免费文献传递   相关文献

向日葵种子蛋白双向电泳技术体系建立的初步研究



全 文 :
(接上页)
繁、推”一体化种子企业合作,组建大型专业制种公
司。同时加大对大型专业化玉米制种企业的扶持力
度,支持有能力的企业建立种子加工中心,迅速提升玉
米种子脱水、脱粒和精选的能力和水平。
3. 3 完善化解制种自然风险的技术体系
建议组织有关专家和制种企业共同研究完善化解
新疆玉米制种自然风险的技术体系。(1)科学规划。
新疆地域辽阔,各地无霜期、积温、水资源、干热风等自
然因素差异大,制种基地必须通盘考虑、科学规划,切
记盲目发展。(2)完善风险防范技术体系。针对不同
玉米制种基地制种潜在风险,建立自交系、杂交组合的
制种安全评估技术体系,从源头降低制种风险。(3)
从亲本生产、机械化制种、干燥、精深加工等方面建立
完善的玉米制种技术示范基地。
3. 4 大力提升种子管理站的监管和服务能力
兵团基层种子站管理存在手段落后、服务能力差,
经费和编制不足等问题,建议兵团及各师按照中央 8
号文件的要求,切实强化师级种子管理的机构职能,加
大种子管理工作经费投入,强化种子业务技术培训,提
升种子管理机构人员的技术水平和服务意识。兵团在
2014 年制定了“新疆兵团玉米制种基地管理办法”,应
进一步学习兄弟省市的制种基地管理经验,贯彻落实
“新疆兵团玉米制种基地管理办法”,加强制种基地的
管理,培育一个健康充满活力的种子市场和制种环境,
吸引更多的企业前来制种和合作,促进兵团玉米制种
产业健康快速的发展。
收稿日期:2014 - 06 - 29
作者简介:夏江勇(1991 -) ,男,湖南人;本科生。
通信作者:刘海学(1965 -) ,男,内蒙古通辽市人;研究员,主要从事生
物化学与分子生物学研究;E-mail:liuhaixue715@ 126. com。
向日葵种子蛋白双向电泳技术体系建立的初步研究
夏江勇, 吕 潇, 张晓倩, 刘 洋, 刘海学
(天津农学院, 天津 300384)
A Preliminary Study on Two-dimentional Electrophoresitic
Technology System for Sunflower Seed Protein
XIA Jiang-yong,L Xiao,ZHANG Xiao-qian,LIU Yang,LIU Hai-xue
摘要:以向日葵种子作为实验材料,对双向电泳各个环节条件
进行了比较选择。结果表明:采用上海生工试剂盒提取植物蛋
白,结合使用 pH 3 ~ 10 的 11 cm IPG胶条,上样量为 1 mg,凝胶
浓度为 10%,用改良的考马斯亮蓝法染色,可分离到 130 个蛋
白质点。初步建立了一套适用于向日葵种子蛋白质组分析的
双向电泳技术体系。
关键词: 双向电泳;向日葵;蛋白提取;蛋白质组学
中图分类号: S 565. 5 文献标志码: A
文章编号: 1001 - 4705(2014)12-0094-04
向日葵(H. annuus L.)为世界四大油料作物之
一,约自明朝传入我国。向日葵子实体含油量为
48% ~55%,富含不饱和脂肪酸 85% ~ 91%,其中含
亚油酸 65%、油酸 23%,是一种极富保健作用的食用
油[1]。向日葵种子是优质食用油和优质蛋白质的重
要来源之一,它含有球蛋白、清蛋白和油脂体蛋白等丰
富的蛋白质[2]。向日葵不仅是世界重要油料作物,也
是我国新疆、内蒙古、甘肃等北方省区的主要油料作
物,在未来能源开发和种植结构调整过程中具有重要
经济意义[3]。蛋白质组学(Proteomics)一词是由澳大
利亚学者威尔金斯和威廉姆 1994 年在意大利召开的
一次科学会议上首次提出[4]。蛋白质组学相关技术
现已成为后基因组时代关键发展技术,全世界科学家
都在争相发展和利用该技术,其中,双向电泳技术是蛋
白质组学研究中至关重要的一项技术,但因多方面原
因一直是蛋白质组学技术发展的瓶颈。本实验旨在以
向日葵种子为实验材料,初步建立蛋白质双向电泳体
系,为后期开展不同植物间蛋白质组图谱比较、荧光差
异蛋白电泳、逆境处理蛋白质组变化等相关研究打下
基础。
1 材料与方法
1. 1 材 料
实验材料为向日葵种子、大豆种子、水稻种子,由
天津农学院农业分析实验教学示范中心保存。
·49·
第 33 卷 第 12 期 2014 年 12 月 种 子 (Seed) Vol. 33 No. 12 Dec. 2014
DOI:10.16590/j.cnki.1001-4705.2014.12.061
1. 2 方 法
1. 2. 1 蛋白提取
试验了三氯乙酸 /丙酮沉淀法和酚提取法[5]、改
良水提取法和有机溶剂提取法[6],另外还试验了试剂
盒提取方法,其中包括南京凯基生物科技发展有限公
司和上海生物化工科技发展有限公司(简称生工)植
物蛋白提取试剂盒。试验结果表明,生工试剂盒提取
效果较好,其他方法存在样品用量大、提取杂质多、溶
解特别困难等问题。用生工试剂盒提取蛋白的具体步
骤是取 100 mg向日葵种子,约取尖端 3 mm,用研钵研
碎,然后按试剂盒操作步骤操作,最后加入1 mL水化液,
漩涡震荡使沉淀悬浮,4 ℃过夜溶解。为验证该方法对
其他植物种子蛋白的提取效果,还用该方法提取了 100
mg大豆种子和水稻种子的全蛋白,并进行了初步比较。
1. 2. 2 蛋白定量
采用紫外吸收 A280法和 SDS-PAGE 单向电泳检测
相结合,以期得到准确的蛋白含量测定结果,避免出现
因样品中存在干扰物质导致仪器检测错误的现象。在
这里使用了 Thermo 公司的蛋白质微量测定仪,取
1. 5 μL样品进行测定。单向电泳方法体系采用张云
贵等[7]的方法,上样量为 10 μL,最后采用的染色方法
和双向电泳染色方法一致[9]。
1. 2. 3 双向电泳
(1)水化:采取水化上样,选择 pH 值为线性
3 ~ 10 的11 cm胶条,IPG buffer 的含量为 0. 5%,上样
体积为 200 μL,放置 Immobiline Dry Strip 泡胀盘中过
夜水化,第 2 天开始第一向等电聚焦,保证水化时间在
10 ~ 16 h之间。
(2)一向:等电聚焦程序参照 GE公司操作手册[8]
进行,并稍作改动,改为 100 V 保持 0. 5 h,500 V 保持
1 h,1 000 V 梯度升压 1 h,6 000 V 梯度升压 2 h,
6 000 V保持 0. 5 h。
(3)平衡:平衡时间为 15 min,先在加入 DTT的平
衡液Ⅰ中浸泡 15 min,同时水平摇晃,后立即在加入
IAM的平衡液Ⅱ中浸泡 15 min,同时水平摇晃。其中
平衡液用中号平皿盛放。
(4)二向:二向胶采用的是浓度为 10%的聚丙烯
酰胺胶,厚度为 1 mm,将一向胶条放至二向胶面后,迅
速加入含有溴酚蓝的琼脂糖溶液封顶。二向电泳参数
为先 10 mA 1 h,后 20 mA电泳至溴酚蓝跑到底部。
(5)染色:采用 Giovanni Candiano 等[9]创制的染
色方法,同时在此方法上简化:染色配方不变,先染色
过夜,后脱色 6 ~ 8 h。其中,染色液配方为磷酸浓度为
10%,硫酸铵浓度为 10%,G-250 考马斯亮蓝的浓度为
0. 12%,甲醇浓度为 20%,脱色液为超纯水。
(6)扫描:扫描采用的是 Imagescanner 扫描仪扫描
后,调整对比度,观察胶图情况使背景和蛋白点的对比
度处于最佳状态,为后期进行蛋白点的分析提供便利。
(7)分析:采用 Image Master 2 Dplatinum 5. 0 分析
软件进行分析,其中参数设定:光滑度为 5,最小区域
值为 5,显著度为 10,先自动检测所有蛋白点,后手动
剔除错误识别的蛋白点。
2 结果与讨论
2. 1 向日葵种子蛋白与其他种子蛋白含量测定结果
比较
由表 1 可以看出,用上海生工试剂盒法提取的蛋
白样品浓度较高,并且杂质较少,一般当 A260 /A280值偏
低时说明蛋白样品所含核酸等杂质较少。其中向日葵
种子取的是种子尖端,去除了含油脂较多的子叶部分,
所以得到的蛋白纯度较高。在蛋白样品制备过程中,
蛋白的复溶是很关键也是当前仍未得到有效解决的难
题,当蛋白质经丙酮或甲醇等有机溶剂萃取后,蛋白质
表面的水化层遭到破坏,所以很难再溶,一般用漩涡震
荡、超声处理、微波处理、枪头搅拌等机械方法促进溶
解,但这些方法的过分使用都有对蛋白结构产生破坏
的可能,另外,对一些难溶性蛋白可以采取提高尿素等
盐的浓度来促进溶解,但是盐浓度过高易导致后面等
电聚焦的失败,所以每种方式的选择都存在利弊,需要
根据实际情况多次摸索找到合适溶解方案。
因溶解蛋白样品的水化液中含有尿素等干扰蛋白
样品含量测定,直接用紫外吸收 A280法测定会出现假
阳性结果,前期实验时,常出现机器测定结果含量较高
的现象,但是双向电泳分离后,图像没有任何点的痕
迹,图 1 就是其中一例。所以在建立双向电泳技术体
系之初,仅仅靠机器检测蛋白含量是不够的,需和
SDS-PAGE单向电泳检测结合起来才能确保样品蛋白
含量足够并且杂质较少。
由图 2 可以看出,向日葵种子蛋白条带有 11 条,
其中最亮的 2 条条带分布在 43 000 ~ 31 000 Da 和
20 100 ~ 14 400 Da 之间,标准蛋白每条带的含量约为
2 μg,从亮度进行估计,向日葵种子的含量达到机器测
定的预定值,并且没有拖尾现象和严重的背景干扰,说
明提取的蛋白纯度较高。在此次蛋白单向电泳中,大豆
蛋白有 12条带,比向日葵要多,并且亮度也比向日葵要
亮,水稻蛋白有 8 条带,比向日葵要少,亮度也更弱,说
明同样质量种子样品中大豆蛋白含量比向日葵要多,向
日葵种子比水稻种子要多。除此之外,该蛋白提取方法
不仅适合向日葵、大豆和水稻等蛋白的提取,还适用于
·59·
问题探讨 夏江勇 等:向日葵种子蛋白双向电泳技术体系建立的初步研究
其它植物蛋白的提取,这为后期进行多种植物间蛋白质
组的比较研究打下技术基础。
表 1 向日葵种子蛋白与其他种子蛋白含量测定结果
样品
测定项目
浓度(μ g /μ L) A260 /A280
向日葵种子 13. 359 0. 53
大豆种子 6. 382 1. 10
水稻种子 39. 221 1. 21
图 1 向日葵样品中蛋白含量不足时得到的双向电泳图
(A为向日葵种子,B为大豆种子,C为水稻种子)
图 2 向日葵种子和其他种子蛋白单向电泳检测结果
2. 2 不同上样量获得的双向电泳结果的比较
由图 3 可看出,虽然图谱上存在少量瑕疵,但是蛋
白点清晰可见,并且为数不少,这已基本达到向日葵种
子蛋白分离效果。另外,通过上样量是 1 mg(图 3),与
上样量是 2 mg(图 4)蛋白质双向电泳图相互比较可
知,上样量的多少会直接影响向日葵蛋白点的获取,当
上样量过大时,会导致高丰度蛋白将其他蛋白覆盖,从
而使胶图呈现一片蓝色而达不到分辨效果,当上样量
过小时,又会导致低丰度蛋白丢失。因此,在进行双向
电泳实验过程中,每个环节都是决定最终结果好坏的
关键因素,所以做好每个环节的优化都是很重要的。
一般地,蛋白点数多、背景少、点不拖尾、分辨率高、重
复性高的二向图谱是较优图谱,另外为了得到差异蛋
白点,选择合适的胶条长度和 pH 值以得到特异蛋白
点的图谱也是非常重要的,这些都取决于实验者不同
的要求,但是不管需要得到怎样的图谱,都要求实验者
具有丰富的操作经验和细心的实验态度,只有这样才
能保证实验的成功进行。
图 3 上样量为 1 mg的向日葵种子的双向电泳图
图 4 上样量为 2 mg的向日葵种子的双向电泳图
·69·
第 33 卷 第 12 期 2014 年 12 月 种 子 (Seed) Vol. 33 No. 12 Dec. 2014
图 5 上样量为 1 mg的向日葵双向电泳图谱经 Image Master 2 Dplatinum 5. 0 软件分析后得到的三维 2-DE图
2. 3 上样量为 1 mg的向日葵双向电泳图谱软件分析
结果
通过自动检测和手动剔除,共得出 130 个蛋白质
点。由图 5 可以看出,在低分子量区存在较多高丰度
蛋白,虽然在高分子量区也存在一些高丰度蛋白,但这
些高丰度的蛋白点却不易分辨。在偏碱性区不存在高
分子量蛋白,大部分蛋白都分布在 pH = 7 左右,说明
大部分蛋白为中性蛋白。从向日葵种子双向电泳图中
选取 4 个点做三维展示(图 5),可以直观地看出各个
点的含量或者强度差异。据 Herbert 等[6]实验研究可
知,挖取的向日葵种子双向电泳凝胶中的相关蛋白点
进行质谱分析后得到的蛋白是脱水蛋白、白蛋白、种子
贮藏蛋白、胞质磷酸甘油酸激酶等。其中,脱水蛋白参
与脱水或者低温环境压力下的应答,白蛋白参与细胞
运输,种子贮藏蛋白被认为是主要的贮藏蛋白,胞质磷
酸甘油酸激酶参与能量代谢过程,特别是碳水化合物
代谢。
3 结 论
本实验主要以向日葵种子为材料,研究了植物全
蛋白的提取方法。上海生工试剂盒提取能得到较优结
果,然后结合紫外吸收 A280法和单向电泳法检测蛋白
含量,最后经初步的双向电泳分析,共得到 130 个清晰
的蛋白质点,这为后期进一步研究向日葵蛋白质组学
打下了基础。
参考文献:
[1]王洪预.向日葵 CMS 比较蛋白质组学分析[D]. 吉林大学
硕士学位论文,2008.
[2]董贵俊,张卫东,刘公社.向日葵种子蛋白质的微量提取和
双向电泳技术研究[J]. 中国油料作物学报,2004,26(1):
22 - 25.
[3]刘海学,张冬梅,丁学稳,等. NaCl 胁迫对向日葵种子萌发
的影响[J].种子,2011,30(11):24 - 27.
[4]刘丽杰,于景华,唐中华,等.非模式植物蛋白质组学研究进
展[J].广西植物,2007,27(2) :217 - 223.
[5]Tal Isaacson,Cynthia MB Damasceno,Ramu S Saravanan,et
al. Sample extraction techniques for enhanced proteomic analy-
sis of plant tissues[J]. NATURE PROTOCOLS,2006,1(2) :
769 - 774.
[6]Herbert de Sousa Barbosa,Daiane Leticia Quirino de Souza,
Héctor Henrique Ferreira Koolen,et al. Sample preparation
focusing on plant proteomics:extraction,evaluation and identi-
fication of proteins from sunflower seeds[J]. The Royal Society
of Chemistry,Anal. Methods,2013(5) :116 - 123.
[7]张云贵,刘祥云,李天俊,等. 生物化学实验指导第四版
[M].中国农业出版社,2007:55 - 56,74 - 77.
[8]GE Healthcare. 2-D Electrophoresis Principles and Methods
[M]. 2004,9.
[9]Giovanni Candiano,Maurizio Bruschi ect. Blue silver:A very
sensitive colloidal Coomassie G-250 staining for proteome
analysis[J]. Electrophoresis,2004(25):1 327 - 1 333.
·79·
问题探讨 夏江勇 等:向日葵种子蛋白双向电泳技术体系建立的初步研究