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桃根癌病菌拮抗放线菌抑菌活性物质的分离及其初步鉴定



全 文 :书桃根癌病菌拮抗放线菌抑菌活性物质的分离及其初步鉴定
季敬霖,刘志民,马焕普* (北京农学院植物科学技术学院,北京 102206)
摘要 [目的]分离并初步鉴定从桃树高发根癌病土壤中获得的拮抗线菌 G19菌株的抑菌活性物质。[方法]采用蛋白沉淀法对拮抗放
线菌 G19菌株的抑菌活性物质进行粗提,利用高效液相色谱仪、中压制备色谱仪对其进行分离、纯化,应用 MALDI - TOFMS法进行分子
量的测定,最后通过化学显色反应进行相关官能团的验证。[结果]经分离纯化后拮抗放线菌 G19 的抑菌物质被抨击出 7 个肽段,是分
子量范围为 900 ~1 300 Da,同时推断其含有一个 Cys并携带 H2O,Na
+;官能团显色反应验证该物质为多肽且含有糖基。[结论]研究结
果为拮抗放线菌 G19菌株的抑菌物质结构的最终确定奠定了基础。
关键词 桃树根癌病;放线菌;抑菌肽
中图分类号 S436. 621. 1 文献标识码 A 文章编号 0517 -6611(2011)15 -09013 -04
Isolation and Preliminary Identification of Antimicrobial Peptides Produced by Antagonistic Actinomycetes against Peach Crown Gall
(Agrobacterium tumefaciens)
JI Jing-lin et al (Department of Plant Science and Technology,Beijing University of Agriculture,Beijing 102206)
Abstract [Objective]The paper was to isolate and preliminarily identify the antimicrobial active substances of antagonistic actinomycetes
strain G19 obtained from the soil highly affected by peach crown gall (Agrobacterium tumefaciens). [Method]The antimicrobial substances of
antagonistic actinomycetes strain G19 were extracted using protein precipitation method,then isolated and purified using high performance liq-
uid chromatography and middle-pressure chromatography. Its molecular weight was determined by MALDI-TOFMS method,and the related
functional groups were verified through chemical color reaction. [Result] Seven peptide portions were produced from the antimicrobial sub-
stances of antagonistic actinomycetes strain G19 after isolation and purification with the molecular weights of 900 - 1 300 Da. It could be also
inferred that it contained Cys,and carried with H2O and Na
+ . Color reaction of functional groups verified that the substance was polypeptide
containing glycosyl. [Conclusion]The result provided basis for the final definition of the structure of antimicrobial substances in antagonistic
actinomycetes strain G19.
Key words Peach crown gall;Actinomycetes;Antimicrobial peptides
基金项目 北京市教委资助项目(KM200910020001) ;北京市自然科学
基金(5112010)。
作者简介 季敬霖(1986 -) ,女,安徽巢湖人,硕士研究生,研究方向:
果品品质生理与生态安全。* 通讯作者,教授,硕士生导
师,从事果品品质生理与生态安全研究工作。
收稿日期 2011-03-22
桃树根癌病是由特殊功能的根癌土壤杆菌(Agrobacteri-
um tumefaciens)以自然转基因引起的基因病害,是一种难以
防治的土传细菌病害[1 -2]。我国果树根癌病发生普遍,造成
的经济损失也很大。在北方地区约有 13个省市均有不同程
度的病发,辽宁、内蒙古、河北、山东、北京等地一些葡萄病害
较严重,发病率为 30% ~ 100%,减产 30%,甚至毁园、
绝收[3]。
果树根癌病的发病诱因多种多样,除了土壤质地、温度、
根系伤口外,重茬也是一个重要诱因。从再植的土壤中种植
桃树,可导致多数植株发生根癌病。李仁芳等结合多年的生
产实践,认为在已使用 1 ~2年的育苗地进行再育苗,其根癌
病发生率明显增加,特别是桃树的根癌病发生率可高达 90%
以上[4];刘嘉彬等在多年的生产实践中,发现前茬桃树的根
系在多年的生长发育中,分泌大量的代谢物质,如扁桃苷,经
土壤微生物的分解产生有毒物质,对新栽幼树根系产生毒害
作用,从而造成重茬病的发生[5]。后人证实土壤微生物分解
扁桃苷产生的有毒物质是氢氰酸(HCN) ,其对桃树的生长产
生毒害作用[6 -7]。
目前对根癌病最有效的防治措施是生物防治。1980 年
Kerr等[8]发现 K84菌株对桃树等核果类果树及其近源花卉
的根癌病具有良好防效。1998 年王慧敏[9]等发现 K84 可有
效地防治大樱桃根癌病。2004 年王关林等[10]发现WJK84-1
菌株及其产生的 P-2001 细菌素均对樱桃冠瘿瘤病原菌 C58
病原菌具有明显的抑制作用。李金云等[11]研究发现葡萄土
壤杆菌 E26产生的土壤杆菌素不仅对葡萄根癌病菌 K308具
有明显的抑制作用,而且对茄科青枯病菌、番茄疮痂病菌、水
稻白叶枯病菌、棉花细菌性角斑病菌和白菜软腐病菌也有一
定的抑制作用。Hammami 等采用(NH4)2SO4 沉淀法从枯草
芽孢杆菌 14B 中提取的抑菌肽可抑制根癌病[11]。然而,此
类生防菌能否存活于含有高毒物质(HCN)的土壤中尚不得
而知。笔者从桃高发根癌病的再植土中筛出了具有耐氰效
应的生防放线菌菌株 G19,该菌株的发酵液对桃根癌土壤杆
菌有良好的抑菌效果,且性质稳定,经 16S rRNA鉴定与链霉
菌属有 97%的相似性[13]。因而,在此基础上分离、鉴定该放
线菌菌株的抑菌物质意义重大。
1 材料与方法
1. 1 材料 致病菌株:桃根癌土壤菌(Agrobacterium tumefa-
ciens) ,购于中国农业大学;供试生防菌株:从桃高发根癌病
的土壤中分离出的具有抗氰效应的放线菌 G19。
1. 2 生防放线菌抑菌活性物质的粗提 采用硫酸铵沉淀
法。将放线菌菌株置在高氏液体培养基中,在 28 ℃下 180
r /min震荡培养 8 d,其发酵液离心(10 000 r /min,15 min) ,将
上清液用无菌滤膜过滤,然后加入(NH4)2SO4 至 60%饱和
度,静置 2 h,10 000 r /min离心 10 min,取沉淀于截流分子量
为 8 000 ~14 000 Da的透析袋中,0. 1 mol /L磷酸缓冲液(pH
值 7. 0)中透析过夜,低温离心(10 000 r /min,10 min) ,弃不
溶物,上清冷冻干燥即为抑菌活性物质粗提物。
1. 3 抑菌活性检测 在涂好根癌土壤杆菌的平板上,用灭
过菌的打孔器围绕平皿周围打孔,分别注入 100 μl放线菌原
发酵液、100 μl 放线菌上清液、100 μl(NH4)2SO4 沉淀后的上
清液、100 μl粗提物、100 μl无菌水,以磷酸缓冲液做对照,28
安徽农业科学,Journal of Anhui Agri. Sci. 2011,39(15):9013 - 9016 责任编辑 高晓余 责任校对 况玲玲
DOI:10.13989/j.cnki.0517-6611.2011.15.175
℃恒温培养 12 h,观察抑菌圈直径大小。
1. 4 生防放线菌抑菌活性物质的纯化 抑菌活性物质粗
提物分别经过高效液相色谱和制备色谱分离纯化。样品经
0. 22 μm微孔滤膜过滤,流动相均为乙腈∶水 = 3∶7(V∶V) ;268
nm 紫外检测,柱温 25 ℃。高效液相色谱的色谱柱为 zor-
boxXDB-C18(4. 6 mm × 150 mm,5 μm) ,流速为 1. 0 ml /min,
进样量为 10 μl;制备色谱质谱柱为 zorboxXDB-C18(4. 6 mm
×250 mm,20 μm) ,流速为 10 ml /min,进样量为 200 μl。经
制备色谱后,收集冷冻干燥后的粉状样品备用。
1. 5 生防放线菌抑菌活性物质的鉴定
1. 5. 1 生防放线菌抑菌活性物质分子量的确定。取适量样
品用少量基质[乙腈∶水 =3∶7 (V∶V) ]溶解,取 0. 5 μl该水溶
物于 MALDI (matrix-assisted laser desorption ionisation)目标
板上,等风干后进行 MS/MS检测。得到该样品的分子量后,
在 CNBI数据库中进行 Blast比对。
1. 5. 2 生防放线菌抑菌活性物质相关官能团的确定。
1. 5. 2. 1 氨基酸、蛋白质性质确定。称取 0. 1 g样品粉末,
用水溶解配成质量分数为 1%为测试样品。取 1 ml 该测试
样品于试管中,加入 1%茚三酮 2 ~3滴,沸水中 10 ~ 15 min,
观察颜色变化。分别以 0. 1%牛血清蛋白和无菌水作对照。
1. 5. 2. 2 糖类性质确定。按“1. 5. 2. 1”中方法制备测试样
品,在 1 ml测试样品中加入莫里许试剂(2. 5 g α-萘酚于 50
ml乙醇中,用乙醇稀释至 100 ml)2滴。混匀后将试管倾斜,
沿管壁徐徐注入浓 H2SO4 约 1 ml。分层后,静置,观察颜色
变化。分别以 0. 1%葡萄糖和无菌水作对照。
1. 5. 2. 3 酚类性质确定。按“1. 5. 2. 1”中方法制备测试样
品,在 0. 5 ml测试样品中加入 1% FeCl3 溶液 2 ~ 3 滴,观察
颜色变化。分别以 0. 1%水杨酸和无菌水作对照。
2 结果与分析
2. 1 抑菌活性物质的提取、纯化及活性测定 抑菌活性物
质粗提物进行高效液相色谱分析时,在保留时间为 1. 244
min时出现 1个主峰,保留时间为 1. 625、2. 069 min时,出现
2个极小的峰(图 1-A) ;制备色谱中,1. 244 min出现的主峰
呈现出 1个单峰,对其进行收集(图 1-B)。抑菌物质的活性
测定结果表明,G19原发酵液(图 2-A)、放线菌上清液(图 2-
B)、粗提物(图 2-C)及(NH4)2SO4 沉淀后上清液(图 2-E)对
根癌土壤杆菌均有一定的抑制作用;而 PBS缓冲液(图 2-D)
及无菌水(图 2-F)没有抑制作用。
注:A为 268 nm高效液相色谱图,流速 1. 0 ml /min;B为流速为 10 ml /min时,其他条件相同下,主峰的中压制备色谱图。
Note:A represents high performance liquid chromatogram at 268 nm with flow speed of 1. 0 ml /min;B represents the chromatogram with main maximum
in the middle when flow speed is 10 ml /min and the other conditions are the same.
图 1 放线菌 G19菌株抑菌活性物质的色谱图
Fig. 1 Chromatogram of antimicrobial substances of actinomycetes strain G19
注:A为 G19原发酵液,B 为上清液,C 为粗提物,D 为 PBS 缓冲
液,E为 60%硫酸铵沉淀后上清液,F为灭菌水。
Note:A. original fermentation broth of G19;B. supernatant;C. crude
extract;D. PBS buffer;E. supernatant after precipitation of 60%
ammonium sulfate;F. sterile water.
图 2 放线菌 G19菌株的抑菌活性测定
Fig. 2 Antimicrobial activity determination of actinomycetes
strain G19
2. 2 生防放线菌抑菌活性物质的鉴定
2. 2. 1 生防放线菌抑菌活性物质分子量的确定。制备色谱
纯化的样品经 MALDI-TOFMS 激光抨击测定其分子量。如
图 3所示,共 7个肽段,分子量范围为 900 ~1 300 Da,其中分
图 3 放线菌 G19菌株MALDI-TOFMS质量纹图谱
Fig. 3 MALDI-TOFMS chromatogram of actinomycetes strain
G19
4109 安徽农业科学 2011 年
子量为 1 078. 5、1 096. 5、1 118. 5 Da 为主要部分。
1 078. 5 Da 与 1 096. 5 Da 间相差 18 Da,应该间隔为
H2O;1 096. 5 Da和 1 118. 5 Da 应该相差 Na
+,因为 MS/MS
间存在 + 1 的差异。同理 1 037 Da 和 1 199 Da 间相差 162
Da,推断之间存在 1 个葡萄糖残基,1 096 Da 和 1 199 Da 间
相差 103 Da,表明其可能结合 1个 Cys。Blast比对结果显示
其分值较低,数据库里没有匹配的氨基酸序列。
2. 2. 2 生防放线菌抑菌活性物质的相关官能团的确定。如
图 4所示,抑菌活性物质与茚三酮反应呈阳性,可知其含有
蛋白质,多肽或氨基酸类结构;且与 α-萘酚反应也呈阳性,表
明其分子结构中含有糖类基团(图 5) ;但在与 1% FeCl3 反应
中呈现阴性,说明其分子结构中不含酚类基团(图 6)。
注:A.牛血清蛋白;B.纯化的抑菌肽;C.灭菌水。
Note:A. Bovine serum albumin;B. Purified antimicrobial peptide;C.
Sterile water.
图 4 抑菌肽与茚三酮反应
Fig. 4 Reaction between antimicrobial peptide and ninhydrin
注:A.灭菌水;B.纯化的抑菌肽;C.葡萄糖。
Note:A. Sterile water;B. Purified antimicrobial peptide;C. Glucose.
图 5 抑菌肽与 α-萘酚反应
Fig. 5 Reaction between antimicrobial peptide and α-naphhthol
3 讨论
在植物病害生物防治中生防菌为链霉菌属(Streptomy-
ces)及其相关类群的研究较多。张永春从土壤中分离得到的
放线菌菌种 A4 和 A24 对烟草黑胫病具有较好的防效[14]。
胡俊等从向日葵菌核病土壤中分离纯化出 8 株对向日葵核
盘菌具有拮抗作用的放线菌菌株[15]。陈洁从土壤中分离纯
化得到的放线菌 K5对棉花枯萎病菌具有很强的拮抗作用,
对水稻稻瘟病菌也有一定的抑制作用[16]。张璐等的研究表
明,放线菌 SG-126防治黄瓜枯萎病的效果为42. 86%[17]。涂
注:A.灭菌水;B.纯化的抑菌肽;C.水杨酸。
Note:A. Sterile water;B. Purified antimicrobial peptide;C. Salecyl-
ic acid.
图 6 抑菌肽与三氯化铁反应
Fig. 6 Reaction between antimicrobial peptide and ferric chlo-
ride
璇等研究发现,在盆栽条件下 0108 和 0110 拮抗放线菌都能
通过影响辣椒根系微生物数量控制辣椒疫霉菌,且对辣椒根
系生长有显著促进作用[18]。原犇犇等筛选出的 8 株放线菌
对杨树腐烂病原菌(Valsa sordida)有较强拮抗作用[19]。姚敏
等通过对峙试验筛选出 26株对番茄叶霉病菌和番茄早疫病
菌、番茹灰霉病菌有拮抗作用的内生放线菌菌株[20]。展丽
然等从土壤中筛选的放线菌菌株 Z-6、Z-8、Z-23、Z-42 和 5-1
对苹果轮纹病菌具有一定的拮抗作用[21]。刘洪亮等从土壤
样品分离得到的 6 株生防放线菌菌株对玉米丝黑穗病有拮
抗作用[22]。李增波等从青藏高原的土壤样品中分离到 1 株
生防放线菌 AL-04,产生的抑菌物质对多种植物病原真菌和
细菌有较强的抑制作用[23]。汪倬等从济南地区 10多种作物
田采集的 20份土样中,筛选出 3 个对黄瓜灰霉病菌有明显
拮抗作用的放线菌菌株[24]。
对于抑菌肽的提取,普遍采用硫酸铵沉淀法。韩冬梅等
用饱和度 30%的硫酸铵沉淀和超滤离心的方法从枯草芽孢
杆菌 BSn5发酵上清中分离纯化 Apn5蛋白[25]。张玉芬等用
饱和度 50%的硫酸铵沉淀法从番茄灰霉病拮抗菌 B26 中提
取了抑菌蛋白[26]。李永刚等分别用不同梯度的硫酸铵对芽
孢杆菌 L1发酵液进行抑菌蛋白提取,且抑菌蛋白对水稻稻
瘟病有抑菌作用的硫酸铵饱和度为 50% ~60%,而对水稻纹
枯病则在 60% ~70%[27]。
然而,对于抑菌蛋白的纯化方法,各有不同。张玉芬等
采用 DEAE-纤维素离子交换层析法[26];韩冬梅等采用不同
分子截留量的透析袋进行纯化[25];吕淑霞等对乳酸链球菌
素的纯化采用 Sephadex G-50 凝胶柱层析法,280 nm 检
测[28]。对于采用色谱柱的也有报道。邱宏端等采用 CM-
Sephadex C-50色谱柱对耐盐红螺菌拮抗物质进行纯化;醋酸
缓冲液洗脱,流速 0. 3 ml /min,紫外 280 nm检测[29]。陈贝等
应用 DEAE-650柱纯化抗真菌蛋白 MAP13,2 mmol /L的磷酸
缓冲液洗脱,流速 2. 0 ml /min,紫外 280 nm 检测进行纯
化[30]。笔者采用的正是硫酸铵沉淀法提取抑菌蛋白,是 zor-
boxXDB-C18色谱柱纯化,紫外 268 nm 检测,然后用中压制
备色谱进行纯化物的制备。
510939卷 15期 季敬霖等 桃根癌病菌拮抗放线菌抑菌活性物质的分离及其初步鉴定
4 结论
试验通过硫酸铵蛋白沉淀法得到拮抗放线菌 G19 的抑
菌物质粗提物,利用高效液相色谱仪及中压制备色谱仪进行
分离纯化,利用 MALDI-TOFMS、一系列化学反应确定其结构
性质。可判断拮抗放线菌 G19 的抑菌物质是一种分子量范
围为 900 ~1 300 Da的含有糖基的抑菌肽,同时推断其含有
一个 Cys并携带 H2O,Na
+,且其官能团显色反应亦验证该物
质为多肽且含有糖基。
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94 -96.
GB/T 7714 -2005 题 名
题名包括书名、刊名、报纸名、专利题名、科技报告名、标准文献名、学位论文名、析出的文献名等。题名按著录信息源所
载的内容著录。
(1)同一责任者的多个合订题名,著录前 3 个合订题名。对于不同责任者的多个合订题名,可以只著录第一个或处于显
要位置的合订题名。在参考文献中不著录并列题名。
示例 1:自己的园地;雨天的书(原题:自己的园地 雨天的书 周作人著)
示例 2:美国十二名人传略(原题:美国十二名人传略 Twelve Famous Americans)
(2)文献类型标志依据 GB /T 3469《文献类型与文献载体代码》著录;对于电子文献不仅要著录文献类型标志,而且要著
录文献载体标志。
(3)其他题名信息可根据文献外部特征的揭示情况决定取舍,包括副题名,说明题名文字,多卷书的分卷书名、卷次、册
次等。
示例 1:地壳运动假说:从大陆漂移到板块构造
示例 2:中国科学:D辑 地球科学
6109 安徽农业科学 2011 年