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作 者 ：尹悦佳

期 刊 ：吉林大学 2007年 03期 页码：61

关键词：Arabidopsis；promoter；free energy；bendability；nucleotide frequency；

摘 要 ：启动子的结构特性对转录调控有重要作用。本文对拟南芥全基因组中启动子序列结构特性,包括自由能分布,可弯曲性,单核苷酸组成分布及二核苷酸的分布进行了计算分析,并与脊椎动物和大肠杆菌的启动子结构特性进行比较。分析表明,拟南芥启动子与其他启动子相比,DNA结构最为稳定;这三组启动子在转录起始位点附近自由能都有明显变化峰,然而变化趋势各有不同;在可弯曲性与核苷酸组成上也有同样的差异特征。同时,启动子的转录起始位点上游序列和下游序列的结构特征也有明显差异。这些差异性特征可用于计算预测不同物种,尤其是植物基因的启动子和转录起始位点,从而增强预测的针对性。

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