全 文 ：林业科学研究摇 圆园员猿袁圆远渊源冤院源源苑 源缘猿云燥则藻泽贼 砸藻泽藻葬则糟澡
摇 摇 文章编号院员园园员鄄员源怨愿渊圆园员猿冤园源鄄园源源苑鄄园苑
杜仲 匀阅砸基因全长 糟阅晕粤克隆与序列分析
刘攀峰员袁 杜红岩员鄢袁 乌云塔娜圆袁 杜兰英员袁 孙志强员
渊员郾 中国林业科学研究院经济林研究开发中心袁河南 郑州摇 源缘园园园猿曰 圆郾 国家林业局经济林育种与栽培重点实验室袁湖南 长沙摇 源员园园园源冤
收稿日期院 圆园员圆鄄园愿鄄圆愿
基金项目院 国家公益性行业科研专项渊圆园员园园源园圆怨冤
作者简介院 刘攀峰渊员怨愿源要冤袁男袁河南平顶山人遥 研究方向院杜仲栽培与育种曰耘皂葬蚤造院责枣藻灶早造蚤怎岳 员圆远援 糟燥皂
鄢 通讯作者袁研究员袁博士生导师遥 主要从事杜仲育种尧栽培与综合利用的研究
摘要院以杜仲叶片 糟阅晕粤为模板袁采用反转录 砸悦砸 及 砸粤悦耘 技术分离出 匀阅砸 基因的 糟阅晕粤 克隆袁命名为 耘怎匀阅砸遥
耘怎匀阅砸基因 糟阅晕粤全长 员 远缘猿 遭责袁缘爷端非编码区长 愿圆 遭责袁猿爷端非编码区长 员愿愿 遭责袁编码 源远园 个氨基酸袁与喜树 匀阅砸
基因序列相似性最高袁达 愿圆豫 曰推导 耘怎匀阅砸氨基酸序列中包含转运肽序列渊粤员鄄粤猿猿冤及植物 匀阅砸 蛋白多个保守的
功能位点渊粤员员苑袁粤圆园愿袁粤圆远圆袁粤猿源缘冤曰耘怎匀阅砸 蛋白二级结构 琢鄄螺旋占 猿缘郾 远缘豫 袁茁鄄折叠占 员怨郾 苑愿豫 袁螺环结构占
源源郾 缘苑豫 曰耘怎匀阅砸蛋白三级结构为单体形式袁呈不规则的三叶草形状曰系统进化分析表明 耘怎匀阅砸蛋白与葡萄 匀阅砸蛋
白的亲缘关系最为接近遥
关键词院杜仲曰匀阅砸曰基因曰序列分析
中图分类号院杂苑员愿援 源摇 摇 摇 摇 文献标识码院粤
悦造燥灶蚤灶早 葬灶凿 杂藻择怎藻灶糟藻 粤灶葬造赠泽蚤泽 燥枣 员鄄匀赠凿则燥曾赠鄄圆鄄酝藻贼澡赠造鄄圆鄄耘鄄月怎贼藻灶赠造鄄源鄄阅蚤责澡燥泽责澡葬贼藻
砸藻凿怎糟贼葬泽藻 郧藻灶藻 糟阅晕粤 枣则燥皂 耘怎糟燥皂皂蚤葬 怎造皂燥蚤凿藻泽
蕴陨哉 孕葬灶鄄枣藻灶早员袁阅哉 匀燥灶早鄄赠葬灶员袁宰哉再哉晕 栽葬鄄灶葬圆袁 阅哉 蕴葬灶鄄赠蚤灶早员袁杂哉晕 在澡蚤鄄择蚤葬灶早员
渊员郾 晕燥灶鄄贼蚤皂遭藻则 云燥则藻泽贼则赠 砸藻泽藻葬则糟澡 葬灶凿 阅藻增藻造燥责皂藻灶贼 悦藻灶贼藻则袁 悦澡蚤灶藻泽藻 粤糟葬凿藻皂赠 燥枣 云燥则藻泽贼则赠袁 在澡藻灶早扎澡燥怎摇 源缘园园园猿袁 匀藻爷灶葬灶袁 悦澡蚤灶葬曰
圆郾 运藻赠 蕴葬遭燥则葬贼燥则赠 燥枣 晕燥灶鄄憎燥燥凿 云燥则藻泽贼 孕则燥凿怎糟贼泽 燥枣 杂贼葬贼藻 云燥则藻泽贼则赠 粤凿皂蚤灶蚤泽贼则葬贼蚤燥灶袁 悦澡葬灶早泽澡葬摇 源员园园园源袁 匀怎爷灶葬灶袁 悦澡蚤灶葬冤
粤遭泽贼则葬糟贼院 员鄄澡赠凿则燥曾赠鄄圆鄄皂藻贼澡赠造鄄圆鄄渊耘冤鄄遭怎贼藻灶赠造 源鄄凿蚤责澡燥泽责澡葬贼藻 则藻凿怎糟贼葬泽藻 渊匀阅砸冤 泽赠灶贼澡藻泽蚤扎藻泽 陨孕孕 葬灶凿 阅酝粤孕孕 蚤灶 贼澡藻
造葬泽贼 泽贼藻责 燥枣 贼澡藻 责造葬灶贼 圆鄄悦鄄皂藻贼澡赠造鄄阅鄄藻则赠贼澡则蚤贼燥造 源鄄责澡燥泽责澡葬贼藻 渊酝耘孕冤 责葬贼澡憎葬赠援 匀燥皂燥造燥早燥怎泽 匀阅砸 早藻灶藻 糟阅晕粤 憎葬泽 蚤泽燥造葬鄄
贼藻凿 枣则燥皂 贼澡藻 造藻葬增藻泽 燥枣 耘怎糟燥皂皂蚤葬 怎造皂燥蚤凿藻泽 遭赠 贼澡藻 皂藻贼澡燥凿 燥枣 则藻增藻则泽藻 贼则葬灶泽糟则蚤责贼蚤燥灶 责燥造赠皂藻则葬泽藻 糟澡葬蚤灶 则藻葬糟贼蚤燥灶 渊砸栽鄄
孕悦砸冤 葬灶凿 则葬责蚤凿 葬皂责造蚤枣蚤糟葬贼蚤燥灶 燥枣 糟阅晕粤 藻灶凿泽 渊砸粤悦耘冤 贼藻糟澡灶蚤择怎藻袁 葬灶凿 灶葬皂藻凿 葬泽 耘怎匀阅砸援 宰蚤贼澡 贼澡藻 澡蚤早澡藻泽贼 早藻灶藻 泽藻鄄
择怎藻灶糟藻 泽蚤皂蚤造葬则蚤贼赠 贼燥 悦葬皂责贼燥贼澡藻糟葬 葬糟怎皂蚤灶葬贼葬 渊愿圆豫 冤袁 贼澡藻 枣怎造造鄄造藻灶早贼澡 糟阅晕粤 燥枣 耘怎匀阅砸 憎葬泽 员 远缘猿 遭责 蚤灶糟造怎凿蚤灶早 缘爷
灶燥灶鄄糟燥凿蚤灶早 则藻早蚤燥灶 燥枣 愿圆 遭责 葬灶凿 猿爷灶燥灶鄄糟燥凿蚤灶早 则藻早蚤燥灶 燥枣 员愿愿 遭责 葬灶凿 藻灶糟燥凿藻凿 源远园 葬皂蚤灶燥 葬糟蚤凿泽援 栽澡藻 贼则葬灶泽蚤贼 责藻责贼蚤凿藻
泽藻择怎藻灶糟藻 渊粤员鄄粤猿猿冤 葬灶凿 皂怎造贼蚤责造藻 糟燥灶泽藻则增藻凿 枣怎灶糟贼蚤燥灶葬造 泽蚤贼藻泽渊粤员员苑袁 粤圆园愿袁 粤圆远圆袁 粤猿源缘冤燥枣 责造葬灶贼 匀阅砸 责则燥贼藻蚤灶 憎藻则藻 枣燥怎灶凿蚤灶 贼澡藻 凿藻凿怎糟藻凿 糟燥凿蚤灶早 泽藻择怎藻灶糟藻 燥枣 耘怎匀阅砸援 栽澡藻 泽藻糟燥灶凿葬则赠 泽贼则怎糟贼怎则藻 燥枣 耘怎匀阅砸 责则燥贼藻蚤灶 憎葬泽 责则藻凿蚤糟贼藻凿 憎蚤贼澡 责则燥责燥则贼蚤燥灶
燥枣 琢鄄澡藻造蚤曾 贼燥 猿缘郾 远缘豫 袁茁 原 泽澡藻藻贼 贼燥 员怨郾 苑愿豫 葬灶凿 造燥燥责 辕 糟燥蚤造 贼燥 源源郾 缘苑豫 援 栽澡藻 糟葬造糟怎造葬贼藻凿 责则燥贼藻蚤灶 贼藻则贼蚤葬则赠 泽贼则怎糟贼怎则藻 燥枣
耘怎匀阅砸 憎葬泽 枣燥则皂藻凿 葬泽 皂燥灶燥皂藻则袁 憎澡蚤糟澡 蚤灶 泽责葬糟藻 凿蚤泽责造葬赠藻凿 葬泽赠皂皂藻贼则蚤糟葬造 泽澡葬皂则燥糟噪鄄造蚤噪藻 泽澡葬责藻援 孕澡赠造燥早藻灶藻贼蚤糟 葬灶葬造赠泽蚤泽
则藻增藻葬造藻凿 贼澡葬贼 贼澡藻 藻增燥造怎贼蚤燥灶葬则赠 则藻造葬贼蚤燥灶泽澡蚤责 燥枣 耘怎匀阅砸 责则燥贼藻蚤灶 憎葬泽 贼澡藻 糟造燥泽藻泽贼 贼燥 灾蚤贼蚤泽 增蚤灶蚤枣藻则葬 匀阅砸 责则燥贼藻蚤灶援
运藻赠 憎燥则凿泽院 耘怎糟燥皂皂蚤葬 怎造皂燥蚤凿藻泽曰匀阅砸 早藻灶藻曰 泽藻择怎藻灶糟藻 葬灶葬造赠泽蚤泽
萜渊贼藻则责藻灶燥蚤凿冤是结构最为古老和种类最为繁多
的生物大分子袁自然界中目前已发现有 远缘 园园园 多
种袁因而此类化合物也统称为萜组 咱员 原 圆暂 遥 植物萜类
作为重要的次生代谢产物袁具有驱虫尧杀虫尧吸引授
林摇 业摇 科摇 学摇 研摇 究 第 圆远 卷
粉者尧激素尧香料以及染料等功能袁在日常生活中广
泛开发和应用在食品尧保健品尧化妆品尧化工尧医药以
及橡胶等行业咱猿暂 遥 异戊烯基焦磷酸渊 陨孕孕冤及其异构
体二甲基烯丙基焦磷酸渊阅酝粤孕孕冤是萜类化学组成
与生物合成的基本结构单位和功能单位袁植物中二
者的形成主要经定位于胞质的甲羟戊酸途径渊酝灾粤
责葬贼澡憎葬赠冤和质体的 圆鄄甲基鄄阅鄄赤藓醇鄄源鄄磷酸途径
渊酝耘孕 责葬贼澡憎葬赠冤 咱源暂 遥 员鄄羟基鄄圆鄄甲基鄄圆鄄耘鄄丁烯基鄄源鄄焦
磷酸还原酶渊匀阅砸冤是酝耘孕途径的末端酶袁催化 员鄄羟
基鄄圆鄄甲基鄄圆鄄耘鄄丁烯基鄄源鄄焦磷酸渊匀酝月孕孕冤发生还原
反应并以 缘院员 的比例生成 陨孕孕 与 阅酝粤孕孕 的混合
物咱缘暂 遥 有近 缘 千余条与 匀阅砸 相关的基因序列在
郧藻灶月葬灶噪 中登录袁包括细菌尧植物及其它真核生物
等袁其中银杏渊郧蚤灶噪早燥 遭蚤造燥遭葬 蕴援 冤尧马尾松渊孕蚤灶怎泽 皂葬泽鄄
泽燥灶蚤葬灶葬 蕴葬皂遭援 冤尧苏铁渊悦赠糟葬泽 则藻增燥造怎贼葬 栽澡怎灶遭援 冤等裸
子植物均有 圆 猿 个基因家族成员咱远暂 遥 匀阅砸基因在
萜类合成过程中起重要的调控作用咱苑 原 员员暂 袁被认为是
萜类代谢工程的理想靶点袁其基因结构尧生物学功能
与作用机理日益受到萜类研究的关注遥
杜仲渊耘怎糟燥皂皂蚤葬 怎造皂燥蚤凿藻泽 韵造蚤增援 冤适生于华中尧华
西尧西南及西北各地袁现广泛栽培咱员圆 原 员猿暂 遥 许多杜仲
提取物在工业领域以及医药生产上有重要的经济价
值袁其中最重要的是萜类次生产物遥 目前对杜仲萜
类生物合成尧功能基因开发和利用开展的研究不多袁
对杜仲 匀阅砸 基因的克隆及序列分析尚无报道遥 本
研究以杜仲叶片为材料袁分离 匀阅砸 同源基因全长
糟阅晕粤袁通过生物信息学方法对基因序列及推导的氨
基酸序列进行分析袁以期为研究杜仲 匀阅砸 基因功
能尧阐释杜仲萜类生物合成机制和分子育种提供
参考遥
员摇 材料与方法
员援 员摇 材料
圆园员员 年 源 月下旬于中国林业科学研究院经济
林研究开发中心院内采集耶华仲 远 号爷杜仲良种叶
片袁清洗干净后投入液氮带回室内 原 愿园 益 保存
备用遥
员援 圆摇 试剂
阅耘孕悦渊杂蚤早皂葬袁德国冤袁孕灾孕渊粤皂则藻泽糟燥袁美国冤袁杂阅杂
渊上海生工袁上海冤袁氯化锂渊粤皂则藻泽糟燥袁美国冤袁悦栽粤月
渊粤皂则藻泽糟燥袁美国冤袁酝蚤早澡贼赠粤皂责 阅晕粤 孕燥造赠皂藻则葬泽藻 灾藻则援 圆
渊栽葬噪葬则葬袁大连冤袁琼脂糖凝胶 阅晕粤 回收试剂盒渊天
根袁北京冤袁猿爷鄄云怎造造 砸粤悦耘 悦燥则藻 杂藻贼 渊 栽葬噪葬则葬袁大连冤袁
缘爷鄄云怎造造 砸粤悦耘 运蚤贼渊栽葬噪葬则葬袁大连冤袁酝鄄酝蕴灾 砸栽葬泽藻 糟阅鄄
晕粤 杂赠灶贼澡藻泽蚤泽 运蚤贼 渊 栽葬噪葬则葬袁大连冤袁责耘粤杂再鄄栽员 悦造燥灶蚤灶早
运蚤贼渊全式金袁北京冤袁阅匀缘琢 感受态细胞 渊天根袁北
京冤遥
员援 猿摇 试验方法
员援 猿援 员摇 总 砸晕粤提取与单链 糟阅晕粤 的合成摇 采用改
良的 悦栽粤月鄄蕴蚤悦造法提取杜仲叶片 砸晕粤咱员源 原 员缘暂 袁对满足
实验要求的 砸晕粤 样品保存于 原 愿园 益冰箱备用遥 按
酝鄄酝蕴灾 砸栽葬泽藻 糟阅晕粤 杂赠灶贼澡藻泽蚤泽 运蚤贼 说明书进行单链
糟阅晕粤的合成遥
员援 猿援 圆摇 引物设计摇 根据一段已知杜仲 匀阅砸 怎灶蚤早藻灶藻
序列袁结合试剂盒锚定引物序列袁设计适于 猿忆砸粤悦耘
的巢式扩增的引物 猿孕员院 缘忆鄄栽粤悦郧郧栽郧粤粤栽粤粤郧粤郧鄄
郧栽栽粤郧粤郧郧鄄猿忆袁 猿孕圆院 缘忆鄄粤栽悦栽栽郧悦悦栽郧悦栽栽栽悦郧郧栽鄄
郧悦栽郧鄄猿忆以及 缘忆砸粤悦耘 巢式扩增引物 缘孕员院缘忆鄄 郧栽栽鄄
郧粤郧悦栽粤郧粤栽悦悦粤栽悦粤粤郧栽栽郧粤悦鄄猿忆袁 缘孕圆院 缘忆鄄悦栽粤栽鄄
粤郧栽悦栽悦悦栽悦郧栽郧悦郧粤粤栽粤栽鄄猿忆遥
员援 猿援 猿摇 基因全长 糟阅晕粤 末端扩增 摇 猿忆砸粤悦耘 及 缘忆
砸粤悦耘 的 孕悦砸 反应体系与反应条件参照 栽葬噪葬则葬 猿忆鄄
云怎造造 砸粤悦耘 悦燥则藻 杂藻贼 灾藻则援 圆郾 园 与 栽葬噪葬则葬 缘忆鄄云怎造造 砸粤悦耘
运蚤贼 说明书操作遥
员援 猿援 源摇 目的片段回收与测序摇 按 栽陨粤晕郧耘晕 通用型
阅晕粤回收试剂盒说明进行目的 孕悦砸 产物的回收曰按
责耘粤在再要栽 克隆试剂盒说明将回收片段连接至克隆
载体袁鉴定后将阳性克隆送至南京金斯瑞公司测序遥
员援 猿援 缘摇 生物信息学分析 摇 利用 晕悦月陨 月造葬泽贼 程序进
行序列相似性检索袁并用 韵砸云 云蚤灶凿藻则 程序查找基因
糟阅晕粤开放阅读框架曰利用 耘曾孕粤杂赠 孕则燥贼孕葬则葬皂程序与
杂糟葬灶孕则燥泽蚤贼藻程序分析氨基酸残基数目与组成尧蛋白
质相对分子量尧理论等电点以及功能位点等曰利用
孕则藻凿蚤糟贼 孕则燥贼藻蚤灶 以及 孕杂陨孕砸耘阅 方法预测蛋白质的细
胞定位及二级结构咱员远暂 曰利用 悦澡造燥则燥孕 员援 员 杂藻则增藻则 进
行转运肽的预测咱员苑暂 曰利用 杂宰陨杂杂鄄酝韵阅耘蕴 程序进行
蛋白质的同源建模咱员愿暂 曰利用 蕴葬泽藻则早藻灶藻 软件进行蛋
白质序列的多重比对并通过 酝耘郧粤 缘 软件构建基因
的系统进化树咱员怨暂 遥
圆摇 结果与分析
圆援 员摇 杜仲 匀阅砸基因全长 糟阅晕粤的分离及序列特征
利用 猿爷砸粤悦耘与 缘爷砸粤悦耘端巢式扩增引物在逆
转录的 糟阅晕粤模板上分别扩增出 员 条 员 园园园 遭责左右
和 员 条 愿园园 遭责 左右的目的条带渊图 员冤袁拼接后得到
愿源源
第 源 期 刘攀峰等院杜仲 匀阅砸基因全长 糟阅晕粤克隆与序列分析
员 条长 员 远缘猿 遭责 的基因序列袁与喜树渊悦葬皂责贼燥贼澡藻糟葬
葬糟怎皂蚤灶葬贼葬 阅藻糟灶藻援 曰粤糟糟藻泽泽蚤燥灶 晕韵援 院阅匝愿远源源怨缘援 员冤尧葡
萄渊灾蚤贼蚤泽 增蚤灶蚤枣藻则葬 蕴援 曰载酝赃园园圆圆愿源远圆猿援 圆冤尧长春花渊悦葬鄄
贼澡葬则葬灶贼澡怎泽 则燥泽藻怎泽渊蕴援 冤 郧援 阅燥灶曰阅匝愿源愿远苑远援 员冤尧甜菊
渊 杂贼藻增蚤葬 则藻遭葬怎凿蚤葬灶葬 月藻则贼燥灶蚤曰 阅匝圆远怨源缘员援 源冤尧萝芙木
渊砸葬怎增燥造枣蚤葬 增藻则贼蚤糟蚤造造葬贼葬 渊 蕴燥怎则援 冤 月葬蚤造造援 曰 耘哉园猿源远怨怨援 员 冤
匀阅砸的相似性分别为 愿圆豫 尧愿圆豫 尧苑怨豫 尧愿园豫 尧苑怨豫 遥
韵砸云 枣蚤灶凿藻则推导基因序列含 员 条长 员 猿愿猿 遭责 的开放
阅读框袁缘爷鄄哉栽砸为 愿圆 遭责袁猿爷鄄哉栽砸为 员愿愿 遭责袁共编码
源远园 个氨基酸残基渊图 圆冤遥 推导的氨基酸序列与喜
树渊粤月陨远源员缘圆援 员冤尧葡萄渊载孕赃园园圆圆愿源远缘怨援 员冤尧长春花
渊粤月陨猿园远猿员援 员冤尧萝芙木渊粤月灾愿怨缘愿圆援 员冤尧橡胶渊匀藻增鄄
藻葬 遭则葬泽蚤造蚤藻灶泽蚤泽 渊 宰蚤造造凿援 藻曾 粤援 允怎泽泽援 冤 酝怎藻造造援 粤则早援 曰
月粤云怨愿圆怨苑援 员冤匀阅砸蛋白的相似性分别为 愿愿豫尧愿苑豫尧
愿缘豫 尧愿源豫 尧愿缘豫 袁确定为杜仲 匀阅砸 基因全长 糟阅晕粤袁
将其命名为 耘怎匀阅砸遥
摇 摇 摇 摇 摇 渊葬冤猿忆末端片段摇 摇 摇 摇 摇 摇 摇 渊遭冤缘忆末端片段
图 员摇 耘怎匀阅砸基因 砸栽鄄孕悦砸扩增的琼脂糖凝胶电泳图
图 圆摇 耘怎匀阅砸 全长 糟阅晕粤序列及推导的氨基酸序列
圆援 圆摇 耘怎匀阅砸编码蛋白的结构特征
圆援 圆援 员 摇 耘怎匀阅砸 蛋白一级结构分析 摇 耘曾孕葬杂赠 孕则燥贼鄄
孕葬则葬皂预测 耘怎匀阅砸编码蛋白分子量为 缘员郾 怨园 噪阅袁理
论等电点为 缘援 源源袁以谷氨酸 渊 怨郾 愿豫 冤尧赖氨酸
渊愿郾 缘豫 冤尧缬氨酸渊苑郾 愿豫 冤含量为最高袁蛋白不稳定
系数为 猿猿郾 缘远袁属稳定蛋白质遥 孕则藻凿蚤糟贼 孕则燥贼藻蚤灶 预测
耘怎匀阅砸亚细胞定位于叶绿体袁耘曾责葬泽赠 责则燥贼泽糟葬造藻 推断
耘怎匀阅砸为疏水性蛋白遥 灾藻糟贼燥则 晕栽陨 粤凿增葬灶糟藻 员园 多重
比对的结果显示 耘怎匀阅砸蛋白序列具有植物 匀阅砸蛋
白催化过程中必需的 源 个半胱氨酸位点渊粤员员苑袁粤圆园愿袁粤圆远圆袁粤猿源缘冤袁缘 条同源序列比对后相同的氨基酸位点
达 远苑 个曰几种植物 匀阅砸 蛋白 晕 端比大肠杆菌
渊耘泽糟澡藻则蚤糟澡蚤葬 糟燥造蚤冤多 员园园 员员园 个氨基酸残基袁说明
在这段区域可能包含转运肽袁利用 悦澡造燥则燥孕 员援 员
杂藻则增藻则程序推导 耘怎匀阅砸 转运肽序列为 猿猿 个氨基酸
残基渊图 猿冤遥
圆援 圆援 圆摇 耘怎匀阅砸蛋白二级结构及保守结构域分析摇
孕则藻凿蚤糟贼孕则燥贼藻蚤灶 在线预测 耘怎匀阅砸 蛋白二级结构中 琢鄄
螺旋占 猿缘郾 远缘豫 袁 茁鄄折叠占 员怨郾 苑愿豫 袁螺环结构占
源源郾 缘苑豫 袁属混合型结构渊图 源冤遥 保守结构域分析显
示 耘怎匀阅砸 为一多结构域蛋白袁属 蕴再栽月 蛋白家族
渊图 缘冤遥
怨源源
林摇 业摇 科摇 学摇 研摇 究 第 圆远 卷
渊耘糟赃匀阅砸袁孕远圆远圆猿援 员曰粤贼赃匀阅砸袁粤耘耘愿远猿远圆援 员曰匀遭赃匀阅砸袁粤悦郧缘缘远愿猿援 员曰孕贼赃匀阅砸袁耘耘耘愿苑苑苑员援 员冤
图 猿摇 耘怎匀阅砸氨基酸序列与同源序列的多重比对
图 源摇 耘怎匀阅砸 蛋白二级结构预测
园缘源
第 源 期 刘攀峰等院杜仲 匀阅砸基因全长 糟阅晕粤克隆与序列分析
图 缘摇 耘怎匀阅砸蛋白的保守结构域预测
圆援 圆援 猿摇 耘怎匀阅砸蛋白功能位点与翻译后磷酸化修饰
预测摇 耘曾孕葬杂赠 杂糟葬灶孕则燥泽蚤贼藻 程序分析 耘怎匀阅砸 蛋白基
序类型分为 缘 种袁含 圆怨 个潜在的功能位点袁包括 怨
个酪蛋白激酶域磷酸化位点渊栽泽贼阅袁员圆 员缘曰栽造责耘袁员苑
圆园曰杂泽早耘袁猿缘 猿愿曰栽藻枣阅袁源怨 缘圆曰栽造泽耘袁员怨源 员怨苑曰
杂澡藻耘袁圆猿源 圆猿苑曰杂贼噪耘袁圆苑源 圆苑苑曰栽蚤糟阅袁猿源圆 猿源缘曰
杂贼责阅袁源猿缘 源猿愿冤曰远 个蛋白激酶 悦 磷酸化位点
渊杂增砸袁猿员 猿猿曰 栽增运袁员园远 员园愿曰 杂藻运袁员猿缘 员猿苑曰
杂藻运袁员怨远 员怨愿曰杂贼运袁圆苑源 圆苑远曰杂赠运袁源园远 源园愿冤曰缘
个 晕 端糖基化位点渊晕蕴栽砸袁缘怨 远圆曰晕灾栽灾袁员园源
员园苑曰晕匝栽栽袁猿园源 猿园苑曰晕杂杂晕袁猿苑圆 猿苑缘曰晕栽杂匀袁猿苑缘
猿苑愿冤曰愿 个 晕 端豆蔻酰化位点 渊 郧晕藻赠栽宰袁怨苑
员园圆曰 郧灾藻则粤灾袁 员员愿 员圆猿曰 郧粤葬增晕耘袁 员愿远 员怨员曰
郧匝造凿郧杂袁圆远苑 圆苑圆曰 郧杂泽泽栽运袁圆苑员 圆苑远曰 郧郧憎灶杂杂袁
猿远怨 猿苑源曰 郧晕噪蚤杂再袁 源园圆 源园苑曰 郧灾贼泽郧粤袁 源圆怨
源猿源冤曰员 个酪氨酸激酶磷酸化位点渊运灶皂葬耘葬皂援 再袁
圆缘圆 圆缘怨冤遥
晕藻贼孕澡燥泽 圆郾 园 泽藻则增藻则预测出 圆苑 个 耘怎匀阅砸蛋白翻
译后磷酸化位点袁包括 员员 个丝氨酸磷酸化位点
渊粤猿员尧 粤猿缘尧 粤猿远尧 粤猿怨尧 粤源圆尧 粤员猿缘尧 粤圆圆苑尧 粤圆猿源尧 粤圆苑源尧 粤源猿圆尧粤源猿缘冤袁员园 个苏氨酸磷酸化位点渊粤员圆尧粤员苑尧粤源怨尧粤愿远尧粤员园远尧粤员怨源尧粤圆园缘尧粤猿源圆尧粤源圆苑尧粤源猿远冤以及 远 个酪氨酸磷酸
化位点渊粤员园园尧粤圆圆缘尧粤圆源愿尧粤圆缘怨尧粤圆愿缘尧粤源园苑冤渊图 远冤遥
图 远摇 耘怎匀阅砸蛋白翻译后磷酸化位点预测
圆援 圆援 源 摇 耘怎匀阅砸 蛋白三级结构分析 摇 以超嗜热菌
渊粤择怎蚤枣藻曾 葬藻燥造蚤糟怎泽冤匀阅砸蛋白渊猿凿灶枣冤为模板对 耘怎匀阅砸
蛋白进行同源建模袁如图 苑 所示袁耘怎匀阅砸 蛋白三维
结构为单体形式袁在空间上呈不规则的三叶草形状遥
耘曾孕粤泽赠 泽贼则怎糟贼怎则藻 葬泽泽藻泽泽皂藻灶贼 程序评测推导蛋白模型
匝酝耘粤晕 源 得分为 园援 缘园猿袁与模板蛋白序列的相似性
为 圆源郾 缘豫 遥
图 苑摇 耘怎匀阅砸蛋白三级结构预测
圆援 猿摇 耘怎匀阅砸同源蛋白系统进化树的构建
利用 酝耘郧粤缘 中 悦造怎泽贼葬造 宰 法对 圆圆 个不同物种
匀阅砸蛋白序列进行比对袁并用 晕藻蚤早澡遭燥则鄄躁燥蚤灶蚤灶早 法构
建了系统进化树渊图 愿冤遥 结果表明不同来源的 匀阅砸
蛋白属不同的进化分支袁裸子植物尧单子叶植物及双
子叶植物 匀阅砸之间有较为清晰的界限遥 耘怎匀阅砸 蛋
白与葡萄亲缘关系最为接近袁进化距离为 园郾 园愿源袁其
次为橡胶渊园郾 园愿苑冤尧喜树渊园郾 园怨员冤尧番茄渊蕴赠糟燥责藻则泽蚤糟燥灶
藻泽糟怎造藻灶贼怎皂 酝蚤造造藻则 曰园郾 园怨员冤尧萝芙木渊园郾 园怨愿冤和长春花
渊园郾 园怨愿冤遥
猿摇 讨论
萜类存在于近乎所有的生命形式中袁生理功能
涉及蛋白合成调节尧电子转移尧光合作用尧质膜形成尧
信号传递以及植物防御等多个方面咱圆园暂 遥 分析代谢
网络中的限速步骤袁发掘鉴定关键功能基因袁是应用
基因工程以及分子育种的前提条件遥 相对于 酝灾粤
途径袁酝耘孕 合成途径更广泛地存在于自然界中遥
阅载杂和 阅载砸酶基因最早被认为是 酝耘孕途径中重要
的调控靶点袁并在大肠杆菌尧拟南芥 渊 粤则葬遭蚤凿燥责泽蚤泽
贼澡葬造蚤葬灶葬 蕴援 冤及番茄等生物系统中开展了一系列研
究对其基因功能进行验证咱圆员 原 圆圆暂 遥 而近期的一些研
究表明 匀阅砸 基因在 酝耘孕 途径 陨孕孕 与 阅酝粤孕孕 合成
的代谢流动中同样发挥关键作用袁如在萜类物质含
量很高的薄荷腺体中发现大量分布 匀阅砸 基因表达
的序列标签咱苑暂 曰在模式物种拟南芥尧大肠杆菌中也证
员缘源
林摇 业摇 科摇 学摇 研摇 究 第 圆远 卷
实 匀阅砸 基因对萜类化合物的合成产生重要影
响咱员员暂 曰在银杏 匀阅砸 基因转化系中银杏总内酯含量
是非转基因系的 圆郾 缘 倍袁进一步说明了 匀阅砸 对萜类
合成有重要作用咱员园暂 遥 基于生物信息学分析的结果
图 愿摇 匀阅砸同源蛋白的系统进化树分析
表明 耘怎匀阅砸蛋白具有植物 匀阅砸 典型的功能位点尧
基序及结构域袁意味着所克隆的 耘怎匀阅砸 是高等植物
匀阅砸基因家族的新成员袁可为杜仲萜类基因工程候
选基因的筛选提供基础信息袁但对基因功能的判定
有待深入研究遥
目前 孕阅月数据库中已注册 缘园 种 匀阅砸 蛋白的
晶体模型袁包括细菌尧古生菌尧真核生物以及病毒等
类型遥 利用 载鄄射线对大肠杆菌和嗜热菌分析的数
据显示 匀阅砸蛋白由一条肽链折叠形成三个相似的
结构域袁在空间上排列成不完全对称的三叶草形
状咱圆猿暂 遥 而通过 杂憎蚤泽泽鄄皂燥凿藻造 同源建模法预测的 耘怎鄄
匀阅砸蛋白三维结构与已解析的 匀阅砸 蛋白空间特征
基本吻合袁这为 耘怎匀阅砸蛋白的功能预测以及认识植
物 匀阅砸的催化机制提供了初步参考遥
参考文献院
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