免费文献传递   相关文献

豆梨磷转运蛋白质基因(PcPht1)的克隆、表达及启动子分析



全 文 :江苏农业学报(Jiangsu J. of Agr. Sci.) ,2013,29(4) :842 ~ 850
h ttp:/ /w ww. jsn y x b . c o m
李 慧,丛 郁,常有宏,等. 豆梨磷转运蛋白质基因(PcPht1)的克隆、表达及启动子分析[J]. 江苏农业学报,2013,29(4) :
842-850.
doi:10. 3969 / j. issn. 1000-4440. 2013. 04. 027
豆梨磷转运蛋白质基因(PcPht1)的克隆、表达及启动
子分析
李 慧1,2, 丛 郁3, 常有宏1,2, 蔺 经1, 盛宝龙1
(1.江苏省农业科学院园艺研究所,江苏 南京 210014;2.国家农业科技华东(江苏)创新中心———高效园艺作物遗传改良实
验室,江苏 南京 210014;3.中国科学院南京土壤研究所土壤与农业可持续发展国家重点实验室,江苏 南京 210008)
收稿日期:2013-01-24
基金项目:国家自然科学基金项目(31101529) ;江苏省农业科技自
主创新基金项目[CX(12)5033]
作者简介:李 慧(1979-) ,女,广西贵港人,博士,副研究员,主要从
事果树分子生物学研究。(E-mail)lihui7904@ 163. com
通讯作者:常有宏,(E-mail)cyh@ jaas. ac. cn
摘要: 为明确梨砧木豆梨(Pyrus calleryana Dcne.)磷转运蛋白质基因的序列特点和表达模式,采用同源克
隆、RACE 技术和染色体步移法克隆获得 1 个 Pht 基因 PcPht1 的 cDNA、DNA 及启动子序列,并利用 RT-PCR 检测
在不同供磷水平下该基因在豆梨幼苗中的表达情况。结果表明 PcPht1 cDNA 序列编码区长 1 617 bp,编码 1 个由
538 个氨基酸组成的蛋白质,其相对分子质量为 5. 908×104。该基因编码区 DNA 序列没有内含子,其启动子除了
具有 TATA /CAAT-box外还包含防御与胁迫响应元件、光响应元件和茉莉酸甲酯响应顺式作用元件。PcPht1 所编
码蛋白质由 12 个疏水的跨膜区域组成,包括 H2PO4
- /nH+共运体、糖转运体和 MFS通用底物转运体 3 个 Pht1 蛋白
质特征结构域。PcPht1 与大豆 GmPht1;7 和橡胶 HbPht1 间有较高的一致性(分别为 88. 0%和 87. 0%) ;与拟南芥
Pht1 蛋白质家族处于系统进化树的同一分支,并与 AtPht1;4 和 AtPht1;7 的亲缘关系最近。正常供磷条件下,
PcPht1 基因主要在根中表达,低磷时该基因的表达上调,提高供磷浓度其表达受到抑制,说明 PcPht1 的表达受环
境磷浓度调控。
关键词: 豆梨;磷转运蛋白质基因;分离;启动子;表达
中图分类号: S661. 2 文献标识码: A 文章编号: 1000-4440(2013)04-0842-09
Cloning,expression and promoter analysis of a phosphate transporter
protein gene PcPht1 from Pyrus calleryana Dcne.
LI Hui1,2, CONG Yu3, CHANG You-hong1,2, LIN Jing1, SHENG Bao-long1
(1. Institute of Horticulture,Jiangsu Academy of Agricultural Sciences,Nanjing 210014,China;2. Efficient Horticulture Crop Genetic Improvement Labo-
ratory,National Agricultural Science and Technology Jiangsu Innovative Center,Nanjing 210014,China;3. State Key Laboratory of Soil and Sustainable
Agriculture,Institute of Soil Science,Chinese Academy of Sciences,Nanjing 210008,China)
Abstract: This experiment was conducted to investigate the sequence characteristics and expression pattern of phos-
phate transporter protein (Pht)gene in bean pear (Pyrus calleryana Dcne.). The cDNA,DNA and promoter sequences of
a PcPht1 gene were isolated from bean pear using homologous cloning,rapid amplification of cDNA ends (RACE)and ge-
nome walking method. At the same time,its expression in bean pear seedlings at different phosphate levels was analyzed by
semi-quantitative reverse transcription polymerase chain
reaction. PcPht1 cDNA coding region length is 1 617 bp,
which contains an open reading frame encoding a 5. 908×
104 protein consisting of 538 amino acids. Its DNA se-
quence has no intron. In addition to the TATA /CAAT-
box,its promoter contains some specific regulatory ele-
ments such as cis-acting element involved in defense and
248
stress responsiveness,light responsive element and cis-acting regulatory element involved in the MeJA-responsiveness.
Twelve hydrophobic transmembrane regions constitute PcPht1 protein which has three feature domains,H2PO4
- /nH+ trans-
porter,sugar transporter and the major facilitator superfamily (MFS)general substrate transporter. PcPht1 shared high
similarities (88. 0% and 87. 0%)with Glycine max GmPht1;7 and Hevea brasiliensis HbPht1,respectively. PcPht1 and
Arabidopsis Pht1 proteins belong to the same branch in Pht phylogenetic tree. PcPht1 has the closest relationship with At-
Pht1;4 and AtPht1;7. Semi-quantitative RT-PCR results revealed that PcPht1 gene was expressed mainly in root under
normal inorganic phosphate (Pi)conditions. Its expression was increased at low Pi levels,and was inhibited at high Pi lev-
el,suggesting PcPht1 expression was regulated by environmental phosphorus concentration.
Key words: Pyrus calleryana Dcne.;phosphate transport protein gene;isolation;expression;promoter
磷是植物生命过程中的重要营养元素,构成植
物细胞干重的 5%,它作为能量转移的物质,在活化
体内蛋白质,调控植物体的整个代谢过程,协调生长
和抗逆等方面发挥重要作用[1-3]。植物主要以无机
磷(Pi)形式吸收土壤中的磷,而土壤对磷的强烈吸
附使土壤溶液中植物可吸收的可溶性无机磷含量非
常低,通常小于 10 μmol /L[4]。因此,植物能否高效
吸收磷对植物生长有着至关重要的影响。植物对磷
的吸收是一个逆浓度的主动运输过程,主要依靠根
系细胞膜上的磷转运蛋白质家族来完成[5],细胞膜
上磷转运蛋白质的数量和其对磷酸根(H2PO4
-)离
子的亲和性决定植物磷吸收效率。植物磷转运蛋白
质分为 Pht1、Pht2、Pht3、Pho1 和 Pho2 5 大家族,其
中 Pht1 基因家族属于 H2PO4
- / nH+共运体,为高亲
和性的磷转运蛋白质,位于根系细胞膜上,通过利用
质膜上的氢离子浓度梯度来驱动植物对土壤溶液中
可溶性磷的吸收[6-8]。
梨树生产普遍采取砧木嫁接优良品种的方式,
而树体生长发育所需的磷主要从根系中吸收,因此,
研究砧木吸收土壤磷营养的分子机制,挖掘控制该
过程的功能基因,有着重要的实践意义。前人研究
结果表明,Pht1;1 基因的缺失极显著地削弱了植株
吸收磷酸盐的能力[6],超表达 Pht1 基因家族成员可
以显著提高受体植物对无机磷的吸收能力[9-10]。鉴
于 Pht1 基因家族在植物磷吸收过程的重要作用,研
究梨砧木 Pht1 基因序列特点和表达调控方式有助
于通过生物技术手段来提高梨树的磷吸收效率,但
目前在蔷薇科植物中未见该类基因的相关报道,因
此,本研究以梨砧木豆梨为研究对象,开展 Pht1 基
因分离及表达方面的研究。根据植物 Pht1 基因的
保守性氨基酸序列设计简并引物,利用同源克隆、
RACE 技术和染色体步移法克隆 Pht1 基因 cDNA、
DNA及启动子序列,并研究不同供磷条件下该基因
的表达情况,为有针对性地解析其在豆梨磷吸收过
程中所起的生理功能提供理论依据。
1 材料和方法
1. 1 供试材料
2009 年 11 月于江苏省农业科学院砂梨种质资
源圃收集豆梨成熟种子,湿砂拌种贮藏在海尔冷藏
柜(4 ℃)中进行层积处理。2010 年 3 月将种子取
出,播种于光照培养箱盆钵内(以石英砂为基质) ,
培养温度(25±0. 5)℃,光照周期 14 h /10 h(光照 /
黑暗) ,光照度 3 000 lx。生长期间常规管理,并用
Hoagland完全营养液(H2PO4
-浓度为 1 mmol /L)浇
灌,待幼苗长至 4 片真叶时,选择长势一致的植株于
去离子水中饥饿 24 h 后,分别置于 H2PO4
-浓度为
0. 1 mmol /L、1. 0 mmol /L、10. 0 mmol /L 的 Hoag-
land营养液中处理 24 h,收获不同处理的豆梨叶片
与根,保存于-70 ℃冰箱待用。
1. 2 试验方法
1. 2. 1 PcPht1 基因全长的克隆
1. 2. 1. 1 RNA 的提取和 cDNA 第一链的合成 取
0. 1 mmol /L H2PO4
-处理 24 h 的豆梨根,用 RNA-
plant plus 植物总 RNA 提取试剂(TIANGEN 公司产
品)提取总 RNA,经 DNase I (无 RNA 酶,TIANGEN
公司产品)消化后取 2 μg 总 RNA 用于 cDNA 第一
链的合成(TIANScript cDNA 第一链合成试剂盒,
TIANGEN公司产品) ,用 RNase A(无 DNA 酶和蛋
白酶,GenStar公司产品)消化 cDNA产物。
1. 2. 1. 2 豆梨 PcPht1 基因核心片段的扩增 根据
GenBank核酸数据库中不同植物 Pht1 基因保守氨
基酸序列 VLNALDV 和 AEIFPAR,设计简并引物
PcPht1-S1 (5-GTGCTNAATGCACTNGATGT-3)和
PcPht1-F1 (5-CCTDGCHGGGAAAATCTCNGC-3) ,
以 0. 1 mmol /L H2PO4
-处理 24 h的豆梨根 cDNA 为
348李 慧等:豆梨磷转运蛋白质基因(PcPht1)的克隆、表达及启动子分析
模板,用 Taq Plus DNA Polymerase(TIANGEN 公司
产品)扩增豆梨 PcPht1 基因核心片段。反应参数:
94 ℃ 5 min;94 ℃ 30 s,50 ℃ 30 s,72 ℃ 2 min,30
个循环;72 ℃ 10 min。
1. 2. 1. 3 3端和 5端序列的获得 采用 Invitrogen
公司 3 /5RACE System(Ver. 2. 0)试剂盒克隆基因
的末端序列,根据获得的基因核心片段设计 3 /5
基因特异引物。用两条正向嵌套引物 PcPht1-3-1
(5-TTGAAGCAGAGCCGCAGAAG-3)和 PcPht1-3-2
(5-TGGACTCACAAGGACAACCG-3) ,分别与通用
引物 3 AUAP(5-GGCCACGCGTCGACTAGTAC-3)
进行巢式 PCR扩增。第 1 轮 PCR产物稀释 10 倍作
为模板进行第 2 轮巢式扩增。5端反转录特异引物
为 PcPht1-5-1 (5-CCAAGCAAGTGAAGTCCATG-
3) ,扩增特异引物为 PcPht1-5-2 (5-TCTGCG-
GCTCTGCTTCAATT-3)和 PcPht1-5-3 (5-AAGA-
CAGCGGCAATGAAAGC-3) ,分别与通用引物 5
AAP (5-GGCCACGCGTCGACTAGTACGGGIIGGGI-
IGGGIIG-3)和 5 AUAP (5-GGCCACGCGTCGAC-
TAGTAC-3)进行巢式 PCR扩增。
1. 2. 1. 4 PcPht1 基因 cDNA序列的获得 比对、拼
接豆梨 PcPht1 基因核心片段、3末端和 5末端 3 个
序列片段,获得豆梨 PcPht1 基因的全长 cDNA 序列
信息,并设计编码区引物 PcPht1-ORF-S1(3-ATG-
GCTAGAGAGCAATTACAGG-5)和 PcPht1-ORF-F1
(3-CTACACAACTGGAACTGTCCTG-5) ,用高保真
耐热 DNA 聚合酶(Pfu DNA Polymerase,TIANGEN
公司产品)进行扩增。反应参数:94 ℃ 5 min;94 ℃
1 min,50 ℃ 1 min,72 ℃ 3 min,30 个循环;72 ℃ 10
min。
1. 2. 1. 5 PcPht1 基因 DNA序列及启动子扩增 豆
梨总 DNA 提取采用 CTAB 法,采用编码区引物
PcPht1-ORF-S1 和 PcPht1-ORF-F1 扩增 DNA 序列,
反应参数同方法 1. 2. 1. 4。根据扩增出目的基因的
DNA序列设计扩增启动子的特异引物 SP1(5-
CAAAGACAGCGGCAATGAAAGCG-3)、 SP2 (5-
TCACCGCCAATACCAAACCCTAG-3)和 SP3 (5-
TCACCAAGCCAGCCAAAGAAGAG-3) ,按 照 Ge-
nome Walker Kit(TaKaRa 公司产品)原理和方法进
行染色体步移。
1. 2. 1. 6 目的片段的回收和克隆 扩增所得各轮
PCR特异产物按照琼脂糖凝胶回收试剂盒(TIAN-
GEN公司产品)的使用说明进行回收后,与 pGM-T
克隆载体(TIANGEN公司产品)连接,转化 DH5α感
受态细胞(TIANGEN 公司产品) ,并进行蓝白斑筛
选,挑取白斑接种于 3 ml SOC(含 100 μg /L氨苄青
霉素)液体培养基中,37 ℃ 200 r /min 振荡培养过
夜。取 1 μl菌液用 pGM-T重组菌落 PCR鉴定试剂
盒(TIANGEN 公司产品)进行 PCR 扩增鉴定,琼脂
糖凝胶电泳检测插入片段的大小。序列测定由上海
美吉生物医药科技有限公司完成。
1. 2. 2 PcPht1 基因序列分析 PcPht1 基因核苷酸
翻译采用 BioXM 软件,并使用 ProtParam tool(ht-
tp:/ /www. expasy. ch / tools /protparam. html)分析氨
基酸基本成分。蛋白质跨膜区和亚细胞定位预测分
别通过 TMpred (http:/ /www. ch. embnet. org / soft-
ware /TMPRED_form. html)和 PSORT(http:/ /psort.
ims. u-tokyo. ac. jp / form. html)完成。在 InterPro(ht-
tp:/ /www. ebi. ac. uk / InterProScan)上分析结构域。
PcPht1 基因氨基酸序列比对和系统进化树构建采
用 DNAMAN软件完成,所用 Pht 蛋白质序列来自
http:∥www. ncbi. nlm. nih. gov 和 http:/ /www. arabi-
dopsis. org。利用生物学数据库 PlantCARE(http:/ /
bioinformatics. psb. ugent. be /webtools /plantcare /ht-
ml /)进行启动子元件的预测分析。
1. 2. 3 PcPht1 基因表达研究 经 DNase I(无 RNA
酶,TIANGEN公司产品)消化后,取各处理样品的 2
g总 RNA 逆转录成 cDNA 第一链(TIANScript cD-
NA第一链合成试剂盒,TIANGEN 公司产品) ,用
RNase A(无 DNA酶和蛋白酶,GenStar公司产品)消
化 cDNA 产物。通过 PcPht1 基因的特异性引物
PcPht1-BD-S1(5-TTGAAGCAGAGCCGCAGAAG-3)
和 PcPht1-BD-F1(5-AGAAGTTGACCACACCCAGC-
3) ,用 2×HotMaster PCR MasterMix (TIANGEN公司
产品)进行半定量 RT-PCR。反应参数:94 ℃ 5 min;
94 ℃ 30 s,55 ℃ 30 s,72 ℃ 2 min,28 个循环;72 ℃
10 min。选用豆梨肌动蛋白质 Actin 基因为内参
照[11],在相同的条件下进行扩增,比较研究不同供
磷条件下 PcPht1 基因的表达情况。
2 结果与分析
2. 1 PcPht1 基因克隆
以 0. 1 mmol /L H2PO4
- 处理 24 h 的豆梨
根 cDNA 为模板,用 PcPht1-S1 和 PcPht1-F1 为引
448 江 苏 农 业 学 报 2013 年 第 29 卷 第 4 期
物,进行豆梨 Pht1 基因核心片段的 PCR 扩增,获得
与预期片段(1 275 bp)大小一致的条带(图 1) ;以
引物 PcPht1-3-1 和 PcPht1-3-2 分别与通用引物 3
AUAP 结合,对核心片段的 3末端进行巢式 PCR扩
增,得到 1 条 676 bp的片段(图 1) ;以引物 PcPht1-
5-2 和 PcPht1-5-3 分别与通用引物 5 AAP 和 5
AUAP 结合,对核心片段的 5末端进行巢式 PCR 扩
增,得到 1 条 518 bp的片段(图 1)。这 3 个片段依
次有一段重叠区域,证明它们为同一基因的不同位
置片段。用 DNAMAN 软件比对、拼接核心片段、3
末端和 5末端片段,获得 cDNA全长序列信息,并设
计编码区引物 PcPht1-ORF-S1 和 PcPht1-ORF-F1,
进行 RT-PCR扩增,获得 1 条 1 617 bp条带(图 1) ,
测序结果与拼接序列预测的编码区完全一致,将其
命名为 PcPht1 基因。
利用引物 PcPht1-ORF-S1 和 PcPht1-ORF-F1 对
豆梨基因组 DNA进行扩增,获得 1 条 1 617 bp条带
(图 1) ,测序结果与 cDNA 编码区序列完全一致。
利用 PcPht1 基因组 DNA 序列设计的特异引物
SP1、SP2 和 SP3 进行染色体步移,经过 3 轮巢式
PCR,获得 1 条 1 547 bp条带(图 1) ,测序后发现该
序列与 PcPht1 基因组 DNA 序列有一段重叠区域,
确认所得到的片段为 PcPht1 基因的上游启动子序
列。
A:PcPht1 核心片段;B:3RACE扩增产物;C:5RACE扩增产物;D:PcPht1 编码区 cDNA扩增产物;E:PcPht1 编码区 DNA 扩增产物;F:
PcPht1 启动子扩增产物;M1:DL2000TM DNA marker;M2:250 bp DNA ladder marker。
图 1 豆梨 PcPht1 基因的 PCR扩增结果
Fig. 1 The PCR amplification results of PcPht1 gene of Pyrus calleryana Dcne.
2. 2 PcPht1 基因序列特点
PcPht1 基因 cDNA 序列全长 1 865 bp,其中
编码区 1 617 bp,编码 1 个含有 538 个氨基酸残
基的蛋白质(图 2) ,预测的等电点(pI)为 8. 08,
估计的相对分子质量为 5 . 908 × 104,分子式
为 C2732H4159N679O733S26。PcPht1 基因编码区 DNA
序列与 cDNA序列完全一致,表明 PcPht1 基因无内
含子,符合植物 Pht1 基因家族特点。
利用 TMpred软件对 PcPht1 进行蛋白质跨膜区
分析,发现 PcPht1 由 12 个疏水的跨膜区域(TM)组
成,符合磷转运蛋白质的基本特征[12],每个跨膜结
构域由 17 ~ 25 个氨基酸残基组成螺旋,二级结构为
“6-环-6”结构,即包括 6 个 N 端的跨膜区以及 6 个
C端的跨膜区,中部(TM6 和 TM7 之间)由 1 个中央
亲水环(Hydrophilicloop)分隔,并且 PcPht1 蛋白质
的 N端、C端和中间的大环都分布在细胞质中(图
3)。PcPht1 蛋白质包括 H2PO4
- /nH+共运体、糖转
运体和 MFS 通用底物转运体 3 个结构域。通过在
线软件 PSORT 进行亚细胞定位预测,发现 PcPht1
蛋白质位于细胞质膜上的几率最大。
利用 DNAMAN 软件进行多重比对(Multiple a-
lignment) ,结果表明 PcPht1与大豆 GmPht1;7蛋白质
(FJ797407)和橡胶 HbPht1 蛋白质(HM015901)间有
较高的一致性(分别为 88. 0%和 87. 0%) (图 4)。磷
转运蛋白质 Pht家族系统进化树(图 5)显示,PcPht1
蛋白质与 Pht1 家族位于同一发育分支上,与拟南芥
的 AtPht1;4(NM_129452)、AtPht1;7(NM_115327)亲
缘关系最近,并与番茄 LePT1(AF022873)、马铃薯
StPT1(X98890)的亲缘关系较近。
总的来说,本研究所克隆 PcPht1 基因的氨基酸
序列特征表明了该基因属于植物高亲和性磷转运蛋
白质 Pht1 家族。
548李 慧等:豆梨磷转运蛋白质基因(PcPht1)的克隆、表达及启动子分析
* 代表终止密码子;N-糖基化位点用方框标注;蛋白激酶 C和酪蛋白激酶介导的磷酸化位点分别用下划线和椭圆标注。
图 2 豆梨 PcPht1 基因编码区序列及其编码的氨基酸
Fig. 2 PcPht1 coding region and deduced amino acid sequences of Pyrus calleryana Dcne.
跨膜区模型采用 TOPO2 软件(http:/ /www. sacs. ucsf. edu /TOPO2 /)绘制,数字表示跨膜区编号。
图 3 PcPht1 跨膜区域预测结果
Fig. 3 The predicted result of PcPht1 transmembrane region
648 江 苏 农 业 学 报 2013 年 第 29 卷 第 4 期
2. 3 PcPht1 基因启动子分析
对 PcPht1基因进行染色体步移后获得的 1 547
bp条带(图 1F)包括一段与其基因组 DNA序列重叠
的区域,去除该区域后,获得长度为 1 269 bp 的启动
子序列。启动子的转录起始位点 G位于翻译起始位
点 ATG上游-30 bp处(将转录位点定义为 0)。通过
生物学数据库 PlantCARE(http:/ /bioinformatics. psb.
ugent. be /webtools /plantcare /html /)对得到的启动子
进行预测分析,发现存在大量顺式作用元件。其中启
动子基本作用元件 TATA-box位于转录起始位点上游
-93 bp、- 143 bp、- 436 bp 及 - 804 bp 处,增强子
CAAT-box位于转录起始位点上游-119 bp、-340 bp、
-364 bp及-482 bp处。在该启动子还存在着防御与
胁迫响应元件(TC-rich repeats,-69 bp 和-127 bp)、
光反应元件(Box I,-360 bp)、热胁迫响应元件(HSE,
-565 bp)和茉莉酸甲酯响应顺式作用元件(TGACG-
motif,-516 bp) (图 6)。
GmPht1;7:大豆(FJ797407)。HbPht1:橡胶(HM015901)。LePT1:
番茄(AF022873)。LePT2:番茄(AF022874)。PcPht1:豆梨(本研
究获得)。PhPht1;1:矮牵牛(EF564180)。PtrPht1;7:杨树(XM_
002306809)。StPT1:马铃薯(X98890)。StPT2:马铃薯(X98891)。
图 4 PcPht1推测的氨基酸与其他植物 Pht1蛋白质同源性分析
Fig. 4 Homology analysis of PcPht1 deduced amino acid se-
quence and several Pht1 proteins from other plants
AtPht1;1:拟南芥(NM_123701)。AtPht1;2:拟南芥(NM_123703)。AtPht1;3:拟南芥(NM_123702)。AtPht1;4:拟南芥(NM_129452)。At-
Pht1;5:拟南芥(NM_128843)。AtPht1;6:拟南芥(NM_123700)。AtPht1;7:拟南芥(NM_115327)。AtPht1;8:拟南芥(DQ446267)。AtPht1;
9:拟南芥(NM_106293)。AtPht2;1:拟南芥(NM_113565)。AtPht3;1:拟南芥(NM_121407)。AtPht3;2:拟南芥(NM_114744)。AtPht3;3:拟
南芥(AK227300)。AtPht4;1:拟南芥(NM_128519)。AtPht4;2:拟南芥(NM_129362)。AtPht4;3:拟南芥(NM_001035747)。AtPht4;4:拟南
芥(NM_116261)。AtPht4;5:拟南芥(NM_122045)。AtPht4;6:拟南芥(NM_123804)。LePT1:番茄(AF022873)。LePT2:番茄(AF022874)。
PcPht1:豆梨(本研究获得)。StPT1:马铃薯(X98890)。StPT2:马铃薯(X98891)。
图 5 Pht蛋白质家族系统进化树
Fig. 5 Phylogenetic tree of Pht protein family
748李 慧等:豆梨磷转运蛋白质基因(PcPht1)的克隆、表达及启动子分析
TATA-box:启动子基本作用元件;CAAT-box:增强子;TC-rich repeats:防御与胁迫响应元件;BoxⅠ:光反应元件;HSE:热胁迫响应元件;
TGACG-motif:茉莉酸甲酯响应顺式作用元件。
图 6 豆梨 PcPht1 基因启动子序列分析
Fig. 6 Sequence analysis of PcPht1 gene promoter of Pyrus calleryana Dcne.
2. 4 PcPht1 的表达模式
为了研究 PcPht1在不同供磷条件下的表达情况,
以不同浓度 H2PO4
-处理 24 h 的豆梨叶片和根 cDNA
为模板,进行半定量 RT-PCR扩增。结果表明,正常供
磷(H2PO4
- 1. 0 mmol /L)条件下,PcPht1 在叶片和根
中均有表达,根中表达量高于叶片,叶片中仅能检测到
微弱的表达信号;低磷(H2PO4
- 0. 1 mmol /L)能够强烈
诱导 PcPht1在根中的表达,增加 PcPht1在叶片中的表
达,并且根中表达量远大于叶片;提高供磷浓度
(H2PO4
- 10. 0 mmol /L),直接导致 PcPht1在根中的表
达受抑制,在叶片中无表达(图 7)。
3 讨 论
磷是植物生长所需的重要矿质元素,磷缺乏会
1:0. 1 mmol /L H2PO4
-;2:1. 0 mmol /L H2PO4
-;3:10. 0
mmol /L H2PO4
-。
图 7 不同供磷条件下豆梨 PcPht1 基因的表达分析
Fig. 7 Expression of PcPht1 gene in Pyrus calleryana Dcne. un-
der different inorganic phosphate concentrations
对细胞代谢产生较大的影响[9]。在缺磷条件下,植
物主要通过以 Pht1 家族为代表的高亲和性磷转运
系统吸收土壤中的有效磷[13-14]。该家族的大部分
848 江 苏 农 业 学 报 2013 年 第 29 卷 第 4 期
成员在序列结构上都有着高度保守性,它们具有固
定的磷酸化及糖基化位点来进行转录后的加工修
饰,以此调节蛋白质相互作用,从而执行吸收和转运
磷的功能。本研究克隆的豆梨 PcPht1 基因 cDNA
序列所编码的氨基酸序列与大豆和橡胶等高亲和性
Pht1 磷转运蛋白质有着较高的一致性,并且 PcPht1
具备 Pht1 家族成员的主要特征:位于细胞质膜上,
编码蛋白质大小相似(相对分子质量约为 5. 8×
104) ,含 520 ~ 550 个氨基酸残基,由 12 个亲脂的
跨膜域(TM)组成,被一个亲水性的大环(TM6 和
TM7 之间)分成 2 组;在氨基酸序列中存在 N-连接
的保守糖基化位点,蛋白激酶 C 和酪蛋白激酶介导
的磷酸化位点[10,12,15-18]。综合上述特点,可以初步
确定 PcPht1 为豆梨的高亲和性磷转运蛋白质基因。
现有的研究发现 Pht1 主要在植物根部表达,如
拟南芥 Pht1 家族中有 8 个基因在根部表达[19-20],而
水稻的 13 个 Pht1 家族成员中有 10 个在根部表
达[21]。正常供磷(H2PO4
- 1 mmol /L)条件下,豆梨
PcPht1 在根部和叶片均有表达,而根中的表达丰度
显著高于叶,叶片中仅能检测到该基因的微弱表达
信号,表明该基因与其他植物 Pht1 家族大多数成员
相似,其表达主要集中在根部。
Pht1 家族磷转运蛋白质基因的调控主要在转
录水平上进行,大部分高亲和性磷转运 Pht1 基因受
低磷诱导表达[22-24]。豆梨 PcPht1 基因在低磷
(H2PO4
- 0. 1 mmol /L)条件下,叶片和根中的表达
量均显著上调,在高磷(H2PO4
- 10 mmol /L)条件下
显著下调,即本研究所克隆获得的 PcPht1 基因具备
Pht1 家族基因表达特点。Pht蛋白质家族系统进化
树分析结果表明,PcPht1 与拟南芥 Pht1 家族中 At-
Pht1;4 和 AtPht1;7 的遗传距离最近,与马铃薯和番
茄高亲和性磷转运蛋白质 Pht1 家族的 4 个成员
StPT1、StPT2、LePT1 和 LePT2 也属于同一进化分
支。Misson等[25]研究了拟南芥 AtPht1;4 基因缺失
体,发现 AtPht1;4 基因的缺失极显著地降低了植株
在低磷介质中对磷的吸收,但并不影响高磷供应条
件下磷的利用,这表明低磷条件可以诱导 AtPht1;4
基因的大量表达。与 AtPht1;4 基因类似的是,在缺
磷的环境中 StPT2 基因和 LePT2 基因的表达也主要
限于植株的根部[22,26-28],这与 PcPht1 基因的表达特
点很相似。而 StPT1 基因和 LePT1 基因在缺磷或不
缺磷的根部和地上部均大量表达[22,26-28],这与
PcPht1 基因的表达模式有所区别,推测 StPT1、
LePT1 与 PcPht1 的功能有所差异。
参考文献:
[1] BUCHER M. Functional biology of plant phosphate uptake at root
and mycorrhiza interfaces[J]. New Phytologist,2007,173(1) :
11-26.
[2] 王敬丽,杨美燕,杨秀珍,等.磷营养对独本菊生长及开花的影
响[J].江苏农业科学,2012,40(9) :156-159.
[3] 牛慧样,吴沿友,朱咏莉,等.磷胁迫下根系分泌物中苹果酸含
量测定及特征分析[J]. 江苏农业科学,2012,40(10) :286-
288.
[4] RAGHOTHAMA K G,KARTHIKEYAN A S. Phosphate acquisi-
tion[J]. Plant and Soil,2005,274(1-2) :37-49.
[5] LIU J Y,VERSAW W K,PUMPLIN N,et al. Closely related
members of the Medicago truncatula PHT1 phosphate transporter
gene family encode phosphate transporters with distinct biochemical
activities[J]. Journal of Biological Chemistry,2008,283(36) :
24673-24681.
[6] CATARECHA P,SEGURA M D,FRANCO-ZORRILLA J M,et
al. A mutant of the Arabidopsis phosphate transporter PHT1;1 dis-
plays enhanced arsenic accumulation[J]. Plant Cell,2007,19
(3) :1123-1133.
[7] MIAO J,SUN J H,LIU D,et al. Characterization of the promoter
of phosphate transporter TaPHT1. 2 differentially expressed in
wheat varieties[J]. Journal of Genetics and Genomics,2009,36
(8) :455-466.
[8] PREUSS C P,HUANG C Y,GILLIHAM M,et al. Channel-like
characteristics of the low-affinity barley phosphate transporter
PHT1;6 when expressed in Xenopus oocytes[J]. Plant Physiology,
2010,152(3) :1431-1441.
[9] SHIN H,SHIN H S,DEWBRE G R,et al. Phosphate transport
in Arabidopsis:Pht1;1 and Pht1;4 play a major role in phosphate
acquisition from both low- and high-phosphate environments[J].
Plant Journal,2004,39(4) :629-642.
[10] PARK M R,BAEK S H,DELOSREYES B G,et al. Overexpres-
sion of a high-affinity phosphate transporter gene from tobacco(Nt-
PT1)enhances phosphate uptake and accumulation in transgenic
rice plants[J]. Plant and Soil,2007,292(1-2) :259-269.
[11] 李 慧,丛 郁,常有宏,等. 豆梨半胱氨酸蛋白酶抑制剂基因
的克隆及胁迫表达[J]. 西北植物学报,2011,31(5) :861-
867.
[12] WU Z,ZHAO J,GAO R,et al. Molecular cloning,characteriza-
tion and expression analysis of two members of the Pht1 family of
phosphate transporters in Glycine max[J]. PloS ONE,2011,6
(6) :e19752.
[13] SCHUNMANN P H D,RICHARDSON A E,VICKERS C E,et
al. Promoter analysis of the barley Pht1;1 phosphate transporter
gene identifies regions controlling root expression and responsive-
948李 慧等:豆梨磷转运蛋白质基因(PcPht1)的克隆、表达及启动子分析
ness to phosphate deprivation[J]. Plant Physiology,2004,136
(4) :4205-4214.
[14] NAGY R,VASCONCELOS M J,ZHAO S,et al. Differential reg-
ulation of five Pht1 phosphate transporters from maize (Zea mays
L.) [J]. Plant Biology (Stuttg) ,2006,8(2) :186-197.
[15] KAI M,TAKAZUMI K,ADACHI H,et al. Cloning and charac-
terization of four phosphate transporter cDNAs in tobacco [J].
Plant Science,2002,163(4) :837-846.
[16] MING F,LU Q,WANG W,et al. Cloning,expression and func-
tion of phosphate transporter encoded gene in Oryza sativa L. [J].
Science in China Series C-Life Sciences,2006,49(5) :409-413.
[17] 汤银辉,何 鹏.巴西橡胶树磷转运蛋白基因的克隆及生物信
息学分析[J]. 热带作物学报,2010,31(5) :758-766.
[18] 马彩艳,刘冬成,阳文龙,等. 短柄草磷转运蛋白家族基因的克
隆及表达分析[J]. 分子植物育种,2011,9(4) :482-490.
[19] KARTHIKEYAN A S,VARADARAJAN D K,MUKATIRA U T,
et al. Regulated expression of Arabidopsis phosphate transporters
[J]. Plant Physiology,2002,130(1) :221-233.
[20] MUDGE S R,RAE A L,DIATLOFF E,et al. Expression analy-
sis suggests novel roles for members of the Pht1 family of phosphate
transporters in Arabidopsis[J]. Plant Journal,2002,31(3) :
341-353.
[21] PASZKOWSKI U,KROKEN S,ROUX C,et al. Rice phosphate
transporters include an evolutionarily divergent gene specifically
activated in arbuscular mycorrhizal symbiosis[J]. Proceedings of
the National Academy of Sciences of the United States of America,
2002,99(20) :13324-13329.
[22] GORDON-WEEKS R,TONG Y P,DAVIES T G E,et al. Re-
stricted spatial expression of a high-affinity phosphate transporter in
potato roots[J]. Journal of Cell Science,2003,116(15) :3135-
3144.
[23] RAE A L,CYBINSKI D H,JARMEY J M,et al. Characterization
of two phosphate transporters from barley;evidence for diverse
function and kinetic properties among members of the Pht1 family
[J]. Plant Molecular Biology,2003,53(1-2) :27-36.
[24] 刘芳朋,张立军,谷俊涛,等. 小麦磷转运蛋白基因 TaPT4 的
克隆和表达分析[J]. 河北农业大学学报,2012,35(3) :1-7.
[25] MISSON J,THIBAUD M C,BECHTOLD N,et al. Transcription-
al regulation and functional properties of Arabidopsis Pht1;4,a
high affinity transporter contributing greatly to phosphate uptake in
phosphate deprived plants[J]. Plant Molecular Biology,2004,
55(5) :727-741.
[26] LIU C M,MUCHHAL U S,RAGHOTHAMA K G. Cloning and
characterization of high affinity phosphate transporter homologs
from tomato uthappa mukatira[J]. Plant Physiology,1996,111
(2) :436-436.
[27] ROSEWARNE G M,BARKER S J,SMITH S E,et al. A lycop-
ersicon esculentum phosphate transporter (LePT1) involved in
phosphorus uptake from a vesicular-arbuscular mycorrhizal fungus
[J]. New Phytologist,1999,144(3) :507-516.
[28] RAUSCH C,DARAM P,BRUNNER S,et al. A phosphate trans-
porter expressed in arbuscule-containing cells in potato[J]. Na-
ture,2001,414(6862) :462-466.
(责任编辑:张震林)
058 江 苏 农 业 学 报 2013 年 第 29 卷 第 4 期