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DNA POLYMORPHISM AND HETEROZYGOSITY IN SEVEN PARENTAL EUCALYPT CLONES AS REVEALED BY RAPD MARKERS

7个桉树杂交亲本RAPD位点多态性和杂合性的研究(英文)


利用RAPD分子标记技术对桉树杂交亲本的RAPD位点多态性和杂合性进行了比较研究。研究材料包括不同起源的3个尾叶桉母本和4个细叶桉父本及其杂交产生的5个全同胞家系,每家系10株子代。RAPD为显性标记,其检测一个杂交群体中分离位点的概率可以用分离位点至少在一个个体中出现的概率来表示,即1-(1/2 )n - 1(Aa×aaaa×Aa)或1 -(3/4)n - 1(Aa×Aa) (n为群体内个体数) ,则利用10个个体的杂交群体,其概率分别为99.8%和92.5% ,检测的有效性较高。各样品RAPD扩增结果统计中,以1代表一条谱带出现,以0代表不出现。9个随机引物共扩增出58条谱带,亲本间呈多态性的谱带42条,占72.4% ,多态性较高。利用亲本的RAPD数据矩阵,计算了亲本间的遗传距离。根据亲本出现的谱带在子代中是否分离判断该位点是否为杂合位点,如果某谱带出现于亲本且在子代中分离,则亲本在该位点上的基因型为Aa,即杂合位点,从而统计出不同亲本的杂合位点数。以亲本的杂合位点数占其总位点数的百分比表示亲本的杂合性,检测各亲本的杂合性水平。7个亲本的杂合性平均为28.0% ,杂合性较高。但不同亲本的杂合性有差异,介于16.2%和39.5%之间。并且,同一无性系在不同的家系中检测到的杂合位点数和计算的杂合性有差异,这主要是由于以下两个原因;一是RAPD为显性标记技术,不能有效探测样品本身的杂合位点,因此当另一亲本在该位点上基因型为AA时,则亲本的基因型即使为Aa,子代在该位点上的RAPD谱带也没有分离;二是10个个体的群体偏小,有些实际分离的位点需要更大的群体才能检测到(尤其是偏分离的位点)。林木中,常用F1 谱系和显性标记进行遗传连锁图谱构建,相应的作图策略为拟测交策略(Pseudo-testcross strategy) ,即可用于图谱构建的标记为只出现于一个亲本、而在子代中按1∶1分离的标记,类似于测交的分离方式。因此,亲本的较高杂合性表明其杂交时有大量的拟测交位点出现,这种位点在子代中的分离可以用显性标记有效检测。所以,本研究中亲本杂合性均较高的家系可以用作遗传图谱构建的材料(合适大小的群体,如100个以上的子代) ,这对增加图谱的标记数量和提高作图的效率具有重要意义。

Five controlled crosses of Eucalyptus urophylla S.T.Blake×E.tereticornis Smith were used for RAPD analysis on DNA polymorphism and heterozygosity of the seven parental clones.A total of 58 fragments were amplified with 9 single arbitrarily chosen primers,and 42 fragments(72.4%) were scored as polymorphic among the parents.The genetic distance (GD) between parents was calculated with RAPD data matrix.High levels of heterozygosity were revealed in the parents studied,with an average 28.0%,but the percentage of heterozygous loci varied with parent from 16.2% to 39.5%.The implications for material selection in genetic linkage map construction were discussed.


全 文 :第 v|卷 第 u期
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林 业 科 学
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k中国林业科学研究院热带林业研究所 广州 xtsxusl
施季森ul
k南京林业大学林木遗传与基因工程实验室 南京 utssvzl
摘 要 } 利用 • „°⁄分子标记技术对桉树杂交亲本的 • „°⁄位点多态性和杂合性进行了比较研究 ∀研究材
料包括不同起源的 v个尾叶桉母本和 w个细叶桉父本及其杂交产生的 x个全同胞家系 o每家系 ts株子代 ∀
• „°⁄为显性标记 o其检测一个杂交群体中分离位点的概率可以用分离位点至少在一个个体中出现的概率来
表示 o即 t p ktΠulν p tkΑα ≅ αα或 αα ≅ Ααl或 t p kvΠwlν p tk Αα ≅ Ααlk ν为群体内个体数l o则利用 ts个个体的
杂交群体 o其概率分别为 ||1{ h和 |u1x h o检测的有效性较高 ∀各样品 • „°⁄扩增结果统计中 o以 t代表一条
谱带出现 o以 s代表不出现 ∀|个随机引物共扩增出 x{条谱带 o亲本间呈多态性的谱带 wu条 o占 zu1w h o多态
性较高 ∀利用亲本的 • „°⁄数据矩阵 o计算了亲本间的遗传距离 ∀根据亲本出现的谱带在子代中是否分离判
断该位点是否为杂合位点 o如果某谱带出现于亲本且在子代中分离 o则亲本在该位点上的基因型为 Ααo即杂
合位点 o从而统计出不同亲本的杂合位点数 ∀以亲本的杂合位点数占其总位点数的百分比表示亲本的杂合
性 o检测各亲本的杂合性水平 ∀z个亲本的杂合性平均为 u{1s h o杂合性较高 ∀但不同亲本的杂合性有差异 o
介于 ty1u h和 v|1x h之间 ∀并且 o同一无性系在不同的家系中检测到的杂合位点数和计算的杂合性有差异 o
这主要是由于以下两个原因 ~一是 • „°⁄为显性标记技术 o不能有效探测样品本身的杂合位点 o因此当另一亲
本在该位点上基因型为 ΑΑ时 o则亲本的基因型即使为 Αα o子代在该位点上的 • „°⁄谱带也没有分离 ~二是 ts
个个体的群体偏小 o有些实际分离的位点需要更大的群体才能检测到k尤其是偏分离的位点l ∀林木中 o常用
ƒt 谱系和显性标记进行遗传连锁图谱构建 o相应的作图策略为拟测交策略k°¶¨∏§²2·¨¶·¦µ²¶¶¶·µ¤·¨ª¼l o即可用于
图谱构建的标记为只出现于一个亲本 !而在子代中按 tΒt分离的标记 o类似于测交的分离方式 ∀因此 o亲本的
较高杂合性表明其杂交时有大量的拟测交位点出现 o这种位点在子代中的分离可以用显性标记有效检测 ∀所
以 o本研究中亲本杂合性均较高的家系可以用作遗传图谱构建的材料k合适大小的群体 o如 tss个以上的子
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关键词 } • „°⁄o多态性 o杂合性 o桉树
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基金项目 }国家自然科学基金项目kv|{zsyt|l和国际科学基金项目kŒ±·¨µ±¤·¬²±¤¯ ƒ²∏±§¤·¬²±©²µ≥¦¬¨±¦¨ oŒƒ≥lk⁄Πu|wz2tl ∀
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wyt 林 业 科 学 v|卷
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212 Ηετεροζψγοσιτψτεστσ οφ σεϖεν παρεντσ
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Ταβ .3 Νει. σ γενετιχ διστανχε βετωεεν τηε σεϖεν παρεντσ
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Ταβ .4 Παρενταλ ϖαριατιονσ οφ ηετεροζψγουσ Ρ ΑΠ∆σιν φιϖεφαµιλιεστεστεδ
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xyt 第 u期 甘四明等 }z个桉树杂交亲本 • „°⁄位点多态性和杂合性的研究
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Ρεφερενχεσ
甘四明 o施季森 o白嘉雨等 1林木分子标记研究进展 1 林业科学研究 ot||{ ott }wu{ ∗ wvw
甘四明 o施季森 o白嘉雨 1Œ§¤«² •¤³¬§¦¼¦¯ µ¨°≤• 仪上用薄壁管进行 • „°⁄扩增的程序优化 1 南京林业大学学报 ousss ouw }uz ∗ vt
甘四明 o施季森 o白嘉雨等 1尾叶桉和细叶桉无性系的 • „°⁄指纹图谱构建 1 南京林业大学学报 ot||| ouv }tt ∗ tw
徐建民 o白嘉雨 o甘四明 1 尾叶桉家系综合选择的研究 1 林业科学研究 ot||y o| }xyt ∗ xyz
吴坤明 o吴菊英 o徐建民等 1桉树种间杂种优势和优良杂种的评选 1 广东林业科技 ot||y otu }t ∗ x
≤¤µ¯¶²± ∞o×∏¯¶¬¨µ¤° Žo¤±§ Š¯¤∏¥¬·½≤ ετ αλq≥ ª¨µ¨ª¤·¬²± ²©µ¤±§²° ¤°³¯¬©¬¨§⁄‘„ °¤µ®¨µ¶¬± ƒt ³µ²ª¨ ±¼ ²©¦²±¬©¨µ¶q׫¨ ²µ„³³¯ Š¨ ±¨ ·ot||t o{v }
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Šµ¤·¤³¤ª¯¬¤ ⁄¤±§≥¨ §¨µ²©© • qŠ¨ ±¨ ·¬¦ ¬¯±®¤ª¨ °¤³¶²© Ευχαλψπτυσ γρανδι󤱧 Ευχαλψπτυσ υροπηψλλα ∏¶¬±ª¤³¶¨∏§²2·¨¶·¦µ²¶¶°¤³³¬±ª¶·µ¤·¨ª¼ ¤±§ • „°⁄
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¬±ª¤±§ Š¨ ±¨ ·¬¦• ¶¨²∏µ¦¨¶q≥¬±¤¨ ∏µ„¶¶²¦¬¤·¬²± ¤¶¶¤¦«∏¶¨·¶ot||s }wv ∗ yv
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