全 文 :作物学报 ACTA AGRONOMICA SINICA 2013, 39(6): 1013−1020 http://www.chinacrops.org/zwxb/
ISSN 0496-3490; CODEN TSHPA9 E-mail: xbzw@chinajournal.net.cn
本研究由国家重点基础研究发展计划(973计划)项目(2013CBA01401)和国家自然科学基金项目(31000696)资助。
* 通讯作者(Corresponding authors): 郭宝太, E-mail: btguo12@163.com, Tel: 15969841765; 李学勇, E-mail: lixueyong@caas.cn, Tel: 010-82107409
第一作者联系方式: E-mail: qinyanling.2008@163.com, Tel: 18201617497
Received(收稿日期): 2012-11-13; Accepted(接受日期): 2013-01-18; Published online(网络出版日期): 2013-03-22.
URL: http://www.cnki.net/kcms/detail/11.1809.S.20130322.1737.006.html
DOI: 10.3724/SP.J.1006.2013.01013
两个水稻 D2基因等位突变体的表型分析及分子鉴定
秦雁玲 1,2 尹 亮 3 赵金凤 2 孙 伟 3 赵庆雷 3 袁守江 3 朱文银 3
郭宝太 1,* 李学勇 2,*
1 青岛农业大学生命科学学院, 山东青岛 266109; 2 中国农业科学院作物科学研究所 / 农作物基因资源与基因改良国家重大科学工
程, 北京 100081; 3 山东省水稻研究所, 山东济南 250100
摘 要: 通过 EMS诱变粳稻品种日本晴, 筛选到 2个矮秆突变体 s1-46和 s1-96。突变体株高分别为野生型的 44.7%
和 55.9%, 且叶片直立, 穗粒数减少, 籽粒变短。暗处理时, 野生型的中胚轴伸长, 但突变体的不伸长, 说明突变性状
与油菜素内酯(BR)相关。外源活性 BR 处理后, 突变体与野生型的叶夹角均变大, 根长均变短, 表明突变基因与 BR
的生物合成相关。遗传分析表明, 该突变性状由 1 对隐性基因控制。通过与籼稻品种 Dular 杂交构建 F2群体, 将该
基因定位在第 1染色体 40.9 kb范围内。测序表明, 该基因与参与 BR生物合成的 D2基因等位, 其中 s1-46第 305位
的氨基酸由脯氨酸突变成亮氨酸, 而 s1-96第 370位的甘氨酸突变成谷氨酸。
关键词: 水稻; 矮秆突变体; 油菜素内酯; 精细定位
Phenotypic Analysis and Molecular Characterization of Two Allelic Mutants of
D2 Gene in Rice
QIN Yan-Ling1,2, YIN Liang3, ZHAO Jin-Feng2, SUN Wei3, ZHAO Qing-Lei3, YUAN Shou-Jiang3, ZHU
Wen-Yin3, GUO Bao-Tai1,*, and LI Xue-Yong2,*
1 College of Life Sciences, Qingdao Agricultural University, Qingdao 266109, China; 2 National Key Facility for Crop Gene Resources and Genetic
Improvement / Institute of Crop Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100081, China; 3 Shandong Rice Research Institute,
Jinan 250100, China
Abstract: Two dwarf mutants s1-46 and s1-96 were isolated from an EMS mutated japonica cultivar Nipponbare. The plant
height of the two mutants was 44.7% and 55.9% of that of the wild-type, respectively. The mutants also exhibited erect leaves,
reduced grain number, and shortened grains. When grown in complete darkness, the mesocotyl elongated in the wild-type plant,
but not in the mutants, indicating that s1-46 and s1-96 are brassinosteroids (BRs)-related mutants. Furthermore, treatment of seed-
ling with bioactive BR showed that the leaf angle was increased and the root length was decreased in both the wild-type and mu-
tant plants, suggesting that the mutated gene is involved in BR biosynthesis. Genetic analysis showed that the phenotypes of both
mutants were caused by a recessive gene. Fine-mapping showed that this gene was located within a 40.9 kb region on chromo-
some 1. Sequence analysis revealed that the mutated gene was allelic to D2, encoding CYP90D2 that is involved in BR biosyn-
thesis. In s1-46 and s1-96, the encoded amino acids were changed from proline to leucine and from glycine to glutamic acid at the
305th and 370th positions of D2, respectively.
Keywords: Rice; Dwarf mutant; BR (brassinosteroids); Fine-mapping
油菜素内酯(brassinosteroids, BR), 是一类多羟基
化的甾醇类植物激素, 对植物的生理和形态发生具
很大影响。BR 调控细胞和茎的伸长 [1-2]、维管的
分化[3-4]、暗形态建成[5-6]、叶夹角形成[7-8]、种子萌
发[9-10]、气孔发育[11]、分蘖形成[12]、叶片衰老和脱
落等生长发育过程[13], 并可提高作物对生物胁迫如
病害的抗性和调控植物株型 , 从而增加产量。
OsDWARF4 基因编码一个细胞色素 P450 单加氧
1014 作 物 学 报 第 39卷
酶[15], 与 D11共同参与 BR合成及后期 C-22的羟基
化, 二者在功能上存在冗余。所不同的是, D11参与
BR 合成的主要途径, 调控茎的伸长和生殖生长, 突
变 时 导 致 植 株 明 显 矮 化 , 粒 型 变 小 [16]; 而
OsDWARF4 参与 BR 合成的补充途径, 主要影响叶
片角度, 突变后叶片直立, 有利于密植条件下捕获
光能, 即使在不额外施加化肥的条件下, 产量都比
野生型高[15]。说明通过遗传学的方法调控 BR 的生
物合成可以提高产量。
在双子叶和单子叶植物中, 主要通过筛选 BR
缺陷型和不敏感型突变体, 借助遗传分析对基因进
行定位克隆与功能分析, 确定参与 BR 合成和信号
途径的基因及作用机制。但在单子叶植物如水稻中,
已发现的 BR 相关突变体还不多, BR 合成和信号通
路研究得还不很清楚[17]。目前, 水稻中已克隆 5 个
与 BR合成相关的基因, 即 D2、D11、BRD1、BRD2
和 OsDWARF4, 其中 4 个编码细胞色素 P450 酶类,
即 CYP90D2/D2编码 C-23羟化酶[18], CYP724B1/D11
和 CYP90B2/OsDWARF4 编码 C-22 羟化酶 [15-16],
CYP85A1/BRD1编码 C-6氧化酶[19], 它们都是 BR合
成途径中的关键酶。拟南芥 BRI1是第一个被克隆的
BR信号转导基因, 编码一个跨膜的富亮氨酸重复的
蛋白激酶, 为 BR的受体, 水稻 D61基因与 BRI1 同
源[20]。
到目前为止, 已发现 60 多个水稻矮秆突变体,
其中有些突变体的籽粒小而圆[21]。与 BR 合成相关
突变体通常表现小粒特征, 如 d2 [18]、d11 [16]、brd1 [19]
和 brd2 [22]等。本研究利用 EMS诱变粳稻品种日本
晴获得 2 个稳定遗传的矮秆突变体, 进行了形态学
观察和 BR 激素处理实验; 对该突变基因的定位和
克隆丰富了控制水稻株高相关基因的理论。
1 材料与方法
1.1 实验材料的获得
粳稻品种日本晴经化学诱变剂甲基磺酸乙酯
(ethyl methylsulfonate, EMS)诱变处理后, 从M2代成
熟期筛选出 2 个矮秆突变体 s1-46 和 s1-96, 多代自
交性状稳定。
1.2 突变体的表型鉴定
分蘖期和成熟期考察 s1-46 和 s1-96 与野生型
(日本晴)的株高、叶夹角、叶片形态、穗型、粒型、
穗粒数、粒长、粒宽、节间长度等重要形态指标。
1.3 暗形态建成
参考 Sumiyo 等[16]的方法, 分别将野生型和突
变体水稻种子置于剪掉底部的 96孔 PCR板中, 并于
加水的密封容器中 35℃催芽 2 d, 再于 30℃黑暗处
理 20 d。每个处理 15粒种子, 观察中胚轴的伸长情
况并拍照记录。
1.4 BR敏感性分析
以叶夹角和根长的变化反映对 BR 的敏感性。
用无水乙醇配制 1 μmol L−1 的表油菜素内酯
(Brassinolide, 简称 BL, Sigma, E1641)溶液。选取充
实度良好的种子去壳后, 用 1.7% NaClO 溶液消毒
30 min, 灭菌蒸馏水洗涤 5次, 于 35℃萌发 2 d, 选
取胚芽鞘萌发一致的种子, 分成两组, 分别置于不
含BL和含有 1 μmol L−1 BL的 1/2 MS固体培养基上,
30℃持续光照培养, 15 d后用量角器测量第 3叶与其
叶鞘之间的夹角, 同时测量根长, 每个处理 15 粒种
子, 3次重复。采用 Microsoft Excel和 SPSS(6.1)数据
处理统计软件进行相关的方差分析和差异性比较。
1.5 定位群体的构建和总 DNA的提取
将突变体分别与籼稻品种 Dular杂交, F1代自交
后获得 F2群体。于成熟期调查 F2群体的株高并统计
分离比。从 2个突变体的 F2代中分别选取 786株和
695 株矮秆植株构成定位群体。按单株取叶片以
CTAB 法[23]提取总 DNA, 参照 Michelmore 等[24]的
BSA (bulked segregation analysis)方法, 总 DNA 经
0.8%琼脂糖凝胶电泳检测后, 随机挑选亮度一致的
20株突变体 DNA, 各取等量构成混池。
1.6 基因初步定位
根据籼、粳稻序列间的插入或缺失差异, 设计
170个有多态性的 InDel (Insertion or Deletion)标记,
均匀分布在 12条染色体上, 利用这些标记进行初步
定位。通过比对日本晴、Dular、F1代、F2代突变体
DNA 混池之间的标记差异性确定可能与目的基因
连锁的 InDel 标记。PCR 扩增体系包含 10×PCR
buffer 1 μL, 引物(4 μmol L−1) 1 μL, 模板 DNA 1 μL,
dNTPs (2.5 mmol L−1) 0.2 μL, Taq DNA聚合酶(5 U
μL−1) 0.1 μL, ddH2O 6.7 μL。PCR扩增条件为 94℃预
变性 5 min; 94℃ 30 s, 55℃ 30 s, 72℃ 30 s, 循环
数为 35个; 72℃延伸 5 min。在 220V下以 8%聚丙
烯酰胺凝胶电泳 1 h, 再经硝酸银染色后照相分析。
1.7 基因精细定位
根据已公布的粳稻品种日本晴与本实验室已测序
的籼稻品种 Dular 全基因组序列(待发表)之间的差异,
第 6期 秦雁玲等: 两个水稻 D2基因等位突变体的表型分析及分子鉴定 1015
在与目的基因连锁的标记区间内开发新的 InDel标记,
对 F2群体中表现矮化性状的单株进行精细定位。
1.8 基因功能预测和突变位点确定
通过 Rice Genome Annotation Project (水稻基因
组注释系统)网站(http://rice.plantbiology.msu.edu/)在
精细定位区间内进行基因预测, 分析可能的候选基
因。根据网站上提供的全基因组序列设计引物, D2
基因组 DNA全长 7898 bp, 分成 6个约 1.5 kb的片
段, 对 PCR产物直接测序, 然后使用 DNAStar软件
比对突变体和野生型的序列差异。
2 结果与分析
2.1 突变体的表型分析
由图 1 (A、D)和表 1 可见, 突变体植株 s1-46
和 s1-96 表现出明显的矮化, 成熟期野生型日本晴
的株高为 101.27 cm, 突变体的株高分别只有野生型
的 44.7%和 55.9%。进一步调查发现, 突变体的各个
节间与野生型相比都有不同程度的缩短(图 2-A), 其
中 s1-46尤以穗下第 2、第 3、第 4节间缩短最为显
著; 随机调查 s1-96的 100个分蘖, 发现共有 4种缩
短类型, 分别是穗下第 2节间、第 3节间、第 2和 3
节间及第 2和 4节间缩短(图 2-A中的 1、2、3、4),
各占 19%、27%、19%和 35%。根据各节间长度占
总节间长度的相对比例, Takeda[25]将水稻矮秆突变
体分为 dn、dm、sh、d6和 nl 5种类型(图 2-B)。参
照此分类方法, s1-46属于 d6类型矮化(图 2-C); s1-96
的 4 种矮化类型中, 第 1 种表现为第 2 节间严重缩
短, 属于 dm 类型(图 2-C 中的 1), 其他 3 种矮化类
型目前少见报道(图 2-C中的 2、3、4)。此外, 突变
体还表现叶片直立和叶夹角变小(图 1-B和表 1), 叶
片顶端扭曲和褶皱(图 1-C)。穗粒数(图 1-E 和表 1)
和粒长(图 1-F和表 1)与野生型相比都有极显著差异,
其中, 穗粒数分别为对照的 38.2%和 58.9%, 粒长为
对照的 61.8%和 64.6%。突变体的粒宽没有显著变化,
但长宽比显著降低(图 1-F和表 1)。上述表型特征与
已报道的水稻 BR相关突变体非常相似[15-20,22]。
图1 野生型与s1-46、s1-96表型
Fig. 1 Phenotypes of WT and s1-46, s1-96
A: 分蘖期表型; B: 叶夹角; C: 叶片表型; D: 成熟期表型; E: 穗型; F: 粒型。
A: phenotype at tillering stage; B: leaf angle; C: leaves; D: phenotype at maturity stage; E: panicles; F: grains.
表1 野生型、s1-46和s1-96的主要农艺性状比较
Table 1 Agronomic characters of WT, s1-46, and s1-96 (mean ± SE, n = 20)
性状
Trait
野生型
Wild type
s1-46 s1-96
成熟期株高 Plant height (cm) 101.27 ± 3.70 45.25 ± 3.32** 56.62 ± 3.17**
叶夹角(分蘖期第1片叶) Leaf angle (°) 10.21 ± 2.97 6.02 ± 1.54** 6.46 ± 1.67**
每穗粒数 Grain number per panicle 118.54 ± 3.86 45.31 ± 2.35** 69.84 ± 3.24**
粒长 Grain length (mm) 6.89 ± 0.25 4.26 ± 0.24** 4.45 ± 0.20**
粒宽 Grain width (mm) 2.86 ± 0.11 2.45 ± 0.15 2.59 ± 0.12
粒长宽比 Length/width ratio of grains 2.41 ± 0.13 1.73 ± 0.14 ** 1.71 ± 0.10**
*和**分别表示野生型与突变体相比在P<0.05和P<0.01水平上差异显著。
*, ** Significantly different at P<0.05 and P<0.01, respectively.
1016 作 物 学 报 第 39卷
图2 野生型、s1-46和s1-96节间伸长模式
Fig. 2 Elongation pattern of internodes of WT, s1-46, and s1-96
A: 野生型、s1-46和s1-96的节间形态; B: 矮秆突变体节间伸长模型; C: 野生型、s1-46和s1-96的相对节间伸长长度。I、II、III、IV分
别表示穗下第1、第2、第3、第4节间,1、2、3、4分别表示s1-96的4种节间类型。
A: internodes of WT, s1-46 and s1-96; B: internodes elongation patterns of wild type and various rice dwarf mutants; C: relative length of
internodes of WT, s1-46, and s1-96. I, II, III, and IV indicate internodes from the uppermost to the fourth, 1, 2, 3, and 4 indicate the four
internode types in s1-96.
2.2 暗培养下的形态发生
据报道, 典型的水稻 BR 缺陷或不敏感突变体
在黑暗处理时表现出中胚轴不伸长的特征[18]。我们
对 s1-46和 s1-96暗培养表明, 野生型的中胚轴明显
伸长, 而 2 个突变体的中胚轴几乎不伸长(图 3), 说
明 s1-46和 s1-96的突变性状和 BR相关。
WT sl-46 sl-96
图3 野生型、s1-46和s1-96暗处理下的形态发生
Fig. 3 Morphology of WT, s1-46, and s1-96 grown in the dark
箭头表示中胚轴。Arrows indicate the mesocotyls.
2.3 突变体对 BR的响应
施加 BL (1 μmol L−1)使野生型和突变体的叶夹
角均显著变大(图 4-A, B), 根长明显缩短(图 4-C, D),
但突变体与野生型相比没有显著差异(图 4-B, D)。说
明 s1-46 和 s1-96 对 BR 的响应不受影响, 其突变表
型应该与 BR的合成有关。
2.4 突变体的遗传分析
突变体与株高正常的籼稻品种 Dular 杂交获得
的 F1植株株高表现正常, 表明突变性状受隐性基因
控制。F2 植株表型分离, 可明显地区分为正常与矮
秆植株。随机调查 200 株 F2单株, 经卡方检测, 正
常和突变表型个体的分离比例符合 3∶l (表 2), 表
明该突变性状受 1对隐性核基因控制。
2.5 s1-46和 s1-96的基因定位
利用 170 个在日本晴和 Dular 之间有多态性的
InDel 标记, 对 F2群体中的 20 个突变单株 DNA 混
池进行 BSA 分析, 发现可与第 1 染色体上的标记
R1-3.68M和 R1-6.34M (表 3)连锁。进一步利用这 2
第 6期 秦雁玲等: 两个水稻 D2基因等位突变体的表型分析及分子鉴定 1017
图4 野生型、s1-46和s1-96的叶夹角和根长对BL处理的响应
Fig. 4 Leaf angle and root length responded to BL treatment in WT, s1-46, and s1-96
A和B: 叶夹角对BL的响应; C和D: 根长对BL的响应。−BL表示未添加BL; +BL表示添加了1 μmol L−1 BL。
B和D中Student’s t-test检测显著差异(P<0.05)用不同字母表示。
A and B: leaf angle responded to BL treatment; C and D: root length responded to BL treatment. −BL means without BL treatment, +BL
means with BL (1 μmol L−1) treatment. Significant differences (P<0.05) detected by Student’s t-test are indicated by different letters
subscripted on bars.
表2 水稻矮化突变体s1-46和s1-96的遗传分析
Table 2 Genetic analysis of the s1-46 and s1-96 mutant
杂交组合
Cross combination
总株数
Total
正常植株
Normal
矮化植株
Dwarf
χ2
(3:1)
s1-46/Dular 200 155 45 0.35
s1-96/Dular 200 153 47 0.12
表3 用于基因定位的分子标记
Table 3 Molecular markers used for gene mapping
分子标记
Marker
正向引物序列
Forward primer sequence (5–3)
反向引物序列
Reverse primer sequence (5–3)
所在的BAC
BAC clone
R1-3.68M ACAAGAAGTACGATCTCCAC CATACAATAATGCAGTAGCC AP003282
R1-6.34M TCGTCGATAGAGAGACAGAG TTTCCCAAAGTGGCAAGAGG AP001633
R1-4.84M CAGCCCAGAGGTTTCTTAAG GAGAGGAAGAGCTGGCGAAC AP002743
R1-5.18M GTGGAGGTATCACCCGATTG ACATGCATGTGACATACGCC AP003417
R1-5.21M CTTACCTGGGATAGCAACTC CTATCGACTAGTCTATGTG AP003417
R1-5.25M TCACCAGCTCACCAGCATGG GACCGCTGTGCGAGCTTTAT AP003244
R1-5.30M CCTAGTACTCCATAATCCTG CTGCAAGCAATCTGAGCCAT AP003244
R1-5.84M TATAGCATCAGCAGCTGCTC AGACAACGTGTTGTACGAGG AP003052
个标记分别对 s1-46和 s1-96的 48个 F2突变单株进
行初步定位, 发现 s1-46与这 2个标记的遗传距离分
别为 13.5 cM与 14.6 cM, 而 s1-96与这 2个标记的
遗传距离分别为 14.6 cM与 15.6 cM, 这 2个标记间
的物理距离为 2.66 Mb (图 5-A)。
为了进一步定位目标基因, 继续开发了 6 个具
有多态性的 InDel 标记 R1-4.84M、R1-5.18M、
R1-5.21M、R1-5.25M、R1-5.30M 和 R1-5.84M (表
3)。将定位群体分别扩大到 786 株和 695 株 F2突变
个体, 用这些标记进行连锁分析, 最终将突变基因定
位在 R1-5.21M和 R1-5.25M (图 5-B)之间的 40.9 kb范
围内。
2.6 候选基因的测序分析
根据 TIGR 网站(http://rice.plantbiology.msu.edu/)
1018 作 物 学 报 第 39卷
提供的基因注释信息, 在 R1-5.21M 和 R1-5.25M 之
间有 5个基因(图 5-C和表 4)。其中 LOC_Os01g10040
(D2)编码一个新的细胞色素氧化酶 P450, 归属于
CYP90D 家族, 是 BR 生物合成过程中的一种关键酶,
催化 6-脱氧茶甾酮(6-deoxoteasterone)→3-脱氢-6-脱
氧茶甾酮 (3-dehydro-6-deoxoteasterone)和茶甾酮
(teasterone)→3-脱氢茶甾酮 (3-dehydroteasterone)的
反应, 它的隐性突变导致 BR生物合成受阻, 植株矮
化[18]。因此, 把 LOC_Os01g10040作为候选基因, 全
长 7898 bp, 由 8个外显子和 7个内含子组成(图 5-D)。
D2基因编码 490个氨基酸, 包括 5个重要的结构域,
从氮端到碳端依次是膜定位区域、高脯氨酸结构域、
氧分子结合结构域、类固醇结合结构域和亚铁血红
素结合结构域(图 5-E)。
表4 定位区间内基因功能注释
Table 4 Gene function annotation in the mapped region
基因座位
Locus ID
基因功能注释
Gene function annotation
位置
Location
LOC_Os01g10010 Prenylated rab acceptor, putative, expressed 5216701–5215828
LOC_Os01g10020 Ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 1, putative, expressed 5218542–5220398
LOC_Os01g10030 Expressed protein 5227044–5229966
LOC_Os01g10040 Cytochrome P450, putative, expressed 5236623–5244011
LOC_Os01g10050 DEAD-box ATP-dependent RNA helicase, putative, expressed 5251192–5246503
图5 s1-46和s1-96在第1染色体上的精细定位及D2蛋白结构
Fig. 5 Fine mapping of s1-46 and s1-96 on chromosome 1 and the structure of the D2 protein
A: 基因初步定位, 横线上方为所用标记, 下方为 2个突变体定位群体揭示的遗传距离; B: 基因精细定位, 横线上方为所用标记, 下方
为 2个突变体定位群体中的重组个体数目; C: 精细定位区间内的候选基因; D: D2基因结构, 箭头指示 2个突变体的突变位点; E: D2
蛋白结构, 阴影部分表示 5个保守的结构域, 4个等位突变体的突变位点在基因结构上方标出。
A: Primary mapping of the s1-46 and s1-96 mutant. Indel markers used and genetic distance revealed in the two mapping populations are indi-
cated above and below the horizontal line, respectively; B: Fine mapping of s1-46 and s1-96. Indel markers used and recombinants detected in the
two mapping populations are indicated above and below the horizontal line, respectively; C: The candidate genes in the fine mapping region; D:
Structure of the D2 gene. Arrows indicate the mutation sites in the s1-46 and s1-96 mutant; E: Structure of the D2 protein. Regions in the shade
indicate the five conserved domains. Mutation sites of four d2 allelic mutants are indicated above the gene structure sketch.
第 6期 秦雁玲等: 两个水稻 D2基因等位突变体的表型分析及分子鉴定 1019
测序表明, 在 s1-46中, D2基因编码区内第 914个碱
基(第 4 个外显子内)由 C 变成了 T, 导致编码的第
305 个氨基酸由脯氨酸突变成亮氨酸; 在 s1-96 中,
第 1109个碱基(第 6个外显子内)由 G 变成了 A, 导
致第 370 个氨基酸由甘氨酸突变成谷氨酸(图 5-D,
E)。因此, s1-46和 s1-96是 D2基因新的等位突变体。
3 讨论
BR是一种重要的植物激素, 与植物的多个生长
发育阶段相关。BR除了引起植株矮化外, 还影响籽
粒大小和叶夹角大小[16]。本研究中的突变体 s1-46
和 s1-96, 都表现半矮秆、叶片直立、籽粒变小(图
1)等特征。研究表明 BR缺陷型和不敏感型突变体在
暗培养时, 中胚轴都表现不伸长的特点[18]。本研究
的暗培养结果表明二者的中胚轴都没有伸长(图 3),
说明突变是与 BR相关的。而且 BR缺陷型突变体在
施加外源 BL 后, 可恢复野生型表型。当用 BL 处
理 s1-46和 s1-96时, 突变体的叶夹角达到野生型的
大小, 根长也与野生型相当(图4), 说明引起 s1-46和
s1-96 表型异常的 D2 基因参与了 BR 的生物合成过
程。
D2 基因编码的 C-23 羟化酶包括 5 个重要的结
构域, 发生在不同位点的突变所产生的效应也不相
同。如已报道的突变体 d2-1 (K83变成终止密码子),
丧失了 3 个重要的结构域, 所引起的突变就比较严
重, 其植株更矮小、叶夹角更小、籽粒更小等。而
d2-2 (P305S)中突变发生在处于中间位置的氧分子
结合结构域中, 引起的突变就比较弱[18]。本研究中
的突变体 s1-46 (P305L)与 d2-2发生突变的位置相同
(图 5-E), 但突变后产生的氨基酸不同, 所引起的表
型变化也不相同, 例如, 在 d2-2 中只有穗下第 2 节
间缩短[18], 而 s1-46中除穗下第 1节间外, 其余节间
均严重缩短。当突变发生在这 5 个保守的结构域之
外时 , 对表型的影响比较弱 , 如本研究中的 s1-96
(G370E) (图 5-E), 株高、叶夹角、籽粒大小等性状
的改变都没有 s1-46严重。此外, s1-96各分蘖间表现
出 4 种不同的节间伸长模式, 这种现象在几个水稻
d1 等位突变体中也有报道[26], 但其机制还有待进一
步研究。
BR 相关突变体通常表现叶片直立和叶夹角变
小, 这是影响作物株型的重要因素之一, 可影响作
物种植密度和对光的获取, 进而决定粮食产量[17]。
例如, 水稻 BR 受体突变体 d61-7, 在相同的种植面
积时, 叶片直立使其种植密度加大, 从而比野生型
提高生物量 35%[27]。植物的生长发育是个非常复杂
的过程, 牵涉多方面因素, 分离鉴定不同的矮秆突
变体并克隆基因对揭示植物生长发育的分子机制、
合理利用有利等位突变基因资源进而提高作物产量
具有重要意义。
4 结论
以 EMS诱变粳稻品种日本晴获得了 2个矮秆突
变体 s1-46 和 s1-96, 均具叶片直立、籽粒变短等表
型, 均属 BR 缺陷型突变体。参与 BR 合成途径的
D2基因的突变发生在不同结构域, 导致 2个突变体
表型上的差异。
References
[1] Azpiroz R, Wu Y, LoCascio J C, Feldmann K A. An Arabidopsis
brassinosteriod-dependent mutant is blocked in cell elongation.
Plant Cell, 1998, 10: 219–230
[2] Cheon J, Park S Y, Schulz B, Choe S. Arabidopsis brassinoster-
oid biosynthetic mutant dwarf7-1 exhibits slower rates of cell di-
vision and shoot induction. BMC Plant Biol, 2010, 10: 270
[3] Yamamoto R, Demura T, Fukuda H. Brassinosteroids induce en-
try into the final stage of tracheary element differentiation in cul-
tured Zinnia cells. Plant Cell Physiol, 1997, 38: 980–983
[4] Fukuda H. Signals that control plant vascular cell differentiation.
Nat Rev Mol Cell Biol, 2004, 5: 379–391
[5] Neff M M, Nguyen S M, Malancharuvil E J, Fujioka S, Noguchi
T, Seto H, Tsubuki M, Honda T, Takatsuto S, Yoshida S, Chory J.
BAS1: a gene regulating brassinosteroid levels and light respon-
siveness in Arabidopsis. Proc Natl Acad Sci USA, 1999, 96:
15316–15323
[6] Song L, Zhou X Y, Li L, Xue L, Yang X, Xue H W. Ge-
nome-wide analysis revealed the complex regulatory network of
brassinosteroid effects in photomorphogenesis. Mol Plant, 2009,
2: 755–772
[7] Wada K, Marumo S, Ikekawa N, Morisaki M, Mori K. Brassino-
lide and homobrassinolide promotion of lamina inclination of rice
seedlings. Plant Cell Physiol, 1981, 22: 323–325
[8] Wada K, Marumo S, Abe H, Morishita T, Nakamura K, Uchi-
yama M, Mori K. A rice lamina inclination test—a micro-quan-
titative bioassay for brassinosteroids. Agric Biol Chem, 1984, 48:
719–726
[9] Sasse J M, Smith R, Hudson I. Effect of 24-epibrassinolide on
germination of seeds of Eucalyptus camaldulensis in saline con-
ditions. Proc Plant Growth Regul Soc Am, 1995, 22: 136–141
[10] Steber G M, McCourt P. A role for brassinosteroids in germina-
tion in Arabidopsis. Plant Physiol, 2001, 125: 763–769
[11] Kim T W, Michniewicz M M, Bergmann D C, Wang Z Y.
Brassinosteroid inhibits stomatal development by releasing
GSK3-mediated inhibition of a MAP kinase pathway. Nature,
1020 作 物 学 报 第 39卷
2012, 482: 419–422
[12] Fujii S, Hirai K, Saka H. Growth-regulating action of
brassinolide in rice plants. In: Cutler H G, Yokota T, Adam G, eds.
Brassinosteroids: Chemistry, Bioactivity, and Application.
Washington, DC: American Chemical Society, 1991. pp 306–311
[13] Iwahori S, Tominaga S, Higuchi S. Retardation of abscission of
citrus leaf and fruitlet explants by brassinolide. Plant Growth
Regul, 1990, 9: 119–125
[14] Nakashita H, Yasuda M, Nitta T, Asami T, Fujioka S, Arai Y,
Sekimata K, Takatsuto S, Yamaguchi I, Yoshida S. Brassinoster-
oid functions in a broad range of disease resistance in tobacco
and rice. Plant J, 2003, 33: 887–898
[15] Sakamoto T, Morinaka Y, Ohnishi T, Sunohara H, Fujioka S,
Uequchi-Tanaka M, Mizutani M, Sakata K, Takatsuto S, Yoshida
S, Tanaka H, Kitano H, Matsuoka M. Erect leaves caused by
brassinosteroid deficiency increase biomass production and grain
yield in rice. Nat Biotechnol, 2006, 24: 105–109
[16] Sumiyo T, Motoyuki A, Shozo F, Suguru T, Shigeo Y, Masahiro Y,
Atsushi Y, Hidemi K, Makoto M, Yukiko F, Hisaharu K, Yuki-
moto I. A novel cytochrome P450 is implicated in brassinosteroid
biosynthesis via the characterization of a rice dwarf mutant,
dwarf11, with reduced seed length. Plant Cell, 2005, 17: 776–790
[17] Bishop G J. Plants steroid hormone, brassinosteroids: current
highlights of molecular aspects on their synthesis/metabolism,
transport, perception and response. Plant Cell Physiol, 2001, 42:
114–120
[18] Zhi H, Miyako U T, Kazuto U, Sakurako U, Shozo F, Suguru T,
Shigeo Y, Motoyuki A, Hidemi K, Makoto M. A rice brassinos-
teroid-deficient mutant, ebisu dwarf (d2), is caused by a loss of
function of a new member of cytochrome P450. Plant Cell, 2003,
15: 2900–2910
[19] Zhi H, Miyako U T, Sae S S, Yoshiaki I, Shozo F, Yukihisa S,
Suguru T, Masakazu A, Shigeo Y, Yoshihisa W, Sakurako U, Hi-
demi K, Motoyuki A, Makoto M. Loss-of-function of a rice
brassinosteroid biosynthetic enzyme, C-6 oxidase, prevents the
organized arrangement and polar elongation of cells in the leaves
and stem. Plant J, 2002, 32: 495–508
[20] Yamamuro C, Ihara Y, Wu X, Noguchi T, Fujioka S, Takatsuto S,
Ashikari M, Kitano H, Matsuoka M. Loss of function of a rice
brassinosteroid insensitive1 homolog prevents internode elonga-
tion and bending of the lamina joint. Plant Cell, 2000, 12:
1591–1605
[21] Iwata N, Satoh H, Omura T. The relationships between chromo-
somes identified cytologically and linkage groups. Rice Genet
Newsl, 1984, 1: 128–132
[22] Zhi H, Miyako U T, Shozo F, Suguru T, Shigeo Y, Yasuko H,
Motoyuki A, Hidemi K, Makoto M. The rice brassinoster-
oid-deficient dwarf2 mutant, defective in the rice homolog of
Arabidopsis DIMINUTO/DWARF1, is rescued by the endoge-
nously accumulated alternative bioactive brassinosteroid, doli-
chosterone. Plant Cell, 2005, 17: 2243–2254
[23] Wang G-L(王关林), Fang H-Y(方宏筠). Plant Gene Engineering
(植物基因工程), 2nd edn. Beijing: Science Press, 2002. pp
742–744(in Chinese)
[24] Michelmore R W, Paran I, Kesseli R V. Identification of markers
linked to disease-resistance genes by bulked segregation analysis:
a rapid method to detect markers in specific genomic regions by
using segregation population. Proc Natl Acad Sci USA, 1991, 88:
9828–9832
[25] Takeda K. Internode elongation and dwarfism in some gramine-
ous plants. Gamma Field Symp, 1977, 16: 1–18
[26] Oki K. Study of novel d1 alleles, defective mutants of the alpha
subunit of heterotrimeric G-protein in rice. Genes Genet Syst,
2009, 84: 35–42
[27] Yoichi M, Tomoaki S, Yoshiaki I, Masakazu A, Hidemi K, Mo-
toyuki A, Makoto M. Morphological alteration caused by brassi-
nosteroid insensitivity increases the bomass and grain production
of rice. Plant Physiol, 2006, 141: 924–931