全 文 ：糯米香（Strobilanthes tonkinensis Lindau）为爵
床科（Acanthaceae）马蓝属 （Strobilanthes）多年生草
本植物， 原产于云南景洪、 临沧等地， 生于低山沟
谷密林下或石灰岩山脚密林下， 泰国和越南也有
分布 [1 -2]。 在 2002 年版的 《中国植物志 》中采纳
Bremekamp 分类系统， 将糯米香归为糯米香属， 因
而这期间发表糯米香的科研论文， 学名普遍采用
Semnostachya menglaensis[3-7]， 也有误把糯米香鉴定
为 Teucrium manghuaense[8-10]。 2011 年的《中国植物
志》英文版则采纳了广泛的马蓝属分类建议， 将糯
米香归为马蓝属， 学名为 Strobilanthes tonkinensis
Lindau， S. menglaensis做为异名处理[2]。
糯米香是一种天然香料和药用植物 [2]， 全株含
有 40 多种香气成分， 主要成分为对人体有益的角
鲨烯和亚麻酸 [8]。 植株干时散发出糯米香气， 除可
供调配香精， 亦可作为酒曲、 饼干、 冰淇淋、 点心
配料， 香气清雅、 滋味醇正爽口， 有独特的糯米清
香。 具有清热解毒、 养颜抗衰的功效， 是一种天然
饮料， 也是云南傣家待客的常用饮料[3]。
近年来糯米香产业发展迅速， 栽培面积和产量
不断提高。 目前国内外对糯米香的研究工作仅见于
引种试种、 繁育技术、 植物营养和挥发性成分的研
究 [4-11]。 而关于其遗传多样性的研究未见报道， 缺
乏开展糯米香引种驯化、 遗传育种等工作的基础资
料。 本研究采用 RAPD 技术， 对中国热带农业科
学院香料饮料研究所收集保存的 12 份糯米香种质
热带作物学报 2011， 32（7）： 1320-1324
Chinese Journal of Tropical Crops
收稿日期： 2011-05-10 修回日期： 2011-07-03
基金项目： 2010年海南省工程中心专项 “糯米香茶高效生产技术集成与示范”； “热带香辛饮料作物种质资源保护” （No. 11RZZY-08）。
作者简介： 吴 刚（1981年—）， 男， 助理研究员。 研究方向： 热带香料饮料作物种质资源。 *通讯作者： 张家明， E-mail: jmzhang@vip.163.com。
糯米香种质资源遗传多样性的 RAPD分析
吴 刚 1，2， 马 帅 3， 张翠玲 1，2， 庄辉发 1，2， 张家明 2，3*
1 中国热带农业科学院香料饮料研究所， 海南万宁 571533
2 海南省热带香辛饮料作物遗传改良与品质调控重点实验室， 海南万宁 571533
3 中国热带农业科学院热带生物技术研究所， 海南海口 571101
摘 要 利用 RAPD 技术， 对 12 份糯米香种质资源进行遗传多样性研究。 从 95 条随机引物中筛选出 41 条条带
清晰、 重复性及多态性好的引物， 对 12 份糯米香种质资源的基因组 DNA 进行 PCR 扩增， 共扩增出 305 条带，
其中扩增条带的多态位点有 120 个， 在物种水平上， 多态性位点百分率为 39.34％， 表明供试糯米香种质资源遗
传多样性较低。 遗传相似性在 0.734 4～0.963 9 之间， 12 份种质表现出较高的遗传相似性。 通过 UPGMA 构建树
状图， 当相似系数为 0.821 时， 12 份种质资源可以聚为Ⅰ和Ⅱ两个类群， 在地理分布图上， 来源地相同或较近
的种质表现出较为亲密的亲缘关系。
关键词 糯米香； 遗传多样性； RAPD
中图分类号 S573 文献标识码 A
Analysis to Genetic Diversity in Strobilanthes tonkinensis by RAPD
WU Gang1，2, MA Shuai3, ZHANG Cuiling1，2, ZHUANG Huifa1，2, ZHANG Jiaming2，3
1 Spice and Beverage Research Institute, CATAS, Wanning, Hainan 571533, China
2 Hainan Provincial Key Laboratory of Genetic Improvement and Quality Regulation for Tropical Spice and Beverage Crops, Wanning,
Hainan 571533, China
3 Institute of Tropical Bioscience and Biotechnology, Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences, Haikou, Hainan 571101, China
Abstract Genetic diversity of twelve accessions of Strobilanthes tonkinensis was evaluated by RAPD. The results
showed that 305 bands were amplified by 41 random primers, among which 120 were polymorphic, accounting for
39.34% of the total bands, which revealed a low degree of genetic diversity among the twelve accessions. The
genetic similarity analysis demonstrated that their genetic similarity coefficients were between 0.734 4 and 0.963 9.
The phylogenetic dendrogram with UPGMA revealed that the twelve accessions could be divided into two clusters
I and II (D=0．821)． More over, the germplasm resources coming from the same geographic area presented closer
relationship in phylogeny．
Key words Strobilanthes tonkinensis; Genetic diversity; RAPD
doi 10.3969/j.issn.1000-2561.2011.07.026.
第 7 期
1.2.2 PCR 扩增 从 Sangon 公司（上海生工生物
工程技术服务有限公司）合成的 95 条 10 碱基的随
机引物中筛选出 41 条条带清晰、 重复性和多态性
好的引物用于 RAPD 分析（引物序列见表 2）。 PCR
反应在 Biometro 公司生产的 T1 Thermocycler 扩增
仪上进行。
反应体系（25 μL）： Taq 酶 5 U/μL（TianGen 公
司）0.5 μL， 10×PCR Buffer（含Mg2+）2.5 μL（TianGen
公司）， 2.5 mmol/L dNTP（TakaRa公司）2.0 μL， 引
物 10 ng/μL（Sangon公司合成 ）1 μL， 模板 DNA
（50 ng/μL）0.5 μL， ddH2O 18.5 μL。
反应条件： 94℃预变性 5 min； 94℃变性 45 s，
38 ℃复性 45 s， 72 ℃延伸 1.5 min， 共 38 个循环；
72℃延伸 10min。 PCR扩增产物于 4℃冰箱中保存。
1.2.3 电泳检测和数据分析 扩增产物在 1×TAE
缓冲液中， 以 1.0％的琼脂糖凝胶（GoldViewTM-Ⅱ
染色）进行电泳， 电压 100 V， 电泳 45 min。 用水冲
净后， 于 Bio-rad 凝胶成像仪上扫描， 用 Quantity
One 软件进行成像分析。 条带的记录， 根据 RAPD
指纹图谱中 Marker （TianGen公司）的分子量标准估
计扩增条带的分子量， 每个供试样品的扩增带按有
或无记录， “有” 赋值为 1， “无” 赋值为 0， 得到
原始数据表征矩阵， 弱带及重复性不好的条带不予
统计。 将图形资料转换成数据资料， 计算单位引物
扩增的条带、 多态性条带及多态性条带百分率。 用
NTSYS pc2.10e 分析软件 ， 采用 UPGMA 聚类方
法， 对 12 份糯米香种质资源进行分析， 得到种质
间的遗传相似性， 并建立样品间的亲缘关系树状图。
2 结果与分析
2.1 RAPD扩增结果
从 95 条随机引物中共筛选出 41 条随机引物，
对 12 份糯米香供试材料进行 RAPD 分析 ， 引物
S1330 扩增的总条带数（总位点数）最多， 为 12 条；
引物 S90和 A18扩增的总条带数最少， 为 4条； 多
态性条带百分率最高的是 S8 和 S203， 为 88.89％；
多态性条带百分率最低的是 A10， 为 10.00％。 共
扩增出 305 条带， 所得的条带大小在 250～3500 bp
之间， 平均每个引物扩增 7.44 条带， 其中扩增条
带的多态位点有 120个， 在物种水平上， 多态性位
点百分率为 39.34％， 说明供试糯米香种质资源遗
传多样性较低。 从条带的统计结果和 RAPD 扩增
结果的电泳图（图1）可看出， 各个供试材料间具有
较为单一的遗传背景。
表 1 材料来源与生境
编号 种质名称 来源地 生境 备注
1 bn-1 云南景洪市四分场六大队 农田 农家种
2 bn-2 云南景洪市嘎洒镇镇政府 农户家 农家种
3 bn-3 云南景洪市嘎洒镇曼播村 农户家 农家种
4 bn-4 云南景洪市嘎洒镇曼科松村 农户家 农家种
5 bn-5 云南景洪市勐腊县勐仑镇 林下 野生种
6 lc-6 云南临沧地区耿马县勐撒镇勐撒农场 农户家 农家种
7 lc-7 云南临沧地区临沧县 农户家 农家种
8 hls-8 云南景洪市勐海县 林下 野生种
9 xl-9 海南万宁香饮所（1992年从云南临沧耿马县） 林下 野生种
10 dh-10 云南德宏芒市法帕镇 农户家 农家种
11 dh-11 云南德宏芒市象滚场镇 农户家 农家种
12 bs-12 云南保山市潞江坝 农户家 农家种
资源遗传多样性进行分析， 探讨其亲缘关系， 以期
为该资源合理有效利用和进行遗传育种、 规模化种
植提供可利用的基础资料。
1 材料与方法
1.1 材料
糯米香种质资源共 12 份均来自云南， 9 份为
农家品种， 3 份为项目组采集的野生植株。 种质
资源详细来源见表 1。 所有种质资源都种植在中
国热带农业科学院香料饮料研究所保育基地 （海
拔 36 m）。
1.2 方法
1.2.1 CTAB法提取 DNA 糯米香基因组 DNA 的
提取： 取冷冻新鲜叶片 0.3 g 放入灭菌研钵中， 加
入液氮， 充分研磨后， 倒入离心管中， 加入 2×CTAB，
65 ℃水中保温 1 h， 不时摇匀。 冷却后离心， 上清
加入等体积的氯仿 ∶异戊醇溶液[24 ∶ 1（V/V）]抽提 2
次， 取上清加 1 μL 核糖核酸酶 H（RNase H， 宝生
物工程有限公司）。 37 ℃静置 30 min， 接着加 2 倍
体积的无水乙醇沉淀， -20 ℃静置 1 h， 离心后沉
淀用 70％乙醇洗 2 次。 沉淀晾干后， 加入 50 mL
ddH2O溶解， -20℃保存。 电泳检测并标定 DNA浓
度至 50 ng/μL， 备用。
吴 刚等： 糯米香种质资源遗传多样性的 RAPD分析 1321- -
第 32 卷热 带 作 物 学 报
序号 引物 扩增位点数 多态性位点 多态性/％ 序号 引物 扩增位点数 多态性位点 多态性/％
1 S8 GTCCACACGG 9 8 88.89 23 S359 GGACACCACT 5 2 40.00
2 S10 CTGCTGGGAC 6 4 66.67 24 S476 CCAAGCTGCC 6 1 16.67
3 S25 AGGGGTCTTG 5 1 20.00 25 S483 GGTCACCTCA 11 5 45.45
4 S28 GTGACGTAGG 6 3 50.00 26 S490 TGTGCCCGAA 11 9 81.82
5 S30 GTGATCGCAG 7 1 14.29 27 S1325 AGTGCACACC 8 1 12.50
6 S38 AGGTGACCGT 5 2 40.00 28 S1329 GGAAGTCCTG 7 1 14.29
7 S54 CTTCCCCAAG 9 4 44.44 29 S1330 CCAGGCTGAC 12 3 25.00
8 S56 AGGGCGTAAG 8 4 50.00 30 S2006 GGACGACCGT 5 2 40.00
9 S80 ACTTCGCCAC 9 1 11.11 31 S1336 GTCTGTGCGG 9 2 22.22
10 S90 AGGGCCGTCT 4 2 50.00 32 A9 GTCACGTAGG 6 1 16.67
11 S91 TGCCCGTCGT 7 3 42.86 33 A10 AGATGACCGT 10 1 10.00
12 S120 GGGAGACATC 5 2 40.00 34 A13 GCGAGACATC 5 2 40.00
13 S129 CCAAGCTTCC 10 3 30.00 35 A14 CCACGCTTCC 10 7 70.00
14 S133 GGCTGCAGAA 6 2 33.33 36 A17 AGCTGGACAC 9 5 55.56
15 S161 ACCTGGACAC 8 1 12.50 37 A18 ACTGCACACC 4 2 50.00
16 S167 CAGCGACAAG 8 2 25.00 38 A19 GGAGGACCGT 6 1 16.67
17 S203 TCCACTCCTG 9 8 88.89 39 A23 TCGGATCCCT 6 1 16.67
18 S242 CTGAGGTCTC 11 5 45.45 40 A27 CCGGGCATAA 7 2 28.57
19 S270 TCGCATCCCT 10 3 30.00 41 A33 CTGCGACAAG 6 1 16.67
20 S276 CAGCCTACCA 5 2 40.00 总计 305 120 39.34
21 S341 CCCGGCATAA 10 8 80.00 平均 7.44 2.93 39.38
22 S358 TGGTCGCAGA 5 2 40.00
表 2 随机引物序列和扩增结果
1 5000
10 000
7 500
5 000
2 500
2 000
1 000
750
500
250
100
bp
M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
M. D 15 000+2 000 Marker； 1～12. 种质资源 DNA 编号。
图 1 A14（左）和 A17（右）引物扩增的 DNA 指纹图谱
2.2 遗传关系和聚类分析
12 份糯米香种质资源 RAPD 分析的遗传相似
性在 0.734 4～0.963 9 之间。 总体上， 12 份种质表
现出较高的遗传相似性， 来自景洪市嘎洒镇的 bn-2
和 bn-4 种质之间的遗传相似性最高， 为 0.963 9；
bn-2和 bs-12的遗传相似性最低， 为 0.734 4（见表
3）。 从地理分布分析， 相距较近的种质资源之间遗
传相似性较高， 相距较远的种质资源之间遗传相似
性相对较低。 UPGMA 构建的树状图中， 当相似系
数为 0.821 时， 12份种质资源可以聚为Ⅰ和Ⅱ两个
类群， 来源地相同的种质大多聚在一起， 表现出了
较为密切的亲缘关系（见图 2）。 bs-12 为较特殊的
个类， 与其他种质的遗传一致性最低， 从地理分布
上看， 该种质也位于与其它种质较远的保山地区。
1322- -
第 7 期
3 讨论与结论
根据中国植物志和地方植物名录的记载， 糯米
香主要集中分布在云南景洪勐腊、 勐海等地， 分布
区较为狭隘。 在德宏、 临沧、 保山等地有引种栽
培， 特别是傣族聚集地， 一些家庭、 农户常在房前
屋后或家中盆栽。 在引种地万宁兴隆中国热带农
业科学院香料饮料研究所基地栽培的糯米香， 每
年都大量开花但偶见自然结实， 人工栽培主要通过
扦插繁殖更新。
基于 41 条引物的 RAPD 分析结果表明， 在物
种水平上， 糯米香多态性位点百分率为 39.34％，
种质资源的遗传相似性在 0.734 4～0.963 9 之间 ，
这在一定程度上体现了供试糯米香种质间的遗传多
态性偏低。 供试样品来源地较为集中可能是其偏低
的原因之一。 Pascale Besse 和 Bory S 等学者对另
外一种热带香料作物墨西哥香荚兰遗传多样性进行
研究时发现， 栽培墨西哥香荚兰遗传多态性低和长
期的割蔓无性繁殖方式相关 [12-13]。 植物繁育系统直
接与种内遗传变异量有关， 它是决定植物遗传多态
性的最主要因素之一[14]。 据调查， 在野外糯米香常
成群分布于林下， 群体中无性繁殖植株占主导地
位； 同时该饮料植物被群众长期采集茎蔓扦插， 通
过无性繁殖扩散， 而所分析的 12 份种质中， 9 份
来自农户栽培引种， 其繁殖方式可能也是其遗传多
编号 bn-1 bn-2 bn-3 bn-4 bn-5 lc-6 lc-7 hls-8 xl-9 dh-10 dh-11 bs-12
bn-1 1.000 0
bn-2 0.924 6 1.000 0
bn-3 0.918 0 0.954 1 1.0000
bn-4 0.908 2 0.963 9 0.937 7 1.000 0
bn-5 0.885 2 0.921 3 0.934 4 0.924 6 1.000 0
lc-6 0.859 0 0.895 1 0.895 1 0.891 8 0.875 4 1.000 0
lc-7 0.859 0 0.895 1 0.921 3 0.891 8 0.882 0 0.960 7 1.000 0
hls-8 0.865 6 0.882 0 0.868 9 0.872 1 0.855 7 0.947 5 0.934 4 1.000 0
xl-9 0.901 6 0.898 4 0.878 7 0.895 1 0.872 1 0.911 5 0.911 5 0.937 7 1.000 0
dh-10 0.790 2 0.813 1 0.819 7 0.809 8 0.826 2 0.852 5 0.859 0 0.826 2 0.829 5 1.000 0
dh-11 0.760 7 0.757 4 0.750 8 0.780 3 0.763 9 0.757 4 0.770 5 0.757 4 0.793 4 0.845 9 1.000 0
bs-12 0.783 6 0.734 4 0.754 1 0.744 3 0.800 0 0.754 1 0.760 7 0.754 1 0.770 5 0.803 3 0.839 3 1.000 0
表 3 糯米香种质资源遗传相似性统计分析结果
bn-1
bn-2
bn-4
bn-3
bn-5
lc-6
lc-7
hls-8
xl-9
dh-10
dh-11
bs-12
0.78 0.83 0.87 0.92 0.96
图 2 糯米香种质资源聚类分析树状图（UPGMA）
Coefficient
吴 刚等： 糯米香种质资源遗传多样性的 RAPD分析 1323- -
第 32 卷热 带 作 物 学 报
态性偏低的另一重要原因。
在聚类分析中， 来源地相同的种质资源表现出
较为密切的亲缘关系， 表现出较多的遗传相似性。
如 bn-2和 bn-4、 lc-6和 lc-7、 以及 dh-10和 dh-11
都最先聚为一起。 本单位规模化种植的糯米香 xl-9
与 hls-8、 lc-6、 lc-7 等 3 份资源最先聚为一组，
其中 lc-6 和 lc-7 都是来自临沧的种质， 显示了较
高的遗传相似性， xl-9 是 1992 年从云南临沧耿马
县引进。 同时从聚类图也可看出， bs-12 为较为特
殊的个类， 与其他种质的遗传一致性最低， 说明它
有着较为特殊的遗传背景。
在对 12 份种质资源的试种保存中也发现， 个
别种质资源存在着香气成分的差异， 叶片散发的香
气有些较为浓香、 有些清淡。 如果生产中糯米香的
香气成分不稳定， 将影响到糯米香茶的品质和口
感， 但这香气成分是遗传因素还是产地来源造成的
还有待进一步的研究。
糯米香作为一种新的香料资源， 熟知者甚少。
但其具管理粗放， 生长快， 产量高等特点， 且随着
我国天然香料产业的迅速发展以及海南省建设国际
旅游岛、 “香岛” 的需要， 糯米香原材料及其特色
旅游产品越来越受到人们的青睐， 产品供不应求。
然而其种质资源和遗传基础方面的研究甚为薄弱，
目前国内还只有中国热带农业科学院香料饮料研
究所进行了初步的资源收集、 保存研究。 进一步加
强资源研究的广度和深度将有利于我国糯米香资源
的可持续利用。
丰富的遗传多样性是物种适应外界环境变化的
物质基础， 农业生产上应用的作物品种类型愈丰富
愈能抵御变化莫测的自然灾害。 综合遗传一致性和
聚类分析结果得出， 供试糯米香种质资源遗传多样
性较低， 资源份数也较少， 应收集更多的野生型种
质资源， 全面揭示其遗传多样性， 为遗传育种、 规
模化种植提供科学依据。
致谢 感谢马帅在实验过程中给予的无私帮助， 以及
中国热带农业科学院热带生物技术研究所生物质能源与植
物代谢工程实验室的谭德冠老师、 孙雪飘老师、 付莉莉师
姐、 吴丽娟师妹给予的大力支持。
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责任编辑： 沈德发
1324- -