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Cloning and Expression Dynamics of NCED and CYP707A Genes from Zoysia japonica Seeds

结缕草种子中NCED基因和CYP707A基因的克隆及其表达动态



全 文 :第20卷 第1期
 Vol.20  No.1
草 地 学 报
ACTA AGRESTIA SINICA
   2012年  1月
  Jan.  2012
结缕草种子中NCED基因和CYP707A基因
的克隆及其表达动态
迟晓雪1,孙洁峰2,方 程1*
(1.中国农业大学草地研究所,北京 100193;2.青岛海源草坪有限公司,山东 青岛 266318)
摘要:ABA是抑制种子萌发的主要激素,而9-顺式-环氧类胡萝卜素双加氧酶(NCED)和8’-羟化酶(CYP707A)是
控制ABA合成及代谢的关键基因。为了解基因表达水平与种子萌发率之间的关系,以2种萌发率不同的结缕草
(Zoysia japonica)海青一号(H1)和野生型(WT)结缕草种子为材料,克隆CYP707A基因目的片段,通过Real-time
PCR测定2种结缕草种子在不同吸胀时间的NCED和CYP707A基因表达水平。结果表明:NCED和CYP707A
基因在不同吸胀时间和不同材料中基因表达水平不同,在萌发率较高的海青一号(H1)种子吸胀过程中,NCED基
因和CYP707A基因表达持续升高,在萌发率较低的野生型(WT)结缕草种子吸胀过程中NCED和CYP707A基因
表达量先升高,随后又降低到较低水平,NCED基因和CYP707A基因在萌发率不同的2种结缕草种子吸胀过程中
的表达存在差异,说明种子的萌发率不仅与ABA含量有关,还与ABA代谢速率有关,体现两者在影响种子萌发率
过程中相互协作,相互平衡的关系。
关键词:结缕草;NCED基因;CYP707A基因;基因克隆;表达水平
中图分类号:Q943.2    文献标识码:A     文章编号:1007-0435(2012)01-0146-07
Cloning and Expression Dynamics of NCEDand CYP707AGenes
fromZoysia japonica Seeds
CHI Xiao-xue1,SUN Jie-feng2,FANG Cheng1*
(1.Institute of Grassland Science,China Agricultural University,Beijing 100193,China;
2.Haiyuan Turf Ltd,Qingdao,Shandong Province 266318,China)
Abstract:ABA is a major plant hormone inhibiting seed germination.Both 9-cis-epoxycarotenoid dioxygen-
ase(NCED)and ABA 8’-hydroxylase(CYP707A)are key genes involved in the biosynthesis and degrada-
tion processes of ABA.Correlation of seed germination rate and these two genes has been reported in many
plant species,but few in herbage seeds.Two herbage seeds fromZoysia japonica-Haiqing1(H1)and wild
type(WT)were used to study the relationship between seed germination rate and the expressions of these
two genes.The gene CYP707Awas cloned and the expression of both NCEDand CYP707Ain different
materials under different imbibition regimes were determined through Real-time PCR.Both NCEDand
CYP707Ahad a continuous increasing trend in H1with seed imbibition processing and had a relatively
higher germination rate.However,the expressions of these two genes in WT with seed imbibition process-
ing showed an increasing trend during the first 2hours of imbibition then dropped to a very low level.The
expression variances of these two genes suggest that there was a mutual coordination and balance relation-
ship between ABA biosynthesis and degradation during seed germination.
Key words:Zoysia japonica;NCED;CYP707A;Gene clone;Expression
  种子的萌发是由基因本身决定的,同时也受环
境因素的影响。乙烯、赤霉素(GA)能诱导种子萌
发,脱落酸(ABA)则抑制萌发[1]。在高等植物中,
ABA的合成主要通过C40间接途径,ABA在9-顺
式-环氧类胡萝卜素双加氧酶(NCED)催化下可生
成8’-羟基ABA,9-顺式-环氧类胡萝素双加氧酶是催
收稿日期:2011-03-17;修回日期:2011-10-20
基金项目:国家自然科学基金(30972137)资助
作者简介:迟晓雪(1986-),女,内蒙古扎兰屯人,硕士,研究方向为牧草分子技术,E-mail:chixiaoxue.333@163.com;*通信作者 Author
for correspondence,E-mail:fangcheng@cau.edu.cn
第1期 迟晓雪等:结缕草种子中NCED基因和CYP707A基因的克隆及其表达动态
化有生物活性脱落酸合成的关键酶[2~10]。ABA失活
代谢途径主要分为8’-甲基羟基化代谢途径、7’-羟基
化代谢途径和ABA酯化降解途径,其中通过8’-羟化
酶分解ABA产生红花菜豆酸(phaseic acid,PA)和二
氢红花菜豆酸(dehydrophaseic acid,DPA)是主要的代
谢途径[11~16]。Shigeki Saito等[15]克隆拟南芥(Arabi-
dopsis thaliana)中的CYP707A家族基因中的4个基
因,并证明了CYP707基因是编码ABA 8’-羟化酶的
关键基因。9-顺式-环氧类胡萝卜素双加氧酶最早从
玉米(Zea mays)ABA缺失突变体vp14中发现,之后
相继从菜豆(Phaseolus vulgaris)、鳄梨(Persea ameri-
cana)和拟南芥等植物中克隆到[12~14]。Sonia Ali-
Rachedi等[17]用拟南芥的休眠型为材料,证明 ABA
含量与种子的萌发率之间成负相关,但萌发率并不是
由单一激素决定的,是与GA协同作用的结果。9-顺
式-环氧类胡萝卜素双加氧酶在转基因植物中的过量
表达能增加ABA的含量[18]。ABA在植物中的含量
是由9-顺式-环氧类胡萝卜素双加氧酶(NCED)和
ABA 8’-羟化酶(CYP707A)共同决定的。9-顺式-环
氧类胡萝卜素双加氧酶(NCED)和 ABA 8’-羟化酶
(CYP707A)在种子吸胀过程中的表达与种子萌发率
的关系在拟南芥、大麦(Hordeum vulgare)等植物中
已有研究[19]。
结缕草(Zoysia japonica)是禾本科结缕草属草
本植物,具有抗旱性强、适应性广,耐磨性和耐践踏
性强、弹性高等特性,被广泛应用于草坪建植、生态
恢复、水土保持和优良饲料等方面[20]。然而结缕草
种子在未经处理的情况下发芽率较低,周期较长,导
致幼苗参差不齐,严重影响了草坪的美观及使用效
率[21,22]。近年来,国内外一些研究人员对结缕草休
眠较深的原因以及打破休眠促进萌发的方法进行了
大量研究,但多为生理及物理方面的研究[23~25],对
分子水平的研究相对较少。本试验采用发芽率不同
的2种结缕草海青1号(H1)和野生型(WT)为试验
材料,克隆控制 ABA降解的CYP707A 基因,通过
荧光定量PCR测得NCED 和CYP707A基因在种
子吸胀过程中表达动态及差异,为从分子水平探究
造成2种结缕草种子萌发率存在差异的原因提供基
础依据。
1 材料与方法
1.1 试验材料与试剂
试验材料为海青1号(H1)和野生型(WT)结缕
草种子,于2010年7月采自青岛海源草坪结缕草种
子繁殖基地,带回中国农业大学草地研究所低温保
存备用。
RNA提取试剂盒,反转录试剂盒,琼脂糖凝胶
回收试剂盒购于北京百泰克生物技术有限公司,所
用的大肠杆菌DH5a菌株,质粒提取试剂盒,克隆载
体pMD-19T,固相RNAase清除剂、感受态细胞、荧
光定量PCR试剂盒均购自于北京天泽基因生物试
剂公司。
1.2 试验方法
1.2.1 发芽试验 海青一号(H1)和野生型(WT)
结缕草种子以及去除颖苞的海青一号(H1)和野生
型(WT)种子共4种材料,每个培养皿中100粒种
子,每种材料3个重复,在光照培养箱中进行发芽计
数,发芽的条件为25℃和35℃交替,35℃8h,25℃
16h。
1.2.2 CYP707A 基因目的片段的克隆 分别取
0.3g野生型(WT)和海青一号(H1)结缕草种子液
氮研磨后按RNA提取试剂盒说明提取RNA,反转
录成cDNA,以此cDNA 为模板,引物(Forward:
5-TGAATGTGGCATTGCTGTCC-3;Reverse:5-
ACGTTGTCGGCGATCTGG-3)扩增CYP707A基
因目的片段。引物通过分析其他植物(大麦、水稻
(Oryza sativa)、玉米)CYP707A 基因保守区域,然
后用Primer premier 5软件设计。PCR反应条件为
94℃,3min;94℃,15s;60℃,15s;72℃,25s;30个
循环;72℃,10min。PCR产物切胶回收后转移到
PMD19T载体中,16℃连接过夜,再转化到大肠杆
菌DH5α中,平板培养后挑取阳性克隆,扩增后菌液
送至三博生物科技有限公司测序。
1.2.3 多序列比对 用DNAMAN软件的多序列
比对功能,分析克隆得到结缕草中的CYP707A 目
的片段序列与大麦、水稻、玉米保守区域的同源性。
1.2.4 荧光定量PCR 海青一号(H1)与野生型
(WT)结缕草种子去除颖苞后分别进行吸胀处理
0h,2h,6h,24h。室温晾干后放入-80℃冰箱保
存。提取RNA后反转录成cDNA,以此cDNA为
模板,引 物 为 NCED(Forward:5-CCTCCGACATGGC
GAGCAG-3;Reverse:5-CACGGACACTCGGGCATCG-3);
CYP707A(Forward:5-ACACAGAAAGATGCGCTAATCG-
3;Reverse;5-TACGTTGTCGGCGATCTG-3)进行PCR扩
增。18sRNA(Forward:5-CGCAGTTGTTCGTCTTTCA-
3Reverse:5-CCATCGCTCTGGATACATTAG-3)为内参。
741
草 地 学 报 第20卷
PCR反应在荧光定量PCR仪上进行。3个基因的
PCR反应程序均为95℃,4min;95℃,15s;60℃,
15s;72℃,25s;40个循环。每个样品3个重复,取
平均值。
2 结果与分析
2.1 发芽率
经过28d的发芽计数,海青一号(H1)与野生
型(WT)以及去除颖苞后海青一号(H1)与野生型
(WT)结缕草种子的发芽率结果如图1和图2所
示。
  海青一号(H1)结缕草种子在去除颖苞后发芽
率显著提高,与未经处理的海青一号(H1)差异显著
(P<0.05),且大大缩短了发芽周期,在吸胀的第14
d已经达到最高水平76.7%,发芽整齐。野生型
(WT)结缕草种子去除颖苞后发芽率为41.5%,较
未经处理的野生型结缕草种子发芽率相比没有显著
差异(P>0.05),但是发芽较整齐,与未经处理的野
生型(WT)相比发芽所需时间较短,发芽速度较快。
未经处理的海青一号(H1)和野生型(WT)结缕草
种子发芽率差异不显著(P>0.05),但是经过去除
颖苞处理后海青一号(H1)和野生型(WT)结缕草
种子发芽率存在显著差异(P<0.05)。
2.2 CYP707A基因的克隆与测序
在结 缕 草 种 子 中 克 隆 到 248 个 碱 基 的
CYP707A基因目的片段,通过 DNAMAN软件进
行多序列比对发现,所克隆结缕草中的CYP707A
基因目的片段与水稻、大麦和玉米的保守区同源性
较高,达到 91.27% ,根据 Schuler and Werck
Reichhart[26]的定义体系,该基因为结缕草中的
CYP707A基因(图3和图4),命名为ZjCYP707A。
图3 CYP707A基因cDNA片段扩增结果
Fig.3 Amplification result of CYP707A
gene from cDNA fragment
M:marker,C:CYP707A
2.3 CYP707A 基因与NCED 基因的相对 mRNA
表达
图5是以NCED 基因为例,得出的 Real-time
PCR试验结果图。
  对海青一号(H1)与野生型(WT)2种结缕草不
同吸胀时间的 NCED 基因及CYP707A 基因进行
荧光定量检测,分析其结果,如图6和图7所示。
通过荧光定量PCR分析检测海青一号(H1)和
野生型(WT)结缕草种子在不同吸胀时间内的相对
mRNA水平(图6,图7)。海青一号(H1)和野生型
(WT)结缕草种子在未经吸胀处理时 NCED 基因
的表达量相近,但是经过2h吸胀处理后野生型
(WT)结缕草种子中NCED基因的相对表达量是
841
草 地 学 报 第20卷
图7 CYP707A基因在野生型(WT)和海青一号(H1)结缕草种子吸胀过程中的表达
Fig.7 Expression level of CYP707Awith Zoysia japonica Seeds(H1,WT)imbibition processing
海青一号(H1)结缕草种子的10倍;吸胀处理6h
后,野生型(WT)结缕草种子NCED 基因表达量略
低于海青一号(H1),但是经过6h到24h吸胀处理
后,海青一号(H1)结缕草种子中NCED 基因的表
达量急速上升,而野生型(WT)结缕草种子则略有
下降;吸胀处理24h时,海青一号(H1)结缕草种子
中NCED 基因的表达量是野生型(WT)结缕草种
子的100倍。CYP707A 基因在未进行吸胀处理的
野生型(WT)结缕草种子中的表达量是海青一号
(H1)结缕草种子的4倍;经过2h的吸胀处理过
程,野生型(WT)结缕草种子中CYP707A基因的表
达量明显上升,达到海青一号(H1)结缕草种子的
10倍;吸胀处理2h到6h过程中,野生型(WT)结
缕草种子中的CYP707A 基因的表达量急速下降;
吸胀处理6h到24h过程中,海青一号(H1)结缕草
种子中CYP707A 基因的表达量急速上升,而野生
型(WT)结缕草种子的CYP707A 基因的表达量持
续下降,吸胀处理24h时,海青一号(H1)结缕草种
子中CYP707A基因的表达量是野生型(WT)结缕
草种子的100倍。
3 讨论与结论
母株的生长环境(光照、温度、水分、土壤养分
等)能影响种子的休眠性,在成熟前的30d日均温
度高,母株处于水分充足,土壤含氮量高的条件下,
种子的萌发率较高。干旱和低温会引起种子体内
ABA含量的变化[27]。野生型(WT)结缕草生长在
山坡上,土壤质地紧密,吸水保水能力差,而海青一
号(H1)结缕草种植于平整的土地上,土质疏松,水
分充足,土壤透水性和透气性较好,这是影响海青一
号(H1)与野生型(WT)结缕草种子发芽率有差异
的原因之一。
未经处理的结缕草种子具有深度休眠,是由于
结缕草种子的包覆组织太紧密,密封性好,含有蜡
质、胶质、粘质或革质化,使水分和氧气不易进入,二
氧化碳和其他一些化学抑制性物质不能快速排出,
从而导致休眠加深[21]。去除颖苞处理后能提高种
子的萌发率,由图1可知未经处理的海青一号(H1)
和野生型(WT)结缕草种子发芽率差异不显著,但
是经过去颖苞处理后的海青一号(H1)和野生型
(WT)结缕草种子之间发芽率达到显著水平(P<
0.05)(图2)。无论是野生型(WT)还是海青一号
(H1)结缕草种子在吸胀过程中ABA含量均呈下降
趋势[28],由图6和图7可知,在海青一号(H1)结缕
草种子吸胀过程中,NCED 基因在吸胀过程中表达
量升高,有利于 ABA的合成,但是CYP707A 基因
的表达也在上升,有利于ABA的降解,而结缕草种
子在吸胀过程中 ABA 含量下降[28],说明这时
CYP707A基因对 ABA 含量的影响占主导作用。
在野生型(WT)结缕草种子中,NCED 基因表达水
平在种子吸胀的前2h过程中,表达量明显升高,有
利于ABA的合成,CYP707A基因表达量也明显升
高,有利于ABA的降解,而 ABA在种子吸胀过程
含量减少,说明在野生型结缕草种子吸胀的2h过
程中,CYP707A基因起主导作用。在野生型(WT)
结缕草种子吸胀的2h到24h过程当中,NCED和
CYP707A 基因表达量都明显下降,说明不利于
ABA的合成及降解,ABA含量的减少与NCED 基
因有着更加密切的关系,NCED 在吸胀2h到24h
过程中起着主导作用。Saito等[19]在对拟南芥的休
眠型(D)及非眠型(ND)种子的研究过程中发现,
AtCYP707A2基因的表达对ABA含量的影响占主
导作用。
NCED 基因和CYP707A 基因在海青一号
051
第1期 迟晓雪等:结缕草种子中NCED基因和CYP707A基因的克隆及其表达动态
(H1)结缕草种子吸胀过程中表达量都持续上升,说
明 ABA 的 生 理 代 谢 进 程 加 快。NCED 及
CYP707A基因在野生型(WT)结缕草种子吸胀2h
过程中,表达量均上升,ABA的生理代谢进程加快,
但是吸胀2h到24h过程中ABA的生理代谢进程
减慢。说明ABA在种子吸胀过程中的代谢速率也
是影响野生型结缕草(WT)和海青一号(H1)结缕
草种子萌发率差异的原因之一,ABA代谢速率加
快,有利于种子的萌发,该结果与Schmitz等[29]的
研究相一致,即胚对ABA的敏感性以及ABA的代
谢能力是影响种子萌发的关键因素。层积处理增加
了8’-羟化酶的代谢活性,从而增加了种子的萌发
率。
ABA在影响种子萌发及萌发后生长的过程中
除了与控制它合成及降解的基因有关,还与内源信
号分子乙烯和糖等有关,ABA对种子萌发具有强烈
的抑制作用,能抑制淀粉酶的形成,降低植物糖代谢
的速度[30]。控制ABA合成的另一个基因ZEP 基
因在拟南芥的研究中发现,它的表达能增加 ABA
的含量并且能延迟休眠[18]。在结缕草种子中对
ZEP和NCED 基因的表达与 ABA含量的关系研
究中发现,NCED 基因是结缕草种子中 ABA合成
途径中的关键基因[29]。马铃薯(Solanum tuberos-
um)中leNCED基因的过量表达能增加ABA的含
量,增强种子休眠性[31]。诱导豆类作物中pvNCED
基因的表达能延迟种子的萌发[5]。
本试验研究了控制ABA合成及代谢的NCED
基因及CYP707A基因的表达动态与种子萌发率的
关系,对于控制赤霉素合成及代谢的基因[32~34]内根
一贝 壳 杉 烯 酸 氧 化 酶 (KAO)、GA20-氧 化 酶
(GA20ox)、GA3-氧化酶 (GA3ox)、GA2-氧化酶
(GA2ox)在种子吸胀过程中的表达动态与萌发率
的关系尚待进一步研究。
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(责任编辑 李美娟
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(责任编辑 邵新庆)
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