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龙眼钙依赖蛋白激酶(CDPKs)基因的克隆及表达分析



全 文 :园 艺 学 报 2011,38(增刊):2506 http: // www. ahs. ac. cn
Acta Horticulturae Sinica E-mail: yuanyixuebao@126.com

收稿日期:2011–07–25
基金项目:国家科技支撑计划项目(2008BADB8B01,2008BADB8B02);广西自然科学基金项目(2011GXNSFA018115);广西高等
学校优秀人才资助计划项目(桂教人 201065)
* 通信作者(E-mail:chenhubeijing-2008@163.com;Tel:0771-3270184)
龙眼钙依赖蛋白激酶(CDPKs)基因的克隆及
表达分析
陈 虎 1,何新华 1,2,*,罗 聪 1,邓立宝 1,胡 颖 1
(1广西大学农学院,南宁 530004;2广西作物遗传改良生物技术重点实验室,南宁 530007)
龙眼喜温忌冻,寒害和冻害常给其生产带来严重损失。钙离子被认为是植物细胞内重要的第二
信使,在各种外部环境胁迫刺激下,Ca2+浓度会发生相应的变化并诱导下游基因表达和蛋白质磷酸
化方式的改变,从而实现对环境胁迫的应答。其中,钙依赖蛋白激酶(CDPKs)是钙离子信号传递
途径中一类重要感受器,在调控自身对外界环境的适应性中发挥重要作用。本研究中以石硖龙眼为
试材,从蛋白质和转录水平对 CDPKs基因的功能进行研究,为深入探讨龙眼 CDPKs基因功能及其与
抗寒的关系奠定基础。
选用盆栽一年生石硖龙眼嫁接苗为材料,分别在 4 ℃下处理 0(对照)、2、4、8、12、24、48
和 72 h,采集样品保存于–80 ℃冰箱备用。龙眼叶片双向凝胶电泳参考游向荣的方法。利用 SDS
法提取总 RNA,cDNA合成按说明书进行。根据罗聪等的方法扩增基因全长。利用相关软件对 CDPKs
基因生物信息学进行分析。荧光定量 PCR采用染料法,按照 2-ΔΔCT法计算出基因相对表达水平。
采用 17 cm IPG干胶条(pH 4 ~ 7)对龙眼叶片低温胁迫蛋白质进行 IEF-SDS-PAGE分离,从质
谱鉴定出 30个蛋白点,发现 CDPKs蛋白在低温胁迫表现为下调。利用 RACE 技术克隆龙眼 CDPKs
基因的全长 cDNA,长度为 1 971 bp,包括 1个 1 605 bp的开放阅读框,编码 535个氨基酸序列。
预测龙眼 CDPKs 基因所编码的氨基酸序列的等电点为 7.68,蛋白质分子量为 60.97 kD;该基因不
含信号肽,属于膜蛋白,亚细胞定位在细胞质、叶绿体和液泡中。其蛋白质功能结构域分析显示:
有两个 cAMP-和 cGMP-CDPKs 磷酸化位点,1 个典型的蛋白激酶结构域,12 个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸
化位点,3 个 N–肉豆蔻酰化位点,9 个蛋白激酶 C 磷酸化位点,1 个典型的丝氨酸/苏氨酸蛋白激
酶结构域,4个保守的 EF手型结构。同源性分析表明,龙眼 CDPKs基因与 11种不同植物中的 CDPKs
基因氨基酸序列同源性高达 89% ~ 93%,说明 CDPKs基因在进化过程中相当保守。龙眼 CDPKs基
因在根、茎、叶中都有表达,为组成型表达,并发现该基因在蛋白水平和转录水平表达结果相一致。
72 h 内低温胁迫下间隔采样的荧光定量分析结果显示,随着低温胁迫时间的延长,龙眼不同组织
CDPKs 相对表达量都表现出下降趋势,并在低温胁迫 24 h 达到最小值,之后出现小幅度的上升。
荧光定量结果也进一步验证了 CDPKs基因与响应冷胁迫之间的相关性。

关键词:龙眼;低温胁迫;CDPKs;克隆;表达
中图分类号:S 667.2 文献标识码:A 文章编号:0513-353X(2011)S-2506-01