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Effect of adaptation to rapeseed varieties on genetic differentiation of Sclerotinia sclerotiorum assessed with SRAP markers

利用SRAP分析油菜品种对核盘菌遗传分化的影响



全 文 :植物病理学报
ACTA PHYTOPATHOLOGICA SINICA  43(4): 383 ̄392(2013)
收稿日期: 2012 ̄02 ̄05ꎻ 修回日期: 2013 ̄03 ̄10
基金项目: 国家科技支撑计划课题(2010BAD01B04)ꎻ农业部公益性行业(农业)科研专项(201103016)ꎻ四川省农作物育种攻关项目
(2011YZGG ̄25)
通讯作者: 刘 勇ꎬ研究员ꎬ博士ꎬ主要从事油菜病害、生物农药和转基因安全研究ꎻ E ̄mail:liuyongdr@163. com
第一作者: 余垚颖ꎬ女ꎬ四川攀枝花人ꎬ硕士研究生ꎬ从事油菜菌核病研究ꎻ E ̄mail:kellyyyzsj@yahoo. com. cnꎮ
利用 SRAP分析油菜品种对核盘菌遗传分化的影响
余垚颖1ꎬ3ꎬ 刘 勇1ꎬ2∗ꎬ 张 蕾1ꎬ2ꎬ 黄小琴1ꎬ2ꎬ 刘红雨1ꎬ2ꎬ 周西全1ꎬ2ꎬ 陈 蓉1ꎬ3
( 1四川省农业科学院植物保护研究所ꎬ 成都 610066ꎻ 2 农业部西南作物有害生物综合治理重点实验室ꎬ 成都 610066ꎻ
3 四川农业大学ꎬ 雅安 625014)
摘要:本文采用茎秆牙签接种法将单一核盘菌菌株接种至不同油菜品种茎秆ꎬ再从 46个油菜品种茎秆内收集接种后形成的菌
核进行分离纯化和培养ꎬ并采用 SRAP技术对 46 株核盘菌菌株进行了遗传分化分析ꎮ 从 12 对检测引物中共获得 357 个位
点ꎬ其中多态性位点 273个ꎬ占 76. 47% ꎻUPGMA聚类分析显示ꎬ在相似系数为 0. 77时ꎬ46株核盘菌菌株能够分为 7 组ꎮ 当以
寄主的抗(耐)病程度、寄主品种类型和品种选育地来源为标准将菌株分为不同群体时ꎬAMOVA(analysis of molecular vari ̄
ance)结果表明核盘菌菌株在各群体内变异率分别为 98. 50% 、105. 16%和 95. 36% ꎬ均达到极显著水平(P <0. 001)ꎬ而寄主品
种选育地群体间的遗传变异达到极显著ꎬ变异率为 4. 64% ꎮ 结果表明:核盘菌菌株接种不同油菜品种后ꎬ菌株间存在明显的
遗传分化ꎬ这种分化与油菜品种的选育地来源有密切关系ꎮ
关键词:核盘菌ꎻ 油菜ꎻ SRAP标记ꎻ 遗传分化
Effect of adaptation to rapeseed varieties on genetic differentiation of Sclerotinia scle ̄
rotiorum assessed with SRAP markers   YU Yao ̄ying1ꎬ3ꎬ LIU Yong1ꎬ2ꎬ ZHANG Lei1ꎬ2ꎬ HUANG
Xiao ̄qin1ꎬ2ꎬ LIU Hong ̄yu1ꎬ2ꎬ ZHOU Xi ̄quan1ꎬ2ꎬ CHEN Rong1ꎬ3   (1 Institute of Plant Protectionꎬ Sichuan Academy of
Agricultural Sciencesꎬ Chengdu 610066ꎬ Chinaꎻ2 Key Laboratory of Integrated Pest Management on Crops in Southwestꎬ Ministry
of Agricultureꎬ Chengdu 610066ꎬ Chinaꎻ3 Sichuan Agricultural Universityꎬ Yaan 625014ꎬ China)
Abstract: Fourty six rapeseed varieties were inoculated with a same strain of Sclerotinia sclerotiorum using the
toothpick inoculation method. Sclerotia were consequently collected from the inoculated and diseased stems of 46
varieties of rapeseed and individually isolated. SRAP (sequence ̄related amplified polymorphism) markers were
used to analyze genetic differentiation of the 46 isolates of S. sclerotiorum reisolated. A total of 357 DNA frag ̄
ments were identified with twelve pair of SRAP primer combinations among which 273 DNA fragments were
polymorphic loci (76. 47% ) . UPMGA results (unweighted pair group method with arithmetic mean) indicated
that the dendrogram consisted of seven groups at the genetic similarity coefficient of 0. 77. AMOVA (analysis of
molecular variance) analysis revealed that the percentage of variation among populations differed by host resis ̄
tant level (98. 5% ꎬP < 0. 001)ꎬ cultivar type (105. 16% ꎬP < 0. 001) and by breeding ground (95. 36% ꎬP <
0􀆰 001)ꎬ but the variation among populations of different breeding ground plants was extremely significant
(4􀆰 64% ꎬP <0. 001) . One of the most significant results in this study was that S. sclerotiorum isolated from dif ̄
ferent varieties of oilseed rape inoculated with the same strain differentiated genetically and the genetic differenti ̄
ation appeared closely related to the rapeseed breeding ground.
Key words: Sclerotinia sclerotiorumꎻ oilseed rapeꎻ SRAP markersꎻ genetic differentiation
中图分类号: S435. 65          文献标识码: A          文章编号: 0412 ̄0914(2013)04 ̄0383 ̄10
 
植物病理学报 43 卷
    核盘菌 ( Sclerotinia sclerotiorum ( Lib. ) De
Bary)是一种非专一性的植物病原真菌ꎬ可侵染
400 种以上的植物[1]ꎬ引起植株幼苗猝倒病和植物
茎基部、果实及贮藏器官的腐烂ꎬ是我国油菜及其
他多种经济作物的重要植物病原菌[2]ꎮ
长期以来ꎬ国内外学者先后对核盘菌病原菌的
寄主适应性、致病性和地理分化等进行了探索和研
究ꎬ试图明确核盘菌的遗传演化规律ꎬ大多数人认
为核盘菌存在遗传多样性ꎮ Sun[3]、Hsiang 等[4]和
Sexton等[5]认为核盘菌的遗传分化与菌株的地理
来源关系密切ꎻLiu等[6]认为核盘菌遗传背景与寄
主关系明显ꎻSun[3]和 Chen 等[7]则认为不同菌核
病菌群体遗传演化与寄主关系不大ꎮ 由此可见ꎬ不
同寄主来源与核盘菌遗传分化的关系尚不明确ꎮ
相关序列扩增多态性 SRAP( sequence ̄related
amplified polymorphism)是 2001 年美国加州大学
的 Li等[8]提出的一种新型分子标记技术ꎬ目前已
成功应用于核盘菌的遗传多样性分析[9]ꎬ如 Li
等[10]用 SRAP对 96 个不同地域的向日葵核盘菌
菌株的遗传多样性和群体结构差异进行了分析研
究ꎮ 为了进一步明确核盘菌遗传分化与油菜的关
系ꎬ本研究采用 SRAP技术对一个核盘菌菌株接种
不同油菜品种所获得 46 个衍生核盘菌进行了遗传
分化分析ꎬ试图评估油菜品种对核盘菌遗传分化的
影响ꎮ
1  材料与方法
1. 1  核盘菌菌株材料
2009 年从四川新都发病油菜茎杆分离纯化获
得核盘菌纯培养物ꎬ次年采用茎杆牙签菌丝体接种
法[11]在油菜初花期将同一(同一营养亲和型)核盘
菌菌丝接种到不同油菜品种茎杆内部ꎬ待油菜成熟
期收集油菜接种牙签部位茎杆内形成的新鲜菌核ꎬ
经室内分离、纯化后获得 46 株油菜核盘菌菌株
(表 1)ꎬ4℃低温保存备用ꎮ
1. 2  核盘菌菌丝收集与 DNA提取
菌株活化后ꎬ挑取菌丝块接种到铺有无菌玻璃
纸的 PDA平板上ꎬ于 20℃的恒温条件下黑暗培养
2 d后收集菌丝于 - 20℃保存备用ꎮ 培养菌丝采
用 CTAB[12]法进行核盘菌 DNA提取ꎮ
1. 3  SRAP引物
引物采用 2001 年 Li等[8]设计的引物ꎬ由上海
生工合成ꎬ详细的碱基序列见表 2ꎮ
1. 4  SRAP ̄PCR及电泳检测
PCR反应体系:总反应体积 20 μLꎬ1 × Bufferꎬ
2 mM MgCl2ꎬ200 μM dNTPsꎬTaq 酶 1 U(购自大
连宝生公司)ꎬ模板 DNA 100 ngꎬ正向和反向引物
各 50 ngꎬddH2O补至 20 μLꎮ
SRAP ̄PCR反应程序:95℃预变性 1 minꎻ94℃
1 minꎬ35℃ 1 minꎬ72℃ 1 minꎬ5 个循环ꎻ94℃ 1
minꎬ50℃ 1 minꎬ72℃ 1 minꎬ35 个循环ꎻ72℃延伸
10 minꎬ4℃保存ꎮ
PCR产物检测:PCR扩增产物用 6%变性聚丙
烯酰胺凝胶电泳分离ꎬ电泳缓冲液为 1 × TBEꎮ 电
泳时ꎬ恒定功率为 65 Wꎬ预电泳 30 minꎬ电泳
2. 5 hꎮ 电泳后采用银染法进行染色[13]ꎮ
1. 5  数据统计与分析
采用人工读带法ꎬ有带记为 1ꎬ无带记为 0ꎬ排
除模糊不清和无法准确标识的条带ꎮ
1. 5. 1  聚类分析  利用 NTSYS软件按 Nei&Li相
似系数法(又称 Dice 法)计算样品间的相似系数
GSijꎬ得到相似系数矩阵ꎬ根据遗传相似系数矩阵ꎬ
按 UPGMA 法进行 SAHN 聚类分析ꎬ再用 Tree
Plot绘出聚类分析树状图[14ꎬ15]ꎮ
1. 5. 2  多样性分析  利用 POPGENE 软件进行统
计分析ꎬ计算 Shannon 信息指数(Shannon’ s index
of diversityꎬⅠ)ꎬ基因分化系数( the coefficient for
gene divergeneꎬGst)和基因流(geneflowꎬNm)等[16]ꎮ
1. 5. 3  分子方差分析   应用 WINAMOVA 1. 55
程序进行分子变异分析(analysis of molecular vari ̄
anceꎬ AMOVA) [17]ꎮ
2  结果与分析
2. 1  引物筛选和 SRAP分析
根据培养特性ꎬ随机选取 2 株正常的核盘菌菌
株对合成的 30 对 SRAP引物进行筛选(图 1)ꎮ 筛
选出 12 对扩增条带丰富、均匀、多态性好的引物ꎮ
12 对引物在 46 个核盘菌菌株中都具有良好的多
态性ꎬ多态位点数目从 18 ~ 39 个不等ꎬ总计 357
个ꎬ平均每对引物29. 75个ꎬ多态位点比例平均为
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  4 期     余垚颖ꎬ等:利用 SRAP分析油菜品种对核盘菌遗传分化的影响
Table 1  The rapeseed varieties and strains of Sclerotinia sclerotiorum used in this study
Strain number Rape variety Breeding ground Host resistance level Cultivar type
2# Deyouzao 1 Sichuan High sensitive Brassica napus L
6# Keyuanyou 9 Sichuan Medium susceptible Brassica napus L
14# Keyuanyou 2 Sichuan Low sensitive Brassica napus L
20# Deyou 8 Sichuan Low sensitive Brassica napus L
23# Meiyouwang Sichuan Low sensitive Brassica napus L
24# Deyou 9 Sichuan Medium susceptible Brassica napus L
30# Zhongnongyou 9 Guizhou Low sensitive Brassica napus L
33# Huawanyou 4 Hubei Low sensitive Brassica napus L
35# Chuanyou21 Sichuan Resistant Brassica napus L
36# Mianyou18 Sichuan Low sensitive Brassica napus L
39# Mianyouwang Sichuan Low sensitive Brassica napus L
45# Liagyou 8 Sichuan Low sensitive Brassica napus L
47# Youyan 7 Sichuan Medium susceptible Brassica napus L
50# Zhongyouza 11 Hubei Low sensitive Brassica napus L
52# Qianyou 11 Guizhou Medium susceptible Brassica napus L
55# Nanyou 6 Sichuan High sensitive Brassica napus L
61# Changyou 2 Sichuan Medium susceptible Brassica napus L
62# Shuza 9 Sichuan High sensitive Brassica napus L
64# Qianhuangyou 21 Sichuan Medium susceptible Brassica napus L
67# Deyou 5 Sichuan Medium susceptible Brassica napus L
74# Deyou 15 Sichuan High sensitive Brassica napus L
79# Jinyou 6 Sichuan High sensitive Brassica napus L
81# Jinyou 858 Sichuan High sensitive Brassica napus L
85# Xinwanzayou 2 Sichuan Low sensitive Brassica napus L
88# Deyouza 10 Sichuan Low sensitive Brassica napus L
90# Chuanyou 20 Sichuan Medium susceptible Brassica napus L
91# Mianyou 15 Sichuan High sensitive Brassica napus L
94# Tezaowang Chongqing High sensitive Brassica napus L
96# Zeye Chongqing High sensitive Brassica napus L
98# Baihuaban Chongqing High sensitive Brassica napus L
100# Gaodengyoucai Chongqing High sensitive Brassica napus L
101# Guiza 4 Guizhou High sensitive Brassica napus L
103# Huayouza 13 Hubei Medium susceptible Brassica napus L
105# Chuanyou33 Sichuan Medium susceptible Brassica napus L
107# Youyan 9 Guizhou High sensitive Brassica napus L
108# Zhongyouza 2 Hubei High sensitive Brassica napus L
109# Zhongyou 821 Hubei Medium susceptible Brassica napus L
112# Deza 800 Sichuan Medium susceptible Brassica napus L
114# Zhongyou 6303 Guizhou Low sensitive Brassica napus L
115# Baoyou 517 Guizhou High sensitive Brassica napus L
116# Yuyou 22 Chongqing High sensitive Brassica napus L
120# Chuanda 319 Sichuan Low sensitive Brassica napus L
127# Guiyou 7 Guizhou Low sensitive Brassica napus L
106# Maweiyoucai Sichuan High sensitive Brassica campestris L
68# Leyou 4 Sichuan High sensitive Brassica campestris L
99# Zeyejie Chongqing Low sensitive Brassica juncea L
Note: Host resistant level is derived from the result of rape field resistance by Institute of plant Protectionꎬ Sichuan Acade ̄
my of Agricultural Sciences in 2010.
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植物病理学报 43 卷
Table 2  SRAP primers used in genetic diversity analysis of Sclerotinia sclerotiorum
Code Reverse primer Code Forward primer
em1 5′ ̄GACTGCGTACGAATTAAT ̄3′ me1 5′ ̄TGAGTCCAAACCGGATA ̄3′
em2 5′ ̄GACTGCGTACGAATTTGC ̄3′ me2 5′ ̄TGAGTCCAAACCGGAGC ̄3′
em3 5′ ̄GACTGCGTACGAATTGAC ̄3′ me3 5′ ̄TGAGTCCAAACCGGAAT ̄3′
em4 5′ ̄GACTGCGTACGAATTTGA ̄3′ me4 5′ ̄TGAGTCCAAACCGGACC ̄3′
em5 5′ ̄GACTGCGTACGAATTAAC ̄3′ me5 5′ ̄TGAGTCCAAACCGGAAG ̄3′
em6 5′ ̄GACTGCGTACGAATTGCA ̄3′
Table 3  Number of total and polymorphic fragments per SRAP primer combination
Primer combination Total fragments Number of poly ̄morphic loci Percentage of poly ̄morphic loci / %
em1 ̄me4 18 15 83. 33
em2 ̄me5 33 26 78. 79
em3 ̄me3 24 17 70. 83
em3 ̄me5 37 31 83. 78
em4 ̄me3 23 16 69. 57
em4 ̄me5 34 23 67. 65
em5 ̄me1 39 32 82. 05
em5 ̄me3 28 21 75. 00
em5 ̄me5 32 28 87. 50
em6 ̄me1 30 23 76. 67
em6 ̄me2 28 16 57. 14
em6 ̄me5 31 25 80. 65
Total 357 273 76. 47
Mean 29. 75 22. 75 76. 47
Fig. 1  Primer screening
Lane A to K shows em3 ̄me2ꎬ em3 ̄me3ꎬ em3 ̄me5ꎬ em4 ̄me3ꎬ em4 ̄me5ꎬ DL 2000 Markerꎬ
em4 ̄me1ꎬ em4 ̄me2ꎬ em5 ̄me1ꎬ em5 ̄me3ꎬ em5 ̄me2 and em5 ̄me5 respectively.
683
 
  4 期     余垚颖ꎬ等:利用 SRAP分析油菜品种对核盘菌遗传分化的影响
76. 47% (表 3)ꎬ部分引物扩增条带原图信息
(图 2)ꎮ
2. 2  遗传聚类分析
用 NTSYS软件ꎬ按照 UPGMA法对 46 个核盘
菌菌株进行聚类分析并构建聚类树状图(图 3)ꎮ
从图 3 可以看出ꎬ在相似性系数为 0. 77 时ꎬ供试菌
株可分为 7 类(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、IV、V、Ⅵ、Ⅶ)ꎮ 其中第
Ⅰ类仅有 101#号菌株ꎻ第Ⅱ类包含 64#和 67#号 2
个菌株ꎻ第Ⅲ类有 4 个菌株ꎬ分别是 81#、85#、88#、
90#ꎻ52#、55#、61#、62#、68#、74#、79#共 7 个菌株属于
第 V类ꎻ第Ⅵ类包括 35#、45#、47#、50#ꎬ第Ⅶ类 10
个菌株ꎬ分别是 2#、6#、14#、20#、23#、24#、30#、33#、
36#、39#ꎻ其余 18 个菌株属于第Ⅳ类ꎮ
    根据寄主的抗(耐)病程度、寄主品种类型和
寄主选育地来源为标准进一步对 46 个核盘菌菌株
进行区组划分ꎬ可分别划分为 2 个寄主选育地(川
育和省外选育)群体ꎻ4 个抗感程度(高感、中感、低
感、抗(耐)病)群体ꎻ3 个类型(甘蓝型、白菜型、芥
菜型)群体ꎮ 聚类图(图 3)显示:从寄主类型来看ꎬ
不同寄主类型的菌株聚在一起ꎬ如 98#与 99#菌株
其寄主类型分别为甘蓝型和白菜型ꎬ说明寄主类型
对核盘菌菌株的遗传分化影响不明显ꎻ从寄主菌核
病抗感程度来看ꎬ寄主抗感程度随着其菌株聚类未
呈明显的分组趋势ꎬ说明寄主菌核病抗感程度对核
盘菌菌株的遗传分化影响不明显ꎻ但从寄主选育地
来看ꎬ寄主选育地随着菌株聚类而呈现明显的分组
趋势ꎬ说明寄主选育地来源影响核盘菌菌株的遗传
分化ꎮ
用 Cophenetic values将聚类结果转换为协表
征矩阵ꎬ用 MXCOMP 程序对聚类结果与相似系
数进行Mantel检验ꎬr = 0. 750 5ꎬ达到了显著的水
平ꎬ说明聚类结果与遗传相似系数密切相关ꎬ表
明采用 SRAP分子标记对 46 个核盘菌菌株进行
聚类分析结果可靠ꎬ46 个菌株存在真实的遗传
差异ꎮ
2. 3  遗传多样性与分子变异分析
46 个核盘菌菌株按上述方法分为 3 组ꎬ统计
每组每群体菌株的份数ꎬ根据其 SRAP指纹数据计
算 Shannon指数表明:对于不同寄主选育地来源的
菌株ꎬ川育品种的遗传多样性高于省外选育品种ꎻ
对于不同寄主抗(耐)病程度来源的菌株ꎬ中感群
体的遗传多样性最高ꎬ抗(耐)病群体最低ꎻ对于不
同寄主类型的菌株而言ꎬ甘蓝型 >白菜型 >芥菜型
(表 4)ꎮ
    对 3 组中不同群体进行 AMOVA 分析的结果
(表 5)显示ꎬ核盘菌菌株群体内遗传变异比例均大
于群体间ꎬ并且所有群体内变异都达到极显著水平
(P <0. 001)ꎬ说明核盘菌菌株的遗传变异主要来
源于群体内ꎻ在寄主抗感程度、寄主类型两个组中
菌株群体间的变异分别为 1. 85%和 - 5. 16% ꎬ且
变异不显著ꎬP 值分别为 0. 126 9 和 0. 846 2ꎬ说明
寄主的抗(耐)病程度、寄主品种类型对核盘菌菌
株遗传分化影响不明显ꎻ在寄主选育地来源组中菌
株群体间的变异为 4. 64% ꎬ95. 36%的变异发生在
群体内ꎬ群体间和群体内的变异均达到极显著水平
(P <0. 001)ꎬ说明寄主选育地对核盘菌菌株遗传
分化有显著影响ꎻ同样ꎬ依据 POPGENE 软件对 46
个核盘菌菌株按照寄主选育地分组进行分析的结
果(表 6)表明ꎬ基因分化系数(Gst)为 0. 048ꎬ表明
其群体间的遗传变异达 4. 8% ꎬ此结果与 AMOVA
分析的结果基本一致ꎮ
3  讨论
病原菌变异的方式包括个体间进化(系统发
育)以及时空差异造成的变异ꎬ核盘菌属于非专
一性病原菌ꎬ不存在小种分化ꎬ但致病力存在明
显的差异ꎬ使得防治核盘菌相当困难ꎮ 近年来ꎬ
利用 SRAP标记对核盘菌遗传多样性[7ꎬ10]研究结
果表明ꎬSRAP 标记技术不仅可用于地区间核盘
菌遗传多样性分析ꎬ也可用于寄主、生态区等遗
传背景差异造成的核盘菌遗传多样性分析ꎬ应用
前景广阔ꎮ 本文利用 SRAP分子标记对同一核盘
菌菌株接种不同油菜品种茎杆后形成的 46 株核
盘菌菌株进行了遗传多样性分析ꎬ结果显示:12
对 SRAP 引物扩增出 273 个多态性位点ꎬ表明
SRAP标记技术是研究核盘菌菌株遗传多样性以
及遗传演化分析的一种有效方法ꎮ
783
 
植物病理学报 43 卷883
 
  4 期     余垚颖ꎬ等:利用 SRAP分析油菜品种对核盘菌遗传分化的影响 983
 
植物病理学报 43 卷
Table 4  Genetic diversity indices of Sclerotinia sclerotiorum populations
Group Sample size Shannon
Breeding ground In Sichuan 28 0. 236
Out of Sichuan 18 0. 213
Host resistance level Tolerant 1 0. 000
Low sensitive 15 0. 217
Medium susceptible 12 0. 239
High sensitive 18 0. 220
Cultivar type Brassica napus L. 43 0. 239
Brassica campestris L. 2 0. 120
Brassica juncea L 1 0. 000
Total mean 46 0. 238
SD 0. 193
SD: Standard deviation.
Table 5  AMOVA analysis of genetic variation in Sclerotinia sclerotiorum populations
Source of variation df
Mean
square
Variance
component
Percentage of
variation / %

Four host resistance levels Among populations 3 51. 167 0. 8065 1. 85 0. 1269
Within population 42 42. 857 42. 857 98. 15 <0. 001
Three types Among populations 2 38. 761 -2. 209 -5. 16 0. 8462
Within population 43 45. 054 45. 054 105. 16 <0. 001
Two breeding grounds Among populations 1 87. 637 2. 064 4. 64 <0. 001
Within population 44 42. 405 42. 405 95. 36 <0. 001
Table 6  Genetic differentiation in Sclerotinia sclerotiorum
populations from various breeding grounds
Group Sample size Ht Hs Gst Nm
China 46 0. 236 0. 225 0. 048 10. 031
SD 0. 037 0. 033
Ht: Gene diversity of speciesꎻ Hs: Gene diversity with a populationꎻ Gst: Gene coefficient of gene differentiationꎻ Nm:
Gene flowꎻ SD: Standard deviation.
    聚类分析结果显示ꎬ在相似性系数为 0. 77 时ꎬ
46 株供试菌株可分为 7 类ꎬ证明同一核盘菌菌株
接种不同油菜品种后形成的 46 株核盘菌菌系存在
遗传分化ꎮ 目前ꎬ国内外许多学者对核盘菌菌株的
遗传多样性进行了大量研究ꎬ如Wang[18]利用 SSR
分子标记技术对 112 株向日葵菌核病病原菌的遗
传多样性分析后证明地理位置的不同是导致不同
核盘菌群体存在差异的重要原因ꎻSexton 等[4]对
澳大利亚油菜菌核病病原菌群体遗传多样性分析
后也表明其遗传分化与地理来源有密切关系ꎻ
Chen等[7]利用 SRAP 对 76 个核盘菌菌株进行遗
传多样性分析后也表明核盘菌的遗传分化和遗传
多样性与地理隔离密切相关ꎮ 本文按核盘菌菌株
的寄主抗(耐)病程度、寄主品种类型和品种选育
地分组ꎬ进行遗传多样性分析后的 AMOVA 结果
显示:只有按寄主选育地分组的核盘菌菌株群体内
和群体间的变异率达到了极显著水平ꎬ分别为
95􀆰 36%和 4. 64% ꎮ 其余两组ꎬ群体内变异率未达
093
 
  4 期     余垚颖ꎬ等:利用 SRAP分析油菜品种对核盘菌遗传分化的影响
到显著水平ꎮ 说明菌株来源寄主的抗(耐)病程
度、寄主品种类型对核盘菌菌株遗传分化影响不明
显ꎬ只有寄主选育地对核盘菌菌株遗传分化的影响
达到显著水平ꎬ表明核盘菌菌株的遗传分化和遗传
多样性与寄主的地理来源密切相关ꎮ 本文采用菌
丝亲和性试验验证了分离菌株与接种菌株的同源
特性ꎬ同时采用菌株生物学特性观察方法证实了菌
株在菌丝生长速度、菌核的重量、数量和基质颜色
等特征上存在差异(试验结果将另行发表)ꎬ表明
本文采用同一(同一营养亲和型)核盘菌菌株菌丝
接种到油菜茎杆内部ꎬ再收集菌丝生长后对形成的
菌核进行核盘菌遗传变化分析的结果与前人研究
一致ꎬ首次证实了寄主生长环境对同一核盘菌菌系
遗传分化存在影响ꎮ 在寄主品种类型(白菜型、甘
蓝型、芥菜型)分组中ꎬ由于芥菜型和白菜型油菜
品种较少ꎬ在一定程度上可能会掩盖因不同油菜品
种类型来源菌株数差异太大而影响结果的精确性ꎬ
以后将会专门收集芥菜型和白菜型油菜品种进行
进一步研究ꎮ
本文采用火柴棍菌丝接种法将同一个核盘菌
菌株菌丝接种到油菜茎杆内部后再收集菌丝生长
后形成的菌核进行核盘菌遗传变化分析的方法ꎬ首
次研究了不同寄主油菜品种对同一核盘菌菌系遗
传分化的影响ꎬ研究结果在一定程度上揭示了核盘
菌遗传分化速度较快和菌核病防治相对困难的主
要原因ꎬ给菌核病防控带来一定启示:在进行油菜
菌核病防控时ꎬ应对核盘菌引发的不同寄主菌核病
进行全面防控以降低核盘菌分化速度ꎻ在油菜新品
种选育方面ꎬ要充分考虑由于地域差异可能会导致
核盘菌存在优势菌群差异ꎬ在选育新品种时应针对
当地的优势菌群进行抗性品种选育ꎮ
参考文献
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责任编辑:李晖
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