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Construction of Suppression Subtractive Hybridization Library and Expression Pattern of a Few Genes Involved in Rooting of <i>Larix</i> Cuttings

落叶松扦插生根过程SSH文库构建及部分基因的表达分析


为研究落叶松在扦插生根过程中基因的表达情况,以落叶松扦插生根率存在显著差异的2个全同胞无性系为材料构建差异表达cDNA文库,获得正、反2个消减文库。随机挑取正库和反库各500个克隆进行测序。将测序结果整理后,正库得到272个UniEST,反库得到249个UniEST。经生物信息学分析表明,这些UniEST分别属于新陈代谢、信号途径、物质运输、抗性相关、生长发育等类别基因,这些基因可能在扦插生根过程中具有重要作用。选择部分有代表性的基因,运用半定量PCR技术对这些基因在落叶松不同器官、不同扦插阶段的表达情况及对IBA的响应进行检测。检测结果表明激素在落叶松扦插生根过程中发挥重要作用,除激素类基因外,小G蛋白、ABC转运蛋白类、因伤诱导物质等相关基因也参与落叶松扦插生根的过程。

In order to investigate the expression pattern of genes during rooting of <i>Larix</i> cuttings,two differentially expressed cDNA libraries were constructed by using two <i>Larix</i> clones whose rates of rooting are significantly different.Each 500 clones,stochastically selected from positive and negative library,were sequenced.After sequencing and assembling,we obtained 521 UniEST(272 from positive library and 249 from negative library).The UniEST included the genes related to metabolism,signal pathway,transport,resistance,development and cell structure.The result suggested that these genes might have the function during rooting of <i>Larix</i> cuttings.The representational genes were selected and further detected by using semi-quantitative RT-PCR to understand their expression patterns in roots,stems,leaves and at different stages of rooting of <i>Larix</i> cuttings.The result indicated that hormones played pivotal roles in rooting of <i>Larix</i> cuttings.Besides genes related to hormones,small G protein genes,ATP binding cassette transporters genes and WRCs genes were all involved in the rooting procedure.


全 文 :第 !" 卷 第 " 期
# $ % $ 年 " 月
林 业 科 学
&’()*+(, &(-.,) &(*(’,)
./01!"!*/1"
2345!# $ % $
落叶松扦插生根过程 &&P文库构建及
部分基因的表达分析!
冯6健%!#6齐力旺%6孙晓梅%6张守攻%
"%1中国林业科学研究院林业研究所细胞生物学实验室6北京 %$$$7%# #1辽宁省林业科学研究院6沈阳 %%$$=#$
摘6要!6为研究落叶松在扦插生根过程中基因的表达情况!以落叶松扦插生根率存在显著差异的 # 个全同胞无
性系为材料构建差异表达YC*,文库!获得正’反 # 个消减文库% 随机挑取正库和反库各 <$$ 个克隆进行测序% 将
测序结果整理后!正库得到 #8# 个m4H)&+!反库得到 #!7 个m4H)&+% 经生物信息学分析表明!这些m4H)&+分别属
于新陈代谢’信号途径’物质运输’抗性相关’生长发育等类别基因!这些基因可能在扦插生根过程中具有重要作
用% 选择部分有代表性的基因!运用半定量d’N技术对这些基因在落叶松不同器官’不同扦插阶段的表达情况及
对(B,的响应进行检测% 检测结果表明激素在落叶松扦插生根过程中发挥重要作用!除激素类基因外!小I蛋白’
,B’转运蛋白类’因伤诱导物质等相关基因也参与落叶松扦插生根的过程%
关键词&6落叶松# &&P文库# 扦插# 生长素
中图分类号! &8%91!"666文献标识码!,666文章编号!%$$% A8!99"#$%$#$" A$$#8 A$9
收稿日期& #$$7 A$" A#7# 修回日期& #$$7 A$7 A#7%
基金项目& )9"=*计划)高产优质多抗林木花草分子与细胞高效育种技术及品种创制*"#$$",,%$$%$7$和国家转基因与产业化专项)优
质’杂种落叶松抗旱基因工程育种研究*"2#$$# ABA$$<$%
!张守攻为通讯作者%
!($’*170*,($()+7221&’’,($+7>*1#0*,<&3/>1,4,Z#*,($[,>1#1/ #$4NL21&’’,($
.#*&1$()# 6&@:&$&’K$<(-<&4,$;((*,$% ()3*’14 !7*,$%’
gM4F2HE4%!#6JH-HZE4F%6&34 @HE/OMH%6fLE4F&L/3F/4F%
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=>’*1#0*&6(4 /UVMUW/H4[MKWHFEWMWLMM_\UMKKH/4 \EWMU4 /TFM4MKV3UH4FU//WH4F/T:&’-GY3WH4FK!WZ/VHTMUM4WHE0XM_\UMKKMV
YC*,0H^UEUHMKZMUMY/4KWU3YWMV ^X3KH4FWZ/:&’-GY0/4MKZL/KMUEWMK/TU//WH4FEUMKHF4HTHYE4W0XVHTMUM4W5)EYL <$$ Y0/4MK!
KW/YLEKWHYE0XKM0MYWMV TU/O\/KHWH[ME4V 4MFEWH[M0H^UEUX! ZMUMKMR3M4YMV5,TWMUKMR3M4YH4FE4V EKKMO^0H4F! ZM/^WEH4MV <#%
m4H)&+"#8# TU/O\/KHWH[M0H^UEUXE4V #!7 TU/O4MFEWH[M0H^UEUX$5+LMm4H)&+H4Y03VMV WLMFM4MKUM0EWMV W/OMWE^/0HKO!KHF4E0
\EWLZEX!WUE4K\/UW!UMKHKWE4YM! VM[M0/\OM4WE4V YM0KWU3YW3UM5+LMUMK30WK3FFMKWMV WLEWWLMKMFM4MKOHFLWLE[MWLMT34YWH/4
V3UH4FU//WH4F/T:&’-GY3WH4FK5+LMUM\UMKM4WEWH/4E0FM4MKZMUMKM0MYWMV E4V T3UWLMUVMWMYWMV ^X3KH4FKMOH]R3E4WHWEWH[MN+]
d’NW/34VMUKWE4V WLMHUM_\UMKKH/4 \EWMU4KH4 U//WK!KWMOK!0ME[MKE4V EWVHTMUM4WKWEFMK/TU//WH4F/T:&’-GY3WH4FK5+LMUMK30W
H4VHYEWMV WLEWL/UO/4MK\0EXMV \H[/WE0U/0MKH4 U//WH4F/T:&’-GY3WH4FK5BMKHVMKFM4MKUM0EWMV W/L/UO/4MK! KOE0I\U/WMH4
FM4MK!,+d^H4VH4FYEKKMWMWUE4K\/UWMUKFM4MKE4V SN’KFM4MKZMUME0H4[/0[MV H4 WLMU//WH4F\U/YMV3UM5
?&/ @(14’&6:&’-G# &&P0H^UEUX# Y3WH4F# E3_H4
66落叶松":&’-G$是我国北方地区主要造林树种%
扦插繁殖是落叶松今后实现无性系化的主要方式%
但是!落叶松是难生根树种!其生根能力差成为其无
性系化的瓶颈"杨书文等!%77!$% 为解决此问题!
很多学者从解剖学和生理学角度分析落叶松扦插生
根的过程!并提出解决办法"敖红等!#$$## 杜继煜
等!#$$!# 黄卓烈等!#$$## 刘桂丰等!%77#$% 这些
办法在一定程度上提高了落叶松扦插生根率!但是
并未探明落叶松扦插生根的机制!使得生产上带有
一定的盲目性% 为了解落叶松扦插生根过程中基因
表达谱!探明落叶松扦插生根机制!解决落叶松扦插
生根 率 低 的 问 题! 本 文 利 用 抑 制 消 减 杂 交
"K3\\UMKKH/4 K3^WUEYWH[MLX^UHVHaEWH/4!&&P$技术!分
别以扦插生根率存在显著差异的 # 个落叶松全同胞
无性系为试验材料!构建落叶松消减文库!并对部分
重要的差异表达基因进行表达分析% 获得这些基因
及其表达模式可为落叶松提高扦插生根率及遗传改
良提供理论支持和基因资源%
林 业 科 学 !" 卷6
%6材料与方法
CBCD材料
试验材料为杂种落叶松 " :&’-G3$E,/3$E-%j:"
/34$+%-%$"日永 9< j长 !’$=%]" 和 %<]! 两个全同胞
无性系!其中无性系 =%]" 的生根率 >7$:!无性系
%<]! 的生根率 ?#$:% 均取自辽宁大孤家国营林
场!取样时间为 #$$"+#$$8 年% 插穗经(B,处理后
进行扦插试验% 取材分 = 个时期!分别为插穗茎段’
插穗形成愈伤组织且有根原基形成’不定根生长初
期!其中插穗茎段分 (B,处理前和处理后!处理的
方法为 # j%$ A! O/0.-A% (B,处理 =$ OH4!" L 后取
材% 上述材料为建库和半定量 d’N部分材料% 另
外取 % 个 %!]%# 全同胞无性系"日永 9< j长 !’$"其
生根率为 !<: ;<<:$根’茎’叶作为半定量 d’N
材料使用% 取材后迅速液氮冷冻!带回实验室后
A8$ c保存%
CBAD方法
%1#1%6落叶松 ON*,分离6总 N*,提取参照
&Y/W2U等 "%779$的方法# ON*,分离纯化采用
JHEFM4 ON*,分离试剂盒提供的方法%
%1#1#6YC*,消减文库构建6获得足量 ON*,后!
按照 ’0/4WMYL d’N]&M0MYW+Q YC*,&3^WUEYWH/4 DHW操
作手册获得 YC*,片断% 获得的 YC*,片断与
+]MEKX载体连接# 然后转化大肠杆菌菌株 CP<’!构
建落叶松YC*,消减文库% 正库构建以无性系=%]"
插穗茎段经(B,处理前和处理后’插穗形成愈伤组
织且有根原基形成’不定根生长初期 ! 个时期的总
N*,等量混合后反转录成 YC*,为 +MKWMU# 以无性
系 %<]! 插穗茎段经(B,处理前和处理后’插穗形成
愈伤组织且有根原基形成’不定根生长初期 ! 个时
期的总N*,等量混合后反转录成 YC*,为 CUH[MU#
反库构建所用 +MKWMU和 CUH[MU为正库构建所用的
+MKWMU和CUH[MU互换%
细菌培养参考,分子克隆实验指南-"萨姆布鲁
克!#$$#$的方法进行% 随机挑取% $$$个克隆!委托
上海生工生物工程技术服务有限公司进行 =i端单
向序列测定%
%1#1=6生物信息学分析6采用 *’B(的 B-,&+软
件对所测序列与 IM4BE4‘ 中的非冗余数据库"4/4]
UMV34VE4WVEWE^EKM!*N$’V^)&+库比对%
%1#1!6半定量d’N分析6选择 7个差异表达基因!
设计特异性引物!落叶松 (]EYWH4 作为内参照物"表
%$% 以落叶松根’茎’叶’插穗茎段经(B,处理前和处
理后’插穗形成愈伤组织且有根原基形成的插穗基
部’不定根生长初期为试验材料!取等量的总N*,为
模板合成第 % 链YC*,!进行N+]d’N分析% 反应体
系为& 模板 % )-!V*+d$1! )-!%$ jd’N反应缓冲液
# )-!上游基因特异引物 $1! )-!下游基因特异引物
$1! )-!酶 $1# )-!d’N级无菌水%<1" )-!合计 #$
)-% 反应循环参数为 7! c预变性 = OH4# 7! c变性
=$ K!<< c退火 =$ K!8# c延伸 =$ K!%9 ;=< 个循环
"不同的基因!循环数不同!但每个基因在所有参试样
品中的循环数是固定的$# 8# c延伸 %$ OH4# ! c保
存% 所有的d’N产物在 %1#:的琼脂糖凝胶上进行
电泳!每个基因至少重复 =次%
表 CD半定量;95.!;上下游引物
9#>ICD.1,J&1’&S7&$0&’7’&4,$’&J,5S7#$*,*#*,<&;95.!;
YC*,66 上游引物 m\KWUMEOdUHOMUK66 下游引物 C/Z4KWUMEOdUHOMUK66 片段大小 &HaMe^*88L:V *88L:W A87L: K8WXL: #K8L: 8#1L: #87L: 8?7L: dMU/_HVEKMFM4M $Y&(,-+ #6结果与分析
ABCD落叶松0QW=消减文库构建
经过总 N*,和 ON*,质量’接头连接效率’
消减效率’阳性率检测表明!各项指标均符合试
验要求% 获得的 )&+大小在 <$$ ^\ 左右!消减
效率明显!阳性率达到 9<:以上% 上述结果表
明!以落叶松扦插生根率存在显著差异的 # 个全
同胞优良无性系为材料成功构建了YC*,消减文
库%
9#
6第 " 期 冯6健等& 落叶松扦插生根过程 &&P文库构建及部分基因的表达分析
ABAD落叶松0QW=消减文库N+9功能分类
在构建的正’反 # 个YC*,消减文库中!随机挑
取各 <$$ 个克隆进行单项序列测定% 对测序结果进
行整理后!正库得到 #8# 个 m4H)&+!反库得到 #!7
个m4H)&+% 将以上获得的 <#% 条序列和 *’B(的
*N库’V^)&+库进行序列比对!正库中有 %"% 条序
列!反库中有 %9# 条序列与数据库中的序列具有同
源性"分值"9$!相似性"89:!同源序列长 %$$ ^以上$% 所获得的 <#% 条序列分别属于不同的类
别!具体统计情况如表 # 所示%
分类结果"表 #$显示!在正库所获得的 #8# 个
m4H)&+中!有同源性的序列中!以信号途径占的比
例最大!达到 %<1$8:!其次是生长发育和抗性相
关!分别达到 %$1"":和 717=:# 无同源序列的
m4H)&+占 =718$:!加上功能尚未确定的序列!占到
所获得 m4H)&+的 !818$:% 在反库所获得的 #!7
个m4H)&+中!有同源性的序列中!新陈代谢类序列
占的比例最大!达到 #"1<%:!其次是信号途径’抗
性相关’生长发育类序列# 无同源序列的m4H)&+占
#91%%:!加上功能尚未确定的序列!占到所获得
m4H)&+的 =91%<:%
表 AD落叶松扦插生根过程差异表达0QW=文库
所获得的\$,N+9分类
9#>IAD9"&’(1*()\$,N+9(>*#,$&4)1(J*"&4,)&1&$*,#-/
&L21&’’&40QW=-,>1#1/ ()3*’14 ,$07*,$%
基因类别
&/UWK/TFM4MK
正库序列个数
m4H)&+H4
\/KHWH[M0H^UEUX
反库序列个数
m4H)&+H4
4MFEWH[M0H^UEUX
新陈代谢 QMWE^/0HKO #< ""
信号途径 &HF4E0\EWLZEXK !% ==
物质运输 +UE4K\/UW %< 8
抗性相关 NMKHKWE4YM #8 #=
生长发育 CM[M0/\OM4WE0\U/YMKKMK #7 #$
亚细胞组成 -/YE0HaEWH/4 < !
功能未知 m4‘4/Z4 \U/WMH4K ## #"
无比对结果 */LHWKT/34V %$9 8$
合计 +/WE0 #8# #!7
ABED激素类基因表达分析
#1=1%6*88:LV基因表达分析6如图 % 所示!*88L:V
基因在根’茎’叶中均表达!叶中表达量最高!茎中表
达量最低% 无论是生根率高的落叶松无性系"=%]"!
-%$还是生根率低的落叶松无性系"%<]!!-#$!(B,
处理后!*88L:V基因表达量均增加% 表明*88L:V 基
因受生长素的调控% 在-% 中!各个时期均有*88L:V
基因表达!且在不定根生长初期表达量较高% 在 -#
中!各个时期均有*88L:V基因表达!但是在插穗不定
根根原基形成和不定根生长初期 # 个时期表达量很
低% 上述结果表明!*88L:V 基因是生长素早期响应
基因!其在落叶松扦插生根过程中可能具有促进不定
根和侧根形成和生长发育的作用%
#1=1#6*88:LW 基因表达分析6如图 % 所示!
*88L:W 基因在根’叶和茎中均表达!茎中表达量高!
叶中表达量最低% (B,处理后!*88L:W 基因在 -#
中表达量明显升高!而在 -% 中表达量升高不明显%
表明*88L:W 基因受生长素的调控!但不同落叶松无
性系间!其表达量变化不同% 在 -# 中!各个时期均
有*88L:W 基因表达!且在 (B,处理后表达量最高%
在-% 中!*88L:W 基因表达均很低% 以上结果表明!
*88L:W 基因是生长素早期响应基因!其在落叶松扦
插生根过程中的作用有待进一步研究%
#1=1=6A87:L基因表达分析6如图 % 所示!
A87L:基因在根’茎’叶中均表达!且表达量无明显
差别% (B,处理后!A87L: 基因表达量在 -% 和 -#
中均增加% 表明A87L:基因受生长素的调控!且为
生长素早期响应基因% 在落叶松扦插生根各个时
期!A87L:基因在-% 中表达量均高于其在 -# 中表
达量% 这一结果表明!A87L: 基因可能具有促进落
叶松插穗形成不定根或侧根的作用%
#1=1!6K8WXL: 基因表达分析6如图 % 所示!
K8WXL:基因在根’茎’叶中均表达!且茎中表达量
高于根和叶中表达量% (B,处理后!K8WXL: 基因在
-# 中表达量变化不明显# 而其在 -% 中表达量明显
增加% 在落叶松扦插生根各个时期!K8WXL: 基因
在-# 中表达量均低于其在-% 中的表达量!并且!在
-% 中!K8WXL:基因在 (B,处理后和不定根根原基
形成 # 个时期表达量高于其他 # 个时期%
#1=1<6#K8L:基因表达分析6如图 % 所示!#K8L:
基因在根’茎’叶中均表达!且茎中表达量高于根和
叶中表达量% (B,处理后! #K8L: 基因表达量在
-% 中无明显变化!在 -# 中有增加的趋势% 在落叶
松扦插生根各个时期!#K8L: 基因在 -# 中表达量
均高于该基因在-% 中表达量%
ABOD信号转导类基因’’’小 :蛋白基因的表达
分析
#1!1%6#87L:基因表达分析6如图 # 所示!#87L:
基因在根’茎’叶中均表达!其中茎中的表达量略高
于根和叶中的表达量% (B,处理后!8#1L: 基因表
达量在-% 和 -# 中均明显增加% 在扦插生根过程
中!该基因在-# 中的表达量均低于其在 -% 中的表
达量% 在-# 中!该基因在根生长初期表达量极低%
在-% 中!该基因在激素处理后和不定根根原基形成
# 个时期的表达量明显高于其他时期% 上述结果表
7#
林 业 科 学 !" 卷6
图 %6*88L:V!*88L:W!A87L:!K8WXL:和#K8L:基因表达模式
gHF5%6+LMM_\UMKKH/4 /T*88L:V!*88L:W!A87L:!K8WXL: E4V #K8L:
%1根# #1叶# =1茎# ! A81*88L:V!*88L:W!A87L:!K8WXL:和#K8L:基因在生根率高的落叶松无性系"=%]"$中不同生根时期的表达#
9 A%%1*88L:V!*88L:W!A87L:!K8WXL:和#K8L:基因在生根率低的落叶松无性系"%<]!$中不同生根时期的表达% !!91插穗# %$ A! O/0.-A% (B,处理的插穗# "!%$1插穗不定根根原基形成# 8!%%1不定根生长初期%
%1N//W# #1-MET# =1&WMO# ! A81+LMM_\UMKKH/4 /T*88L:V!*88L:W!A87L:!K8WXL: E4V #K8L: V3UH4FU//WH4F/T:&’-GY3WH4FZLHYL LEKLHFL UEWM
/TU//WH4F# 9 A%%& +LMM_\UMKKH/4 /T*88L:V!*88L:W!A87L:!K8WXL: E4V #K8L: V3UH4FU//WH4F/T:&’-GY3WH4FZLHYL LEK0/ZUEWM/TU//WH4F5
!!91’3WH4FK# EV[M4WHWH/3KU//W5
明!#87L:基因的表达量可能受生长素的调控% 该
基因在落叶松扦插形成不定根的关键时期表达量较
高!表明其可能参与生长素作用的信号途径%
#1!1#68#1L:基因表达分析6如图 # 所示!8#1L:
基因在根’茎’叶中均表达!且根中的表达量略高于
茎和叶中的表达量% (B,处理后!8#1L: 基因表达
量在-% 和 -# 中均增加!但增加不明显% 在扦插
生根的各个时期!8#1L:基因在-%的不定根生长初
期表达量最低!在不定根根原基形成过程中表达量
最高% 8#1L:基因在-# 中茎段和不定根生长初期
表达量低!在不定根根原基形成过程中为高表达%
在形成愈伤组织且有根原基形成时期!8#1L: 基因
在-% 中表达量明显高于该基因在-# 中表达量% 上
述结果表明!8#1L: 基因表达量是否受生长素的调
控不能确定% 该基因可能具有促进落叶松扦插形成
不定根的作用%
图 #6#87L:! 8#1L:! 8?7L:和dMU/_HVEKM基因表达模式
gHF5#6+LMM_\UMKKH/4 /T#87L:!8#1L:!8?7L: E4V dMU/_HVEKM
%1根# #1叶# =1茎# ! A81#87L:!8#1L:!8?7L: 和 dMU/_HVEKM基因在生根率高的落叶松无性系"=%]"$中不同生根时期的表达# 9 A
%%1#87L:!8#1L:!8?7L:和dMU/_HVEKM基因在生根率低的落叶松无性系"%<]!$中不同生根时期的表达% !!91插穗# -A% (B,处理的插穗# "!%$1插穗不定根根原基形成# 8!%%1不定根生长初期%
%1N//W# #1-MET# =1&WMO# ! A81+LMM_\UMKKH/4 /T#87L:!8#1L:!8?7L: E4V dMU/_HVEKMV3UH4FU//WH4F/T:&’-GY3WH4FZLHYL LEKLHFL UEWM/T
U//WH4F# 9 A%%5+LMM_\UMKKH/4 /T#87L:!8#1L:!8?7L: E4V dMU/_HVEKMV3UH4FU//WH4F/T:&’-GY3WH4FZLHYL LEK0/ZUEWM/TU//WH4F5!!91’3WH4FK#
$=
6第 " 期 冯6健等& 落叶松扦插生根过程 &&P文库构建及部分基因的表达分析
ABPD转运蛋白基因表达分析
如图 # 所示!8?7L: 基因在根’茎’叶中均表
达% (B,处理后!8#1L:基因在 -% 和 -# 中表达量
均无明显变化% 在 -% 和 -# 中!该基因在扦插生根
的各个时期均表达% 不定根根原基形成和根生长初
期!该基因在-# 中的表达量明显低于该基因在 -%
中的表达量% 另外!在不定根根原基形成时期!该基
因表达量明显高于其他时期!表明该基因可能在不
定根形成中发挥作用%
ABUD因伤诱导物质相关基因’’’过氧化物酶基因
表达分析
如图 # 所示!落叶松过氧化物酶基因在根’茎’
叶中均表达!且表达量无明显差别% (B,处理后!落
叶松过氧化物酶基因表达量在 -# 和 -% 中均增加!
但-% 增加量高于-# 增加量% 在落叶松扦插生根的
各个时期!落叶松过氧化物酶基因在-# 中的表达量
均低于该基因在 -% 中的表达量% 在 -% 中!落叶松
过氧化物酶基因在 (B,处理后和不定根根原基形
成 # 个时期表达量明显高于该基因在其他时期的表
达量% 上述结果表明!在落叶松扦插生根的过程中
伴随着大量酶类基因的表达!这些基因的表达产生
大量创伤相关物质!这些物质同外援 (B,共同作
用!在落叶松扦插生根过程中促进不定根或侧根的
形成和生长发育%
=6讨论
构建一个好的差异表达 YC*,文库对起始
ON*,的完整性和纯度要求非常高% 本试验的结果
表明!试验获得的总N*,含量高!完整性好!#9& 与
%9&带型亮度比达到 #p%% ON*,的完整性和纯度
也完全达到文库构建要求% 在本文抑制消减杂交试
验中!从反转录合成YC*,的监控’加接头后的接头
连接效率分析到差减YC*,片段的差减效率分析试
验!都随时监控着各个试验环节!保证最终获得高质
量的差异表达 YC*,文库% 单菌落 d’N扩增电泳
图谱呈现很好的多态性!点杂交试验结果为阳性率
在 9<:以上% 这些结果直接说明获得了高质量的
正’反 # 个差异表达YC*,文库%
通过生物信息学分析!正库获得的 #8# 个
m4H)&+中! 以信号途径占的比例最大! 达到
%<1$8:!其次是生长发育和抗性相关!分别达到
%$1"":和 717=:# 无同源序列的 m4H)&+占
!$19%:!加上功能尚未确定的序列!占到所获得
m4H)&+的 !818$:% 这些结果表明!在落叶松扦插
生根过程中!与生长发育和新陈代谢相关的基因大
量表达!这些基因的表达产生相应的蛋白和信号!最
终促使插穗形成不定根根原基并最终发育成不定
根% 反库获得的 #!7 个m4H)&+中!新陈代谢类序列
占的比例最大!达到 #"1<%:!其次是信号途径’抗
性相关’生长发育类序列# 无同源序列的m4H)&+占
#91%%:!加上功能尚未确定的序列!占到所获得
m4H)&+的 =91%<:# 这些结果表明!在生根能力弱
的落叶松无性系插穗中大量表达新陈代谢类基因%
这些基因的表达会在插穗中产生大量次生代谢物!
这些物质的产生是否影响插穗生根!有待进一步
研究%
EBCD激素相关基因对落叶松扦插生根能力的影响
8.GZ*88基因家族是生长素早期响应基因之
一!该基因的功能获得性突变体在根的生长发育中
表现出生长素敏感性降低!并表现出十分明显的与
生长素相关的发育缺陷!如 &G’WZ-&&[ 突变体
"*EF\E0$,&35!#$$$# SH0K/4 $,&35!%77$$!&G’\Z-&&V[
突变体 "N/3KM$,&35! %779 $ 和 &G’]Z-&&V 突变体
"GE4F$,&35!#$$!$向地性和顶端优势改变!-&&W^ 突
变体"N/FF$,&35!#$$%$和 %3’Z-&&V_ 突变体"g3‘E‘H
$,&35!#$$#$严重的侧根缺陷!%)5WZ-&&\"JH4F$,&35!
%777# &/L $,&35!%777$光形态建成缺陷!=%4WZ-&&V‘
突变体"+EWMOEWK3 $,&35!#$$!$下胚轴向性缺陷% 这
些结果说明!8.GZ*88基因在不定根和侧根生长发
育中发挥重要作用% 本研究通过 N+]d’N结果表
明!在使用 (B,处理后!所获得的 # 个落叶松 8.GZ
*88基因表达量均增加!说明 *88L:V 和 *88L:W 基
因均受生长素的调控!为生长素响应基因% 在 -%
中!在扦插生根的各个时期均有 *88L:V 基因表达!
且均高于其在 -# 中的表达量% 上述结果说明!
*88L:V 基因伴随着落叶松扦插生根的各个过程!其
在落叶松扦插生根过程中具有促进不定根形成和生
长发育的作用% 然而!(B,处理后!*88L:W 基因在
-# 中的表达量明显高于其在 -% 中表达量% 在落叶
松扦插生根的各个过程中!*88L:W 基因在 -% 中表
达量均低于其在-# 中表达量!因此!*88L:W 基因对
不定根和侧根的发生具有促进还是抑制作用有待进
一步探讨%
A87K是一个植物中特有的基因家族!在植物发
育过程中起作用% 在根中首次发现该基因家族成员
是A87V% A87V 在根尖’子叶和叶子中都有表达!
但以根中的表达最为活跃% 通过对 A87V 检测!其
同样具有转录因子的作用% A87V 参与生长素信号
转导途径!过量表达将促进侧根的发生% 同时!
A87V 控制着D?!和 8*#\ 两个生长素相关基因的
%=
林 业 科 学 !" 卷6
表达% 这表明A87V 参与了生长素调控的侧根发生
过程"JH$,&35!#$$$$% 半定量分析表明!本研究中
A87L:基因受生长素的调控% 在扦插生根各个时
期!A87L:基因均在-% 中表达量高于其在 -# 中表
达量% 这表明A87L: 基因可能在落叶松扦插生根
过程中具有促进不定根和侧根生长发育的作用%
上述生长素响应基因的表达分析结果表明!在
落叶松扦插生根过程中伴随着一系列生长素相关基
因的表达% 这些基因的表达最终促进不定根和侧根
的形成与生长发育% 这些生长素响应基因的发现!
从分子水平上证明!生长素在落叶松扦插生根过程
中发挥重要作用% 这一结果同以往从生理角度研究
落叶松扦插生根的结果相一致"敖红等!#$$#$%
赤霉素对根生长发育影响的报道不多!在落叶
松扦插试验中!I,! 促进插穗愈伤组织形成和不定
根产生% 另外!研究表明赤霉素通过减少C)--,蛋
白在细胞核内浓度从而降低 C)--,蛋白的生长抑
制效应% 在赤霉素的合成过程中赤霉素 #$ A氧化
酶发挥重要作用!参与催化多步氧化的过程!使
’#$ AI,K氧化掉 % 个碳原子转化成 ’%7 AI,K% 本
研究结果表明!K8WXL: 基因表达量在 -% 和 -# 中
存在明显差异!且该基因受生长素的影响% (B,处
理后和形成愈伤组织且有根原基形成 # 个时期!
K8WXL:基因在 -% 中表达量明显高于其在 -# 中表
达量% 这些结果表明!生根能力强的落叶松无性系
在扦插生根过程中合成的赤霉素多!相反!生根能力
弱的落叶松无性系在扦插生根过程中合成的赤霉素
少% 另外!本研究还获得 % 个 #K8基因!该基因编
码一种 C)--,蛋白!C)--,蛋白具有抑制植物生
长发育的作用!但是在生长素促进下赤霉素可以减
少C)--,蛋白的浓度!从而降低其对生长发育的抑
制作用% 半定量分析表明!在落叶松扦插生根各个
时期!#K8L: 基因在 -# 中表达量均高于该基因在
-% 中表达量% 在生根能力弱的无性系中!#K8L: 基
因大量表达产生C)--,蛋白!从而抑制落叶松扦插
过程中不定根的生长发育% 而在生根能力强的落叶
松无性系中!一方面 #K8L: 基因表达量低!产生的
C)--,蛋白少!另一方面!大量合成赤霉素降解
C)--,蛋白% 这两方面的综合作用!使得 C)--,
蛋白的抑制生长作用大大降低!从而使插穗具有较
强的生根能力%
EBAD其他基因对落叶松扦插生根能力的影响
=1#1%6小I蛋白对落叶松扦插生根的影响6小 I
蛋白家族成员是单体蛋白!分子质量较小!大约
#$ ;=$ ‘3!为了与异三聚体 I蛋白区别!通常称之
为小I蛋白% 小I蛋白家族成员结构保守!一般包
括 ! 个鸟核苷酸结合区和 % 个效应器分子结合区
"GE4F!#$$#$% 小 I蛋白虽然结构保守!但其功能
却具有多样性% 许多植物特有的信号途径和功能均
需要小I蛋白参与完成% NEK家族在酵母和哺乳动
物中调节细胞分化过程# NL/家族成员调控肌动蛋
白重组过程和参与Q,d激酶的细胞信号转导过程#
NE^家族在膜转运过程中起着重要作用# 而 NE4 家
族在核孔位置调节着蛋白和N*,分子的运输过程%
,UT和 ,UTI)g"F3E4H4M43Y0M/WHVMM_YLE4FMTEYW/U$
对d(*% 的极性定位有很重要的作用% 在调控质膜
和胞质之间的蛋白运输中!d(*% 可能充当了植物激
素的运出载体"IM0V4MU$,&35!#$$%# GE4F!#$$#$%
Nod是植物小I蛋白中参与信号转导的唯一家族%
Nod在调控根毛的发育中起到重要的作用% 通过
对#L!_ 抗体和 K1!Y#L!W 的定位研究表明!Nod
位于拟南芥"8’&;-6/E%-%,)&3-&+&$伸长的根毛尖端%
#L!W 调控了根毛的发生和尖端的生长!拟南芥
#L!W 超表达植株增加了根毛的数量和密度!78Y
’/EW!78Y’/E_ 或78Y’/Ea 能引起根毛尖端各向同性
生长或延长根毛的长度!而 DAY’/EW 则抑制根毛尖
端的生长"BE03K‘E$,&35!#$$$# S3 $,&35!#$$%# 2/4MK
$,&35!#$$## Q/0M4V3‘ $,&35!#$$%# 吕品等!#$$<$%
另外!Nod介导了,B,应答途径的负调控% 拟南芥
DAY’/EW 和78Y’/EW 分别促进和抑制 ,B,抑制的种
子萌发过程% 对某些功能缺失突变体研究表明&
#L!‘ 和#L!VX 是,B,反应的负调控子% #L!‘ 或
#L!VX 突变体中!,B,对种子萌发’变绿以及根生
长的抑制作用都微弱增强了!而#X3!VXZ#X3!‘ 双突
变体显著增强了,B,在这些方面的反应"dMH$,&35!
%779# fLM4F$,&35!#$$#$% Nod除了介导,B,应答
途径的负调控外!还可能调控其他激素的功能和发
育的过程!如转 \]>b78Y’/EW植株表型上类似于生长
素或油菜素内酯过量表达的植株% 与此相反!转
\]>bDAY’/EW植株表型上类似于缺乏生长素或油菜
素内酯的植株% 推测不同的 #L!基因参与不同的
生长素或油菜素内酯反应或积累调控!从而调控植
物的形态建成"-H!#$$%$% 本研究获得的#87L: 基
因在扦插生根率高的落叶松无性系扦插生根的各个
时期均有表达!且在生长素处理后和形成愈伤组织
且有根原基形成时期表达量高于其他时期% 同时!
与-# 相比!该基因表达量在 -% 的扦插生根各个时
期表达量均较高% 这些结果表明!该基因可能在落
叶松扦插生根过程中具有促进不定根发生发育的作
用% 因该基因在生长素处理后表达量明显增加!其
#=
6第 " 期 冯6健等& 落叶松扦插生根过程 &&P文库构建及部分基因的表达分析
作用机制可能参与生长素的信号转导途径% 本研究
获得的8#1L:基因在落叶松扦插最关键的不定根
根原基形成时期表达量最高!且该基因在-% 中表达
量明显高于其在-# 中的表达量% 表明该基因在落
叶松扦插形成不定根过程中具有促进不定根形成的
作用% 其作用机制有待进一步探讨% 可以肯定的是
在落叶松扦插形成不定根’侧根和根毛过程中!小I
蛋白具有一定的促进作用%
=1#1#6转运蛋白对落叶松扦插生根能力的影响6
自然界生物体中普遍存在着 # 大家族的初级和次级
转运体& ,+d结合盒式蛋白 ",+d]^H4VH4FYEKKMWM
WUE4K\/UWMU!,B’$转运体超家族和主要易化转运体
"OEh/UTEYH0HWEW/UK3\MUTEOH0X! Qg&$超家族% ,B’家
族主要是初级主动转运体!通过 ,+d水解释放能量
而运输大小分子化合物!包括离子’氨基酸’核苷酸’
多糖’多肽甚至蛋白质等% ,B’蛋白除了运输环境
胁迫过程中积累的细胞毒素物质到细胞质中以外!
还参与调控植物体内的离子运输和植物的生长过
程% 在拟南芥中!由 8,F#!] 编码的 ,B’转运蛋白
是有机阳离子的运载体!主要在植物的维管束核表
皮表达!此基因的缺失!引起根生长减慢!侧根增加!
生长素含量升高!由此认为 8,F#!] 可能为生长素
结合运输载体"*HY/0E$,&35!#$$%$% 在落叶松扦插
生根的各个时期!-% 中 8?7L: 基因的表达量均明
显高于-# 中该基因的表达量% 在 -% 中!8?7L: 基
因在不定根根原基形成时期表达量特别高% 这表
明!8?7L: 基因的表达量同落叶松扦插形成不定根
或侧根的能力成一定的正相关% 其在落叶松扦插形
成不定根和侧根的过程中可能具有促进作用%
=1#1=6创伤相关物质对落叶松扦插生根能力的影
响6植物在受到创伤时!会产生一些与伤害有关的
物质及代谢酶类!如葡聚糖酶’过氧化物酶’磷脂酶
和脂氧化酶等% 国内外很多研究表明!一些种类的
酶与不定根的发生有关% &aE^/0YK等"#$$#$测定了
马缨丹":&+,&+& (&=&’&$’南美天芥菜"H$3-/,’/E-.=
&’;/’$%($+%$’斯托卡蜡菊"H$3-()’5%.=%,/$()&%$扦插
生根过程中的过氧化物酶"\MU/_HVEKM$的动态变化!
生根快的马缨丹和南美天芥菜比生根慢的斯托卡蜡
菊插穗上所有器官内的过氧化物酶活性都要高 %$
倍% 所有插穗上叶片内过氧化物酶活性在生根前均
缓慢下降!过氧化物酶活性自顶部向基部逐渐升高!
在插穗基部愈伤组织形成的过程中达到最高水平%
而最显著的变化是在扦插 8 天后!马缨丹和南美天
芥菜基部的过氧化物酶活性都升高 < 倍!而斯托卡
蜡菊则升高 #$ 倍!不定根发生后!过氧化物酶活性
降低!最终恢复至样本的初始水平% 因此!&aE^/0YK
等"#$$#$认为不定根发生过程中的过氧化物酶活
性与植物生根能力密切相关% 通过测定黑杨
"!/E.3.%+-4’&$’银白杨"!/E.3.%&3;&$’欧洲山杨
"!/E.3.%,’$=.3&$在扦插生根过程中过氧化物酶和
(,,氧化酶活性的动态变化!发现尽管 = 个树种的
插穗生根能力不同!但在根发生或根原基形成过程
中!过氧化物酶活性均上升!没有发现过氧化物酶活
性和生根能力有显著的相关性!因此认为过氧化物
酶活性不影响插穗生根能力和生根率!但对细胞分
裂起作用" &aE^/0YK$,&35!#$$## +/LHW!#$$$# -H3 $,
&35!#$$=# 张肪等!#$$"$% 本研究结果表明! (B,处
理后!落叶松过氧化物酶基因在 -% 和 -# 中的表达
量均升高% 但是该基因的表达量是否跟生长素处理
有关!仍无法确定% 本研究生长素处理后材料是
(B,处理至少 " L后取材的!在这段时间里!由于插
穗已造成切口!因此与产生因伤诱导物质相关的基
因已开始表达% 在落叶松扦插生根各个时期!过氧
化物酶基因在 -% 中表达量均高于其在 -# 中表达
量% 在-% 中!过氧化物酶基因在生长素处理后和不
定根根原基形成 # 个时期的表达量明显高于其他时
期该基因的表达量% 这些结果说明!该基因的表达
量与落叶松生根能力存在正相关!且在落叶松扦插
生根的关键时期表达量增高% 据此表明!落叶松过
氧化物酶基因可能有促进落叶松扦插形成不定根和
侧根的作用%
参 考 文 献
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杜继煜! 白6岩! 白宝璋5#$$!5植物的插条繁殖生理5农业与技
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黄卓烈! 李6明! 谭绍满!等5#$$#5萘乙酸处理桉树插条后过氧化
物酶活性及其同工酶变化与插条生根的关系研究5植物研究!
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Q/0M4V3‘ 2! BHKYL/Tg!NEhM4VUE‘3OEU’& .!$,&35#$$%58’&;-6/E%-%
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A!9$5
N/3KMC! QEY‘EXd! &WHU4^MUFd! $,&35%7795’LE4FMKH4 E3_H4
UMK\/4KMTU/OO3WEWH/4 H4 E48JCZ*88FM4M5&YHM4YM! #87& %=8% A
%=8=5
&Y/W2UC-!’0EU‘ ’S!CMEL0D-!$,&35%7795(K/0EWH/4 /TT34YWH/4E0
N*,TU/O\MUHVMUOWHKK3M/T\/WEW/W3^MUKE4V KZMMW\/WEW/KW/UEFM
U//WK5d0E4WQ/0MY30EUBH/0/FXNM\/UWMU! %"& = A95
&/L Q&! P/4F& P! DHOB’! $,&35%7775NMF30EWH/4 /T^/WL 0HFLW]
E4V E3_H4]OMVHEWMV VM[M0/\OM4W^XWLM8’&;-6/E%-%*88\Z>HcW
FM4M52/3U4E0/Td0E4WBH/0/FX! !#& #=7 A#!"5
&aE^/0YKg! ,4VUMEQ! )[E& B5#$$#5’LE4FM/T\MU/_HVEKMM4aXOM
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&aMFMVHM4KHK! !""=e!$& #7 A=%5
+EWMOEWK3 D! D3OEFEH&! Q3W/P! $,&35#$$!5F8>>JKJW M4Y/VMK
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WLMWUE4KYUH\WH/4E0EYWH[EW/U*dP!e,Ng8 W/UMF30EWMVHTMUM4WHE0
FU/ZWL UMK\/4KMK/TLX\/Y/WX0KE4V T/UOEWH/4 /T0EWMUE0U//WKH4
8’&;-6/E%-%,)&3-&+&"d0E4W’M0! %" & =87 A=7=5
+/LHWI5#$$$5dMU/_HVEKME4V (,,]o_HVEKMEYWH[HWHMKV3UH4FU//WH4FH4
Y3WH4FK/TWLUMM\/\0EUK\MYHMK5+3U‘ 2B/W! #!& 78 A%$%5
SH0K/4 ,D!dHY‘MWgB!+3U4MU2’!$,&35%77$5,V/OH4E4WO3WEWH/4
H4 8’&;-6/E%-%Y/4TMUKUMKHKWE4YMW/E3_H4! MWLX0M4M! E4V E^KYHKHY
EYHV5Q/0MY30EUE4V IM4MUE0IM4MWHYK! ###& =88 A=9=5
S3 I3E4F! I3 GH4F! -H&L34VEH! $,&35#$$%5,FM4/OM]ZHVME4E0XKHK
/T8’&;-6/E%-%N/\]H4WMUEYWH[M’N(BO/WHT]Y/4WEH4H4F\U/WMH4KWLEW
EYWEKN/\ I+dEKMWEUFMWK5d0E4W’M0! %=& #9!% A#9<"5
GE4F@! -MM&! &/2P! $,&35#$$!5+LM(,,% \U/WMH4 HKM4Y/VMV ^X
8C#< E4V HKEK3^KWUEWM/T&’g+(N(5d0E4W2!!$ & 88# A89#5
GE4FfLM4^HE/5#$$#5&OE0I+dEKM& [MUKEWH0MKHF4E0H4FKZHWYLMKH4
\0E4WK5+LMd0E4W’M0! %!& =8< A=995
fLM4Ff-!*ETHKHQ!+EO,! $,&35#$$#5d0EKOEOMO^UE4M]EKK/YHEWMV
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UMK\/4KMKH4 8’&;-6/E%-%5d0E4W’M0! %!& #898 A#8785
!责任编辑6徐6红"
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