全 文 :书犜犇犖犃插入对拟南芥突变体色素和
内囊体膜色素蛋白复合物的影响
张峰1,2,王玉萍1,黄惠英1,王蒂1
(1.甘肃农业大学农学院 甘肃省作物改良与种质创新重点实验室,甘肃 兰州730070;2.甘肃农业大学生命科学学院,甘肃 兰州730070)
摘要:采用正向遗传学方法,从TDNA标签技术构建的拟南芥突变体种子库中筛选到1株高叶绿素荧光表型的突
变体(犎犮犳1)。对该突变体及其子代群体进行Basta抗性及PCR分子检测,证实该突变体是由TDNA插入引起
的。突变性状与TDNA共分离。对突变体(犎犮犳1)和野生型(WT)叶片中色素含量、叶绿体内囊体膜色素蛋白复
合物及蛋白亚基变化的分析结果表明,与野生型相比,突变体叶中的Chla和Chlb含量显著降低。光系统II部分
解聚,其主要蛋白亚基CP43,CP47,D1,D2蛋白以及外周捕光色素天线蛋白LCHII含量均下降。光系统I基本未
受到影响。据此判断由于TDNA的插入,导致一个控制PSII发育的基因发生突变,叶绿体的发育和PSII的组装
均受到较大的影响。
关键词:拟南芥;TDNA插入;类囊体膜色素蛋白复合物;犎犮犳1突变体
中图分类号:Q945 文献标识码:A 文章编号:10045759(2008)05014506
叶绿体是高等植物和真核藻类进行光合作用的重要细胞器,含约3000多种蛋白质。叶绿体对光能的吸收、
传递和转换均是通过类囊体膜上的色素蛋白复合体光系统II(PSII)、光系统I(PSI)及有关电子载体进行的。
PSII和PSI的结构和功能各不同,由叶绿体基因和核基因编码的蛋白质共同组成[1]。光系统II捕光色素蛋白复
合物(LCHII)在类囊体膜上的含量最为丰富,它所结合的叶绿素约占类囊体膜上色素总量的50%,同时LCHII
作为PSII的天线,由核基因编码6个叶绿素结合蛋白组成,它不仅为PSII捕集光能,而且能够将激发能传递给
PSI。
叶绿体膜的组装是一个多步骤的过程。在光合膜的发育过程中,PSI和PSII的生物发生和复合体的组装是
相继出现的。突变体是功能基因组学研究的重要工具之一。可转移的DNA(TDNA)插入已有效地用于功能基
因的鉴定与克隆[2]。当TDNA随机插入到与叶绿体发育有关的基因中时,就会对叶绿体的功能产生影响[3]。
如果该基因不表达或超表达,引起叶绿体的损伤,植物不能完全利用所吸收到的光能,过量的光能则以热量和荧
光的形式释放出,这类突变体在短波紫外光下呈现出很强的红色荧光,称为高叶绿素荧光(highchlorophylfluo
rescence,Hcf)突变体。作为光合电子传递链受损标志的高叶绿素荧光表型,广泛地应用于筛选光合组分功能缺
失突变体,研究光系统结构和功能的变化[4]。
正向遗传学方法为功能基因组的研究手段之一,即通过对拟南芥突变体库的筛选,获得与光合作用相关的突
变体,并采用构建突变体库所用的质粒载体序列鉴定和克隆相关的突变基因,进而研究这些基因对叶绿体生物发
生及光合作用调控功能,以此构建相关的功能基因组。本研究以通过高荧光方法[4]筛选出的1株拟南芥(犃狉犪犫犻
犱狅狆狊犻狊狋犺犪犾犻犪狀犪)光合突变体为材料,对TDNA插入产生的突变进行了遗传分析和鉴定,并分析了色素含量、内
囊体膜色素蛋白复合物组成以及光系统的一些主要功能蛋白亚基的变化,为利用TDNA作为标签克隆该突变
基因和进行功能分析奠定基础。
1 材料与方法
1.1 试验材料
拟南芥高荧光突变体(highchlorophylfluorescenceof犃狉犪犫犻犱狅狆狊犻狊,犎犮犳1)来源于Scheible和Somervile
第17卷 第5期
Vol.17,No.5
草 业 学 报
ACTAPRATACULTURAESINICA
145-150
10/2008
收稿日期:20071107;改回日期:20080318
基金项目:教育部新世纪优秀人才支持计划项目(MCET070214),科技部“973”前期研究项目(2006CB708203),甘肃省自然科学基金项目
(0710RJZA095;0803RJZA051)和重点实验室开放基金项目(033155)资助。
作者简介:张峰(1971),男,陕西长安人,副教授,硕导,博士。Email:zhangf@gsau.edu.cn
通讯作者。Email:zhangf@gsau.edu.cn,wangd@gsau.edu.cn
利用质粒pSKI015构建的拟南芥突变体种子库。用于转化的质粒pSKI015在TDNA区中携带一个PPT乙酰
转移酶(Bar)基因,能提供对除草剂Basta(商用除草剂,有效成分为phosphonothricin,PPT膦丝菌素)的抗性[2]。
野生型(Col0)拟南芥种子(widetype,WT)购自NottinghamArabidopsisStockCenter(NASC)。种子经4℃春
化48h后,点播在泥碳土中(泥碳土∶蛭石为5∶1),在光照度120μmol/(m
2·s),光照周期为12h/12h(光/
暗),温度22℃,湿度50%~70%的光照培养室中生长约8周左右。
1.2 Basta抗性鉴定
突变体种子种在含有10mg/L的phosphonothricin上生长2周,检测TDNA诱导的除草剂抗性。
1.3 PCR检测
剪取约0.5g拟南芥叶片,用溴化十六烷三甲基铵(CATB)法[5]提取基因组DNA。PCR扩增检测Bar基
因,鉴定TDNA插入。PCR循环参数为:94℃,2min,94℃,1min;60℃,1min;72℃,30s,72℃,10min,30
个循环。引物对为:
Bar53 5′CTgAAgTCCAgCTgCCAgAAA3′
Bar35 5′CTgCACCCATCgTCAACCACTA3′
Actin53 5′CCTCCAATCCAgACACTgTA3′
Actin35 5′AACTgggATgATATggAgAA3′
1.4 色素含量的测定
生长6周后测定叶片中的叶绿素含量,3次重复。取0.5g叶片于液氮中研磨,用80%丙酮充分溶解洗涤研
磨材料,提取液定容至5mL,5000g离心10min,收集上清液。上清用DU640分光光度计(Beckman,USA)测
定646和663nm处的光吸收值,色素含量按照Porra等[6]的方法计算,单位μg/gFW。
1.5 类囊体膜的提取
取约0.5g拟南芥叶片加入预冷的STS提取液(400mmol/L蔗糖,10mmol/LNaCl,2mmol/LMgCl2,50
mmol/LHepes,用KOH调pH值至7.8),在4℃下研磨,提取液经3层擦镜纸过滤。5000g离心10min,弃去
上清液,沉淀用STS悬浮提取液重悬浮,后再以5000g离心10min,得到类囊体膜沉淀。沉淀用200μLSTS液
悬浮,取20μL样品加入3mL80%的丙酮后以分光光度计测定OD646和OD663的值。提取的类囊体膜立即使
用或在液氮中速冻后储存在-70℃冰柜里。
1.6 蓝绿温和胶电泳
参照李贝贝等[7]的方法。凝胶于室温下进行,用梯度混合仪灌制完成,次日进行电泳,分离胶为5.0%~
13.5%,浓缩胶浓度为4%,溶液配置见表1。
1.6.1 制样 类囊体膜用含25mmol/L,20%甘油的溶液洗涤,后以14000g下离心5min,沉淀悬浮于1%十
二烷基麦芽糖苷(DM)增溶溶液中,充分混匀后以40000g离心10min。取上清液,加入1/10体积的ServaG溶
液(5%ServaG,100mmol/LBisTris,pH值7.0,0.5mmol/L6氨基己酸,30%甘油)并充分混匀后,上样。
表1 蓝绿温和胶溶液的配制
犜犪犫犾犲1 犘狉犲狆犪狉犪狋犻狅狀狅犳犵狉犪犱犻犲狀狋犫犾狌犲狀犪狋犻狏犲犵犲犾狊狅犾狌狋犻狅狀
项目Item 4%浓缩胶Stacking 5%分离胶Separation 13.5%分离胶Separation
49.5%丙烯酰胺甲叉双丙烯酰胺Acrylamideandbisacrylamide(mL) 0.125 0.215 0.675
150mmol/LBisTris,1.5mol/L6氨基己酸 Aminocaproicacid,
pH值 Value7.0(mL)
3.33 2.33 2.33
75%甘油 Glycerol(mL) 0 0.47 1.87
双蒸水ddH2O(mL) 5.733 3.427 0.823
5%过硫酸胺APS(μL) 107.0 40.0 40.0
TEMED(μL) 20 7.0 7.0
总计Total(mL) 10 10 10
641 ACTAPRATACULTURAESINICA(Vol.17,No.5) 10/2008
1.6.2 电泳 电极缓冲液为含50mmol/LN[三(羟
甲基)甲基]甘氨酸(Tricine),15mmol/LBisTris,
pH值7.0的阴极缓冲液和含50mmol/LBisTris,
pH值7.0的阳极缓冲液。电泳系统为hofermighty
smalverticalelectrophoresisunit,胶板厚度为0.75
mm,电泳在4℃下进行。
1.7 SDS-脲聚丙烯酰胺凝胶电泳
电泳条件参照Laemmli[8]的方法。将经蓝色温和
胶分离的类囊体膜复合物胶条切下,于室温下在含6
mmol/L尿素,5%十二烷基硫酸钠(SDS),20%甘油,
10%巯基乙醇,10%甲醇,25%含50mmol/L三羟基
氨基甲烷盐酸缓冲液(TrisHCl),pH 值6.8的浓缩
胶缓冲液(4×)的上样缓冲液中,添加0.2%的溴酚
蓝,变性30min,进行第二向电泳,即SDS-脲聚丙烯
表2 犛犇犛脲聚丙烯酰胺凝胶电泳溶液的配制
犜犪犫犾犲2 犘狉犲狆犪狉犪狋犻狅狀狅犳犛犇犛狌狉犲犪犘犃犌犈狊狅犾狌狋犻狅狀
项目
Item
11.5%分离胶
Separation
4.5%浓缩胶
Stacking
尿素Urea(g) 3.6 1.8
30%丙烯酰胺甲叉双丙烯酰胺
Acrylamideandbisacrylamide(mL)
3.80 0.75
75%甘油Glycerol(mL) 1.3 0
分离胶缓冲液Separationbuffer(8×)(mL) 1.3 0
浓缩胶缓冲液Stackingbuffer(4×)(mL) 0 1.25
10%十二烷基硫酸钠SDS(10×)(mL) 0.1 0.05
双蒸水ddH2O(mL) 0.8 1.7
15%过硫酸胺APS(mL) 0.04 0.05
TEMED(mL) 0.004 0.005
酰胺凝胶电泳。胶条挑入胶孔中并用20%琼脂糖封顶,加入SDS电极缓冲液,于室温下以30mA电泳1h。电
泳系统为miniproteanIII(BIOrad),胶板厚度为1.0mm。
2 结果与分析
2.1 突变性状的遗传分析及与TDNA的关系
从TDNA插入株系的后代T2代开始,连续2个世代对犎犮犳1的突变性状进行了遗传分析(表3)。结果表
明,在不同世代群体均表现为高荧光的突变性状,说明突变性状能稳定遗传,没有发生分离,犎犮犳1是纯合体。同
时,对犎犮犳1的T2,T3代的表型和Basta抗性的遗传进行了分析(表3)。结果显示,凡是高荧光的植株均表现
抗Basta,证实了高荧光突变与Basta抗性共分离。表明突变体表型是由于TDNA的插入引起的。
表3 突变性状与犅犪狊狋犪抗性的共分离
犜犪犫犾犲3 犆狅狊犲犵狉犲犵犪狋犻狅狀狅犳犺犻犵犺犮犺犾狅狉狅狆犺狔犾犳犾狌狅狉犲狊犮犲狀犮犲犪狀犱犅犪狊狋犪狉犲狊犻狊狋犪狀犮犲犻狀狋犺犲狆狅狆狌犾犪狋犻狅狀
犱犲狉犻狏犲犱犳狉狅犿犿狌狋犪狀狋犎犮犳1 株数No.ofplants
世代
Generation
表型Phenotype
正常Normal 高荧光 Highchlorophylfluorescence
Basta抗性Bastaresistance
敏感Susceptible 抗性Resistant
合计
Total
T2 0 126 0 126 126
T3 0 135 0 135 135
以拟南芥叶片基因组DNA为摸板,突变体(犎犮犳1)和野生型(WT)中都能扩增出800bp左右的Actin基因
条带,证明DNA提取质量良好。为了进一步从分子水平上验证高荧光突变性状与TDNA之间存在共分离关
系,根据TDNA激活标签载体pSK1015质粒上的一段长为444bp的Bar基因序列[2]设计引物,对突变体和野
生型植株的基因组DNA进行PCR扩增(图1)。结果表明,具Basta抗性的高荧光突变体中能检测出1条约450
bp左右的Bar基因特异条带,而对Basta敏感的野生型植株无特异性的扩增带出现 (图1)。表明犎犮犳1的突变
性状与TDNA的插入相关。
2.2 突变体的叶绿素色素含量变化
在正常生长条件下,该突变体生长速率只有野生型的60%左右,叶色发黄。对突变体和野生型叶片叶绿素
含量进行了测定(表4)。结果显示,突变体(犎犮犳1)叶片中叶绿素含量较同时期野生型(WT)相比都明显降低。
Chla降为野生型的60.95%,Chlb降为野生型的67.40%,Chla+b为野生型的62.49%,Chla/b则为野生型的
90.25%。影响光合作用的主要色素Chla降低较多,与突变体的叶色发黄的表型相一致。说明由于TDNA的
插入,突变体中的叶绿体发育受到影响,不能正常吸收光能。
741第17卷第5期 草业学报2008年
2.3 类囊体膜蛋白复合物的结构变化
图1 犜犇犖犃插入的犘犆犚验证
犉犻犵.1 犘犆犚犪狀犪犾狔狊犻狊狅犳犜犇犖犃犻狀狊犲狉狋犻狅狀犻狀犠犜犪狀犱犎犮犳1
为了研究突变体中类囊体膜蛋白复合物的结构
是否发生了变化,采用蓝绿温和胶电泳系统(BN
PAGE)[7]。将类囊体膜用温和去垢剂1%DM进行
增溶后,用BNPAGE分离类囊体膜各个蛋白复合
物分离出5个主要的条带,复合物的位置通过适当
的抗体来鉴定[7,9]。图2显示出的5个主要的条带
分别为:PSI+PSII二聚体(条带I),PSII单体(条带
II),缺失叶绿体蛋白43(CP43)亚基的PSII(条带
III),LHCII三聚体(条带IV),LHCII单体(条带
V)。
表4 突变体和野生型叶片叶绿素含量
犜犪犫犾犲4 犆狅狀狋犲狀狋狅犳犮犺犾狅狉狅狆犺狔犾狆犻犵犿犲狀狋狊狅犳犠犜犪狀犱犎犮犳1
材料
Material
叶绿素色素含量ContentofChlorophyl (μg/g)
Chla Chlb Chla+b Chla/b
WT 1336.6±26.0 420.2±22.4 1756.8±48.4 3.18±0.12
犎犮犳1 814.6±31.2 283.2±23.2 1097.8±54.4 2.87±0.10
犎犮犳1/WT(%) 60.95 67.40 62.49 90.25
结果显示,在等色素上样量的条件下,突变体
图2 犠犜和犎犮犳1类囊体蓝绿温和胶电泳图谱
犉犻犵.2 犅犖犘犃犌犈犪狀犪犾狔狊犻狊狅犳狋犺狔犾犪犽狅犻犱犿犲犿犫狉犪狀犲
狆狉狅狋犲犻狀犮狅犿狆犾犲狓犲狊狅犳犠犜犪狀犱犎犮犳1
(犎犮犳1)和野生型(WT)蛋白条带表现出明显的差
异。与野生型相比,突变体中PSII含量明显降低
(条带I,II,III),说明PSII单体发生了降解和PSII
二聚体解聚;作为PSII的外周天线组分的LHCII
单体(条带V)的蛋白组分减少。犎犮犳1中PSII复
合体的组装受到严重地影响。
2.4 内囊体膜蛋白复合物亚基的变化
将BN胶条切下,进行第2向SDS脲聚丙烯酰
胺电泳。依据各自的分子质量不同,将蛋白质复合
物的各个亚基清楚地分开,蛋白亚基的位置由相应
的抗体来鉴定[7,9]。图3所示,野生型中可以看到明
显的光系统I反应中心蛋白(PsaA/B),叶绿体蛋白
47(CP47),叶绿体蛋白43(CP43),光系统II反应中
心蛋白(D1,D2)和捕光色素蛋白(LHCII)等蛋白,而突变体中的PSII蛋白CP47,CP43,D1,D2含量和LHCII蛋
白明显减少。PSI反应中心蛋白PsaA/B含量与野生型中相差不大。因此,突变体中PSII中主要蛋白亚基含量
比野生型显著降低,而其他复合物如PSI反应中心蛋白含量基本未变。说明由于TDNA的插入,控制PSII蛋
白质合成的相关基因发生了突变。
3 讨论
光合突变体在进行光合作用功能解析,揭示核基因参与叶绿体功能的调节机理以及时空调控机制上起着重
要作用。用各种插入元件构件突变体文库的方法已成为功能基因组研究的一个重要部分[10]。对突变体进行
了遗传分析和分子检测,证实其确实是由TDNA插入引起的,而不是由于TDNA在整合过程中造成缺失所导
841 ACTAPRATACULTURAESINICA(Vol.17,No.5) 10/2008
图3 以犛犇犛脲聚丙烯酰胺凝胶电泳为第2向分析 犠犜和犎犮犳1类囊体膜蛋白复合物组成
犉犻犵.3 犜狑狅犱犻犿犲狀狊犻狅狀犪犾犪狀犪犾狔狊犻狊狅犳狋犺狔犾犪犽狅犻犱犿犲犿犫狉犪狀犲狆犻犵犿犲狀狋狆狉狅狋犲犻狀犮狅犿狆犾犲狓狊犲狆犪狉犪狋犲犱犫狔犫犾狌犲狀犪狋犻狏犲犵犲犾犲犾犲犮狋狉狅狆犺狅狉犲狊犻狊
致的[11]。初步鉴定了一个由TDNA插入引起的高荧光突变体,遗传分析表明突变性状与TDNA共分离,因此
TDNA可以作为分子标签来分离控制该性状的基因。
Chla和Chlb是绿色植物叶绿体中接受光能的主要分子,大多数以色素蛋白复合物的形式结合在LHCII。
Chla和Chlb也是保证光合膜上蛋白质稳定的重要因素,在缺乏叶绿素b时,不同的LHCII蛋白多肽有不同的稳
定性[12,13]。因此,突变体内囊体膜上LHCII含量的降低,可能是由于色素的缺乏而导致LHCII的稳定性降低,
其多肽成分部分降解或处于快速周转造成的。
PSII是进行光合作用原初光化学反应的功能蛋白复合物。除了进行原初电荷分离的电子传递组分外,这个
系统还含有超过20种蛋白和50多个辅助因子,且有单体,双体和超聚体等多种聚合形式[14]。蓝绿温和胶电泳
系统可以根据内囊体膜复合物自身的分子质量,同时在一块胶上以近似天然的状态将PSI,PSII,LHCII的不同
聚合状态的蛋白质复合物,CP43缺失的PSII复合物更好的分离,条带更清晰[7,15],且大部分蛋白质复合物都保
持其完整性。本研究发现,与野生型相比,突变体PSII的二聚体含量降低,PSII的单体和缺失CP43亚基的含量
明显降低。PSII的外周天线组分的LHCII单体的蛋白含量减少。因此突变体犎犮犳1中PSII复合体的组装受
到严重地影响。
采用SDS脲聚丙烯酰胺凝胶电泳进行第2向电泳,当SDS与蛋白质结合后,蛋白质各亚基可以根据分子质
量而分开[16]。通过二向电泳技术清楚地发现了拟南芥突变体和野生型在光系统复合体结构与主要蛋白亚基之
间的变化,即PSII的主要蛋白亚基CP47,CP43,D1,D2,LCHII的含量降低。所以,由于TDNA的插入,导致核
基因编码的有关叶绿体PSII发育的某个基因被敲除或表达量降低,而明显地影响到叶绿体的光系统复合体的组
装,蛋白质的表达以及叶绿素含量等生理功能的改变[17~19]。本研究获得的高荧光突变体,对控制该性状基因的
克隆,对了解该基因参与叶绿体发育的调控机理将具有重要意义。
致谢:张立新教授提供种子,并对试验给予了指导。
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犈犳犳犲犮狋犻狅狀狅犳狆犻犵犿犲狀狋狊犪狀犱狋犺犲狆狉狅狋犲犻狀犮狅犿狆犾犲狓犲狊狅犳狋犺狔犾犪犽狅犻犱犿犲犿犫狉犪狀犲
犻狀犎犮犳1犿狌狋犪狀狋狅犳犃狉犪犫犻犱狅狆狊犻狊犫狔犜犇犖犃犻狀狊犲狉狋犻狅狀
ZHANGFeng1,2,WANGYuping1,HUANGHuiying1,WANGDi1
(1.FacultyofAgronomyandGansuKeyLaboratoryofCropGenetic&GermplasmEnhancement,Gansu
AgricultureUniversity,Lanzhou730070,China;2.ColegeofLifeSciences&Technology,
GansuAgricultureUniversity,Lanzhou730070,China)
犃犫狊狋狉犪犮狋:Accordingtoforwardgeneticsapproaches,aphotosynthesismutantofhighchlorophylfluorescence
phenotypehasbeenisolatedbyscreeningtheseedsofTDNATransformedActivationTaglines.TestforBasta
resistancetothemutantanditsgenerationsshowedthemutantswerealresistant,whichindicatedthatthe
phenotypewascosegregatedwithresistance,andTDNAinsertionwasfurtherconfirmedusingPCRmethod.
ThepigmentscontentandthecomponentsofchloroplastproteincomplexeswereinvestigatedbyBNPAGEand
SDSureaPAGE.Theresultsshowed:thecontentofpigmentsdecreasedsignificantlyin犎犮犳1.Thecontentsof
PSIIdimer,PSIImonomer,CP43lessPSIIandLHCIImonomerdecreased.Thecontentsofsomecrucialsmal
molecularproteinsCP43,CP47,D1,D2andLHCIImonomerwhicharecomponentsofphotosystemIIwerede
graded,whereasthecontentofreactioncentreproteinpsaA/Bwerelittleaffected.Fromtheresultsabovewe
deducedthatthemutantlocationmaylieinPSII.
犓犲狔狑狅狉犱狊:犃狉犪犫犻犱狅狆狊犻狊;TDNAinsertion;thylakoidmembraneproteincomplexes;犎犮犳1mutant
051 ACTAPRATACULTURAESINICA(Vol.17,No.5) 10/2008