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普通小麦-华山新麦草衍生后代H18和0841的SSR标记鉴定



全 文 :麦类作物学报 2013,33(3):423-428
Journal of Triticeae Crops
网络出版时间:2013-04-26
网络出版地址:http://www.cnki.net/kcms/detail/61.1359.S.20130426.0950.032.html
普通小麦-华山新麦草衍生后代H18和0841的SSR标记鉴定
收稿日期:2013-02-02   修回日期:2013-03-09
基金项目:国家高技术研究发展计划(863计划)项目(2011AA100102);西北农林科技大学唐仲英育种基金。
作者简介:邓 欣(1987-),女,硕士,主要从事小麦分子染色体工程研究。E-mail:deng_xin_11@126.com
通讯作者:吉万全(1963-),男,博士,教授,博士生导师,主要从事小麦分子染色体工程与育种研究。E-mail:jiwanquan2003@
126.com
邓 欣1,郑祥博2,陈春环1,王长有1,田增荣1,吉万全1
(1.旱区作物逆境生物学国家重点实验室,西北农林科技大学农学院,陕西杨凌712100;
2.陕西省种子管理站,陕西西安710000)
摘 要:为了明确普通小麦-华山新麦草衍生后代材料中所携带的外源遗传物质,利用SSR标记对普通
小麦-华山新麦草衍生后代H18和0841进行了鉴定。SSR标记结果表明,331个SSR标记中有271个在亲本
华山新麦草和普通小麦7182间具有多态性;85个在华山新麦草中具有清晰且明亮的特异条带,其中9个标
记在 H18衍生的8个单株中(2n=51~54)具有华山新麦草特征条带。0841的染色体数目为42条,利用筛选
的9个标记对其鉴定,发现定位于小麦3D染色体上的标记Xbarc71 在0841中具有华山新麦草的特异条带,
同时缺失小麦亲本7182的特异条带,推测0841可能是华山新麦草的3Ns染色体代换了小麦的3D染色体。
条锈病抗性鉴定显示,0841中抗至高抗条锈菌条中31号和条中32号混合小种。
关键词:普通小麦;华山新麦草;衍生后代;条锈病抗性;细胞学;SSR标记
中图分类号:S512.1;S330    文献标识码:A    文章编号:1009-1041(2013)03-0423-06
Identification of the Wheat-Psathyrostachys huashanica
Derivatives H18and 0841with SSR Marker
DENG Xin1,ZHENG Xiang-bo2,CHEN Chun-huan1,
WANG Chang-you1,TIAN Zeng-rong1,JI Wan-quan1
(1.State Key Laboratory of Crop Stress Biology for Arid Areas/Colege of Agronomy,Northwest A&F University,
Yangling Shaanxi 712100,China;2.Seed Administration Division of Shaanxi,Xian,Shaanxi 712100China)
Abstract:In this study,SSR markers were used to identify the genetic materials of Psathyrostachys
huashanica(P.huashanica)in wheat-P.huashanica derivatives H18and 0841.The results showed
that among the 331SSR markers which located on single wheat homoeologous group and used to in-
vestigate the polymorphism between common wheat 7182and P.huashanica,271markers(81.87%)
could display polymorphisms and 85markers could display the specific bands of P.huashanicaclearly
and brightly.Nine of the 85markers showed specific bands among 8plants of wheat-P.huashanica
derivatives H18.Cytological analysis showed that the somatic chromosome number of 0841was 42.
Among the 9selected markers above,Xbarc71located in wheat chromosome 3Dexpressed the specific
band of P.huashanicaand missed the band of wheat.Based on these results,we infered that wheat
chromosome 3Dwas substituted by P.huashanicachromosome 3Ns in this derivative.The strip rust
resistance test indicated that 0841was moderate-highly resistance to mixed Puccinia striiformis f.sp.
tritici races of CYR31and CYR32.
Key words:Common wheat;Psathyrostachys huashanica;Derivative;Stripe rust resistance;Cytology;
SSR analysis
  华山新麦草(Psathyrostachys huashanica
Keng ex Kuo,2n=14,NsNs)是禾本科小麦族新
麦草属(Psathyrostachys Nevski)的多年生二倍
体物种,仅生长在陕西华山,具有抗旱[1]、抗寒、耐
贫瘠[2]以及抗赤霉病、高抗全蚀病[3]和抗条锈
病[4]等优良性状。由于地理分布的局限性和作为
小麦族重要的三级基因源,华山新麦草已被列为
我国急需保护的农作物野生亲缘种[5]。
陈漱阳等[2]1988年用普通小麦7182与华山
新麦草杂交获得了杂交后代。傅 杰等[6-7]、赵继
新等[8]、武 军等[9-10]用细胞学、C-分带、原位杂交
等方法对衍生后代进行了研究。此后,在该杂交
组合的衍生后代中获得了1Ns[11]、6Ns[12]的二体
异附加系,二体异附加系的矮至秆种质B62[13]和
大穗多花种质B46[14]。用J-11和 CSph2b 分别
与华山新麦草杂交也成功获得杂种后代,包括以
J-11为背景的小麦-华山新麦草完全双二倍体
PHW-SA[15]、3Ns二体异附加系[16]和以 CSph2b
为背景的5Ns二体异附加系[17]。Kishi等[18]用
细胞学、荧光原位杂交和EST-SSR方法鉴定了
以中国春为背景的4个华山新麦草二体异附加和
3个单体异附加材料,结果表明,附加的华山新麦
草染色体各不相同。前人研究还表明,华山新麦
草对小麦条锈病具有抗性,小麦-华山新麦草的完
全双二倍体[12]、部分双二倍体[19]、华山新麦草异
附加系[16]、7182与华山新麦草的易位系[20-21]都表
现对条锈菌的抗性,Wang等[22]已证明华山新麦
草3Ns染色体携带有条锈病抗性基因。
分子标记是鉴定远缘杂交后代外缘遗传物质
的常用方法。Kang等[23]用形态学、细胞学和Ns
染色体组特异RAPD标记等方法鉴定了所获得
的小麦-华山新麦草杂交种;Kishi等[18]用荧光原
位杂交和3个EST-SSR标记区分了7个不同的
添加华山新麦草染色体的材料;Kang等[16]用
GISH和位于小麦3D染色体上的SSR标记鉴定
了一系列涉及3Ns染色体的衍生后代;Du等[12]
用细胞学、GISH、定位于小麦第六部分同源群的
EST-SSR和EST-STS标记鉴定了小麦-华山新
麦草6Ns附加系。武 军等[24]用SSR引物将20
个附加系归为华山新麦草的7个同源群。在上述
研究中,各种类型的分子标记为材料分析提供了
重要依据,但所获得的分子标记数量有限。
本研究筛选了分布于小麦7个部分同源群的
SSR引物,并对来源于普通小麦7182与华山新
麦草杂交衍生后代材料0841进行了形态学、条锈
病抗性、细胞学和SSR分子标记分析,以期明确
该材料所携带的华山新麦草遗传物质,为进一步
研究利用该材料提供依据。
1 材料与方法
1.1 材 料
参试材料包括亲本普通小麦7182和华山新
麦草,7182与华山新麦草杂交衍生后代0841、
H18,以及由 H18衍生的8个后代单株:182A(2n
=52)、182B(2n=53)、1824(2n=52+t)、183A
(2n=50+t)、183B(2n=51)、184A(2n=52+
2t)、184B(2n=53+t)和1842(2n=54)。以上材
料由西北农林科技大学农学院小麦分子染色体工
程实验室提供。条锈菌生理小种条中31号和条
中32号的混合菌种由西北农林科技大学植物保
护学院提供。
1.2 形态学调查和条锈病抗性鉴定
在成熟期调查材料的株高、株型、穗长、小穗
数、穗粒数、穗型、芒性等性状,记载标准参照文献
[25]。
成株期条锈病抗性鉴定在西北农林科技大学
农学院小麦育种圃进行。10月中旬播种鉴定材
料和感病对照辉县红,翌年3月中旬采用撒粉接
种法接种条中31号和条中32号混合小种,在辉
县红充分发病时调查鉴定材料的反应型,3d后
复查一次。反应型记载标准参照文献[26]。
1.3 体细胞染色体数目鉴定
3月下旬在田间取新生幼根,冰水预处理
24h,卡诺液(乙醇∶醋酸=3∶1,体积比)固定
1~2d,1%醋酸洋红染色,45%醋酸压片,观察体
细胞染色体数目。
1.4 SSR分析
采用CTAB法提取叶片全基因组DNA[27]。
选择分布在小麦单个部分同源群的SSR引物进
行扩增,筛选在华山新麦草和7182之间有多态性
的引物。筛选出的具有多态性的引物首先在
H18衍生的附加多条华山新麦草染色体的8个
·424· 麦 类 作 物 学 报                  第33卷
后代单株中进行验证,进而用于0841的分析。
所用引物根据 GrainGenes(http://wheat.
pw.usda.gov)公布的SSR引物序列信息,由上海
生物工程有限公司或北京奥科鼎盛生物技术有限
公司合成。PCR扩增反应在S1000型热循环仪
(Bio-Rad,美国)上进行,反应体系为10μL,10×
Taq Buffer(Mg2+)1μL,2.5mmol·L
-1 dNTPs
0.8μL,引物(5μmol·L
-1)1μL,2.5UTaq酶
0.1μL,模板 DNA(50~100ng·μL
-1)1μL,
ddH2O 6.1μL。扩增程序为94℃变性3min;
94℃变性30s,55~61℃ (根据引物退火温度选
择)复性45s,72℃延伸50s,35个循环;72℃延
伸10min。扩增产物用8%非变性聚丙烯酰胺凝
胶电泳检测,硝酸银染色后照相。
2 结果与分析
2.1 华山新麦草衍生后代0841的体细胞染色体
数目
细胞学鉴定表明,小麦-华山新麦草衍生后代
0841的体细胞染色体数目为42条(图1)。
2.2 华山新麦草衍生后代0841的SSR 分析
结果
以7182和华山新麦草DNA为模板,选择仅
定位于小麦单个部分同源群的331对SSR引物
进行分析。结果表明,271对(81.87%)引物在华
山新麦草和普通小麦7182之间显示出不同于
7182的华山新麦草特异条带,表明这些普通小麦
SSR标记在华山新麦草中也大量存在,可以用于
图1 小麦-华山新麦草衍生后代0841的
体细胞染色体数目(2n=42)
Fig.1 Chromosome number of wheat-Psathyrostachys
huashanicaderivative 0841(2n=42)
小麦与华山新麦草杂交后代中华山新麦草遗传物
质的检测。在271对引物中,挑选扩增稳定且清晰
的85对引物(表1和图2)用于衍生后代的分析。
  以7182、华山新麦草以及二者杂交后代 H18
衍生的8个单株(2n=51~54)为模板,用筛选出
的85个标记进行分析。结果表明,这些标记可以
分为两种类型:普通小麦7182的带型和双亲杂合
带型。其中76个标记在8个衍生单株中具有和
7182一致的条带,不具有华山新麦草的特异条
带;9个标记在8个衍生单株中同时具有7182和
华山新麦草的特异条带,可以用来检测普通小麦
7182与华山新麦草衍生后代中华山新麦草的遗
传物质(表2和图3)。这9个标记分别位于小麦
的1A、1D、2D、3B、3D、4A、6B、7A染色体上,而小麦
第五部分同源群的标记没有扩增出华山新麦草的特
异条带。
表1 SSR标记在华山新麦草与普通小麦7182间的扩增结果
Table 1 The PCR results between wheat and Psathynrostachys huashanica with SSR markers
部分同源群 所用引物数目 特异性引物数目 特异性标记名称
1  53  16
Xbarc149,Xbarc152,Xbarc99,Xgwm818,Xcfa2147,Xgwm498,Xwmc93,
Xmag2137,Xgwm135,Xwmc719,Xwmc31,Xcfd72,Xcfd63,Xgdm111,Xg-
pw7093,Xcfd92
2  80  25
Xgwm249,Xgwm301,Xgwm359,Xgwm484,Xcfd56,Xcfd73,Xwmc601,
Xwmc661,Xwmc817,Xwmc272,Xwmc474,Xfbb279,Xfbb72,Xfbb99,Xfba65,
Xbcd111,Xfba38,Xbarc145,Xwmc11,cfd168,Xgpw361,Xgpw5212,Xwmc144,
Xwmc175,Xcfd193
3  40  13 Xbarc71
,Xbarc77,Xgwm341,Xbarc73,Xcfb3079,Xcfb3192,Xgdm72,Xg-
wm161,Xgwm285,Xwmc169,Xwmc231,Xwmc291,Xwmc307
4  21  6  Xbarc78,Xcfd84,Xwmc707,Xwmc718,Xwmc720,Xwmc722
5  49  10 Xbarc130
,Xgwm639,Xbarc186,Xcfd12,Xcfd7,Xgwm186,Xgwm212,Xg-
wm292,Xwmc233,Xwmc759
6  35  5  Xcwem50a,Xbarc201,Xbarc24,Xgwm518,Xcfd13
7  53  10 Xcfa2028
,Xcfa2049,Xcfa2257,Xcfd14,Xgwm044,Xgwm046,Xwmc121,
Xwmc14,Xwmc662,Xwmc476
·524·第3期         邓 欣等:普通小麦-华山新麦草衍生后代 H18和0841的SSR标记鉴定
  M.DL2000;1、2.Xcfd61 ;3、4.Xwmc93 ;5、6.Xcfd168 ;7、8.Xwmc601 ;9、10.Xwmc307 ;11、12.Xbarc71 ;13、14.Xcfd84 ;15、16.
Xgwm518 ;17、18.Xgwm44 ;19、20.Xcfa2049 ;21、22.Xwmc718 ;23、24.Xgwm285 (奇数泳道为华山新麦草,偶数泳道为7182)
图2 部分SSR标记在华山新麦草与普通小麦7182间的扩增结果
Fig.2 PCR results between wheat and Psathynrostachys huashanica with partial SSR markers
  M.DL2000;P1.华山新麦草(P.huashanica);P2.7182;1~8.182A、182B、1824、183A、183B、184A、184B、1842;
A.Xcfd61 ;B.Xwmc601 ;C.Xwmc307 ;D.Xwmc718 ;E.Xgwm518 ;F.Xcfa2049
图3 特异SSR标记在小麦-华山新麦草衍生后代的扩增结果(箭头所示为华山新麦草特征条带)
Fig.3 SSR markers with specific bands in the derivatives of wheat and Psathyrostachys huashanica
(Arrows indicate the specific band)
  利用9个具有华山新麦草特异条带的SSR
标记(表2)对0841进行鉴定,定位在小麦3D染
色体上的标记Xbarc71 扩增出了华山新麦草
120bp的特异条带,同时缺失小麦亲本7182的目
标条带(图4);定位在小麦3B染色体上的标记
Xwmc307 则只有小麦亲本7182的带型,不具有
华山新麦草特异条带。推断0841可能缺失了小
麦的3D染色体。
2.3 华山新麦草衍生后代0841的形态学分析和
条锈病抗性鉴定结果
普通小麦7182、华山新麦草及二者衍生后代
0841的植物学性状调查结果(表3)表明,0841的
表2 小麦-华山新麦草衍生后代的特异SSR标记
Table 2 SSR markers with specific bands in the derivatives
of wheat and Psathyrostachys huashanica
标记名称 染色体 华山新麦草特异片段长度/bp
Xwmc93  1A,1D 119
Xcfd61  1D 120
Xcfd168  2D 202
Xwmc601  2D 152
Xwmc307  3B 98
Xbarc71  3D 120
Xwmc718  4A 272
Xgwm518  6B 235
Xcfa2049  7A 258
·624· 麦 类 作 物 学 报                  第33卷
株高、小穗数和穗粒数均高于亲本7182。此外,
0841的株型为紧凑型,芒性为长芒,穗为纺锤形,
这些性状与7182相同,而与华山新麦草的松散株
型和短芒不同。
成株期条锈病抗性鉴定表明,亲本普通小麦
7182对条锈菌生理小种条中31号和条中32号
混合菌种的反应型为4级,表现高感条锈病;0841
的反应型为1~2,表现中抗-高抗条锈病。说明
小麦-华山新麦草衍生后代0841具有条锈病抗性
基因,携带的抗性基因来自华山新麦草。
  M.DL2000;P1.华山新麦草(P.huashanica);P2.7182;
D.0841。箭头指示华山新麦草特异条带
图4 Xbarc71 (左)和Xwmc307 (右)对小麦-
华山新麦草衍生后代0841的扩增
Fig.4 Amplification of Xbarc71 (left)and Xwmc307
(right)in Psathyrostachys huashanica,
wheat and their derivative 0841
表3 小麦-华山新麦草衍生后代的植物学性状
Table 3 Morphological characteristics of 7182,Psathyr-
otachys huashanica and their derivative 0841
材料名称 株高 穗长 小穗数 穗粒数
7182  70  10.5  23  50
华山新麦草P.huashanica  50  5  14  28
0841  80  10  25  58
3 讨 论
华山新麦草和普通小麦分属于小麦族不同
属,两者亲缘关系较远。前人研究证明,针对一个
属开发的SSR标记也可以用于其近缘属[28],这
为小麦SSR标记应用于华山新麦草提供了依据。
在以普通小麦和华山新麦草为模板筛选多态性引
物的过程中发现,虽然SSR标记在华山新麦草中
具有多态性丰富的条带,但大部分标记缺少清晰
明亮的主带,这样的标记直接用于杂交后代材料
的分析中很难辨认且重复性差。这种现象同样出
现在用小麦、大麦SSR标记分析大麦和小麦-大
麦附加系[29]中。与外源序列相比,小麦序列与引
物的同源性更高,外源材料不能扩增条带或扩增
条带较弱。在目前尚未获得普通小麦7182-华山
新麦草完全双二倍体或整套华山新麦草二体异附
加系的情况下,以附加多条华山新麦草染色体的
H18衍生后代为材料,筛选能扩增出稳定、明亮
华山新麦草特异条带的引物,进而在来自相同亲
本的其他衍生后代中扩增,所获得的结果更可靠,
工作量也大大降低。与以往报道的华山新麦草特
异SSR标记[16,24]比较发现,本研究筛选的9个
标记不同于已获得的标记,是新的华山新麦草特
异的SSR标记。
本研究所用小麦-华山新麦草衍生后代 H18
系的单株最多为54条染色体,与期望获得的完全
双二倍体相比,缺失华山新麦草两条染色体或者
包含全部华山新麦草染色体而缺失两条小麦染色
体。用分布于小麦各部分同源群的SSR标记对
其衍生单株进行分析,仅第五部分同源群的标记
没有扩增出华山新麦草的特异条带,结合细胞学
结果,判断 H18可能缺少华山新麦草的一对5Ns
染色体。
华山新麦草是小麦重要的条锈病抗性基因来
源,Wang[22]等已证明华山新麦草3Ns染色体上
携带有条锈病抗性基因。本研究发现0841对条
锈菌条中31号和条中32号混合小种表现中抗至
高抗,SSR 标记也显示小麦3D 染色体的标记
xbarc71 能在该材料中扩增出华山新麦草特征条
带,同时缺失普通小麦目标条带,故认为它可能涉
及华山新麦草的3Ns染色体对小麦3D染色体的
代换,进一步的确认还需要通过花粉母细胞染色
体构型和原位杂交等方法对其进行鉴定。
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·824· 麦 类 作 物 学 报                  第33卷