本研究主要评估了双齿围沙蚕热休克蛋白70(HSP70)基因的分子特征,记录了其对于液态Cu2+胁迫的基因表达情况,并通过测序获得的HSP70 cDNA序列与其他沙蚕及无脊椎动物HSP70同源性比对来判定蛋白特性.结果表明: 该HSP70基因全长cDNA序列共2161 bp,包括5′非翻译区48 bp,3′非翻译区142 bp,一个多聚腺苷酸信号序列(AATAAA)和Poly A尾巴以及开放阅读框1971 bp.阅读框共编码656个氨基酸,总分子量为71.43 kD,理论等电点为5.15.该氨基酸序列中含有HSP70家族的3个签名序列——IDLGTTYS、IFDLGGGTFDVSIL和IVLVGGSTRIPKIQK,以及细胞质特异性调控基序EEVD,C端重复序列GGMP.同源性分析表明,本研究所获双齿围沙蚕HSP70氨基酸序列与已报道的序列相似性高达94%,与其他无脊椎生物的HSP70相似性也高达79%以上.荧光实时定量PCR分析表明,Cu2+〖KG*4〗(0.2~5.0 mg·L-1)胁迫能够显著诱导沙蚕HSP70 mRNA表达,并于1 d后达到峰值.本研究系统描述了双齿围沙蚕HSP70的分子特性,其可被液态Cu2+诱导表达,具备作为环境污染分子生物标记物的潜力.
The objective of this study was to evaluate the molecular characteristics of heat shock protein 70 (HSP70) gene, and document changes in HSP70 gene expression upon exposure of Perinereis aibuhitensis to aqueous Cu2+. Full length cDNA of HSP70 was sequenced and the characteristics of the translated protein were determined and compared both with other ragworms species and other invertebrates. The results showed that the cDNA was 2161 bp and consisted of a 5′terminal untranslated region (UTR) of 48 bp, a 3′termianl UTR of 142 bp with a canonical polyadenylation signal sequence AATAAA and a poly A tail, and an open reading frame (ORF) of 1971 bp. The HSP70 protein was 656 amino acids with a calculated molecular weight of 71.43 kD and theoretical isoelectric point of 5.15. Sequence analysis of the protein showed that HSP70 of P. aibuhitensis contained three signature sequences IDLGTTYS, IFDLGGGTFDVSIL and IVLVGGSTRIPKIQK all belonging to the HSP70 family, a cytoplasm characteristic motif of EEVD, and the Cterminal repeats of GGMP. The molecular characteristics of P. aibuhitensis shared 94% identity with other ragworms and 79% identity with other invertebrates. In ragworms exposed to Cu2+, expression of HSP70 mRNA increased significantly with Cu2+ concentration (0.2-5.0 mg·L-1), and it reached the peak on 1day exposure. In summary, the molecular characteristics of HSP70 of P. aibuhitensis were described, and its gene expression was inducible by exposure to aqueous Cu2+, suggesting HSP70 has potential to become a useful molecular biomarker of environmental pollution.
全 文 :双齿围沙蚕诱导型热休克蛋白 70基因的
克隆及 Cu胁迫下的表达分析
张倩茹1∗ 姜丽思1,2 牟文燕1,2 李斯雯1,3 魏树和1
( 1中国科学院沈阳应用生态研究所污染生态与环境工程重点实验室, 沈阳 110016; 2中国科学院大学, 北京 100049; 3辽宁大
学环境学院, 沈阳 110036)
摘 要 本研究主要评估了双齿围沙蚕热休克蛋白 70(HSP70)基因的分子特征,记录了其对
于液态 Cu2+胁迫的基因表达情况,并通过测序获得的 HSP70 cDNA序列与其他沙蚕及无脊椎
动物 HSP70同源性比对来判定蛋白特性.结果表明: 该 HSP70 基因全长 cDNA 序列共 2161
bp,包括 5′非翻译区 48 bp,3′非翻译区 142 bp,一个多聚腺苷酸信号序列(AATAAA)和 Poly A
尾巴以及开放阅读框 1971 bp.阅读框共编码 656个氨基酸,总分子量为 71.43 kD,理论等电点
为 5.15.该氨基酸序列中含有 HSP70 家族的 3 个签名序列———IDLGTTYS、IFDLGGGTFDVSIL
和 IVLVGGSTRIPKIQK,以及细胞质特异性调控基序 EEVD,C 端重复序列 GGMP.同源性分析
表明,本研究所获双齿围沙蚕 HSP70氨基酸序列与已报道的序列相似性高达 94%,与其他无
脊椎生物的 HSP70 相似性也高达 79%以上.荧光实时定量 PCR 分析表明,Cu2+ (0.2 ~ 5.0
mg·L-1)胁迫能够显著诱导沙蚕 HSP70 mRNA 表达,并于 1 d 后达到峰值.本研究系统描述
了双齿围沙蚕 HSP70的分子特性,其可被液态 Cu2+诱导表达,具备作为环境污染分子生物标
记物的潜力.
关键词 双齿围沙蚕; 热休克蛋白 70; 生物信息学分析; 基因表达; 重金属胁迫
本文由国家自然科学基金项目 (40801202,31470552)、国家 “十二五”科技支撑计划项目 ( 2012BAC17B04)、辽宁省自然科学基金项目
(20102232)和教育部留学回国人员科研启动基金项目资助 This work was supported by the National Natural Science Foundation of China
(40801202,31470552 ), the Key Projects in the National Science & Technology Pillar Program during the Twelfth Five⁃year Plan Period
(2012BAC17B04), the Natural Science Foundation of Liaoning Province (20102232) and the Scientific Research Foundation for the Returned Overseas
Chinese Scholars, State Education Ministry.
2015⁃09⁃12 Received, 2016⁃02⁃28 Accepted.
∗通讯作者 Corresponding author. E⁃mail: zhangqianru@ iae.ac.cn
Gene cloning and expression analysis of an inducible heat shock protein 70 gene from the
polychaete Perinereis aibuhitensis under Cu2+ stress. ZHANG Qian⁃ru1∗, JIANG Li⁃si, MU
Wen⁃yan1,2, LI Si⁃wen1,3, WEI Shu⁃he1 ( 1Key Laboratory of Pollution Ecology and Environmental
Engineering, Institute of Applied Ecology, Chinese Academy of Sciences, Shenyang 110016, China;
2University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, China; 3College of Environmental
Sciences, Liaoning University, Shenyang 110036, China) .
Abstract: The objective of this study was to evaluate the molecular characteristics of heat shock
protein 70 (HSP70) gene, and document changes in HSP70 gene expression upon exposure of
Perinereis aibuhitensis to aqueous Cu2+ . Full length cDNA of HSP70 was sequenced and the charac⁃
teristics of the translated protein were determined and compared both with other ragworms species
and other invertebrates. The results showed that the cDNA was 2161 bp and consisted of a 5′⁃termi⁃
nal untranslated region (UTR) of 48 bp, a 3′⁃termianl UTR of 142 bp with a canonical polyadeny⁃
lation signal sequence AATAAA and a poly A tail, and an open reading frame (ORF) of 1971 bp.
The HSP70 protein was 656 amino acids with a calculated molecular weight of 71.43 kD and theore⁃
tical isoelectric point of 5.15. Sequence analysis of the protein showed that HSP70 of P. aibuhitensis
contained three signature sequences IDLGTTYS, IFDLGGGTFDVSIL and IVLVGGSTRIPKIQK all
belonging to the HSP70 family, a cytoplasm characteristic motif of EEVD, and the C⁃terminal re⁃
peats of GGMP. The molecular characteristics of P. aibuhitensis shared 94% identity with other rag⁃
应 用 生 态 学 报 2016年 5月 第 27卷 第 5期 http: / / www.cjae.net
Chinese Journal of Applied Ecology, May 2016, 27(5): 1628-1638 DOI: 10.13287 / j.1001-9332.201605.021
worms and 79% identity with other invertebrates. In ragworms exposed to Cu2+, expression of
HSP70 mRNA increased significantly with Cu2+ concentration (0.2-5.0 mg·L-1), and it reached
the peak on 1⁃day exposure. In summary, the molecular characteristics of HSP70 of P. aibuhitensis
were described, and its gene expression was inducible by exposure to aqueous Cu2+, suggesting
HSP70 has potential to become a useful molecular biomarker of environmental pollution.
Key words: Perinereis aibuhitensis; HSP70; bioinformatics analysis; gene expression; heavy metal
stress.
长期以来,对水体的安全评价一直以化学分析
为主要手段,但有限的化学分析数据很难直观地反
映出受试水体的生物毒性.因此,如何灵敏、快速地
检测和评价环境污染成为迫切需要解决的现实问
题.基于污染物对生态系统影响的最早期作用发生
于分子水平的原理,研究污染物与生物体内有关生
化成分(特别是蛋白质和核酸)的反应,利用生物标
记物来评估污染物的生态毒性,进而做出污染物的
早期预警及诊断是目前生态毒理学的研究热点.研
究发现,热、重金属、氧化损伤及病源侵染会诱导细
胞表达和分泌热休克蛋白 ( heat shock proteins,
HSPs),且当生物体受到胁迫时,热休克蛋白比基于
生长速率、死亡率或繁殖率等而建立的生物标记物,
变化更迅速,更能被较早检测出来[1-2] .
热休克蛋白 70(HSP70)是进化最为保守、研究
最为广泛和功能上至关重要的一类热休克蛋白家
族,具有多种生物学功能,包括分子伴侣功能、参与
免疫反应、抗细胞凋亡功能、抗氧化功能、提高细胞
的应激耐受性、促进细胞增殖、参与细胞骨架的形成
和修复等[2-3] .普遍存在于绝大多数生物(一些古细
菌除外)体内[4] .HSP70 可分为两种类型,即组成型
HSC70 ( heat shock cognate protein 70 ) 和诱导型
HSP70(heat shock protein 70) [5-6] .正常生理条件下,
HSC70 在所有细胞内均能稳定表达,而诱导型
HSP70不表达或表达量极低;在外界刺激下,HSC70
在细胞内表达量维持不变或少量增加,而诱导型
HSP70表达量显著上升[7-9] .这两种基因所编码的
热休克蛋白在细胞内作为分子伴侣均发挥着重要作
用,组成型 HSC70主要与细胞的分裂、增殖、发育等
生理过程相关[10];而诱导型 HSP70 主要参与应激
保护、改善细胞的生存能力以及提高对环境胁迫或
伤害的耐受性[2,11] .大量研究证实,HSP70 可被重金
属、氧化剂、过氧化物、化学杀虫剂、类固醇、硝基苯
酚等无机和有机污染物诱导表达[6-7,12],与生物的
环境适应能力密切相关,因此许多学者认为 HSP70
是一种潜在的环境污染早期综合预警的生物标
志物[1,6,13] .目前,有关水生生物 HSP70 被污染物
诱导表达的相关研究多集中在鱼类[3,14-15]、贝
类[6-7,13,16]、螺类[17]、甲壳类[18]等. Radlowska 等[19]
研究表明,高浓度重金属污染可导致紫贻贝(Mytilus
edulis)体内 HSP70表达水平升高,在一定浓度范围
内,其表达量随着镉和铜浓度的升高而升高.中国学
者的研究也表明,在一定浓度范围内牡蛎 (Cras⁃
sostrea hongkongensis)体内 HSP70 基因的表达量随
Cu2+浓度的升高而升高[6],这可能是由于铜在牡蛎
体内逐渐富集后超过了生物体对其吸收的临界值,
导致体内某些蛋白质失活,进而诱导 HSP70 基因的
表达[8] .此外,还发现特定浓度 Cu2+在一定时间范围
内可显著诱导牡蛎 HSP70的表达,存在先升高后降
低至起始水平的时间效应关系[6] .
沙蚕作为潮间带地区的常见物种,是各种鱼类、
甲壳类和海鸟的重要食饵.由于沙蚕位于水陆生态
食物链的底部,对重金属和有机污染物具有积累和
消化作用,这些被积累的化学物质在一定浓度水平
范围内可能并不对沙蚕造成严重的伤害,却可能影
响食物链中更高级的生物,进而直接影响水生生态
系统食物链的长度及生物多样性和数量.由于这种
关系及其生活环境的特殊性,沙蚕经常被作为海陆
交错带生态监测的指示生物,特别是重金属污染下
有关沙蚕生态毒理学的研究进行得最为广泛[20] .尽
管目前有大量关于海洋生物 HSP70 基因及蛋白功
能的研究,但对于海陆交错带模式生物多毛纲沙蚕
HSP70基因的研究还鲜有报道[21],更未见有关重金
属铜胁迫条件下该基因表达模式的相关报道,这无
疑给应用沙蚕作为区域环境污染监测的模式物种带
来了障碍.
鉴于从分子生物学水平开展沙蚕热休克蛋白
70研究的必要性,本研究以在我国广泛分布的双齿
围沙蚕 ( Perinereis aibuhitensis)为生物材料,通过
5′⁃RACE和 RT⁃PCR 技术克隆得到 HSP70 的 cDNA
完整编码序列,并通过相关生物信息学分析,确定其
为一种诱导型 HSP70 基因;并利用荧光实时定量
PCR技术对其在 Cu 胁迫条件下,不同浓度和时间
mRNA表达模式进行了考察和分析.
92615期 张倩茹等: 双齿围沙蚕诱导型热休克蛋白 70基因的克隆及 Cu胁迫下的表达分析
1 材料与方法
1 1 材料
1 1 1供试动物 用于 HSP70 cDNA 克隆及组织表
达分析的双齿围沙蚕取自江苏省赣榆县沙蚕养殖
场,置于装有底泥的冰盒中运至实验室,用采自其生
活区的海水清洗.活体样品采回后,取少量沙蚕进行
总 RNA 提取;其余沙蚕挑选健康完整、大小相近的
3条置于 250 mL烧杯中,加入 100 mL盐度为 16 的
人造海水,在(15±1) ℃下恒温培养.2 d 后,将健康
沙蚕转至含不同浓度污染物的人造海水中,每天换
一次相同溶液,保证足够氧气及恒定的污染物浓度,
不投喂饵料.人造海水成分见文献[20].
1 1 2 试验试剂 TRIZOL Reagent 购自 Invitrogen
公司, 5′⁃Full Race Kit、 PrimeScript Reverse Tran⁃
scriptase、TakaRa Taq、Agarose Gel DNA Purification
Kit、大肠杆菌(Escherichia coli) DH5α、PrimeScriptTM
RT Master Mix 购自宝生物工程(大连)有限公司;
pGEM⁃T Easy 载体和 dNTP 购自 Promega 公司;
Oligo(dT) 20 Primer 购自 Invitrogen 公司, LightCy⁃
cler480 SYBR Green I Master 购自 Roche 公司;其
他试剂均为国产分析纯.
1 2 研究方法
1 2 1引物设计 根据已构建的双齿围沙蚕 cDNA
文库得到该物种的 HSP70 和 β⁃actin mRNA 部分序
列,设计并合成引物 HSP70⁃Outer⁃R、HSP70⁃Inner⁃R
和 HSP70⁃F用于双齿围沙蚕 HSP70基因的扩增;设
计引物 β⁃actin⁃F 和 β⁃actin⁃R 用于双齿围沙蚕
β⁃actin内参基因的扩增,具体序列信息见表 1.
1 2 2总 RNA 的提取 将清洗干净的整条沙蚕用
液氮速冻处死,于-80 ℃保存备用.取保存的沙蚕样
品置于预冷研钵中,加入适量液氮研磨至粉末状;取
大约1.5 g组织至离心管中,并加入1 mL Trizol,充
表 1 试验用引物
Table 1 Sequences of primers in the experiment
引物
Primer
引物序列(5′⁃3′)
Sequence of primer
用途
Purpose
HSP70⁃Outer⁃R 5′⁃AGTCTTGCCGATGTAAGCCT⁃3′ 5′RACE第一轮
HSP70⁃Inner⁃R 5′⁃TTGGCGTCGAAGACTGTGTT⁃3′ 5′RACE第二轮
HSP70⁃F 5′⁃GGTCAACCACTTCATTCAGG⁃3′ 3′RACE反转录 PCR
HSP70⁃RT⁃F 5′⁃TTTGGTTTGCCACCCTCAC⁃3′ 半定量 PCR
HSP70⁃RT⁃R 5′⁃AGGACCACGCCCAGTTATG⁃3′ 半定量 PCR
β⁃actin⁃F 5′⁃TGTGCTATGCTGCTCTGGAC⁃3′ 半定量 PCR
β⁃actin⁃R 5′⁃CGGGCAACTCGTAGCTCTT⁃3′ 半定量 PCR
分匀浆;室温放置 5 min,使其充分裂解;加入 200
μL 氯仿,涡旋 1 min,冰浴 20 min; 4 ℃ 12000
r·min-1离心 20 min;吸取上清至另一 1.5 mL 离心
管中,加入等体积-20 ℃预冷的异丙醇,混匀后-80
℃沉淀过夜,使 RNA沉淀.次日,4 ℃13000 r·min-1
离心 20 min,弃上清;加入 4 ℃预冷的 75%乙醇 10
mL,洗涤沉淀及离心管壁;4 ℃13000 r·min-1离心
5 min,弃上清;加入适量无 RNA酶去离子水(RNase
Free dH2O),至完全溶解.经琼脂糖凝胶电泳检测
RNA完整性,紫外分光光度计测定浓度.将提取的总
RNA置于-80 ℃冰箱保存备用.
1 2 3 5′端 RACE扩增 根据 5′⁃Full Race Kit 试剂
盒说明书对总 RNA进行去磷酸化处理和“去帽子”
反应,并与 5′RACE Adaptor 连接后,反转录合成 5′
RACE的 cDNA.采用巢式 PCR 方法扩增目的基因,
Outer PCR反应使用引物为 HSP90⁃Outer⁃R(表 1)和
试剂盒提供引物 5′RACE Outer Primer,Inner PCR反
应使用引物为 HSP70⁃Inner⁃R(表 1)和试剂盒提供
引物 5′RACE Inner Primer;Outer PCR 和 Inner PCR
反应条件与试剂盒说明书建议条件一致.所得到的
PCR产物在 1.2%的琼脂糖凝胶电泳上进行分离检
测后,使用 Agarose Gel DNA Purification Kit 试剂盒
纯化回收 PCR 产物,将回收片段与 pGEM⁃T Easy
载体连接;将全部连接产物转化到大肠杆菌 DH5α
感受态细胞,在含有氨苄青霉素(100 μg·L-1)和
5⁃溴⁃4⁃氯⁃3⁃吲哚⁃D⁃半乳糖苷(X⁃gal 0. 2 μg·L-1)
的平板过夜,挑取阳性克隆,并送测序公司测序.
1 2 4 3′端 RT⁃PCR 反应 根据 5′RACE 扩增的测
序结果设计反向引物 HSP70⁃F(表 1),并利用 Oligo
(dT) 20引物反转录 PCR 扩增 3′端 cDNA 序列.按下
列组份配置反转录反应液:5×PrimeScript 缓冲液 2
μL, dNTP (10 mmol·L-1) 1 μL,Oligo(dT) 20引物 1
μL,沙蚕总 RNA 1 μL,PrimeScript 逆转录酶 1 μL,
无 RNA酶去离子水 4 μL.将上述反应液 42 ℃反应
1 h 后,加入 PCR 反应体系:10 ×PCR 缓冲液 (含
Mg2+)2 5 μL,dNTP (10 mmol·L-1)0.5 μL,HSP70⁃
F Primer (10 μmol·L-1 ) 0. 5 μL,TakaRa Taq ( 5
U·μL-1) 0.5 μL,反转录反应液 0.25 μL,无 RNA
酶去离子水 20.75 μL.PCR 反应条件:1 个循环,94
℃变性 2 min; 40个循环,94 ℃变性 30 s;50 ℃退火
30 s;72 ℃延伸 1 min;1 个循环,72 ℃延伸 5 min,4
℃保温.切胶回收及 PCR 产物克隆、质粒纯化及测
序方法同 5′端 RACE扩增,序列测定由 TAKARA公
司完成.
0361 应 用 生 态 学 报 27卷
1 2 5序列分析 应用 Chromas Pro 2.33 软件将得
到的 5′端和 3′端序列拼接得到双齿围沙蚕 HSP70
的全长 cDNA 序列.运用 BLAST( http: / / www. ncbi.
nlm.nih. gov / BLAST) 进行序列同源性分析.运用
ORF Finder(http: / / www.ncbi.nlm.nih.gov / gorf / orfig.
cgi)寻找开放阅读框;运用 ProtParam( http: / / web.
expasy.org / protparam / )对所推测的蛋白质基本物理
化学参数进行分析;利用 DNAStar 和 ScanProsite
(http: / / prosite.expasy.org / )对蛋白质的功能区及结
构进行分析;利用 SWISS⁃MODEL(http: / / swissmod⁃
el.expasy.org / workspace / )对蛋白质的三维结构进行
预测.将双齿围沙蚕 HSP70 的氨基酸与其他物种
HSP70氨基酸进行 Clustal W 比对,利用 MEGA 4.0
软件中邻接法构建 HSP70分子系统发育树,并进行
1000次的 Bootstraps值验证.
1 3 Cu胁迫对 HSP70基因表达影响试验
取已适应实验室人造海水环境的健康沙蚕,体
质量大约在 ( 0. 80 ± 0. 23) g,放入含有不同浓度
CuSO4人造海水溶液(盐度为 16)处理,24 h 后分别
取对照和处理组沙蚕按上述方法提取沙蚕组织总
RNA.试验设置 3 个处理组,分别为空白对照组、1
mg·L-1CuSO4处理组和 5 mg·L
-1CuSO4处理组,每
组 3个平行,每个平行随机取 3 条双齿围沙蚕提取
组织总 RNA.
提取沙蚕组织总 RNA 后,按照 TaKaRa Prime⁃
ScriptTM RT Master Mix 方法,合成 cDNA 第一链.
cDNA稀释 10 倍后,以 HSP70⁃RT⁃F 和 HSP70⁃RT⁃R
(表 1)为特异性引物进行荧光定量 PCR (Roche
Real Time LightCycler 480ⅡLaboratory System).PCR
反应液:SYBR Green I Master 10 μL,HSP70⁃F(10
μmol·L-1) 0.5 μL,HSP70⁃R(10 μmol·L-1) 0.5
μL,cDNA 2 μL,去离子水 7 μL.用三步法 PCR 程
序:95 ℃预变性 5 min,1个循环;95 ℃变性 15 s,60
℃退火及延伸 60 s,共 40 个循环;每个循环第三步
进行荧光采集,融解曲线反应条件为:65 ℃ 5 min
不采集,95 ℃ 5 s 不采集,从 60 ℃缓慢升高至 97
℃,每升高 1 ℃采集 5次.每个模板重复 3次,数据采
用 2-ΔΔCt法计算目的基因相对表达量,并利用软件
Origin 8.0进行分析,以平均值±标准差表示,α=0.05.
2 结果与分析
2 1 总 RNA提取和 HSP70基因 cDNA序列克隆
用 1%琼脂糖凝胶电泳可以清晰显示 28S 和
18S rRNA条带(图 1),说明提取的 RNA 完整性较
好;用紫外分光光度计测得各样品总 RNA 的
OD260 / OD280值为 2.03~ 1.90,说明提取的总 RNA 质
量较好,具有较高的完整性和均一性,无降解现象,
符合基因克隆及荧光定量 PCR 的要求. 5′ RACE
PCR和 3′RT⁃PCR结果如图 2,扩增片段大小分别在
650、1100和 400 bp 左右,与预期扩增片段大小相
近.经 ChromasPro 1.33 软件进行序列拼接,得到全
长为 2161 bp的双齿围沙蚕 HSP70基因 cDNA全序
列,提交至 GenBank,登录号为 KU255783.
2 2 核苷酸序列分析及同源性比较
序列分析显示:该序列全长 2161 bp,5′非翻译
区(5′⁃UTR) 48 bp,3′非翻译区(3′⁃UTR) 142 bp,开
图 1 双齿围沙蚕肌肉总 RNA电泳图
Fig.1 Electrophoretogram of total RNA from Perinereis aibuhi⁃
tensis.
1) 5′RACE 扩增产物 PCR product of 5′RACE; 2) M⁃MLV(-)对照
Blank control of M⁃MLV(-). 下同 The same below.
图 2 双齿围沙蚕 HSP70基因 cDNA片段扩增产物电泳图
Fig. 2 Electrophoretogram of amplification of HSP70 cDNA
from Perinereis aibuhitensis.
M: DNA分子量标准(DL2000 marker) DNA molecular mass marker
(DL2000 marker); 3) RT⁃PCR扩增产物 RT⁃PCR product.
13615期 张倩茹等: 双齿围沙蚕诱导型热休克蛋白 70基因的克隆及 Cu胁迫下的表达分析
放阅读框(ORF)位于 49 ~ 2019 位核苷酸,共 1971
bp,编码 656个氨基酸(图 3).以起始密码子 ATG为
1、2、3位,则第 4 位为 G,第-3 位为 A,ATG 的 5′端
约 15 bp 范围的侧翼序列内不含 T,符合 Kozak 规
则;在 Poly(A)尾上游有典型的真核细胞加尾信号
(AATAAA).
利用 ProtParam 分析显示:双齿围沙蚕 HSP70
的相对分子质量为71430.5道尔顿(Da),理论等电
图 3 双齿围沙蚕 HSP70 cDNA核苷酸序列及其推测的氨基
酸序列
Fig. 3 cDNA sequence and deduced amino acid sequence of
heat shock protein 70 in Perinereis aibuhitensis.
单下划线表示起始密码子,∗表示终止密码子,HSP70家族特征区域
用方框表示,胞质 C端特征基序用虚线表示,GGMP 四肽简单重复序
列用双下划线表示 Underline indicated initiation codon, and the trans⁃
lation stop codon was designated with an asterisk (∗). HSP70 family
signature sequences were enclosed in the boxes. The consensus sequence
at cytoplasmic C⁃terminal region was showed with dotted line (---) and
the degenerate repeats of tetrapeptide GGMP were underlined with double
lines ( ) .
点(pI)为 5.15,负电荷残基(Asp+Glu)总数 100,正
电荷残基(Arg+Lys)总数 82.氨基酸序列分析显示:
该蛋白质含有 Dnak特征基序和两个 HSP70 家族标
签序列,分别位于氨基酸序列的 IDLGTTYS(8⁃15 残
基)、 IFDLGGGTFDVSIL ( 196⁃209 残基)、 IVLVGG⁃
STRIPKIQK(333⁃347 残基);根据该 HSP70 氨基酸
序列无原核生物热休克蛋白特征序列(GPKH),并
存在靠近 C 端有 3 个 GGMP 四肽简单重复序列
(618⁃629残基)和由 GPTIEEVD(649⁃656 残基)组
成的胞质 C 端特征基序,因此推断该基因为真核生
物 HSP70家族的一种胞质 HSP70成员.
根据两个序列间用 BLAST软件比对后 E⁃Value
值小于 0.005,则两个序列之间具有显著相似性,即
证明序列为同一种基因序列.利用 BLASTn 软件进
行同源性比对,从 E⁃value 值为 0.0 的序列中发现:
与双齿围沙蚕(Perinereis aibuhitensis,HQ449186)基
因序列同源性最为接近,达到 94%;与多齿围沙蚕
( Perinereis nuntia, HM625718 )、 沙蚕 ( Platynereis
dumerilii, DQ206465 )、 西 伯 利 亚 鲟 ( Acipenser
baerii,HM348777) 和牙鲆 ( Paralichthys olivaceus,
AF053059)基因序列同源性分别为 91%、83%、80%
和 79%.
进一步分析本研究双齿围沙蚕 HSP70 与其他
物种 HSP70 氨基酸序列之间的进化关系,利用
BLASTx 软件在 GeneBank 中搜索得到多条与本研
究双齿围沙蚕热休克蛋白相似性较高的动物氨基酸
序列,利用 MEGA 4.0 软件,采用 Neighbor⁃joining 法
构建双齿围沙蚕 HSP70 系统发育树(图 4).结果表
明,本研究所获得的 HSP70氨基酸序列与已报道的
双齿围沙蚕 ( Perinereis aibuhitensis, ADR66514. 1)
HSP70 氨基酸序列非常接近[ 21 ],和庞贝蠕虫
( Alvinella pompejana, CBM42048. 1 )、 革 囊 星 虫
(Phascolosoma esculenta, ACB47483. 1 ) HSP70 的
亲缘 关 系 也 较 近; 而 黄 鳝 ( Monopterus albus,
AGO01988. 1 )、 小 体 鲟 ( Acipenser ruthenus,
AEK81529. 1 )、 非 洲 爪 蟾 ( Xenopus laevis, NP -
001080068 )、 白 鲢 ( Hypophthalmichthys molitrix,
ACJ03595. 1 ) 和 草 鱼 ( Ctenopharyngodon idella,
ACJ03596.1)等淡水生物聚为一簇;文蛤(Meretrix
meretrix, ADT78476.1)、波纹巴飞蛤(Paphia undu⁃
late, AFZ93094. 1 )、缢蛭 ( Sinonovacula constricta,
AEP26350. 1 ) 和 厚 壳 贻 贝 ( Mytilus coruscus,
AGY56119.1)等软体动物聚为一簇.
2361 应 用 生 态 学 报 27卷
图 4 双齿围沙蚕 HSP70与其他物种 HSP70 氨基酸序列系
统进化树
Fig. 4 Neighbor⁃joining phylogenetic tree of HSP70 protein
from Perinereis aibuhitensis and similar proteins.
图 5 双齿围沙蚕 HSP70 亲水性、柔韧性、表面可能性及抗
原性的预测结果
Fig.5 Prediction result of hydrophilicity, flexibility, surface
probability and antigenicity of HSP70 in Perinereis aibuhitensis.
a) 标尺 Scale; b) 亲水性区域Hydrophilicity plot-Kyte⁃Doolittle; c) 柔韧
性区域 Flexible region-Karplus⁃Schulz; d) 抗原性区域 Antigenic index-
Jameson⁃Wolf; e) 表面可能性区域 Surface probability plot-Emini.
2 3 蛋白质结构和功能预测
用 DNAStar 软件的子程序 Protean 预测双齿围
沙蚕 HSP70的亲水性、柔韧性、表面可能性及抗原
性,结果如图 5 所示.Kyte⁃Doolittle 方案预测的亲水
性区域大致为 30 ~ 39 残基、43 ~ 68 残基、71⁃92 残
基、95⁃118 残基、127⁃133 残基、148⁃161 残基、185⁃
191 残基、220⁃239 残基、241⁃276 残基、284⁃289 残
基、295⁃304 残基、313⁃329 残基、340⁃345 残基、350⁃
368 残基、381⁃387 残基、413⁃436 残基、442⁃456 残
基、467⁃472 残基、489⁃547 残基、549⁃572 残基、574⁃
600 残基、610⁃612 残基、625⁃627 残基、629⁃631 残
基、637⁃647残基和649⁃656残基,可见亲水性残基
图 6 双齿围沙蚕 HSP70信号肽(A)和跨膜区域(B)的预测
Fig.6 Prediction of signal peptide ( A) and transmembrane
region (B) of HSP70 in Perinereis aibuhitensis.
C⁃score: 剪切位点分值 Cleavage site score; S⁃score: 信号肽分值 Sig⁃
nal peptide score; Y⁃score: 综合剪切位点分值 Combined cleavage site
score. a) 跨膜段 Transmembrane; b) 内段 Inside; c) 外段 Outside.
所占比例远大于疏水性残基,因此推测该蛋白是亲水
性的.Jameson⁃Wolf方案预测抗原性显示,该蛋白具有
丰富的 B细胞抗原位点,特别是在 58⁃90残基、93⁃119
残基、214⁃236 残基、243⁃289 残基、489⁃547 残基、549⁃
572残基和 574⁃600 残基这 7 个区域,为优势抗原表
位,均存在很好的抗原结合位点.从图 5还可以看出,
抗原表位区域与 Karplus⁃Schulz方案预测的柔韧性区
域和 Emini方案预测的表面可能性区域出现了较多
的重叠区,这些区域相对易于形变,便于抗原、抗体的
自由结合,可能是抗原位点的富集区.
利用 SignalIP 对双齿围沙蚕 HSP70 蛋白序列
在线搜索,寻找信号肽序列,发现该蛋白存在信号肽
的概率极低,说明该蛋白不存在信号肽酶切位点,无
信号肽,是一种非分泌型蛋白(图 6A).用 TMHMM
在线进行跨膜性分析,结果显示双齿围沙蚕 HSP70
蛋白序列无明显跨膜区域(图 6B).
利用 PROSITE scan 在线分析双齿围沙蚕
HSP70潜在的蛋白修饰位点,发现有 6 个 N⁃糖基化
位点(34⁃37 残基、150⁃153 残基、359⁃362 残基、416⁃
419残基、486⁃489 残基、583⁃586 残基),1 个依赖
cAMP 和 cGMP 的蛋白激酶磷酸化位点(414⁃417 残
基),8个蛋白激酶 C磷酸化位点(46⁃48 残基、84⁃86
残基、152⁃154 残基、319⁃321 残基、 339⁃341 残基、
494⁃496残基、536⁃538残基、570⁃572残基),15 个酪
蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点(44⁃47残基、65⁃68残基、
33615期 张倩茹等: 双齿围沙蚕诱导型热休克蛋白 70基因的克隆及 Cu胁迫下的表达分析
图 7 双齿围沙蚕 HSP70二级结构预测
Fig.7 Prediction on secondary structure of HSP70 in Perinereis aibuhitensis.
h): α⁃螺旋 α⁃helix; e) β⁃折叠 β⁃sheet; t) β⁃转角 β⁃turn; c) 无规则卷曲 Random coil.
210⁃213残基、221⁃224 残基、264⁃267 残基、285⁃288
残基、319⁃322 残基、429⁃432 残基、 488⁃491 残基、
494⁃497残基、510⁃513 残基、550⁃553 残基、551⁃554
残基、562⁃565 残基、651⁃654 残基),20 个 N⁃肉豆蔻
酰化位点(7⁃12残基、11⁃16残基、161⁃166残基、189⁃
194 残基、401⁃406 残基、406⁃411 残基、407⁃412 残
基、613⁃618 残基、614⁃619 残基、618⁃623 残基、619⁃
624 残基、622⁃627 残基、623⁃628 残基、626⁃631 残
基、627⁃632 残基、630⁃635 残基、635⁃640 残基、639⁃
644残基、643⁃648 残基、647⁃652 残基),1 个酰胺化
位点(73⁃76). 1 个 ATP / GTP 结合位点基序 A( P
环)(130⁃137残基).
利用 SOPMA对双齿围沙蚕 HSP70二级结构进
行预测.如图 7 所示, α⁃螺旋 ( 248 个氨基酸)占
37.8%,β⁃折叠(128个氨基酸)占 19.5%,β⁃转角(72
个氨基酸)占 11.0%,无规则卷曲(208个氨基酸)占
31.7%,说明双齿围沙蚕 HSP70 基因编码的蛋白以
α⁃螺旋和无规则卷曲为主,含少量的 β⁃折叠,间或
有 β⁃转角.
使用 SWISS⁃MODEL同源建模数据库对双齿围
沙蚕 HSP70空间结构进行预测[22],找到了与其有
较高同源性的 3 个已知结构 ( 1hx1A、 1yuwA、
4po2A)的蛋白序列,范围相当于双齿围沙蚕 HSP70
序列中的 4⁃379 残基、3⁃553 残基和 385⁃612 残基,
取前 2 个作为模板,参照 Hartl 等[23]的方法构建双
齿围沙蚕 HSP70空间结构图(图 8).HSP70 包括两
个功能单元: N 端供 ATP 结合的核苷酸结构域
(nucleotide binding domain)和 C端多肽底物结合域
(polypeptide substrate binding domain).多肽底物结
合域由一个 β⁃三明治亚功能域(beta⁃sandwich sub⁃
domain)和紧跟其后的 α⁃螺旋片段组成[24] .
2 4 Cu2+胁迫对 HSP70 mRNA表达的影响
采用荧光定量 PCR 对不同处理时间和不同浓
度 Cu2+胁迫对双齿围沙蚕 HSP70 基因的表达研究
表明,不同浓度 Cu2+胁迫 1 d,双齿围沙蚕 HSP70
mRNA表达量呈现出明显的剂量⁃效应关系(图 9).
当较低浓度 Cu2+胁迫 ( 0. 2 和 0. 5 mg·L-1 )时,
HSP70 mRNA 表达量相对较低,几乎不表达 ( P
>0.05);当 Cu2+浓度升高至 1 mg·L-1时,表达量显
著增加,为对照组(0 mg·L-1)的 38倍;当 Cu2+浓度
升高至5 mg·L-1时,表达量显著增加,高达对照组
图 8 双齿围沙蚕 HSP70的空间结构示意图
Fig.8 Schematic dimensional structure of HSP70 in Perinereis
aibuhitensis.
4361 应 用 生 态 学 报 27卷
图 9 不同浓度 Cu2+胁迫 1 d双齿围沙蚕 HSP70 mRNA的相
对表达量
Fig.9 Relative expression levels of HSP70 in Perinereis aibu⁃
hitensis exposed to the different concentrations of Cu2+ at 1 d
(n= 6).
∗P<0.05; ∗∗P<0.01. 下同 The same below.
图 10 双齿围沙蚕 HSP70 mRNA 在 5 mg·L-1 Cu2+胁迫下
不同时间的相对表达量
Fig.10 Relative expression levels of HSP70 in Perinereis aibu⁃
hitensis exposed to 5 mg·L-1 Cu2+ at different times (n= 6).
的 526 倍.这表明该基因可以在短时间内被较高浓
度 Cu2+诱导表达.
在 5 mg·L-1 Cu2+胁迫条件下,双齿围沙蚕
HSP70 mRNA表达量随时间延长呈波动性变化(图
10).在 Cu2+胁迫 1 d,HSP70 mRNA表达量急速上升
至峰值,为胁迫前(0 d)mRNA 表达量的 29.48 倍;
然后其表达量开始下降,至 2 d时表达量仍然为 0 d
时 5.41倍;至 3和 4 d时 HSP70 mRNA表达量下降
至与胁迫前(0 d)水平相当,且基本维持不变.这表
明 Cu2+的胁迫作用对 HSP70 基因的表达具有时间
效应.
3 讨 论
沙蚕作为海陆交错带的关键物种,常被作为生
态监测的指示生物,针对其生态毒理学方面的研究
也在日益兴起[20,25] .然而,这些研究多针对生物富集
特性及细胞水平生物标志物(酶 /蛋白)的分泌状
况,与生态毒理学污染早期预警的初衷还存在一定
差距.因此,为了从基因水平阐明生物对污染物的响
应机制,从根本上解决生物标志物早期预警的应用
问题,我们开展了沙蚕基因组及其对污染响应机制
的研究,特别瞄准了与应激、免疫及抗病相关的基因
研究.双齿围沙蚕是广泛分布于我国海陆交错带的
常见物种,通过其差异表达基因文库构建、筛选及测
序,得到了双齿围沙蚕热休克蛋白家族成员基因
EST序列信息,其中属于 HSP70家族的 EST 序列显
示出对 Cu2+具有较高水平表达的特征,因此决定对
该基因进行深入研究.
3 1 双齿围沙蚕 HSP70 cDNA的克隆及序列分析
本研究采用 5′RACE 和 RT⁃PCR 方法,经分离
克隆获得了双齿围沙蚕 HSP70 cDNA 全序列,该序
列长 2161 bp,其中包括 3′和 5′非翻译区及完整开放
阅读框编码区,共编码 656个氨基酸,总分子量约为
71.43 kD,理论等电点为 5.15.根据大部分诱导型
HSP70基因不含内含子的特征[7,26],本次克隆到的
双齿围沙蚕 HSP70基因编码区不含内含子,转录后
不必经过 mRNA剪切拼接的加工过程,该基因可能
属于诱导型 HSP70基因.
氨基酸序列分析发现,该基因具有 HSP70 家族
的 3 个签名序列: IDLGTTYS、 IFDLGGGTFDVSIL、
IVLVGGSTRIPKIQK[2,6,27]以及靠近 C 末端的 GGMP
四肽重复序列和 C 端 EEVD 特征基序[28] . Deane
等[29]认为,在 HSP70家族中,组成型 HSC70 有多个
GGXP 四肽重复序列和九肽基序 SGPTIEEVD,而诱
导型 HSP70多数情况只出现一次 GGXP,九肽结构
也不同于组成型的九肽基序.这个结论与明建华
等[30]对团头鲂(Megalobrama amblycephala)和 Cui
等[31]对三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)的热休
克蛋白基因克隆结果相同.本研究获得的 HSP70 氨
基酸序列中 GGMP 重复出现 3 次,并含有九肽基
序 SGPTIEEVD,按照 Deane 等[29]的观点应该为组
成型 HSC70.但非洲爪蛙蟾 ( Xenopus laevis, NP -
001091238.1)诱导型 HSP701B 和西伯利亚鲟(Aci⁃
penser baerii, HM348777.1)中都含有九肽基序 SGP⁃
TIEEVD和重复的 GGMP [32-33];而食用牡蛎(Cras⁃
sostreagigas, AJ305316.1)的诱导型 HSP70 和组成
型 HSC70 均含有 GGMP 重复序列[27] .目前,有关
HSP70基因 C 端 GGMP 重复序列的具体功能还不
清楚,认为其可能是分子伴侣因子的结合位点[28] .C
端 EEVD是具有高度保守的细胞质特异性调控基
序[28],说明双齿围沙蚕 HSP70主要存在于细胞质中.
53615期 张倩茹等: 双齿围沙蚕诱导型热休克蛋白 70基因的克隆及 Cu胁迫下的表达分析
同源性分析表明,双齿围沙蚕 HSP70 与其他无
脊椎动物 HSP70 的氨基酸序列相似性高达 79%以
上,与多毛纲沙蚕的相似性更高达 83%以上,其中
与已报道双齿围沙蚕的亲缘关系最近,相似性达
94%.从 HSP70系统进化树分析,双齿围沙蚕与多毛
纲生物在一个分支上,这与传统的分类结果相一致,
这证实了本研究结果的真实性及 HSP70 在进化上
的保守性.生物信息学分析结果表明,双齿围沙蚕
HSP70基因编码的蛋白质以亲水性区域为主,具有
丰富的 B细胞抗原位点,抗原表位区域、柔韧性区
域和表面可能性区域出现了较多的重叠区,这些区
域相对易于形变,有利于抗原、抗体的自由结合,可
能是抗原位点的富集区;该蛋白无信号肽,为非分泌
型蛋白,无明显的跨膜区域.对潜在的蛋白修饰位点
分析发现,该蛋白有众多的 N⁃糖基化位点、蛋白激
酶 C 磷酸化位点、酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点、N⁃肉
豆蔻酰化位点,蛋白质的磷酸化和脱磷酸化在细胞
信号传导中起重要作用,提示这些位点可能是
HSP70完成其生理功能的结构基础.
双齿围沙蚕 HSP70 的二级结构以 α⁃螺旋和无
规则卷曲为主, 空间结构包括 N 端供 ATP 结合的
核苷酸结构域和 C 端多肽底物结合域.核酸结构域
主要由两个球形亚结构域组成,多肽底物结合域由
一个 β⁃三明治亚功能域和紧跟其后的 α⁃螺旋片段
组成[24] .
3 2 重金属 Cu 胁迫对双齿围沙蚕 HSP70 mRNA
表达的影响
环境胁迫可以诱导机体产生分子伴侣蛋白
HSP70,帮助细胞内多肽的正确折叠、装配和转运,
迅速修复或清除错误折叠、受损蛋白或变性蛋白,对
细胞起修复和保护作用,从而能有效提高机体的耐
受性和抗胁迫能力[34] .重金属 Cu 既是一种生物体
必需微量元素,是细胞结构和酶化合物的重要组成
部分,也是我国近岸海域常见的主要重金属污染物.
极微量的 Cu 对水生生物常常是无害的,当其浓度
超过生物的生理承载力时,则对其生长发育和生理
代谢产生影响.Jing 等[35]研究报道,重金属 Cu 胁迫
会导致金丝鱼(Tanichthys albonubes)肝脏中 HSP70
mRNA表达量显著上升.Zhang 等[6]研究也发现,无
胁迫时,牡蛎组织中 HSP70 mRNA 表达水平低下;
而 Cu2+能诱导其显著表达,如当牡蛎暴露于 50
μg·L-1 Cu2+胁迫条件下,其组织 HSP70 mRNA 表
达量在 4 d时显著增加至峰值,随后开始下降至起
始水平.也有学者报道,萘等有机污染物胁迫能够诱
导海湾扇贝(Argopecten irradians)血细胞显著表达
HSP70 mRNA[16] .Martini等[36]报道了不同浓度苯并
[a]芘与非洲爪蟾(Xenopus laevis) HSP70 mRNA 表
达量存在明显的剂量效应关系,HSP70 能够被较高
浓度苯并[a]芘显著诱导,呈现随胁迫浓度升高基
因表达量逐渐升高的趋势.
不同浓度 Cu2+胁迫过程中,双齿围沙蚕 HSP70
mRNA表达量在一定范围内呈现随 Cu 浓度增加而
升高的变化趋势.较低浓度 Cu2+ 胁迫时, HSP70
mRNA表达量相对较低,与无胁迫条件下差异不显
著;但当 Cu2+浓度升高至一定浓度时,HSP70 mRNA
表达量显著增加,并可能接近峰值.其原因可能是由
于低浓度 Cu 胁迫并未损害沙蚕正常生理代谢过
程,热休克转录因子(heat shock transcription factor,
HSF)无需激活,沙蚕体内所储备的维持正常生理功
能的 HSP70 mRNA 含量基本维持不变;当 Cu 胁迫
浓度接近或超过胁迫临界阈值时,HSF 被激活形成
三聚体并转入细胞核内,与热休克元件(heat shock
element, HSE)结合,启动热休克基因的转录[37],
HSP70 mRNA转录水平随之出现明显增加.在应激
过程中,尽管诱导型 HSP70 mRNA的合成会显著增
加,但其诱导水平随应激强度和持续时间长短而异,
且一般认为这种诱导表达是短期的[11,38] .本研究在
胁迫 1 d时,HSP70 mRNA表达量急速上升至峰值,
之后表达量开始下降,3 d 后表达量下降至胁迫前
水平.这种先升高后降低的变化趋势正是热休克蛋
白负反馈调控机制作用的结果,即胁迫前期大量表
达的 HSP70可增强细胞对损伤性刺激的耐受性,提
高细胞存活率,保护机体免受或少受损伤[39];胁迫
后期 HSP70 mRNA表达量呈下降趋势,可能与获得
对胁迫的耐受力有关,此时胁迫已有所缓解,而且不
断增多的 HSP 与 HSF 结合并抑制 HSF 的活性,从
而减少 HSF与 HSE的特异性结合,进而控制热休克
基因的转录[37],使 HSP70 mRNA 表达量维持在一
定的水平.本研究虽然未对双齿围沙蚕 HSP70 含量
进行检测,但 HSP70的合成主要在转录水平进行调
控[38],其含量变化是由 HSP70 mRNA 转录水平的
变化所决定,因此 HSP70 mRNA相对表达量可以直
接且快速地反映 HSP70的合成及变化情况.
诱导型 HSP70基因没有内含子,可由未被隔断
的开放阅读框编码整个蛋白[38],而组成型 HSC70
基因的编码区一般含有几个内含子[5] .这种内含子
的缺失,使转录后的 mRNA 不需要经过剪切拼接等
加工过程,在应激状态下可优先转录和表达 HSP70,
6361 应 用 生 态 学 报 27卷
及时发挥对机体(细胞)的保护作用[7,30] .推测这可
能是诱导型 HSP70 mRNA 在应激初期表达量下降
不明显[7],有的甚至检测到升高[6,40]的原因.本研究
克隆获得的基因具有诱导型 HSP70 基因的特征及
表达情形,说明该 HSP70基因为诱导型.
本研究表明,从双齿围沙蚕组织中克隆获得一
种编码热休克蛋白 70的 cDNA全长序列,氨基酸序
列分析表明该基因在翻译区不包含内含子,具有
HSP70家族的 3个签名序列,与已知物种的 HSP70
同源性较高,主要存在于细胞质中;基因表达分析表
明,在 Cu胁迫过程中,双齿围沙蚕 HSP70 mRNA被
显著诱导表达,呈剂量效应和时间效应关系.说明本
研究克隆获得的序列为诱导型 HSP70 cDNA.
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作者简介 张倩茹,女,1977 年生,博士,副研究员. 主要从
事污染生态学和生态毒理学研究. E⁃mail: zhangqianru@ iae.
ac.cn
责任编辑 肖 红
张倩茹, 姜丽思, 牟文燕, 等. 双齿围沙蚕诱导型热休克蛋白 70基因的克隆及 Cu胁迫下的表达分析. 应用生态学报, 2016,
27(5): 1628-1638
Zhang Q⁃R, Jiang L⁃S, Mu W⁃Y, et al. Gene cloning and expression analysis of an inducible heat shock protein 70 gene from the
polychaete Perinereis aibuhitensis under Cu2+ stress. Chinese Journal of Applied Ecology, 2016, 27(5): 1628-1638 (in Chinese)
8361 应 用 生 态 学 报 27卷