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75份腰果种质资源的RAPD分析



全 文 :基金项目: 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资助项目(No. PZS059), 中国热带农业科学院重点科技基金资助项目(No. Rky0401)资助。
第一作者简介 : 黄伟坚 , 男 , 1971 年生 , 助理研究员 。 研究方向 : 果树栽培与种质资源评价 、 利用 。 Tel: 0898-23306638; E-mail:
hwj26@163.com。
*通讯作者: 梁李宏, 男, 1962年生, 研究员。 研究方向: 腰果选育种和高产栽培技术。 E-mail: lianglh62@yahoo.com.cn。
收稿日期: 2010-03-15 修回日期: 2010-05-01
第 31 卷 第 6 期 热 带 作 物 学 报 Vol.31 No.6
2010 年 6 月 CHINESE JOURNAL OF TROPICAL CROPS Jun.2010
75份腰果种质资源的 RAPD分析
黄伟坚 1, 黄海杰 1, 张中润 1 , 王金辉 1, 吴家和 2, 梁李宏 1
1
中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所
农业部热带作物种质资源利用重点开放实验室 海南儋州 571737
2中国科学院微生物研究所植物基因组学国家重点实验室 北京 100101
摘要 利用 RAPD 技术, 对 75 份国内现有的腰果种质资源进行遗传亲缘关系及分类研究。 利用 45 个随机引物
对 75 份腰果种质资源的基因组 DNA 进行 PCR 扩增, 共扩增出 407 条谱带, 其中多态性谱带为 294 条, 多态率
达 72.24%, 表明 75 份腰果种质资源具有丰富的多态性。 75 份国内现有的腰果种质遗传相似性分析结果表明,
各种质资源间的遗传相似系数在 0.690~0.936 之间, 平均相似系数为 0.841; 通过 UPGMA 法建立了 75 份腰果种
质资源的亲缘关系聚类图, 当 D=0.79 时, 将 75 份腰果种质划分成 16 个类群。 分析结果表明多数来源相同的种
质资源表现出较为密切的亲缘关系。
关键词 腰果; 遗传多样性; 随机扩增多态性 DNA; 亲缘关系
doi 10.3969/j.issn.1000-2561.2010.06.004
中图分类号 S667.9
腰果(Anacardium occidentale L.)原产巴西东北部, 典型的热带常绿乔木果树, 是世界著名四大坚果之
一, 被公认为用途广, 经济效益高, 社会效益和生态效益明显的优良经济林树种 [1]。 腰果属有 11 个种,
全部起源于南美洲, 但世界普遍分布和栽培的只有 Anacardium occidentale L. 1 个种, 它也被称为普遍栽
培种[2]。 由于现在种植的腰果是由一个普遍栽培种衍生演变而来, 其狭窄的遗传基础造成育成品种遗传多
样性降低, 品种鉴定存在一定难度, 采用形态学方法、 生物化学方法对品种进行识别和鉴定往往受到限
制, 难以区分亲缘关系较近的材料。 分子标记是研究遗传多样性和亲缘关系的有效方法[3-5], 中国腰果种
质资源较为丰富, 但许多品种资源的分类地位及亲缘关系尚不清楚, 不利于进一步利用现有资源开展育种
工作。 在当前, 印度、 越南等国栽培面积不断扩大, 世界贸易量日渐看涨形势下[1], 迫切需要结合现有资
源和在引进新的种质资源基础上, 培育适应我国栽培区生态条件且品质优良、 高产稳产的腰果新品种, 因
此很有必要对现保存的腰果种质的遗传多样性进行研究, 筛选出有利的亲本材料, 选育具有优良性状的腰
果新品种 (系)。 本研究采用 RAPD 技术, 对我国现有的 75 份腰果种质资源遗传多样性进行 RAPD 分析,
探讨其遗传多样性、 亲缘关系和分类鉴定, 旨在为合理有效利用该资源提供科学理论依据, 为腰果种质资
源圃的收集、 保存和研究奠定基础。
1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 腰果种质资源 本试验采用的 75 份腰果种质资源来自中国热带农业科学院热带作物品种资源研
究所乐东种质圃, 基本上包括国内现有的大部分腰果种质资源, 详见表 1。 取其嫩叶做为研究试材。
6期 黄伟坚等: 75 份腰果种质资源的 RAPD 分析
1.1.2 试剂与仪器 Taq 酶、 dNTPs、 10×DNA PCR Buffer、 DNA Ladder Marker 均购于 Genestar 公司
(北京), 随机引物购于北京鼎国昌盛生物技术公司, 其他化学试剂为国产分析纯。 使用的 PCR 仪为美国
MJ RESEARCH公司产品, 型号为 PTC-100TM。
表 1 75 个腰果种质资源的名称、 来源地和采集地
编号 种质名称 来源地 采集地 编号 种质名称 来源地 采集地
1 B-1-16 国外 乐东种质圃 39 YZ-01 海南 乐东种质圃
2 B-1-08 国外 乐东种质圃 40 B-1-03 国外 乐东种质圃
3 B-6-05 国外 乐东种质圃 41 YZ-DT 海南 乐东种质圃
4 B-3-02 国外 乐东种质圃 42 YZ-02 海南 乐东种质圃
5 YN-02-02 云南 乐东种质圃 43 YZ-03 海南 乐东种质圃
6 B-1-09 国外 乐东种质圃 44 B-2-09 国外 乐东种质圃
7 YN-02-05 云南 乐东种质圃 45 B-2-07 国外 乐东种质圃
8 YN-02-07 云南 乐东种质圃 46 B-2-06 国外 乐东种质圃
9 YN-02-01 云南 乐东种质圃 47 B-6-01 国外 乐东种质圃
10 YN-02-04 云南 乐东种质圃 48 B-2-08 国外 乐东种质圃
11 YN-02-06 云南 乐东种质圃 49 GF-01 海南 乐东种质圃
12 YN-02-03 云南 乐东种质圃 50 B-2-01 国外 乐东种质圃
13 HL2-21 海南 乐东种质圃 51 FC-12 海南 乐东种质圃
14 GA63 海南 乐东种质圃 52 B-2-05 国外 乐东种质圃
15 HL2-13 海南 乐东种质圃 53 B-2-02 国外 乐东种质圃
16 FL30 海南 乐东种质圃 54 TG-07 国外 乐东种质圃
17 CP63-36 海南 乐东种质圃 55 TG-02 国外 乐东种质圃
18 B-2-10 国外 乐东种质圃 56 TG-03 国外 乐东种质圃
19 B-2-04 国外 乐东种质圃 57 TG-05 国外 乐东种质圃
20 B-3-09 国外 乐东种质圃 58 TG-01 国外 乐东种质圃
21 B-3-10 国外 乐东种质圃 59 TG-04 国外 乐东种质圃
22 B-3-01 国外 乐东种质圃 60 TG-06 国外 乐东种质圃
23 B-7 国外 乐东种质圃 61 B-3-11 国外 乐东种质圃
24 B-5-02 国外 乐东种质圃 62 B-1-15 国外 乐东种质圃
25 B-5-03 国外 乐东种质圃 63 B-3-03 国外 乐东种质圃
26 B-5-04 国外 乐东种质圃 64 B-3-05 国外 乐东种质圃
27 B-5-05 国外 乐东种质圃 65 B-3-04 国外 乐东种质圃
28 B-5-01 国外 乐东种质圃 66 B-2-03 国外 乐东种质圃
29 B-6-03 国外 乐东种质圃 67 B-4-05 国外 乐东种质圃
30 B-4-03 国外 乐东种质圃 68 B-1-06 国外 乐东种质圃
31 B-4-02 国外 乐东种质圃 69 B-4-04 国外 乐东种质圃
32 B-6-02 国外 乐东种质圃 70 B-1-07 国外 乐东种质圃
33 B-4-01 国外 乐东种质圃 71 B-1-12 国外 乐东种质圃
34 B-1-04 国外 乐东种质圃 72 B-1-11 国外 乐东种质圃
35 CF-05 海南 乐东种质圃 73 B-1-14 国外 乐东种质圃
36 FG-04 海南 乐东种质圃 74 FC-02 海南 乐东种质圃
37 B-6-04 国外 乐东种质圃 75 B-1-10 国外 乐东种质圃
38 B-1-01 国外 乐东种质圃
895
热 带 作 物 学 报 31 卷
1.2 方法
1.2.1腰果基因组 DNA的提取 幼嫩叶片基因组 DNA 的提取方法, 在传统的 CTAB 方法上进行优
化和改进; 用 0.8%的琼脂糖凝胶电泳检测其质量, 并在微量分光光度计下测定其浓度, 稀释标定到
(50 ng/L), 置于-20℃冰箱中储存备用。
1.2.2随机引物的筛选 供试样的基因组 DNA中随机抽取 10份样品, 对 100个随机引物进行筛选, 得
到 45个重复性和多态性较好的引物。
1.2.3 DNA的PCR反应体系与扩增程序 总反应体积为 20 μL: 10×PCR Buffer 2.0 μL, Tag酶(5 U/μL)
0.2 μL, dNTPs(2.0 mmol/L) 2.0 μL, 引物(10 μmol/L) 1.0 μL, DNA模板 (50 ng/L) 1.0 μL, ddH2O 13.8 μL。
反应程序: 94℃ 4 min, 94℃ 40 s, 34℃ 1 min, 72 ℃ 80 s, 40 个循环; 最后 72℃ 8 min, 4℃终止反
应。 PCR扩增产物于 4℃冰箱中保存。
1.2.4扩增产物的数据分析 电泳分析检测。 将基因组 DNA 扩增产物在 1×TAE 缓冲液中, 以 1.8%的
琼脂糖凝胶(GoldViewTM染色)进行电泳, 电压 60 V, 电泳 90 min。 Marker 为 1 kb, 于凝胶成像仪上观看并
拍照。 条带的记录。 以筛选出的 45个引物对 75份基因组 DNA进行 RAPD分析。 DNA电泳图谱中的每一
条带, 均为一个分子标记, 并代表引物的一个结合位点。 同一位点存在时记为1, 无带不存在时记为 0, 强
带和可重复的弱带赋值均为 1。 将图形资料转换成数据资料。 数据分析和处理方法。 用 NTSYS pc2.02 分
析软件, 采用 UPGMA聚类方法, 对 75份腰果种质资源进行分析, 建立样品间的亲缘关系树状图。
2 结果与分析
2.1 供试腰果基因组 DNA质量检测
腰果总 DNA 琼脂糖凝胶电泳图谱见图1(为随机抽取的 12 份供试材料的基因组总 DNA)。 由图 1 可
见, 基因组 DNA 电泳得到的
条带比较整齐清晰, 分子量
较大且基本无降解断裂, 完
整性好; 75 份腰果种质资源
所提取的 DNA 样品色泽近白
色或无色 , 说明大多数酚
类、 多糖、 蛋白质等物质已
被去除。 从微量分光光度仪
测定分析的 OD值(见表 2)上
看, 12个样品的OD260/OD230值
在 1.80 ~1.97间 , 平均值为
1.91; OD260/OD280值 在 1.74 ~
1.95间,平均值为1.86; DNA
浓度在 1 298.3~3 449.2 ng/μL
间,平均值为2 443.5 ng/μL。 这与高纯度 DNA的标准值 OD260/OD230为 2.0、 OD260/OD280值为 1.8非常接近, 说
明所提腰果基因组 DNA质量和产量均较高。 因此, 本试验提取的腰果基因组 DNA完全达到 RAPD分析的
要求。
2.2 RAPD 扩增结果
从 100个随机引物中共筛选出 45个随机引物, 对 75份腰果供试材料 DNA基因组进行 RAPD-PCR扩
增, 每个引物均能扩增出多条清晰的扩增谱带。 由表 3 和扩增结果电泳图(图 2)可以看出, 45 个引物在
75个供试材料中均可获得多条 DNA扩增片断, 且不同引物扩增的总谱带数和 DNA片断大小均不同, A2、
样品序号 OD260/OD230 OD260/OD280 浓度/ng·μL-1 样品序号 OD260/OD230 OD260/OD280 浓度/ng·μL-1
1 1.97 1.90 2 563.1 7 1.94 1.89 3 449.2
2 1.83 1.89 3 433.8 8 1.91 1.88 2 398.4
3 1.80 1.77 2 819.5 9 1.93 1.92 3 025.6
4 1.90 1.94 2 086.8 10 1.91 1.79 1 298.3
5 1.95 1.95 2 516.3 11 1.94 1.74 1 951.3
6 1.90 1.78 1 451.9 12 1.93 1.91 2 327.8
表 2 腰果叶片基因组 DNA 的 OD 值检测结果
M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
图 1 部分腰果叶片基因组 DNA 的凝胶电泳图谱
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6期 黄伟坚等: 75 份腰果种质资源的 RAPD 分析
A3、 A9、 A11、 A12、 C1、 C4、 C6、 C8 与 D3 引物的总谱带数最多, 都为 11 条; D8、 D14 扩增的总谱带
数最少, 为 6 条。 多态性谱带最多的是 C20, 达到了 100%; 最低的是 A11, 仅为 45.45%。 45 个引物扩
增总谱带数为 407条, 平均每个引物扩增谱带数为 9.04条, 每个引物的多态带为 3~10 条; 扩增谱带的多
态位点有 294 个, 在物种水平上, 多态性位点为 72.24%, 这说明 75 份腰果种质基因组遗传多样性和遗
传基础的丰富性。 从谱带统计结果和 RAPD 扩增结果的电泳图可看出, 不同的引物所扩增出的带数不同,
同一引物, 不同材料间的扩增数也不相同, 反映了各个供试材料间丰富的多态性和复杂的遗传背景。
序号 引物 引物序列(5′-3′) 扩增位点数 多态性位点 多态性(%) 序号 引物 引物序列(5′-3′) 扩增位点数 多态性位点 多态性(%)
1 A2 TGCCGAGCTG 11 9 81.82 25 C11 AAAGCTGCGG 9 8 88.89
2 A3 AGTCAGCCAC 11 7 63.64 26 C15 GACGGATCAG 7 6 85.72
3 A4 AATCGGGCTG 8 5 62.50 27 C16 CACACTCCAG 10 8 80.00
4 A7 GAAACGGGTG 9 7 77.78 28 C20 ACTTCGCCAC 10 10 100
5 A8 GTGACGTAGG 8 6 75.00 29 D1 ACCGCGAAGG 8 4 50.00
6 A9 GGGTAACGCC 11 6 54.55 30 D2 GGACCCAACC 7 5 71.43
7 A10 GTGATCGCAG 8 7 87.50 31 D3 GTCGCCGTCA 11 7 58.33
8 A11 CAATCGCCTG 11 5 45.45 32 D5 TGAGCGGACA 8 6 75.00
9 A12 TCGGCGATAG 11 8 72.73 33 D8 GTGTGCCCCA 6 4 66.67
10 A18 AGGTGACCGT 10 9 90.00 34 D11 AGCGCCATTG 8 6 75.00
11 A19 CAAACGTCGG 10 7 70.00 35 D13 GGGGTGACGA 9 5 55.56
12 A20 GTTGCGATCC 10 6 60.00 36 D14 CTTCCCCAAG 6 3 50.00
13 B1 GTTTCGCTCC 9 8 88.89 37 D15 CATCCGTGCT 9 7 77.78
14 B5 TGCGCCCTTC 8 6 75.00 38 D18 GAGAGCCAAC 7 4 57.14
15 B8 GTCCACACGG 8 6 75.00 39 D19 CTGGGGACTT 8 7 87.50
16 B10 CTGCTGGGAC 10 9 90.00 40 D20 ACCCGGTCAC 7 6 85.71
17 B15 GGAGGGTGTT 8 5 62.50 41 E4 GTGACATGCC 7 5 71.43
18 B17 AGGGAACGAG 9 7 77.78 42 E6 AAGACCCCTC 10 9 90.00
19 C1 TTCGAGCCAG 11 6 54.55 43 E7 AGATGCAGCC 10 5 50.00
20 C4 CCGCATCTAC 11 7 63.64 44 E14 TGCGGCTGAG 10 8 80.00
21 C5 GATGACCGCC 8 5 62.50 45 E20 AACGGTGACC 9 6 66.67
22 C6 GAACGGACTC 11 10 90.91 总计 407 294 72.24
23 C8 TGGACCGGTG 11 7 63.64 平均 9.04 6.53 72.23
表 3 随机引物及扩增结果
图 2 引物 A2 对 75 份腰果种质 DNA 的 PCR 扩增结果
M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 M bp
3 000
2 000
1 600
1 000
517
396
230
M 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 M bp
3 000
2 000
1 600
1 000
517
396
230
M. 1 000 bp DNA Ladder Marker
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热 带 作 物 学 报 31 卷
2.3 聚类分析
75 份材料的遗传相似系数在 0.690~0.936 之间, 平均相似系数为 0.841, 绝大多数种质表现出较高的
遗传相似性, 如 B-4-04 和 B-1-07 遗传相似系数为 0.936, 说明它们的亲缘关系非常接近; B-4-01 和
YN-02-07遗传相似系数最小, 为 0.690, 表明其亲缘关系最远。 研究同时发现 B-4-01与其他种质的遗传
相似系数也都较小, 介于 0.621~0.726 之间, 表明它具有特殊的遗传背景。
根据 RAPD 扩增结果, 得到 75 份腰果种质资源材料的 RAPD-PCR 扩增所有位点的二元数据, 用
NTSYS pc2.02 分析软件, 采用 UPGMA聚类方法对其进行聚类分析, 建立聚类分析树状图(图 3)。
0.690 0.734 0.779 0.823 0.867 0.911 0.956 1.000
75 份腰果品系聚类图 B-1-16
B-1-08
A-6-05
B-6-04
B-1-01
YN-02-04
GA-63
HL2-13
B-3-09
B-2-04
B-7
B-5-02
B-5-05
B-5-01
B-5-04
B-4-02
B-1-04
B-6-03
B-4-03
CF-05
EC-12
FG-04
YZ-03
B-2-09
GF-01
B-2-07
B-6-01
B-2-06
B-2-08
TG-06
B-2-01
B-2-02
TG-07
B-1-15
B-4-04
B-1-07
B-1-14
FC-02
B-3-05
B-3-04
B-2-03
B-4-05
TG-05
TG-01
TG-04
B-3-11
YZ-01
YZ-TD
YZ-02
B-3-03
B-2-05
B-1-06
TG-03
B-1-12
B-1-11
B-3-01
B-1-10
B-1-09
YZ-02-07
EL-30
TG-02
YZ-02-02
YZ-02-06
YZ-02-03
B-3-10
B-5-03
B-2-10
B-1-03
B-6-02
B-3-02
YZ-02-05
YZ-02-01
CP63-36
HL2-21
B-4-01
Coefficient0.79
图 3 75 份腰果种质聚类分析树状图(UPGMA)
898
6期 黄伟坚等: 75 份腰果种质资源的 RAPD 分析
在相似系数 0.79 时, 可将 75 个种质资源分为 16 个类群, 其中包括 1 大类群、 3 小类群和 12 个独立
的个类。 突出了各品系之间的遗传多样性、 遗传相似性和亲缘关系。
12个独立个体分别是: (1)B-4-01; (2)HL2-21; (3)CP63-36; (4)B-3-02; (5)B-6-02; (6)B-1-03;
(7)B-2-10; (8)TG-02; (9)FL30; (10)YN-02-07; (11)B-1-09; (12)B-1-10; 3小类群分别是; (1)YN-
02-01和 YN-02-05;(2)B-5-03、 B-3-10、 YN-02-03、 YN-02-06和 YN-02-02;(3)YN-02-04、 B-1-01、
B-1-08、 B-1-16、 B-6-04和 B-6-05; 1大类群是其余的 50个种质。
由此结果可以看出, 多数来源地相同的种质资源表现出较为亲密的亲缘关系, 但也有不同来源地的
种质资源聚在了一起, 如本地种质资源 HL2-21与国外种质资源 B-4-01聚在了一起。
3 讨论
RAPD技术是由 Williams 等首先创立的一种 DNA分子标记技术[6], 具有效率高, 样品用量少, 灵敏度
高及检测容易等优点, 严格控制试验条件可使结果具有良好的重复性 [7]。 通过形态鉴定、 生化测定等手段
鉴定种质资源存在着数量有限、 位点不足等缺点, 而分子标记具有信息量大、 效率高、 不受环境限制和
影响等特点, 它一般覆盖整个基因组, 可以很好的揭示供试材料群体的遗传多样性[8]。 RAPD 技术应用于
种质资源的遗传多样性分析, 具有快速、 方便、 直观等特点, 但由于 RAPD技术是以 PCR技术为基础的,
其 PCR 的假阳性缺点 RAPD 也会存在, 但通过高纯度 DNA 模板的制备, 加样的准确性, 调整 Mg2+浓度,
可以大大提高 RAPD 的准确性和重复性[9]。 所以, RAPD 技术不仅可以用于种属特异性鉴定[10], 确定进化
关系, 追踪外缘导入基因[11], 而且可以用于基因分离、 定位、 遗传作图[12]等。
本研究结果表明, 利用 RAPD 分析, 从分子水平上检测出腰果不同品系种质资源的遗传差异, 可用
于进行腰果品种的亲缘关系和进行分子水平上的研究。
通过本试验分析获知, 75份腰果种质资源的遗传多态性可以达到 72.24%, 种质资源间的平均相似系
数为 0.841, 说明了供试材料间的遗传多样性较为丰富, 聚类分析结果显示, RAPD 的 45 对引物组合能够
将 75 个腰果种质完全区分开, 表明所有检测腰果种质之间的基因型各不相同, 这与腰果是以虫媒为介的
异花授粉树种[13]的遗传特性相一致。 在整个群体中, 有 66.67%的腰果种质间遗传亲缘关系较近, 相聚后
构成第 I 大类复合组, 共 50 个腰果种质, 表明这一组样株间具有相对较高的遗传一致性。 来源相同的种
质资源表现出较为密切的亲缘关系, 说明了资源间的关系与原产地有比较大的相关性, 这是由于腰果为
雌雄同株异花授粉植物, 同一地区中相互授粉的机会多, 基因交换更频繁, 品种的遗传基础更趋于相似。
但也有来源地不同的种质聚在了一起, 如本地种质 HL2-21 与国外引进种质 B-4-01 聚在了一起, 这种情
况可能是由于地区间的引种交流导致了某些基因在不同地区之间的渗入, 也可能是分子标记方法可反映
基因组本质的差异所致[14]。 研究分析中发现, 某些种质资源之间尽管分子标记结果相似系数较高, 但在植
物学形态特征上却有着较大的差异; 有的分子标记虽然结果相似系数较小, 但仍有一部分形态表现出相
似性, 这可能是长期的人为或自然选择品种形成过程中, 腰果通过种间杂交或与其他品种杂交, 不断丰
富其遗传基础, 使其在地理分布、 生态类型、 形态特征等方面保持着较大的变异度和丰富的多样性。 第 II
组有 6个腰果种质; 第 III 组有 5个腰果种质; 第 IV 组有 2 个腰果种质; 其余组均为只有 1 个腰果种质
构成的独立组。 本试验所采用的 75 份腰果种质资源均为同一种质圃中选出的优良品系, 由于种质圃中的
种质资源收集于世界各地, 其遗传背景不同, 从 UPGMA 树状图上可以看出, B-4-01 和 HL2-21 与其他
种质遗传距离最远, 尤其是 B-4-01与其他种质遗传相似系数最低, 说明它有着较为特殊的遗传背景, 二
者具有独特的育种利用价值。
从筛选出的 45 个 10 个碱基的随机引物对 75 份腰果种质资源的基因组 DNA 进行 PCR 扩增, 共产生
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热 带 作 物 学 报 31 卷
407 条谱带, 其中多态性谱带为 294 条, 多态率达 72.24%, 这与 Archak等[15]应用 AFLP 技术对印度栽培
的 19 个腰果品种利用 6 对引物组合共扩增出 694 条谱带、 何承忠等[16]应用 AFLP 技术对 54 个单株构成
的腰果混杂群体的遗传组成进行分析利用 8 对引物组合共扩增出 467 条谱带研究结果相一致。 表明 75 份
腰果种质资源具有丰富的多态性。 综合聚类分析结果可以看出, 该腰果群体内贮藏有丰富的遗传信息,
为腰果新品种的选育贮备了一定的遗传物质基础。
为了保证腰果种质资源的利用、 新品种(系)的选育和品种改良等提供有力的科学依据, 有必要结合
形态标记与其他分子标记技术, 收集更多的不同基因型腰果种质, 更为全面准确地提示其遗传多样性,
为新品种(系)选育策略的制订提供依据, 为亲本选配、 后代遗传变异程度及杂种优势水平的预测提供预
见性指导。
参 考 文 献
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900
6期
RAPD Analysis of 75 Accessions of Cashew
Germplasm (Anacardium occidentale L.)
Huang Weijian1, Huang Haijie1, Zhang Zhongrun1, Wang Jinhui1, Wu Jiahe2, Liang Lihong1
1 Tropical Crops Genetic Resources Institute, Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences / Key
Laboratory of Tropical Crops Germplasm Utilization, Ministry of Agriculture, Danzhou, Hainan 571737,
China;
2 State Key Laboratory of Plant Genomics, Institute of Microbiology, Chinese Academy of Sciences,
Beijing 100101, China
Abstract Seventy-five accessions of Anacardium occidentale L. collected in China were analyzed by random
amplified polymorphic DNA (RAPD) markers to evaluate their genetic variability and relationships. Forty-
five random primers were used for the amplification of random DNA sequences and generated 407 bands
including 294 polymorphic band with 72.24% polymorphism, which revealed a high degree of genetic
diversity among the 75 collected accessions. The genetic similarity analysis demonstrated that their genetic
similarity coefficients were between 0.690 and 0.936 and the mean was 0.841. The phylogenetic dendro
gram with UPGMA revealed the 75 cashew accessions could be divided into 16 clusters (D=0.79). The
results suggested that the majority of germplasm resources coming from the same ancestor presented closer
relationship in phylogenesis.
Key words Cashew (Anacardium occidentale L.); Genetic diversity; RAPD; Genetic relationship
责任编辑: 高 静
黄伟坚等: 75 份腰果种质资源的 RAPD 分析 901