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贵州6个白刺花种群种子贮藏蛋白的遗传多样性



全 文 :书 [收稿日期] 2015-01-21;2015-02-28修回
 [基金项目] 国家自然科学基金项目“贵州石漠化功能灌木群繁殖行为与种群自组织更新响应机制”(31260572);贵州省科教青年英才培育
工程项目“贵州白刺花种群遗传变异及指纹图谱构建”[黔省专合字(2012)142];贵州省农业攻关项目“雀稗属牧草无融合生殖
固定杂种优势研究与示范”[黔科合NY(2014)3048];贵州省农业攻关项目“灌丛草地改良及配套养羊关键技术研究与示范”
[黔科合NY字(2010)3049]
 [作者简介] 马 林(1990-),男,在读硕士,研究方向:草种质资源及育种。E-mail:471315481@qq.com
 *通讯作者:陈 超(1974-),男,副教授,博士,从事草学、畜牧学研究。E-mail:gzgyxgc3855218@163.com
[文章编号]1001-3601(2015)03-0109-0005-04
贵州6个白刺花种群种子贮藏蛋白的遗传多样性
马 林1,王普昶2,姚红艳1,赵丽丽1,陈 超1*,卢立娜3
(1.贵州大学 动物科学学院草业科学系,贵州 贵阳550025;2.贵州省草业研究所,贵州 贵阳550006;
3.鄂尔多斯市林业治沙科学研究院,内蒙古 东胜017000)
  [摘 要]为探明贵州白刺花的遗传背景及其种质资源的开发利用提供理论依据,采用十二烷基硫酸
钠-聚丙烯酰胺凝胶(SDS-PAGE)电泳对采自贵州不同海拔梯度下6个白刺花种群的种子贮藏蛋白,构
建6个种群的种子贮藏蛋白指纹图谱,并进行聚类分析。结果表明:6个白刺花种群的种子贮藏蛋白总条带
数为22条,分子量在17.97~81.91kDa,其中多态性条带8条,多态性百分率为36.36%。SDS—PAGE电
泳图可作为白刺花的生化指纹,各种群种子贮藏蛋白电泳图上具有各自的特征带或缺失带。相邻高海拔的
白刺花种群间遗传差异相对较小,先聚为一类,与低海拔种群遗传差异较大,最后聚为一类。
[关键词]白刺花;种子贮藏蛋白;指纹图谱;聚类分析;贵州
[中图分类号]S514 [文献标识码]A
Genetic Diversity of Seed Storage Protein of Six
Sophora davidi Populations in Guizhou
MA Lin1,WANG Puchang2,YAO Hongyan1,ZHAO Lili 1,CHEN Chao1*,LU Lina3
(1.Department of Grassland Science,College of Animal Science,Guizhou University,Guiyang,Guizhou550025;
2.Guizhou Pratacultural Institute,Guiyang,Guizhou550006;3.Ordos Institute of Forestry and Desertification
Control,Dongsheng,Inner Mongolia 017000,China)
  Abstract:The fingerprint spectrums of seed storage protein of six S.davidii populations with
different elevation were established by SDS-PAGE to probe genetic background of S.davidii and provide
the theoretical basis for development and utilization of S.davidii germplasm resources.The results
showed that 22bands of seed storage protein with 17.97~81.91kDa molecular weight were detected from
6 S.davidii populations,and eight bands are of polymorphism.SDS-PAGE electrophoretogram can be
used as the biochemical fingerprint of S.davidii and there are own characteristics bands and deficiency
band in seed storage protein electrophoretogram of different S.avidii population.The cluster analysis
showed that the genetic difference of adjacent high-altitude S.davidii populations were relatively smaler
and there is great genetic difference between S.davidii populations with high altitude and S.davidii
populations with low altitude.
Key words:Sophora davidii;seed storage proteins;fingerprint;cluster analysis;Guizhou
  白刺花(Sophora davidii)为豆科(Legumino-
sae)槐属多年生灌木,在贵州分布广泛,由于其根系
发达,固土保水能力和适应性较强,同时具有营养丰
富、枝叶多、适口性好等饲用特性[1-2],成为石漠化地
区植被恢复的先锋物种和重要的饲用资源被广泛推
广利用[3]。目前,关于白刺花的研究主要集中在破
除种子硬实性、化学成分、药用价值、抗逆性以及饲
用价值开发等[1,4-5]方面,而对白刺花遗传多样性的
研究未见报道。
种子贮藏蛋白(Seed storage proteins,SSP)是
指高等植物在种子成熟过程中合成并大量储存的贮
藏蛋白质。种子蛋白高度多态,主要由遗传决定,较
少受到环境的影响,利用种子贮藏蛋白电泳技术能
够检测出植物群体内大量的遗传变异[6]。十二烷基
硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶(SDS-PAGE)电泳技术
因具有变性蛋白可溶解,泳动速度只与分子量大小
相关,与蛋白所带电荷和形态无关等,在光叶紫花
苕、胡枝子等豆科植物种子贮藏蛋白图谱分析方面
被广泛应用[7-8]。为贵州白刺花种质资源的开发利
用提供科学依据,笔者等于2014年8月采用SDS-
PAGE电泳技术构建贵州6个白刺花种群种子贮藏
蛋白指纹图谱,拟从蛋白水平探讨白刺花的遗传多
样性,了解其遗传背景。
1 材料与方法
1.1 白刺花种子
供试6个白刺花种子采自贵州当地的自然白刺
花种群,具体情况见表1,其中晴隆白刺花(F)为筛
 贵州农业科学 2015,43(3):5~8
 Guizhou Agricultural Sciences
表1 供试白刺花种群的地理分布
Table 1 Geographical distribution of tested S.davidii populations
编号
Number
来源地
Origin
样品数
Sample number
经度
Longitude(E)
纬度
Latitude(N)
海拔/m
Altitude
A 贵州关岭 30  105°38′ 25°55′ 620
B 贵州岗乌 42  105°19′ 25°55′ 870
C 贵州关岭 30  105°38′ 25°58′ 1 060
D 贵州关岭 40  105°37′ 25°52′ 1 284
E 贵州晴隆 31  105°37′ 25°58′ 1 504
F 晴隆白刺花(品系) 35
选出的优良品系,作为对照。
1.2 种子贮藏蛋白的提取
取20粒种子洗净擦干,放于研钵中压碎,置于
1.5mL离心管中,加入样品缓冲液(50mmol/L
Tris-HCl,pH6.8;5% β-巯基乙醇,2%十二烷基硫
酸钠,0.1%溴芬兰,10%甘油)800μL混匀,在室温
下提取2h,12 000r/min离心10min,取上清液保
存于4℃冰箱备用。上样前按1∶1比例加入上样
缓冲液,100℃煮沸5min,每次上样10μL,每个种
群3个平行,然后进行电泳。
1.3 SDS-PAGE电泳
SDS-PAGE 浓缩胶浓度为5%,分离胶为
10%,每个样品上样量为10μL。采用北京六一电
泳仪器厂DYY-6C型电泳仪,在40mA恒流电泳
7~8h,当指示剂到凝胶底部1.5cm左右停止电
泳。电泳结束后剥下胶片,双蒸水漂洗后,倒入考马
斯亮蓝染色液淹没胶面,水平摇床上染色3~5h,
用双蒸水漂洗后,倒入脱色液放置于摇床上脱色至
条带清晰,脱色后照相并统计。电泳时采用低分子
量标准蛋白为对照,其含6个蛋白亚基,分子量分别
为97.40kDa、66.20kDa、43.00kDa、31.00kDa、
22.00kDa和14.40kDa的条带。
1.4 数据统计分析
测定图谱上各条带的迁移距离,计算迁移率;利
用 标 准 蛋 白 分 子 量 与 迁 移 率 的 关 系 式
〔Lg(M.W.)=R×Rf+A,式中,M.W.为各条带的
分子量,Rf为各条带的迁移率,R为标准曲线斜率,
A为常数〕,作出分子量和迁移率的标准曲线,根据
待测蛋白单体迁移率确定分子量。
对电泳谱带进行统计时,有带记为1,无带记为
0,形成种子贮藏蛋白原始数据矩阵。计数多态性带
数,计算多态性带百分率(PPB),并使用 NTSYS-
pc2.1软件,基于遗传相似系数对各种群白刺花进
行聚类分析。
2 结果与分析
2.1 白刺花种子贮藏蛋白指纹
在6个白刺花种群中共检测出22条迁移率不
同且清晰、分辨率高的种子贮藏蛋白谱带,谱带分子
量在17.97~81.91kDa,迁移率在8.8%~98.1%。
根据谱带迁移率从小到大,把6个白刺花种群种子
贮藏蛋白图谱分为α、β、γ区域(图1),其中,α区的
一级带 二级带 三级带
四级带 五级带 六级带
M E B A C D F
1
2
α
β
γ
 注:M为标准蛋白,A~F为白刺花种群;电泳图谱中1为B种群特征条带,2为E、F种群缺失条带,3为C、D种群缺失条带,4为E、F种群特
征条带,5为A种群缺失条带;图谱模式中1~17为迁移距离。
 Note:M,Standard protein;A~F,S.davidii populations;1,Characteristics band of B population;2,Missing band of E and F populations;
3,Missing band of C and D populations;4,Characteristics band of E and F populations;5,Missing band of A population;1~17in the graph
pattern indicates migration distance.
图1 白刺花种子贮藏蛋白的电泳图谱及图谱模式
Fig.1 Electrophoresis and graph pattern of S.davidii seed storage protein
·6·
                                        贵 州 农 业 科 学
                                   Guizhou Agricultural Sciences
表2 白刺花种子贮藏蛋白各谱带的迁移率(Rf)及分子量
Table 2 Mobility rate and molecular weight of S.davidii seed storage protein
带序号
Number of bands
迁移率/%
Mobility rate
分子量/kDa Molecular weight
A种群 B种群 C种群 D种群 E种群 F种群
1  8.8 - 81.91 - - 81.91  81.91
2  12.8  76.56  76.56  76.56  76.56  76.56  76.56
3  16.4  72.06  72.06  72.06  72.06  72.06  72.06
4  18.9 - 69.04 - - - -
5  24.1  63.16  63.16  63.16  63.16 - -
6  26.8  60.31  60.31  60.31  60.31  60.31  60.31
7  34.8 - 52.68  52.68  52.68  52.68  52.68
8  40.7  47.68  47.68  47.68  47.68  47.68  47.68
9  43.6  45.36  45.36  45.36  45.36  45.36  45.36
10  45.1  44.24  44.24 - - - -
11  50.7  40.19  40.19 - - 40.19  40.19
12  55.1  37.29  37.29  37.29  37.29  37.29  37.29
13  57.9  35.61  35.61  35.61  35.61  35.61  35.61
14  63.7  32.23  32.23  32.23  32.23  32.23  32.23
15  69.6 - - - - 29.17  29.17
16  72.1  27.95  27.95  27.95  27.95  27.95  27.95
17  75.3  26.50  26.50  26.50  26.50  26.50  26.50
18  78.8  24.94  24.94  24.94  24.94  24.94  24.94
19  82.6  23.39  23.39  23.39  23.39  23.39  23.39
20  89.9 - 20.65  20.65  20.65  20.65  20.65
21  95.4  18.82  18.82  18.82  18.82  18.82  18.82
22  98.1  17.97  17.97  17.97  17.97  17.97  17.97
谱带迁移率最小,在8.8%~26.8%,含有6条带;β
区居中,在72.1%~98.1%,含有8条带;γ区最大,
在72.1%~98.1%,含有8条带。
将6个种群在各个位点出现的所有谱带根据宽
窄和颜色深浅不同分为6个等级,颜色最深的为一
级带,次深的为二级带,较浅的为三级带,颜色较深
但呈线形的为四级带,颜色很浅但有一定宽度的为
五级带,颜色很浅且呈线形的为六级带。在迁移率
26.8%和34.8%处,E种群各有1条三级带,F种群
各有1条一级带;在迁移率34.8%处,C种群有1条
三级带,D种群有1条五级带(图1)。因此,依据不
同迁移率特征带的出现和缺失及条带宽窄、颜色深
浅可以鉴定出不同白刺花种群。
从表2可知,贵州6个白刺花种群种子贮藏蛋
白谱带既有相似性,又有一定的特异性。B种群在
迁移率为18.9%处,具有1条分子量为69.04kDa
的特有带(特征带),该带颜色较深,在3组平行中均
出现,因此可以利用该带鉴别B种群。A种群在迁
移率为34.8%、89.9%处各有1条缺失带,这2条
缺失带在其他种群均出现,因此可以用于鉴别A种
群。C种群与D种群条带的有无表现一致,在迁移
率为50.7%处,缺失1条分子量为40.19kDa的条
带,该条带在其他种群均存在,因此可以用于鉴别C
种群和D种群。E种群与F种群条带多少和出现
位置一致,均在迁移率为24.1%处缺失分子量为
63.16kDa的条带,在迁移率为69.6%处存在分子
量为29.17kDa的特征带,利用以上2条带可以将
E和F种群与其他白刺花种群鉴别开。
2.2 白刺花谱带多样性及聚类
在6个白刺花种群种子贮藏蛋白22条谱带中,
E
F
B
C
D
A
0.78 0.84 0.89 0.95 1.00
图2 贵州6个白刺花不同种群的聚类
Fig.2 Dendrogram of six S.davidii populations in Guizhou
有14条共有带,8条多样性条带,多样性条带迁移
率分别为8.8%、18.9%、24.1%、34.8%、45.1%、
50.7%、69.6%和89.9%(表2),多态带百分率为
36.36%。由图2看出,在贵州关岭地区的3个白刺
花种群中,位于海拔1 060m(C种群)和1 284m
(D种群)在种子蛋白谱带的有无方面表现一致,遗
传相似系数较大,遗传差异较小;低海拔的关岭白刺
花A种群(海拔620m)与C、D种群的遗传相似系
数较小,遗传差异较大。
3 结论与讨论
3.1 SDS-PAGE电泳图制作白刺花生化指纹的
可行性
根据SDS-PAGE种子贮藏蛋白电泳谱带数
目、位置、条带宽窄和颜色深浅可以进行各牧草种、
品种、种质间的鉴定[9-10],但电泳凝胶浓度和种子蛋
白的提取方法对图谱的电泳结果影响较大[10]。为
避免试验误差,本研究通过预试验,摸索确定白刺花
种子蛋白的提取方法、凝胶浓度及染色方法后,设置
统一的试验条件,利用SDS-PAGE技术对6个白
刺花种群进行电泳。结果表明,6个白刺花种群种
子贮藏蛋白的谱带数目、位置、条带宽窄和颜色深浅
·7·
 马 林 等 贵州6个白刺花种群种子贮藏蛋白的遗传多样性
 MA Lin et al Genetic Diversity of Seed Storage Protein of Six Sophora davidii Populations in Guizhou
均存在不同程度的差异。B、E和F种群在种子贮
藏蛋白指纹图谱上具有各自的特征谱带,其余种群
有各自的缺失带,部分谱带的宽窄和颜色深浅存在
差异,而且谱带的重复性好。表明,白刺花种群种子
贮藏蛋白SDS-PAGE电泳图可作为白刺花的生
化指纹,用于种质材料间的鉴定。
3.2 白刺花谱带多样性及聚类
蛋白质作为基因表达的直接稳定产物,能在生
化水平上反应DNA组成上的差异,种子贮藏蛋白
在种子细胞内的积累、含量高低及组分的变化受相
关基因的严格调控[11]。何忠效等[12]研究表明,种子
贮藏蛋白具有不受生长季节和环境的影响,电泳结
果稳定,突破了同工酶易受到时空影响的局限性。
并且,李志勇等[13]在豆科植物扁蓿豆种质资源遗传
多样性研究中,利用SDS—PAGE电泳对扁蓿豆种
子贮藏蛋白进行研究,并结合ISSR分子标记对其
遗传多样性进行分析,结果表明,两种方法检测的种
质资源多态性相近,说明种子贮藏蛋白可以直观表
征植物基因上的遗传差异。王清郦等利用12%分
离胶对3个类型尖叶胡枝子群体电泳,得到多态性
条带的百分率为32.14%[6];毛小涛等利用10%分
离胶对4个扁蓿豆品系群体电泳,得到多态性条带
的百分率为35.48%[10];高素玲等利用10%分离胶
对苜蓿20个单粒种子电泳,得到多态条带的百分率
为81.16%[12]。贵州6个白刺花种群利用10%分
离胶电泳,得到多态性谱带的百分率为36.36%,与
上述群体的研究结果相差不大,但明显低于对单粒
种子的研究结果。可见,在植物品种遗传多样性的
研究中,以单粒种子为单位能全面地揭示出品种内
和品种间的变异水平[13]。
黄玮等[14]研究表明,相邻海拔的不同种群间遗
传相似系数相对较高,先聚为一类,与本研究结果一
致。导致这一现象的原因可能是白刺花生长在贵州
喀斯特生态环境下,随着海拔高度的增高,不仅温
度、湿度等气候条件发生变化,土壤特性也有很大差
异[15],导致不同海拔梯度间植物发生分化。谭玉莲
等[16]研究表明,不同海拔导致的异质生境影响基因
流,成为影响植物种群遗传多样性高低的主要原因;
低海拔种群内遗传多样性高于高海拔种群。不同海
拔梯度下白刺花种群的遗传多样性是否存在该现
象,需要进一步利用SDS-PAGE电泳技术进行不
同种群间单粒种子贮藏蛋白的谱带分析。
[参 考 文 献]
[1] 李芳兰,包维楷,吴 宁.白刺花幼苗对不同强度干旱
胁迫的形态与生理响应[J].生态学报,2009,29(10):
5406-5416.
[2] 李安定,李苇洁,唐金刚.贵州喀斯特石漠化区白刺花
群落主要种群生态位分析[J].湖北农业科学,2013,
52(14):3286-3289.
[3] 王 贤.牧草栽培学[M].北京:中国环境科学出版
社,2006:218-219.
[4] 董刘宏,太志刚,杨亚滨,等.白刺花的化学成分研究
[J].华西药学杂志,2010,25(6):636-640.
[5] 李 莉,何胜江,王普昶,等.喀斯特山区特征灌木白
刺花的青贮效果[J].草业科学,2014,31(10):1957-
1965.
[6] 王清郦,孙启忠,赵淑芬,等.尖叶胡枝子种子贮藏蛋
白分析[J].草业科学,2012,29(9):1384-1389.
[7] 柳 茜,王清郦,傅 平,等.光叶紫花苕种子贮藏蛋
白分析[J].草原与草坪,2013,3(4):28-33.
[8] 杜建材,云锦凤,王照兰,等.黄花苜蓿表型分异种质
的种子蛋白图谱研究[J].中国草地学报,2011,33
(3):47-51.
[9] 朱飞雪,杜建材,王照兰,等.五种不同苜蓿的种子蛋
白指纹图谱研究[J].中国草地学报,2007,29(5):1-
7.
[10] 毛小涛,王照兰,杜建材,等.不同品系扁蓿豆种子蛋
白指纹图谱研究[J].中国草地学报,2009,31(6):44-
51.
[11] Kim W T,Okita T W.Expression of stroage protein
multigene families in developing rice endosperm[J].
Plant celphysiol,1993,34(4):374-378.
[12] HE Zhongxiao,BAI Jianshi,ZHANG Yu.Effect of
DNA methylation on protein-DNA interaction of HL-
60cels[J].Sciece in China(Series C),1999,42(5):
501-505
[13] 李志勇.扁蓿豆种质资源遗传多样性机理的研究
[D].北京:中国农业科学院,2011.
[14] 高素玲,郭 丽,朱飞雪,等.黄花苜蓿不同种质材料
的遗传多样性研究[J].中国草地学报,2013,35(1):
61-66.
[15] 李拥军,苏加楷.中国苜蓿地方品种种子贮藏蛋白标
记———遗传多样性的研究[J].草地学报,1998,6(3):
197-206.
[16] 黄 玮,孙 平,张文生,等.北京东灵山地区不同海
拔柴胡居群的遗传多样性[J].植物遗传资源学报,
2008,9(4):453-457.
[17] 秦 松,范成五,孙锐锋.贵州土壤资源的特点、问题
及利用对策[J].贵州农业科学,2009,37(5):94-98.
[18] 谭玉莲,刘迎辉,熊丽娜,等.不同海拔高度的野古草
的遗传多样性分析[J].西南师范大学学报,2009,34
(2):71-74.
(责任编辑:冯 卫)
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