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拟南芥SYTA基因T-DNA插入纯合突变体的鉴定及表型分析



全 文 :2014年3月 四川大学学报(自然科学版) Mar.2014
第51卷 第2期 Journal of Sichuan University(Natural Science Edition) Vol.51 No.2
收稿日期:2013-02-22
基金项目:国家自然科学基金(31171586);国家转基因重大专项(2009ZX08009-080B).
作者简介:谢林峰(1987-),男,重庆人,硕士,研究方向为植物遗传与分子生物学.E-mail:x_justin@126.com.
通讯作者:杨毅.E-mail:yangyi528@vip.sina.com
doi:103969/j.issn.0490-6756.2014.02.035
拟南芥SYTA基因T-DNA插入
纯合突变体的鉴定及表型分析
谢林峰,罗 勤,张 亚,赵 哲,杨 毅
(四川大学生命科学学院与生物资源与生态环境教育部重点实验室,成都610064)
摘 要:通过PCR和RT-PCR在DNA和RNA水平上筛选鉴定SYTA基因T-DAN插入失
活纯合突变体,当对野生型与突变体种子进行45℃/4h与50℃/1h热激后,野生型种子萌发
率分别达到100%与86%,而突变体种子萌发率分别只有83%与27%.当对野生型与突变体
植株幼苗进行热激处理后,其存活率与叶片萎黄率相差不大,说明SYTA基因能显著提高拟
南芥种子的耐热性,但拟南芥幼苗的耐热性不受SYTA基因的影响.
关键词:钙离子;SYTA;膜修复;耐热
中图分类号:Q37   文献标识码:A   文章编号:0490-6756(2014)02-0413-06
Identification and phenotypic observation of SYTA
Gene T-DNA insertional mutant of Arabidopsis
XIE Lin-Feng,LUO Qin,ZHANG Ya,ZHAO Zhe,YANG Yi
(Key Laboratory of Bio-resources and Eco-Environment of Ministry of Education,
Colege of Life Sciences,Sichuan University,Chengdu 610064,China)
Abstract:One homozygous T-DNA mutant was identified at DNA and RNA levels by PCR and RT-
PCR.After wild-type and mutant seeds were subjected to a heat shock treatment of 45℃/4hand 50℃/
1h,wild-type seed germination rate reached 100%and 86%,mutant seed germination rates were only
83%and 27%.When wild-type and mutant seedlings were subjected to a heat shock treatment,their
survival rate and leaf chlorosis rate were almost the same.The phenotype of the mutant and wild type
after subjected to heat shock shows that SYTAgene remarkably enhance the Arabidopsis seeds’ther-
motolerance.But syta mutant seedlings don’t exhibit reduced basal thermotolerance and acquired ther-
motolerance.
Key words:Calcium;SYTA;Membrane resealing;Thermotolerance
1 引 言
质膜是细胞内外环境的生物屏障,是维持细
胞完整性必不可少的结构.如果质膜受到损坏后
没能得到适当的修复,细胞将很快死亡且无法得
到恢复[1].事实上,质膜的损坏与修复活动存在
于许多动物细胞中,如哺乳动物的骨骼肌与心肌
细胞[2].在自然界中,植物在其生命周期会遭遇
到变化的自然环境,所以植物必须进化出一套精
密复杂的机制以感知外界信号从而做出最适当的
  四川大学学报(自然科学版)   第51卷
响应[3-6],如提高植物耐盐性相关的SOS基因;抗
渗透压相关的OSM1/SYP61基因;耐冷性相关的
ICE1基因;以及抗氧化胁迫的 ENH1 基因
等[7-14].虽然植物在上述非生物胁迫下生长其质
膜会受到损坏,但没有明确的报告说明上述抗逆
基因参与植物细胞质膜的修复过程.Synaptotag-
mins(syt)家族蛋白是一种钙离子感受器,其N端
含有一个单跨膜区域,C端含有两个钙离子结合
区域(C2A和C2B).现已知哺乳动物中有16种
Synaptotagmins基因同型物[15].SYT1作为最具
代表性的一种,其主要功能是参与神经细胞神经
递质的释放过程.神经递质释放是由Ca2+内流以
诱导突触囊泡发生胞吐而引起的,而Ca2+需与细
胞内部的Ca2+感受器相结合起来来协同控制囊泡
胞吐释放,SynaptotagminA可能作为快速同步释
放的Ca2+感受器而发挥作用[16].在拟南芥中有五
种syt基因的同源基因(SYT1,-1, -4,和-5;
SYT3基因的cDNA全长序列在其功能区域有一
个终止密码子).在此篇文章中我们把SYT1命名
为SYTA.现已证明,在拟南芥中SYTA 是与质
膜修复系统有关的依赖于钙离子的植物耐冷的一
个正调控因子.此外当拟南芥根部细胞处于高盐
环境压力中时,SYTA 参与细胞质膜完整性与稳
定性的维持.本实验通过购买美国Salk研究院遗
传分析实验室 AtSYTA(At2g20990)基因的 T-
DNA插入突变体,筛选得到纯合体后,测定突变
体与热胁迫相关的一些指标,从了进一步证实
SYTA基因在植物质膜修复上的作用.
2 材料与方法
2.1 试验材料
2.1.1 植物材料 拟南芥(Arabidopsis thaliana
L)为 Columbia生态型.拟南芥(Arabidopsist-
haliana)AtSYTA(At2g20990)基因的 T-DNA插
入突变体SAIL_775_A08购自美国Salk研究院遗
传分析实验室(Salk Institute Genomic Analysis
Labratory).种子经70%乙醇1min,0.1%氯化
汞7min,无菌水洗5次消毒后,4℃低温处理3~
4d.然后播种在 MS培养基上,转至温度22℃/
18℃(日/夜)和16h/8h(日/夜)光周期下,白炽
灯光照培养.
2.1.2 酶与试剂  DNA聚合酶购于TaKaRa公
司.RNA提取试剂盒购于 TransGen公司.反转
率试剂盒购于ToYoBo公司.组织试剂购于Sig-
ma公司.引物合成与测序由Invitrogen生物技术
有限公司完成.
2.2 试验方法
2.2.1 纯合突变体DNA水平的鉴定 当植株生
长到7w时,取叶片用CTAB法提取植物基因组
DNA. 在 http://signal.salk.edu/上 查 到
At2g20990 基 因 特 异 的 引 物 LP (5'-AG-
GTCTCGCGATTTATTAGGG-3'),RP(5'-GC-
CTCCTGACAAGTATAGGGG-3')与 T-DNA 的
LB1(5'-GCCTTTTCAGAAATGGATA AAT-
AGCCTTGCTTCC-3')一起进行PCR扩增(引物
序列由网站http://signal.salk.edu/提供),筛选
出SYTA的纯合突变体,并确定确切的 T-DNA
插入位点.
2.2.2 RNA水平的鉴定 用RNA提取试剂盒
提取同批生长的野生型与突变体植株的RNA,后
用反转率试剂盒对其进行反转率.得到的cDNA
用突变基因 At2g20990的特异引物 LP(5'-AT-
GGGCTTTTTCAGTACGATACTAG-3'和RP(5'-
AACTCCTCATTCCACCTTGGGTCTC-3')进行
扩增,同时以actin基因表达为对照,actin基因引
物为(5'-GTTGGTGATGAAGCACAATCCA-3')
和 (5'-GTTGGTGATGAAGCACAATCCA-3').
48℃/45s,72℃/1min40s,28个循环,扩增产物
用1.0%的琼脂糖凝胶电泳分析.
2.2.3 植株热胁迫后的表型分析
(i)种子萌发率分析 将在4℃下春化3d后的
野生型与突变体种子进行热处理,处理条件为:
50℃/1h;45℃/4h.然后将其进行消毒,并与未经
过热处理的种子一起播种于1×MS平板上.置于
22℃环境下生长.每12h统计一次种子萌发率的
情况.设计3个重复.
(i)苗存活率分析 将生长6d的苗至于人工
气候箱中进行热处理以检测其基础性耐热与诱导
性那热情况.处理条件为:基础性耐热39℃/4h;
诱导性耐热39℃/90min,22℃/2h,45℃/2h.为
了减小植株受到的光氧化与高湿度压力,气候箱
中相对湿度为60%且为避光.热处理4d后统计苗
存活率,设计3个重复.
3 结果与分析
3.1 T-DNA插入位置与At2g20990基因缺失纯
合突变体的鉴定
用基因的两端引物LP与RP扩增后,纯合野
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第2期    谢林峰等:拟南芥SYTA基因T-DNA插入纯合突变体的鉴定及表型分析  
生型中有一条带,条带大小为1027bp.与此对应
的纯合突变体中没有,当用RP与LB1一起扩增
时纯合突变体中有一条特异条带,条带大小在445
~745bp之间.而杂合子中同时存在上述两条带
(图1,b),上述获得的条带大小与预期结果一致.
经过访问网站http://signal.salk.edu/得知,T-
DNA插入在At2g20990基因的第10个外显子处
(图1,a).突变体植株和野生型植株的actin基因
都能正常表达,在野生型中At2g20990基因正常
表达,获得的扩增条带大小为1404bp,与预期结
果一致.但在突变体中At2g20990基因并无表达
(图1,c),表明 T-DNA 的插入使得突变体中
At2g20990基因完全被敲除,这一株材料是 T-
DNA插入At2g20990基因的纯合突变体.
图1 纯合突变体的鉴定
A.At2g20990基因突变通过pDAP101载体在第10个
外显子插入;B.琼脂糖凝胶电泳:1~2.野生型;3~4.突
变体;5~6.杂合体:1,3,5泳道引物为LP与RP(获得的
目的条带为1027bp);2,4,6泳道引物为RP与LB1(获得
的目的条带在445-745bp之间);C.RT-PCR 分析结果:
At2g20990表 示 野 生 型 与 突 变 体 RNA 反 转 录 后 用
At2g20990基因引物扩增(获得的目的条带为1404bp),ac-
tin表示用actin引物扩增
Fig.1 Identification of homozygous mutant
A.The At2g20990gene is disrupted by the insertion of
the pDAP101in the ten exon;B.Analysis with agar gel e-
lectrophoresis:1~2.Wild type;3~4.Mutant;5~6.het-
erozygote:1,3,5.Lane produces were amplification with
the primer(LP)and the primer(RP)of gene(the size of band
is 1027bp);2,4,6.Lane with the RP of gene and LB1of
T-DNA(the size of band is between 445-745bp);C.RT-
PCR analysis;In the picture At2g20990 means col(wild
type)and Mutant's total RNA reverse transcribe into cDNA
by OligodT primer,then amplified with At2g20990gene
special primer pair(the size of band is 1404bp),actin means
RNA amplified with actinprimer pair
3.2 植株种子受热激后萌发率与生长状况分析
如图2所示为植株种子受热激45℃处理4h
后的萌发率与植株生长情况.如图(图2,a,b,
c),未受热激的SYTA 基因缺失突变体种子的萌
发速率,最终萌发率与同样未受热激的野生型一
致.而受到热激后的种子,其萌发速率显著下架.
其中突变体种子的萌发速率比野生型受到更大影
响(图2,b).
又如图3所示为植株种子受50℃处理1h后
的萌发率与植株生长情况(图3,a,b,c,d).未
受热激的SYTA 基因缺失突变体种子的萌发速
率,植株生长状况与同样未受热激的野生型一致.
而受到热激后的种子,其萌发速率且最终萌发率
显著下降,从而导致植株的生长泄后.其中突变
体种子的萌发率与植株生长情况比野生型受到更
大影响.未受热激的野生型与突变体种子,其最
终萌发率达到100%,而受到热激后的野生型种
子,其萌发率下降为86%,而突变体种子的萌发
率只有27%(图2,b,c).这些结果说明拟南芥
SYTA基因会增强拟南芥种子的耐热性.
3.3 植株幼苗受热激后存活率分析
图4所示为植株幼苗受热激后的存活率情况,
从中可以看出无论是对植株进行基础性耐热处理
还是诱导性耐热处理,野生型植株与SYTA基因
缺失突变体植株的存活率与植株萎黄率几乎一致,
及其耐热性无明显区别.说明SYTA 基因对拟南
芥苗期的耐热性无明显影响.
4 讨 论
Syt基因家族广泛的存在于真核生物中.其
蛋白定位于细胞膜上.在动物细胞中,Syt作为钙
离子感受器具有依赖于钙离子的促进膜融合的功
能,如对细胞膜的重新封闭与修复功能.在植物
细胞中,最近已经证明拟南芥中Syt基因家族同
源基因,SYTA参与依赖于钙离子的膜修复过程,
并且能显著提高植株的耐冷性和耐盐性.其作用
机制主要为当植物处于寒冷与高盐环境中时,其
细胞膜会受到一定的损伤,这时,胞外及其胞内
细胞器中的钙离子会大量的涌入细胞质中,SY-
TA的C2A结构将于钙离子子结合而其C2B结构
域具有依赖于钙离子的磷脂绑定功能.此时.SY-
TA将通过其C2B结构域的磷脂绑定功能捕获胞
质中的小泡,使其与细胞质膜融合,从而达到修
复细胞质膜,保持质膜完整性的目的.现研究表
明,高温胁迫将通过对植物细胞膜的完整性与流
动性的破坏及过氧化物的积累,细胞新陈代谢的
失衡与蛋白质的降解与失活等造成对植物的伤害.
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  四川大学学报(自然科学版)   第51卷
图2 突变体种子45℃热处理后萌发率情况
将在4℃下避光春化3d后的野生型与syta突变体种子一部分进行45℃,4h的热激处理,一部分不作处理,然后播散于平板
上,至于24℃下每日光照16h的坏境中生长.指定时间间隔对其萌发率进行测定.A.种子未受高温处理及高温处理后,7d后的生
长情况.B.C.种子萌发率情况.野生型与syta突变体种子萌发率在热激后差异显著P<0.05
Fig.2 seed germination after heat treatment(45℃)
Stratified wild-type,sytaseeds(3din the dark at 4℃)were immediately subjected to heat shock treatment of 45℃for 4hor in-
cubated at 24℃(normal),sown onto plates,and then maintained
under a 16hdaily photoperiod at 24℃.Germination was assessed at the indicated intervals.A,Ilustration of representative
seeds/seedlings 7dafter heat treatment and B,C.seed germination data from three independent experiments,mean+SE,n=55,Al
mean values are signifucantly different between the wild type and sytaafter the heat shock treatment(P<0.05)
图3 突变体种子50℃热处理后萌发率情况
将在4℃下避光春化3d后的野生型与syta突变体种子一部分进行50℃,1h的热激处理,一部分不作处理,然后播散于平板
上,至于24℃下每日光照16h的坏境中生长.指定时间间隔对其萌发率进行测定.A,B种子未受高温处理及高温处理,14d后的
生长情况.C,D.种子萌发率情况.野生型与syta突变体种子萌发率在热激后差异显著P<0.05
Fig.2 seed germination after heat treatment(45℃).
Stratified wild-type,syta seeds(3din the dark at 4℃)were immediately subjected to heat shock treatment of 50℃for 1hor in-
cubated at 24℃(normal),sown onto plates,and then maintained
under a 16hdaily photoperiod at 24℃.Germination was assessed at the indicated intervals.A,B.Ilustration of representative
seeds/seedlings 14dafter heat treatment and C,D.seed germination data from three independent experiments,mean+SE,n=55.
Al mean values are significantly different between the wild type and sytaafter the heat shock treatment(P<0.05)
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第2期    谢林峰等:拟南芥SYTA基因T-DNA插入纯合突变体的鉴定及表型分析  
图4 植株幼苗受热激后存活率情况
syta突变体幼苗没有表现出减弱的基础性耐热和诱导性耐热性质.A,将生长10d的野生型和syta突变幼苗置于光照22℃常
温下4h.B,将生长10d的野生型和syta突变幼苗置于暗处,相对湿度为60%的环境中,并给予4h45℃的热激处理.C,将生长
10天的野生型和syta突变幼苗39℃热激90min,经过2h22℃的恢复后,幼苗被置于45℃下热激2h,环境与B中一致.图片为热
激处理后4d苗的图片.
Fig.2 livability of seedings after heat treatment
sytaseedlings don’t exhibit reduced basal thermotolerance and acquired thermotolerance.a,Ten-day-old Untreated wild-type,
sytaseedlings(normal)were maintained in light at 22℃for the 4-h period b,Ten-day-old wild-type,sytaseedlings were subjected to
a heat shock treatment of 45℃/4hin the dark at 60%relative humidity c,Ten-day-old wild-type,sytaseedlings were subjected to a
heat shock treatment of 39℃for 90min.After a recovery period of 2hat 22℃,seedlings were exposed to a heat shock of 45℃for 2
h under the conditions described above.Ilustrated are representative seedlings 4dafter heat shock treatment.
而植物的耐热性在很大程度上取决于依赖于钙离
子的细胞完整性与流动性的维持.现已有大量报
道证实,受到热激后的植物细胞,其胞质内会有
大量钙离子的积累,且钙离子作为一种信号因子,
将启动细胞内一系列生理活动的变化,进而促进
植物的热胁迫耐受性.
如上所诉,因为冷,高盐,高温胁迫会引起植
物细胞相似的生理活动,所以本研究设计了拟南
芥野生型植株与syta突变体植株的种子和幼苗的
热激实验,以探索SYTA 基因在植株耐热方面的
作用.结果表明,当野生型与突变体种子在受到
热激后,其突变体种子的萌发率与萌发速率显著
下降,而野生型下降不明显,说明SYTA 能显著
提高拟南芥种子的耐热性,推测其作用机制与细
胞耐盐,耐冷的作用机制一致.然而比较有趣的
是,当对拟南芥野生型与SYTA 突变体植株幼苗
进行热激后,野生型与突变体幼苗的存活率与叶
片萎黄率几乎一致.说明SYTA 基因可能只在拟
南芥植株种子萌发阶段参与植株的耐热性活动,
而在植株幼苗期不参与此活动或不表现出耐热特
性.具体原因可能有两点:1.SYTA 基因在植株
种子萌发阶段大量表达而在其幼苗阶段表达量减
少以至于不足以对植株的耐热性造成影响;2.在
拟南芥的幼苗期,有其他与SYTA 功能相似的基
因参与植株的耐热性活动,单纯突变掉SYTA 基
因并不能对植株的耐热性产生影响.当然,其具
体作用机制还需要进一步的研究证明.
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