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Cloning,Procaryotic Expression and Activity Analysis of Grape Berry β-glucosidase Gene

葡萄果实β–葡萄糖苷酶基因克隆、原核表达及活性检测



全 文 :园 艺 学 报 2012,39(6):1073–1080 http: // www. ahs. ac. cn
Acta Horticulturae Sinica E-mail: yuanyixuebao@126.com
收稿日期:2012–02–05;修回日期:2012–05–11
基金项目:国家自然科学基金项目(31040006);国家科技支撑计划项目(2008BAD95B07,2011BAD32B03);北京市自然科学基金委
和北京市教委联合资助重点项目(KZ200910020001)
* 通信作者 Author for correspondence(E-mail:gsfmn@tom.com)
葡萄果实 β–葡萄糖苷酶基因克隆、原核表达及
活性检测
董银行,郭家选*
(北京农学院植物科学技术学院,农业应用新技术北京市重点实验室,北京 102206)
摘 要:以‘玫瑰香’葡萄着色期的果肉为试材,通过反转录技术克隆了 ABA 合成相关酶 β–葡萄
糖苷酶基因 VvBG1 的 1 518 bp 编码区核苷酸序列,其编码 1 个含有 505 氨基酸的多肽。生物信息学分析
表明,VvBG1 含有 1 个跨膜区和糖基水解酶 1 超家族保守域。通过 BamHⅠ和 XhoⅠ限制性内切酶将除
去信号的编码区克隆到原核表达载体 pET28a(+)中,并转化大肠杆菌表达菌株 BL21(DE3),成功诱导
并纯化了 VvBG1 融合蛋白。经过透析复性和超滤浓缩得到了 0.8 mg · mL-1 可溶的融合蛋白。通过纯化蛋
白葡萄果肉均浆液孵育试验和 GC–MS ABA 含量分析证实了葡萄果实中 β–葡萄糖苷酶 VvBG1 具有较
高的生理活性。
关键词:葡萄;果实;β–葡萄糖苷酶 1;脱落酸;基因;克隆;原核表达
中图分类号:S 663.1 文献标识码:A 文章编号:0513-353X(2012)06-1073-08

Cloning,Procaryotic Expression and Activity Analysis of Grape Berry
β-glucosidase Gene
DONG Yin-hang and GUO Jia-xuan*
(Beijing Key Laboratory for Agricultural Application and New Technique;College of Plant Science and Technology,
Beijing University of Agriculture,Beijing 102206,China)
Abstract:To explore the activity of β-glucosidase(VvBG1)in grape berries,in the present study,
VvBG1 gene was first cloned through reverse transcription technique from mesocarp during Hamburg
grape berry red-coloring stages. The 1 518 bp sequences encoded a polypeptide with 505 amino acids.
Bioinformatics analysis showed that VvBG1 contains both a putative transmembrane region and a glycosyl
hydrolase1 superfamily domain. The coding sequence after remove of its signal coding region was cloned
into prokaryotic expression vector pET28a(+)and then transformed into E. coli strain BL21(DE3)by
restriction endonucleases BamHⅠand XhoⅠ. The recombinant strains were successfully induced to
express fusion protein and permitted to purify the VvBG1 protein. A 0.8 mg · mL-1 of soluble protein
solution was obtained after dialysis and ultrafiltration. The results gained from a combination of purified
protein incubation experiment using grape berry pulp and abscisic acid(ABA)content analysis by GC-MS
demonstrated that the grape berry β-glucosidase VvBG1 is of high physiological activity.

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Key words:grape;berry;β-glucosidase 1;ABA;gene;cloning;procaryotic expression

葡萄不仅具有重要的经济价值,而且是研究非呼吸跃变型果实理想的材料。脱落酸(abscisic
acid,ABA)被认为在葡萄果实成熟过程中起着关键的作用(Coombe,1992)。ABA 合成研究受到
了广泛的关注并取得了很大的进展。
高等植物 ABA 生物合成路径中的主要步骤合成酶都已经阐明(Qin & Zeevaart,1999;Nambara
& Marion-poll,2005),主要包括玉米黄质环化酶(zeaxanhtin epoxidase,ZEP),9–顺式–环氧类
胡萝卜素双氧合酶(9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase,NCED),短链乙醇脱氢酶(a short-chain
dehydrogenase/reductase,ABA2),ABA 醛氧化酶(ABA aldehydeoxidase,AAO3)和钼辅硫化酶
(molybdenum cofactorsulfurase,MCSU),其中 NCED(EC 1.13.11.52)是 ABA 生物合成的限速酶
(任杰 等,2010;朱海生 等,2012)。
近年来研究发现,拟南芥中 β–葡萄糖苷酶 AtBG1(β-glucosidase,EC 3.2.1.21)响应环境和发
育信号促进了活性 ABA 的快速积累,即通过把无活性的结合态 ABA 葡萄糖苷(ABA-GE)直接转
化为有活性游离的 ABA(Lee et al.,2006)。王延书等(2010)以始熟期花后 7 ~ 11 周的玫瑰香葡
萄果肉为试材,利用荧光定量 PCR 分析了 VvNCED1 和 VvBG1 在 5 个时期的表达量,研究发现
VvNCED1 在花后第 7 ~ 8 周表达量很高,随后快速降低至最低值,随着果实着色,表达量略有升高;
VvBG1 基因在果实始熟前表达量较低,随着果实始熟启动和果实着色,表达量基本呈持续升高的趋
势,始熟后 ABA 的积累主要归因于 VvBG1 的高水平表达。当玫瑰香葡萄果实中 ABA 水平达到高
峰时,部分游离 ABA 将以 ABA-GE 形式储藏起来(Sun et al.,2010)。Li 等(2012)研究发现,在
西瓜果实发育的早期,ClBG1 表达水平相对较低,随着果实成熟,表达量快速增加。
综上所述,尽管前人通过基因转录分析揭示了 VvBG1 基因可能在果实成熟期起着重要的作用
(Sun et al.,2010;王延书 等,2010;Li et al.,2012),但果实中 VvBG1 蛋白酶活特点目前还不清
楚。为了检测果实中 β–葡萄糖苷酶的活性,本研究中以玫瑰香葡萄果肉为试材,将 VvBG1 转化大
肠杆菌表达并亲和层析纯化外源表达蛋白,通过葡萄果实匀浆液温育试验检测了 VvBG1 具有较高
的生理活性。该研究为从分子水平操纵葡萄果实成熟奠定研究基础。
1 材料与方法
1.1 材料与试剂
以玫瑰香葡萄(Vitis vinifera L.‘Muscat Hamburg’)果实采自在北京农学院葡萄种质资源圃。
2011 年在果实转红期(50%果面着色,于 8 月 5 日花后 70 d)取出果肉,液氮速冻于–80 ℃冰箱保
存备用。
大肠杆菌 DH5α、BL21(DE3)、DNA marker、pEASYTM-T1 Simple Cloning Kit 购自北京全式金
生物技术有限公司;pET28a(+)由本实验室保存;RNA 提取试剂盒购自北京博迈德生物科技有限
公司;限制性内切酶、反转录酶、DNA 酶、T4 DNA 连接酶、LA-Taq 酶均购自 TaKaRa 公司;引物
合成及测序均由上海生工生物工程技术服务有限公司完成;其他试剂均为国产分析纯。
1.2 重组原核表达质粒构建及目的蛋白表达
根据本实验室克隆得到的 VvBG1(GenBank 登录号:GU480917)的 CDS 序列(去除信号肽序
列,预测网址 http://www. cbs. dtu. dk/services/SignalP/或 http://genome. cbs. dtu. dk/services/TargetP/)
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设计原核表达基因全长引物(正义引物:5-GGATCCGAAAATATCACCAGAGGAAG-3和反义引物
5-CTCGAGGGGAGAATTCAAGAAGTTC-3,并分别在引物的 5端引入了 BamHⅠ和 XhoⅠ酶切位
点(下划线部分)。以葡萄果肉 cDNA 为模板,通过 PCR 克隆获得目的基因片段,连接 pEASYTM-T1
Simple 克隆载体后与 pET28a(+)载体用 BamHⅠ和 XhoⅠ限制性内切酶同时双酶切,用 T4 DNA
连接酶将 VvBG1 目的片段与 pET28a(+)载体连接形成 pET28a-BG1 重组表达质粒并转化 E. coli
DH5α感受态细胞,经菌落 PCR 筛选及序列测定后转化 E. coli BL21(DE3)表达菌株。挑取阳性转
化子于含有 50 μg · mL-1 硫酸卡那霉素的 LB 液体培养基 37 ℃,220 r · min-1 培养至 OD600 为 0.6 ~ 0.8
时,加入 1 mmol · L-1 IPTG 诱导表达 3 ~ 4 h。收集少量菌体超声破碎后,SDS-PAGE 鉴定蛋白表达。
1.3 融合蛋白纯化与复性
收集菌体于 50 mL 离心管中,按每克菌体鲜样质量加入 30 mL 洗涤缓冲液Ⅰ(50 mmol · L-1
Tris-Cl、2 mmol · L-1 EDTA,100 mmol · L-1 NaCl、0.5% triton X-100),用超声波破碎仪(宁波东芝
JY92-II)冰浴超声破碎(工作时间 5 s,间歇时间 5 s,60 次循环),8 000 r · min-1 离心 5 min 收集包
涵体,用洗涤缓冲液Ⅰ和洗涤缓冲液Ⅱ(50 mmol · L-1 Tris-Cl,100 mmol · L-1 NaCl)各洗涤 2 到 3
次,加入适量 8 mol · L-1 尿素,震荡混匀后 4 ℃溶解过夜。
将溶解后的蛋白于 4 ℃,13 000 × g 离心 30 min,收集上清用 0.45 μm 滤膜过滤后,过镍离子金
属螯合亲和层析柱,用 8 倍柱床体积的 Binding buffer (8 mol · L-1 尿素,20 mmol · L-1 Tris-Cl,pH 7.9,
5 mmol · L-1 咪唑,300 mmol · L-1 NaCl)洗涤,500 μL 依次收集的洗脱蛋白,收集总量为 2.5 mL Elution
buffer(8 mol · L-1 尿素,20 mmol · L-1 Tris-Cl,pH 7.9,300 mmol · L-1 咪唑,300 mmol · L-1 NaCl),
SDS-PAGE 分析依次收集纯化浓度及纯度。
纯化后的目的蛋白用 Elution buffer 稀释至 20 ~ 50 μg · mL-1,加入到截留分子量为 10 kD 的透
析袋中分别于下列透析液中冰浴震荡透析 5 ~ 8 h。透析液Ⅰ:6 mol · L-1 尿素, 50 mmol · L-1 Tris-Cl,
0.5 mmol · L-1 EDTA,50 mmol · L-1 NaCl,5 mmol · L-1 DTT,4 mmol · L-1 GSH,0.5 mmol · L-1 GSSH,
8%甘油,0.2% PEG 4000;透析液Ⅱ:2 mol · L-1 尿素,50 mmol · L-1 Tris-Cl,0.5 mmol · L-1 EDTA,
50 mmol · L-1 NaCl,5 mmol · L-1 DTT,4 mmol · L-1 GSH,0.5 mmol · L-1 GSSH,8%甘油,0.2% PEG
4000;透析液Ⅲ:50 mmol · L-1 Tris-Cl,0.5 mmol · L-1 EDTA,50 mmol · L-1 NaCl。收集透析袋中蛋
白溶液,用截留分子量为 10 kD 的超滤管超滤浓缩,BCA 法测定蛋白含量后,立即使用或加入 20%
甘油冻存于–20 ℃备用。
1.4 VvBG1 活性检测
取着色期葡萄果实(50%果面着色)为材料,去掉果皮和种子后,加入少许石英砂于研钵中研
磨至匀浆,分别称取 0.5 g 匀浆液置于 3 个 10 mL 的玻璃试管中。A 管加入 500 μL 无菌水,B 管加
入 500 μL 透析液Ⅲ,C 管加入 500 μL 复性蛋白液,轻轻吹打混匀,室温中孵育 1 h。分别加入铜试
剂以及适量预冷的 80%甲醇和 D3-ABA,4 ℃冰箱过夜,GC-MS 法测定各管中 ABA 含量(王延书 等,
2010)。
2 结果与分析
2.1 葡萄 β–葡萄糖苷酶基因片段的克隆
根据 GenBank 上已公布的拟南芥 β-glucosidase 基因序列通过 BLAST 比对得到一个类似葡萄
BG1 mRNA 序列,设计特异引物(正向引物:5-ATGGCGTTCGGAAGATTCATCG-3,反向引物:
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5-TTAGGGAGAATTCAAGAAGTTCTTAAACC-3),以玫瑰香葡萄果肉 cDNA 文库为模板,通过
RT-PCR技术克隆得到VvBG1的1 518 bp编码区核苷酸序列,其编码了505个氨基酸的多肽(GenBank
No. GU480917.1,图 1)。



图 1 葡萄果实中 VvBG1 核苷酸序列及其推导的氨基酸序列
Fig. 1 The nucleotide and its deduced amino sequences of VvBG1 gene in grape berry

2.2 葡萄 β–葡萄糖苷酶基因生物信息学分析
基于 VvBG1 蛋白 NCBI BLAST(http://blast. ncbi. nlm. nih. gov/Blast. cgi,)同源性序列分析表
明,VvBG1 与蓖麻(Ricinus communis,XP_002512097.1)、大豆(Glycine max,XP_003556662.1)、
杨树(Populus trichocarpa,XP_002311330.1)、拟南芥(Arabidopsis thaliana,NP_173978.1)、苜蓿
(Medicago truncatula,XP_003607794.1)、草莓(Fragaria × ananassa,gene04638 in https://strawberry.
Plant and food. co. nz/index. html)、高粱(Sorghum bicolor,XP_002465651.1)和水稻(Oryza sativa,
AAK92581.1)的同源基因相似性较高,分别为 77%、76%、75%、75%、75%、74%、71%和 71%。
该序列推测蛋白含有一个葡萄糖基水解酶 1 家族保守序列(图 2),表明已成功克隆到了 VvBG1。


图 2 VvBG1 氨基酸保守序列
Fig. 2 The deduced conserved amino acid sequence of VvBG1
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葡萄与上述 8 种植物 BG1 蛋白质序列用 MEGA 4.1 软件采用邻接法(NJ)和 Bootstrap 的 1 000
次重复检测方法进行亲缘关系分析,结果表明在遗传进化上 BG1 主要分为单子叶和双子叶植物两大
类。在双子叶植物中,葡萄首先与蓖麻和杨树聚为一类,然后再与草莓,最后与拟南芥、大豆和苜
蓿聚为一类(图 3)。

图 3 葡萄与其他物种之间 β–葡萄糖苷酶 1 的聚类分析
节点旁数据为 1 000 次 bootstrap 检测后的置信度(%)。
Fig. 3 Phylogenetic analysis of BG1 in grapevine and other species homologues
The numbers at notes represent bootstrap values(%)with 1 000 replicate.

使用网络 DAS 服务器(http://www. sbc. su. se/~miklos/DAS)对 VvBG1 蛋白序列进行跨膜结
构预测。在 strict cut-off 严格条件限制下,该蛋白分别在 8 ~ 18 氨基酸之间存在 1 个跨膜区域,推
测该序列为信号肽序列(图 4)。

图 4 DAS 服务器对葡萄中 VvBG1 氨基酸序列跨膜区域的预测
Fig. 4 Transmembrane domain of grapevine VvBG1 amino acid sequence predicted by DAS server
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2.3 VvBG1 原核表达载体的构建、表达及融合蛋白的纯化
根据信号肽预测(http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP)发现 VvBG1 信号肽断裂点位于 24 与
25 氨基酸之间,设计不含信号肽序列的原核表达引物。正义引物:5-GGATCCGAAAATATCA
CCAGAGGAAG-3,反义引物:5-CTCGAGGGGAGAATTCAAGAAGTTC-3,并分别在引物 5端引
入了 BamHⅠ和 XhoⅠ酶切位点(下划线部分)。将 PCR 扩增目的表达基因片段(图 5,A,白色箭
头),通过 BamHⅠ和 XhoⅠ限制性内切酶构建 pET28a-VvBG1 重组表达质粒(图 5,B,白色箭头),
然后转化 E. coli BL21(DE3)进行诱导表达。由图 6,A 中可以看出,随着诱导时间的增加,60 kD
融合蛋白表达量逐渐增加,至 3 ~ 4 h 达到最高值。通过 HIS 标签亲和层析得到融合蛋白含量高达
1.2 mg · mL-1,纯度在 90%以上(图 6,B)。
图 5 pET28a-VvBG1 载体构建
A:VvBG1 PCR 扩增产物(1、2:两个不带信号肽的扩增条带;M:分子量标准,DL2000);
B:pET28a-VvBG1 酶切鉴定(1、2:两个重组质粒酶切条带;3:重组质粒;M:分子量标准,DL2000)。
Fig. 5 Construction of pET28a-VvBG1 vectors
A:PCR amplified products of VvBG1(1,2:Two PCR amplified bands without signaling peptide;M:Marker,DL2000);
B:Identification of pET28a-VvBG1 using restriction endonucleases(1,2:Two digested bands;
3:One non-digested band;M:Marker,DL2000).

图 6 IPTG 诱导蛋白表达及纯化
A:随时间的诱导表达(1. pET28a 空载体;2. 诱导 0 h;3. 诱导 1 h;4. 诱导 2 h;5. 诱导 3 h;6. 诱导 4 h。M:蛋白 Marker);
B:表达蛋白洗脱纯化(1. 纯化前;2 ~ 6. 纯化 500 μL 依次收集的洗脱蛋白,浓度分别依次为
1.2、0.95、0.46、0.22、0.12、0.09 mg · mL-1。M:蛋白 Marker)。
Fig. 6 IPTG-induced expression and purification
A:Induced expression with time going on(1. Empty pET28a vector;2. 0 h induction;3. 1 h induction;4. 2 h induction;
5. 3 h induction;6. 4 h induction. M:Marker);B:Expressed protein elution and purification(1. Before purification;
2–6. Collecting elution purified protein one by one with 500 μL and in turn gaining their concentrations
at 1.2,0.95,0.46,0.22,0.12,0.09 mg · mL-1,respectively. M:Marker).
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2.4 纯化 β–葡萄糖苷酶活性检测
纯化蛋白经过复性和超滤浓缩,获得可溶蛋白浓度在 0.8 mg · mL-1 左右。用 0.5 g 着色期果肉匀
浆液和 500 μL 0.8 mg · mL-1 进行 25 ℃孵育 1 h 酶解反应。GC–MS 分析 ABA 含量。结果如图 7 所
示,水、洗脱缓冲液(Elution buffer)和复性蛋白(VvBG1)各处理管 ABA 含量分别约为 3.6、4.2
和 35 ng · L-1。试验结果表明,葡萄果实中 VvBG1 具有较高的葡萄糖基水解酶活性。

图 7 纯化蛋白葡萄果肉温育试验及 ABA 含量的测定
Fig. 7 Grape pulp-homogeneity-incubation test and ABA content analysis
3 讨论
近年来研究发现,ABA 在果实发育中起着重要的作用(Yu et al.,2006;Zhang et al.,2009;Sun
et al.,2010,2012;Jia et al.,2011)。来自模式植物拟南芥的研究证实,ABA 的水平一方面受生物
合成的决定,另一方面还要受到 ABA 代谢的调控:前者主要受 NCED 调控;后者主要受 ABA 羟基
化反应(形成 7-,8- 和 9-OH ABA)和结合作用(主要形成 ABA 葡萄糖苷 ABA-glucose ester,
ABA-GE)调控(Nambara & Marion-poll,2005)。Xu 等(2002)研究发现,一种受 ABA 诱导的葡
萄糖基转移酶 ABA-GTase(ABA-glucosyltransferase,EC 2.4.1.35)可以把游离的 ABA 转化为
ABA-GE。过去的研究认为,ABA 葡萄糖苷(ABA-GE)是一个没有活性的终产物(Lehmann & Schutte,
1984;Zeevaart,1999)。但是,随着拟南芥上 β–葡萄糖苷酶 AtBG1 首次鉴定,对以上认识发生了
根本地改变:即该酶能把无活性的结合态 ABA 葡萄糖苷直接转化为有活性的游离态 ABA,从而促
进活性 ABA 的快速积累(Lee et al.,2006)。
近年来借鉴模式植物的研究成果,β–葡萄糖苷酶在果实发育中作用已有少量报道(Sun et al.,
2010;王延书 等,2010;Li et al.,2012)。例如,当玫瑰香葡萄果实中 ABA 水平达到高峰时,部
分游离 ABA 将以 ABA-GE 形式储藏起来,说明果实发育后期存在 ABA-GE 库(Sun et al.,2010)。
王延书等(2010)在玫瑰香葡萄果实成熟期检测到了 VvBG1 基因的高水平表达。Li 等(2012)在
西瓜果实发育的后期也发现了 ClBG1 随着果实成熟表达量快速增加。以上研究在转录分析方面揭示
了 BG1 可能在果实成熟期起着重要的作用,但以上研究 BG1 蛋白酶活特点并没有阐述。本研究中
通过玫瑰香葡萄果实匀浆液温育试验检测到了外源表达蛋白 VvBG1 具有较高的生理活性。该结果
进一步证实了王延书等(2010)的推测:VvBG1 与始熟后 ABA 的积累存在密切的关系。
从生化代谢的能量和步骤来看,ABA 从头生物合成涉及了一系列复杂的生化代谢反应(Nambara
& Marion-poll,2005),而 BG 途径可以直接将大量的无活性的结合态 ABA 葡萄糖苷转化为有活性
的游离态 ABA。因此,BG 途径合成 ABA 比 NCED 途径要简单的多,解离途径合成 ABA 不但节省
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了大量的能量,而且更迅速(王延书 等,2010)。因此,如何通过基因工程或生物化学途径操纵果
实中 β–葡萄糖酯酶的活性进而快速调控 ABA 的水平,对于果实成熟调控及果品生产具有重要的意
义。

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