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红根甘肃桃根系MYB基因片段的克隆及序列分析



全 文 :植物遗传资源学报 2011,12(3) :455-459,463
Journal of Plant Genetic Resources
红根甘肃桃根系 MYB基因片段的克隆及序列分析
魏 潇,曹 珂,王力荣,朱更瑞,方伟超,陈昌文
(中国农业科学院郑州果树研究所,郑州 450009)
摘要:为了明确 MYB转录因子在红根甘肃桃抗性分子机制中的作用,通过 RT-PCR从红根甘肃桃根系 cDNA中克隆了 14
个 MYB基因片段,序列分析表明这些片段与苹果、葡萄、拟南芥、番茄等植物的 MYB转录因子高度同源;系统进化分析显示红
根甘肃桃的 11 个 PkMYB分别与拟南芥、番茄、杨树、柿等植物中已知功能的 MYB转录因子聚在不同的亚类,据此推测它们可
能有相似的功能。试验结果为进一步研究 MYB基因在红根甘肃桃抗性机制中的作用奠定了基础。
关键词:红根甘肃桃;根系;MYB基因;克隆;序列分析
Cloning and Characterization of MYB Genes from Root System of
Honggengansutao Peach(Prunus kansuensis L.)
WEI Xiao,CAO Ke,WANG Li-rong,ZHU Geng-rui,FANG Wei-chao,CHEN Chang-wen
(Zhengzhou Fruit Research Institute,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Zhengzhou 450009)
收稿日期:2010-01-15 修回日期:2010-11-24
基金项目:国家自然科学基金项目(30771480) ;国家“863”计划项目(2006AA100108-4-12)
作者简介:魏潇,在读硕士,研究方向为果树遗传育种。E-mail:weixiao6769@ 163. com
通讯作者:王力荣,研究员,主要从事果树种质资源研究。E-mail:wlirong2009@ sina. com
Abstract:In order to identify the molecular resistance mechanism of Honggengansutao peach(Prunus kansuen-
sis L.) ,14 fragments in MYB genes family were isolated from cDNA in root system of Honggengansutao peach by
RT-PCR. By comparison,we found that their inferred amino acid sequences have high identity with their counter-
parts from apple,grape,Arabidopsis,tomato and other plants in GenBank. The result of phylogenetic analysis showed
that 11 PkMYBs are clustered with known functions MYBs from Arabidopsis,tomato,poplar and persimmon in differ-
ent subgroups. According to above results,we predicted that PkMYBs have similar functions with other MYB pro-
teins. These consequences will provide a foundation of coming research about MYB gene function in resistant mecha-
nism of Honggengansutao peach.
Key words:Honggengansutao peach(Prunus kansuensis L.) ;Root system;MYB genes;Cloning;Sequence
analysis
甘肃桃(Prunus kansuensis L.)是桃(Prunus per-
sica L.)的近缘种,原产于我国西北地区,为我国特
有的野生种质。甘肃桃抗旱、抗寒,是一种抗逆性很
强的桃砧木。红根甘肃桃 1 号是甘肃桃的一种类
型,因其根表皮、韧皮部和木质部均为红色而得名。
朱更瑞等[1]经过多年对桃不同砧木接种南方根结
线虫并鉴定,认为红根甘肃桃对南方根结线虫免疫。
转录因子(transcription factor,TF)是能够与真
核基因启动子区顺式作用元件特异性结合的 DNA
结合蛋白,通过与靶基因及其他相关蛋白的相互作
用,来调节靶基因表达的强度,或控制基因的时空特
异性表达。MYB 类转录因子是植物中最大的转录
因子家族之一,以含有 MYB 结构域为共同特征,广
泛参与植物发育和代谢调控,如调控苯丙烷类次生
代谢途径、参与植物生长信号传导、应答生物和非生
物胁迫、控制植物细胞的形态和模式建成、参与细胞
分化和发育调控等[2-4]。
目前,从多种果树如葡萄、苹果、柑橘、桃、李、
杏、樱桃、扁桃等中已经分离出多个 MYB 基因(NC-
BI检索)。在桃研究中,也曾从桃果肉中分离出参
DOI:10.13430/j.cnki.jpgr.2011.03.027
植 物 遗 传 资 源 学 报 12 卷
与调控花色素苷合成的 MYB 基因 MYB10[5](检索
号:EU155160) ,而与抗逆相关的 MYB 基因鲜有报
道。为了探明红根甘肃桃对南方根结线虫和多种逆
境的抗性分子机制及其与花色素苷含量的关系,本
文根据植物中 MYB基因的保守结构域设计引物,从
红根甘肃桃幼苗根系 cDNA中克隆 MYB 基因片段,
并推测其功能,为红根甘肃桃优异抗逆基因资源的
发掘与利用奠定理论基础。
1 材料与方法
1. 1 材料
1. 1. 1 植物材料 试材红根甘肃桃 1 号取自中国
农业科学院郑州果树研究所国家果树种质桃圃。采
集红根甘肃桃种子,砂藏 3 个月后播于营养基质中,
光周期为光照 16h、黑暗 8 h,25℃下培养。取苗龄
为 1 个月的植株根系提取总 RNA。
1. 1. 2 试剂、菌株和载体 RNA 提取试剂 TRNzol
A +、cDNA第一链合成试剂盒、琼脂糖凝胶 DNA 回
收试剂盒、大肠杆菌 DH-5α感受态均购自北京天根
生化科技有限公司;pGEM-T Easy 载体、T4 DNA 连
接酶均购自 Promega公司。其他生化试剂均为市售
分析纯。
1. 2 方法
1. 2. 1 根系总 RNA 提取 在 Trizol 法(参照
TRNzol-A +总 RNA提取试剂说明书)、CTAB 法[6]和
热酚法[7]的基础上建立了 Trizol-CTAB-SDS 联合裂
解法,具体如下:在 15ml离心管中加入 3ml TRNzol-
A +试剂、3ml CTAB 提取液[6](2% CTAB(W/V)、
2%聚乙烯吡咯烷酮 PVP(W/V)、0. 1mol /L Tris-HCl
(pH 8. 0)、25mmol /L EDTA(pH 8. 0)、0. 5g /L 亚精
胺,2. 0mol /L NaCl)、2ml SDS缓冲液[7]、2ml水饱和
酚(pH 4. 7 ~ 5. 5)、200μl 巯基乙醇,颠倒混匀。取
1g新鲜的根放入液氮中研磨,将粉末迅速转入盛有
裂解液的离心管中,涡旋振荡 60 s,65℃水浴 10min,
中间颠倒混匀 3 ~ 4 次。从水浴中取出后置于冰水
浴中,冷却后于 4℃、12000r /min 离心 20min,将上
清液转入 2 个离心管中,加等体积氯仿,颠倒混匀
10min,静置 5min,于 4℃、12000r /min 离心 15min,
将 2 管上清液转入 1 个离心管中,加入 1 /3 体积
10mol /L LiCl,4℃过夜沉淀。4℃、12000r /min 离心
20min,弃上清液,加 1ml 75%乙醇洗涤沉淀 2 次,置
于超净工作台中干燥 5min,加 20μl 无 RNase 的水
溶解,溶解后转入 1. 5ml离心管中,- 80℃保存。用
1. 2%琼脂糖凝胶电泳检测,核酸蛋白测定仪(ep-
pendorf)测定其浓度和吸光值。
1. 2. 2 引物设计与合成 根据 GenBank 中登录的
拟南芥、番茄、苹果、小麦、水稻等植物 MYB 转录因
子的氨基酸保守区序列,参考曹冬梅等[8]、Romero
等[9]、陈荣敏[10]的序列设计 3 对简并引物(表 1) ,
由 Invitrogen生物技术有限公司合成。
表 1 克隆 MYB基因中所用的简并引物
Table 1 Degenerate primers used in isolating MYB genes
引物名称
Primer
引物序列
Primer sequence(5-3)
退火温度(℃)
Annealing temperature
预计扩增片段长度(bp)
Size of amplified fragments
获得片段数量
No. of fragments
参考文献
Reference
MYB1 F:ATAGAATTCATGTCGTCCGGCAC
R:CCGTCGACTCAAGCGACACTG
60 200 2 [8]
MYB2 F:CGGAATTCTTDATYTCRTTRTCNGT
R:CGGAATTCDSNAARAGYTGYCG
48 180 3 [9]
MYB3 F:GGGCCCCGTGCTGYGARAARRT
R:GGTGGGAGTTCCAGTAGTTCTTDA
TYTCRTT
57 300 9 [10]
1. 2. 3 RT-PCR 克隆目的基因片段 以 1μg RNA
为模板,Oligo(dT)15为引物,按照 TIANScript cDNA
第一链合成试剂盒说明书反转录合成 cDNA 第一
链。以 1μl cDNA第一链产物为模板,用设计的 3 对
引物分别扩增目的片段。PCR 反应体系总体积为
20μl,其中含 10 × PCR Buffer 2μl,dNTP(10mmol /L)
0. 5μl,MgCl2(25mmol /L)1. 5μl,Taq DNA polymer-
ase(5U /μL)0. 2μl,上、下游引物(10μmol /L)各
1μl,加双蒸水至总体积 20μl。反应条件为:94℃预
变性 5min,94℃变性 45s,退火 45s,退火温度见表 1,
72℃延伸 60s,30 个循环,最后 72℃延伸 10min,置
4℃保温。取 5μl PCR扩增产物,用 1. 2%琼脂糖凝
胶电泳检测。
按照琼脂糖凝胶 DNA 回收试剂盒说明回收目
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3 期 魏 潇等:红根甘肃桃根系 MYB基因片段的克隆及序列分析
的片段,连接到 pGEM-T Easy 载体中,转化感受态
大肠杆菌 DH-5α,蓝白斑筛选阳性克隆,经菌落
PCR鉴定后送 Invitrogen生物技术有限公司测序。
1. 2. 4 序列分析和系统进化树的构建 用 NCBI
的 VecScreen 程序去除所测序列中的载体序列,
通过 BLASTN 进行同源性分析。用 DNAMAN
6. 0 软件分析 DNA 序列,翻译出氨基酸序列后在
BLASTP 中搜索相似性高的蛋白质序列,用 Bi-
oedit软件进行多序列比对,用 MEGA 4. 0 软件构
建系统进化树。
2 结果与分析
2. 1 不同 RNA提取方法的对比以及 RNA 纯度和
完整性检测
试验采用 Trizol法、CTAB法[6]和热酚法[7]提取
红根甘肃桃根系总 RNA,效果均不理想,进而在此
三者基础上建立了适于红根甘肃桃根系总 RNA 提
取的 Trizol-CTAB-SDS联合裂解法,得到了高质量的
总 RNA。电泳检测结果如图 1 所示,用 Trizol 法和
CTAB法提取的 RNA电泳条带模糊,表明降解严重
且产率不高;而用热酚法提取检测不到 RNA;只有
用联合裂解法提取的总 RNA显示有 3 条带,分别为
28S、18S 和 5S,电泳带型整齐,基本无拖尾,且 28S
rRNA条带的亮度约为 18S rRNA的 2 倍,说明 RNA
未发生降解,完整性较好。用核酸蛋白测定仪检测
联合裂解法提取的总 RNA 的纯度和浓度,A260 /
280 为 1. 87,A260 /230 为 2. 56,表明 RNA 无蛋白
质、DNA 和其他杂质污染,可以用于下一步试验,
RNA产率为 13. 4μg /g。
图 1 不同 RNA提取方法对比
Fig. 1 Contrast of RNA extracted with different methods
1:Trizol 法;2:CTAB 法;3:热酚法;4:Trizol-CTAB-SDS 联合裂
解法
1:Trizol method;2:CTAB method;3:Hot phenol method;4:Trizol-
CTAB-SDS method
2. 2 MYB 基因片段的克隆和序列分析
以红根甘肃桃根系 cDNA 为模板,利用表 1 中
的 3 对简并引物进行 PCR扩增,结果得到了与预计
片段大小一致的片段(图 2) ,转化测序,得到 22 条
不同的序列。将这 22 条序列通过 BLASTN 与 Gen-
Bank 中登录的不同 MYB 基因序列进行同源性比
对,结果发现这些序列与苹果、葡萄、拟南芥、草莓、
柿、烟草、番茄、小麦、大麦、水稻、金鱼草、白菜、黄
瓜、豌豆、花生、辣椒、蓖麻等物种的 MYB 基因同源
性达到 75% ~90%。
图 2 红根甘肃桃根系MYB基因的 RT-PCR产物
Fig. 2 Conservative MYB genes fragments in root system of
Honggengansutao peach amplified by RT-PCR
with different primers
M:DNA分子量标准 DL2000;1:MYB1 扩增产物;2:MYB2 扩增
产物;3:MYB3 扩增产物
M:DL2000 marker;1:PCR products amplified by MYB1;2:PCR
products amplified by MYB2;3:PCR products amplified by MYB3
用 DNAMAN 6. 0 软件分析得到的 22 个序列,
其中有 14 个能推导出完整的氨基酸序列。分别命
名为 PkMYB1-14。将这 14 个 氨 基 酸 序 列 在
BLASTP中搜索蛋白质序列,结果显示 PkMYB1-14
与苹果、葡萄、拟南芥、大豆、棉花等多个物种的
MYB转录因子的保守结构域高度同源,表明所得到
的片段均为 MYB 基因家族成员的保守区。将本试
验所得的 PkMYB1-14 和与之同源性高的苹果、葡
萄、拟南芥、大豆和棉花的 MYB 蛋白序列进行多序
列比对,结果如图 3 所示,PkMYB1-7 含有典型的
R2R3-MYB 结构域,而 PkMYB8-14 只含有 1 个
MYB结构域,分析其原因可能是由于设计引物时选
择的保守区域长度不同所致。
2. 3 系统进化分析
蛋白质结构域的分组对功能分析很重要,系统
进化树中聚在同一组的蛋白亲缘关系较近,表明它
们具有共同的起源,存在功能相似的可能[11]。为了
对本试验中所得的序列进行功能预测,用 MEGA
4. 0 软件对来自不同物种已知功能的 MYB 蛋白序
列和本试验获得的 14 条序列一起构建系统进化树。
聚类结果如图 4 所示,当演化距离为 0. 15 时聚类结
果可分为 7组,第 1组包含 PkMYB5、PkMYB6 和拟南
芥的 AtMYB87(NP_195492. 2) ,其功能与病原胁迫有
关[12];第 2组只包含桃的 PpMYB10(ABX79945. 1) ,
754
植 物 遗 传 资 源 学 报 12 卷
图 3 红根甘肃桃(推导的MYB氨基酸序列)
与其他几种植物中MYB结构域氨基酸序列比对
Fig. 3 Alignment of amino acid sequences of MYB
domains of Honggengansutao peach(predicted)
and other plants
MdMYB23(DQ074471. 1)来自苹果;VvMYB4a(EF113078. 1)来
自葡 萄;AtMYB102 (NM _118264. 2 )来 自 拟 南 芥;GhMYB9
(AF336286. 1)来自棉花;GmMYB29B2(BAA81736. 1)来自大豆;Pk-
MYB1-14 来自红根甘肃桃
MdMYB23 (DQ074471. 1 ) come from apple; VvMYB4a
(EF113078. 1)come from grape;AtMYB102(NM_118264. 2)come from
Arabidopsis;GhMYB9(AF336286. 1)come from cotton;GmMYB29B2
(BAA81736. 1)come from soybean;PkMYB1-14 come from Honggengan-
sutao peach
其功能为调控花色素苷的合成[5];第 3 组包含 Pk-
MYB7 以及拟南芥的 AtMYB30(NP_189533. 1)、At-
MYB60(NP_172358. 1)、AtMYB96(NP_201053. 2) ,
其功能与抗干旱、病原胁迫有关[12];第 4 组为 Pk-
MYB10;第 5 组为 PkMYB14;第 6 组为 PkMYB13;其
余的 MYB蛋白聚为一大类,为第 7 组。当演化距离
为 0. 10 时,第 7 组的 MYB蛋白又可分为 4 亚类,其
中 PkMYB8、 PkMYB9 与 杨 树 的 PtMYB134
(ACR83705. 1)、柿的 DkMYB(BAI49721. 1)聚为第 1
亚类;PkMYB1 与拟南芥的 AtMYB6(NP_192684. 1)
聚为第 2 亚类;PkMYB2、PkMYB3、PkMYB11、Pk-
MYB12 与拟南芥的 AtMYB13(NP_172108. 1)、At-
MYB102(NP_567626. 1)聚为第 3 亚类;PkMYB4 与
拟南芥的 AtMYB12(ABB03913. 1)、番茄的 SlMYB12
(ACB46530. 1)聚为第 4 亚类。由于第 1 和第 4 亚类
中的已知功能的蛋白与调控类黄酮和原花色素的合
成有关[13-16],因此这些亚类中的 PkMYB 可能也具
有相似的功能;第 2 和第 3 亚类中的 PkMYB的功能
可能与高盐、冷害、干旱、伤害和病原胁迫有关[12]。
图 4 红根甘肃桃(推导的MYB氨基酸序列)
与其他物种MYB蛋白的系统进化树
Fig. 4 Phylogenetic tree of MYB proteins in Honggen
gansutao peach(predicted)and other species
3 讨论
3. 1 红根甘肃桃根系 RNA提取
联合裂解法的优点在于提高了裂解效率和产
率。单独用 CTAB或 SDS裂解,裂解时间相对于 Tr-
izol较长,增加了 RNA降解的风险;单独用 Trizol 裂
解,虽然裂解能力较强、时间短,但容易引起褐化
现象,而采用三者联合裂解缩短了裂解时间,减少
了 RNA被内源 RNase 降解的机会。根系 RNA 含
量低于叶片,如用联合裂解法提取红根甘肃桃叶
片 RNA,产率为 116μg /g,而提取根系 RNA,产率
仅为 13. 4μg /g。Trizol法、CTAB 法[6]和热酚法[7]
中使用的离心管容积为 1. 5ml,而本研究使用了
15ml离心管,同时加大样本量和裂解液量,提高了
RNA产率。
3. 2 MYB基因片段的序列分析
通常,MYB结构域约含 51 ~ 52 个氨基酸,形成
螺旋 -转角 -螺旋的构型,一般有 3 个保守的色氨
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酸残基(W) ,间隔 18 ~ 19 个氨基酸排列,参与空间
结构中疏水核心的形成[12]。R2R3-MYB 类转录因
子含有 2 个串联 MYB结构域,R2 和 R3 中均含有 3
个保守的色氨酸残基,其中 R3 中第一个色氨酸残
基通常为苯丙氨酸(F)或异亮氮酸(I)所代替。Pk-
MYB1-7 含有 R2R3-MYB 结构域,属于 R2R3-MYB
类转录因子;PkMYB8-14 序列较短,含有 1 个 MYB
结构域,属于哪个亚类还有待于进一步研究。
系统进化的聚类结果(图 4)与 Kranz等[17]报道
的拟南芥中 MYB蛋白分类结果一致,证实进化树构
建结果可信。本研究利用同源克隆法从红根甘肃桃
的根 cDNA中得到了 14 个 MYB 基因家族成员的保
守区片段,它们与苹果、葡萄、拟南芥、大豆、棉花等
多个物种的 MYB转录因子的保守结构域高度同源,
其中 11 个 PkMYB 分别与拟南芥、番茄、杨树、柿等
植物中已知功能的 MYB转录因子聚在不同的亚类,
据此推测它们与该类基因具有相似的功能。
3. 3 MYB转录因子的功能
MYB转录因子广泛参与植物次生代谢调控、激
素和环境胁迫的应答,不同的 MYB转录因子在基因
的结构、表达特性及功能方面存在明显的差异。克
隆 MYB基因,明确其功能对于阐明这类转录因子在
转录水平对植物生理代谢调控及逆境胁迫的应答机
制具有重要意义。
MYB转录因子通过调控苯丙烷类代谢途径中
结构基因的表达来调控类黄酮和花色素苷的合成。
如拟南芥的 AtMYB12 和番茄的 SlMYB12 可特异调
控类黄酮的合成[14-15],柿果实中的 DkMYB4 和杨树
的 PtMYB134 能够增加原花色素的合成[13-16]。原花
色素(Proanthocyanidins,PA)是一种无色的类黄酮
物质,参与植物对生物和非生物胁迫的防卫反应。
机械伤害、叶锈菌侵染和紫外线 - B 照射诱导杨树
叶片产生大量原花色素来抵御伤害,而原花色素合
成途径的激活有赖于转录因子 PtMYB134。凝胶迁
移实验(EMSA)表明,PtMYB134 能够与原花色素合
成途径基因 PAL1、DFR1、ANR2 的启动子区结
合[13]。无色花色素(Leucoanthocyanidins)是花色素
苷和原花色素共同的前体物质。本试验所用的试材
红根甘肃桃的根中富含花色素苷和其他类黄酮化合
物,而杨树叶片中也含有花色素苷[13],由此推测红
根甘肃桃根中也含有原花色素,而从其根系 cDNA
中分离的 PkMYB4、PkMYB8、PkMYB9 又与调控苯
丙烷代谢途径的 MYB蛋白聚为 1 类,因此可能参与
调控原花色素合成途径,通过增加原花色素含量来
抵御根结线虫的侵染。然而,从桃果肉中分离参与
调控花色素苷的合成的 PpMYB10(ABX79945. 1)[5]
与本试验红根甘肃桃根中的 PkMYB4、PkMYB8、Pk-
MYB9 关系较远,可能与调控不同的酶有关。
在逆境胁迫下,MYB转录因子可与许多功能基
因启动子区中的 MYB结合元件结合,从而激活胁迫
应答基因的表达。MYB 转录因子受到各种环境因
子诱导,如干旱、低温、机械伤害、病原等。拟南芥的
AtMYB6 对低温和 NaCl胁迫比较敏感,其表达还受
到外源 ABA 和水分胁迫调节[18];AtMYB13 的表达
受到干旱、外源 ABA、光、机械伤害调节[19];At-
MYB30 则能够加快和强化过敏性坏死反应的出现,
从而使植株表现抗性[20]。红根甘肃桃具有抗旱、抗
寒、抗根结线虫等特性,从其根系 CDNA 中分离的
多个 PkMYB与拟南芥中应答生物与非生物胁迫的
MYB蛋白序列聚在不同的亚类,可能与其具有相似
的功能。
植物对生物和非生物胁迫的应答反应是一个涉
及多基因、多信号途径、多基因产物的复杂过程,本
文从红根甘肃桃幼苗根系 cDNA 中得到了 14 个不
同的 MYB基因片段,根据序列同源性和系统进化分
析预测了部分基因的功能,然而对于不同 MYB转录
因子之间的调控网络尚缺乏深入研究。因此,开展
这些 MYB基因在次生代谢过程以及逆境、病原诱导
下的表达研究,从而揭示 MYB基因在红根甘肃桃抗
性机制中的作用将是下一步研究的重要内容。
参考文献
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(下转第 463 页)
954
3 期 林清芳等:蒙古沙冬青总 RNA提取与 mRNA分离方法的研究
行了提取。结果用第 1 种方法提取的部分样品(尤
其夏季嫩叶)总 RNA 沉淀呈透明浅黄色凝胶状,虽
然沉淀量较多但水溶性较差,导致 RNA得率不高且
在电泳图谱中可见明显的基因组 DNA污染(如图 1
泳道 4)。推测可能与夏季嫩叶生长旺盛,多糖和次
生代谢物质含量高而不易去除有关。第 2 种方法是
在经典热酚法的 RNA提取液中增加了 KAc 以去除
多糖,用此方法得到的 RNA提取液及其沉淀呈浅褐
色且得率低(如图 1 泳道 2) ,表明有酚类物质干
扰[6,13]。这 2 种方法都不适用于蒙古沙冬青嫩叶、
尤其是夏季嫩叶总 RNA的提取。
Trizol法因操作简单而得到广泛应用。本研究
通过在 Trizol试剂中增加 β-巯基乙醇而抑制了酚类
物质的干扰[6,13],但可能因为多糖等物质未能有效
去除,使得 RNA提取量依然不高(如图 1 泳道 3) ,
故该方法也不能满足对高质量蒙古沙冬青总 RNA
提取的要求。
热酚法的优点是适用于大量提取且 RNA 纯度
较高,可在乙醇中长期保存而不降解。本研究针对
蒙古沙冬青的特点对其主要加以 2 点改进:一是在
提取液中增加了 2%的 β-巯基乙醇,以抑制多酚氧
化酶的活性而排除酚类物质干扰[6,13];二是在提取
液中加入 1. 25 mol /L KAc,以去除多糖污染[6,13-14]。
对于 β-巯基乙醇的用量和 KAc 的浓度及 pH 值无
需十分精确,如果是冬季嫩叶和低温驯化的幼苗,二
者浓度均可减少,KAc 母液的 pH 值可调在 4. 8 ~
6. 5。此方法适用于蒙古沙冬青不同季节嫩叶和不
同胁迫处理幼苗总 RNA 的提取,不仅得率高、完整
性好,而且多糖、酚类和蛋白质等基本去除干净,已
成功应用于蒙古沙冬青 SMART 全长 cDNA 文库的
构建(另有全文发表)和基因扩增。
在构建全长 cDNA文库时需要高质量的 mRNA
作模板。本试验所用 Promega公司的 mRNA分离试
剂盒(磁珠法)比 QIAGEN 公司的 mRNA 分离试剂
盒(纤维素柱)更能有效地去除 rRNA,使 mRNA 纯
度更高。另外,前者价格也较便宜,至少在分离沙冬
青 mRNA时不失为一种较理想的选择。
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