中对照菌株 FZB42ꎬ XF ̄1ꎬ Y2 和 B168 检测
结果与文献报道一致ꎬ尤其是野生型 B168ꎬ已证明
其不产丰源素和表面活性素ꎬ其它脂肽也很少[2]ꎮ
本次研究中仅检测到 1个伊枯草菌素分子ꎬ与文献
报道完全吻合ꎬ这充分证明用 MALDI ̄TOF ̄MS 全
细胞原位检测芽孢杆菌的环脂肽类化合物真实可
靠ꎮ
    B041、B285、B355 和 B033 与 FZB42、XF ̄1和
Y2相比ꎬ它们抑制三七根腐病活性相对较弱(抑
制结果未展示)ꎮ 通过 MALDI ̄TOF ̄MS 图谱分析
发现(图 1)ꎬB041、B285、B355和 B033缺少了 m / z
1 400~ 1 500 的信号或信号很弱ꎬ说明不产或少产
丰源素类化合物ꎬ而这类化合物对真菌有较强的生
防活性ꎬ尤其是对丝状真菌活性最强ꎮ 这也许是 4
个测试菌株生防活性相对较弱的原因之一ꎮ
3  讨论
    芽孢杆菌的生防活性与 CLPs 类抗生素有关ꎬ
甚至称其为“生防多功能武器” [1]ꎬ快速准确地检
测这一“武器”显得尤为重要ꎮ MALDI ̄TOF ̄MS
具有灵敏度高、准确性高及分辨率高等特点ꎬ在生
命科学等领域的研究中起着越来越重要的作用ꎬ如
肽质量指纹谱蛋白质鉴定ꎬ快速测定分析寡核苷
酸ꎬ代谢产物微生物逆向鉴定法等等ꎮ 该方法近些
年来被应用于微生物次生代谢产物定性研究已获
得了许多成果ꎮ 本文利用该技术结合全细胞原位
分析法检测了 8株生防芽孢杆菌的次生代谢产物ꎬ
在 m / z 800~2 000获得了清晰的 CLPs化合物分子
离子峰信号(如图 1 所示)ꎬ可以快速定性判断表
面活性素ꎬ伊枯草菌素和丰源素类化合物ꎮ 该方法
无需发酵、提取、分离纯化等过程ꎬ可以直接测定细
胞单菌落ꎬ其过程简单快速ꎬ灵敏度高ꎮ 但由于芽
孢杆菌环脂肽类化合物结构变化多样ꎬ存在多种同
分异构体[1]ꎬ仅从 MALDI ̄TOF ̄MS 检测结果ꎬ不
能鉴定此类化合物ꎬ如 m / z 1030.6 可能是 C11表面
活性素ꎬC10EsprinꎬC10地衣素 BꎬC10Pumilacidin 或
是 C9Bamylocin Aꎬ若想获得结构信息ꎬ需进一步
测定其二级质谱ꎬ通过碎片离子峰来鉴定化合物结
构ꎮ 其次ꎬ该技术应用于环脂肽类化合物分析准确
可靠ꎬ不受辅助基质的干扰ꎬ但应用于次生代谢产
物系统分析存在局限ꎬ如 m / z 500以下的信号受基
质信号干扰很难被利用ꎻ水溶性强、易扩散至培养
基或发酵液中的化合物很难被检测到ꎬ如聚酮化合
物[3]ꎮ
参考文献
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责任编辑:李晖
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