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The Xanthomonas campestris pv. vesicatoria flagellin FliCxcv functions as a PAMP to trigger immunity responses in rice leaves

鞭毛素蛋白FliCxcv对水稻免疫反应的诱导功能鉴定



全 文 :植物病理学报
ACTA PHYTOPATHOLOGICA SINICA  45(2): 151 ̄157(2015)
收稿日期: 2014 ̄03 ̄11ꎻ 修回日期: 2014 ̄12 ̄19
基金项目: 国家“863”计划项目(2012AA101504)ꎻ国家“973”计划项目(2011CB100700)
通讯作者: 何晨阳ꎬ研究员ꎬ主要从事分子植物病理学研究ꎻE ̄mail: cyhe@caas.net.cn
共同第一作者: 刘维振ꎬ男ꎬ博士研究生ꎬ研究方向为植物抗病性分子机制ꎻE ̄mail: weizhen510@163.comꎻ
陈华民ꎬ 男ꎬ博士ꎬ硕士生导师ꎬ 研究方向为植物抗病性分子机制ꎻE ̄mail: hmchen@ ippcaas.cnꎮ
doi:10.13926 / j.cnki.apps.2015.02.005
鞭毛素蛋白 FliCxcv对水稻免疫反应的诱导功能鉴定
刘维振1ꎬ 2#ꎬ 陈华民2#ꎬ 于 清2ꎬ 田 芳2ꎬ 唐嘉义1ꎬ 何晨阳2*
( 1云南农业大学植物保护学院 云南省植物病理重点实验室ꎬ昆明 650201ꎻ
2中国农业科学院植物保护研究所ꎬ植物病虫害生物学国家重点实验室ꎬ北京 100193)
摘要:为揭示来源于番茄细菌性斑点病菌(Xanthomonas campestris pv. vesicatoriaꎬ Xcv)菌株 XV18鞭毛素(FliCxcv)作为一
种病原相关分子模式(PAMP)诱导水稻免疫反应的功能ꎬ本研究对 FliCxcv编码基因 flicxcv进行了基因克隆、序列分析、原
核表达、蛋白纯化和诱导活性测定ꎮ 结果表明ꎬ通过 PCR特异性扩增ꎬ从 Xcv菌株 XV18中克隆了 1 200 bp的 fliCxcv基因
片段ꎬ其序列与 GenBank中己测序菌株的完全一致ꎮ 在大肠杆菌中对该基因全长、N端和 C端截短序列进行了原核表达ꎬ
并获得了纯化的 FliCxcv全长及其截短蛋白ꎮ 将纯化蛋白浸润接种到水稻品种日本晴叶片组织ꎬ发现 FliCxcv全长及其截
短蛋白均能诱导水稻叶片细胞死亡、H2O2产生以及防卫基因(OsPAL 和 OsPR1b)表达等免疫反应ꎬ但诱导活性存在差异ꎮ
因此ꎬ本研究验证了 FliCxcv具有激发水稻细胞免疫反应的 PAMP功能ꎬ为水稻免疫诱导制剂的研发提供了材料ꎮ
关键词:番茄细菌性斑点病菌ꎻ 鞭毛素ꎻ 病原相关分子模式ꎻ 水稻ꎻ 免疫反应
The Xanthomonas campestris pv. vesicatoria flagellin FliCxcv functions as a PAMP
to trigger immunity responses in rice leaves  LIU Wei ̄zhen1ꎬ 2ꎬ CHEN Hua ̄min2ꎬ YU Qing2ꎬ
TIAN Fang2ꎬ TANG Jia ̄yi1ꎬ HE Chen ̄yang2   ( 1Yunnan Province Key Laboratory of Plant Pathologyꎬ Faculty of Plant
Protectionꎬ Yunnan Agricultural Universityꎬ Kunming 650201ꎬ Chinaꎻ 2 State Key Laboratory for Biology of Plant Disease and
Insect Pestsꎬ Institute of Plant Protectionꎬ Chinese Academy of Agricultural Sciencesꎬ Beijing 100193ꎬ China)
Abstract: To elucidate whether the flagellin (FliCxcv) from Xanthomonas campestris pv. vesicatoria(Xcv) act
as a PAMP to induce PTI (PAMP ̄triggered ̄immunity) in riceꎬ the gene cloningꎬ sequence analysisꎬ prokaryotic
expressionꎬ protein purification and PAMP activity assay of FliCxcv and truncated proteins were performed in
this study. The results show that the fliCxcv gene was cloned through PCR specific amplication from the genomic
DNA of Xcv strain XV18ꎬ the sequence of which is identical to that of the sequenced strain in the GenBank.
Moreoverꎬ the full ̄lengthꎬ N ̄ and C ̄terminal domains were expressed in Escherichia coli respectively and
purified to get FliCxcv and truncated proteins FliCxcv ̄N and FliCxcv ̄C. The immunity responses including
hypersensitive cell deathꎬ H2O2production and expression of defense ̄related genesꎬ such as OsPAL and OsPR1b
were observed in rice leave tissues infiltrated by these purified proteins. These results suggested that Xcv flagellin
was an effective PAMP to elicit PTI in riceꎬ which can be used for the development of novel inducing agent of
rice disease resistance.
Key words: Xanthomonas campestris pv. vesicatoriaꎻ flagellinꎻ PAMPsꎻ riceꎻ immunity response
中图分类号: S432.42          文献标识码: A          文章编号: 0412 ̄0914(2015)02 ̄0151 ̄07
 
植物病理学报 45卷
    在与病原物长期互作中ꎬ植物进化出由病原物
相关分子模式(PAMPs)激发的免疫反应(PTI)和
效应子激发的免疫反应(ETI)的 2 种先天免疫反
应[1ꎬ2]ꎮ PAMPs是微生物中相对保守的结构或分
子ꎬ近年来分离和鉴定的主要有鞭毛素、几丁质、脂
多糖和延伸因子 EF ̄Tu 等[3ꎬ4]ꎮ 其中研究比较深
入的是鞭毛素和 ET ̄Tu 以及它们的相关受体及其
介导的 PTI途径[5~7]ꎮ
    鞭毛素是组成细菌鞭毛丝的亚基ꎬ可作为一种
PAMP诱发植株的防卫反应[8]ꎮ 例如ꎬ丁香假单胞
鞭毛素能够诱导番茄细胞介质碱化、烟草植株产生
过敏性坏死反应[9ꎬ10]ꎮ 水稻非致病菌的鞭毛素也
可诱导水稻细胞产生类似免疫反应[11ꎬ12]ꎮ 作为一
种 PAMPꎬ非致病菌鞭毛素将为植物诱导免疫制剂
的研发提供更多的选择材料ꎮ 鞭毛素具有特定的
活性位点和识别机制来诱导植物 PTIꎮ 例如ꎬ铜绿
假单胞鞭毛素蛋白 N端 22 个氨基酸(Flg22)能够
比全长蛋白更好地诱导拟南芥和番茄等植物细胞
PTIꎬ这样的类似结构域被认为是鞭毛素活性中
心[13]ꎮ 然而ꎬ丁香假单胞 Flg22 虽能高效地诱导
十字花科植物免疫反应ꎬ但诱导水稻悬浮细胞产生
PTI的能力较弱[14]ꎮ 燕麦嗜酸菌水稻不亲和亚种
菌株 N1141鞭毛素能引起水稻 PTIꎬ然而 Flg22 却
缺乏此诱导功能[12]ꎮ 一般认为ꎬ鞭毛素诱导水稻
PTI反应机制与诱导拟南芥等植物的不同ꎬ水稻细
胞免疫反应的诱导活性中心也有可能存在于 Flg22
区域以外[15]ꎮ
    番茄细菌性斑点病菌(Xanthomonas campes ̄
tris pv. vesicatoriaꎬ Xcv)是水稻上的一种不亲和
病菌ꎮ 至今尚不清楚 Xcv鞭毛素(FliCxcv)是否具
有 PAMP功能、诱导水稻细胞免疫反应ꎮ 本研究
分析了 FliCxcv 蛋白对水稻细胞防卫反应的诱导
能力ꎬ探讨该蛋白 N 端和 C 端不同结构域的免疫
活性ꎬ为进一步探究其对植物抗病性诱导的作用机
理以及研发水稻免疫诱导制剂提供了科学依据ꎮ
1  材料与方法
1.1  供试细菌菌株、培养条件和试剂
    Xcv菌株 XV18和水稻品种日本晴(本实验室
保存)ꎻ大肠杆菌(Escherichia coli)DH5α 和 BL21
(北京天根生化科技有限公司)ꎻ克隆质粒 pMD ̄
18T (TaKaRa 公司)ꎻ表达载体 pCold ̄SUMO (哈
尔滨海基生物公司)ꎮ
    Xcv菌株在 28 ℃下 KB培养基(蛋白胨 20 g /
L、甘油 10 mL / L、K2HPO41.5 g / L、MgSO4􀅰7H2O
1.5 g / L)上培养ꎻE.coli 菌株在 37℃下 LB 培养基
(蛋白胨 10 g / L、酵母提取物 5 g / L、NaCl 10 g / L)
上培养ꎮ 抗生素种类和浓度:卡那霉素(Kan)为
50 μg / mL、氨苄青霉素(Amp)为 50 μg / mLꎮ
    TaqTM DNA 聚合酶、高保真酶 Prime STAR
Max DNA Polymerase、T4 DNA ligase 和各种限制
性内切酶(TaKaRa 公司)ꎻ胶回收试剂盒、核酸和
蛋白 Marker (北京天根生化科技有限公司)ꎻBCA
蛋白定量试剂盒(康为生物公司)ꎻ蛋白纯化 Ni ̄
SepharoseTM填料 (GE 公司)ꎮ PCR 仪和电泳仪
(Bio ̄Rod公司)ꎻ酶标仪(Thermo公司)ꎻ超声波破
碎仪 VCX750(Sonic 公司)ꎻ用 Primer premier 5.0
软件设计特异性引物(表 1)ꎬ引物均由北京华大基
因生物公司合成ꎮ
1.2  基因克隆及其序列分析
    根据 Xcv 己测序菌株 XV85 ̄10 基因组序列
(登录号 AM039952.1)中鞭毛素基因全长序列、N
端和C端结构域序列ꎬ设计和使用不同的特异性
Table 1  Primers used in the study
Primer Sequence (5′ ̄3′) Restriction enzyme Product
fliCxcv ̄F1 CGGGATCCATGGCACAGGTAATCAACACC BamH I fliCxcv
fliCxcv ̄R1 GCTCTAGATTACTGCAGCAGGCTCAGCA Xba I
fliCxcv ̄F1 CGGGATCCATGGCACAGGTAATCAACACC BamH I fliCxcv ̄N
fliCxcv ̄R2 GCTCTAGATTAGAACGACAGGCTGATGCCG Xba I
fliCxcv ̄F2 CGGGATCCATGAAGGACGCCAGCGGTTCG BamH I fliCxcv ̄C
fliCxcv ̄R1 GCTCTAGATTACTGCAGCAGGCTCAGCA Xba I
  Restriction enzyme sites are in bold text.
251
 
  2期 刘维振ꎬ等:鞭毛素蛋白 FliCxcv对水稻免疫反应的诱导功能鉴定
引物(表 1)ꎬ以 XV18 菌株基因组 DNA 为模板ꎬ
PCR扩增全长基因片段 fliCxcv、N 端结构域片段
fliCxcv ̄N与 C 端结构域片段 fliCxcv ̄Cꎮ 用 1%琼
脂糖凝胶电泳检测 PCR扩增产物ꎮ 扩增产物纯化
后ꎬ连接至克隆载体 pMD18 ̄Tꎮ 将重组质粒
pMD18 ̄T ̄fliCxcv、 pMD18 ̄T ̄fliCxcv ̄N 和 pMD18 ̄
T ̄fliCxcv ̄C分别转化 E. coli 菌株 DH5α 感受态细
胞ꎬ获得阳性质粒ꎬ测序确认ꎮ
    使用 NCBI GenBank 数据库对 fliCxcv 基因和
蛋白序列同源性进行分析ꎻ通过 SMART 和 CDS
分析蛋白结构ꎻ序列分析采用软件 DNAStar 7.1 和
DNAMAN 6.0ꎻ聚类分析采用 MEGA 4.0软件ꎮ
1.3  原核表达载体构建和蛋白质分离纯化
    将经 BamH I / Xba I 酶切后获得的 fliCxcv、
fliCxcv ̄N和 fliCxcv ̄C 片段ꎬ分别连接到表达载体
pCold ̄SUMO上ꎬ构建重组表达载体ꎬ转化 E. coli
菌株 BL21(DE3)感受态细胞ꎮ 获得阳性转化子ꎬ
测序确认ꎮ
    接种单菌落于 5 mL LB(Amp)培养基中ꎬ在
37℃下培养过夜(200 r / min)ꎻ然后转接到 500 mL
相同培养基中培养生长ꎻ 收集菌体、用 PBS溶液悬
浮、加入蛋白酶抑制剂、超声波破碎、收集上清液ꎮ
用 Ni ̄SepharoseTM纯化蛋白ꎬ用 100 mmol / L 咪唑
溶液洗脱ꎬSDS ̄PAGE 检测ꎮ 用 Western blot 进行
验证ꎮ 纯化蛋白分别用 Tris ̄HCl (pH 8.0)置换出
咪唑ꎬ超滤浓缩、定量ꎮ
1.4  水稻叶片诱导处理及其细胞死亡和 H2O2产
生的检测
    将 2 μmol / L纯化蛋白用 1 mL 无针头注射器
浸润接种到苗龄 14 d 的水稻叶片ꎬ以 10 mmol / L
Tris ̄HCl (pH 8.0) 缓冲液作为对照ꎮ
    参照文献[16]方法检测叶细胞过敏性坏死反
应ꎮ 取样接种 24 h 的叶片组织ꎬ置于台酚蓝溶液
(10 mg台酚蓝、20 mL 乙醇、10 mL Tris 饱和酚、10
mL乳酸、10 mL水)ꎬ煮沸 3 minꎬ之后用 2.5 mg / mL
的水合氯醛溶液脱色至叶片底色显白后ꎬ用清水洗
涤ꎬ在光学显微镜(Olympus SZX16)下观察ꎮ
    参照文献[17]方法检测H2O2产生ꎮ 取样接种 24
h的叶片组织ꎬ置于 DAB染色液中(1 mg / mLꎬ0.01%
Triton ̄X ̄100)染色ꎬ在低真空压力下处理 2 h左右后ꎬ
在室温下放置过夜ꎮ 将叶片放在乙醇 ̄乳酸 ̄酚
(95%乙醇 ∶ 乳酸 ∶ 苯酚)2 ∶ 1 ∶ 1、65℃水浴 30 minꎬ
用水合氯醛(2.5 mg / mL)脱色至叶片透明ꎬ用清水洗
涤ꎬ在光学显微镜(Olympus SZX16)下观察ꎮ
1.5  水稻防卫基因表达的 qRT ̄PCR检测
    参照文献[18]方法对接种 24 h的水稻叶片进
行总 RNA的提取和反转录ꎮ 用 Primer premier 5.0
软件对水稻防卫基因进行引物设计(表 2)ꎮ 按照
IQSYBR􀅹 Green Supermix 试 剂 盒 ( Bio ̄Radꎬ
USA)方法[19]ꎬ用 iCycler IQTM实时定量 PCR 仪
(Bio ̄RadꎬUSA)进行荧光定量 PCR(qRT ̄PCR)的
检测ꎮ 参照文献[20] 的方法ꎬ以 OsActin 基因为
内标参照ꎬ对水稻防卫基因表达进行定量分析ꎮ 靶
基因相对表达量 = 2-ΔΔCtꎬ其中 ΔΔCt = (Cttarget -
CtOsA ctin)Time X-(Cttarget -CtOsA ctin)Time 0ꎬCt 为荧
光阈值ꎮ 釆用 SAS 假设检验的配对法ꎬ对定量分
析数据进行 t检验ꎬ分析样品与对照间的差异显著
性(P < 0.05)ꎮ
2  结果与分析
2.1  fliCxcv基因克隆和序列鉴定
    通过 PCR特异性扩增ꎬ从菌株 XV18中获得
Table 2  Primers used for qRT ̄PCR assays for expression of rice defense genes
Gene Primer sequence (5′ ̄3′) Product length / bp
OsPAL
CATCCAGGGCGGCTTCTTCG
CCGGGTGGTGCTTCAGCTTGT
213
OsPR1b
CGATCAGCGCCCTTACTAGC
ACACACAATCCGGCTACATAGAT
207
OsActin
AAGGATCTATATGGCAACATCG
ATCCACATCTGCTGGAATGTG
201
351
 
植物病理学报 45卷
了 fliCxcv基因全长片段ꎮ 经回收纯化后ꎬ连接克
隆载体 pMD18 ̄Tꎬ构建质粒 pMD18 ̄T ̄fliCxcvꎮ 测
序分析表明ꎬ其序列与 GenBank 中 Xcv 己测序菌
株的序列完全一致ꎮ 进一步以此基因片段为模板ꎬ
克隆了 N 端和 C 端序列片段ꎮ 构建了质粒
pMD18 ̄T ̄fliCxcv ̄N和 pMD18 ̄T ̄fliCxcv ̄Cꎬ并测序
验证ꎮ 生物信息学分析表明ꎬ fliCxcv 全长基因
(1 200 bp)编码蛋白由 399个氨基酸组成ꎬ预测分
子量大小为 43.89 kDꎬ具有 Flagellin_N、Flagellin_
IN和 Flagellin_C 3个保守结构域(图 1 ̄A)ꎮ
Fig. 1  Domain analysis of FliCxcv (A)ꎬ phylogenetic analysis of FliC
(B) and flg22 homology analysis (C) from different bacterial strains
451
 
  2期 刘维振ꎬ等:鞭毛素蛋白 FliCxcv对水稻免疫反应的诱导功能鉴定
    通过系统进化分析ꎬ来源不同病原细菌的 FliC
可聚类为黄单胞、燕麦嗜酸菌、铜绿假单胞和丁香
假单胞 4类ꎮ FliCxcv 序列与水稻白叶枯病菌(X.
oryzae pv. oryzaeꎬ Xoo)和十字花科黑腐病菌(X.
campestris pv. campestrisꎬ Xcc)的同源性最高ꎬ与
燕麦嗜酸菌(Acidorvorax avenaeꎬ Aa)的亲缘关系
较远ꎬ与丁香假单胞菌(Peudomonas syringeꎬ Ps)
的亲缘关系最远(图 1 ̄B)ꎮ
    进一步将 XV18 中 FliCxcv 的 flg22 与其他不
同细菌菌株的进行了序列比对分析ꎬ发现 XV18 与
Xoo 菌 株 ( PXO99A、 MAFF311018 和
KACC10331)、Xcv 菌株(XV5 和 XV85 ̄10)中的
flg22 序 列 完 全 相 同ꎻ 与 Xcc 菌 株 ( 8004、
ATCC33919和 XCC186)的有个别氨基酸的差异ꎻ
与其余测定菌株的序列差异较大(图 1 ̄C)ꎮ
2.2  fliCxcv基因原核表达和蛋白纯化及其定性
    分别将克隆的基因序列定向克隆至表达载体
pCold ̄SUMO中ꎬ得到重组表达质粒 pCold ̄SUMO ̄
fliCxcv、 pCold ̄SUMO ̄fliCxcv ̄N 和 pCold ̄SUMO ̄
fliCxcv ̄Cꎮ 经 BamH I / Xba I 酶切验证后ꎬ分别得
到大小约为 1 200、600和 600 bp片段ꎬ与预期结果
一致ꎮ 对构建质粒进行测序ꎬ得以验证ꎮ 将上述重
组表达载体转化至 E. coli菌株 BL21(DE3)中ꎬ经
IPTG诱导后ꎬ在上清液中获得了大小为 58. 89、
36.89和 36.89 kD的可溶性蛋白(未列出资料)ꎮ
    通过对诱导表达蛋白进行 Ni ̄sepharose 分离、
咪唑溶液洗脱、凝胶电泳检测ꎬ获得了分子量大小
与预期一致的 3 种表达蛋白质(图 2 ̄A)ꎮ 对纯化
蛋白进行Western blot分析验证ꎬ表明蛋白质表达
的正确性(图 2 ̄B)ꎮ
Fig. 2  SDS ̄PAGE (A) and Western ̄blot (B)
of the purified FliCxcv and truncated
proteins
Lane M: Protein markerꎻ Lane 1: FliCxcvꎻ Lane 2: FliCxcv ̄
Nꎻ Lane 3: FliCxcv ̄C.
2.3  FliCxcv对水稻叶片细胞死亡和 H2O2产生的
诱导作用
    将纯化的 FliCxcv 全长及其截短蛋白浸润
接种到水稻幼苗叶组织ꎬ分别用台酚兰和 DAB
染色法测定了其诱导水稻细胞死亡和 H2O2产生的
能力ꎮ 结果显示ꎬ处理 24 h 后ꎬ FliCxcv 及其截
短蛋白均能引起叶片细胞死亡(图 3)和组织 H2O2
产生(图 3)ꎬ其诱导能力 FliCxcv ﹥ FliCxcv ̄C ﹥
FliCxcv ̄Nꎬ而对照 (Tris ̄HCl 缓冲液和标签蛋白
SUMOtag)处理未发现明显的细胞死亡和 H2O2的
产生ꎮ
Fig. 3  Cell death and H2O2 production induced by FliCxcv and truncated
proteins in rice leaves reveled by trypan ̄blue and DAB staining respectively
551
 
植物病理学报 45卷
2.4  FliCxcv对水稻防卫基因 OsPAL 和 OsPR1b
表达的诱导作用
    将纯化蛋白浸润接种到水稻幼苗叶组织ꎬ用
qRT ̄PCR方法测定了其诱导水稻叶组织中 2 种主
要防卫基因表达的能力ꎮ 结果显示ꎬ处理 24 h 后ꎬ
FliCxcv及其截短蛋白均能显著地诱导水稻组织中
OsPAL和 OsPR1b 基因转录本增加ꎬ其诱导能力
FliCxcv>FliCxcv ̄C>FliCxcv ̄N (图 4)ꎮ
Fig. 4   Expression of OsPAL and OsPR1b
genes in rice leaves inoculated with
FliCxcv and truncated proteins
3  讨论
    前期研究发现ꎬ作为一种不亲和病原细菌ꎬ
Xcv菌体能显著地诱导水稻悬浮培养细胞过敏性
死亡以及防卫相关基因(nos、gst、pal 和 pox)显著
表达[21]ꎮ 为了进一步确定起 PAMP功能的菌体组
分ꎬ本研究对 Xcv 鞭毛素基因进行克隆、分段原核
表达以及表达蛋白的 PTI 诱导活性测定ꎮ 确证了
FliCxcv作为一种 PAMP 分子ꎬ可以显著地诱导水
稻叶片细胞死亡和 H2 O2产生ꎮ 由于 OsPAL 和
OsPR1b是水稻中重要的防卫反应标志基因[11ꎬ 22]ꎬ
这 2个基因对 FliCxcv 蛋白的应答表达显著增加ꎬ
初步揭示该蛋白可能在转录水平上诱导水稻的抗
病反应ꎮ 需要对其他更多重要防卫基因的转录情
况进行分析ꎬ对此进行验证ꎮ 通过分析试验结果ꎬ
本研究认为 FliCxcv 蛋白具有水稻细胞免疫反应
的激发活性功能ꎬ可以用作水稻免疫诱导制剂的研
发材料ꎮ
    通过生物信息学分析ꎬ发现 FliCxcv 蛋白含有
3个保守结构域 Flagellin_N、Flagellin_IN和 Flagel ̄
lin_Cꎮ 由于 Flagellin_N 和 Flagellin_C 结构非常
保守ꎬ推测它们可能具有免疫反应激活功能ꎮ 鉴此
设计特异性引物ꎬ分别扩增含有 Flagellin _N 和
Flagellin_C 序列ꎬ进行了蛋白 N 端和 C 端截短表
达ꎬ初步验证了 PTI 诱导活性ꎮ 虽然 FliCxcv 及其
截短蛋白均能诱导水稻细胞免疫反应ꎬ但诱导活性
存在一定的差异ꎬFliCxcv 诱导能力大于 FliCxcv ̄C
和 FliCxcv ̄N肽段ꎮ 其可能的原因是后两者活性
位点不完整ꎬ导致了诱导活性略为下降ꎬ推测其活
性位点可能位于 Flagellin_IN 位点附近ꎮ 因此ꎬ需
要继续通过该基因分段表达ꎬ对该蛋白活性位点进
行深入的探究ꎬ以期彻底阐明 3 个保守结构域与
FliCxcv蛋白免疫激活功能的关系ꎮ
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责任编辑:于金枝
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