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Site directed mutagenesis of the LpP5CS gene of Lolium perenne
and its transformation in Arabidopsis thaliana

多年生黑麦草P5CS基因的定点突变及其在拟南芥中的转化



全 文 :书多年生黑麦草犘5犆犛基因的定点突变
及其在拟南芥中的转化
曹丽1,2,义鸣放1,孙振元2,韩蕾2,巨关升2,马欣荣3
(1.中国农业大学观赏园艺与园林系,北京100193;2.中国林业科学研究院林业研究所/国家林业局林木培育
重点实验室,北京100091;3.中国科学院成都生物研究所,四川 成都610041)
摘要:在前期克隆获得犔狆犘5犆犛基因的全长cDNA序列基础上,采用PCR扩增技术对多年生黑麦草脯氨酸合成酶
基因犘5犆犛的定点突变体系进行了探讨,并运用农杆菌转化技术对突变后的基因进行了功能验证。根据突变位点
序列设计一对引物,使用Pfu高保真DNA聚合酶和超级感受态细胞DMT,通过PCR扩增,获得含有所要突变位
点的犔狆犘5犆犛F128A,定向克隆入真核表达载体pCAMBIA1300中,转化拟南芥验证基因功能。结果表明,预期位
点上发生了突变,犔狆犘5犆犛编码的第128位密码子已由苯丙氨酸残基(Phenylalanine,简称Phe或F)变为丙氨酸残
基(Alanine,Ala),证明用PCR技术已成功地使犔狆犘5犆犛基因发生定点突变。转基因拟南芥T1 代植株进行PCR
和RT-PCR检测,获得4个转基因阳性株系。拟南芥T2 代植株经100mmol/LNaCl处理7d后,转基因株系脯
氨酸含量分别为4262和5623μg/gFW,显著高于野生型株系的2581μg/gFW。说明转基因株系能积累更多地
脯氨酸。
关键词:多年生黑麦草;定点突变技术;脯氨酸合成酶基因;农杆菌转化
中图分类号:S543+.603.53;Q943.2  文献标识码:A  文章编号:10045759(2011)01024206
  △1吡咯啉5羧酸合成酶(P5CS)是双功能酶,催化植物中经谷氨酸合成脯氨酸的前2步反应,胁迫条件下
脯氨酸的合成不仅受P5CS转录激活的调节,也受到该途径终产物脯氨酸的反馈抑制[1]。Hong等[2]研究表明,
VaP5CS上的129位的苯丙氨酸(Phenylalanine,简称Phe或F)突变为丙氨酸(Alanine,Ala)后VaP5CS的反馈
抑制被消除,脯氨酸对 P5CS活性50% 的抑制量从野生型6mmol/L 提高到突变型 P5CSF129A 的960
mmol/L,转突变P5CS基因的烟草(犖犻犮狅狋犻犪狀犪狋犪犫犪犮狌犿)个体脯氨酸含量是转野生型P5CS基因的2倍还多[3],
在干旱和盐胁迫条件下,根的生长量增加并促进了花的发育。证明P5CS的反馈调节在控制植物脯氨酸水平上
扮演着重要的角色[4]。
中国林业科学研究院林业研究所生理生化实验室将犔狆犘5犆犛与其他植物的同源基因进行比对和分析后,推
测LpP5CS蛋白上128位的Phe是这个基因的反馈抑制位点。基于此,笔者以先前克隆的犔狆犘5犆犛基因为靶基
因,将多年生黑麦草P5CS蛋白上128位的Phe定点突变为Ala,采用双酶切方法构建了多年生黑麦草(犔狅犾犻狌犿
狆犲狉犲狀狀犲)犘5犆犛犉128A基因真核表达载体,并通过农杆菌GV3101介导,将犔狆犘5犆犛犉128A基因转入拟南芥(犃狉
犪犫犻犱狅狆狊犻狊狋犺犪犾犻犪狀犪)中,并对其进行初步的功能鉴定,为采用遗传工程手段创制抗逆性草坪草品种提供参考依据。
1 材料与方法
1.1 材料
本实验于2009-2010年在北京进行,野生拟南芥 (Columbia)、表达载体pCAMBIA1300质粒、根癌农杆菌
菌株GV3101由中国农业大学辛海波博士惠赠;重组质粒pMD19T犔狆犘5犆犛为中国林业科学研究院林业研究
所生理生化实验室克隆并保存。
1.2 方法
1.2.1 引物设计及突变基因的获得 引物设计采用EasyMutagenesisSystem试剂盒说明并略有改动。设计引
242-247
2011年2月
   草 业 学 报   
   ACTAPRATACULTURAESINICA   
第20卷 第1期
Vol.20,No.1
 收稿日期:20100204;改回日期:20100329
基金项目:国家十一五科技支撑计划(2006BAD01A192)和国家“863”项目(2006AA100109)资助。
作者简介:曹丽(1974),女,吉林长春人,讲师,博士。Email:caoli1974@yahoo.com.cn
通讯作者。Email:ymfang@cau.edu.cn;sunzy@caf.ac.cn
物对PF128/PR128,以pMD19T犔狆犘5犆犛质粒DNA(10ng/L)为模板,进行PCR(polymerasechainreaction)定
点突变反应。取扩增PCR产物连接转化到感受态细胞DMT,挑取单斑进行菌落PCR鉴定并测序验证。
1.2.2 多年生黑麦草P5CSF128A表达载体的构建及鉴定 通过PCR扩增以及测序鉴定,筛选出正向插入的
阳性克隆pMD19犔狆犘5犆犛犉128A。用犛犿犪犾Ⅰ和犛犪犾Ⅰ限制性内切酶分别对pMD19犔狆犘5犆犛F128A和pCAM
BIA1300进行酶切反应。回收纯化后,16℃连接反应过夜,转化大肠杆菌,筛选抗性质粒[5,6],用犛犪犾Ⅰ/犛犿犪犾Ⅰ进
行双酶切鉴定,将含有目的片段的克隆测序。将重组子pCAMBIA1300犔狆犘5犆犛F128A 导入农杆菌感受态
GV3101。
1.2.3 拟南芥的转化及抗性筛选 将拟南芥的花序浸入侵染液中30s,避光保湿24h后置于正常光照条件下
生长,直到开花结荚收集种子。将不同株系的转基因拟南芥连续自交,用T2 代植株作表型和功能分析。
1.2.4 转基因拟南芥的分子生物学鉴定 在得到的5个T1 株系中,设计引物OEA:5′ATGGCGCCCGC
CGACCCCAACCGGAGCTT3′和OEF:5′TCATTGCAAAGGAAGACTT3′进行PCR反应检测,预期片段
为2151bp。以cDNA作为模板,以β犃犮狋犻狀基因作为内参(引物序列ActF:5′CTATTCTCCGCTTTGGACT
TGGCA3′和 ActF:5′AGGACCTCAGGACAACGGAAACG3′)。设计引物 HP1(5′GCTGTTATGCGGC
CATTGTC3′)和 HP2(5′GACGTCTGTCGAGAAGTTTG3′),进行RTPCR反应检测,半定量PCR检测转
基因植株的犔狆犘5犆犛F128A的表达量。
1.2.5 转基因拟南芥植株游离脯氨酸含量的测定 选择经过RTPCR检测的Tp1、Tp3转基因及野生型株系
进行脯氨酸含量的测定,测定方法参照Bates[7]茚三酮测定法。测定结果用Excel和DPS软件进行分析。
2 结果与分析
2.1 引物设计
为了对犔狆犘5犆犛的第128位编码氨基酸Phe的功能进行分析,在不改变氨基酸总数的前提下,用结构简单
的Ala将其替换。图1序列分析表明,将突变位点GC放在引物128R5′端,2条引物的重叠区域为15个碱基,延
伸区为10个碱基,以保证2个片段的重叠区较大,而使引物的长度最小。
图1 突变位点及两侧序列
犉犻犵.1 犜犺犲犿狌狋犪狀狋狊犻狋犲犪狀犱犳犾犪狀犽犻狀犵狊犲狇狌犲狀犮犲狊
方框部分表示欲突变的位点Frameshowsthesiteformutation
2.2 阳性菌落鉴定突变基因的获得
将PCR产物与T载体连接,转化DMT感受态细胞。挑取白色克隆,进行菌落PCR分析,引物为OEA和
OEF。扩增结果如图2所示:在2000bp的上方有一条大约2151bp的片段。提取阳性菌落的质粒DNA,用载
体上的犛犪犾Ⅰ/犛犿犪犾Ⅰ位点进行酶切分析(犔狆犘5犆犛F128A序列不含此位点),反应成分及反应时间如1.2.2,电
泳检测,质粒DNA已被切成2个部分,大片段与T载体大小一致,小片段与目的片段大小相似,确认目的片段已
经插入到T载体中。通过PCR扩增,目的条带清晰,大小与野生型犔狆犘5犆犛的扩增结果一致。
2.3 突变犔狆犘5犆犛的序列分析
将构建在T载体上的突变犔狆犘5犆犛进行序列分析,测序结果与野生型犔狆犘5犆犛比对表明,第128位编码苯
丙氨酸的TTC已成功突变成编码丙氨酸的GCC,而其他位点未发生任何改变(图3)。
342第20卷第1期 草业学报2011年
2.4 转基因拟南芥阳性植株的PCR及RT-PCR鉴定
图2 犘犆犚及酶切产物检测结果
犉犻犵.2 犃犵狉狅狊犲犵犲犾犲犾犲犮狋狉狅狆犺狅狉犲狊犻狊狅犳犘犆犚犪狀犱犛犪犾Ⅰ/犛犿犪犾Ⅰ
犱狅狌犫犾犲犱犻犵犲狊狋犲犱狆狉狅犱狌犮狋狊
   A:1代表质粒pMD19犔狆犘5犆犛的扩增产物,M 代表 DNA marker
(DL2000plus);箭头所示为目标片段;B:1和2-3分别代表质粒
pMD19犔狆犘5犆犛犉128A的扩增产物和酶切产物,M 代表DNAmarker
(DL2000plus);箭头所示为目标片段A:1representsthePCRproduct
ofpMD19犔狆犘5犆犛,MrepresentsDNAmarker,andarrowsshowthe
targetfragments;1and2-3inBrepresentthePCRproductand犛犪犾
Ⅰ/犛犿犪犾ⅠdoubledigestionproductofpMD19犔狆犘5犆犛犉128A,respec
tively.MrepresentsDNA marker,andarrowsshowthetargetfrag
ments
以开花期的拟南芥为材料,采用渗透法把基因
犔狆犘5犆犛F128A转入花蕾,收集转基因当代植株的种
子,在含潮霉素(Hyg,50mg/L)的1/2MS(Murash
igeandSkoog)培养基中筛选,对抗性植株进行分子水
平检测。结果表明,5株 PCR 检测为阳性。RT-
PCR检测转基因植株的犔狆犘5犆犛F128A 的表达量。
结果表明,4个转基因株系中靶基因均高水平表达,1
个转基因株系未检测到外源靶基因的转录本,说明靶
基因在该转基因系植株中发生基因沉默现象。因此最
终获得4个转基因的拟南芥独立株系,分别命名为
Tp1、Tp2、Tp3和Tp4(图4A,B)。
2.5 过量表达的犔狆犘5犆犛F128A转基因拟南芥(T2
代)植株的形态观察
T2 代幼苗在添加Hyg的培养基上的生长情况如
图5A。野生幼苗生长细弱并且不能正常生根,继续培
养会黄化死亡。而转基因株系中75%左右植株能正
常生根,生长健壮,25%左右T2 代幼苗在抗性筛选时
不能正常生根,说明转基因拟南芥T2 代株系出现基
因和性状分离。
图3 突变后的测序结果
犉犻犵.3 犜犺犲狉犲狊狌犾狋狅犳狊犲狇狌犲狀犮犻狀犵犪犳狋犲狉犿狌狋犪狋犻狅狀
 划方框的位置表示苯丙氨酸残基(TTC)突变为丙氨酸残基(GCC)Theframeshowsthemutationsitefromfromphenylalanineresidue(Phenylal
anine,TTC)intoalanineresidues(Alanine,GCC)
图5B为播种3周后,T2 代过量表达的转基因Tp3株系和野生对照株系的形态观察,过量表达的转基因植
株生长旺盛,莲座叶片肥大,而野生对照植株莲座叶片细小(数据未列出),这与Zhang等[3]研究结果一致。说明
转犔狆犘5犆犛F128A基因促进了转基因拟南芥生物量的增加。
2.6 转基因拟南芥植株的脯氨酸含量测定
将2.5培养7d能够成活的T2 代转基因Tp1和Tp3株系幼苗,与同期播种的野生型拟南芥幼苗(不加Hyg
筛选),转移到含有100mmol/LNaCl(不含Hyg)的 MS培养基上继续培养7d。按照1.2.5的方法测定不同转
基因株系和野生型植株全苗脯氨酸含量(图6)。方差分析显示,转基因株系脯氨酸含量显著高于野生型植株
442 ACTAPRATACULTURAESINICA(2011) Vol.20,No.1
图4 转犔狆犘5犆犛犉128犃基因犘犆犚检测
犉犻犵.4 犘犆犚狆狉狅犱狌犮狋狅犳狋犺犲狋狉犪狀狊犵犲狀犻犮犪狀犱狑犻犾犱狋狔狆犲犃狉犪犫犻犱狅狆狊犻狊狊犲犲犱犾犻狀犵狊
 A:T2代转基因植株DNA-PCR检测,M代表DNAmarker(DL2000),CK1代表清水对照,CK2代表质粒DNA-PCR检测;B:T2 代转基因植
株RT-PCR检测,WT代表野生植株,Tp1~Tp4代表转基因植株 A:DNA-PCRproductofT2generationtransgenicplants,MrepresentsDNA
marker,CK1representswaternegativecontrol,CK2representstheDNA-PCRproductofpMD19犔狆犘5犆犛;B:RT-PCRproductofT2generation
transgenicplants,WTrepresentswildtypeplant,Tp1-Tp4representT2generationtransgenicplants
图5 转犔狆犘5犆犛犉128犃基因和野生型拟南芥幼苗的生长
犉犻犵.5 犌狉狅狑犻狀犵狊狋犪狋狌狊狅犳狋犺犲狋狉犪狀狊犵犲狀犻犮犪狀犱狑犻犾犱狋狔狆犲犃狉犪犫犻犱狅狆狊犻狊狊犲犲犱犾犻狀犵狊
 A:在50μg/LHyg抗性培养基上的生长情况Growingstatusonmediumwith50μg/LHyg;B:T2 代转基因Tp3株系和野生型幼苗生长情况
犔狆犘5犆犛F128AexpressioninT2transgenicandwildtypeseedlings
(犘<0.01),表明转犔狆犘5犆犛F128A基因拟南芥植株比
图6 100犿犿狅犾/犔犖犪犆犾处理下转犔狆犘5犆犛犉128犃基因
和野生型拟南芥幼苗的脯氨酸含量
犉犻犵.6 犘狉狅犾犻狀犲犮狅狀狋犲狀狋狅犳狋犺犲狋狉犪狀狊犵犲狀犻犮犔狆犘5犆犛犉128犃
犲狓狆狉犲狊狊犻狅狀犻狀犜2狋狉犪狀狊犵犲狀犻犮犪狀犱狑犻犾犱狋狔狆犲犃狉犪犫犻犱狅狆狊犻狊
狊犲犲犱犾犻狀犵狊狋狉犲犪狋犲犱狑犻狋犺100犿犿狅犾/犔犖犪犆犾
野生型能合成更多脯氨酸,犔狆犘5犆犛F128A在转基因
植株体内被正常表达并行使催化功能。在正常培养条
件下,Tp1和Tp3之间差异不显著,但它们的脯氨酸
含量显著高于野生株系,其中Tp3株系脯氨酸含量最
高,为1580μg/gFW;100mmol/LNaCl胁迫处理
下,Tp1和Tp3株系之间的脯氨酸含量差异显著,分
别为4262和5623μg/gFW,均显著高于野生型株
系。暗示转基因株系能积累更多的脯氨酸,与 Hong
等[2]研究结果相同。这也预示转犔狆犘5犆犛F128A基因
植株可能表现出更强的对渗透胁迫的耐性。
3 结论与讨论
在 DNA 序 列 上 进 行 定 点 突 变 (sitedirected
mutagenesis)是研究蛋白质的结构和功能以及蛋白质
之间的相互作用的重要手段[8]。Li等[9]以含有目的
基因的质粒为模板,以含突变位点的2个反向重叠引物起始PCR扩增,扩增产物不需连接反应直接转化大肠杆
菌,利用细胞内表达的DpnI消化去除原始模板质粒的干扰。但该方法使用的引物片段反向重叠区域大,在PCR
过程中易形成引物二聚体,致使PCR扩增效率和所得产物阳性率均非常低。为此,利用北京全式金生物技术公
542第20卷第1期 草业学报2011年
司EasyMutagenesisSystem试剂盒内配套的DMT超敏感受态细菌得到了足够的菌落[10]。将构建在T载体上
的突变犔狆犘5犆犛进行序列分析,测序结果与野生型犔狆犘5犆犛比对表明:第128位编码苯丙氨酸的TTC已成功突
变成编码丙氨酸的GCC,而其他位点未发生任何改变。PCR扩增效率和所得产物阳性率均非常高。
大量研究表明,脯氨酸积累与植物对干旱和盐胁迫适应性之间有显著的正相关[11,12]。将犔狆犘5犆犛F128A基
因插入表达载体的35S启动子下游,成功地将犔狆犘5犆犛F128A转入拟南芥中,实现了基因的高效表达,本试验结
果表明,在正常和盐处理条件下,Tp1和Tp3转基因株系脯氨酸含量的平均值是野生型的2.72和2.83倍,由于
犔狆犘5犆犛F128A基因的转入,明显提高了转基因拟南芥植株脯氨酸的积累速度。脯氨酸含量显著提高,预示着转
目的基因犔狆犘5犆犛F128A后,可提高转基因植物抗逆性[13]。
目前转基因株系正进行连续自交筛选,将进行抗逆性功能验证。总之,犔狆犘5犆犛的定点突变为进一步研究多
年生黑麦草在渗透胁迫过程中脯氨酸的作用机制奠定了基础。
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642 ACTAPRATACULTURAESINICA(2011) Vol.20,No.1
犛犻狋犲犱犻狉犲犮狋犲犱犿狌狋犪犵犲狀犲狊犻狊狅犳狋犺犲犔狆犘5犆犛犵犲狀犲狅犳犔狅犾犻狌犿狆犲狉犲狀狀犲
犪狀犱犻狋狊狋狉犪狀狊犳狅狉犿犪狋犻狅狀犻狀犃狉犪犫犻犱狅狆狊犻狊狋犺犪犾犻犪狀犪
CAOLi1,2,YIMingfang1,SUNZhenyuan2,HANLei2,JUGuansheng2,MAXinrong3
(1.DepartmentofOrnamentalHorticultureandLandscapeArchitecture,ChinaAgricultureUniversity,
Beijing100193,China;2.ResearchInstituteofForestry,ChineseAcademyofForestry\Key
LaboratoryofTreeBreedingandCultivation,StateForestryAdministration,Beijing
100091,China;3.ChengduInstituteofBiology,ChineseAcademy
ofSciences,Chengdu610041,China)
犃犫狊狋狉犪犮狋:FullengthcDNAsequencesofthe犔狆犘5犆犛gene,previouslyobtainedusingPCRamplificationwere
usedasabasisfordevelopingasitedirectedmutagenesissystemofthe犔狅犾犻狌犿狆犲狉犲狀狀犲prolinesynthetasegene
犔狆犘5犆犛.Thegenewasusedin犃犵狉狅犫犪犮狋犲狉犻狌犿mediatedtransformationtechnologytoverifyafunctionalmu
tantgene.ApairofprimerswasdesignedtothemutationsequenceandwasusedwithPfuhighfidelityDNA
polymeraseandsupercompetentcelsDMTinPCRamplification.The犔狆犘5犆犛F128Amutantgenewhichcon
tainedthedesiredmutationalsiteswasdirectlyclonedintotheeukaryoticexpressionvectorpCAMBIA1300,for
transformationinto犃狉犪犫犻犱狅狆狊犻狊forvalidationofgenefunction.Theexpectedlocusmutationshadoccurredin
犔狆犘5犆犛andchangedtheencodingcodonNo.128fromaphenylalanineresidue(PheorF)intoanalanineresi
due(Alanine,Ala).ThiswasproofthatPCRtechnologyhadsucceededinsitedirectedmutagenesisofthe
犔狆犘5犆犛gene.FourtransgeniclineswereobtainedfromtheT1generationoftransgenic犃狉犪犫犻犱狅狆狊犻狊plantsby
PCRandRT-PCR.TheT2generationof犃狉犪犫犻犱狅狆狊犻狊plantsweretreatedwith100mmol/LNaClsolutionfor
7dandtheprolinecontentofT1andT2transgenicplantswere4262and5623μg/gFWrespectively,higher
thanthe2581μg/gFWofwildtypestrains.Thisindicatedthattransgenicstrainscanaccumulatemorepro
line.
犓犲狔狑狅狉犱狊:犔狅犾犻狌犿狆犲狉犲狀狀犲;sitedirectedmutagenesis;prolinesynthasegenes;犃犵狉狅犫犪犮狋犲狉犻狌犿mediatedtrans
formationtechnology
742第20卷第1期 草业学报2011年