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Identification of the quarantine fungus Plenodomus lindquistii from the sunflower seeds imported from Kazakhstan

进境哈萨克斯坦向日葵种子中向日葵黑茎病菌的鉴定



全 文 :植物保护学报 Journal of Plant Protectionꎬ 2015ꎬ 42(5): 795 - 800 DOI: 10􀆰 13802 / j. cnki. zwbhxb. 2015􀆰 05􀆰 014
基金项目:国家质检总局科研项目(2014IK020)ꎬ浙江省博士后择优资助项目(BSH1402011)ꎬ宁波市社会发展科研项目(2014C50082)
∗通讯作者(Author for correspondence)ꎬ E ̄mail: weijunduan@ tom. comꎬ Tel: 0574 - 87022951
收稿日期: 2014 - 08 - 15
进境哈萨克斯坦向日葵种子中向日葵黑茎病菌的鉴定
段维军1ꎬ2∗  李  兰3   莫善明3   段丽君1   蔡  磊2
(1.宁波检验检疫科学技术研究院ꎬ 浙江 宁波 315012ꎻ 2.中国科学院微生物研究所ꎬ 北京 100101ꎻ
3.阿拉山口出入境检验检疫局ꎬ 新疆 阿拉山口 833418)
摘要: 自进境哈萨克斯坦向日葵种子中ꎬ采用常规平板分离法获得 1 株疑似向日葵黑茎病菌
Plenodomus lindquistii菌株 LL4ꎬ通过生物学性状、ITS序列测定和比对分析及致病性测定等方法对
其进行了鉴定ꎮ 结果表明ꎬ该病菌在 PDA平板上培养初期菌丝无色ꎬ分隔分枝多ꎬ后期菌丝褐色或
深褐色ꎬ常膨大ꎻ分生孢子器暗褐色ꎬ分散或聚集ꎬ球形、近球形或不规则形ꎬ大小为 71􀆰 2 ~ 361􀆰 8
μmꎻ分生孢子形态变化较大ꎬ无色ꎬ单孢ꎬ肾形至椭圆形ꎬ大小为 3􀆰 6 ~ 8􀆰 2 μm ×2􀆰 2 ~ 3􀆰 7 μmꎬ常含
有 2 个油球ꎻ培养期间未见有性阶段ꎮ 基于 ITS序列分析比对发现ꎬ菌株 LL4 与 GenBank中多个向
日葵黑茎病菌分离物序列同源性达 99%以上ꎬ系统进化树显示其与其它向日葵黑茎病菌分离物聚
在同一个分支ꎮ 菌株 LL4 可侵染向日葵根茎部ꎬ造成典型黑茎病症状ꎮ 表明分离获得的菌株 LL4
为向日葵黑茎病菌 P. lindquistiiꎮ
关键词: 向日葵黑茎病菌ꎻ 形态学特征ꎻ 序列分析ꎻ 致病性测定ꎻ 检测鉴定
Identification of the quarantine fungus Plenodomus lindquistii from the
sunflower seeds imported from Kazakhstan
Duan Weijun1ꎬ2∗   Li Lan3   Mo Shanming3   Duan Lijun1   Cai Lei2
(1. Ningbo Academy of Inspection and Quarantineꎬ Ningbo 315012ꎬ Zhejiang Provinceꎬ Chinaꎻ 2. Institute of
Microbiologyꎬ Chinese Academy of Sciencesꎬ Beijing 100101ꎬ Chinaꎻ 3. Alataw Entry ̄exit Inspection and
Quarantine Bureauꎬ Alataw 833418ꎬ Xinjiang Uygur Autonomous Regionꎬ China)
Abstract: Strain LL4 was isolated from sunflower seeds imported from Kazakhstan by using conventional
PDA plate method. To identify strain LL4ꎬ the biological traitsꎬ ITS sequencing and its pathogenicity
were analyzed. The results showed that the strain LL4 grew well on PDA mediumꎬ and the mycelium was
colorless at early culture stage with separate branchesꎬ and then turned brown or dark brown at late
culture stageꎬ often inflated. The pycnidia were dark brownꎬ dispersed or aggregatedꎬ sphericalꎬ nearly
spherical or irregular in shapeꎬ with a size of 71􀆰 2 - 361􀆰 8 μmꎻ the conidia form varied widelyꎬ
colorlessꎬ single ̄sporedꎬ kidney ̄shaped or ovalꎬ with a size of 3􀆰 6 - 8􀆰 2 μm × 2􀆰 2 - 3􀆰 7 μmꎬ which
often contained two oil ballsꎻ there was no sexual stage in the culture period. The ITS sequence of strain
LL4 was compared with those in GenBank databaseꎬ showing that the sequence shared more than 99%
identity with several sequences of Plenodomus lindquistii ( Frezzi) in GenBank. The phylogenetic tree
showed that the strain LL4 gathered with other P. lindquistii isolates in a branch. The strain LL4 could
infect sunflower stemꎬ formed typical symptoms of black stem. Based on morphological characteristicsꎬ
ITS sequence analysis and pathogenicity test resultsꎬ the strain LL4 was identified as P. lindquistii.
Key words: Plenodomus lindquistiiꎻ morphological characteristicsꎻ sequence analysisꎻ pathogenicityꎻ
detection and identification
    向日葵是全球 4 大油料作物之一ꎬ在我国油料
作物中向日葵的种植面积仅次于大豆和油菜ꎬ且近
年来呈逐年增大的趋势ꎬ向日葵病害也随之日益严
重(宋娜等ꎬ2012ꎻ卜浩宇等ꎬ2014)ꎮ 向日葵黑茎病
于 20 世纪 50 年代被首次发现(Sackstonꎬ1992)ꎬ至
70—80 年代相继扩展到欧美地区 ( Miric et al. ꎬ
1999ꎻBoerema et al. ꎬ2004)ꎬ目前在世界多个向日葵
生产国家和地区均有发生(Roustaee et al. ꎬ2000ꎻ
Luo et al. ꎬ2011ꎻde Gruyter et al. ꎬ2012)ꎬ我国新疆
等地也有发生危害的报道(张祥林等ꎬ2011ꎻWu et
al. ꎬ2012)ꎮ 向日葵黑茎病导致向日葵籽小、空、瘪ꎬ
种子产量和产油量严重降低ꎻ发病早者致植株枯死ꎬ
发病晚者可致植株矮化、瘦弱甚至倒伏ꎬ在重病田发
病率达 100% ꎬ死亡率达 50%以上(陈卫民等ꎬ2008ꎻ
魏良民ꎬ2008)ꎮ 鉴于其严重危害性ꎬ2010 年 10 月
农业部和国家质量监督检验检疫总局联合发布了第
1472 号公告ꎬ将向日葵黑茎病列入«中华人民共和
国进境植物检疫性有害生物名录»ꎮ
向日葵黑茎病菌 Plenodomus lindquistii (Frezzi)
于 1964 年首次被分离和鉴定(McDonaldꎬ1964)ꎬ其
无性阶段为 Phoma macdonaldii Boeremaꎬ是一种土
壤习居菌ꎬ能够在侵染残存组织上以菌丝体、假囊壳
和分生孢子器等形态越冬并侵染向日葵(Gulya et
al. ꎬ1997ꎻSeassau et al. ꎬ2010)ꎮ 目前ꎬ生产上尚未
见抗黑茎病的向日葵品种面世 ( Quiroz et al. ꎬ
2014)ꎬ化学防治等传统方法难以进行有效防治ꎬ因
此开展口岸检疫鉴定工作对于有效防范该病菌传人
和扩散危害具有重大意义ꎮ
对于向日葵黑茎病菌的检测和鉴定ꎬ单纯依靠
形态学方法进行鉴定存在一定困难ꎮ 茎点霉属
Phoma已报道的种类超过 3 000 种ꎬ大部分种类是
腐生或非专性寄生菌(Crous et al. ꎬ2004)ꎮ 其外部
形态十分相像ꎬ主要根据其在寄主以及活体培养时
分生孢子器、分生孢子以及菌落形态的不同进行区
分ꎬ但这些特征受外部环境影响很大ꎬ存在较大变异
性(Miric et al. ꎬ1999ꎻBoerema et al. ꎬ2004)ꎮ 且该
属真菌能够产生多种类型孢子ꎬ容易与近似种类相
混淆ꎬ利用 DNA分子序列分析进行该属种类鉴定具
有一定优越性ꎬ但关键是获得合适的能够有效区分
不同种类的分子标记ꎮ 研究表明ꎬ采用 ITS 序列能
够有效区分向日葵黑茎病菌(Miric et al. ꎬ1999ꎻLuo
et al. ꎬ2011)ꎬ且 ITS序列中多个位点的差异也为建
立在此基础上的向日葵黑茎病菌快速检测方法提供
了可能(张祥林等ꎬ2011ꎻ宋娜等ꎬ2012)ꎮ 2014 年 6
月ꎬ本课题组自进境哈萨克斯坦向日葵种子上分离
培养获得了 1 株疑似向日葵黑茎病菌菌株 LL4ꎬ对
其进行了生物学性状研究、ITS 序列测定分析和致
病性测定ꎬ以期准确鉴定该菌株ꎬ为口岸检疫、疫情
防控及后续相关研究工作提供参考依据ꎮ
1 材料与方法
1􀆰 1 材料
供试菌株及向日葵:采用常规平板分离法从进
境哈萨克斯坦向日葵种子上分离获得 1 株疑似向日
葵黑茎病菌分离物ꎬ进行单孢分离后得到分离株
LL4ꎬ4℃下保存在 PDA斜面备用ꎮ 选用市售向日葵
种子进行接种试验ꎮ
培养基:马铃薯葡萄糖琼脂 ( potato dextrose
agarꎬPDA)培养基:马铃薯 200 g、葡萄糖 20 g、琼脂
20 g、水 1 000 mLꎬ121℃下灭菌 15 minꎮ
试剂:Labserv Plant DNA Kit 核酸提取试剂盒ꎬ
美国 Thermo Fisher 公司ꎻTaq DNA 聚合酶、MgCl2、
10 × PCR Buffer、DL2000 Marker、DNA片段纯化试剂
盒ꎬ宝生物工程(大连)有限公司ꎻ其它试剂均为分
析纯ꎻ引物均由上海英俊生物技术有限公司合成ꎮ
仪器: BX ̄51 显微镜ꎬ奥林巴斯有限公司ꎻ
Imager Z1 显微镜数码成像系统、Discovery V12 解剖
镜及其成像系统ꎬ德国 ZEISS公司ꎻFriocell 222 培养
箱ꎬ德国 MMM 公司ꎻKingfisher 核酸自动化提取仪、
Thermo Scientific Multiskan GO 生物分光光度计ꎬ美
国 Thermo Fisher 公司ꎻTProfessional Basic PCR 仪ꎬ
德国 Biometra 公司ꎻPowerPac Basic 电泳设备、Gel ̄
DocEQ型凝胶成像系统ꎬ美国伯乐生命医学产品有
限公司ꎮ
1􀆰 2 方法
1􀆰 2􀆰 1 菌株 LL4 的生物学性状观察
将供试菌株 LL4 接种于 PDA 平板上ꎬ在 25℃
条件下连续暗培养 7 d 后ꎬ观察记录菌落正反面的
颜色和气生菌丝的疏密程度ꎮ 再用黑光灯 12 h /黑
暗 12 h交替培养 7 d后ꎬ用解剖针自 PDA平板上挑
取供试菌ꎬ置于加有水滴的玻片上ꎬ盖上盖玻片后ꎬ
在显微镜下观察分生孢子器、分生孢子的形态特征ꎬ
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并利用显微数码测量系统进行测量并记录ꎮ
1􀆰 2􀆰 2 菌株 LL4 的 DNA提取及 ITS序列测定
用灭菌枪头刮取 PDA 平板上培养 7 d 的菌株
LL4 菌丝体ꎬ根据 Labserv Plant DNA Kit核酸提取试
剂盒使用说明书ꎬ在核酸自动化提取仪上进行 DNA
提取ꎮ 提取后 DNA 经分光光度计检测 DNA 浓度
后ꎬ冻存于 - 20℃ 冰箱备用ꎮ 采用 White et al.
(1990)设计的引物 ITS1 和 ITS4 进行 ITS 片段扩
增ꎮ 反应程序为:95℃ 3 minꎻ95℃ 40 sꎬ53℃ 40 sꎬ
72℃ 60 sꎬ35 个循环ꎻ72℃ 10 minꎮ PCR 扩增产物
经 2%琼脂糖凝胶电泳检测ꎬ确认扩增成功后ꎬ使用
凝胶成像系统进行拍照ꎬ根据 DNA片段纯化试剂盒
说明书进行纯化ꎮ 纯化产物送上海英俊生物技术有
限公司进行双向测序ꎮ
1􀆰 2􀆰 3 菌株 LL4 的 ITS序列比对分析
利用 NCBI网站上的 BLAST 程序对测得的 ITS
序列进行比对分析ꎬ确认序列的可靠性ꎮ 将测得的
序列与 GenBank 中下载的向日葵黑茎病菌及其近
似种的 ITS 序列用 Clustal X 程序进行分析ꎬ使用
Mega 5􀆰 0 程序进行比对ꎬ以 GenBank 上下载的草茎
点霉 Phoma herbarum 的 ITS 序列 ( AY293791 和
JQ754707)为外群ꎬ采用邻接法(neighbor ̄joiningꎬN ̄
J)构建系统进化发育树ꎬ进行 1 000 次重抽样计算
系统树中节点的置信度ꎮ
1􀆰 2􀆰 4 菌株 LL4 的致病性测定
选用成熟饱满的向日葵种子ꎬ均匀种植于灭菌
后土壤中ꎬ室温下培养ꎬ直径为 30 cm的花盆每盆种
植 5 粒种子ꎬ幼苗长出后每盆保留 2 株幼苗ꎮ 在苗
龄 2 周的向日葵根茎部用灭菌锋利小刀切割表皮
后ꎬ将在 PDA平板上培养 10 d 的菌落用直径 4 mm
打孔器在菌落边缘打出菌饼后ꎬ小心放置在切割处ꎬ
用蘸有无菌水的湿润灭菌脱脂棉覆盖伤口ꎬ接种 6
株ꎬ置于温室 25℃条件下进行培养ꎬ并逐日观察记
录发病情况ꎮ 以未接种菌饼 PDA 作为对照ꎬ每处理
3 次重复ꎮ
2 结果与分析
2􀆰 1 菌株 LL4 的菌落性状及形态特征
在 25℃下ꎬ菌株 LL4 在 PDA 平板上生长 7 d
后ꎬ菌落直径可达 6􀆰 3 cmꎻ气生菌丝棉絮状ꎬ灰白
色ꎬ多丛生于培养基中央ꎬ边缘气生菌丝稀疏少见ꎮ
培养基正面菌落浅灰白色或橄榄色ꎬ培养后期为黑
褐色ꎬ培养基反面橄榄色(图 1)ꎮ 显微镜检发现菌
株 LL4 菌丝膨大现象明显(图 2 ̄a)ꎮ 培养 1 周后产
生黑色或深褐色分生孢子器(图 2 ̄b、c)ꎬ半埋生ꎬ分
散或聚生ꎬ球形或扁球形ꎬ具乳头状突起ꎬ直径大小
为 71􀆰 2 ~ 361􀆰 8 μmꎬ挤压后释放大量分生孢子ꎮ 分
生孢子无色ꎬ形态差异大ꎬ单孢ꎬ肾形至椭圆形ꎬ两端
有油球ꎬ大小为 3􀆰 6 ~ 8􀆰 2 μm × 2􀆰 2 ~ 3􀆰 7 μm(图 2 ̄
d)ꎮ 菌株 LL4 的菌落性状和显微形态特征与向日
葵黑茎病菌 Plenodomus lindquistii相符ꎬ可初步鉴定
其为向日葵黑茎病菌ꎮ
图 1 供试菌株 LL4 正反面宏观形态特征图
Fig. 1 Morphological characteristics of strain
LL4 on PDA plate
 
图 2 菌株 LL4 的微观形态图
Fig. 2 Microscopic characteristics of strain LL4
a: 膨大菌丝ꎻ b ~ c: 分生孢子器ꎻ d: 分生孢子ꎮ a:
Formation of swollen aerial myceliaꎻ b - c: formation of
conidiaꎻ d: formation of pycnidia.
 
2􀆰 2 菌株 LL4 的 ITS序列分析
菌丝 DNA用真菌通用引物 ITS1 / ITS4 扩增后获
得的片段长度约为 581 bpꎬ所获得序列在 GenBank中
通过 BLAST 比对分析表明ꎬ与登录号为 JN227087、
HM003206、HQ700313、AB690463 和 JQ979488 等向日
葵黑茎病菌分离物的 ITS 序列同源性达 99%以上ꎮ
系统发育分析结果显示ꎬ供试菌株 LL4 的 ITS 序列
与 GenBank中下载的向日葵黑茎病菌 ITS序列聚在
7975 期 段维军等: 进境哈萨克斯坦向日葵种子中向日葵黑茎病菌的鉴定
同一个分支(bootstrap值为 100ꎬ图 3)ꎮ 从分子水平
进一步证明疑似菌株 LL4 为向日葵黑茎病菌 P.
lindquistiiꎮ
图 3 基于向日葵黑茎病菌 rDNA ̄ITS序列采用邻接法构建的系统进化树
Fig. 3 Phylogenetic tree from the neighbor ̄joining (NJ) analysis based on the nuclear ribosoal ITS regions including ITS1ꎬ
5􀆰 8S rDNA and ITS2 of Plenodomus lindquistii and related species 
2􀆰 3 菌株 LL4 的致病性测定
在 6 株健康向日葵幼苗上接种 7 d 后ꎬ供试向
日葵根茎部均出现典型黑茎病症状ꎬ伤口黑色ꎬ迅速
向茎秆扩展ꎬ形成黑色病斑ꎮ 未接种菌饼的对照未
发现上述症状ꎮ 致病性测定中接种植株表现出的症
状与向日葵黑茎病症状相同ꎬ病菌再分离培养产生
的菌落性状及病原菌形态特征与向日葵黑茎病菌
一致ꎮ
3 讨论
向日葵黑茎病菌易受 pH 值、温度等多种环境
因素影响发生形态变异(Roustaee et al. ꎬ2000)ꎬ这
对于单纯依赖形态特征进行向日葵黑茎病菌的准确
鉴定带来了一定困难ꎮ 目前ꎬ真菌 ITS 片段已被广
泛用于构建系统发育树、评估种群进化过程以及确
定物种分类地位等(Qin et al. ꎬ2006ꎻPannecoucque
& Höfteꎬ2009ꎻ段维军等ꎬ2013)ꎬ也已被推荐作为真
菌的 DNA 条形码(Schoch et al. ꎬ2012)ꎮ 在形态学
鉴定基础上ꎬ结合合适的分子标记序列测定分析和
致病性测定ꎬ能够应用于口岸检疫性真菌的截获鉴
定工作中(段维军等ꎬ2014aꎻb)ꎮ 本研究采用形态
学特征结合 ITS 序列分析和致病性测定的方法ꎬ鉴
定了来自进境哈萨克斯坦向日葵种子上的疑似向日
葵黑茎病菌菌株 LL4ꎬ该菌能够产生膨大的气生菌
丝ꎬ具球形或近球形的分生孢子器ꎬ内生大量具两端
油球的形态变化较大的分生孢子ꎻ该菌株与 Gen ̄
Bank中多株向日葵黑茎病菌分离物 ITS 序列聚在
一个分支上ꎬ且致病性测定结果表明该菌株能够侵
染向日葵茎秆ꎬ形成黑色病斑ꎬ以上结果均表明自进
897 植  物  保  护  学  报 42 卷
境哈萨克斯坦向日葵种子中所截获的疑似病菌为向
日葵黑茎病菌 P. lindquistiiꎮ
现有检疫性真菌检测过程中ꎬ分离培养是一个
重要环节ꎮ 尽管目前已有一些关于向日葵黑茎病菌
快速检测技术的报道ꎬ如张祥林等(2011)利用向日
葵黑茎病菌 ITS区的 PCR ̄RFLP分析技术进行该病
菌的种类鉴定ꎻ张伟宏等(2013)报道了能够同时区
分向日葵黑茎病菌和向日葵茎溃疡病菌的三重
PCR扩增方法ꎻ宋娜等(2012)针对向日葵黑茎病菌
ITS区一致性较高的特点ꎬ在其 rDNA ̄ITS 的多态性
丰富区域设计了一对特异性引物 320FOR / 320REVꎬ
建立了该病菌的快速分子检测方法ꎮ 但是这些技术
和方法如果不能和分离培养相结合ꎬ往往难以准确
鉴定并检测出向日葵黑茎病菌ꎮ 本研究曾经尝试使
用 PCR方法初筛获得可疑样品后再进行分离培养
以获得向日葵黑茎病菌ꎬ但是初筛条带普遍较弱ꎬ难
以准确判断是否有可疑样品ꎬ这可能与普通 PCR 检
测灵敏度较低有关ꎮ 因此对于分离培养工作应该引
起足够重视ꎬ切实做到有效分离ꎬ在此基础上对可疑
菌株进行进一步的鉴定ꎮ 在病菌分离培养过程中ꎬ
由于向日葵种子混杂各种茎秆、花盘、叶片等多种杂
质ꎬ分离培养时极易生长多种杂菌ꎬ如向日葵菌核病
菌 Sclerotinia sclerotiorum、富克葡萄孢盘菌 Botryotin ̄
ia fuckeliana、镰刀菌属 Fusarium、根霉属 Rhizopus、
青霉属 Penicillium、链格孢属 Alternaria菌株等ꎬ且这
些病菌普遍生长速度较快ꎬ造成待分离致病菌难以
获得ꎬ可在分离时适当延长灭菌时间以提高分离成
功率ꎮ
向日葵黑茎病菌可通过田间昆虫活动等进行短
距离传播ꎬ然而其长距离传播多通过受侵染寄主组
织传播ꎬ例如向日葵种子ꎮ Stajic′ et al. (2001)自受
侵染向日葵种皮部观察到了向日葵黑茎病菌分生孢
子器ꎻ轩娅萍等(2011)研究证实向日葵黑茎病菌可
以通过侵染造成种子带菌ꎬ感染部位包括种壳、种皮
及胚乳ꎻMiric et al. (1999)发现在澳大利亚ꎬ向日葵
黑茎病的发生发展与受侵染向日葵种子具有很大关
系ꎻ我国自 2005 年以来向日葵黑茎病在新疆伊犁河
谷 5 县 1 市普遍发生ꎬ危害严重ꎬ且为从国外引种带
病向日葵种子所致(陈卫民等ꎬ2008)ꎬ有报道发现
从进境阿根廷和法国向日葵种子中检出了向日葵黑
茎病菌(Luo et al. ꎬ2011ꎻ罗加凤等ꎬ2012)ꎮ 上述研
究均表明ꎬ该病可以侵染种子造成种子带菌ꎬ并成为
该病传播扩散的重要途径ꎮ 本研究中所截获菌株的
鉴定结果表明ꎬ从哈萨克斯坦进口向日葵种子具有
很大风险ꎬ今后应继续加强对该类进境植物产品上
检疫性有害生物的检测工作ꎬ防范其进一步扩散和
危害ꎮ
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(责任编辑:李美娟)
008 植  物  保  护  学  报 42 卷