全 文 :2016年9月 四川大学学报(自然科学版) Sep.2016
第53卷 第5期 Journal of Sichuan University(Natural Science Edition) Vol.53 No.5
doi:103969/j.issn.0490-6756.2016.09.031
拟南芥AtHHR3响应热胁迫应答的初步分析
齐辉辉,蔡潇潇,杨虹伟,王健美,刘志斌,杨 毅
(四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室,成都610064)
摘 要:拟南芥基因AtHHR3编码一个RING结构域的E3连接酶,通过生物信息学分析发
现其可能参与植物热胁迫相关的应答.为了探索其具体的功能,构建了AtHHR3互补株系,并
在DNA水平和转录水平分别鉴定了 AtHHR3互补株系,用RT-PCR技术分析了 AtHHR3
在热处理条件下基因表达的变化情况.在热胁迫下分析了野生型、突变体athhr3、回复株系幼
苗存活以及种子萌发的表型变化情况,发现突变体athhr3表现出对热胁迫的耐受性,并检测
了热胁迫下不同株系的 HSF、HSP等热相关基因的转录水平的变化,初步的研究表明拟南芥
基因AtHHR3负调控植物对热胁迫的耐受性.
关键词:AtHHR3;E3连接酶;热胁迫;拟南芥;耐热性
中图分类号:Q945 文献标识码:A 文章编号:0490-6756(2016)05-1141-06
收稿日期:2015-11-20
基金项目:国家自然科学基金(31171586);973计划(2015CB755702).
作者简介:齐辉辉(1992-),男,河南永城人,硕士研究生,研究方向为植物遗传与分子生物学.E-mail:qhh835@163.com
通讯作者:杨毅.E-mail:yangyi528@vip.sina.com
Primary analysis of the function of Arabidopsis thaliana
AtHHR3 to response heat stress
QI Hui-Hui,CAI Xiao-Xiao,YANG Hong-Wei,WANG Jian-Mei,LIU Zhi-Bin,YANG Yi
(Colege of Life Sciences,Key Laboratory of Bio-Resources and Eco-Environment of MOE,
Sichuan University,Chengdu 610064,China)
Abstract:Arabidopsis thaliana gene AtHHR3encodes a RING domain E3ligase.According to the anal-
ysis in silico,it was found that the gene might participate in Arabidopsis thaliana heat stress response.
In order to explore the detail function of AtHHR3,the transgene lines of AtHHR3was constructed
which was identified in DNA level and the transcription level.The changes of AtHHR3gene expression
was analyzed by RT-PCR under different temperature.The analysis demonstrated that athhr3mutant
plants had a higher germination rate and survival rate than wild type(col)and AtHHR3transgenic lines
under heat stress,suggesting that athhr3mutant plants were more tolerant than wild type and AtHHR3
transgenic lines to heat shock.The changes of transcription of some HSFs and HSPs were detected in
different strains under heat stress.Hence,the preliminary studies reveal that AtHHR3acts as a nega-
tive regulator of thermotolerance in Arabidopsis thaliana.
Key words:AtHHR3;E3ligase;Heat stress;Arabidopsis thaliana;Thermotolerance
四川大学学报(自然科学版) 第53卷
1 引 言
随着全球CO2 气体的排放量逐渐增加,全球
气候变暖逐渐加剧,研究表明如果农作物不能适应
逐渐升高的气候温度,将会影响光合作用和碳的固
定,从而严重影响农作物的生长和产量[1,2].因此,
研究植物对于高温耐受性的分子机制,对于我们改
良农作物的品质,提高农作物产量具有重大意义.
泛素化降解途径通过泛素激活酶E1,泛素结
合酶E2以及泛素连接酶E3将泛素叠加到底物
上,然后通过26S蛋白酶体降解.作为一种典型的
翻译后修饰调节,泛素化修饰被认为广泛参与植物
对逆境胁迫的响应[3].拟南芥中大约有1400多种
E3连接酶,E3连接酶在识别特异性底物方面起到
重要的作用[4].过表达U-Box结构域的E3连接酶
AtCHIP增强了拟南芥对冷胁迫的耐受性[5];
CRL4家族的多亚基E3连接酶 HTD1被报道负
调控拟南芥对热胁迫的响应[6];而油菜中的一个
RING结构域的E3连接酶BnTR1正调控油菜和
水稻的耐热性[7];研究发现,异源表达水稻中的一
个RING结构域的E3连接酶OsHCL增强了拟南
芥对获得性热胁迫的耐受性[8].而拟南芥中RING
结构域的E3却很少有报道其在热胁迫中的作用.
本实验室在前期的研究中,发现了拟南芥中一
个 RING 结 构 域 的 E3 连 接 酶 AtHHR3
(At3g28620),通过生物信息学预测其可能参与拟
南芥热信号转导.因此,本实验以拟南芥AtHHR3
为研究对象,在DNA水平和转录水平分别鉴定了
AtHHR3的互补株系,并检测了AtHHR3在热胁
迫的不同阶段基因表达变化,分析了AtHHR3在
热胁迫下对种子萌发和幼苗存活率的影响,最后检
测了不同株系在热胁迫下 HSP、HSF等基因的变
化情况,初步揭示了其在拟南芥响应热胁迫方面的
相关功能.
2 材料与方法
2.1 实验材料
拟南芥(Arabidopsis thaliana)Columbia野生
型(Col)种子为本实验室所保存,拟南芥突变体
athhr3种子购自于拟南芥生物资源中心(ABRC).
Taq DNA 聚合酶、PrimerSTAR Max DNA
Polymerase、SYBGreen、Trizol、反转录试剂盒均购
自于Takara公司,限制性内切酶、T4Ligase等均
购自于Fermentas公司,实验中所用引物由华大基
因合成,其他试剂为进口或国产分析纯.
2.2 实验方法
2.2.1 引物设计 在拟南芥基因数据库Tair上
查询并获得拟南芥基因AtHHR3的序列信息,并
用primer premier 5.0结合在线引物设计工具Ol-
igoArchitect TM(http://www.oligoarchitect.com)
设计引物如表1.
2.2.2 植物培养 将拟南芥种子加水放在4℃避
光春化2天,在超净台中用70%的乙醇消毒3min,
然后用无菌水清洗3次,再用1%的氯化汞消毒
8min,用无菌水清洗5次,均匀播种在 MS固体培
养基上,22℃16h光照/8h黑暗培养.
2.2.3 DNA水平和转录水平的鉴定互补株系
将T0 代转基因株系播种在含有潮霉素抗性的 MS
固体培养基中,生长一段时间后将根长比较长的株
系移栽到营养土中培养收获T1 代种子.按照此方
法筛选到T3,将T3 代得到的种子播种于 MS固体
培养基中生长7d提取拟南芥总RNA并反转录,
进行RT-PCR检测基因表达;取 MS培养基中的
阳性苗移栽到土壤中生长一个月,用CTAB法提
取拟南芥叶片DNA用35S引物和基因下游特异
性引物进行PCR扩增检测互补株系.
2.2.4 热胁迫下不同时间段AtHHR3的转录水
平变化 分别在正常条件下、直接45℃2h、38℃
2h、22℃2h以及再继续45℃2h处理这几个时间
点取样,提取幼苗的总RNA并反转录成cDNA用
RT-PCR分析不同时间段AtHHR3基因的表达
变化情况.
2.2.5 热胁迫下野生型、突变体、回复株系萌发
率分析 播种前将种子在38℃处理2h,然后放在
22℃2h,随后放在50℃处理3h15min将种子消毒
均匀播种于 MS固体培养基中放在22℃培养,统
计种子萌发率.
2.2.6 热胁迫下野生型、突变体、回复株系存活率
分析 分别将野生型、突变体、回复株系播种于
MS固体培养基 22℃ 生长 6d,然后 45℃ 加热
135min,然后放在22℃组培室培养5d统计存活
率.
2.2.7 热胁迫相关基因转录水平的变化 将生长
7d的野生型、突变体、回复株系幼苗38℃处理2h
分别提取总 RNA,反转录,并用 RT-PCR检测热
相关基因的变化情况.
2411
第5期 齐辉辉,等:拟南芥AtHHR3响应热胁迫应答的初步分析
表1 引物列表
Tab.1 Primers List
基因(Gene) 引物序列(Primer Sequence)5′→3′
Q-PCR HHR3F CGTTGTGTCTTGTGATTCTGCTC
Q-PCR HHR3R CTCCGATCTCAACAAATTCTCC
Q-PCR HSFA3F CTTGGGGACTGACCGGAGCTAGCTTCGTAG
Q-PCR HSFA3R GCTAGTGCTACTGCAGCAAGTTTGGTTG
Q-PCR HSP18.2F CCGTTCTCGCAAGACTTATGG
Q-PCR HSP18.2R GAAGCGTTTGCCAACGCAGAA
Q-PCR Actin F TTGACTACGAGCAGGAGATGG
Q-PCR Actin R ACAAACGAGGGCTGGAACAAG
35S GACGCACAATCCCACTATCC
HHR3R TCAACTGTGTAGTTTGTCAACAGC
3 结果与分析
3.1 互补株系的鉴定
3.1.1 DNA水平鉴定互补株系 分别提取Col、互
补株系C-6、C-7、C-8、C-9植株的叶片DNA,然后用
烟草花叶病毒35S引物和AtHHR3基因特异性下游
引物进行PCR扩增,结果显示在互补株系中能够扩
增出AtHHR3片段,而在Col植株中没有DNA条带
(如图1),说明AtHHR3基因成功转入互补株系中.
3.1.2 mRNA水平鉴定互补株系 分别提取上
述Col、互补株系植株的总RNA,然后进行反转录,
用Real-Time RCR 实验分别检测不同植株中
AtHHR3基因的表达量,实验结果显示互补株系
植株中的AtHHR3基因的表达量分别比Col植株
中分别高21.2倍、136.7倍、18.6倍、37.5倍(图
1).结果表明 AtHHR3基因成功转入互补株系而
且表达量符合预期可以进行后续的实验.
图1 DNA水平和转录水平检测拟南芥AtHHR3转基因植株
Fig.1 Detection of AtHHR3transgenic Arabidopsis by DNA level and transcription level
3.2 热胁迫下AtHHR3基因表达分析
基因芯片 Arabidopsis eFP Browser分析发
现,AtHHR3与热胁迫相关,因此分别检测了在正
常生长条件下(22℃)与获得性耐热条件下下不同
时间段(38℃2h、22℃2h、45℃2h)以及基础性耐
热条件(45℃/B 2h)AtHHR3基因的变化情况,结
果显示无论是获得性耐热还是基础性耐热条件下
AtHHR3相对于正常条件下的表达量明显降低
(图2).由此猜测 AtHHR3有可能在拟南芥响应
热胁迫过程中起负调控作用.
3.3 AtHHR3影响热胁迫下种子的萌发
将春化2d的种子按照下面的条件(图3C)进
行热胁迫处理,然后消毒灭菌,播种在 MS固体培
养基上,分别统计野生型、athhr3突变体、以及互
补株系的萌发率.可以观察到在没有热胁迫处理条
件下各株系间的萌发率几乎没有差异,而在热胁迫
处理条件下athhr3突变体种子的萌发率显著高于
野生型和互补株系种子的萌发率(如图3).各株系
萌发率统计图显示,各株系随着时间的增加其萌发
率逐渐增高,但是即使到第六天野生型和互补株系
种子萌发率依然没有超过50%表现出对热胁迫的
敏感性,而athhr3突变体种子萌发率则达到了
80%以上,在一定程度上表现了对热胁迫的耐受
性.
3411
四川大学学报(自然科学版) 第53卷
图2 热胁迫下AtHHR3基因的相对表达量
Fig.2 Relative expression quantity of AtHHR3under
heat stress
3.4 AtHHR3影响热胁迫下幼苗的存活
将在 MS固体培养基上生长6天的拟南芥幼
苗按照如下条件(图4B)处理,然后统计各种株系
的热胁迫下的存活率(图4C).从图4中可以明显
看出athhr3突变体株系相对于Col和互补株系表
现出较强的耐热性,从统计图中可以看出热胁迫处
理后athhr3突变体幼苗存活率达到47.3%左右,
而野生型和互补株系存活率不到10%,由此可以
看出AtHHR3基因负调控拟南芥对于热胁迫的耐
受性.
图3 热胁迫下拟南芥种子的萌发率
A.正常条件下种子萌发情况B.热胁迫后种子萌发情况C.热处理条件草图 D.各株系种子萌发率
Fig.3 Seed germination rate of Arabidopsis under heat stress
A.The conditions of seed germination under normal condition B.The conditions of seed germination under heat
stress C.Schematicaly,the condition of Arabidopsis seed exposure to heat stress D.Seed germination rate of
Arabidopsis under heat stress
3.5 AtHHR3影响拟南芥中热胁迫相关基因的表
达
遗传和生理上的分析已经证明,HSFs和
HSPs直接调控植物的耐热,当植物植物处于一个
缓和的热胁迫条件下(38℃),可以非常有效的激活
HSF-HSP 信号网络,而一些 HSP又能通过反馈
调节 HSFs的活性,从而显著提高植物的耐热
性[9-12].因此,我们在38℃2h条件下分别处理了野
生型(Col)、athhr3突变体、互补株系C-7以及C-
8,从而检测不同株系中相关 HSP和 HSF基因表
达的变化情况.
如图5所示,在正常条件下Col、athhr3突变体、
互补株系C-7、C-8植株中HSFA3和HSP18.2基因
表达量均比较低,而且没有明显的差异,在38℃2h
处理过后Col、athhr3突变体、互补株系C-7、C-8植
株中HSFA3和HSP18.2基因表达量均明显升高,
但是,相对于Col和互补株系C-7、C-8,athhr3突变
体中的 HSFA3和 HSP18.2基因表达上升更为明
显,通过结果可以推测 AtHHR3通过调节相关的
HSF和HSP基因的表达量从而参与拟南芥热胁迫
应答,athhr3突变体中相关 HSF和 HSP基因表达
比较高,从而表现出对热胁迫的耐受性.
4411
第5期 齐辉辉,等:拟南芥AtHHR3响应热胁迫应答的初步分析
图4 athhr3突变体表现出对热胁迫的不敏感性
A.热胁迫后幼苗存活情况B.热处理草图C.幼苗存活率
Fig.4 The athhr3mutant is insensitive to heat stress
A.The conditions of seedings after exposure to heat stress B.Schematicaly,the condition of Arabidopsis
seedings exposure to heat stress C.The survival rate of Arabidopsis seedings
图5 热胁迫下野生型、突变体、互补株系中 HSFA3和 HSP18.2的相对表达量
Fig.5 Relative expression quantity of HSFA3and HSP18.2in wild type、mutant、trans-
genic lines under heat stress
4 讨 论
本研究为探索AtHHR3在拟南芥热胁迫应
答中的功能,分别在DNA水平上和转录水平上鉴
定了AtHHR3互补株系,用35S引物和AtHHR3
下游特异性引物进行PCR,结果显示在互补株系
中能扩增出AtHHR3而在Col却不能,RT-PCR
显示互补株系中 AtHHR3的表达量明显高于
Col,表明AtHHR3基因成功转入互补株系(图
1).体内AtHHR3在热胁迫下基因表达量呈下降
趋势,表明 HHR3可能负调控拟南芥耐热(图2).
于是我们分析了热胁迫下拟南芥种子萌发率和幼
苗存活率,发现athhr3突变体无论在种子萌发还
是在幼苗存活率上均高于Col和互补株系(图4,
图5).以上结果说明AtHHR3在拟南芥响应热胁
迫中起负调控作用.
泛素-26S蛋白酶体介导的蛋白降解系统在植
物抗逆方面起到了重要的作用,而E3连接酶能够识
别特结合异性的底物,从而降解特异性的蛋白[4].目
前,关于E3连接酶在拟南芥抗逆方面的研究主要集
中在盐胁迫、渗透胁迫等方面.AtDRIP1和AtDRIP2
负调控拟南芥对盐和干旱的响应[13];AtRGLG1和
AtRGLG2与AtERF53相互作用负调控拟南芥对干
旱的响应[14].而E3连接酶在拟南芥耐热方面的研
究所知甚少,我们在研究中发现了一个参与拟南芥
热胁迫信号转的RING结构域的E3连接酶AtH-
HR3,并做了相关的研究.
早期的研究主要集中在对 HSPs和 HSFs等
方面的研究,研究表明 HSP101直接参与拟南芥基
础耐热和获得性耐热[15,16];HSP70可以调控结合
5411
四川大学学报(自然科学版) 第53卷
变性的蛋白促进它们重新折叠[17];一些小分子
HSP蛋白同样能够起到分子伴侣的作用.研究发
现,HSFA1在热胁迫中起到主要的调控作用,HS-
FA2主要受光和渗透诱导,HSFA3同样在热信号
传导通路中起到正调控作用[18,19];鉴于,HSFs和
HSPs在植物耐热方面起到重要的作用因此我们
检测了一些HSF和HSP基因的变化情况,结果表
明 HSFA3和 HSP18.2基因在athhr3突变体表
达量明显高于Col和互补株系(图5),从而使得
athhr3突变体表现的更为耐热.
本研究只是初步揭示了AtHHR3在拟南芥中的
功能,而对于其具体的信号传导和耐热机制还需要进
一步的研究.随着全球气温的逐渐升高,其所带来的
危害也越来越显著,热胁迫通过破坏植物细胞里面的
稳态平衡等,从而导致农作物减产,更有甚者,一些植
物由于不能适应逐渐升高的温度而濒临灭绝,因此,
研究植物耐热的分子机制,用基因工程的方法提高植
物耐热性也会更加引起科学家的重视.
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