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东北地区香茶菜属植物遗传多样性的RAPD分析



全 文 :北方园艺2013(12):87~90 ·生物技术·
第一作者简介:张博(1987-),女,吉林松原人,硕士研究生,现主要从
事药用植物资源学和生态学研究工作。E-mail:zb1987523@qq.com.
责任作者:刘霞(1965-),女,吉林长春人,博士,副教授,现主要从
事中药资源的分类和调查与栽培技术的研究工作。E-mail:
Liuxia651015@163.com.
收稿日期:2013-01-17
东北地区香茶菜属植物遗传多样性的RAPD分析
张   博,刘 翠 晶,刘   霞
(吉林农业大学 中药材学院,吉林 长春130118)
  摘 要:以东北地区不同产地的24份蓝萼香茶菜和尾叶香茶菜样品为试材,采用RAPD分
子标记技术对其进行遗传多样性分析。结果表明:从60条随机引物中筛选出5条引物用于2种
香茶菜的扩增,2种香茶菜共扩增得到63条清晰条带,其中55条为多态性条带,多态性比率为
87.30%。系统聚类分析结果表明,2种香茶菜亲缘关系明显,遗传多样性较丰富,且种间大于种
内。因此,RAPD分子标记技术可以作为研究香茶菜属植物遗传多样性的有效标记方法。
关键词:蓝萼香茶菜;尾叶香茶菜;RAPD;聚类分析
中图分类号:Q 949.95 文献标识码:A 文章编号:1001-0009(2013)12-0087-04
  唇形科香茶菜属植物[Rabdosia(BL.)Hassk.]在全世
界约有150种,我国约有90种21个变种,是该属植物资源
最丰富的国家[1]。东北地区有2种,即蓝萼香茶菜[Rabdo-
sia japonica (Burm.f.)Hara var.glaucocalyx (Maxim.)
Hara]和尾叶香茶菜[Rabdosia excise(Maxim.)Hara]。2种
香茶菜在吉林省的分布尤为丰富,多生长在向阳山坡、路边、
林间等地[2-3]。香茶菜属植物在民间多作药用,用于清热解
毒、活血破瘀、抗菌消炎、抗癌、治疗各种肝炎等[4]。对于这2
种香茶菜属植物的研究,国内外多有报道,主要集中在其化
学成分、药理和毒理作用等方面[5-9]。该研究利用随机扩增
多态性DNA(Random amplified polymorphic DNA,RAPD)标
记技术对东北地区不同产地的2种香茶菜的自然群体的遗
传多样性进行研究,以期从分子水平研究其适应环境变化
的能力,为更好的开发、利用和保护现有的野生植物资源奠
定基础,也为这一药用植物人工栽培提供相关理论依据。
1 材料与方法
1.1 试验材料
供试蓝萼香茶菜和尾叶香茶菜采于2012年6~8
月,蓝萼香茶菜采自吉林省的长白县十二道沟、磐石市
烟筒山和延吉市帽儿山,尾叶香茶菜采自吉林省长白县
十二道沟、磐石市烟筒山和辽宁省丹东凤凰山(表1)。
每个样地每种香茶菜分别采摘4株新鲜幼嫩叶片,每株
植株间隔10m以上,装入冰盒带回实验室,处理干净后
置于-70℃超低温冰箱中保存备用。
表1 采样地地理位置
  Table 1 Geograhical location of sampling
采样地(采样地代号) 样本数 经度 纬度 海拔/m
长白十二道沟(LCB) 4  127°42′E  41°25′N  500~750
磐石市烟筒山(LYT) 4  126°10′E  43°17′N  350~450
延吉市帽儿山(LMS) 4  129°28′E  42°51′N  210~240
长白十二道沟(WCB) 4  127°42′E  41°25′N  500~750
磐石市烟筒山(WYT) 4  126°10′E  43°17′N  350~450
辽宁省凤凰山(WFH) 4  124°5′E  40°25′N  300~400
  基因组操作试剂盒(大连宝生物工程有限公司)、
DL 2 000DNA Marker(大连宝生物工程有限公司)、
2×Power Taq PCR Master Mix(北京百泰克生物技术有
限公司)、随机引物(上海生工生物工程股份有限公司)、
三羟甲基氨基甲烷(Tris)、硼酸、乙二胺四乙酸(EDTA)、
溴化乙锭(EB)、琼脂糖(上海瓦兰生物技术有限公司)。
5×TBE电泳缓冲液(1 000mL):54g Tris,27.5g
硼酸,20mL 0.5MEDTA(pH 8.0),ddH2O补充至
1 000mL。
1.2 试验方法
1.2.1 基因组DNA提取 每个单株取新鲜叶片50mg,
采用试剂盒提取DNA后,用1.5%的琼脂糖凝胶置于
0.5×TBE的电泳缓冲液中电泳30min,用EB染色
5min,取出胶块于天能数码凝胶图像处理系统(上海,广
州誉维生物科技仪器有限公司)中观察成像,记录DNA
质量,并用微量分光光度计检测其浓度和纯度,最后将
浓度稀释至4ng/μL,-20℃保存备用。
1.2.2 PCR扩增 反应体系(20μL):ddH2O 9.2μL,
2×Power Taq PCR Master Mix 9μL,模板DNA 1μL,
引物0.8μL。扩增程序为:94℃预变性3min;94℃40s,
36℃1min,72℃1min,38个循环;72℃延伸5min,4℃
保温。取4μL扩增产物于2%的琼脂糖凝胶电泳中电
泳1h后,经溴化乙锭染色,置于天能成像系统中进行拍
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·生物技术· 北方园艺2013(12):87~90
照记数。每个引物重复3次,以确保条带的稳定性。
1.3 数据分析
RAPD是显性标记,同一个引物扩增产物的电泳迁
移率一致的条带被认为具有同源性。根据凝胶同一位
置片段的有无进行统计,有带的记为“1”,无带的记为
“0”,建立0/1数据矩阵,用DPS数据处理软件构建遗传
距离矩阵,用UPGMA法(非加权的成对算术平均法)构
建RAPD聚类树状图。
2 结果与分析
2.1 引物筛选
分别用2种香茶菜的DNA模板进行扩增筛选,从
60条RAPD随机引物中筛选出5条条带清晰、数量多、稳
定性好和多态性高的引物用于2种香茶菜的RAPD-PCR
反应(表2)。
表2 用于RAPD分析的5条随机引物序列
  Table 2 Sequence of 5random primers used in RAPD analysis
引物 序列(5′~3′) 引物 序列(5′~3′)
OPB-10 GTGTGCCCCA  OPO-05 CCACGGGAAG
OPD-08 CCCAGTCACT  OPO-06 AGGGAACGAG
OPD-11 CCACGGGAAG
2.2 RAPD扩增条带的多态性分析
利用5个引物分别对2种香茶菜的各个自然居群
样品进行RAPD分析,由表3可知,扩增得到的清晰可
记录的条带为11~14条不等。共扩增出63条可统计条
带,其中多态性条带55条,占总条带数的87.30%,平均
每个引物扩增出12条带,其中11条是多态性条带,2种
香茶菜表现出较高的遗传多样性。图1为引物OPD-08
对2种香茶菜样品的扩增结果对比图,图2为引物OPO-
05对尾叶香茶菜样品2次重复试验的扩增结果。
表3 蓝萼香茶菜和尾叶香茶菜种群多态位点比率
  Table 3 Percentage of polymorphic loci of
R.japonicavar.glaucocalyxand R.excise
引物 条带数 多态性条带数 多态位点比率/%
OPB-10  11  10  90.91
OPD-08  14  12  85.71
OPD-11  12  10  83.33
OPO-05  12  11  91.67
OPO-06  14  13  92.86
Total  63  55  87.30
图1 引物OPD-08对24份香茶菜样品的扩增
注:左1~4为 WCB,5~8为 WYT,9~12为 WFH;右1~4为LCB,5~8为LYT,9~12为LMS。
Fig.1 Amplified products of 24samples of Isodonusing primer OPD-08
Note:Left 1~4is WCB,5~8is WYT,9~12is WFH;right 1~4is LCB,5~8is LYT,9~12is LMS.
图2 引物OPO-05对尾叶香茶菜样品的扩增结果
注:1~4为 WCB,5?~8为 WYT,9~12为 WFH,2次重复。
Fig.2 Amplified products of 12samples of R.excisausing primer OPO-05
Note:1~4is WCB,5~8is WYT,9~12is WFH,repeat two times.
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2.3 2种香茶菜居群间聚类分析
通过用DPS数据处理软件按Nei’s遗传距离,得到
蓝萼香茶菜和尾叶香茶菜的24个样本的居群遗传距
离,其范围约为0.0000~0.4194,并使用UPMGA聚类
法得出树状图(图3)。从图3可以看出,在遗传距离
0.3143处,聚类为二大类群,前12个是蓝萼香茶菜,后
12个是尾叶香茶菜。蓝萼香茶菜的种内遗传距离较小,
磐石烟筒山(LYT11)和长白县(LCB)的4个样品之间的
遗传距离较近,为0.0811,首先聚在一起,再与延吉帽儿
山(LMS)的4个样品聚类,最后与磐石烟筒山(LYT)的
其它3个样品聚集成为蓝萼香茶菜的类群。由于长白
县(WCB6)与凤凰山(WFH)的4个样品遗传距离较近,
为0.1667,首先聚在一起,又与烟筒山(WYT)的4个样
品聚在一起,最后于长白县(WCB2、4、8)的3个样品聚
集成为尾叶香茶菜类群。图3结果明确显示出蓝萼香
茶菜和尾叶香茶菜的亲缘关系,但仍可看出2种香茶菜
的种间差异大于种内差异。
图3 种源Nei’s遗传距离的UPGMA聚类图
Fig.3 UPGMA based on Nei’s genetic distance
3 讨论
利用RAPD标记可明确显示出供试材料种间和种
内的遗传差异,并能根据种内不同基因型或种间差异将
供试材料区分出来。长白县(WCB6)与丹东凤凰山
(WFH)的4份尾叶香茶菜存在交叉现象,也许是因为尾
叶香茶菜主要分布在东北地区,自然资源丰富,种内遗
传差异较小。磐石烟筒山(LYT11)与长白县的4份蓝
萼香茶菜存在交叉现象,原因也是如此。由于采集的材
料数量和地点有限,对研究这2种香茶菜的遗传多样性
有一定的局限性,因此,今后可采集更多地区的香茶菜
进行居群遗传多样性研究。
由于RAPD分子标记技术操作简便、快速、易行,近
年来广泛的用于研究种群遗传结构和种质资源保
存[10-11],及药用植物的遗传关系[12]。该试验结果表明,
利用RAPD技术对香茶菜属植物的蓝萼香茶菜和尾叶
香茶菜进行遗传分析时,表现出较强的区分能力,这也
说明用RAPD标记技术分析香茶菜属植物种质资源遗
传多态性的可行性。检测方法的稳定性是影响样本的
遗传多样性和居群遗传结构的重要因素。该试验中,
RAPD对DNA模板的纯度和退火温度极为敏感,对聚
合酶等条件在一定范围内的改变却稳定很多。这与
Schierwater等[13]和Skroch等[14]的研究结论相符。因
此,确保DNA模板的质量,使用同一批次的聚合酶,并
且在同一台PCR仪进行试验,是获得重复性好的试验结
果必要保障。
参考文献
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·生物技术· 北方园艺2013(12):90~92
作者简介:祝海燕(1978-),女,硕士,讲师,研究方向为蔬菜学。
E-mail:zhuhaiyan1978@126.com.
收稿日期:2013-01-21
结球甘蓝不同初级三体的花粉整齐度及生活力的研究
祝 海 燕
(潍坊科技学院,山东 寿光262700)
  摘 要:以“中甘11”结球甘蓝初级三体为试材,结球甘蓝二倍体为对照,研究比较了其花粉
生活力、花粉整齐度和花粉量。结果表明:结球甘蓝各初级三体花粉的花粉量、整齐度、生活力均
低于二倍体,但不同三体之间存在着显著差异。经比较发现,三体6的花粉不管是在花粉量、花
粉整齐度还是花粉生活力上与二倍体相比都达到了差异极显著水平,说明结球甘蓝第6染色体
对花粉各方面的影响都较大,可能存在于花粉发育相关的基因。
关键词:结球甘蓝;初级三体;花粉整齐度;花粉生活力
中图分类号:S 635.1 文献标识码:A 文章编号:1001-0009(2013)12-0090-03
  初级三体是重要的遗传工具材料,利用初级三体可
将基因及连锁群定位到特定染色体上,从而构建基因的
物理图谱。由于三体增加了一条同源的额外染色体,位
于该染色体上的DNA含量亦以等比例增加,因此必定
会影响到植株性状的表现,现以结球甘蓝二倍体为对
照,对结球甘蓝各初级三体的花粉生活力、花粉整齐度、
花粉量进行了研究,旨在研究不同染色体的附加对结球
甘蓝花粉生活力、花粉整齐度及花粉量的影响,以期为
结球甘蓝三体有性繁殖的保存、利用及利用其进行基因
定位提供遗传参数和依据。
1 材料与方法
1.1 试验材料
供试植物材料为“中甘11”结球甘蓝初级三体系
    
植株。
1.2 试验方法
1.2.1 花粉量的测定 用血球计数板测定花粉量。取
单个花朵内即将开裂散粉的6枚花药置于洁净的小玻
璃瓶中,加入10%甘露醇水溶液1mL,制成花粉悬浮
液,3次重复。然后用血球计数板计数花粉数,并计算出
平均单个花药中花粉量。
1.2.2 花粉整齐度的观察 于上午9:00左右分别采
集各初级三体及二倍体当天散粉的花粉,将采集的新
鲜花粉均匀地撒到洁净的载玻片上,在40×镜下观察
并记录花粉总数及畸形花粉数,各材料的观察花粉数
为1 000~1 500粒,并统计正常花粉和畸形花粉所占的
比例。
1.2.3 花粉生活力的测定 用TTC(2,3,5-氯化三苯基
四氮唑)染色法进行花粉生活力的测定。用10%的蔗糖
溶液配成0.5%的TTC染色液。将新鲜花粉涂在载玻
片上,加1~2滴TTC染色液,盖上盖玻片,放入铺有湿
    
RAPD Analysis on the Genetic Diversity of Genus Rabdosiain Northeast China
ZHANG Bo,LIU Cui-jing,LIU Xia
(Colege of Chinese Medicinal Materials,Jilin Agricultural University,Changchun,Jilin 130118)
Abstract:Taking 24samples of Rabdosia japonica(Burm.f.)Hara var.glaucocalyx(Maxim.)Hara and Rabdosia excise
(Maxim.)Hara from diferent regions of northeast China as materials,the genetic diversity was studied using random
amplified polymorphism DNA(RAPD)markers.The results showed that 5primers were selected from 60primers.63DNA
bands were amplified from the two species of Rabdosia,the percentage of polymorphism was 87.30%.Analysis of Nei’s
unbiased genetic distance showed that the genetic relationship between the two species of Rabdosia was significant.The
genetic diversity was high,and the genetic diversity of interspecies was higher than that of interspecies.In conclusion,RAPD
molecular marker technology could be an eficient method to study the genetic diversity of Rabdosiaplants.
Key words:Rabdosia japonica var.glaucocalyx;Rabdosia excise;RAPD;cluster analysis
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