全 文 :林业科学研究 2014,27(3):323 328
ForestResearch
文章编号:10011498(2014)03032306
马尾松钙调素基因的克隆及响应松材
线虫侵染的表达特征
徐 亮1,2,刘振宇3,吕 全2,梁 军2,张星耀2
(1.北京林业大学林学院,北京 100083;2.中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所,北京 100091;
3.山东农业大学植物保护学院,山东 泰安 271018)
收稿日期:20130810
基金项目:国家林业局公益性行业专项(200904061、201204501)
作者简介:徐亮,男,在读博士。主要研究方向:森林病理学。电话:15210508538,Email:xuliang19824@163.com
通讯作者:张星耀,博士,研究员。主要研究方向:森林病理学。Email:zhangxingyao@126.com;刘振宇,博士,教授。Email:cosmos
liuchina@gmail.com
摘要:松材线虫病是由松材线虫(Bursaphelenchusxylophilus)侵染引起的严重病害,引起重大的经济和生态损失。钙
调素(CaM)是真核生物中 Ca2+主要传导蛋白,本研究采用 RTPCR方法,首次从马尾松中克隆获得 CaM,命名为
pmCaM,并检测了其响应松材线虫侵染的表达特征。序列分析表明:pmCaM完整的开放阅读框核苷酸序列为450
bp,编码149个氨基酸的蛋白质;该蛋白含有4个EFhand结构域,具有钙调素的典型特征,与其它植物的CaM蛋白
均有较高同源性。实时荧光定量PCR分析显示:接种松材线虫后30 180min时间段,马尾松苗根、茎、叶器官中
的pmCaM均下调表达,但不同器官间显著下调表达的时间点存在差异;同时,不同器官 pmCaM表达量变化均存在
特异的随时间发展的波动特征,其中发现,根茎pmCaM在松材线虫接种45min时均处于表达量高峰。本研究结果
显示pmCaM表达响应了松材线虫侵染,揭示pmCaM可能参与了调控松材线虫马尾松互作早期的钙信号响应。
关键词:松材线虫病;马尾松;松材线虫;pmCaM;克隆表达
中图分类号:S791.248 文献标识码:A
CloningandExpressionCharacteristicsofPinusmassonianapmCaM
ResponsetoBursaphelenchusxylophilusInfection
XULiang1,2,LIUZhenyu3,LUQuan2,LIANGJun2,ZHANGXingyao2
(1.ColegeofForestry,BeijingForestryUniversity,Beijing 100083,China;2.ResearchInstituteofForestEcology,
EnvironmentandProtection,ChineseAcademyofForestry,Beijing 100091,China;3.ColegeofPlantProtection,
ShandongAgriculturalUniversity,Tai’an 271018,Shandong,China)
Abstract:Pinewiltdisease(PWD)causedbythepinewoodnematode(PWN),Bursaphelenchusxylophilus,is
believedtobethemostdestructivediseaseofpinespecies,causingsignificanteconomicandecologicallossesaround
theworld.Calmodulin(CaM)isamajorcalciumbindingmessengerproteinexpressedinaleukaryoticcels.A
cDNAsequenceofCaMwasclonedfromMassonpine(P.masoniana)byreversetranscriptionpolymerasechain
reaction(RTPCR)methods,andnamedaspmCaM.AndthepmCaMexpressioncharacteristicsresponsetopine
woodnematodeinfectionwascheckedbyrealtimefluorescentquantitativePCR.Thesequenceanalysisshowedthat
thepmCaMconsistedofanopeningreadingframeof450bp,encodedaproteinof149aacontainingfourEFhand
domainsandhavingthetypicalfeaturesofcalmodulin.ThecomparisonanalysisshowedthatpmCaMsharedhighho
mologywithCaMsfromotherplants.RealtimePCRanalysisshowedthat30 180minpostPWDinoculation,pm
CaMgenesinroot,stemandleafofpineseedlingwerealdownregulatedexpression,butthetimesforsignificantly
林 业 科 学 研 究 第27卷
downregulatedexpressionofpmCaMwerediferenceamongdiferentorgans;specificfluctuatecharacteristicsofpm
CaMexpressionamountalongwithtimedevelopmentwereappearedinroot,stemandleaf,andthepmCaMexpres
sionamountpeakedinrootandstem45minpostPWDinoculation.ThisstudyshowedthattheexpressionofpmCaM
wasresponsetoPWDinfection,andinferedthatthepmCaMinpinemayplayanimportantroleintheregulationof
calciumsignalresponseearlyinteractionbetweenpinewoodnematodewithMassonpine.
Keywords:Pinewiltdisease;Pinusmasoniana;Bursaphelenchusxylophilus;pmCaM;cloning;expressin
松材线虫病是由松材线虫(Bursaphelenchusxy
lophilus)侵染引起的松树树种的最具破坏性的病害,
在全球范围内造成了严重的经济、生态损失。松材
线虫病在日本每年造成1000000m3松树死亡[1],
在韩国截至到2005年大约7811ha的松树遭到毁
灭[2],在中国造成的经济损失达到4亿美元[3]。
松材线虫病是复杂的病害系统,其致病机理一
直存在争议[4]。钙调素(calmodulin,CaM)响应病
原物侵染并引起植物的抗感病反应,是病原物致病
机理研究中的重要内容。越来越多数据直接或间接
地揭示了 CaM响应病原侵染,可启动植物防卫反
应[5-10]。研究发现,松材线虫侵染早期,松树质外
体钙库内流和胞内钙库释放导致胞质内游离钙离子
浓度升高,薄壁细胞中游离 Ca2+浓度变化随松材线
虫病病程的发展具有“低 -高 -低 -高”的特征,进
而诱导基因表达[11]。Ca2+作为胞内重要的第二信
使,在植物防御反应信号转导中具有重要作用[12]。
Ca2+的主要传感蛋白之一为 CaM,存在于所有真核
生物中。CaM结合Ca2+后可发生构象变化,并与下
游蛋白质相互作用,而调节细胞的活动[13]。
马尾松(PinusmasonianaLamb.)是中国主要
松树树种之一,分布广泛,并且大多数马尾松是以纯
林的形式存在;过去的30年里,松材线虫病迅速蔓
延,马尾松树种因对松材线虫病高度敏感而遭到严
重破坏[3],因此,研究马尾松松材线虫病的致病机
理,对于防控该病害具有重要意义。马尾松是否具
有CaM,马尾松 CaM是否响应松材线虫侵染,目前
尚未见报道。本研究从马尾松中克隆了 CaM,并采
用实时荧光定量 PCR技术检测其在松材线虫侵染
早期的表达特征,以期揭示马尾松 CaM对松材线虫
的响应特征。本研究有利于对 CaM是否参与调控
松材线虫侵染早期的钙信号传递的探索,并对揭示
松材线虫病早期发病机制具有重要意义。
1 材料与方法
1.1 试验材料
健康半年生马尾松苗栽培于多菌灵消毒的营养
土(草炭∶珍珠岩∶蛭石 =6∶1∶2,V/V/V)中,置
28℃恒温箱内,光照16h·d-1,光照强度20000lx,
相对湿度80%,适应生长1个月后,用于松材线虫的
接种。
接种松材线虫虫株BXY61为强致病力,张星耀
实验室保存虫株。虫株首先接种于长满灰葡萄孢的
PDA培养基中,25℃培养7d备用。
1.2 接种与取材
线虫接种,将前端剪切成斜面的10μL枪头插
进健康的半年生马尾松苗顶梢;向插好的枪头注入
10μL的松材线虫虫株BXY61悬浮液,含线虫2000
条。将接种后的松苗置于人工气候培养箱(温度为
28℃,光照16h·d-1,光照强度20000lx,相对湿度
80%)培养;每1.5h向接种枪头补加10μL无菌水
保湿,共补加2次。
分别在松材线虫接种后30min、45min、60min、
90min和180min进行马尾松苗根、茎和叶部位取
样,以相同时间点取材的无菌水接种样品做对照。
将获得的样品迅速置液氮中,-80℃保存备用。
1.3 马尾松CaM的克隆
取健康马尾松植株的茎干组织,采用 RNeasy
plantminikit(QIAGEN)提取总RNA;采用1.0%的
琼脂糖凝胶电泳以及GeneQuant(GeneQuantI,Pha
maciaBiotech)分光光度计检测提取的 RNA完整性
和质量;按照 SuperSMARTTM PCRcDNASynthesis
Kit(Clontech)操作说明书合成第一链cDNA。
根据GenBank中松科植物的 CaM序列设计克
隆引物CaM1:5’ATAGATTTGCGTTTGCCCGTTTC
3’;CaM 2:5’GGCATCCTCCGAATGTCCTTATT
3’。以马尾松茎干RNA反转录成的cDNA为模板,
进行PCR扩增,PCR程序为94℃ 3min;94℃ 30s,
52℃30s,72℃ 1min,30个循环;72℃延伸10min。
将回收的PCR产物克隆至 pDM18T载体(TaKaRa,
Japan),送北京华大基因进行测序,获得含有完整开
放阅读框的cDNA序列。
1.4 CaM序列分析
利用 NCBI中 Blast程序(htp://www.ncbi.
423
第3期 徐 亮等:马尾松钙调素基因的克隆及响应松材线虫侵染的表达特征
nlm.nih.gov/BLAST/),氨基酸序列翻译工具(ht
tp://au.expasy.org/tools/dna.html),蛋白质理化参
数计算工具(htp://expasy.org/tools/protparam.ht
ml),蛋白质一级结构分析工具(htp://www.ex
pasy.org/tools/scanprosite/),信号肽预测工具 Sig
nalP(htp://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/),
蛋白质跨膜结构域预测工具(htp://www.cbs.dtu.
dk/services/TMHMM/),蛋白质疏水结构预测工具
(htp://us.expasy.org/tools/protscale.html)等在线
软件对基因进行序列分析。利用MEGA5.0软件进
行马尾松CaM与43个其他植物来源CaM的氨基酸
序列同源性比对。
1.5 马尾松CaM时空表达特征分析
分别在松材线虫接种后30min、45min、60min、
90min和180min的马尾松苗根、茎和叶部位取样,
以相同时间点无菌水接种的松苗根、茎、叶为对照。
样品RNA提取方法见上。根据克隆获得的马尾松
CaM的 cDNA序列设计实时荧光定量 PCR引物
(pmCaM F:5’GACGAAGAAGTTGATGAGATGA
3’;pmCaM R:5’TCCTCCGATTGTCCTTATTGAT
3’);以18SrRNA作为内参,设计引物(F:5’CG
GCTACCACATCCAAGGAA3’;R:5’GCTGGAAT
TACCGCGGCT3’)。采用 SuperRealPreMix(SYBR
Green,TaKaRa,Japan)荧光定量 PCR试剂和 Ap
pliedBiosystemsABI7500RealTimeSystem实时定
量PCR仪,以各取样点的 cDNA为模板进行马尾松
CaM的RealtimePCR分析,反应体系与程序参照试
剂说明。反应结束后分析荧光值变化曲线和融解曲
线,PCR产物电泳确认扩增产物特异性。采用
2-ΔΔCT法分析数据,确定基因的相对表达量。在同
一个批次完成内参基因和目标基因的 PCR反应,每
个取样点分别设3个生物学和3个技术学重复。
2 结果与分析
2.1 马尾松CaM的克隆
经马尾松茎干总 RNA反转得到的 cDNA片段
长度为613bp,经ORFfinder分析,该片段具有一个
完整的开放阅读框(ORF)。该 ORF长450bp,编码
149个氨基酸的蛋白质(图1),命名为 pmCaM。该
蛋白的预测分子量为16.83kD,理论 pI值为4.14;
蛋白质结构预测结果表明,该蛋白具亲水性,不含跨
膜区,无信号肽序列,不属于分泌蛋白。同时发现,
该蛋白质含有4个 EFhand保守结构域,分别在21
至32位、57至68位、94至105位和130至141位氨
基酸,每个EFhand内都有Ca2+结合位点,符合CaM
的序列特征。初步判定克隆获得的基因为马尾松
CaM基因。
pmCaM的起始密码子、终止密码子为粗斜体字;阴影部分为 EF
hand结构域。
图1 pmCaM的核苷酸序列及其推测的氨基酸序列
2.2 马尾松pmCaM同源性分析
从GenBank数据库中筛选获得落羽松(Taxodi
umdistichum)、日本柳杉(Cryptomeriajaponica)、烟
草(Nicotianatabacum)NtCaM、拟南芥(Arabidopsis
thaliana)CAM、小麦(Triticumaestivum)TaCaM和大
豆(Glycinemax)SCaM等43个不同植物来源的CaM
氨基酸序列,采用MEGA5.0软件中的邻接法对pm
CaM编码的氨基酸序列与它们进行比较构建系统进
化树(见图2)。结果显示,pmCaM编码的蛋白与这
些植物的CaM均具有很高的同源性,其中与落羽松
(BAF32140.1)、日本柳杉(BAF31995.1)的 CaM以
及已知的烟草NtCaM12相似性最高(98%以上),
并处于一个独立分支中。烟草 NtCaM312、拟南芥
CAM23,57、小麦TaCaM14以及大豆SCaM13
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林 业 科 学 研 究 第27卷
处于另一个大分支中,拟南芥 CAM1、4处于一个独
立小分支中,它们和pmCaM编码蛋白间的相似性也
比较高(93%)。而拟南芥 CAM8、烟草 NtCaM13
以及大豆SCaM45与pmCaM编码蛋白间的相似性
较远(仅77%),单独处于一个大分支中;此外,拟
南芥CAM9则处于一个与上述所有 CaM亲缘关系
都较远的独立分支上,其中,与 pmCaM编码蛋白的
相似性仅有50%。聚类分析进一步证实了作者获
得的pmCaM为马尾松CaM基因。
进化树分支处的数字代表 Bootstrap值(重复抽样次数为500);
直线标尺代表10%序列差异。
图2 pmCaM编码蛋白与43个其他植物来源的
CaM的进化树分析
2.3 马尾松pmCaM表达模式分析
采用扩增pmCaM的特异引物pmCaMF、pmCaM
R,以不同样品 cDNA为模板,进行实时荧光定量
PCR,获得松材线虫接种后的马尾松苗 pmCaM的时
空表达特征(图3所示)。研究发现,相对于无菌水
接种的对照组,马尾松苗的pmCaM表达响应松材线
虫侵染,除茎干 45min时相对表达量为 1外,根、
茎、叶pmCaM在接种后30 180min整个时间段均
呈下调表达特征。但不同器官间 pmCaM表达显著
下调的时间点存在差异,松材线虫接种 60min、90
min、180min,马尾松苗根部 pmCaM表达显著下调
(相对表达量相差2倍以上);60min、90min,茎干处
pmCaM表达显著下调;而30min、45min、180min,
叶部pmCaM表达显著下调。同时发现,不同器官中
pmCaM表达均存在特异的时序表达特征,松材线虫
接种、无菌水接种,马尾松苗根部 pmCaM表达量分
别在接种45min、60min达到高峰;茎干 pmCaM表
达量则分别在接种45min、90min达到高峰;叶部
pmCaM表达量在松材线虫接种30 180min整个
过程中变化不大,趋于恒定,但在无菌水接种 30
min、45min以及180min达到高峰。综上所述,本
研究结果显示了松材线虫接种早期,马尾松苗根茎
叶pmCaM表达响应了松材线虫侵染,其表达量变化
均存在特异的随时间发展的波动特征;其中发现,根
茎pmCaM在松材线虫接种 45min均出现表达量
高峰。
3 讨论
松材线虫病是造成松树毁灭性的灾害,但关于
松材线虫病的致病机理一直存在争议。从松材线虫
-松树互作的角度来研究松材线虫病的致病机理,
具有重要意义。前期研究发现,松材线虫侵染早期,
马尾松树体内大量防卫相关蛋白基因以及钙相关蛋
白基因受诱导表达[14],而且在松材线虫侵染早期,
马尾松不同器官均出现胞外 Ca2+瞬时内流的现象,
并且不同器官间Ca2+流特征存在明显差异(数据未
显示)。结合前人研究[11],推测松树体内的钙可能
作为信号参与调控松树早期的防卫反应。
CaM是植物细胞内高度保守的 Ca2+结合蛋白,
而研究发现 CaM响应病原物侵染[5-10]。Heo等[15]
发现大豆叶斑病杆菌(Pseudomonassyringaepv.
glycinea)或病原激发子可诱导大豆 SCaM4和
SCaM5基因表达,却不诱导其他 CaM亚型基因表
达;组成型表达 SCaM4和 SCaM5可诱导大豆枯斑
自动生成和一系列 SAR相关基因表达。霍建飞
等[16]发现,相比亲和组合,非亲和叶锈菌(Puccinia
triticina)接种小麦,小麦 CaMSF1、CaMSF4表达
量上调,CaMSF2表达量下调,CaMSF3表达量相
差不大;因此提出,CaMSF1、CaMSF4可能与小麦
抗叶锈病相关,CaMSF2可能与小麦感叶锈病相
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第3期 徐 亮等:马尾松钙调素基因的克隆及响应松材线虫侵染的表达特征
1,pmCaM相对表达量=不同样品 pmCaM表达量/无菌水接种
30minpmCaM表达量;2,不同小写字母分别表示无菌水接种、
松材线虫接种后,不同时间点间,pmCaM相对表达量差异显著
(P<0.05);3,表达同一时间,无菌水接种、松材线虫接种
间,pmCaM相对表达量差异显著(相对表达量相差2倍以上)。
图3 马尾松pmCaM响应松材线虫BXY61侵染在
根茎叶中的时序表达特征
关,CaMSF3整个过程可能不参与小麦抗叶锈病反
应。此外,Yamakawa[17]和Takabatake[18]等发现烟草
花叶病毒(tobaccomosaicvirus,TMV)侵染可诱导
NtCaM1、NtCaM2以及 NtCaM13表达上调,Nt
CaM3NtCaM12未显示响应;NtCaM13敲除品种对
烟草花叶病毒的敏感性轻微增加,对亲和病原细菌
Ralstoniasolanacearum、病原真菌 Rhizoctoniasolani、
Pythiumaphanidermatum抗性减少。关于马尾松树
体内是否存在CaM,以及其是否响应松材线虫侵染,
国内外未见报道。本研究首次克隆获得马尾松 pm
CaM,该基因编码的蛋白为149个氨基酸、亲水性的
酸性蛋白质,具有4个直接与Ca2+结合的EFhand保
守结构域,符合 CaM典型特征。同源性分析知,pm
CaM编码蛋白与已知的松科植物、烟草、拟南芥、大豆
以及小麦等的 CaM具有高同源性,其中与已知的烟
草NTCaM1、NTCaM2相似性高达98%以上,进一步
证实了马尾松体内CaM的存在,pmCaM为编码CaM
的基因。同时,本研究发现,相对无菌水接种,在松材
线虫接种后的30 180min,除茎干45min外,马尾
松根茎叶 pmCaM表达均下调;而且不同器官间 pm
CaM表达显著下调的时间点存在差异,叶部 pmCaM
在接种30min、45min、180min显著下调,根部在60
min、90min、180min显著下调,茎部则在60min、90
min显著下调(图3所示);结果表明马尾松苗pmCaM
表达响应松材线虫侵染,并且具有器官特异性。
Ca2+在植物防御反应信号转导中具有重要作
用,CaM作为细胞内主要的 Ca2+受体蛋白,在介导
Ca2+信号传导途径中发挥重要作用[19,20]。霍建飞
等[21]通过用CaC12和CaM拮抗剂TFP、CPZ和W7
预处理小麦种子后,接种亲和及非亲和小麦叶锈菌
后的结果表明:小麦叶片接种非亲和性叶锈菌后,
TFP、CPZ和W7浸种处理抑制了POD、PAL、PPO和
CAT活性的上升;小麦叶片接种亲和性叶锈菌后,
CaC12预处理加剧了POD、PAL、PPO和 CAT活性的
上升;间接说明了CaM参与调控小麦防御反应中的
钙信号传递,Ca2+CaM信使系统可能在小麦抗叶锈
病过程中起着重要作用。我们前期研究发现,松材
线虫侵染早期,马尾松苗根茎叶均发生瞬时 Ca2+内
流;而呈现明显 Ca2+内流的早晚时间依次为接种后
的7min(茎)=7min(叶)>15min(根);Ca2+内流
最大流速分别为 3700pmol·cm-2·s-1(根)>1
300pmol·cm-2·s-1(叶)>450pmol·cm-2·s-1
(茎);Ca2+内流持续时间则分别为大于67min(茎)
>43min(叶)>24min(根),同时发现,马尾松不同
器官均出现特异的钙振荡特征(数据未显示);结合
金钢[11]研究发现的松树质外体钙库内流和胞内钙
库释放共同导致细胞内游离钙离子浓度升高,以及
伴随松材线虫病病程的发展,松树细胞中 Ca2+浓度
变化具有“低-高-低-高”的特征;推测知 Ca2+参
与了松材线虫-马尾松互作早期的信号传递,而且
不同器官间钙信号特征存在差异。本研究中,松材
线虫接种,马尾松苗根、茎 pmCaM在接种45min均
处于表达量高峰,叶部pmCaM在30 180min整个
过程恒定不变;而对照无菌水接种,马尾松苗根、茎
pmCaM分别在接种 60min,90min处于表达量高
峰,叶部 pmCaM则在接种 30min、45min、180min
723
林 业 科 学 研 究 第27卷
处于表达量高峰(图3所示);表明松材线虫侵染后,
马尾松苗不同器官 pmCaM表达量变化均存在特异
的随时间发展的波动特征。其中发现,松材线虫接
种45min,马尾松苗根茎 pmCaM均处于表达量高
峰,pmCaM做为Ca2+主要的传导蛋白,可能参与调
控根茎中钙信号传递;而叶中pmCaM表达量在接种
后的30 180min整个过程变化不明显,进一步推
测说明马尾松苗不同器官 pmCaM在调控钙信号传
递方面存在差异;松树钙/钙调素信号系统在松材线
虫病发生发展过程中可能发挥了重要的调控作用。
综上所述,本研究首次证实了马尾松体内 CaM
基因的存在;同时发现,马尾松根茎叶 pmCaM表达
响应松材线虫的侵染,其表达量变化均存在特异的
随时间发展的波动特征;结合作者前期发现的 Ca2+
作为信号物质参与了松材线虫-马尾松互作早期的
信号传递,推测松材线虫接种后,pmCaM参与调控
马尾松体内钙信号传递。下一步工作将证实钙/钙
调素信号通路的确存在,找到与pmCaM编码蛋白互
作的下游蛋白(钙调素结合蛋白CaMBP),并对松材
线虫侵染过程中,马尾松体内 “Ca2+pmCaM
CaMBP”复合物的功能进行研究,进而来揭示松材线
虫病发生发展过程中,松树体内的钙介导的信号通
路的调控机制。
4 结论
本研究首次从马尾松上克隆获得 pmCaM。实
时荧光定量 PCR研究发现,接种松材线虫后,马尾
松苗根茎叶 pmCaM均下调表达,但不同器官间 pm
CaM显著下调表达的时间点存在差异;而且松材线
虫接种后,马尾松苗根茎叶pmCaM表达量变化均存
在特异的随时间发展的波动特征,其中发现,根茎
pmCaM在松材线虫接种45min均出现表达量高峰。
总之,本研究结果显示马尾松pmCaM表达响应了松
材线虫侵染,推测松材线虫-松树互作早期,pmCaM
参与调控马尾松体内的钙信号传递。
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