全 文 :园 艺 学 报 2011,38(12):2342–2348 http: // www. ahs. ac. cn
Acta Horticulturae Sinica E-mail: yuanyixuebao@126.com
收稿日期:2011–05–10;修回日期:2011–10–25
基金项目:国家自然科学基金项目(30900115,31070275);中央高校基本科研业务费专项基金项目(DL09BA08)
* 通信作者 Author for correspondence(E-mail:lyhshen@126.com)
羽衣甘蓝 ARC1 的基因分离、表达及与 SRK 相
互作用的分析
蓝兴国,杨 佳,赵 昕,李玉花*
(东北林业大学生命科学学院,哈尔滨 150040)
摘 要:以羽衣甘蓝(Brassica oleracea var. acephala)自交不亲和系(S13-bS13-b)为试验材料,利用
RT-PCR 的方法分离其 ARC1 基因 cDNA 序列(命名为 BoARC1,GenBank 登录号为 EU344909)。BoARC1
cDNA 序列中含有 1 个 1 992 bp 的开放读码框(ORF),编码 1 个含有 663 个氨基酸的蛋白质。羽衣甘蓝
BoARC1 与油菜 BnARC1 的氨基酸序列具有 94%的一致性;Southern 杂交结果显示 BoARC1 在基因组中
只存在单一拷贝;Northern 杂交结果显示 BoARC1 特异性地在柱头组织中表达;在酵母双杂交试验分析中,
BoARC1 能够与 SRK3、SRK13-b 和 SRK910 的胞内激酶域发生相互作用。
关键词:羽衣甘蓝;自交不亲和;ARC1;相互作用
中图分类号:S 681.9 文献标识码:A 文章编号:0513-353X(2011)12-2342-07
Isolation,Expression of ARC1 from Ornamental Kale and Interaction
Analysis Between ARC1 and SRK
LAN Xing-guo,YANG Jia,ZHAO Xin,and LI Yu-hua*
(College of Life Sciences,Northeast Forestry University,Harbin 150040,China)
Abstract:The ARC1 cDNA sequence was isolated from stigma of ornamental kale(Brassica oleracea
var. acephala)S13-bS13-b homozygotes using RT-PCR techniques,named BoARC1(GenBank accession No.
EU344909). The BoARC1 cDNA sequence had an ORF of 1 992 bp,encoding a 663-aa protein. The
deduced amino acid sequence of isolated BoARC1 shared 94% identity with Brassica napus ARC1.
Southern blot analysis showed that there was a single copy of BoARC1 gene in genome. Northern blot
analysis showed that BoARC1 mRNA only expressed in the stigma. The yeast two-hybrid analysis
indicated that the BoARC1 interacted with SRK3,SRK13-b and SRK910.
Key words:Brassica oleracea var. acephala;self-incompatibility;ARC1;interaction
自交不亲和性(Self-incompatibility,SI)是显花植物采取的一种避免自交,促进种内遗传多样
性的机制(Franklin-Tong,2008)。芸薹属植物 SI 反应是由花粉外壁蛋白 SCR(S-locus cysteine-rich
protein)/SP11(S-locus protein 11)与柱头乳突细胞膜 SRK(S-locus receptor kinase)受体特异性相
互作用引起的(Kachroo et al.,2001;Takayama et al.,2001;杨洋 等,2009)。SCR/SP11 配体是一
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个低相对分子质量并富含半胱氨酸的分泌蛋白,决定花粉的 SI(Schopfer et al.,1999;Takayama et
al.,2000)。
SRK 受体具有 3 个结构域:胞外域、跨膜结构域和胞内激酶域,控制柱头乳突细胞的 SI(Goring
& Rothstein,1992;Takasaki et al.,2000)。当花粉落到柱头表面之后,花粉 SI 信号分子 SCR/SP11
转运到柱头乳突细胞的表面,被受体 SRK 的胞外域识别,并引起 SRK 胞内域的磷酸化,通过下游
的信号传递来完成 SI 反应(Cabrillac et al.,2001;王艳红 等,2009;Ivanov et al.,2010;Tantikanjana
et al.,2010)。
利用酵母双杂交系统筛选 SRK 相互作用的蛋白,获得了 ARC1(armadillo repeat-containing
protein 1)、激酶相关的蛋白磷酸酶(kinase associated protein phosphatase)、硫氧还蛋白、钙调蛋白
(calmodulin)和分选连接蛋白(sorting nexin)(Bower et al.,1996;Gu et al.,1998;Vanoosthuyse
et al.,2003)。其中,ARC1 作为 S 位点受体激酶(SRK)的下游底物,在自交不亲和信号传递过程
中起着正调控因子的作用。转入 ARC1 反义基因的植株具有部分打破 SI 的现象(Stone et al.,1999)。
此外,在体外泛素化试验中,ARC1 具有 E3 泛素连接酶的活性;而且在自交授粉过程中,柱头内
蛋白质泛素化的水平特异性地增高(Stone et al.,2003;蓝兴国 等,2009,2010)。因此认为,
ARC1 利用其 E3 泛素连接酶的活性,将其下游底物通过泛素/26S 蛋白酶体途径降解从而引起 SI
反应。
本研究中以羽衣甘蓝自交不亲和系(S13-bS13-b)为研究试材,分离了 ARC1(BoARC1)基因。
对 BoARC1 进行序列及基因组拷贝数的分析,通过 Northern 杂交检测 BoARC1 mRNA 的表达模式,
利用酵母双杂交系统检测 BoARC1 与 SRK 胞内激酶域间的相互作用,从而为深入探讨 SI 的分子机
制奠定基础。
1 材料与方法
1.1 试验材料及其 BoARC1 cDNA 的分离
将羽衣甘蓝自交不亲和系(S13-bS13-b)于 2008 年 6 月—2009 年 5 月种植于东北林业大学花卉生
物工程研究所。
采集开花当天的柱头,利用 CTAB 法提取柱头总 RNA(蓝兴国 等,2009)。
RNA 反转录采用 AMV 反转录酶(TaKaRa)和锚定引物 Oligo (dT)18,反转录的程序为 42 ℃孵
育 30 min,99 ℃变性 5 min 和 4 ℃孵育 5 min。根据油菜 BnARC1 的 5′和 3′末端编码区(Gu et al.,
1998)设计 BoARC1 特异性引物 1(5′-TGTTCATTGATGTTCTACCC-3′)和引物 2(5′-GTTCTCTATC
ATAAGACC-3′),进行 BoARC1 编码区序列的扩增。
PCR 以反转录的第 1 条链作为模板,利用 LA Taq DNA 聚合酶(TaKaRa)进行反应,扩增条件
为 94 ℃变性 30 s,50 ℃退火 30 s,72 ℃延伸 2 min,共 35 个循环,72 ℃延伸 7 min。PCR 产物用
MagExtractor-PCR & Gel Clean up(东洋纺)回收,与 pGEM-T 载体连接,转化到 Top10 菌株中,
挑选阳性克隆,进行 DNA 序列测定。
1.2 BoARC1 的 Southern 杂交分析
提取叶片组织基因组 DNA(6 ~ 7 µg),分别用 EcoRⅠ、XbaⅠ、SalⅠ限制性内切酶进行消化
后,用 0.7%琼脂糖凝胶电泳分离;然后将 DNA 片段转移到 HybondTM-N 尼龙膜上;探针是以获得
的 BoARC1 编码区序列设计的引物 1(5′-GGTTACGACCTCAAAACAGG-3′)和引物 2(5′-TCC
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GGTCCAAATCACACAAC-3′),扩增片段长度为 308 bp,用地高辛标记;凝胶在变性液(0.5 mol · L-1
NaOH 和 1.5 mol · L-1 NaCl)中处理后,65 ℃水浴锅中过夜杂交;杂交后用 2% SSC 和 0.1% SDS
的溶液在室温下洗膜两次,每次 5 min;再用 0.1% SSC 和 0.1% SDS 溶液在 65 ℃洗 30 min,进行 X
光片显影。
1.3 BoARC1 的 Northern 杂交分析
提取根、茎、叶、花瓣、花药和不同发育阶段柱头的总 RNA(15 µg),用 0.7%琼脂糖凝胶电泳
分离;然后将 RNA 片段转移到 HybondTM-N 尼龙膜上;探针与 Sourthern 杂交探针相同;尼龙膜在
65 ℃水浴锅中过夜杂交;杂交后用 2% SSC 和 0.1% SDS 的溶液在室温下洗膜两次,每次 5 min;再
用 0.1% SSC 和 0.1% SDS 溶液在 65 ℃洗 30 min,进行 X 光片显影。
1.4 BoARC1 与 SRK 的酵母双杂交分析
将 BoARC1、BnARC1(Gu et al.,1998)全长编码区 cDNA 连接到 pGADT7 酵母表达载体中,
构建AD-BoARC1、AD-BnARC1质粒,利用的引物为BO1(5′-GGAATTCCATATGGCCACTGATTCAG
CAATGTTC-3′)和 BO2(5′-CAGAATTCTTATCTCTGTGTTTTCTGGTCGC-3′);BN1(5′-GGAATTCCA
TATGGCCACTGATTCAGCAATGTTC-3′)和 BN2(5′-CAGAATTCTTATCTCTGTGTGTTCTGGTCGC-
3′)。
另一方面,将编码甘蓝 SRK3(Delorme et al.,1995)、羽衣甘蓝 SRK13-b(蓝兴国 等,2010)、
油菜 SRK910(Goring et al.,1992)激酶结构域的 cDNA 分别连接到酵母表达载体 pGBDT7 中,构
建 BD-SRK3、BD-SRK13-b、BD-SRK910,利用的引物为 SRK3-1(5′-CGGAATTCAAAAGAAAACAAAA
GCGAGC-3′)和 SRK3-2(5′-CGGGATCCTTACCGGGCATCGATGAATGAGC-3′);SRK13-b-1(5′-CATG
CCCATGGAGAAAAGGAAACAAAATCGAGC-3′)和 SRK13-b-2(5′-CGGGATCCTTACCGGGCATCGA
TGACTGAGC-3′);SRK910-1(5′-CATGCCCATGGAGAAAAGGAAACAAAAGCGAGC-3′)和SRK910-2
(5′-CGGGATCCCTACCGGGCATCGATGTCTGA-3′)。
酵母双杂交系统参照 Clontech 公司的 GAL4 Two-Hybrid System 3 系统的说明书,使用的酵母菌
株为 Y187,采用醋酸锂转化法进行酵母的转化,利用滤纸转移法检测 β–半乳糖苷酶的分泌,将附
着有酵母克隆的滤纸在液氮速冻后,放在浸有 Z-buffer/X-β-Gal 的滤纸上,在室温孵育 2 h 内,显蓝
色为阳性结果。
2 结果与分析
2.1 BoARC1 基因的克隆与序列分析
利用已知油菜 BnARC1 基因的序列设计引物,通过 RT-PCR 的方法从羽衣甘蓝的柱头组织中获
得 ARC1(BoARC1)的 cDNA 序列,GenBank 收录号为 EU344909。
BoARC1 的 cDNA 序列含有一个 1 992 bp 的开放读码框(ORF),编码一个含有 663 个氨基酸的
蛋白质。通过氨基酸序列比对分析显示,BoARC1 的序列与油菜 BnARC1 的序列具有 94%的一致性
(图 1)。
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图 2 BoARC1 的 Sourthern 杂交分析
Fig. 2 Sourthern blot analysis of BoARC1
图 1 羽衣甘蓝 BoARC1 与油菜 BnARC1 氨基酸序列比对
不一致的氨基酸序列比对用灰色背景显示,“-”代表空位。
Fig. 1 Alignment of predicted amino acid sequences between BoARC1 and BnARC1
Different residues are shaded gray.“-”are introduced to optimize the alignment.
2.2 BoARC1 的 Sourthern 杂交分析
为了分析 BoARC1 在羽衣甘蓝基因组中的
拷贝数,将其基因组 DNA 经 EcoRⅠ、XbaⅠ、
SalⅠ限制性内切酶酶切消化,用 BoARC1 探针
进行杂交,结果显示只有单一的条带(图 2),
这说明 BoARC1 可能在基因组中只存在单一的
拷贝。而且,在获得的 BoARC1 序列中不存在
EcoRⅠ、XbaⅠ、SalⅠ限制性内切酶酶切位点,
这进一步确定 BoARC1 在基因组中只存在单一
的拷贝。
2.3 BoARC1 的表达分析
为了分析 BoARC1 在植物组织中的表达情况,分别提取各组织中的总 RNA,利用 Northern 杂交
的方法进行检测。结果表明,BoARC1 在根、茎、叶、花瓣、花药中没有表达,只在柱头中有表达,
在柱头发育的早期阶段(1 ~ 4 mm、4 ~ 6 mm 花蕾内的柱头)表达量较低,在柱头接近成熟阶段(6 ~
8 mm、8 ~ 10 mm 花蕾内的柱头和接近开花的花蕾)表达量增高(图 3)。
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图 3 BoARC1 的表达分析
1:0 ~ 4 mm 花蕾;2:4 ~ 6 mm 花蕾;3:6 ~ 8 mm 花蕾;4:8 ~ 10 mm 花蕾;5:接近开花的花蕾。
Fig. 3 Expression analysis of BoARC1
The stage numbers correspond to different bud sizes. 1:0–4 mm;2:4–6 mm;3:6–8 mm;
4:8–10 mm;5:Approaching the flowering period.
2.4 BoARC1 与 SRK 相互作用的分析
将 BoARC1、BnARC1 的编码区序列构建到 pGADT7 载体中,获得 AD-BoARC1 和 AD-BnARC1
质粒;把羽衣甘蓝 SRK13-b、甘蓝 SRK3、油菜 SRK910 的编码胞内域的序列构建到 pGBDT7 载体中,
获得 BD-SRK13-b、BD-SRK3、BD-SRK910 质粒。为了分析 BoARC1 与 SRK 胞内域的相互作用,将
获得的质粒相应地共转化到 Y187 酵母菌株。结果表明,共转化的酵母菌株能够在双缺陷(-leu-trp)
培养基中正常的生长,并且通过 X--gal 显色检验成蓝色(图 4),这说明 BoARC1、BnARC1 分别
与 SRK13-b、SRK3、SRK910 的胞内域存在相互作用。
图 4 利用酵母双杂交检测 ARC1 与 SRK 的相互作用
pGADT7-T 和 pGBDT7-53 质粒、pGADT7-T 和 pGBDT7-Lam 质粒分别共转化到酵母细胞中,作为阳性和阴性对照。
Fig. 4 Interaction analysis between ARC1 and SRK in the yeast two-hybrid system
Combinations of pGADT7-T and pGBDT7-53,pGADT7-T and pGBDT7-Lam
were the positive and negative controls,respectively.
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3 讨论
羽衣甘蓝是我国北方秋冬季节深受人们喜爱的一种观赏和食用植物。由于大部分羽衣甘蓝栽培
品种具有 SI,在育种过程中受到了人们的关注并且得到了应用。在本研究中,为了进一步探讨 SI 的分
子机制,作者从具有较强 SI 的羽衣甘蓝自交不亲和系(S13-bS13-b)中分离出 BoARC1 基因。BoARC1
在羽衣甘蓝的基因组中只存在单一的拷贝;氨基酸序列比对分析显示 BoARC1 与油菜 BnARC1 具有
较高(94%)的一致性;并且 BoARC1 主要在柱头组织内特异性地表达,而且在柱头接近成熟期时
表达量较高,这种表达的时空性是与 SI 反应相关的;此外,酵母双杂交试验分析显示 BoARC1 能
够与不同 S 单倍型的 SRK 胞内域进行相互作用,这说明 BoARC1 作为 SRK 下游的底物参与 SI 的反
应。
芸薹属植物 SI 反应发生在授粉过程中多个阶段,如花粉水合、花粉代谢的激活、花粉管的形成、
花粉管穿入柱头乳突细胞壁等(Heslop-Harrison,1975),这暗示 SI 信号转导的网路可能是复杂的。
在反向遗传学研究中发现,BnARC1 的反义转基因植株表型没有发生变化,但有打破 SI 的现象。因
此认为,ARC1 在 SI 信号传递过程中起着正向调控因子的作用。此外,在体外的生化分析中,BnARC1
具有 E3 泛素连接酶的活性,而且在自交授粉过程中蛋白质泛素化水平增加,因此推测 SI 反应是
ARC1 将其下游底物泛素化通过 26S 蛋白酶体途径降解引起的。最近发现,一个蛋白囊泡转运和分
泌复合体的成分 Exo70A1 作为 ARC1 下游的一个底物参与到 SI 反应中(Samuel et al.,2009;Chong
et al.,2010)。Exo70A1 能够被 ARC1 泛素化;在转基因试验中,过量表达 Exo70A1 的植株具有部
分打破 SI 的现象;Exo70A1 功能丧失的植株干扰了亲和花粉管的生长。
目前,虽然在 SI 信号转导途径中取得了一些进展,但对于 ARC1 介导 SI 反应的机制还存在许
多问题,如 ARC1-Exo70A1 信号途径不能完全打破 SI,这就暗示着 SI 信号网络还存在其它分支的
可能。本研究中分离和鉴定出羽衣甘蓝 BoARC1 基因,并且认为 BoARC1 作为 SRK 下游的底物参
与 SI。这为下一步筛选 BoARC1 相互作用的蛋白,通过功能获得和功能丧失的转基因试验来阐释
SI 的分子机制奠定了基础。
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