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应用SCoT分子标记分析73份杧果资源的遗传多样性



全 文 :园 艺 学 报 , (增刊): 2011 38 2511 http: // www. ahs. ac. cn
Acta Horticulturae Sinica E-mail: yuanyixuebao@126.com

收稿日期:2011–07–25
基金项目:广西自然科学基金项目(2011GXNSFA018115);广西高等学校优秀人才资助计划项目(桂教人 201065);广西教育厅研
究生创新基金项目(105931001011)
* 通信作者(E-mail:22003luocong@163.com;Tel:0771-3270184)
应用SCoT分子标记分析 73 份杧果资源的遗传
多样性
罗 聪1,何新华1,2,*,陈 虎1,胡 颖1,欧世金1
(1广西大学农学院,南宁 530004;2广西作物遗传改良生物技术重点实验室,南宁 530007)
杧果栽培历史悠久,品种繁多,仅印度就有 1 000多个品种,我国约有 200多个品种或品系。
由于杧果是开放性授粉的植物,许多品种都是通过实生苗繁殖和芽变选种获得,许多资源缺乏相应
的文字记录,并且由于存在饰变和观察标准不同,导致同物异名、同名异物的现象严重。SCoT 分
子标记是一种基于翻译起始位点的目的基因标记新技术,具有操作简单,重复性好等特点,目前已
经成功应用于水稻、花生、杧果、龙眼、柑橘、柿等物种的遗传研究。
供试材料采集于广西百色国家农业科技园区、广西农业科学院、广西大学杧果资源圃和广西亚
热带作物研究所。杧果品种来自于 12个国家和地区,其中中国 37份,中国台湾 9份,泰国 8份,
越南 5份,印度 4份,美国 2份,澳大利亚 2份,菲津宾 2份,斯里兰卡 1份,印度尼西亚 1份,
缅甸 1份,古巴 1份,共 73份资源。选取生长健壮,无病虫害植株的叶片,采用改良的CTAB法提
取DNA,共用 34条SCoT分子标记引物对其进行多样性分析。
试验结果表明,34条 SCoT分子标记引物共扩增出 273条带,其中多态性条带 201条,多态性
为 73.63%。引物 SCoT39扩增出 7条带,而 7条带均为多态性条带,多态性比率为 100%,引物 SCoT34
和 SCoT70均扩增出 15条带,其多态性条达分别为 13和 14条,多态性比率分别为 86.67%和 93.33%。
仁面杧和红花杧相似系数最高达 94.18%,而夏矛香杧和印度 15号相似系数最低为 66.18%。利用 SM
相似系数和 UPGMA 法进行聚类,结果显示,来自印度的 3 个品种印度 4 号、印度 7 号和印度 15
号单独聚为一类,与其他品种相距最远,形成一个外类群,其他杧果品种以相似系数 0.78分为 3大
类,第一大类为中国内陆品种和大部分东南亚品种;第二类主要为土杧类品种;第三类全部为中国
台湾、美国和澳大利亚品种。聚类结果显示,中国内陆的杧果品种与泰国、越南等东南亚国家的杧
果品种亲缘关系较近而聚类到一起,说明东南亚区域内杧果种质资源交流密切,而我国许多杧果新
品种的母本或父本也源于这些区域。源于中国台湾、美国和澳大利亚的杧果品种单独聚类到一起,
说明其亲缘关系较近,符合中国台湾的许多杧果品种的亲本来自于美国的事实。试验结果表明,SCoT
分子标记是一种非常有效的用于杧果遗传多样性分析的标记方法,能够很好地体现杧果品种之间的
亲缘关系。本研究的结果可为我国杧果种质资源的收集保护和有效利用提供参考。

关键词:杧果;SCoT分子标记;遗传多样性;分析
中图分类号:S 667.7 文献标识码:A 文章编号:0513-353X(2011)S-2511-01