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Genetic diversity of Gliadin in worldwide germplasm collections of Elymus sibiricus

老芒麦种质的醇溶蛋白遗传多样性研究



全 文 :书老芒麦种质的醇溶蛋白遗传多样性研究
马啸1,陈仕勇1,张新全1,周永红2,白史且3,刘伟1
(1.四川农业大学动物科技学院,四川 雅安625014;2.四川农业大学小麦研究所,
四川 成都611130;3.四川省草原科学研究院,四川 成都611731)
摘要:利用APAGE的醇溶蛋白标记,对来自亚洲和北美的86份老芒麦种质的遗传多样性和遗传关系进行了分
析。电泳共检测到52条醇溶蛋白条带,其中47条为多态性条带,多态性带百分比达90.4%。种质间遗传相似系
数的变幅为0.108~0.952,平均值为0.373。利用Shannon多样性指数反映了类似的结果,即供试种质间的多样性
指数达到0.460的较高水平。基于多样性指数计算了老芒麦种质地理类群遗传分化程度,地理类群内和类群间的
遗传变异分别占总变异的55.8%和44.2%,这表明种质间存在较高水平的遗传多样性。对供试种质和地理类群
的聚类分析结果均显示,来源于青藏高原的种质与其他地理来源的种质具有较大的差异,可以分成明显的2支。
这种聚类结果可能与老芒麦种质的地理来源和生态适应性有关。本研究结果可为老芒麦种质的收集保护及核心
种质构建提供有益信息。
关键词:老芒麦;醇溶蛋白;遗传多样性;地理类群;遗传分化
中图分类号:S543+.903;Q943  文献标识码:A  文章编号:10045759(2009)03005908
  披碱草属(犈犾狔犿狌狊)是禾本科(Poaceae)小麦族(Triticeae)中最大的1个属,约由150个物种组成,绝大多数
分布于温带地区[1]。老芒麦(犈犾狔犿狌狊狊犻犫犻狉犻犮狌狊),别名西伯利亚野麦草,是披碱草属的模式种,是一种原生于亚洲
北部、多年生、自花授粉的异源四倍体禾草,具有StStHH的染色体组构成[2]。其自然分布横跨欧洲的瑞典到东
亚的日本,甚至到达北美的阿拉斯加和加拿大[3],向南可以延伸分布至中国青藏高原的低海拔地区。老芒麦主要
生于森林草原的河谷草甸、草甸化草原、疏林、灌丛和林间空地等[4]。在中亚塔吉克斯坦的干旱山区、我国北方温
带草原的较湿润地区及青藏高原的亚高山草甸地区,老芒麦作为一种重要的牧草在草地畜牧业中发挥了巨大作
用[5,6]。
研究和了解植物种质间的遗传变异,对其在育种上的有效利用非常有益[7,8]。如何拓宽品种遗传基础,合理
选择亲本及导入野生近缘物种中存在大量优异基因,都有赖于对种质资源遗传多样性的研究,对野生牧草种质的
栽培驯化更是如此。目前,对有关披碱草属种质或居群的遗传变异信息了解很少[9]。虽然已有对野生老芒麦种
质形态或农艺性状的少量报道[10,11],但是形态标记的数目有限、易受环境影响和非均匀分布等缺点限制了其利
用。胚乳贮藏蛋白(醇溶谷蛋白)已经在披碱草属物种基因型和居群的遗传学研究中得到初步应用[12~14],在其他
小麦族物种的研究中发现醇溶蛋白具有很高的多态性[15~18],这为利用酸性聚丙烯酰胺凝胶电泳(APAGE)技术
评价老芒麦的遗传多样性提供了可行性。本研究的目的在于利用醇溶蛋白标记确定供试86份老芒麦种质间的
遗传关系并检测遗传多样性水平与地理来源的关系,从而为今后老芒麦种质的保存和利用提供基础信息。
1 材料与方法
1.1 植物材料
86份老芒麦供试种质分别从美国国家遗传资源库(NPGS,USDA)、四川农业大学小麦研究所和四川草原科
学研究院获得(表1)。种质的护照信息显示它们分别采集自俄罗斯(西伯利亚地区为主)、蒙古、中国、哈萨克斯
坦和北美,绝大部分为野生材料。
第18卷 第3期
Vol.18,No.3
草 业 学 报
ACTAPRATACULTURAESINICA   
59-66
2009年6月
 收稿日期:20080729;改回日期:20081028
基金项目:四川省“十一五”牧草育种攻关项目和国家重点基础研究发展计划(973计划)项目(2007CB108907)资助。
作者简介:马啸(1977),男,山东济宁人,讲师,博士。Email:maroar@163.com
通讯作者。Email:zhangxq@sicau.edu.cn
表1 86份老芒麦种质材料
犜犪犫犾犲1 犇犲狊犮狉犻狆狋犻狅狀狅犳狋犺犲86犈.狊犻犫犻狉犻犮狌狊犪犮犮犲狊狊犻狅狀狊狌狊犲犱犻狀狋犺犻狊狊狋狌犱狔
序号
No.
种质编号
AccessionNo.
地理来源
Geographicorigin
序号
No.
种质编号
Accessionno.
地理来源
Geographicorigin
1 PI610850 蒙古东戈壁省宗巴彦县Dzuunburen,DornogoviAymag,Mongolia 44 Y0877 中国新疆巴里坤Barkol,Xinjiang,China
2 PI610860 蒙古东戈壁省宗巴彦县Dzuunburen,DornogoviAymag,Mongolia 45 Y1914 中国新疆哈巴河Kaba,Xinjiang,China
3 PI610886 蒙古东戈壁省宗巴彦县Dzuunburen,DornogoviAymag,Mongolia 46 Y2024 中国新疆哈巴河Kaba,Xinjiang,China
4 PI610866 蒙古后杭爱省大塔米尔县Ihtamir,ArhangayAymag,Mongolia 47 Y1823 中国新疆阿勒泰Altay,Xinjiang,China
5 PI610857 蒙古后杭爱省浩吞特Hotont,ArhangayAymag,Mongolia 48 Y0909 中国新疆木垒 Mori,Xinjiang,China
6 PI610862 蒙古乌兰巴托Ulaanbaatar,Mongolia 49 Y0486 中国新疆乌鲁木齐Urumqi,Xinjiang,China
7 PI610876 蒙古库苏古尔省车车尔勒格县 Tsetserleg,HvsglAymag,
Mongolia
50 Y005 中国新疆乌鲁木齐Urumqi,Xinjiang,China
8 PI628726 蒙古巴彦乌列盖省布彦特县BuyantSum,Bayan?lgiyAymag,
Mongolia
51 PI499462 中国新疆乌鲁木齐Urumqi,Xinjiang,China
9 PI634230 蒙古肯特省温都尔汗Onderhan,HentiyAymag,Mongolia 52 PI628677 中国新疆焉耆Yanqi,Xinjiang,China
10 PI634231 蒙古东方省GumensatSum,DornodAymag,Mongolia 53 PI499453 中国内蒙古锡林浩特Xilinhot,InnerMon
golia,China
11 PI314619 哈萨克斯坦阿拉木图AlmaAta,Kazakhstan 54 PI499455 中国内蒙古锡林浩特Xilinhot,InnerMon
golia,China
12 PI598773 哈萨克斯坦Kazakhstan 55 PI499457 中国内蒙古InnerMongolia,China
13 PI598778 哈萨克斯坦Kazakhstan 56 PI499459 中国内蒙古InnerMongolia,China
14 PI598788 哈萨克斯坦Kazakhstan 57 205124 中国四川稻城Dabba,Sichuan,China
15 PI372696 美国阿拉斯加Alaska,UnitedStates 58 204145 中国四川炉霍Zhaggo,Sichuan,China
16 PI348916 美国阿拉斯加Alaska,UnitedStates 59 204155 中国四川炉霍Zhaggo,Sichuan,China
17 PI372541 加拿大不列颠哥伦比亚省BritishColumbia,Canada 60 205189 中 国 四 川 马 尔 康 鹧 鹄 山 Zhehu Mts.,
Barkam,Sichuan,China
18 PI326266 俄罗斯远东阿穆尔区Amurregion,FarEast,Russia 61 205201 中国四川色达Srtar,Sichuan,China
19 PI628699 俄罗斯远东苏维埃港SovetskayaGavan,FarEast,Russia 62 205179 中国四川若尔盖Zoige,Sichuan,China
20 PI598478 俄罗斯新西伯利亚Cherga,Novosibirsk,Russia 63 204081 中国四川红原Hongyuan,Sichuan,China
21 PI369236 俄罗斯新西伯利亚Novosibirsk,Russia 64 204089 中国四川红原Hongyuan,Sichuan,China
22 PI611013 俄罗斯西伯利亚阿尔泰区Altairegion,Siberia,Russia 65 204119 中国四川色达Srtar,Sichuan,China
23 PI598800 俄罗斯西伯利亚阿尔泰区Altairegion,Siberia,Russia 66 205215 中国四川壤塘Zamtang,Sichuan,China
24 PI634228 俄罗斯西伯利亚阿尔泰区Altairegion,Siberia,Russia 67 205156 中国四川道孚Dawu,Sichuan,China
25 PI406467 俄罗斯西伯利亚Siberia,Russian 68 205226 中国四川阿坝Ngawa,Sichuan,China
26 PI611020 俄罗斯西伯利亚布里亚特共和国BuryatAutonomousRepublic,
Siberia,Russia
69 川草1号
ChuancaoNo.1
中国四川红原Hongyuan,Sichuan,China
27 PI315427 俄罗斯西伯利亚布里亚特共和国BuryatAutonomousRepublic,
Siberia,Russia
70 川草2号
ChuancaoNo.2
中国四川红原Hongyuan,Sichuan,China
28 PI598789 俄罗斯西伯利亚赤塔区Chitaregion,Siberia,Russia 71 205171 中国四川若尔盖Zoige,Sichuan,China
29 PI345600 俄罗斯西伯利亚克拉斯诺亚尔斯克区Krasnoyarskregion,Siber
ia,Russia
72 205172 中国四川若尔盖Zoige,Sichuan,China
30 PI345599 俄罗斯西伯利亚赤塔区Chitaregion,Siberia,Russia 73 Y2906 中国甘肃夏河Xiahe,Gansu,China
31 PI326267 俄罗斯西伯利亚赤塔区Chitaregion,Siberia,Russia 74 PI499461 中国甘肃祁连山QilianMts.,Gansu,China
32 PI315428 俄罗斯西伯利亚克拉斯诺亚尔斯克区Krasnoyarskregion,Siber
ia,Russia
75 PI499460 中国甘肃兰州Lanzhou,Gansu,China
06 ACTAPRATACULTURAESINICA(2009) Vol.18,No.3
 续表1 Continued
序号
No.
种质编号
Accessionno.
地理来源
Geographicorigin
序号
No.
种质编号
Accessionno.
地理来源
Geographicorigin
33 PI598774 俄罗斯开米共和国Kami,northeastofLeningrad,Russia 76 PI499458 中国甘肃山丹Shandan,Gansu,China
34 Y0811 中国新疆昭苏Zhaosu,Xinjiang,China 77 PI499456 中国甘肃山丹Shandan,Gansu,China
35 Y004 中国新疆哈密Hami,Xinjiang,China 78 PI636676 中国甘肃夏河Xiahe,Gansu,China
36 Y0860 中国新疆伊吾Yiwu,Xinjiang,China 79 PI531671 中国甘肃黄城Huangcheng,Gansu,China
37 Y0771 中国新疆巴音布鲁克Bayinbulak,Xinjiang,China 80 204451 中国甘肃合作Hezuo,Gansu,China
38 Y0766 中国新疆巴音布鲁克Bayinbulak,Xinjiang,China 81 PI504462 中国青海西宁Xi’ning,Qinghai,China
39 Y0760 中国新疆库车Kuqa,Xinjiang,China 82 PI504463 中国青海青海湖边NorthofQinghaiLake,
Qinghai,China
40 Y2027 中国新疆布尔津Burqin,Xinjiang,China 83 PI531669 中国青海西宁Xi’ning,Qinghai,China
41 Y0822 中国新疆特克斯 Tekas,Xinjiang,China 84 204441 中国青海青海湖SouthofQinghaiLake,
Qinghai,China
42 Y0473 中国新疆和静Hejing,Xinjiang,China 85 204251 中国西藏丁青县Dingqing,Tibet,China
43 Y013 中国新疆和静Hejing,Xinjiang,China 86 204404 中国西藏Tibet,China
 注:为栽培材料,为品种,无标注即为野生材料。
 Note:meanscultivatedmaterial,meanscultivar,andaccessioncodewithoutasteriskmeanswildmaterial.
1.2 研究方法
1.2.1 样品提取 每份种质随机取10粒种子,用种子钳夹碎成粉末状,称重,放入0.5mL离心管中,然后按1
mg加5μL的比例加入样品提取液(2氯乙醇25%、甲基绿0.05%),室温浸提过夜,使用前用10000r/min离心
10min。
1.2.2 APAGE 采用国际种子检查协会ISTA(1986)颁布的酸性聚丙烯酰胺凝胶电泳(APAGE,pH值3.2)
标准程序[19]。采用DYCZ24F型电泳槽(北京六一仪器厂)进行电泳,恒压500V,恒温10~15℃,电泳3.5h。
以加拿大春小麦(犜狉犻狋犻犮狌犿犪犲狊狋犻狏狌犿)品种 Marquis为对照,以计算各种质醇溶蛋白条带在凝胶上的相对迁移率。
醇溶蛋白条带从电泳阴极到阳极可被划分为4个区(α,β,γ和ω)
[20]。本研究据此将电泳条带归类到每个区内,
并计数。
1.2.3 数据分析 对凝胶上的蛋白谱带,以“0-1”法进行转换,有带记作1,无带记作0。醇溶蛋白凝胶电泳图
谱采用一般分子标记的处理方式,按条带有无赋值,有记为1,无记为0。具有相同迁移率的条带视为同一条带。
利用POPGENE1.31软件[21],基于醇溶蛋白表型数据,计算香农多样性指数,公式如下:犎狅=-∑狆犻ln狆犻,式中,
狆犻表示某个给定位点的等位基因频率[22]。犎狅 可以在2个水平上进行计算,即类群内平均多样性(犎group)和总的
多样性(犎狋)。犎group=∑犎狅/狀,是指狀个不同类群的平均多样性;犎狋=-∑狆ln狆,是指把所有供试群体作为一个
整体时计算出的多样性[23]。各地理类群内的遗传变异比例用犎group/犎狋 表示,类群间的遗传变异比例即类群间
的遗传分化用(犎狋-犎group)/犎狋表示。
用NTSYSpc2.11x软件计算各种质间的Dice遗传相似系数[24],构建UPGMA聚类树形图;同时基于聚类
树矩阵计算其协表征矩阵,再利用 Mantel检验计算犌犛矩阵与协表征矩阵间的相关系数,从而反映聚类结果与
犌犛矩阵的符合度[25]。另外,用POPGENE软件,计算各地理类群间的Nei’s无偏遗传距离,再用NTSYSpc绘
制出各类群的UPGMA聚类图。
2 结果与分析
2.1 醇溶蛋白多态性
86份老芒麦种质共检测出52条醇溶蛋白谱带,其中47条为多态性谱带,多态性带百分比为90.4%(表2)。
单份种质的多态性谱带为12~15。图1是部分种质的电泳图谱。根据所有谱带的迁移率,将凝胶板上的谱带划
16第18卷第3期 草业学报2009年
分为α、β、γ和ω四个电泳谱带区,ω区的谱带数目(21条)和清晰度都远高于其他3区。每区谱带的平均值为13
条,多态性谱带平均值为11.75条。为衡量每4个电泳区的遗传多样性,基于谱带频率计算了每区总的Shannon
多样性指数。γ区总的多样性指数最高(犎狅=0.557),其次为β区(犎狅=0.472)和α区(犎狅=0.431),ω区的多样
性指数最小,犎狅=0.401。Simpson指数(即期望杂合度犎犲)具有与Shannon指数类似的变化趋势。
表2 86份老芒麦种质的醇溶蛋白多态性
犜犪犫犾犲2 犌犾犻犪犱犻狀犵犲狀犲狋犻犮狆狅犾狔犿狅狉狆犺犻狊犿犪犿狅狀犵86犪犮犮犲狊狊犻狅狀狊狅犳犈.狊犻犫犻狉犻犮狌狊
电泳区
Electrophoreticzones
总谱带数
Numberoftotalbands
多态性谱带数
Numberofpolymorphicbands
多态性带百分比
Po1ymorphismpercentage(犘p,%)
Shannon指数
犎狅
Simpson指数
犎犲
α 10 10 100.0 0.431 0.274
β 9 7 77.8 0.472 0.318
γ 12 12 100.0 0.557 0.376
ω 21 18 85.7 0.401 0.253
总计Total 52 47 90.4 0.460 0.302
均值Average 13 11.75 90.9 0.465 0.305
图1 21份中国来源的老芒麦种质的醇溶蛋白电泳图谱
犉犻犵.1 犃犘犃犌犈犵犾犻犪犱犻狀犲犾犲犮狋狉狅狆犺狅狉犲犵狉犪犿狅犳21犈.狊犻犫犻狉犻犮狌狊犪犮犮犲狊狊犻狅狀狊犳狉狅犿犆犺犻狀犪
图中序号见表1,下同 Thenumberonthefigureseetable1,thesamebelow
26 ACTAPRATACULTURAESINICA(2009) Vol.18,No.3
2.2 相似性系数
供试种质间的Dice遗传相似系数(犌犛)为0.108~0.952,平均值为0.382。来自于俄罗斯的材料PI598800
和来自于中国四川的材料205124之间的犌犛=0.108为最小,而均来源于北美洲阿拉斯加的材料PI372696和
PI348916之间的犌犛=0.952为最高。北美来源种质间的平均犌犛值为0.859,而来自于蒙古、哈萨克斯坦、俄罗
斯和中国的种质间的平均犌犛值分别为0.636,0.494,0.418和0.391。对中国种质类群而言,青海来源种质间的
平均犌犛=0.555为最高,来源于内蒙古、新疆、甘肃和四川的种质间的平均犌犛分别为0.554,0.514,0.483和
0.452。
2.3 供试种质间的聚类分析
基于醇溶蛋白谱带数据得到的UPGMA系统树(图2),揭示了86份老芒麦种质间的遗传关系。基于系统树
图2 老芒麦种质基于犇犻犮犲相似性系数的聚类图
犉犻犵.2 犇犲狀犱狉狅犵狉犪犿狅犳犈.狊犻犫犻狉犻犮狌狊犪犮犮犲狊狊犻狅狀狊犫犪狊犲犱狅狀犇犻犮犲’狊犵犲狀犲狋犻犮狊犻犿犻犾犪狉犻狋狔犮狅犲犳犳犻犮犻犲狀狋狊
36第18卷第3期 草业学报2009年
矩阵,计算出的协表征矩阵与原始犌犛矩阵的相关系数比较高(狉=0.826),这说明聚类结果与原始犌犛矩阵能较
好地吻合。系统树可以在不同的犌犛水平上将供试种质划归为不同的组群。即便如此,在犌犛=0.325的水平上,
供试种质可以被划分成2个明显不同的组群。第Ⅰ组群包括来自于北美(3份)、哈萨克斯坦(4份)、蒙古(10
份)、俄罗斯(16份)和中国新疆、甘肃和内蒙古(共30份)的种质。第Ⅱ组群包括全部来自于青藏高原的23份种
质,其中16份来自四川西部,4份来自青海,1份来自甘肃。
2.4 不同地理类群的遗传多样性指数
基于醇溶蛋白谱带计算的Shannon多样性指数同样也应用于5个地理类群的群体遗传结构分析中(图3)。
北美、俄罗斯、蒙古、哈萨克斯坦和中国地理类群的Shannon多样性分别为0.053,0.340,0.205,0.240和0.446,
北美类群具有最小的类群内变异(犎狅=0.053),但需要注意的是它的样本数最少,仅有3个。而来自于中国和俄
罗斯的地理类群表现出较高的类群内变异,其多样性指数分别为0.446和0.340。将所有供试材料看做一个大
类群时,可求得总Shannon多样性为犎狋=0.460;5个类群多样性的平均值为犎group=0.257;最终可计算出类群
内(犎group/犎狋)和类群间[(犎狋-犎group)/犎狋]的遗传变异分别为55.8%和44.2%。
同样,中国类群可以划分为新疆、内蒙古、甘肃、四川、青海和西藏6个亚类群,各亚类群的Shannon多样性
分别为0.316(新疆),0.201(内蒙古),0.356(甘肃),0.374(四川),0.280(青海)和0.173(西藏),其中西藏亚类群
表现出最低的群体内遗传变异,而四川亚类群具有最高的变异性。群体遗传结构分析表明,亚类群内遗传变异占
总变异的63.4%,而只有36.6%的变异发生在亚类群间。
2.5 地理类群的聚类分析
图3 5个地理类群基于犖犲犻’狊遗传距离的犝犘犌犕犃聚类分析
犉犻犵.3 犇犲狀犱狉狅犵狉犪犿狅犳狋犺犲犳犻狏犲犿犪犻狀犵犲狅犵狉犪狆犺犻犮犵狉狅狌狆狊犵犲狀犲狉犪狋犲犱
犫狔犝犘犌犕犃犮犾狌狊狋犲狉犪狀犪犾狔狊犻狊犳狉狅犿犖犲犻’狊犵犲狀犲狋犻犮犱犻狊狋犪狀犮犲
基于Nei氏遗传距离(D),对5个地理类群
进行了UPGMA聚类分析(图3),结果表明俄罗
斯类群和中国类群具有较近的亲缘关系,虽然中
国类群的生态地理来源比俄罗斯类群丰富。在犇
=0.15的水平上,5个地理类群可以明显划分成
2支,第1支具有欧亚大陆来源,包括来源于俄罗
斯、哈萨克斯坦、中国和蒙古的4个类群。第2支
仅由北美类群组成。
3 讨论
本研究所得醇溶蛋白的多态性带百分比
(犘p)为90.4%,这比其他小麦族自交物种的醇溶
蛋白或贮藏蛋白的 犘p 值为高,如一粒小麦
(犜狉犻狋犻犮狌犿犿狅狀狅犮狅犮犮狌犿ssp.犕狅狀狅犮狅犮犮狌犿)(犘p=
31%)[26]、二粒小麦 (犜狉犻狋犻犮狌犿狋狌狉犵犻犱狌犿 ssp.
犇犻犮狅犮犮狅犻犱犲狊)(犘p=83%)[27]和垂穗披碱草(犈.
狀狌狋犪狀狊)(犘p=92%)[14]。将供试种质看成一个大
的群体,计算出的总Shannon多样性指数为 犎狋
=0.460,这进一步说明醇溶蛋白标记非常适合于大规模检测老芒麦种质的遗传变异。另外,本研究发现的种质
间高水平的遗传变异与田间形态学性状的高度变异具有一致性。
Shannon指数计算结果表明,中国和俄罗斯来源的种质类群具有较高的醇溶蛋白变异,其多样性指数分别为
0.447和0.340,而北美来源的种质类群具有最低多样性指数。有研究表明遗传多样性和群体样本数量间存在明
显的相关性[28,29]。因此,可能正是由于北美类群太小的群体样本数量(3份种质),才导致了其多样性的下降。另
外PI372696和PI348916均采集自阿拉斯加的同一地点,更加剧了这种多样性下降的趋势。同时,对5个地理类
群比较了类群间和类群内的遗传变异比例,结果表明类群内的遗传变异(55.8%)要高于类群间的遗传变异
(44.2%)。所以,为今后更有效地保护和利用老芒麦资源,在采集野生种质时要充分重视样本数量和地理生态类
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群的遗传分化,即在多样性丰富的地区大规模采集为宜。
根据对所有种质基于Dice相似系数的聚类结果分析,种质的遗传变异分布与生态和地理来源具有明显的相
关性。种质的地理来源代表了不同的宏观生态环境,而这些不同的生态环境条件是造成种质间遗传变异的主要
因素[30,31]。本研究供试种质被分成2大类的原因,可能主要依赖于青藏高原种质的特有生态地理适应性。由于
青藏高原的高海拔及它被喀喇昆仑山、阿尔金山和祁连山等著名高山与其他种质的来源地区隔离开来[32],造成
其植物种质可能具有特定的生态地理适应性。然而,来自于除青藏高原地区以外的种质,并没有按地理来源被清
晰的分开(如俄罗斯和中国新疆的种质),可能与这3个生态区接壤且并无明显区别有关。另外,虽然一般认为老
芒麦是自花授粉植物[2],但田间观测发现其具有较高的异交率,在种质繁殖后代过程中的遗传交流(花粉流),也
可能会加剧种质间的遗传相似性。对地理类群进行的聚类分析,将北美来源种质与欧亚来源种质划分开,可能也
是生态地理隔离所造成的,即北美和欧亚大陆间的太平洋隔离所致。但基于种质的聚类并没有将来自北美的3
份材料与其他材料分开,这可能是由于北美来源的种质数量太少,特异带在总条带中的比例很小。所以,关于类
群聚类模式的形成及原因,还需补充北美来源的种质数量,做进一步探讨。
从本研究结果可以看出,醇溶蛋白标记在老芒麦多样性研究中具有多态性高、简单易行的特点,非常适合大
规模检测老芒麦种质遗传多样性及核心种质构建。但是,醇溶蛋白标记毕竟只能反映基因编码区的部分变异,所
以今后还需利用各种DNA分子标记检测供试种质间的遗传变异。
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犌犲狀犲狋犻犮犱犻狏犲狉狊犻狋狔狅犳犌犾犻犪犱犻狀犻狀狑狅狉犾犱狑犻犱犲犵犲狉犿狆犾犪狊犿犮狅犾犲犮狋犻狅狀狊狅犳犈犾狔犿狌狊狊犻犫犻狉犻犮狌狊
MAXiao1,CHENShiyong1,ZHANGXinquan1,ZHOUYonghong2,BAIShiqie3,LIU Wei1
(1.TheDepartmentofGrasslandScience,ColegeofAnimalScienceandTechnology,SichuanAgricultural
University,Ya’an625014,China;2.TriticeaeResearchInstitute,SichuanAgriculturalUniversity,
Chengdu611130,China;3.SichuanAcademyofGrasslandSciences,Chengdu611731,China)
犃犫狊狋狉犪犮狋:GliadinmarkersbasedonAPAGEwereusedtoanalyzegeneticdiversityandgeneticrelationships
amongeightysix犈犾狔犿狌狊狊犻犫犻狉犻犮狌狊犪犮犮犲狊狊犻狅狀狊fromAsiaandNorthAmerica.Atotalof52gliadinbandswere
scored,ofwhich47werepolymorphic(90.4%).Thegeneratedsimilaritymatrixshowedthatthegenetic
diversitywithintheaccessionswasfairlyhigh(averagesimilarityindex=0.373).Similarityvaluesamongthe
accessionsrangedfrom0.108and0.952.Similarresultswereobtainedwhengeneticdiversitywasestimated
usingtheShannonindexofdiversity.Thetotalgeneticdiversityacrossalaccessionswas0.460.Thepropor
tionofvariationexplainedbywithingeographicgroupsandbetweengeographicgroupsdiversitywas0.559and
0.442,respectively.ClusteranalysisshowedacleardemarcationbetweenaccessionsfromtheQinghaiTibetan
Plateau,Chinaandtheothersasseparategroups.Theextentofgeneticdiversityandgeneticrelationship
amongaccessionsisdiscussed.Theclusteringpatternprobablydependedongeographicoriginandecological
adaptabilityoftheaccessions.
犓犲狔狑狅狉犱狊:犈犾狔犿狌狊狊犻犫犻狉犻犮狌狊;gliadin;geneticdiversity;geographicgroups;geneticdifferentiation
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