以新疆2013年前审定的51个新陆早常规棉花品种为材料, 从5000对SSR引物中筛选出多态性高、稳定性好、且定位在棉花26条染色体上(每条染色体上选择2~3对)的75对核心引物,检测到多态性位点226个, 每个标记检测到的基因型位点数在2~12之间, 平均为3.01个;引物多态信息量(PIC)值介于0.0799~0.8752之间, 平均值为0.6624。结果显示, 在51份新陆早棉花常规品种中, 可利用特征引物将21份品种一次性区分开。利用40对引物可以完全区分开新陆早51份常规品种, 并构建供试品种的指纹图谱。同时利用NTSYS-pcV2.10软件聚类分析表明, 51个新陆早棉花品种遗传相似系数变化范围为0.4269~0.9873, 平均值为0.7071, 说明新陆早棉花品种之间遗传多样性较狭窄;遗传相似系数矩阵和聚类分析将51个新陆早品种分为4大类型, 与原品种选育系谱高度吻合。
全 文 :作物学报 ACTA AGRONOMICA SINICA 2014, 40(12): 21042117 http://zwxb.chinacrops.org/
ISSN 0496-3490; CODEN TSHPA9 E-mail: xbzw@chinajournal.net.cn
本研究由国家公益性行业(农业)科研专项(201303008), “十二五”兵团重点领域科技攻关项目(2011BA001)和新疆兵团石河子科技攻关
项目(2009NY05)资助。
通讯作者(Corresponding author): 林忠旭, E-mail: linzhongxu@mail.hzau.edu.cn ** 同等贡献(Contributed equally to this work)
第一作者联系方式: 聂新辉, E-mail: xjnxh2004130@126.com, Tel: 18186490516; 尤春源, E-mail: xjycy99@126.com, Tel: 18935700526
Received(收稿日期): 2014-04-02; Accepted(接受日期): 2014-09-16; Published online(网络出版日期): 2014-10-16.
URL: http://www.cnki.net/kcms/detail/11.1809.S.20141016.1533.001.html
DOI: 10.3724/SP.J.1006.2014.02104
新陆早棉花品种 DNA指纹图谱的构建及遗传多样性分析
聂新辉 1,2,** 尤春源 2,** 李晓方 3 秦江鸿 2 黄 聪 1 郭欢乐 1
王夏青 1 赵文霞 1 林忠旭 1,
1 华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室, 湖北武汉 430070; 2石河子农业科学研究院棉花研究所, 新疆石河子 832000; 3长江大
学, 湖北荆州 434025
摘 要: 以新疆 2013年前审定的 51个新陆早常规棉花品种为材料, 从 5000对 SSR引物中筛选出多态性高、稳定性
好、且定位在棉花 26条染色体上(每条染色体上选择 2~3对)的 75对核心引物, 检测到多态性位点 226个, 每个标记
检测到的基因型位点数在 2~12 之间, 平均为 3.01 个; 引物多态信息量(PIC)值介于 0.0799~0.8752 之间, 平均值为
0.6624。结果显示, 在 51 份新陆早棉花常规品种中, 可利用特征引物将 21 份品种一次性区分开。利用 40 对引物可
以完全区分开新陆早 51份常规品种, 并构建供试品种的指纹图谱。同时利用 NTSYS-pcV2.10软件聚类分析表明, 51
个新陆早棉花品种遗传相似系数变化范围为 0.4269~0.9873, 平均值为 0.7071, 说明新陆早棉花品种之间遗传多样性
较狭窄; 遗传相似系数矩阵和聚类分析将 51个新陆早品种分为 4大类型, 与原品种选育系谱高度吻合。
关键词: 新陆早常规品种; SSR; DNA指纹图谱; 遗传多样性
Construction of DNA Fingerprinting and Analysis of Genetic Diversity for
Xinluzao Cotton Varieties
NIE Xin-Hui1,2,**, YOU Chun-Yuan2,**, LI Xiao-Fang3, QIN Jiang-Hong2, HUANG Cong1, GUO Huan-Le1,
WANG Xia-Qing1, ZHAO Wen-Xia, and LIN Zhong-Xu1,
1 National Key Laboratory of Crop Genetic Improvement, Huazhong Agricultural University, Wuhan 430070, China; 2 Cotton Research Institute,
Shihezi Academy of Agricultural Sciences, Shihezi 832000, China; 3Yangtze University, Jingzhou 434025, China
Abstract: Fifty-one Xinluzao conventional cotton varieties authorized before 2013 were detected with 75 pairs of primers with
high polymorphism, good repeatability, and even distribution on 26 chromosomes (2–3 pairs from each chromosome) selected
from 5000 pairs of SSR primers. A total of 226 polymorphic loci were obtained, and each marker detected 2–12 polymorphic loci
with an average of 3.01; the polymorphism information content ranged from 0.0799 to 0.8752, with an average of 0.6624. The
results showed that 21 varieties were differentiated by characteristic primers, and the rest 30 varieties could be identified by
primer conbinations. In the end, 40 specific primers and combinated primers could completely differentiate the 51 Xinluzao cotton
varieties from each other. DNA fingerprinting of the 51 Xinluzao conventional varieties were constructed with the 40 pairs of SSR
markers. NTSYS-pcV2.10 software was used to analyze genetic diversity of the 51 conventional varieties, the results indicated
that genetic similarity coefficient for the varieties ranged from 0.4269 to 0.9873, with an average of 0.7071, showing the narrow
genetic diversity in Xinluzao cotton varieties. The 51 Xinluzao cotton varieties were divided into four types with the genetic simi-
larity coefficient matrix and cluster analysis, which were strongly consistent with their pedigrees.
Keywords: Xinluzao conventional cotton varieties; SSR; DNA fingerprinting; Genetic diversity
棉花是我国重要的经济作物, 优质、高产棉花
品种的选育在棉花产业可持续稳定发展中发挥重要
作用。随着棉花产业形势的发展, 新品种审定速度
快、数量多, 而骨干亲本数量有限且反复利用, 导致
第 12期 聂新辉等: 新陆早棉花品种 DNA指纹图谱的构建及遗传多样性分析 2105
品种间遗传差异变小; 随着转基因技术在棉花育种
中的应用, 在原品种基础上改良少数或单个性状的
衍生品种增多, 完全依据形态性状进行棉花品种的
辨别越来越困难[1]。同时, 推向生产的新品种更新换
代快、数量多, 导致种子市场“混、杂、乱”局面, 阻
碍棉花产业的健康发展。传统的棉花品种真实性和
纯度是通过田间种植的方法鉴定的, 耗时长、成本
高、时效性差, 易受环境因素的影响[2]。
近年来, 随着分子生物学的不断发展, 分子标
记技术因不受环境条件的影响且多态性标记可反映
DNA水平上生物个体间的遗传差异而被广泛应用 ,
其中SSR标记被认为是品种鉴定较为理想的标记之
一[3]。目前, 分子标记技术广泛应用在棉花品种指纹
图谱构建和遗传多样性分析中 , 例如 , 郭旺珍等 [4]
最早在1996年利用RAPD技术对中国9个棉花主栽品
种的指纹图谱进行了研究。Multani等 [5]利用RAPD
标记构建了澳大利亚13个陆地棉品种和1个海岛棉
品种的指纹图谱。Iqbal等[6]对22个陆地棉品种和1个
亚洲棉品种进行RAPD分析 , 认为陆地棉品种的遗
传基础很窄。武耀廷等[7]利用SSR标记检测了30个陆
地棉栽培品种和4个杂交种亲本的多态性 , 并建立
了杂交种的指纹图谱, 用于它们的分子鉴定和纯度
检测。马轩等[8]利用SSR技术建立18个彩色棉品系的
DNA指纹图谱。姜伟等[9]利用ISSR标记, 对8个新疆
品种(系) 构建指纹图谱。李武等[10]利用SRAP标记,
对中国引入海岛棉以来培育的36个国内品种及20个
国外品种进行了遗传多样性分析。潘兆娥等[11]构建
中棉所48的SSR数字指纹图谱。薛艳等[12]建立新疆
早熟棉品种SSR分子标记体系。李成奇等[13]利用20
对SSR核心引物构建了百棉系列棉花自交系品种(系)
的DNA指纹图谱。孙宁等[14]以2009年度参加黄河流
域国家棉花区试的57份参试品种为材料进行指纹图
谱分析。匡猛等[15]采用SSR标记构建2008年中国3大
棉区8个棉花主产省份32份棉花主栽品种的DNA指
纹图谱并进行遗传多样性分析。赵亮等[16]利用26对
SSR引物构建12个品种DNA条形码编制。与其他分
子标记相比 , 以微卫星序列为基础的SSR标记在
DNA指纹鉴定上显示了独特的优越性, SSR 标记数
量丰富 , 覆盖整个基因组 , 揭示的多态性高 , 以孟
德尔方式遗传, 呈共显性[2]。近年来, 基于SSR标记
构建了水稻[17]、小麦[18]、玉米[19]、烟草[20]、大豆[21]
等主要农作物的DNA指纹图谱数据库。
本研究拟通过对51份新陆早常规棉花品种指纹
图谱的建立及品种间遗传关系分析, 为种子管理经
营单位提供棉花品种快速、准确、科学的鉴定方法,
保护育种者品种的知识产权和育种家的权益, 也为
育种者提供亲本有效选配、品种合理种植的参考依
据, 加快优质丰产新陆早棉花新品种的选育。
1 材料与方法
1.1 试验材料
2013年以前新疆审定的新陆早棉花常规品种51
份, 统一由原品种选育单位提供(见附表)。SSR引物
由华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室提供,
引物合成、PCR试剂dNTPs、Taq酶及电泳试剂等购
自上海Sangon公司。
1.2 DNA提取及 SSR检测
参照白静的棉花总DNA提取方法、SSR-PCR反应
体系、PCR扩增程序、PAGE凝胶电泳及显色方法 [22]。
1.3 指纹的建立
根据PCR扩增产物在电泳凝胶上的相对位置 ,
对每对引物生成的不同基因型直接编号, 构建51份
新陆早棉花品种的DNA分子指纹图谱。其中电泳结
果采用0,1系统记录谱带位置, 某一扩增条带有带记
为1, 无带记为0, 将每对引物在品种间扩增得到0,1
(二进制)数据转化成十进制数据, 该十进制数据代
表每个引物扩增的结果, 则每40个引物组合的十进
制数字串作为每一个品种的数字指纹。
1.4 统计分析
各引物对应不同基因型扩增, 计算位点多态性
信息含量 (polymorphism information content, PIC),
按公式PIC = 1–Σ Pi2 计算, 其中Pi指第i个等位变异
出现的频率。采用UPGMA (unweighted pair-group
method with arithmetic mean, 未加权平均数)法进行
聚类分析 , 并绘制树状聚类图。利用NTSYS-pcV
2.10软件中的Qualitative data计算品种间的遗传相似
系数(Jaccard系数)。
2 结果与分析
2.1 SSR核心标记确定及标记信息分析
全面综合评价实验室已有的 5000对引物, 选择
多态性高、稳定性好、定位在棉花 26条染色体上且
分布均匀的标记引物 91 对, 在参试品种中进行筛选,
最终确定核心引物 75对, 占检测引物的 82.42%。
如表1所示, 75对 SSR核心引物扩增检测到多态
性基因型位点226个 , 每个标记检测到的基因型位
2106 作 物 学 报 第 40卷
点数介于2~12个之间, 平均为3.01个。其中基因型数
目大于平均数的标记47个, 引物编号分别为2、3、4、
5、7、10、11、12、13、14、16、17、20、21、22、
23、24、25、26、27、30、36、37、38、39、40、
41、42、43、 46、48、50、52、54、56、57、60、
61、64、65、66、68、69、70、71、73和74。图1
所示, NAU3995标记在51份材料中扩增出等位基因
数为4个。
表 1 所示, 标记间的多样性指数介于 0.0799~
0.8752 之间, 平均多样性指数为 0.6624, 其中多样
性指数大于平均数的标记 51个, 引物编号分别为 1、
2、3、4、5、7、8、9、10、11、12、13、14、15、
16、20、21、22、23、24、25、26、27、30、31、
32、34、36、37、38、39、41、42、43、44、45、
46、48、50、53、54、56、57、60、61、62、64、
65、66、70和 71。表明这些标记具有较强鉴别品种
的能力。
等位基因数和多样性指数均大于平均数的标记
有 40个, 如标记 NAU3736, 等位基因数和基因型个
数分别为 5 和 12, 引物多态性信息值为 0.8752。进
一步证实挑选的核心标记引物有效性高, 标记的等
位变异数多, 其多样性指数也高。
表 1 75对 SSR标记在 51份新陆早棉花品种中的引物多态性信息
Table 1 Polymorphism information of 75 SSR loci in 51 Xinluzao cotton varieties
引物编号
Primer number
引物
Primer
染色体
Chromosome
等位基因数
No. of alleles
基因型个数
No. of genotypes
PIC
1 NAU3254 1 2 2 0.7287
2 NAU5163 1 2 3 0.7426
3 BNL663 2 3 4 0.7743
4 NAU5233 3 2 3 0.6925
5 NAU1190 3 2 3 0.7107
6 NAU1071 3 1 2 0.3533
7 NAU3995 3 4 8 0.8347
8 MUCS101 4 2 2 0.6645
9 HAU1384 5 2 2 0.6975
10 NAU3036 5 2 3 0.6970
11 NAU934 5 2 3 0.6994
12 NAU1200 5 2 3 0.7480
13 BNL3650 6 2 3 0.6838
14 DPL238 6 2 3 0.7307
15 NAU874 6 2 2 0.6975
16 TMB1618 7 2 4 0.7316
17 NAU1362 7 2 3 0.6013
18 DPL176 8 2 2 0.6170
19 BNL3255 8 2 2 0.5399
20 BNL3257 8 2 3 0.7472
21 BNL1317 9 4 7 0.8729
22 NAU859 9 2 3 0.6682
23 BNL2960 10 2 3 0.7420
24 BNL3442 11 2 3 0.6708
25 MUSS281 11 2 3 0.7185
26 DPL0209 11 2 3 0.7316
27 NAU2671 12 2 3 0.7359
28 NAU3897 12 2 2 0.6447
29 BNL598 12 1 2 0.0799
30 NAU3778 12 2 3 0.7072
31 NAU3468 13 2 2 0.6766
第 12期 聂新辉等: 新陆早棉花品种 DNA指纹图谱的构建及遗传多样性分析 2107
(续表 1)
引物编号
Primer number
引物
Primer
染色体
Chromosome
等位基因数
No. of alleles
基因型个数
No. of genotypes
PIC
32 Gh697 13 2 2 0.6645
33 BNL1421 13 1 2 0.4861
34 NAU3820 14 2 2 0.7222
35 TMB71 14 2 2 0.5493
36 NAU5499 14 2 3 0.6925
37 JESPR156 14 2 3 0.7444
38 CIR246 14 2 4 0.7359
39 CIR307 15 2 4 0.7055
40 BNL3033 15 2 3 0.6385
41 NAU3736 15 5 12 0.8752
42 NAU2437 15 2 4 0.7281
43 MUSS95 16 2 3 0.6875
44 JESPR292 16 2 2 0.7255
45 NAU2931 16 2 2 0.7431
46 BNL2486 17 3 4 0.7329
47 NAU1028 17 2 2 0.6389
48 TMB2295 18 2 3 0.6708
49 HAU979 19 1 2 0.2491
50 NAU3095 19 2 4 0.7483
51 BNL3875 19 2 2 0.6246
52 NAU3110 19 2 3 0.6343
53 NAU1102 19 2 2 0.7148
54 BNL3948 20 2 3 0.7287
55 CIR043 20 1 2 0.4783
56 BNL119 20 2 3 0.6749
57 Gh277 20 3 4 0.7806
58 BNL3646 20 2 2 0.5493
59 Gh132 21 1 2 0.3047
60 BNL1655 21 2 3 0.7496
61 BNL1154 21 2 3 0.7342
62 NAU1103 21 2 2 0.7500
63 NAU5099 22 1 2 0.4575
64 NAU5508 23 2 4 0.7177
65 NAU3732 23 2 4 0.7446
66 BNL3173 23 3 4 0.7680
67 BNL3140 23 2 2 0.6523
68 NAU5335 24 2 3 0.6024
69 NAU2631 24 2 3 0.5760
70 BNL1521 24 2 3 0.6871
71 HAU2022 25 2 3 0.7107
72 BNL2495 26 2 2 0.5764
73 MGHES44 26 2 3 0.6456
74 NAU1042 26 2 3 0.6207
75 CIR170 26 2 2 0.5204
2108 作 物 学 报 第 40卷
图 1 标记 NAU3995在 51份新陆早棉花中电泳扩增等位基因特征
Fig. 1 Alleles feature of marker NAU3995 in 51 Xinluzao cotton varieties
2.2 参试品种的指纹图谱分析
采用75对引物对51个新陆早棉花品种进行指
纹分析, 其中21个新陆早棉花品种具有特征引物。
在一定材料范围内, 特征引物是指某个品种具有明
显区别与其他品种特有指纹信息的引物, 采用这对
引物就可以直接区分该品种与其他品种。表2所示,
新陆早4号、新陆早10号、新陆早13、新陆早15、
新陆早16、新陆早21、新陆早22、新陆早23、新陆
早26、新陆早33、新陆早34、新陆早37、新陆早38、
新陆早39、新陆早41、新陆早45和新陆早54分别具
有1个特征引物, 新陆早3号、新陆早6号、新陆早40
和新陆早47分别有3、3、6和2个特征引物。图2所
示 , BNL3257标记是新陆早 41的特征引物。而
NAU3736标记可以一批次分别鉴别出新陆早13、新
陆早16、新陆早22、新陆早38、新陆早39和新陆早
47。
表 3所示, 其余 30份材料需要引物组合来区别
该品种与其他品种。例如, 在 51份新陆早品种中区
分新陆早 1 号, 第一步加标记 HAU2022, 利用扩增
出的特征带型(指纹信息)从 51 份材料中首先区分出
来新陆早 1 号和新陆早 3 号, 第二步加新陆早 3 号
特征引物 NAU3995, 可明显区分开新陆早 1 号和新
陆早 3 号, 即选用 2 对引物 HAU2022 和 NAU3995
组合就鉴别出新陆早 1号。
依据表2和表3, 综合如表4所示, 最少选用40对
特征引物和组合引物就可以完全区分开30份新陆早
常规品种。因此, 可用这40对引物的指纹信息构建
新陆早品种的指纹图谱。
图 2 新陆早 41的特征引物 BNL3257电泳扩增图
Fig. 2 Electrophoresis profiles of specific marker NAU1362 for Xinluzao 41
表 2 新陆早棉花品种的特征引物
Table 2 Specific amplification primers for Xinluzao cotton varieties
品种
Variety
特征引物
Specific primer
品种
Variety
特征引物
Specific primer
新陆早 3号 Xinluzao 3 NAU3995, NAU2631,
MUSS95
新陆早 33 Xinluzao 33 BNL2486
新陆早 4号 Xinluzao 4 BNL3173 新陆早 34 Xinluzao 34 BNL1317
新陆早 6号 Xinluzao 6 BNL663, BNL2486,
BNL3442
新陆早 37 Xinluzao 37 CIR170
新陆早 10号 Xinluzao 10 NAU2437 新陆早 38 Xinluzao 38 NAU3736
新陆早 13 Xinluzao 13 NAU3736 新陆早 39 Xinluzao 39 NAU3736
新陆早 15Xinluzao 15 Gh277
新陆早 16 Xinluzao 16 NAU3736
新陆早 40 Xinluzao 40 Gh277, BNL1317, NAU1362, MUSS281,
NAU3732, NAU5499
新陆早 21 Xinluzao 21 BNL1521 新陆早 41 Xinluzao 41 BNL3257
新陆早 22 Xinluzao 22 NAU3736 新陆早 45 Xinluzao 45 CIR307
新陆早 23 Xinluzao 23 NAU1190 新陆早 47 Xinluzao 47 NAU3736, MGHES44
新陆早 26 Xinluzao 26 NAU3110 新陆早 54 Xinluzao 54 MUCS101
第 12期 聂新辉等: 新陆早棉花品种 DNA指纹图谱的构建及遗传多样性分析 2109
表 3 30份新陆早品种区分的组合引物
Table 3 Primer combinations for 30 Xinluzao cotton varieties
品种
Variety
组合引物
Primer team
新陆早 1号 Xinluzao 1 HAU2022, NAU3995
新陆早 2号 Xinluzao 2 BNL3255, BNL1421
新陆早 5号 Xinluzao 5 BNL3948, Gh277
新陆早 7号 Xinluzao 7 NAU3995, BNL598, TMB71, NAU3095, NAU3736, BNL663, BNL3173
新陆早 8号 Xinluzao 8 BNL663, BNL3948, NAU3995, NAU2437, CIR170
新陆早 9号 Xinluzao 9 BNL598, NAU3736
新陆早 11 Xinluzao 11 BNL1655, NAU3736
新陆早 12 Xinluzao 12 NAU3736, Gh277, CIR170, NAU1071
新陆早 17 Xinluzao 17 NAU3095, NAU1190
新陆早 18 Xinluzao 18 BNL1317, NAU3736, NAU2631, NAU934, CIR307, BNL1421
新陆早 19 Xinluzao 19 BNL3646, BNL1317
新陆早 20 Xinluzao 20 NAU3995, BNL1521, NAU1190, NAU5099
新陆早 24 Xinluzao 24 BNL119, BNL1421
新陆早 25 Xinluzao 25 BNL1317, NAU3736, NAU2631, NAU934, CIR307, BNL1421
新陆早 27 Xinluzao 27 NAU2631, NAU3110
新陆早 28 Xinluzao 28 NAU3736, NAU3095, NAU3995, BNL1421
新陆早 29 Xinluzao 29 BNL119, BNL1421
新陆早 30 Xinluzao 30 BNL119, BNL1421, DPL238
新陆早 31 Xinluzao 31 DPL238, BNL2486, NAU3995, CIR170, BNL1317
新陆早 32 Xinluzao 32 NAU934, NAU3995, BNL2486, CIR170
新陆早 35 Xinluzao 35 NAU3995, CIR43
新陆早 36 Xinluzao 36 NAU3732, BNL3257
新陆早 42 Xinluzao 42 BNL1317, NAU3995, BNL663, NAU3736, NAU934, BNL3646
新陆早 46 Xinluzao 46 BNL3173, NAU3736
新陆早 48 Xinluzao 48 NAU3736, NAU3095, NAU3995, BNL1421
新陆早 49 Xinluzao 49 TMB71, Gh277
新陆早 50 Xinluzao 50 NAU3778, BNL598, NAU3736, NAU2631, TMB71, BNL1317
新陆早 51 Xinluzao 51 NAU3736, NAU3995, CIR307, BNL3173
新陆早 52 Xinluzao 52 NAU 1042, NAU3995, NAU1362
新陆早 53 Xinluzao 53 NAU 1042, NAU3995, NAU1362
表 4 利用 40对引物构建 51份新陆早棉花品种的指纹信息
Table 4 DNA fingerprinting of 51 Xinluzao cotton varieties using 40 primers
品种 Variety DNA指纹 DNA fingerprinting
新陆早 1号 Xinluzao 1 0-1-0-0-1-2-1-1-2-1-1-1-2-2-1-0-1-1-2-2-2-2-2-2-2-3-1-1-1-3-1-2-4-1-1-4-14-0-2-1
新陆早 2号 Xinluzao 2 0-1-1-0-1-2-0-2-1-1-1-2-2-2-1-0-1-1-1-2-2-2-2-2-2-1-1-1-1-0-1-2-2-1-1-4-10-9-2-1
新陆早 3号 Xinluzao 3 0-1-1-0-1-3-0-1-2-2-1-2-3-3-1-0-1-3-2-2-2-1-2-3-2-3-1-1-1-0-3-2-2-1-0-12-4-25-2-1
新陆早 4号 Xinluzao 4 0-1-0-0-2-2-0-2-2-2-1-1-3-2-1-2-0-1-2-1-2-2-2-2-2-2-1-1-1-0-1-2-2-2-4-4-9-16-2-1
新陆早 5号 Xinluzao 5 0-1-0-0-1-2-1-2-1-1-1-1-2-2-1-2-1-1-3-2-2-2-2-2-2-1-1-1-1-3-1-3-2-2-1-4-9-20-2-1
新陆早 6号 Xinluzao 6 1-1-1-1-1-2-0-1-2-2-3-1-3-2-1-2-1-3-1-0-2-2-2-2-2-1-1-1-1-0-1-6-6-1-0-10-5-16-2-1
新陆早 7号 Xinluzao 7 0-1-1-0-2-2-1-2-2-1-1-2-3-2-1-2-1-1-1-2-2-2-2-2-2-2-1-1-1-3-1-3-4-2-2-10-5-20-2-1
新陆早 8号 Xinluzao 8 0-1-1-1-2-2-0-2-2-1-1-2-2-2-1-2-1-1-1-0-2-2-2-2-2-2-1-1-1-0-1-3-4-2-2-6-5-16-2-1
2110 作 物 学 报 第 40卷
(续表 4)
品种 Variety DNA指纹 DNA fingerprinting
新陆早 9号 Xinluzao 9 1-0-1-1-1-2-0-2-2-2-1-2-1-2-1-2-2-1-1-2-2-1-1-2-2-1-1-1-2-1-1-4-2-1-2-10-10-20-2-1
新陆早 10号 Xinluzao 10 0-1-0-0-2-2-0-2-2-2-2-2-2-2-1-2-1-1-1-2-2-2-2-2-2-2-1-1-1-2-1-3-4-2-2-6-5-20-2-1
新陆早 11 Xinluzao 11 0-1-1-1-1-2-1-1-2-1-1-2-2-2-1-0-2-1-1-1-2-3-2-0-1-2-2-1-0-0-1-4-2-0-0-9-0-20-3-1
新陆早 12 Xinluzao 12 1-1-0-0-1-1-1-2-2-1-2-2-1-2-2-0-2-1-2-2-2-1-2-2-1-1-2-1-1-1-1-4-2-2-1-14-10-9-2-1
新陆早 13 Xinluzao 13 1-1-0-0-1-2-0-2-2-1-1-2-1-2-1-0-2-1-1-2-2-3-2-2-2-1-1-1-2-1-2-4-2-2-2-10-6-11-1-2
新陆早 15 Xinluzao 15 1-1-1-0-1-2-1-2-2-2-1-2-1-1-2-0-2-3-2-2-2-1-2-2-1-1-1-1-2-3-1-4-2-4-2-11-10-9-2-2
新陆早 16 Xinluzao 16 0-1-0-0-1-2-1-2-2-2-1-1-2-2-1-2-1-1-1-1-2-2-1-2-2-1-2-1-1-3-1-4-2-1-2-9-5-26-2-0
新陆早 17 Xinluzao 17 1-1-1-0-1-2-0-2-2-2-1-1-3-2-2-2-3-1-1-2-2-2-1-2-2-2-2-1-2-1-2-4-2-2-1-10-5-28-3-2
新陆早 18 Xinluzao 18 1-1-0-1-1-2-0-2-2-2-1-2-3-2-2-1-2-3-1-2-2-1-2-2-2-2-2-1-2-3-2-4-2-1-2-6-6-0-3-2
新陆早 19 Xinluzao 19 1-1-0-0-2-1-1-2-2-1-1-2-2-2-1-2-1-1-1-2-1-2-2-2-2-2-1-1-2-1-1-4-4-1-2-6-5-20-2-1
新陆早 20 Xinluzao 20 1-1-0-1-1-2-1-2-2-2-1-1-2-2-1-2-1-1-1-1-2-2-2-2-2-1-2-1-2-3-1-4-2-1-0-14-5-28-3-1
新陆早 21 Xinluzao 21 1-1-1-0-1-2-1-2-2-2-2-1-2-2-2-2-1-3-0-2-2-2-2-0-0-0-1-1-0-0-0-4-2-0-0-14-0-20-2-1
新陆早 22 Xinluzao 22 1-1-0-0-1-2-1-2-2-1-2-1-2-2-1-1-2-3-1-2-2-2-1-2-2-1-1-1-1-3-2-4-2-1-1-6-6-18-1-2
新陆早 23 Xinluzao 23 1-1-1-0-3-2-0-2-2-1-1-2-3-2-1-2-3-1-1-2-2-1-2-2-2-1-1-1-2-3-1-4-2-1-2-14-9-20-2-1
新陆早 24 Xinluzao 24 1-1-0-0-1-1-1-2-2-2-1-2-2-2-1-2-2-1-2-1-2-1-1-2-1-1-1-1-1-3-1-4-2-2-2-6-10-20-2-1
新陆早 25 Xinluzao 25 1-1-1-1-1-2-0-1-2-1-1-2-1-2-1-2-2-1-1-2-2-1-1-2-2-1-1-1-2-3-1-4-2-2-2-6-6-20-2-1
新陆早 26 Xinluzao 26 1-1-0-1-2-2-1-2-2-2-1-1-1-2-2-2-1-2-2-2-2-2-2-1-2-1-1-1-1-3-1-4-2-0-1-6-9-20-2-1
新陆早 27 Xinluzao 27 1-1-0-0-2-2-1-2-2-2-1-1-1-2-2-1-2-1-2-2-2-2-1-1-2-1-2-1-2-3-1-2-2-2-1-6-6-25-2-1
新陆早 28 Xinluzao 28 0-1-1-0-1-1-1-2-2-2-1-2-2-2-1-2-2-1-2-1-2-1-1-2-1-1-1-1-1-3-1-4-2-2-2-6-10-28-2-1
新陆早 29 Xinluzao 29 1-1-1-1-1-0-1-2-2-2-1-2-2-2-1-2-2-1-2-0-2-1-1-2-1-1-1-1-1-0-1-4-2-2-2-6-10-20-2-1
新陆早 30 Xinluzao 30 1-1-1-1-1-1-1-2-2-2-1-2-2-2-1-2-2-1-2-1-2-1-1-2-1-1-1-1-1-3-1-4-2-2-2-6-10-20-2-1
新陆早 31 Xinluzao 31 1-1-1-1-1-1-1-2-2-2-1-2-2-2-1-2-2-1-2-1-2-1-1-2-1-1-1-1-3-3-1-4-2-2-2-6-10-20-2-1
新陆早 32 Xinluzao 32 1-1-0-1-2-3-0-2-2-2-1-2-2-2-1-1-0-1-1-0-2-1-1-2-2-1-2-1-1-0-2-4-2-1-0-6-5-16-2-0
新陆早 33 Xinluzao 33 1-1-0-0-1-3-1-2-2-1-2-1-2-2-1-1-0-3-1-2-2-2-1-2-2-1-1-1-3-0-2-4-1-2-1-6-6-16-1-1
新陆早 34 Xinluzao 34 1-1-0-0-2-1-1-2-2-1-1-2-2-2-1-2-1-1-1-2-1-2-2-2-2-2-1-1-2-1-1-4-4-1-2-6-12-20-2-1
新陆早 35 Xinluzao 35 1-1-0-0-1-3-0-2-2-2-1-1-2-2-1-1-2-3-1-2-2-2-2-2-2-1-1-1-3-3-1-4-2-1-2-5-14-2-1-1
新陆早 36 Xinluzao 36 1-1-0-0-2-3-1-2-2-1-1-2-2-2-1-2-0-1-1-2-0-1-0-0-2-0-1-1-1-0-1-0-4-0-0-5-0-16-2-1
新陆早 37 Xinluzao 37 1-1-1-1-1-3-1-2-2-2-1-2-1-2-1-0-1-3-1-2-2-1-1-2-2-2-1-2-3-1-1-3-2-1-2-6-9-9-2-2
新陆早 38 Xinluzao 38 1-0-1-0-1-1-0-2-2-2-2-2-3-2-2-1-2-3-1-2-2-1-2-2-2-1-1-1-2-1-1-4-2-1-2-10-10-10-2-1
新陆早 39 Xinluzao 39 1-1-0-0-1-1-1-2-2-2-1-2-3-2-1-2-0-3-0-2-2-1-1-2-1-1-1-1-1-0-1-4-2-0-0-6-10-24-2-1
新陆早 40 Xinluzao 40 1-1-1-1-1-2-0-3-2-1-1-3-3-2-3-2-1-3-3-2-2-1-3-2-2-1-1-1-3-3-1-4-2-3-0-6-7-20-2-1
新陆早 41 Xinluzao 41 1-1-0-1-1-2-0-2-2-3-2-2-3-2-2-2-0-3-1-2-2-1-0-2-0-0-1-1-2-0-2-4-2-0-0-6-10-16-2-1
新陆早 42 Xinluzao 42 1-1-0-0-2-2-1-2-2-1-1-2-2-2-1-1-1-3-2-2-2-2-1-2-2-1-1-1-1-3-2-4-2-2-0-6-5-0-2-2
新陆早 45 Xinluzao 45 1-1-0-0-1-2-0-2-2-1-1-2-2-2-1-3-2-3-1-2-2-1-1-2-2-1-1-1-1-1-1-4-2-1-1-6-6-2-3-2
新陆早 46 Xinluzao 46 1-1-0-1-2-2-1-2-2-2-2-1-3-2-1-1-1-3-2-2-2-2-2-2-2-2-1-1-1-1-1-3-2-2-3-10-5-2-2-1
新陆早 47 Xinluzao 47 1-1-1-1-1-1-1-2-2-1-1-2-3-2-2-2-2-3-1-1-2-1-2-2-1-1-3-1-1-1-1-4-2-1-3-11-6-29-2-1
新陆早 48 Xinluzao 48 1-1-0-0-2-2-1-2-2-1-2-1-2-2-1-2-1-3-1-2-2-2-1-2-2-1-1-1-1-3-1-4-2-2-2-6-5-28-2-1
新陆早 49 Xinluzao 49 1-1-0-0-1-2-0-2-2-2-1-2-1-1-2-2-2-3-1-2-2-1-2-2-2-1-1-1-1-3-2-4-2-1-2-10-14-20-3-1
新陆早 50 Xinluzao 50 1-1-0-0-1-2-1-2-2-2-2-2-1-2-2-2-2-3-1-2-2-1-2-2-1-2-1-1-2-1-2-4-2-1-2-6-10-20-2-1
新陆早 51 Xinluzao 51 1-1-0-0-2-2-1-2-2-1-1-2-2-2-1-1-1-3-2-2-2-2-1-2-2-1-1-1-1-3-2-4-2-2-2-6-5-2-2-2
新陆早 52 Xinluzao 52 1-1-1-1-1-1-1-1-3-2-1-1-3-1-1-2-3-2-2-1-2-3-1-2-0-1-1-1-1-3-1-6-2-2-2-15-11-24-1-1
新陆早 53 Xinluzao 53 1-1-0-0-1-2-0-2-2-1-2-1-2-2-1-1-1-1-1-2-2-2-1-2-2-1-1-1-3-1-2-4-1-2-1-15-6-16-1-2
新陆早 54 Xinluzao 54 0-1-0-0-1-2-1-2-2-3-1-2-2-3-1-2-2-1-2-2-2-3-2-2-1-2-3-1-1-1-2-1-4-2-2-1-15-10-20-2-3
40 primers: NAU1071-BNL598-BNL1421-NAU5099-NAU1190-NAU934-CIR43-NAU1362-BNL3255-BNL3257-BNL3442-MUSS281-
NAU3778-TMB71-NAU5499-CIR307-NAU3095-NAU3110-BNL3948-BNL119-BNL3646-BNL1655-NAU3732-NAU2631-BNL1521-HAU2022-
MGHES44-CIR170-DPL238-NAU2437-MUSS95-BNL663-BNL2486-Gh277-BNL3173-NAU3995-BNL1317-NAU3736-NAU1042-MUCS101.
第 12期 聂新辉等: 新陆早棉花品种 DNA指纹图谱的构建及遗传多样性分析 2111
2.3 遗传多样性分析
根据 SSR 分子标记统计不同基因型数据结果,
利用 NTSYS-pcV2.10软件, 采用 Jaccard系数计算51
个新陆早常规品种遗传相似系数, 得到相似系数矩
阵。结果表明, 51个新陆早品种遗传相似系数变化范
围是0.4269~0.9873, 平均值为0.7071, 遗传相似系
数较高, 表明新陆早棉花品种之间遗传多样性较狭
窄。遗传相似系数最大的品种是新陆早30和新陆早
31, 表明二者的遗传差异较小; 遗传相似系数最小
是新陆早15和新陆早32, 表明两者遗传差异较大 ,
亲缘关系较远。
根据品种遗传相似系数矩阵, 对品种聚类(图 3),
在相似系数为 0.4619处可以将 51个新陆早棉花品种
分为 4大类, A类包括新陆早 13个棉花品种, B类包
括 29个, C类包括 2个, D类包括 7个, 其中 B类在
遗传相似系数 0.4778 处又可分为 2 个亚类, 即 B1
与 B2, B1包含 16个品种, B2包含 13个品种。对比
各新陆早品种系谱可明显看出, A 类以石河子棉花
研究所(有新陆早 2号、新陆早 5号、新陆早 7号、
新陆早 8号、新陆早 10号、新陆早 19、新陆早 36、
新陆早 46)及农七师农业科学研究所(有新陆早 3号、
新陆早 4 号、新陆早 6 号)选育的品种为主, 其亲本
多含有前苏联早熟陆地面血缘, 其中新陆早 1 号、
新陆早 6号、新陆早 7号、新陆早 8号、新陆早 36
在北疆早熟棉区作为主载品种推广面积较大。
B类以农七师农业科学研究所(新陆早 9号、新
陆早 13、新陆早 15、新陆早 16、新陆早 23、新陆
早 25、新陆早 31、新陆早 35、新陆早 37、新陆早
38、新陆早 39、新陆早 47和新陆早 49)及农五师地
区(新陆早 11、新陆早 12、新陆早 37、新陆早 54)
所选育品种为主, 新陆早系列品种中, 优质中长绒
或抗病性较好的品种主要集中在 B 类中。其亲本多
含有贝尔斯诺、爱子棉、中棉所 12、中棉所 17 及
辽棉系列的资源, 且通过审定的中长绒品种品种主
要都聚类在 B2亚类中(有新陆早 24、新陆早 25、新
陆早 28、新陆早 29、新陆早 30、新陆早 31、新陆
早 35、新陆早 38、新陆早 39、新陆早 40、新陆早
47、新陆早 49)。其中新陆早 12和新陆早 13在北疆
早熟棉区作为主载品种推广。
C类中的包含新陆早 26、新陆早 27, 其中新陆
早 26在北疆早熟棉区推广面积较大。
D 类新陆早品种主要由新疆农垦科学院棉花研
究所(有新陆早22、新陆早32、新陆早33、新陆早42、
新陆早48、新陆早51、新陆早53)选育, 其中新陆早
33和新陆早48在北疆早熟棉区为主载品种。新疆农
垦科学院棉花研究所选育的新陆早45的亲本之一来
源于新陆早13, 在分子标记多样性聚类分析中, 与
新陆早13聚为一类和系谱描述高度吻合。
3 讨论
随着棉花全基因组测序迅速进展 , 构建高通
量、准确性高, 易操作的全基因组覆盖 DNA指纹库
图 3 51个新陆早棉花品种的聚类分析图
Fig. 3 Clustering analysis of 51 Xinluzao cotton varieties
2112 作 物 学 报 第 40卷
将越来越受到重视。一种理想的分子标记应具有以
下特点, 即标记引物的多态性高、重复性和稳定性
好; 带型清晰, 易统计; 染色体上均匀分布; 共显性;
开发和使用成本低。DNA指纹技术的发展经历3个阶
段 , 第1代是以Southern杂交为基础的RFLP, 第2代
是以PCR为基础的DNA指纹标记(如RAPD、AFLP、
SSR、SCAR、ISSR等), 第3代是以单核苷酸多态性
为基础的SNP[23]。近些年, 分子标记开始应用于各物
种的鉴定 , 国际植物品种权保护组织 (UPOV)在
BMT测试指南草案中已将构建DNA指纹数据库的
标记确定为SSR和SNP[24]。随着第2代测序技术的发
展, 使品种基因组DNA测序和SNP全面分析成为可
能, 从而大大提升了品种识别和鉴定精度, 但检测
成本较高, 有时会因检测尺度的过度精细, 把品种
内的差异误判成品种间的差异[25]。因此, SNP高额的
投入使其未能得到广泛应用 [26], 其中SSR标记技术
比较成熟, 成为当前各个作物构建指纹数据库的首
选技术。本研究采用SSR技术构建了新陆早常规品
种指纹图谱, 并分析和研究了品种的遗传多样性和
亲缘关系。
本试验的聚丙烯凝胶电泳采用变性胶, 而薛艳
等[12]研究42份新疆陆地早熟棉指纹图谱构建与品种
鉴别时采用9%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离方
法, 曲鲁江等[27]报道的非变性凝胶中条带过于复杂,
出现的非特异性条带极大地影响了分析带形的准确
性, 使试验结果的误差加大, 变性胶在利用银染检
测微卫星产物时条带清晰 , 带型分析准确性更高 ,
结果更加可靠。
本研究以75对核心引物SSR标记扩增检测到多
态性基因型位点226个 , 每个标记检测到的基因型
位点数在2~12之间 , 平均为3.01个 , 其中等位基因
型数目大于平均数的标记47个; 标记间的多样性指
数介于0.0799~0.8752之间 , 平均数为0.6624, 多样
性指数大于平均数的标记51个。张玉翠等[2]用32个
主栽品种, 40对引物, 共扩增出161种多态性基因型,
引物多态信息量 (PIC)为 0.2989~0.7585, 平均为
0.5407; 艾先涛等[28]用94份新疆陆地棉品种, 54对具
有稳定多态性的引物, 共检测出153个多态性位点,
每对引物的等位变异为2~6个, 平均为2.93个; 引物
多态信息含量(PIC)为0.0430~0.6640, 平均为0.3831。
与其相比, 本研究筛选的引物标记是高效的。
51个新陆早棉花品种采用75对引物进行指纹分
析, 其中21个品种具有特征引物, 获得特征引物为
23个, 其中 NAU3736标记可以一批次分别鉴别出6
个品种, 而引物 NAU3736在表1中, 等位基因数、基
因型个数和 PIC 值分别为5、12、0.8752, 结果表明
引物多态性越丰富且特征谱带数量越多的标记引物
其鉴别品种能力越强, 可以首选作为构建新陆早棉
花品种指纹图谱的标记。其余30份材料没有获得特
征引物 , 采用引物组合来区别该品种与其他品种 ,
共选用组合引物34个。最终统计, 至少确定40对特
征引物和组合引物就可以完全区分开新陆早常规品
种。以上研究表明, 特征引物在一定材料范围内鉴
定是最快捷、易见的, 但是只有部分品种具有特征
引物, 随着鉴定材料数量的扩大, 需要采用组合引
物鉴定, 可大幅度提高鉴别能力。本研究中全面、
系统构建的新陆早51个品种指纹图谱, 每一个品种
的指纹都是唯一的, 具有很强的特异性, 此数据库
可以用于新陆早棉花品种初级数据库。与赵亮[16]等
的研究具有明显差异, 本试验选用新疆2013年前审
定的早熟陆地棉品种全套完整材料, 75对核心标记均
匀分布于棉花26条染色体且较高多态性, 结合特征
引物和组合引物方法构建品种指纹。
51个新陆早品种遗传相似系数矩阵和品种聚类
表明, 新陆早棉花品种之间遗传多样性较狭窄, 这
与艾先涛等[28]的研究结果相似, 说明新疆陆地棉品
种间遗传关系相对简单, 品种的遗传基础相对狭窄,
品种遗传组分差异较小, 总体上遗传多样性不够丰
富。在相似系数 0.4619处将 51个新陆早品种分为 4
大类, 其中每类包括的新陆早品种基本是来源于一
个地区育种单位, 例如, A类包括石河子棉花研究所
和农七师农业科学研究所选育品种, B类包括农七师
农业科学研究所和农五师农业科学研究所选育品种,
C类是 2个公司选育品种, D类包括新疆农垦科学院
棉花研究所选育品种, 具有相同来源的品种最先聚
为一起; 遗传相似系数最大的品种是新陆早 30和新
陆早 31, 表明其遗传差异较小, 结合表 3显示, 新陆
早30和新陆早 31分别用标记 BNL119、BNL1421组
合和标记 DPL238、BNL2486、NAU3995、CIR170、
BNL1317 组合引物鉴别, 因此遗传差异较小的品种
使用组合引物标记鉴别才更为准确。以上研究结果
与 Liu 等[29]的观点一致, 即 SSR 聚类结果与地理分
布一致, 遗传相似系数揭示种群之间的正相关关系;
从附表看出, 新陆早 9号、新陆早 16、新陆早 25、
新陆早 31 和新陆早 39 的亲本均来源于贝尔斯诺系
统, 因此 B 类品种主要亲本来源有贝尔斯诺、爱字
第 12期 聂新辉等: 新陆早棉花品种 DNA指纹图谱的构建及遗传多样性分析 2113
棉系统、中棉所 12、中棉所 17、辽棉系列, 此系列
选育品种数量最多、棉花纤维品质较优, 说明聚类
结果和品种根据实际系谱来源分类是一致的, 这与
张玉翠等 [2]的研究结果一致, 即遗传相似系数聚类
分析结果基本上反映了品种之间的亲缘关系。新疆
北疆早熟陆地棉品种间分子聚类结果与品种本身遗
传系谱背景高度吻合, 符合品种本身的真实特性。
具有相近表型性状、相同的遗传背景和相同育种单位
选育的品种聚在同一类群中。说明北疆不同育种单位
在早熟棉选育过程中积累形成了各自的特点及优势,
表现在各育种单位在基础种质资源上确立了其特定
的选育方向。
今后应将形态信息与分子数据结合一起形成指
纹图谱, 使品种保护信息更加全面、准确。目前已
在油菜[30]、大豆[31]构建分子身份证, 在甜瓜[32]上建
立指纹图谱QR编码, 在水稻[33]上提出基于SSR分子
指纹和商品信息构建品种身份证的新思路。因此 ,
棉花DNA指纹鉴定技术发展将不断完善, 将棉花的
指纹信息编码结合品种的基本商品信息和特异基因
信息构建棉花品种身份证。
4 结论
利用 SSR分子标记技术, 通过 40对特征引物和
组合引物构建了新陆早 51份棉花品种指纹图谱, 将
51个新陆早品种聚为 4大类型, 遗传多样性较狭窄。
构建的指纹图谱可以作为新陆早棉花品种初级分子
标记指纹数据库。
致谢: 本研究的试验材料来自各品种育种单位提供
的原原种 , 主要由新疆农垦科学院李保成和余渝 ,
石河子棉花研究所孔宪良、黄顶元及秦江鸿, 农七
师农科所李家胜和赵富强, 农五师农科所曹阳提供;
分子标记实验由作物遗传改良国家重点实验室林忠
旭教授精心设计指导, 同时得到黄聪、郭欢乐、王
夏青等研究生的帮助, 在此表示真诚的感谢。
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附表 新陆早棉花品种的信息
Supplementary table Informations of Xinluzao cotton varieties
品种
Variety
系谱
Pedigree
品种选育单位
Released institution
新陆早 1号
Xinluzao 1
农垦 5号选系 722
Line 722 from Nongken 5
下野地实验站
Xiayedi Experimental Station
新陆早 2号
Xinluzao 2
6902×中棉所 4号
6902×Zhongmiansuo 4
农八师农业科学研究所
Nongbashi Agricultural Institute
新陆早 3号
Xinluzao 3
(79-73W×爱子棉)×荆州 4588
(79-73W×Aizimian) ×Jinzhou 4558
农七师农业科学研究所
Nongqishi Agricultural Institute
新陆早 4号
Xinluzao 4
(66-241×灃 74-47)F1×岱 70
(66-241× Li 74-47)F1×Dai 70
农七师农业科学研究所
Nongqishi Agricultural Institute
新陆早 5号
Xinluzao 5
(347-2×科遗 181)F1×(83-2-3+陕 1155)
(347-2×Keyi 181)F1×(83-2-3+Shaan 1155)
农八师农业科学研究所
Nongbashi Agricultural Institute
新陆早 6号
Xinluzao 6
85-174×贝尔斯诺
85-174×Beiersinuo
农七师农业科学研究所
Nongqishi Agricultural Institute
新陆早 7号
Xinluzao 7
3347×塔什干 2号
3347×Tashigan 2
农八师农业科学研究所
Nongbashi Agricultural Institute
新陆早 8号
Xinluzao 8
(抗 V.Wx×早 1号)F1辐射
(Kang V.Wx×Zao 1) F1 radiation
农八师农业科学研究所
Nongbashi Agricultural Institute
新陆早 9号
Xinluzao 9
(新陆早 6号×贝尔斯诺)×中棉所 17
(Xinluzao 6×Beiersinuo)×Zhongmiansuo17
农七师农业科学研究所
Nongqishi Agricultural Institute
新陆早 10号
Xinluzao 10
(黑山棉×02II)F2×中棉所 12
(Heishanmian×02II)F2×Zhongmiansuo 12
农八师农业科学研究所
Nongbashi Agricultural Institute
新陆早 11
Xinluzao 11
豫早 202系选
Yuzao 202 breeding line
博乐种子站
Bole Seed Banks
新陆早 12
Xinluzao 12
辽 95-25病圃系选
Liao 95-25 breeding line from disease nursery
农五师农业科学研究所
Nongwushi Agricultural Institute
新陆早 13
Xinluzao 13
83-14 ×(中无 5601+1639)
83-14 ×(Zhongwu 5601+1639)
农七师农业科学研究所
Nongqishi Agricultural Institute
新陆早 15
Xinluzao 15
JW低酚×中棉所 12
JW low gossypol × Zhongmiansuo 12
农七师农业科学研究所
Nongqishi Agricultural Institute
新陆早 16
Xinluzao 16
早熟鸡脚×贝尔斯诺
Zaoshujijiao×Beiersinuo
农七师农业科学研究所
Nongqishi Agricultural Institute
新陆早 17
Xinluzao 17
9908系选
9908 breeding line
新疆农业科学院
Xinjiang Academy of Agricutural Sciences
2116 作 物 学 报 第 40卷
(续附表)
品种
Variety
系谱
Pedigree
品种选育单位
Released institution
新陆早 18
Xinluzao 18
69118系选
69118 breeding line
新疆农业科学院
Xinjiang Academy of Agricutural Sciences
新陆早 19
Xinluzao 19
91-2×900
农八师农业科学研究所
Nongbashi Agricultural Institute
新陆早 20
Xinluzao 20
新陆早 16 (97-185)病圃系选
Xinluzao 16 (97-185) breeding line from disease nursery
150团
150 Group
新陆早 21
Xinluzao 21
新陆早 8号抗病变异株
Xinluzao 8 variation plant with resistant disease
富依德公司
Fuyide Company
新陆早 22
Xinluzao 22
优系 451×新陆早 6号
Elite line 451×Xinluzao 6
新疆农垦科学院
Xinjiang Land Reclamation Academy of Sciences
新陆早 23
Xinluzao 23
中棉所 27变异
Zhongmiansuo 27 variation plant
万氏种业
Wanshi Seed Industry
新陆早 24
Xinluzao 24
中长绒品系 7047×C6524
Middle length fiber line 7047×C6524
康地种业
Kangdi Seed Industry
新陆早 25
Xinluzao 25
[(系 5×贝尔斯诺)×晋 14] ×中棉所 17
[(Xi 5×Beiersinuo)×Jin 14] ×Zhongmiansuo 17
农七师农业科学研究所
Nongqishi Agricultural Institute
新陆早 26
Xinluzao 26
新陆早 8号(1304)变异株
Xinluzao 8 (1304) variation plant
天合种业
Tianhe Seed Industry
新陆早 27
Xinluzao 27
早熟抗病 7147×贝尔斯诺
Zaoshukangbing 7147×Beiersinuo
康地种业
Kangdi Seed Industry
新陆早 28
Xinluzao 28
85-57×(贝尔斯诺+西南农大抗病, 优质, 丰产材料混合花粉)
85-57×(Beiersinuo +Southwest Agricultural University mixture
pollen with resistant disease, high quality and high yield)
惠远公司
Huiyuan Company
新陆早 29
Xinluzao 29
中棉所、辽棉所、河南省农科院等单位引试验品种(系)混播选育
Testing cotton varieties (or lines) mixed seeding breeding from
Institute of Cotton Research of CAAS, Institute of Economic
Crop of LAAS, and Henan Academy of Agricultural Sciences
金博种业
Jinbo Seed Industry
新陆早 30
Xinluzao 30
中棉所、辽棉所、河南省农科院等单位引试验品种(系)混播选育
Testing cotton varieties (or lines) mixed seeding breeding from
Institute of Cotton Research of CAAS, Institute of Economic
Crop of LAAS, and Henan Academy of Agricultural Sciences
金博种业
Jinbo Seed Industry
新陆早 31
Xinluzao 31
(新陆早 6号×贝尔斯诺) F1×岱子棉
(Xinluzao 6×Beiersinuo) F1×Daizimian
万氏种业
Wanshi Seed Industry
新陆早 32
Xinluzao 32
拉玛干 77变异株病圃系选
Lamagan 77 variant plant from disease nursery
新疆农垦科学院
Xinjiang Land Reclamation Academy of Sciences
新陆早 33
Xinluzao 33
石选 87变异株病圃系选
Shixuan 87 variant plant from disease nursery
新疆农垦科学院
Xinjiang Land Reclamation Academy of Sciences
新陆早 34
Xinluzao 34
早熟系 97-65×7003
Zaoshuxi 97-65×7003
康地种业
Kangdi Seed Industry
新陆早 35
Xinluzao 35
[(新陆早 3号×中 2621) ×抗 35]×97-185
[(Xinluzao 3×Zhong 2621) ×Kang 35]×97-185
农七师农业科学研究所
Nongqishi Agricultural Institute
第 12期 聂新辉等: 新陆早棉花品种 DNA指纹图谱的构建及遗传多样性分析 2117
(续附表)
品种
Variety
系谱
Pedigree
品种选育单位
Released institution
新陆早 36
Xinluzao 36
新陆早 8号×抗病品系 BD103
Xinluzao 8×Resistant disease line BD103
农八师农业科学研究所
Nongbashi Agricultural Institute
新陆早 37
Xinluzao 37
(辽 83421×系 5)×(辽 9001+系 5+自育 90-5)
(Liao 83421×Line 5)×(Liao 9001+ Line 5+ self-breeding 90-5)
农五师农业科学研究所
Nongwushi Agricultural Institute
新陆早 38
Xinluzao 38
[(92-226×中 6331)×中 17]×97-145
[(92-226×Zhong 6331)×Zhong 17]×97-145
农七师农业科学研究所
Nongqishi Agricultural Institute
新陆早 39
Xinluzao 39
(新陆早 4号×贝尔斯诺) ×岱字棉
(Xinluzao 4×Beiersinuo)×Daizimian
万氏种业
Wanshi Seed Industry
新陆早 40
Xinluzao 40
97-185×(D256×sw2) F2
新疆农垦科学院
Xinjiang Land Reclamation Academy of Sciences
新陆早 41
Xinluzao 41
高代材料 17-79系选
17-79 line from high generation
富全新科
Fuquanxinke
新陆早 42
Xinluzao 42
新陆早 10×97-6-9
Xinluzao 10×97-6-9
新疆农垦科学院
Xinjiang Land Reclamation Academy of Sciences
新陆早 45
Xinluzao 45
新陆早 13×9941
Xinluzao 13×9941
新疆农垦科学院
Xinjiang Land Reclamation Academy of Sciences
新陆早 46
Xinluzao 46
系 9×抗病 822
Line 9×Resistant disease 822
农八师农业科学研究所
Nongbashi Agricultural Institute
新陆早 47
Xinluzao 47
(中 17×9001)×97-185
(Zhong 17×9001)×97-185
农七师农业科学研究所
Nongqishi Agricultural Institute
新陆早 48
Xinluzao 48
石选 87×优系 604
Shixuan 87× Elite line 604
惠远公司
Huiyuan Company
新陆早 49
Xinluzao 49
9765 ×新陆早 16
9765 ×Xinluzao 16
农七师农业科学研究所
Nongqishi Agricultural Institute
新陆早 50
Xinluzao 50
新陆早 13×Y-605
Xinluzao 13 ×Y-605
新疆农业科学院
Xinjiang Academy of Agricutural Sciences
新陆早 51
Xinluzao 51
新陆早 10×97-6-9×垦 0074
Xinluzao 10×97-6-9×Ken 0074
新疆农垦科学院
Xinjiang Land Reclamation Academy of Sciences
新陆早 52
Xinluzao 52
硕丰 1号优系 4004×早 28选系
Shuofeng 1 4004×Zao 28 breeding line
硕丰种业
Shuofeng Seed Industry
新陆早 53
Xinluzao 53
石选 87×新陆早 9号
Shixuan 87×Xinluzao 9
新疆农垦科学院
Xinjiang Land Reclamation Academy of Sciences
新陆早 54
Xinluzao 54
新陆早 11×中棉所 12
Xinluzao 11×Zhongmiansuo 12
金宏祥高科农业股份有限公司
Jinhongxiang High-Tech Agriculture Co.