全 文 :植物病理学报
ACTA PHYTOPATHOLOGICA SINICA 45(3): 307 ̄316(2015)
收稿日期: 2014 ̄06 ̄30ꎻ 修回日期: 2015 ̄01 ̄12
基金项目: 国家自然科学基金资助项目(31201555)ꎻ 江苏省自主创新基金项目[CX(13)5027]
通讯作者: 刘邮洲ꎬ副研究员ꎬ主要从事园艺作物病害生物防治研究ꎻTel:025 ̄84390228ꎬ E ̄mail:shitouren88888@163.comꎮ
doi:10.13926 / j.cnki.apps.2015.03.010
绿针假单胞菌 YL ̄1抗细菌活性相关基因的克隆和分析
刘邮洲1ꎬ 2∗ꎬ Shi ̄En Lu2ꎬ Sonya M. Baird2ꎬ 乔俊卿1ꎬ 杜 艳1
( 1江苏省农业科学院植物保护研究所ꎬ南京 210014ꎻ 2 美国密西西比州立大学植物病理系ꎬ密西西比州 39759)
摘要:绿针假单胞菌 YL ̄1对植物多种重要病原细菌和病原真菌有较强的抑制作用ꎮ 采用转座子插入突变技术电转化绿针
假单胞菌 YL ̄1ꎬ构建随机插入突变体库ꎮ 通过平板抑菌试验从突变体库中筛选对 3 种病原细菌荚壳伯克霍尔德菌
Burkholderia glumae、解淀粉欧文氏菌 Erwinia amylovora和胡萝卜果胶杆菌 Pectobacterium carotovora抑菌效果显著下降的
突变体ꎬ并采用 PCR和 Southern Blot验证转座子是否成功插入到 YL ̄1染色体基因组上ꎮ 利用质粒拯救技术克隆转座子
插入位点基因、测序和生物信息学分析ꎮ 结果表明:本研究成功构建了绿针假单胞菌 YL ̄1随机插入突变体库ꎬ筛选出 7株
对 3种病原细菌抑制效果明显下降的突变体ꎬ但其对立枯丝核菌的抑制效果与野生型菌株 YL ̄1相同ꎻPCR和 Southern Blot
试验结果表明绿针假单胞菌 YL ̄1的 7株突变体均是单拷贝ꎻ克隆到 7个突变体插入位点的基因序列并测序ꎬ生物信息学
分析结果表明其中 6个突变位点是嗜铁素合成基因簇ꎬ1个突变位点是蛋白分泌基因 secYꎮ
关键词:绿针假单胞菌 YL ̄1ꎻ 突变株ꎻ 抗细菌活性ꎻ 质粒拯救ꎻ 克隆
Cloning the genes of Pseudomonas chlororaphis YL ̄1 dedicated to antibacterial
activities against microbial phytopathogens LIU You ̄zhou1ꎬ 2ꎬ SHI ̄En Lu2ꎬ SONYA M.
Baird2ꎬ QIAO Jun ̄qing1ꎬ DU Yan1 ( 1 Institute of Plant Protectionꎬ Jiangsu Academy of Agricultural Sciencesꎬ Nanjing
210014ꎬ Chinaꎻ 2 Department of Plant Pathologyꎬ Mississippi State Universityꎬ Starkvilleꎬ Mississippi 39759ꎬ USA)
Abstract: Strain YL ̄1 was isolated from soybean root tips and identified to be Pseudomonas chlororaphis. This
strain showed broad ̄spectrum antibacterial and antifungal activities against plant pathogens that are economically
important in agriculture. In order to characterize the genes dedicated to antibacterial activities against microbial
phytopathogensꎬ a Tn5 ̄mutation library of YL ̄1 was constructed. Plate bioassays revealed that seven mutants
MT1 ̄7 reduced their antibacterial activities against Burkholderia glumaeꎬ Erwinia amylovora and Pectobacterium
carotovora as compared with its wild type strain while remained steady antifungal activity against Rhizoctonia
solani. All the mutants MT1 ̄7 were verified by PCR and Southern Blotꎬ and the transposon was inserted into
YL ̄1 genomic DNA successfully by single copy. Seven genes around the insertion site were cloned and
sequenced using a plasmid rescue procedure as recommended by the manufacturer of the EZ ̄Tn5 kit. The
bioinformatic analysis results showed that six genes were related to pyoverdine synthesis and the other secY gene
belonged to the Sec protein translocation system.
Key words: Pseudomonas chlororaphis YL ̄1ꎻ mutantꎻ antibacterial activitiesꎻ rescue plasmidꎻ cloning
中图分类号: S432.44 文献标识码: A 文章编号: 0307 ̄0316(2015)03 ̄0307 ̄10
假单胞菌 Pseudomonas spp.是活跃在植物根
际和叶面的一类微生物ꎬ属内许多菌株属于植物根
围促生细菌 ( Plant Growth ̄Promoting Rhizobacte ̄
riaꎬPGPR)类ꎬ能防治植物病害、促进植株生长[1]ꎮ
植物病理学报 45卷
这些具有生防促生作用的菌株尤以荧光性假单胞
菌 Fluorescent Pseudomonas spp.为主ꎬ包括铜绿假
单胞菌 P. aeruginosa、致金色假单胞菌 P. aureofa ̄
ciens、荧光假单胞菌 P. fluorescens 和绿针假单胞
菌 P. chlororaphis等[2]ꎮ
绿针假单胞菌 P. chlororaphis对多种植物有控
病促生作用[3]ꎬ能增强植物抗逆性[4~5]、对环境友
好、对生物无致病性[6]ꎮ 其中ꎬ有的菌株已成功开发
为商用生防产品ꎬ如瑞士 BioAgri AB公司研制的基
于绿针假单胞菌的生防药剂 Cedomonꎬ主要用于大
麦和燕麦种子处理ꎬ可防治苗期多种真菌病害[7]ꎮ
目前ꎬ国际上研究报道较多的是利用绿针假单胞菌
防治真菌和卵菌病害ꎮ 如ꎬ防治番茄枯萎病[8~9]、烟
草疫霉病[10]、辣椒疫霉病[11~12]、油菜菌核病[13]、柏
树溃疡病[3]和豆类炭疽病[14]等ꎮ 然而ꎬ关于绿针假
单胞菌对细菌病害的防治国际上未见相关报道ꎮ
绿针假单胞菌 YL ̄1 是本实验室从大豆根围
分离获得的一株细菌ꎬ室内抑菌试验结果表明:该
菌株对多种农业重要病原真菌和卵菌(尖孢镰刀
菌 Fusarium oxysporum、辣椒疫霉病菌 Phytophtho ̄
ra capsici、立枯丝核菌 Rhizoctonia solani、核盘菌
Sclerotinia sclerotiorumi)菌丝生长具有很强的抑制
作用ꎻ进一步研究发现绿针假单胞菌 YL ̄1对参试
的几种农业重要病原细菌 (荚壳伯克霍尔德菌
Burkholderia glumae、解淀粉欧文氏菌 Erwinia
amylovora、密执安棒杆菌 Clavibacter michiganesis、
胡萝卜果胶杆菌 Pectobacterium carotovora、丁香
假单胞菌 P.syringae、野油菜黄单胞菌Xanthomonas
campestris)均具有明显的抑制作用ꎬ这个特性区别
于目前已报道的同种内其他菌株ꎮ
本研究采用转座子突变技术建立随机突变体
文库ꎬ进而筛选绿针假单胞菌 YL ̄1抑制细菌能力
明显下降或丧失的突变菌株ꎬ采用质粒拯救
( rescue plasmid)等方法ꎬ克隆绿针假单胞菌 YL ̄1
抗细菌活性的相关基因并进行分析ꎮ 研究结果能
挖掘绿针假单胞菌的抗细菌病害能力ꎬ开发相关抗
细菌病害生物农药ꎬ提升该菌的生防应用前景ꎻ同
时对于遗传改良绿针假单胞菌ꎬ解析该菌对细菌病
害的生防机理提供理论依据ꎮ
1 材料与方法
1.1 材料
供试菌株绿针假单胞菌 P. chlororaphisYL ̄1ꎬ
是本实验室从大豆根围分离获得的对多种病原真
菌和细菌均具有较强抑菌活性的菌株ꎮ 立枯丝核
菌 R. solani 由本实验室保存ꎮ 荚壳伯克霍尔德菌
B. glumae、解淀粉欧文氏菌 E. amylovora、胡萝卜
果胶杆菌 P. carotovora由本实验室保存ꎮ
病原真菌用 PDA 培养基(马铃薯 200 g、葡萄
糖 20 g、琼脂 20 g、蒸馏水 1 000 mL)培养ꎮ 绿针
假单胞菌 YL ̄1、病原细菌和大肠杆菌(Escherichia
coli) EC100D pir+(表 1)用 LB培养基(蛋白胨 10
g、酵母粉 5 g、NaCl 10 g、琼脂 20 g、蒸馏水 1 000
mL)培养ꎮ 假单胞菌感受态细胞电转化后复苏用
SOC液体培养基(胰蛋白胨 20 g、酵母粉 5 g、NaCl
0. 5 g、 2. 5 mmol / L KCl、 10 mmol / L MgCl2、 20
mmol / L 葡萄糖、蒸馏水 1 000 mL)ꎮ 绿针假单胞
菌 YL ̄1 及突变菌株产荧光色素测试用金氏 B 培
养基[15](蛋白胨 20 g、K2HPO4 1.5 g、MgSO4 1.5 g、
pH值 7.2±0.2、琼脂 20 g、蒸馏水 1 000 mL)ꎮ
主要试剂和仪器:DNA Marker、限制性内切
酶、Taq DNA聚合酶、T4 DNA连接酶、细菌基因组
DNA 提取试剂盒、质粒提取试剂盒购自美国
Promega公司ꎻ卡那霉素 ( Kanamycin )、四环素
(Tetracycline)等购自美国 Sigma 公司ꎻ EZ ̄Tn5
<R6Kgori / KAN ̄2>转座子试剂盒购自美国 Epicen ̄
tre公司ꎻDIG试剂盒购自 Roche 公司ꎻElectropora ̄
tor 2510电转化仪购自德国 Eppendorf 公司ꎮ 引物
合成和基因测序由美国 Eurofins公司完成ꎮ
1.2 对病原真菌和病原细菌室内拮抗能力测试
挑取绿针假单胞菌 YL ̄1和 3 种病原细菌(荚
壳伯克霍尔德菌 B. glumae、解淀粉欧文氏菌
E. amylovora和胡萝卜果胶杆菌 P. carotovora)单
菌落接种到 5 mL LB 液体培养基中ꎬ28℃ꎬ200 r /
min过夜培养ꎬ10℃ꎬ10 000×g 离心 10 min 后用无
菌水稀释至菌含量达 2×108 CFU / mLꎮ
在 LB 平板中央滴绿针假单胞菌 YL ̄1 菌液
5 μLꎬ菌含量 2×108 CFU / mLꎬ28℃培养 48 h 后ꎬ
用各病原细菌稀释液瞬间喷雾ꎬ28℃恒温培养过
夜ꎮ 每处理重复 3 皿ꎮ 设清水对照ꎮ 待对照平板
病原细菌长满平板时ꎬ测定抑菌圈直径ꎮ
病原真菌 R. solani 在 PDA 平板上长满平板
后ꎬ沿菌落边缘用孔径为 5 mm 的灭菌打孔器打
孔 ꎮ将病原真菌菌饼置于直径90mm空白PDA
803
3期 刘邮洲ꎬ等:绿针假单胞菌 YL ̄1抗细菌活性相关基因的克隆和分析
Table 1 Strainsꎬ plasmids and primers used in this study
Items Relevant characteristics∗ Source
Escherichia coli
TransforMax
EC100D pir+
F ̄ mcrAΔ(mrr ̄hsdRMS ̄mcrBC) φ80dlacZΔM15 ΔlacX74 recA1 endA1
araD139Δ(araꎬ leu)7697 galU galK λ ̄ rpsL (StrR) nupG pir+(DHFR)
Epicentre
Biotechnologies
Pseudomonas spp.
YL ̄1 Wild ̄type strain This study
MT1 ̄7 Tn5 derivatives of YL ̄1ꎻ Kmr This study
Plasmids
pUCP26 Broad ̄host ̄range vectorꎻ Tcr Luꎬ et al. (2002)
Primers
Tn FP 5′ ̄GCAATCAGGTGCGACAATCT ̄3′ This study
Tn RP 5′ ̄ATTCAACAAAGCCGCCGTC ̄3′ This study
KAN ̄2 FP ̄1 5′ ̄ACCTACAACAAAGCTCTCATCAACC ̄3′ Epicentre Biotechnologies
R6KAN ̄2 RP ̄1 5′ ̄CTACCCTGTGGAACACCTACATCT ̄3′ Epicentre Biotechnologies
∗ Kmrꎬ Tcrꎬ resistance to kanamycinꎬ and tetracyclineꎬ respectively.
平板上ꎬ菌饼中心距平板边缘 30 mmꎬ另一侧离平
板边缘 30 mm 处滴绿针假单胞菌 YL ̄1 菌液 5
μLꎬ菌含量 2×108 CFU / mLꎬ28℃恒温培养ꎮ 每处
理重复 3 皿ꎮ 设清水对照ꎮ 待对照平板病原真菌
长满时ꎬ测量 YL ̄1 处理的病原菌菌落生长带宽ꎬ
计算抑制率ꎮ 病原真菌抑制率(%)= (对照病原菌
菌丝带宽 ̄处理病原菌菌丝带宽) /对照病原菌菌丝
带宽×100ꎮ
1.3 绿针假单胞菌 YL ̄1 随机插入突变体库的
构建
绿针假单胞菌 YL ̄1 感受态细胞的制备参照
文献[16] (Cornish et al.ꎬ 1998 )的方法ꎮ 利用大
肠杆菌 ̄假单胞菌穿梭载体 pUCP26(25 μg / mL 的
四环素抗性)检测菌株 YL ̄1感受态细胞的转化效
率ꎮ 将 50 μL 绿针假单胞菌 YL ̄1 感受态细胞加
入 2 μL 浓度为 25 mg / mL 的 pUCP26 质粒ꎬ混合
后转入 0.2 cm的提前预冷的电击杯中ꎮ 调节电压
2.5 KVꎬ将电击杯放入电转化仪ꎬ电击 2 s 后ꎬ迅速
转入 5 mL 的 SOC 液体培养基试管中ꎬ28℃ꎬ200
r / min复苏 4 hꎮ 转化产物取 100 μL 涂布于含有
25 μg / mL四环素抗性的 LB 平板ꎬ28℃培养24 hꎬ
挑取转化子并计算转化效率ꎮ 转化效率 =产生菌
落的总数×稀释倍数 /质粒 DNA的总量ꎮ
采用上述同样条件ꎬ每 50 μL 绿针假单胞菌
YL ̄1感受态细胞中加入 2 μL 的 EZ ̄Tn5 <R6K
gori / KAN ̄2>质粒ꎬ电转化后复苏ꎬ转化产物取 100
μL涂布于含有 100 μg / mL 卡那霉素抗性的 LB
平板ꎬ28℃培养 24 hꎬ挑取转化子ꎮ 重复 3次ꎮ
1.4 突变株的筛选
从转化平板上用灭菌牙签挑取单菌落ꎬ移入
5 mL LB培养液中ꎬ28 ℃ꎬ200 r / min 过夜培养后ꎬ
测试其对病原细菌的拮抗能力ꎬ试验方法见 1.2ꎮ
28℃恒温培养ꎬ待清水对照平板病原细菌长满时ꎬ
挑选出与野生型菌株 YL ̄1 的抑菌圈对比抑菌效
果明显下降的分离物ꎮ 单菌落纯化后ꎬ-70 ℃甘油
保存ꎮ 测试突变株对病原真菌 R. solani 的拮抗能
力ꎬ试验方法见 1.2ꎮ
1.5 随机插入突变株的 PCR 验证和 Southern
杂交验证
将 1.4抑菌试验中筛选的 7株突变体分别接种
于含 100 μg / mL 卡那霉素的 LB 液体培养基中ꎬ
28℃ꎬ200 r / min培养过夜ꎬ提取突变体的染色体基
因组DNAꎮ 采用引物 Tn FP和 Tn RP(表 1)扩增转
座子 DNA中卡那霉素的部分片段ꎬ大小约 750 bpꎮ
903
植物病理学报 45卷
扩增程序:95℃ 3 minꎻ95℃ 30 sꎻ55℃ 30 sꎬ72℃
40 sꎻ30个循环ꎻEC100D pir+ 10 minꎻ 4℃维持ꎮ
参照 Lu 等[17]的方法ꎬ利用 npt II 基因(赋予
细胞卡那霉素抗性)片段经 DIG 标记为探针ꎬ用
EcoR I限制性内切酶对 7 株突变株的 DNA 进行
酶切ꎬ电泳ꎬ转膜进行 Southern Blotꎮ 杂交及探针
标记采用 Roche公司的 DIG试剂盒ꎮ
1.6 突变株插入位点基因的克隆及生物信息学分析
利用转座子 EZ ̄Tn5 <R6K gori / KAN ̄2>自身
的多酶切位点ꎬ用限制性内切酶 Pst I 对突变株的
基因组 DNA随机进行酶切ꎬ参照转座子试剂盒方
法ꎬ酶切后的 DNA 片段进行环化自连ꎬ构建拯救
质粒ꎬ电转化宿主大肠杆菌 EC100D pir+ꎮ 37℃过
夜培养后提取质粒ꎬ用试剂盒自带引物 KAN ̄2
FP ̄1和 R6KAN ̄2 RP ̄1(表 1)测序ꎬ获得 YL ̄1 突
变株染色体基因组 DNA插入位点的侧翼序列ꎮ
对绿针假单胞菌 YL ̄1 进行了全基因组测
序[18]ꎬ根据获得的插入位点的侧翼序列ꎬ进行序列
分析ꎬ获得的完整基因在 NCBI 网站进行数据分析
(http: / / www.ncbi.nlm.nih.gov / )ꎮ
1.7 嗜铁素(Pyoverdine)选择性培养基上检测
突变株发光表型
将突变株 MT1 ̄7划线于嗜铁素选择性培养基
(金氏 B培养基)上ꎬ28℃培养 2 dꎬ紫外光 366 nm
下观察突变株发光情况ꎮ
2 结果与分析
2.1 绿针假单胞菌 YL ̄1突变体库构建
用大肠杆菌 ̄假单胞菌穿梭载体 pUCP26 (25
μg / mL的四环素抗性) 检测菌株 YL ̄1 感受态细
胞的电转化效率ꎮ 试验结果表明:绿针假单胞菌
YL ̄1感受态细胞电转化效率较高ꎬ为 2×107CFU /
μg DNAꎮ 随机挑取 20个转化子于 LB培养液(25
μg / mL 四环素抗性)中 28℃ꎬ200 r / min 培养过夜
后提质粒ꎬ限制性内切酶 BamH I 和 EcoR V 对质
粒进行双酶切验证ꎬ产生分子量约为 2 000 bp 和
3 000 bp的条带ꎬ与相同酶切的质粒 pUCP26结果一
致ꎬ证明这些转化子中均含有质粒 pUCP26(图 1)ꎮ
利用 EZ ̄Tn5 <R6K gori / KAN ̄2>转座子试剂
盒随机转化菌株 YL ̄1 感受态细胞ꎬ分 3 次进行ꎬ
共获得 5 100个转化子ꎮ
2.2 YL ̄1突变株对几种病原菌的抑菌活性测定
以 3 种病原细菌 (B. glumae、 E. amylovora、
P. carotovora)和病原真菌 R. solani作为试验指示
菌进行室内抑菌能力筛选试验ꎮ 与野生型菌株相
比ꎬ7个突变菌株 (MT1 ̄7) 对 3 种病原细菌抑菌
能力有不同程度的明显下降ꎬ但是对病原真菌 (R.
solani) 抑菌能力几乎不变(图 2 ~图 5)ꎮ 而突变
菌株 MT ̄8对 3种病原细菌抑菌能力几乎不变ꎬ但
是对病原真菌 (R. solani) 完全丧失抑菌能力(另
文发表) ꎮ试验结果表明:7个突变菌株(MT1 ̄7)
Fig. 1 Plasmids 1 ̄20 extracted by the transformants of strain YL ̄1 and plasmid
pUCP26 cut into 2.0 kb and 3.0 kb fragments by BamH I and EcoR V digestion
013
3期 刘邮洲ꎬ等:绿针假单胞菌 YL ̄1抗细菌活性相关基因的克隆和分析
Fig. 2 Comparison of antibacterial activity to Burkholderia glumae in YL ̄1 wild type (WT) and mutants
Fig. 3 Comparison of antibacterial activity to Erwinia amylovora in YL ̄1 wild type (WT) and mutants
Fig. 4 Comparison of antibacterial activity to Pectobacterium carotovora
in YL ̄1 wild type (WT) and mutants
113
植物病理学报 45卷
Fig. 5 Comparison of antifungal activity to Rhizoctonia solani in YL ̄1 wild type (WT) and mutants
的转座子插入突变位点与绿针假单胞菌 YL ̄1 的
抗细菌活性相关ꎬ与其抗真菌活性无关ꎮ 同时绿针
假单胞菌 YL ̄1 分泌的抗细菌活性物质具有广谱
的抗细菌活性ꎮ
2.3 突变株的 PCR验证
7个突变菌株 (MT1 ̄7)进行转座子插入基因
组上的部分卡那霉素抗性基因编码片段的 PCR验
证ꎬ结果如图 6所示ꎮ 7个突变菌株的染色体基因
组中均可以扩增出大小约为 750 bp 的部分卡那霉
素抗性基因编码片段ꎬ而对照野生型菌株 YL ̄1没
有扩增出条带ꎬ说明转座子 Tn5均已进入此 7株突
变体染色体基因组内ꎮ
Fig. 6 PCR amplification of part kanamycin
genomes extracted from YL ̄1 wild
type (WT) and mutants (1 ̄7)
2.4 Southern blot验证 Tn5质粒单拷贝插入染
色体上
对 2.2 中挑选的 7 个突变菌株进行 Southern
blot验证ꎬ结果表明(图 7):7 个突变菌株均为单拷
贝插入ꎬ且条带位置各不相同ꎮ 这说明 Tn5转座子
成功插入绿针假单胞菌 YL ̄1基因组不同位点ꎮ
Fig. 7 Southern blot hybridization analysis
of Tn5 insertion and copies in trans ̄
poson mutants of strain YL ̄1
2.5 突变体转座子插入位点侧翼序列分析
参照转座子试剂盒方法ꎬ构建突变体的拯救质
粒ꎬ测序后获得 YL ̄1 突变株染色体基因组 DNA
插入位点的侧翼序列ꎮ 利用绿针假单胞菌 YL ̄1
的全基因组序列ꎬ获得的完整基因在 NCBI 网站进
行数据分析(http: / / www. ncbi. nlm. nih. gov / ) (表
2)ꎮ 结果表明:7 个突变菌株中 6 个突变位点和嗜
铁素合成相关ꎬ其中突变菌株 MT ̄1的突变位点是
pvdD基因ꎬ编码嗜铁素非核糖体肽合成酶ꎻ突变菌株
213
3期 刘邮洲ꎬ等:绿针假单胞菌 YL ̄1抗细菌活性相关基因的克隆和分析
Table 2 Genes cloning of transposon Tn5 insertion sites
Strain number Gene name Size / bp Homologue∗ Identity / %
MT ̄1 pvdD 13 215 WP_009049995.1 99
MT ̄2 pvdL 12 999 WP_009050073.1 99
MT ̄3 pvdE 1 653 WP_009049993.1 100
MT ̄4 pvdA 1 335 WP_009049983.1 100
MT ̄5 pvdP 1 623 WP_009049988.1 100
MT ̄6 secY 1 329 WP_007924182.1 100
MT ̄7 pvdS 549 WP_009050074.1 100
“∗”:Homologue to the putative protein of Pseudomonas chlororaphis O6 (GenBank Accession No. NZ_CM001490.1) .
MT ̄2的突变位点是 pvdL基因ꎬ编码嗜铁素发光体
合成酶ꎻ突变菌株 MT ̄3的突变位点是 pvdE 基因ꎬ
属于细菌质膜上的 ABC 转运器 (ABC transpor ̄
ter)ꎻ突变菌株 MT ̄4的突变位点是 pvdA 基因ꎬ编
码鸟氨酸羟化酶ꎻ突变菌株 MT ̄5 的突变位点是
pvdP基因ꎬ编码嗜铁素发光体蛋白ꎻ突变菌株 MT ̄
7的突变位点是 pvdS基因ꎬ属于 σ 因子ꎬ调控嗜铁
素的转录ꎮ 突变菌株 MT ̄6 的突变位点是 secY 基
因ꎬ属于 Sec转运系统ꎬ编码转运蛋白ꎮ
2.6 突变体紫外线下发光试验
一般荧光性假单胞菌在金氏 B 培养基上均能
产生水溶性荧光素(青脓素)ꎬ在紫外线(366 nm)
照射下呈黄绿色或蓝白色荧光ꎮ本文2 .5中试验
Fig. 8 Measurement of pyoverdine secreted
by stain YL ̄1 wild type (WT ) and
mutants under ultraviolet light
结果表明ꎬ突变菌株 MT ̄1、MT ̄2、MT ̄3、MT ̄4、
MT ̄5和 MT ̄7的转座子插入位点均为嗜铁素合成
基因簇ꎬ荧光下观察(图 8)发现突变菌株 MT ̄1、
MT ̄2、MT ̄3、MT ̄4、MT ̄5 和 MT ̄7 均丧失发光表
型ꎻ突变菌株 MT ̄6插入位点是 secY 基因ꎬ仍具有
发光表型ꎮ
3 讨论
随着后基因组时代的到来ꎬ基因功能研究越来
越重要ꎮ 转座子突变技术是通过构建突变体研究
基因功能的一种方法ꎬ该方法因其简便易行而备受
关注ꎮ Tn 5属于复合转座子ꎬ含有编码抗生素的
核心序列ꎮ 由 Tn 5构建而成的一系列衍生载体具
有以下优点:(1)均为自杀性载体ꎬ必须在特定的
宿主中才能复制ꎻ(2)含有抗生素抗性基因ꎬ便于
突变体筛选ꎻ(3)能抑制自身转座ꎬ保证突变菌株
上单拷贝插入ꎻ(4)插入位点留下一段已知 DNA
序列ꎬ容易定位ꎻ(5)转座酶不发生转座ꎬ保证转座
子在 DNA上稳定存在ꎬ突变性状稳定[19]ꎮ
采用转座子插入突变的方法研究生防菌防治
机理有很多报道ꎮ 如:P. aureofaciens 30 ̄84 对小
麦全蚀病有比较强的防治效果ꎬ用转座子插入突变
的方法使之失去产生吩嗪 ̄1 ̄羧酸 ( Phenazine ̄1 ̄
carboxylateꎬ PCA)的能力ꎬ对小麦全蚀病的防效也
随之下降ꎬ将含有该抗生素合成基因的质粒转入突
变菌株ꎬ抑菌能力和防病效果也随之恢复[20]ꎮ 硝
吡咯菌素(PyrrolnitrinꎬPrn)是生防菌株 P. fluores ̄
cens BL 915产生的抗生素ꎬ研究结果表明:Prn 合
成基因是由 4个开放阅读框组成的基因簇ꎬ其中任
何一个基因突变都会导致不能产生硝吡咯菌素ꎬ同
313
植物病理学报 45卷
时丧失生防能力[21]ꎮ 产生嗜铁素是荧光假单胞菌
生防机制之一ꎬP. fluorescens ATCC 17400 中细胞
色素 C的生物合成与嗜铁素产生密切相关ꎬ其细
胞色素 C 生物合成基因 ccmC 被 Tn 5 插入失活
后ꎬ嗜铁素产量显著减少ꎬ生防作用也受到影
响[22]ꎮ Gu等[23~25]利用转座子 EZ ̄Tn5<R6Kγori /
Kan ̄2>对一株细菌 B. contaminans MS14进行随机
突变ꎬ获得了一批抑菌能力下降或丧失的突变菌
株ꎬ随后鉴定抗病相关基因并进行了功能验证ꎬ先
后探明菌株 MS14 中一共有 16 个开放阅读框
(ORFs)ꎬ产生一种寡肽类抗菌物质ꎬ命名为 occi ̄
diofunginꎮ Xu 等[26] 利 用 转 座 子 EZ ̄Tn5 <
R6Kγori / Kan ̄2>随机突变的方法ꎬ发现 pqqC 基因
是假单胞菌属 P. kilonensis JX22 抗真菌活性所必
需的ꎻ蛋白分泌相关基因 secG是假单胞菌属 P. ja ̄
ponica YL ̄23抗细菌活性所必需的(另文发表)ꎮ
本文利用转座子 EZ ̄Tn5<R6Kγori / Kan ̄2>对绿针
假单胞菌 YL ̄1随机突变ꎬ7 个抑制细菌能力明显
下降的突变体中 6 个突变位点在嗜铁素合成基因
簇上ꎬ只有突变菌株 MT ̄6的突变位点是蛋白分泌
相关基因 secYꎮ 上述基因一旦被转座子插入破坏ꎬ
突变体就丧失了抗细菌活性的能力ꎮ
噬铁素是一类低分子量化合物可以特异地螯
合 Fe3+的螯合因子ꎮ 嗜铁素在生防作用的研究方
面ꎬ主要以荧光性假单胞菌群分泌的水杨酸、绿脓
杆菌螯铁蛋白、青脓素研究的较多[27]ꎮ 荧光假单
胞菌WCS374合成水杨酸的相关功能基因已经被
鉴定ꎬ由 pmsC、pmsE、pmsA和 pmsB 4个基因组成ꎬ
位于 5 kb的基因组 DNA 序列中[28]ꎻ绿脓杆菌螯
铁蛋白合成的中间体是水杨酸盐ꎬ在荧光假单胞菌
CHA0中 pchD、pchC、pchB、pchA 是合成绿脓杆菌
螯铁蛋白相关的功能基因ꎬ位于 4.4 kb 的基因序
列中[29]ꎻ青脓素是荧光性假单胞菌通过非核糖体
途径 ( non ̄ribosomal peptide synthetase enzymesꎬ
NRPS)分泌的最常见的铁载体ꎬ使得荧光性假单
胞菌在波长为 366 nm紫外线的照射下发蓝绿色荧
光[30]ꎮ 据报道ꎬ已有 50 个以上不同青脓素结构ꎬ
青脓素合成相关的基因簇已经被鉴定ꎬ由多个具有
特定功能的基因如 pvdA、 fpvR、 fpvI、pvdP、pvdE、
fpvA、pvdD、pvdI、pvdJ、pvdS组成[31]ꎮ
关于嗜铁素的研究ꎬ国内外目前仍处于基础性
研究阶段ꎮ 迄今ꎬ已经发现 500多种化学结构不同
的嗜铁素[32]ꎮ 微生物中大多数细菌和真菌都能产
生一种或几种特殊物质嗜铁素ꎬ而分泌嗜铁素是其
控制真菌病害的一种主要机制[32]ꎮ Marla 等[33]研
究发现嗜铁素直接通过抑制病原真菌来起到控制
病害目的ꎮ Ran等[34]研究了嗜铁素缺失突变体控
制桉树灰霉病ꎮ 本研究中绿针假单胞菌 YL ̄1 的
7个突变体ꎬ测序结果显示 6 个突变位点在嗜铁素
合成基因簇上ꎬ随后的金氏 B 培养基上检测发光
试验也进一步证实绿针假单胞菌 YL ̄1 突变体的
突变位点与嗜铁素合成相关ꎬ这是首次发现嗜铁素
与绿针假单胞菌 YL ̄1 抗细菌活性密切相关ꎮ 研
究结果还表明:绿针假单胞菌 YL ̄1分泌的嗜铁素
具有广谱的抗细菌活性ꎬ但不具有抗真菌活性ꎬ这
与前人的研究结果不一致ꎮ
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