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Real-time PCR检测黄牛、牦牛、犏牛睾丸组织中Boule、Dazl基因mRNA表达



全 文 :·研究报告·
生物技术通报
BIOTECHNOLOGY BULLETIN 2012年第10期
收稿日期 : 2012-04-05
基金项目 : 国家星火计划项目(2010GA870003), 青海省科技计划项目(2010-Z-718), 青海省犏牛示范项目(青农函 [2010]395 号)
作者简介 : 付永 , 男 , 硕士 , 助理研究员 , 研究方向 : 分子遗传学 ; E-mail: qhfuyong@163.com
通讯作者 : 魏雅萍 , 女 , 研究员 , 研究方向 : 动物遗传育种与繁殖 ; E-mail: yapingyue@yahoo.com
牦牛是青藏高原主要畜种,具有耐粗、耐寒等
特性,对高寒缺氧的高原环境具有极强的适应性,
为了提高牦牛的生产性能,我国从 20 世纪 50 年代
开始采用良种黄牛与牦牛进行杂交,杂种一代犏牛
生产性能明显优于牦牛,但由于犏牛雄性不育使其
在生产和育种中的应用均受到了极大的限制。因此,
Real-time PCR检测黄牛、牦牛、犏牛睾丸组织中
Boule、Dazl基因 mRNA表达
付永1 魏雅萍1 吴克选1 陈生梅1 张立成2 王谢忠2 孟茹3
(1 青海省畜牧兽医科学院,西宁 810016 ;2 青海省动物疫病预防控制中心,西宁 810001 ;3 西宁市畜牧兽医站,西宁 810003)
摘 要: 旨在探讨 DAZ基因家族 Dazl和 Boule基因与犏牛雄性不育的关系。采用实时荧光定量 PCR技术检测黄牛、牦牛和
犏牛睾丸组织中 DAZ基因家族 Boule和 Dazl基因mRNA表达并进行分析。结果表明,Boule和 Dazl熔解曲线扩增产物呈现单特异峰,
具有较高的灵敏度和特异性;标准曲线显示 Ct值与重组质粒浓度间线性关系良好,相关系数均大于 0.999;mRNA表达分析显示,3
种牛中 Dazl基因在犏牛睾丸组织中表达量最低,其中黄牛与牦牛、黄牛与犏牛差异显著(P<0.05),犏牛与牦牛差异不显著(P>0.05);
Boule基因在 3种牛睾丸组织中的表达量显示,黄牛与牦牛差异不显著(P>0.05),黄牛、牦牛与犏牛差异显著(P<0.05)。结果提示,
Dazl和 Boule基因可作为研究犏牛雄性不育的候选基因。
关键词: 犏牛 雄性不育 Boule基因 Dazl基因 荧光实时定量 PCR
Expression of Boule and Dazl mRNA in Cattle,Yak and Cattle-yak
Testis Tissue by Real-time PCR
Fu Yong1 Wei Yaping1 Wu Kexuan1 Chen Shengmei1 Zhang Licheng2 Wang Xiezhong2 Meng Ru3
(1Qinghai Academy of Animal and Veterinary Science,Xining 810016;2Qinghai Animal Disease Control Center,Xining 810001;
3Animal Husbandry and Veterinary Station of Xining,Xining 810003)
Abstract: To study the relationship of Dazl and Boule gene that was in DAZ gene family with cattle-yak. Using Real-time fluorescence
quantitative PCR technique to detect and analysis the expression of Boule and Dazl mRNA in cattle, yak and cattle-yak testis tissue. The
melting curve analysis showed the product was specific to a single peak, with high sensitivity and specificity. The results showed a good linear
relationships (R2>0.999) between the Ct value and the concentration of plasmid for each gene on the condition. The results showed that, testis
tissue expression of Dazl gene in cattle-yak is the lowest, in which cattle and yak, cattle and cattle-yak were significant difference (P<0.05),
cattle-yak and yak was not significant difference (P>0.05); testis expression of Boule gene in three bovine showed that, no significant difference
of cattle and yak (P>0.05), cattle and yaks had significant difference (P<0.05) with cattle-yak. The results suggest that, Dazl and Boule gene
can be a candidate gene for male sterility of cattle-yak.
Key words: Cattle-yak Male infertility Boule gene Dazl gene Real-time quantitative PCR
近年来犏牛雄性不育的研究是牦牛杂交改良中的一
大热点和难点[1,2]。当前对牦牛远缘杂种不育问题
的研究还基本停留在形态组织学观察的水平上[3],
在基因水平的研究甚少。
DAZ 基因家族包括 Daz(Deleted in Azoospermia)、
Dazl(DAZ-like)和 Boule 基因,三者的编码蛋白均
2012年第10期 151付永等 :Real-time PCR 检测黄牛、牦牛、犏牛睾丸组织中 Boule、Dazl 基因 mRNA 表达
为 RNA 结合蛋白,在生殖细胞中特异表达,参与调
节生殖细胞的发育和分化,是精子发生过程中减数
分裂的主要调控因子[4]。Dazl 基因在脊椎动物的生
殖细胞中表达,对生殖细胞的分化非常重要,突变
或缺失将导致雄性不育[5]。Boule 基因在睾丸组织
中特异表达,是精子发生过程中减数分裂转换的主
要调控因子,可能是牛精子发生的潜在调控因子[6]。
实时荧光定量 PCR 技术具有敏感、快速和准确等特
点,目前成为研究基因表达的首选方法[7]。
本研究采用 Real-time PCR 检测黄牛、牦牛和犏
牛睾丸组织中 Dazl 和 Boule 基因 mRNA 表达,探析
DAZ 基因家族中 Dazl 和 Boule 基因与犏牛雄性不育
的关系,旨在为揭示牦牛杂种的不育机制提供理论
依据和技术支持。
1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 试验动物 在青海省贵南县过马营镇选取成
年健康公黄牛、公牦牛和公犏牛各 10 头,屠宰后立
即采集睾丸,迅速置于液氮中保存。
1.1.2 主要试剂和仪器 总 RNA 提取试剂盒为上
海飞捷生物有限公司产品 ;反转录试剂盒和 SYBR
Premix Ex TaqTM II 荧光定量试剂盒为大连 TaKaRa 公
司产品 ;PCR 扩增试剂盒和质粒 DNA 抽提试剂盒
为上海生工生物工程有限公司产品 ;胶回收试剂盒
为 OMEGA 公司产品。凝胶成像系统(Dolphin-Doc,
美国 Wealtec 公司)、PCR 仪和实时荧光定量 PCR 仪
(ABI 7500,美国 ABI 公司)。
1.2 方法
1.2.1 引物设计与合成 以看家基因β-actin 为内参,
从 GenBank 检 索 牛 Dazl(GenBank 登 录 号 EF50-
1823.2)、Boule(GenBank 登 录 号 EU050657.1) 和
β-actin(GenBank 登录号 NM_173979)mRNA 序列,
综合考虑引物设计的各项原则,在 Primer Premier 3.0
软件中设计引物。引物由上海生工生物工程有限公
司合成,引物序列的相关信息见表 1。
表 1 引物信息
基因 引物序列(5-3) 扩增长度(bp) 退火温度(℃)
Dazl F :tcctcctccaccacaatttcR :gctccggtgtcaacttcatt 270 57
Boule F :acttctgtcccaccaccttgR :aggcaggagactgaggaaca 154 56
β-actin F :tccctggagaagagctacgaR :tagaggtccttgcggatgtc 179 58
1.2.2 RNA 提取与反转录 各牛睾丸组织的总 RNA
提取按照总 RNA 抽提试剂盒(上海飞捷生物有限
公司)的操作说明书进行,提取结果用紫外分光光
度计和琼脂糖电泳检测其质量。采用反转录试剂盒
进行 RNA 反转录。反应体系为 20 μL :包括 5 μL 总
RNA,反转录酶 1 μL,oligo(dT)引物 1 μL,随机
引物 1 μL,5×RT Buffer 4 μL,加 ddH2O 至 20 μL 混
匀,37℃ 15 min,85℃ 5 s。反转录产物于 -20℃保存。
1.2.3 Dazl 和 Boule 基因 PCR 扩增、克隆测序
及 Real-time PCR 反应 使用 PCR 扩增试剂盒进行
PCR 扩增。扩增体系为 25 μL :包括 12.5 μL 2×PCR
buffer,0.6 μL 上游引物,0.6 μL 下游引物,5 μL RT
产物,加水至 25 μL。扩增程序 :94℃ 4 min ;95℃
50 s,退火(温度参见表 1)30 s,72℃ 30 s,40 个
循环;72℃ 7 min。PCR 产物经琼脂糖凝胶电泳分离,
用 E.Z.N.A.TM DNA 凝胶回收试剂盒纯化(按说明书
操作)。回收的 DNA 片段与 pMD18-T Simple vector
载体连接并转化 DH5α 菌株。挑取阳性克隆,用
SanPrep 柱式质粒 DNA 抽提试剂盒提取质粒,PCR
鉴定后送上海生工生物工程有限公司测序。
mRNA 表达水平利用 ABI7500 实时荧光定量仪
来评估。使用 SYBR Premix Ex TaqTM II 荧光定量试
剂盒进行定量 PCR。反应体系为 20 μL :包括模板 2
μL,SYBR Premix Ex TaqTM II (2×) 10 μL,10 μmol/L
上游引物 0.8 μL,10 μmol/L 下游引物 0.8 μL,Rox
Reference Dye II (50×) 0.4 μL,加无菌双蒸水 6 μL。
反应程序 :95℃预变性 30 s ;95℃ 5 s,退火(温度
参见表 1)20 s,72℃ 34 s,40 个循环 ;95℃ 15 s,
生物技术通报 Biotechnology Bulletin 2012年第10期152
60℃ 1 min,95℃ 15 s,以 β-actin 为内参,每个样
品 3 个重复。分别取 Boule 和 Dazl 10 倍系列稀释
的(100-10-6)7 个克隆有目的片段的重组质粒作为
标准品,根据优化的条件在 ABI 7500 荧光定量 PCR
仪上进行扩增,采用三步法进行反应,反应体系为
20 μL,采用自动分析软件绘制标准曲线。
1.2.4 数据统计 定量结果用 SPSS17.0 软件进行统
计分析,文中数据均为平均数 ± 标准差(Mean±SD)
采用 One-Way ANOVA 分析,P<0.05 为差异有显著
性意义。
2 结果
2.1 RT-PCR 扩增结果
如图 1 所示,在黄牛、牦牛和犏牛睾丸组织中,
Dazl、Boule 和 β-actin 基因引物的 RT-PCR 扩增特异
性条带分别为 270 bp、154 bp 和 179 bp,与预期结
果一致。将 Dazl、Boule 和 β-actin 基因的扩增片段
克隆于 pMD18-T vector 中,用 DNAMAN 对测序结果
与引物设计源序列进行同源性比较,结果显示各基
因与引物设计源序列同源性达 99%,表明 PCR 扩增
片段为黄牛、牦牛和犏牛特异的 Dazl、Boule 和 β-actin
图 1 黄牛、牦牛和犏牛睾丸组织中 Dazl、Boule和 β-actin基因的 RT-PCR电泳图
M. DL1200 DNA Marker;1-3.分别为黄牛、牦牛和犏牛 Dazl基因扩增片段;4-6.分别为黄牛、牦牛和犏牛 Boule基因扩增片段;
7-9.分别为黄牛、牦牛和犏牛 β-actin基因扩增片段
基因 cDNA 片段。
2.2 标准曲线的建立及熔解曲线分析
Boule 和 Dazl 基因 10 倍系列稀释的(100-10-6 )
7 个拷贝量的重组质粒作为标准品,根据优化的条
件在 ABI 7500 荧光定量 PCR 仪上进行扩增,采用
自动分析软件绘制标准曲线(图 2,图 3)反应呈现
良好的线性关系,相关系数均在 0.999 以上,对熔
解曲线(图 4,图 5)分析表明,溶解温度 Tm=(84±
0.4)℃处出现单特异峰,无引物二聚体及非特异性
扩增产物出现,扩增效果良好。
2.3 黄牛、牦牛和犏牛睾丸组织Dazl基因mRNA表
达水平
用Real-time PCR法对 3种牛Dazl 基因表达量进
行分析,结果(表 2,图 6)显示,黄牛睾丸组织
Dazl 基因 mRNA 表达量(8.398 0±2.261 46)均显著
高于牦牛睾丸组织 Dazl 基因 mRNA 表达量(1.202 0±
0.705 39),与犏牛睾丸组织 Dazl 基因 mRNA 表达
量(0.981 0±0.258 99)(P<0.05)。而牦牛睾丸组织
Dazl 基因 mRNA 表达量(1.202 0±0.705 39)和犏牛
睾丸组织Dazl基因mRNA表达量(0.981 0±0.258 99)
差异不显著(P>0.05)。
2.4 黄牛、牦牛和犏牛睾丸组织Boule基因mRNA
表达水平
用 Real-time PCR 法对 3 种牛 Boule 基因表达量
进行分析,结果(表 3,图 7)显示,黄牛睾丸组织
Boule 基因 mRNA 表达量(11.433 4±0.997 78)、牦牛
睾 丸 组 织 Boule 基 因 mRNA 表 达 量(11.156 3±
1.137 36),均显著高于犏牛睾丸组织 Boule 基因
mRNA 表达量(5.900 7±0.775 76)(P<0.05),而黄牛
睾 丸 组 织 Boule 基 因 mRNA 表 达 量(11.433 4±
0.997 78)与牦牛睾丸组织 Boule 基因 mRNA 表达量
(11.156 3±1.137 36)差异不显著(P>0.05)。
2012年第10期 153付永等 :Real-time PCR 检测黄牛、牦牛、犏牛睾丸组织中 Boule、Dazl 基因 mRNA 表达
3 讨论
荧光定量 PCR 技术为组织 mRNA 检测提供了
一种敏感性和准确性较高的试验方法[8]。目前,常
图 2 Boule基因荧光定量 PCR标准曲线 图 3 Dazl基因荧光定量 PCR标准曲线
图 4 Boule基因荧光定量 PCR熔解曲线
图 6 黄牛、牦牛和犏牛睾丸组织 Dazl基因
mRNA表达水平
不同字母表示差异显著(P< 0.05),相同字母表
示差异不显著(P> 0.05)。下同
图 5 Dazl基因荧光定量 PCR熔解曲线
图 7 黄牛、牦牛和犏牛睾丸组织 Boule
基因 mRNA表达水平
表 2 黄牛、牦牛和犏牛睾丸组织 Dazl基因mRNA
表达水平的方差分析
变异来源
Dazl
平方和(SS) 自由度(df) 均方(MS) F 值
种类间 356.144 2 178.072 94.071*
种类内 51.110 27 1.893
总变异 407.253 29
* 表示差异显著。下同
表 3 黄牛、牦牛和犏牛睾丸组织 Boule基因 mRNA
表达水平的方差分析
变异来源 Boule平方和(SS) 自由度(df) 均方(MS) F 值
种类间 194.363 2 97.181 100.848*
种类内 26.018 27 0.964
总变异 220.381 29
生物技术通报 Biotechnology Bulletin 2012年第10期154
用的荧光定量 PCR 包括荧光探针和 SYBR Green Ι
两种方法,其中 SYBR Green Ι 具有操作简单、成
本低、无污染、高效益、引物设计合成简便等优点,
是目前研究基因表达较为常用的方法之一[9]。本研
究 Boule 和 Dazl 基 因 SYBR Green Real-time PCR 熔
解曲线扩增产物呈现单特异峰,由于 SYBR Green Ι
是一种能够与任何 dsDNA 结合而发出荧光,其反应
的特异性完全取决于扩增的引物[10],表明所设计的
引物具有较好的特异性,同时 Boule 和 Dazl 基因的
SYBR Green Real-time PCR相关系数均在0.999以上,
表明 Ct 值与重组质粒浓度间具有良好的线性关系。
DAZ 基因家族包括 Daz、Dazl 和 Boule 基因,
是精子生成的重要调控因子。Dazl 起源于 Boule 基
因,位于人类 2 号染色体,Boule 位于人类的 3 号染
色体上,是 DAZ 基因家族的祖先基因[11]。1997 年,
Reijol 等[12]克隆了小鼠 DAZ 同源基因 Dazl,它定
位于小鼠 17 号染色体,在睾丸中表达而在无精小鼠
中未检测到 Dazl 基因的表达。Dazl 基因是脊椎动物
亚门各物种精子发生的重要调控因子[13-15],在脊椎
动物的生殖细胞中特异表达,对生殖细胞的分化非
常重要,突变或缺失将导致雄性不育[16],所以推测
Dazl 基因在牦牛的精子生成过程中也起着重要的作
用。张庆波[17]对黄牛、牦牛和犏牛 Dazl 基因的组
织表达特征进行分析,结果显示,Dazl 基因仅在成
年黄牛和成年牦牛睾丸、卵巢组织中表达,在成年
犏牛的卵巢组织中表达,而在睾丸组织中检测不到
表达信号,得出了 Dazl 基因与犏牛的雄性不育有关。
而本研究采用实时荧光定量 PCR 技术检测 Dazl 基因
在 3 种牛睾丸组织中的表达量,研究结果显示犏牛
睾丸组织中有 Dazl 基因的表达,只是在睾丸组织中
的表达量很低,其中黄牛与牦牛、黄牛与犏牛差异
显著(P<0.05),犏牛与牦牛差异不显著(P>0.05),
说明 Dazl 基因是一个与生殖相关的基因。
1996 年,Eberhart 等[18]在果蝇中发现了 DAZ
基因的同源基因 Boule,与 DAZ 基因一样,Boule 基
因的编码蛋白含有一个 RNA 结合基序,在睾丸组织
中特异表达,进一步研究发现,Boule 基因是精子发
生过程中减数分裂转换的主要调控因子,果蝇、人
等睾丸组织 Boule 基因表达缺乏会导致无精子症并
产生不育[19],所以推断和其它动物一样,Boule 基
因与牦牛的精子生成过程密切相关。李新福[20]对
犏牛和黄牛睾丸组织中 Boule 基因 mRNA 表达水平
进行了荧光定量 PCR 检测,结果显示,Boule 基因
在黄牛睾丸组织中 mRNA 表达量高于犏牛 ;而本研
究对 Boule 基因在黄牛、牦牛和犏牛 3 种牛睾丸组
织的表达量同时进行实时荧光定量 PCR 检测,结
果显示黄牛睾丸组织中 Boule 基因 mRNA 表达量与
牦牛差异不显著(P>0.05),黄牛、牦牛与犏牛差
异显著(P<0.05)。这可能是由于 Boule 基因突变
主要影响第一次减数分裂中期生殖细胞,使其不
能形成正常的染色体,不能发生细胞核膜分解有
关[21],同时 Boule 基因 mRNA 表达水平降低可能
与犏牛精母细胞减数分裂障碍有关。本研究在犏牛
中检测到有 Boule 基因的表达而且表达量显著低于
黄牛和牦牛,可作为研究犏牛雄性不育的重要候选
基因。
4 结论
本试验采用 SYBR Green Real-time PCR 检测黄
牛、牦牛和犏牛睾丸组织中 DAZ 基因家族 Boule 和
Dazl 基因 mRNA 表达,结果显示 Boule 和 Dazl 基
因熔解曲线扩增产物呈现单特异峰,表明所设计的
引物具有较好的特异性,标准曲线显示 Ct 值与重
组质粒浓度间线性关系良好,表明试验可靠性较
高。mRNA 表达分析结果显示,Boule 和 Dazl 基因
在犏牛睾丸组织中表达量最低,这一分布可能与犏
牛精子发生过程中减数分裂调控作用相关,有待进
一步深入研究。本研究进一步证实了 DAZ 基因家族
Boule 和 Dazl 基因可作为研究犏牛雄性不育的候选
基因,最终为揭示牦牛杂种不育机制提供技术平台。
参 考 文 献
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(责任编辑 马鑫)