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Promoter engineering of Escherichia coli K4 for production of fructosylated chondroitin

启动子工程改造大肠杆菌K4生产果糖软骨素



全 文 :第 12卷第 3期
2014年 5月
生  物  加  工  过  程
Chinese Journal of Bioprocess Engineering
Vol􀆰 12 No􀆰 3
May 2014
doi:10􀆰 3969 / j􀆰 issn􀆰 1672-3678􀆰 2014􀆰 03􀆰 004
收稿日期:2013-03-04
基金项目:中组部青年拔尖人才支持计划;国家重点基础研究发展计划(973计划)(2013CB733600);江苏省科技支撑计划(2012617);江苏省
杰出青年基金(BK2012002)
作者简介:吴秋林 ( 1987—),女,四川达县人,硕士研究生,研究方向:食品微生物制造工程;刘立明 (联系人),教授, E⁃mail: mingll @
jiangnan􀆰 edu􀆰 cn
启动子工程改造大肠杆菌 K4生产果糖软骨素
吴秋林1,2,3,刘  佳1,2,3,杨爱华1,2,3,刘立明1,2,3
(1􀆰 江南大学 食品科学与技术国家重点实验室,无锡 214122;2􀆰 江南大学 工业生物技术教育部
重点实验室,无锡 214122;3􀆰 江南大学 食品微生物制造工程实验室,无锡 214122)
摘  要:为了进一步提高大肠杆菌 K4发酵生产果糖软骨素(K4CPS)的产量,将合成基因簇 region 3启动子(PR3)
3′端非翻译区(UTR)进行缺失突变,研究其对突变菌株 K4CPS合成的影响。 研究表明:在 ops序列(RfaH蛋白结合
位点)存在时,PR3启动子强度和 K4CPS产量与 UTR的长度变化无关;但 ops序列缺失时,UTR的延长可导致 PR3
启动子的强度和 K4CPS产量均低于对照菌株;反之,UTR的缩短能显著提高 PR3启动子的强度, 进而使 K4CPS产
量比原菌增加了 46%,达到 751 mg / L。
关键词:硫酸软骨素;大肠杆菌 K4;启动子工程;Red同源重组
中图分类号:TQ923        文献标志码:A        文章编号:1672-3678(2014)03-0019-07
Promoter engineering of Escherichia coli K4 for production
of fructosylated chondroitin
WU Qiulin1,2,3,LIU Jia 1,2,3,YANG Aihua 1,2,3,LIU Liming1,2,3
(1􀆰 State Key Laboratory of Food Science and Technology,Jiangnan University,Wuxi 214122,China;
2􀆰 The key Laboratory of Industrial Biotechnology of the Ministry of Education,Jiangnan University,Wuxi 214122,China;
3􀆰 Laboratory of Food Microbial Manufacturing Engineering,Jiangnan University,Wuxi 214122,China)
Abstract:The capsular polysaccharide of Escherichia coli K4 was almost identical to chondroitin, a
commercially valuable biopolymer􀆰 In order to further improve the productivity of K4CPS by E􀆰 coli K4,
the modification of 3′ untranslated region(UTR) of the capsule gene cluster region 3 promoter( PR3)
were investigated􀆰 The mutants with UTR deletion were screened and confirmed by PCR analysis and
sequencing􀆰 The fermentation and quantitative real time RCR results suggested that the changes of UTR
sequence as ops sequence remain did not affect the production of K4CPS and the transcription of
PR3􀆰 Compared with the wild type,PR3 transcription level and the K4CPS yield of the insertion mutant
with ops sequence deletion were decreased􀆰 Mutant strain was constructed by deleting both of UTR and ops
sequence,however,PR3 transcription level was increased by 2⁃fold and the K4CPS yield reached 751
mg / L,with an increase of 46%􀆰
Key words:chondroitin sulfate;Escherishia coli;promoter engineering;Red recombination
    硫酸软骨素( chondroitin sulfate,CS)作为糖胺
聚糖类大分子酸性多糖,广泛存在于人体组织中,
被誉为人体“软黄金” [1]。 因其具有多种生理活性
而作为膳食补充剂和保湿剂,被广泛应用于食品和
化妆品领域[2-3]。 硫酸软骨素二糖单体结构为 4
GlcA β 1,3 GalNAc β 1(GlcA:葡萄糖醛酸,
GalNAc:乙酰半乳糖胺),根据硫酸化发生位点的不
同可分为 O、A、B、C、D、E和 F等类型,其中,动物来
源的硫酸软骨素多为 CS A和 CS C[4]。 目前,硫
酸软骨素主要来源于动物提取[5]、酶法合成[6]和微
生物发酵,但由于动物提取法存在生产周期长而酶
法合成原料成本高等缺点,限制了其进一步应用。
因此,微生物发酵法已成为最具经济效益和开发潜
力的生产工艺[7]。 据研究,硫酸软骨素能以荚膜多
糖 的 形 式 存 在 于 巴 斯 德 杆 菌 ( Pasteurella
multocida)、大肠杆菌(Escherichia coli)和枯草芽胞
杆菌(Bacillus subtilis)等微生物的细胞壁中[8-10]。
虽然,P􀆰 multocida能合成软骨素类荚膜多糖,但是
其为家禽霍乱致病菌。 近年来,研究重点转向利用
来源于 P􀆰 type F的软骨素合成酶 pmCS进行酶法转
化生产软骨素多糖链,但由于高昂的单糖供体成
本,目前尚无量产报道[9,11-12]。 美国 Amano Enzyme
公司筛选获得 1株可直接生产硫酸软骨素的纳豆枯
草芽胞杆菌(B􀆰 subtilis natto),但其产量仅为 0􀆰 24
g / L[10]。 大肠杆菌 K4(E􀆰 coli K4)能合成软骨素类
似物作为其荚膜多糖 ( capsular polysaccharide,
K4CPS),即果糖软骨素(4 β GlcA(Fru) 1,3
β D N GalNAc 1) [8],经脱果糖和硫酸化修饰
等步骤可获得硫酸软骨素[13]。 此外,大肠杆菌具有
遗传背景清楚、荚膜多糖合成与转运机制清晰等优
点而成为研究硫酸软骨素发酵的主要菌株。
Schiraldi 等[14]采用微膜生物反应器高密度培养大
肠杆菌 K4,可使 K4CPS产量高达 4􀆰 73 g / L,但比细
胞得率仅为 0􀆰 13 g / g (以 1 g 干细胞质量中含
K4CPS量计)。
目前,根据遗传学特征、生物合成方式及其分
子结构等特性,可将大肠杆菌荚膜多糖分为 4大类,
即 group 1~ group 4[15]。 大肠杆菌 K4 属于 group 2,
其 K4CPS 合成基因簇包括 region 1、 region 2 和
region 3 3部分(图 1) [16]。 其中 region 1 和 region 3
主要参与新合成多糖链的修饰、转运与定位[17],而
region 2 包括 kfoA ~ G 等 7 个基因和 1 个插入序列
IS2,主要编码多糖及其前体合成相关的酶[18]。 此
外,group 2荚膜多糖合成基因簇的转录由 2 个 σ70
启动子所调控,分别是位于 region 1 上游 224 bp 的
PR1和 region 3上游 741 bp 的 PR3。 PR1转录产生
1条约 8 kb 的多顺反子,随后再转录出 1 条约 1􀆰 3
kb的 kpsS 转录子[19]。 而 PR3 的转录可从 region 3
延伸至 region 2,此过程需要 RfaH蛋白与 PR3 启动
子 3′端非翻译区( untranslated region,UTR) 713 bp
处 ops序列的结合,在转录过程中与 RNA 聚合酶复
合物相互作用,调节 region 2 转录的正常进行。 ops
序列的缺失或 rfaH 基因的突变均可减弱荚膜多糖
的合成[20]。 同时,UTR 具有减弱 PR3 活性的作用,
整个 741 bp UTR片段的缺失可显著提高 PR3 的转
录活性[21]。 因此,为了进一步提高 K4CPS 产量,笔
者通过 Red同源重组技术对 UTR进行敲除,以增强
PR3启动子的活性,从而促进 K4CPS的合成。
注: 表示转录起始位点; 表示转录子; 表示 RfaA的结合位点 ops序列
图 1  大肠杆菌 K4荚膜多糖合成基因簇的转录[21]
Fig􀆰 1  Transcription of E􀆰 coli K4 CPS gene cluster[21]
1  材料与方法
1􀆰 1  菌株和质粒
大肠杆菌 K4(E􀆰 coli O5:K4:H4) 购买于美国典型
培养物收藏中心(ATCC),保藏编号为 ATCC 23502;大
肠杆菌 JM109为笔者所在实验室保藏;质粒 pKD46(含
有受 ParaB启动子调控的 exo、bet 和 gam基因)、pKD4
(含有卡那霉素抗性)、pCP20(含有翻转酶重组酶基
因)均由美国 Purdue大学 B􀆰 L􀆰 Wanner惠赠;克隆质粒
pMD18 T购买于 Takara公司。
02 生  物  加  工  过  程    第 12卷 
1􀆰 2  培养基和培养条件
Red同源重组过程和种子培养基均用 LB 培养
基。 根据菌株和所用质粒的抗性在培养基中添加
抗生素,氨苄青霉素 50 ~ 100 mg / L,卡那霉素 25 ~
50 mg / L。 摇瓶发酵培养基(g / L):甘油 20,大豆蛋
白胨 1,KH2PO4 2, K2HPO4 9􀆰 7,(NH4) 2SO4 3,柠檬
酸三钠 0􀆰 5,MgCl2 0􀆰 1。 培养条件为 37 ℃、200 r / min
培养 24 h。
1􀆰 3  Red同源重组[22]
1􀆰 3􀆰 1  同源重组引物设计与敲除框的构建
利用软件 Primer Premier 5设计同源重组引物,
其设计位点如图 2。 扩增 pKD4 卡那霉素抗性基因
kan的引物 P3(5′ ATGATGTGATCCTAATCTCTT⁃
CAGGTATGCTACCGCCCCTGGCTTAACTGTGTAG⁃
GCTGGAGCTGCTTCG 3′)、P4(5′ TGTATTTTGT⁃
GTAGTCTGGAAATTAGTAAAATTCCTGGAGATA⁃
ATCAGAAATGGGAATTAGCCATGGTCC 3′)和 P8
(5′ ACTTTCTGGACTTCAAATCCACTTCTTGCCA⁃
TTTGATGATGTGATCCTAGTGTAGGCTGGAGCTGC⁃
TTCG 3′)分别由 2 部分组成,靠近 5′端的序列与
PR3待敲除序列两翼序列同源,靠近 3′端斜体加粗
的序列与 kan 基因两侧序列互补。 在 PR3 启动子
UTR两侧,设计引物 P1(5′ ATCAGCGTCTCAAGC⁃
AGTG 3′)、P2(5′ AGGAACTTCGAAGCAGCTCC⁃
AGCCTACACAGTTAAGCCAGGGGCGGTA 3′)、 P7
(5′ ATTCTCTAGAAAGTATAGGAACTTCGAAGC⁃
AGCTCCAGCCTACACTAGGATCACATCATCAAATG⁃
GCAAG 3′)用于扩增敲除框的右翼,P2 和 P7 靠近
5′端的序列与 kan基因序列同源,靠近 3′端斜体加粗
序列与 UTR+698 bp和+724 bp 互补。 P5(5′ ATAT⁃
TCATATGGACCATGGCTAATTCCCATTTCTGATTAT⁃
CTCCAGGAAT 3′)和 P6(5′ CTTAGCCCAATGGTG⁃
AGT 3′)用于扩增敲除框的左翼,P5靠近 5′端的序
列与 kan基因序列同源,靠近 3′端斜体加粗序列与
UTR+36 bp互补。 所用引物由上海生工生物工程公
司合成。
以大肠杆菌 K4基因组和 pKD4为模板,利用上
述引物可扩增得到敲除框的左翼片段、右翼片段和
kan基因片段。 将此 3种片段以等摩尔浓度混匀后
作为模板,以 P1 和 P6 为引物进行融合 PCR,最终
得到带有 300~400 bp同源臂的敲除框。
1􀆰 3􀆰 2  感受态的制备
将培养 12 h含有 pKD46的大肠杆菌 K4,以 1%
图 2  同源重组引物设计位点
Fig􀆰 2  Localsites of primers used for Red recombination
(体积分数)的接种量转接至 50 mL LB 培养基中,
30 ℃培养 1 h后加入 0􀆰 5 mL 1 mol / L的 L 阿拉伯
糖,培养至 OD600为 0􀆰 5~0􀆰 6。 将 50 mL培养液冰浴
30 min后,4 ℃、8 000 r / min离心 3 min。 收集菌体,
用预冷无菌水洗涤菌体 1 次,用预冷 10%(体积分
数)甘油洗涤菌体 2 次,最后加入 200 μL 预冷 10%
甘油重悬菌体制备成感受态细胞。
1􀆰 3􀆰 3  电击转化与筛选
取 100~200 ng敲除框 DNA与 50 μL感受态细
胞混匀,冰浴 10 min。 用 Bio⁃Rad 公司 MicroPulser
电穿孔仪进行电击转化,0􀆰 1 cm 电击杯,转化参数
为 1􀆰 8 kV、5 ms、25 F、200 Ω。 电击后加入 1 mL LB
培养基,37 ℃预培养 1 h,涂布于含有卡那霉素的
LB平板。 37 ℃倒置培养 12 ~ 16 h,筛选阳性转化
子。 转化子在 43 ℃培养 12 h筛选氨苄青霉素缺失
菌株。 然后,按照 1􀆰 3􀆰 2 的方法制备感受态(不加
L 阿拉伯糖),电击转化质粒 pCP20。 转化液涂布
于含有氨苄青霉素的 LB平板,37 ℃培养 12 h,筛选
阳性转化子。 转化子再转入 43 ℃培养 12 h 筛选氨
苄青霉素和卡那霉素同时缺失的突变株。
1􀆰 4  荧光定量 PCR
发酵培养突变株和原菌至对数生长末期,取约
109 个细胞,按照细菌总 RNA提取试剂盒(天根)提
取总 RNA,并设 3个重复。 经非变性凝胶电泳检测
后通过反转录试剂盒(Bio⁃Rad 公司)得到 cDNA。
以 cca 和 idnT 基因作为双内参基因,对 kpsE、kfoC
和 kpsM基因的表达水平进行相对定量,所用扩增引
物由 Beacon Designer 7设计(表 1)。 荧光定量 PCR
反应体系为 20 μL(3个平行):无菌水 6 μL、cDNA 2
μL、引物各 1 μL、SYBR Green supermix(Bio⁃Rad 公
12  第 3期 吴秋林等:启动子工程改造大肠杆菌 K4生产果糖软骨素
司) 10 μL。 PCR反应程序:95 ℃预变性 30 s;95 ℃
变性 5 s,50 ℃退火 10 s,40个循环;融解曲线:65 ℃
到 95 ℃,每上升 0􀆰 5 ℃保持 10 s。 反应结果利用
Bio⁃Rad CFX Maneger软件采用 2-ΔΔ Ct法进行分析。
表 1  荧光定量 PCR所用引物
Table 1  Primers used for quantitative real time PCR
基因 正向引物(5′-3′) 反向引物(5′-3′) 功能[15,23-24]
cca GGAACACCTGACGCCTGAAC TGGAAGAACACCTGTGGATTGC 融合 tRNA核苷酸转移酶
idnT CACTACGCTGATTGCTAC CTGATGATGCTACGATGG L 艾杜糖和 D 葡萄糖转运子
kpsE CTACTGACGGCTCTTAACTCTG TGACATTAGGGCAAGCGATAG 转运新合成聚合物至周质空间
kfoC GGTGGTTCTTGATGATATGC TTAGCGGAGGTAATGTCG 软骨素聚合酶
kpsM ATCAGCGTCTCAAGCAGTG ATCTTTAGCAGTATCAGCAATCG ABC转运子的核苷酸结合部分
1􀆰 5  分析方法
1􀆰 5􀆰 1  K4CPS含量的测定
发酵液 8 000 r / min离心 3 min 收集上清液,取
少量上清液经蒸发浓缩后,加入 1 mL无水乙醇洗去
杂质。 离心所得沉淀加入适量去离子水重悬,用于
K4CPS 含量的测定。 K4CPS 含量用咔唑法测
定[25]:取 5 mL 浓 H2SO4(含有 9􀆰 5 g / L 四硼酸钠)
与 1 mL样品混匀,煮沸 10 min;迅速冷却至室温,加
入 200 μL咔唑溶液(0􀆰 125 g 咔唑溶于乙醇中)振
荡混匀后煮沸 15 min,迅速冷却至室温。 在 530 nm
处测定吸光值。 以硫酸软骨素 A(Sigma 公司)为标
准品,质量浓度梯度为 25 ~ 125 mg / L,最终所得
K4CPS含量(mg / L) = 标准曲线得到浓度×稀释倍
数×1􀆰 12。
1􀆰 5􀆰 2  甘油浓度的测定
采用高效液相色谱仪 UltiMate 3000(Dionex 公
司)检测上清液中甘油的含量,条件:分离柱 Aminex
HPX 87H column(Bio⁃Rad公司),柱温 35 ℃,进样
量 20 μL,流动相为体积分数 0􀆰 027 5% H2SO4溶液,
流动相流速 0􀆰 6 mL / min,示差折光检测器(RID)。
1􀆰 5􀆰 3  细胞干质量的测定
将发酵液稀释至适当倍数,在 600 nm处测定其
吸光值,细胞干质量 ( DCW) = 吸光值 ×稀释倍
数×0􀆰 412。
2  结果与分析
2􀆰 1  大肠杆菌 K4 PR3 启动子的克隆和序列同源
性分析
    以大肠杆菌 K4 基因组为模板,以 P1 和 P6 为
引物 PCR扩增得到 1 条约 1􀆰 4 kb 的片段。 纯化后
连接至 pMD18 T 载体,转化 E􀆰 coli JM109 感受态
细胞,涂布于含有氨苄青霉素的 LB 平板上,筛选得
到带有 PR3 启动子的重组子。 重组质粒 pMD18
PR3经测序分析,插入片段长度为 1 403 bp,包括
PR3启动子及其 3′端的 741 bp UTR和 kpsM基因的
5′端。 通过 Blast比对分析发现:大肠杆菌 K4 与 K5
的 PR3启动子的同源性为 96􀆰 54%,转录起始位点
由 A变为 G。
2􀆰 2  PR3 启动子 3′端 UTR 缺失突变株的构建与
验证
    以 P3、P4(或 P8)为引物,pKD4 为模板,扩增
kan基因,PCR 产物约 1􀆰 5 kb;以 P1、P2(或 P7)为
引物,大肠杆菌 K4 基因组 DNA 为模板,扩增 UTR
左侧序列,约 400 bp;以 P5、P6 为引物,K4 基因组
DNA为模板,扩增 UTR 右侧序列,约 300 bp。 三段
PCR产物经过融合 PCR分别得到 2 条约 2􀆰 2 kb 的
敲除框。 按照 1􀆰 3 Red 同源重组技术对 UTR 区进
行缺失突变,得到 4株 UTR区加长或缩短的突变菌
株。 敲除流程如图 3(a)所示。 由图 3 可知:由 2 条
敲除框经过第一次同源重组将 kan基因整合到 UTR
区分别得到突变株 PR301:: kan 和 PR303:: kan。
随后在翻转酶的作用下,kan 基因两侧的 FRT 位点
发现第二次同源重组, kan 基因丢失得到突变株
PR301和 PR303。 表 2 为上述突变菌株的特性,其
中菌株 PR301::kan (PR301)在保留 ops 序列的同
时延长(缩短)UTR 序列;而 PR303::kan (PR303)
则是缺失 ops序列的同时延长(缩短)UTR序列。 引
物 P1和 P6进行扩增,根据重组前后序列长度的变
化进行验证(图 3b),并将 PCR 产物送至华大基因
测序,结果与预期相符。
22 生  物  加  工  过  程    第 12卷 
(a)Region 3启动子重组图
表 2  突变株特性
Table 2  Characteristics of mutants
菌株 UTR长度 /bp
ops
序列
E.coli K4 741 +
PR301::kan 1 581 +
PR301 191 +
PR303::kan 1 556 -
PR301 166 -
M—标准 DNA;1—K4(1􀆰 8 kb); 2—PR301::kan(2􀆰 2 kb);
3—PR301(1􀆰 3 kb); 4—PR303::kan(2􀆰 2 kb); 5—PR303(1􀆰 3 kb)
(b)产物 P1和 P6的 PCR扩增结果
图 3  UTR缺失突变株的构建及 PCR鉴定
Fig􀆰 3  Construction of mutants with UTR deletion and PCR analysis
2􀆰 3  UTR缺失突变对 K4CPS合成的影响
为研究 UTR 缺失突变后对 K4CPS 生产的影
响,将原菌 E􀆰 coli K4 与 UTR突变株进行摇瓶发酵
培养 24 h,检测其细胞生长、甘油利用和 K4CPS合
成的情况,结果如表 3 所示。 由表 3 可知:与原菌
相比,4 株突变株的生物量和甘油利用率变化并不
显著。 其中,突变株 PR301:: kan 和 PR301 的
K4CPS 产量与 E􀆰 coli K4 也无明显的变化,这一结
果表明,在 ops 序列存在的情况下,UTR 序列的延
长或缩短并不能影响 K4CPS 产量。 然而,对于菌
株 PR303::kan,在 ops 序列缺失和延长 UTR 序列
的双重调控下,可导致 K4CPS产量的降低,比原菌
下降了 16%;反之,在 ops序列缺失的基础上,缩短
UTR序列至 166 bp 可显著提高菌株 PR303 生产
K4CPS的能力,使其产量达 751 mg / L,而比细胞得
率高达 0􀆰 214 g(以 1 g干细胞质量中含 K4CPS 量
计),比原菌分别提高了 46% 和 51%。 上述结果
表明:缺失 ops 序列且缩短 UTR 能有效地提高
K4CPS产量;ops 序列或 RfaH 蛋白并不是 K4CPS
合成的必需蛋白。
表 3  突变株与原菌的 K4CPS产量对比
Table 3  K4CPS production in mutants and E􀆰 coli K4
菌株 ρ(DCW) /(g·L-1)
ρ(甘油) /
(g·L-1)
ρ(K4CPS) /
(mg·L-1) 相对产量
K4CPS比细胞得率 /
(mg·g-1)
E􀆰 coliK4 3􀆰 58±0􀆰 02 2􀆰 96±0􀆰 43 511±16 1􀆰 00 142±9
PR301::kan 3􀆰 53±0􀆰 04 2􀆰 57±0􀆰 04 529±0 1􀆰 04±0􀆰 01 150±7
PR301 3􀆰 74±0􀆰 05 3􀆰 58±0􀆰 58 544±0 1􀆰 06±0􀆰 02 144±8
PR303::kan 3􀆰 47±0􀆰 12 2􀆰 67±0􀆰 73 431±11 0􀆰 84±0􀆰 03 124±11
PR303 3􀆰 51±0􀆰 03 2􀆰 96±0􀆰 58 751±8 1􀆰 45±0􀆰 02 214±5
32  第 3期 吴秋林等:启动子工程改造大肠杆菌 K4生产果糖软骨素
2􀆰 4  UTR缺失突变对 PR3启动子强度的影响
为了解析 UTR 突变如何影响 K4CPS 合成,选
取 K4CPS合成基因簇中 region 1、region 2 和 region
3的代表性基因 kpsE、kfoC和 kpsM,以 cca和 idnT基
因为双内参基因,通过荧光定量 PCR对 kpsM、kfoC、
kpsE 基因的表达水平进行相对定量,结果见图 4。
由图 4可知:与原菌相比,在突变菌株 PR301::kan
和 PR301中,3个基因的表达水平均无显著变化,而
在 PR303::kan中,kpsM和 kfoC 基因的表达水平则
分别下降为原菌的 58% 和 68%;但在 PR303 中
kpsM和 kfoC基因的表达水平则分别提高了 1􀆰 04 和
1􀆰 16倍。 此外,4株突变菌的 kpsE 基因表达水平均
无显著变化,说明 UTR 的突变对 region 1 基因的转
录表达没有明显的影响。 因此,从基因转录水平上
研究表明,在 ops序列存在的情况下,UTR序列的延
长或缩短都难以影响 PR3 启动子的强度,而 ops 序
列缺失后,UTR 区的延长能减弱 PR3 启动子的强
度,UTR区的缩短则能有效地加强 PR3 启动子的强
度。 上述结果表明,RfaH 蛋白的与 ops 序列的结合
会影响 UTR 区对 PR3 启动子的调控作用,但其具
体的作用机制有待进一步研究。
图 4  荚膜多糖合成基因簇基因表达
水平分析比较结果
Fig􀆰 4  Analysis of expression levels of genes in
capsule gene cluster
3  讨  论
目前,国内外研究人员已从多方面对发酵法生
产硫酸软骨素开展了卓有成效的研究工作。 然而,
由于微生物自身代谢的经济型生存本能和工业生
产环境与自然环境的巨大差异,使硫酸软骨素的产
量、产率和生产强度均难以达到工业化生产的要
求。 因此,利用基因工程手段获得硫酸软骨素高产
菌株已成为硫酸软骨素研究领域的热点和重点[7],
如过量表达 K4CPS 合成途径中的软骨素酶合成基
因可有效提高 K4CPS 产量[26]。 此外,过量表达
UDP 葡萄糖脱氢酶能够使荚膜多糖合成前体
UDP GlcA 的产量提高 3 倍,但意外的是,K4CPS
的产量并没有提高,反而显著地降低了 3 倍[27]。 其
原因可能是硫酸软骨素等荚膜多糖的合成涉及单
糖合成、核糖供应、酶动力学反应以及膜转运蛋白
等多个环节,仅对单一或者 2~3 个基因进行代谢工
程改造难以显著提高 K4CPS生产效率。 因此,如要
提高硫酸软骨素的产量,需要同时对多个基因的表
达水平进行调控。
同时提高胞内多个基因表达水平的另一策略
是过量表达全局转录调控蛋白,如增加 fis 基因(编
码转录调控蛋白)拷贝数和突变 σ 因子均能提高透
明质酸的产量[28-29]。 但需考虑的是对具有潜在致
病性的生产菌株进行全局转录蛋白调控时,可能会
引起多种毒性因子(如脂多糖)的变化。 在对荚膜
多糖合成基因簇转录调控子进行详尽分析的基础
上,采用 Red同源重组技术对荚膜多糖合成基因簇
PR3启动子进行改造,在 ops 序列缺失的基础上缩
短 PR3启动子 3′端 UTR 的长度,增强 PR3 启动子
的活性。 使 region 2 和 region 3 的表达水平同时得
到了提高,从而显著提高了 K4CPS 的生产效能,其
比细胞得率达到 214 mg / g,为目前报道的最高水
平。 分析其原因可能为: region 2 中负责编码
K4CPS 多糖聚合酶 (KfoC)及其单糖前体 UDP
GalNAc与 UDP GlcA合成相关酶(分别为 KfoA和
KfoF)表达水平的提高,增强了胞质中单糖前体合
成和多糖聚合的代谢强度;由于 region 3 中 KpsM和
KpsT蛋白组成的 ABC A2 型转运系统的加强,加
速了 K4CPS多糖链从胞内向胞外的转运;同时提高
胞内 K4CPS合成强度与跨膜转运速率可能更有利
于胞外 K4CPS的高效积累。 这一研究表明,通过启
动子工程从转录水平对荚膜多糖合成基因簇进行
整体调控,能显著促进荚膜多糖的合成,为相关研
究提供了新的代谢工程策略。
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(责任编辑  荀志金)
52  第 3期 吴秋林等:启动子工程改造大肠杆菌 K4生产果糖软骨素