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Sequence analysis of chloroplast maturase K gene of Chinese medical plant Eucommia ulmoides

中药杜仲原植物的分子鉴定


杜仲是我国特有贵重中药材,市场供不应求,各地出现许多伪品,为克服目前仅依据形态、显微特征及理化性状进行鉴别的不足,本研究旨在运用分子标记技术鉴定中药杜仲Eucommia ulmoides Oliv的真伪。采用PCR产物直接测序法测定杜仲原植物matK基因序列,通过Clustal软件将其与GenBank中同源序列进行排序比较,分析杜仲序列特征。结果:测定的杜仲matK序列长度为1140bp,同源序列比较分析表明,杜仲matK序列中存在32个特异性位点,其中特异性A、T、C、G位点分别为8,2,11,11,序列中有一个GAC插入为杜仲所独有。matK基因是良好的分子标记,能够为杜仲原植物鉴定提供足够的特异性变异位点,matK基因序列的测序分析可成为杜仲正品鉴定的有效手段。

Duzhong(Eucommia ulmoides)is important Chinese medicine, due to it‘s high price and short supply, many duplicates are found in market. As Traditional taxonomy is difficult to ensure correct identification genuine Eucommia ulmoides, to develop an ultimate and definitive means for origin identification of genuine, the chloroplast matK gene was amplified by PCR using a consensus primer set and its nucleotide sequence was determined by PCR direct sequencing. The characteristic analysis of Eucommia ulmoides matk sequence was generated using Clustal aligned matK sequences of Apocynaceae and some related taxa, Celastraceae, and some most closely related matK sequences. 1140 bp matK gene sequences of Eucommia ulmoides were determined. Among 67 matK sequences analyzed, 32bp were unique in Eucommia ulmoides, including a "GAC" indels. These characteristic nucleotide loci might be used to obtain species-specific RFLP pattern or to design species-specific primers to ultimate identify genuine Duzhong. Chloroplast matK gene sequences might be a good molecular marker to be used to identify traditional Chinese medical plants.


全 文 : 万方数据
142 生态科学 23卷
表l cpDNAmatK测序和PCR扩增引物序列
Thbl PCRandSequencin譬PrimerSequeIlceofchloroplast咖turasel【2ene
弓I物名称 弓I物序列(5’.3’) 引物名称 弓l物序列(5’.3’)
PrimerNamePrimersequence(5’-3’)PrimerName Primers quence(5’.3’)
MGl C1ACTGCAGAACTAGTCGGATGGAGTAGATM l5 ATCTGGGlTGClAA誉薹羹重垂妻薹
辇毒囊萎童薹 萋墓l;i囊薹薹至薹量茎墨董妻薹霎篷墓 孽主豢薹毒 冀囊主鍪娄薹雾雩蚕奏薹萋垂鎏薹氢
薹蚕重茎霎薹茎l州囊!耋霎毫鏊j鸯囊攀善荔蠢墓耄篓妻霪蕈 囊鼙萋囊一!冀曼』塞
誉薹雾要薹砉耋萋囊鐾;蓑≤i喜蓠雪墓蘑地的上部,面积共约91.6hm2。大屏嶂的常绿阔
叶林属于次生天然林,还处于次生演替的前期阶段。
群落的外貌终年常绿,群落结构比较简单,可以
分为乔木层、灌木层和草本层。群落的郁闭度约在0.8
左右。 乔木层的树木参差不齐,但分层现象不明显,
一般只有一层,在局部地区有出现两层。群落的板根
现象不明显,乔木层与灌木层之问有较多的藤本植物。
上层乔木层平均高7~9m,有少数的树高有15m
以上。 树种以壳斗科的小叶青冈Cyclobalanopsis
myrsinaefolia、米槠Castanopsiscarlesii、石栎
Lithocarpusglaber、甜槠Castanopsiseyrei以及蝶形花
科的光叶红豆Ormosiagl berrima等为主。下层乔木
高3~5m,常见的种类有黄牛木、红车Syzygium
rehderianum、野漆树Toxicodendronsucc daneum等。
灌木层高度为3m以下,其中除了有一部分乔木
层优势 树种的幼苗外,主要的组成种类有桃金娘
Rhodomyrtustomentosa、野牡丹Melastomacandidum、
酸藤果 Embeliaaeta、梅叶冬青flexasprella、粗叶榕
Ficushirta等。草本层的覆盖度大概为35%,主要的
种类是 玉叶金花Mussaendapubessens、淡竹叶
Lophatherumgracile、山菅兰Dianellaensifolia、小叶
海金沙 Lygodiumm crophyllum等。
该类型群落还有丰富的层问藤本植物,如菝葜
Smilaxchina、买麻藤、瓜馥木Fissistigmaoldhamii、
粗叶悬钩子Rubusalceaefolius等,这些植物攀援于树
木的枝条上,甚至攀上了树冠,构成了层问植物。
3.1.2 马占相思林马占相思群落是大屏嶂林场主要
的植被类型。该类型植被分布于牛轭曲、早窝子顶、
丑铁炉顶、九坑、骑相公、石岩下、观音鬓,占地
401.8№2。大屏嶂森林公园的马占相思为林木皆伐以
后种植的人工林,长势一般。
马占相思林的群落四季常绿,林相整齐,林木比
较高大,一般高度为14m,胸径15"-20cm,郁闭度
0.7,分布均匀。群落的结构比较简单,可分为乔木层、
灌木层和草本层。
群落的树种组成单一,乔木层都为马占相思。林
下灌木层的覆盖度45%左右,以耐荫树种为主。其中
主要的 是梅叶冬青、毛果算盘子Glochidion
eriocarpum、三桠苦Evodiatepta、降真香Acronychia
pedunculata、野牡丹等。草本层的物种构成则以芒萁
Dicranopterisdichotoma、小n十海金沙、乌毛蕨
Blechnumorientale等为主。
3.1.3油茶林油茶Camelliao e班era林分布在水头
岭、老虎岩等地,面积大约有20.8hm2。油茶林比较
适宜在该地区生长,因此,长势良好。群落的林相整
齐,郁闭度较高,约为O.6,高度在4--一8m之间。群
落为纯林,林下灌层和草本层较稀。灌木层中种类以
展毛野牡丹Melastoman rmale、了哥王聊出troemia
indica、桃金娘等为主。草本层植物以芒萁为主,其问
夹杂有细毛鸭嘴草lschaemumindicum、玉叶金花等。
3.2 草坡
草坡只有一个类型。主要分布于林坑水库、油柑
坑等地的山坡上,面积大约有18.4时。
大屏嶂森林公园的草坡大多是在人工干扰后次生
演替而形成的。灌木种类很少,主要有桃金娘、算盘
子Glochidionpuberum等。草本植物种类以鹧鸪草
Eriachnepallescens.、细毛鸭嘴草占优势,一般叶层
高20--一35cm,覆盖度达80%以上。除了鹧鸪草和细
毛鸭嘴 草以外,还有少量的蜈蚣草Eremochloa
ciliaris、狗牙根Cynodondactylon、白茅hnperata
cylindricaBeauv.var.major、红毛草Rhynchelytrum
repens、莠狗尾草Setariapallide-fusca、芒萁等。其中
芒萁常集群分布,形成一个个的小斑块散布于草坡中。
万方数据
万方数据
中药杜仲原植物的分子鉴定
作者: 章群
作者单位: 暨南大学生命科学学院,广州,510632
刊名: 生态科学
英文刊名: ECOLOGIC SCIENCE
年,卷(期): 2004,23(2)
被引用次数: 10次

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