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Genetic diversity of Chuanmingshen violaceum by SRAP markers

川明参种质资源遗传多样性的SRAP分析



全 文 :中草药 Chinese Traditional and Herbal Drugs 第 47 卷 第 11 期 2016 年 6 月

• 1943 •
川明参种质资源遗传多样性的 SRAP 分析
杨玉霞,胡 平,夏燕莉,周先建,张 美,曹 柳,郭俊霞
四川省中医药科学院,四川 成都 610041
摘 要:目的 利用 SRAP 分子标记技术对川明参 Chuanmingshen violaceum 种质资源进行遗传多样性研究,为不同来源的
川明参亲缘关系及其优良种质资源的筛选提供依据。方法 采集 5 个不同生态区域的 63 份川明参种质资源,利用 SRAP 分
子标记构建其 DNA 指纹图谱,从分子水平检测其遗传多样性。结果 37 对 SRAP 引物组合共得到 374 条扩增条带,其中有
283 条呈现多态性,占 75.67%。供试材料的遗传相似系数的变化范围 0.726 7~0.923 9,平均值为 0.815 0,整个群体的遗传
相似程度差异较大。基于 SRAP 的聚类分析可将 63 份材料完全分开,并划分为 7 类,聚类结果与材料的地理分布有一定关
系,来源于阆中和金堂的材料多样性相对较为丰富。结论 川明参种质资源在分子水平上确实存在较大遗传差异,SRAP 分
子标记是评价川明参资源遗传多样性的有效方法。
关键词:川明参;SRAP 分子标记;遗传多样性;聚类分析;种质资源
中图分类号:R282.12 文献标志码:A 文章编号:0253 - 2670(2016)11 - 1943 - 07
DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2016.11.022
Genetic diversity of Chuanmingshen violaceum by SRAP markers
YANG Yu-xia, HU Ping, XIA Yan-li, ZHOU Xian-jian, ZHANG Mei, CAO Liu, GUO Jun-xia
Sichuan Academy of Traditional Chinese Medicine Sciences, Chengdu 610041, China
Abstract: Objective In order to correctly identify the different germplasm resources of Chuanmingshen violaceum and gain
the excellent germplasm resources, SRAP molecular marker was used to analyze the genetic diversity of C. violaceum. Methods
C. violaceum was collected from seven different areas, which included 24 samples, the DNA fingerprint of C. violaceum was
constructed with SRAP molecular marker, and the genetic diversity was analyzed. Results Totally 374 bands were amplified by
37 primer pairs, of which 283 bands were polymorphic, and the polymorphic percentage was 75.67%. The SRAP-based genetic
similarity coefficient of all samples ranged from 0.726 7 to 0.923 9, with a mean of 0.815 0. The analysis of molecular variance
showed higher percentages of genetic variation within population. All the accessions could be distinguished by SRAP markers.
The cluster analysis results showed that 63 accessions were classified into seven groups, which were correlated with the
geographical distribution of the accessions to some degree. The accessions from Langzhong and Jintang had higher diversity.
Conclusion There actually exists plentiful genetic diversity among the genetic resources of C. violaceum. SRAP marker is a
useful method for analyzing the genetic diversity among C. violaceum accessions.
Key words: Chuanmingshen violaceum Sheh et Shan.; SRAP molecular marker; genetic diversity; cluster analysis; germplasm resource

川明参俗称明参或明沙参,为伞形科川明参属
植物川明参 Chuanmingshen violaceum Sheh et Shan
的干燥根,是中国特有的单种属植物,亦是四川道
地药材,具有润肺化痰、和胃、生津、解毒等功效,
为滋阴要药[1],主产于四川阆中、巴中、苍溪、金堂
等地,近年来种植面积呈逐年增加趋势,经济效益
十分显著。但由于长期以来农户自选、自繁而不加
选择,导致各地川明参种源十分混杂、种性退化严
重。目前对川明参的研究多侧重于有效成分[2-9]、药
理作用[10-11]及其与明党参的系统演化关系[12-14]等方
面,对其遗传多样性研究至今未见报道。因此,对
川明参资源进行广泛调查和收集,研究其生物学特

收稿日期:2015-09-14
基金项目:四川省科技厅科技支撑计划(2013SZ0114);四川省中医药管理局应用基础研究项目(2012-E-054);四川省省级公益性科研院所基
本科研业务专项(A-2011N-35,A-2010N-39)
作者简介:杨玉霞(1980—),女,副研究员,主要从事中药材遗传育种、资源评价与利用等研究。
Tel: (028)85255011 E-mail: yangyuxia-7@163.com
中草药 Chinese Traditional and Herbal Drugs 第 47 卷 第 11 期 2016 年 6 月

• 1944 •
性、亲缘关系和遗传多样性已成为其资源保护与利
用的首要任务,而遗传多样性研究是资源保护和有
效利用的关键环节。
相 关 序 列 扩 增 多 态 性 ( sequence-related
amplified polymorphism,SRAP)分子标记针对基
因组中的特殊序列设计引物,同时使用较高退火
温度和较长的引物,不仅重复性高、稳定性好,
且具有无需预知受试基因组 DNA 序列、多态性
和信息量丰富等特点[15],已广泛应用于多种药用
植物种质资源遗传多样性的研究[16-20]。本实验以
具代表性的 63 份川明参种质资源为材料,利用
SRAP 分子标记技术研究其遗传多样性,可为川
明参种质资源的合理利用及新品种选育提供一定
参考。
1 材料与方法
1.1 材料
样品主要采自川明参主产区四川阆中、广元、
巴中、金堂和青白江各乡镇(表 1)。经四川省中医
药 科 学 院 舒 光 明 研 究 员 鉴 定 为 川 明 参
Chuanmingshen violaceum Sheh et Shan。
表 1 供试材料及来源
Table 1 Name and source of materials in this study
序号 来源 资源类型 叶型 序号 来源 资源类型 叶型
1 阆中五马乡川明参选种地 栽培 宽叶 33 巴中巴州渔溪镇太吉村 栽培 宽叶
2 阆中五马乡川明参选种地 栽培 宽叶 34 巴中巴州酒店乡方池垭 栽培 细叶
3 阆中五马乡川明参选种地 栽培 宽叶 35 巴中巴州酒店乡凤鸣村 栽培 细叶
4 阆中五马乡川明参选种地 栽培 宽叶 36 巴中巴州酒店乡太阳村 1 组 栽培 细叶
5 阆中五马乡川明参选种地 栽培 宽叶 37 巴中巴州酒店乡凌云村 1 组 栽培 细叶
6 阆中五马乡川明参选种地 栽培 宽叶 38 巴中巴州酒店乡凌云村 1 组 栽培 细叶
7 阆中五马乡川明参选种地 栽培 宽叶 39 成都金堂赵镇云顶村 8 组 栽培 细叶
8 阆中五马乡川明参选种地 栽培 宽叶 40 成都金堂赵镇云顶村 11 组 栽培 细叶
9 阆中五马乡川明参选种地 栽培 宽叶 41 成都金堂赵镇云顶寺 栽培 宽叶
10 阆中五马乡川明参选种地 栽培 细叶 42 成都金堂赵镇云顶寺 栽培 宽叶
11 阆中五马乡川明参选种地 栽培 细叶 43 成都金堂赵镇云顶寺 栽培 细叶
12 阆中五马乡川明参选种地 栽培 细叶 44 成都金堂淮口镇团结村 12 组 栽培 宽叶
13 阆中五马川明参良种繁育基地 栽培 细叶 45 成都金堂淮口镇团结村 12 组 栽培 宽叶
14 阆中五马川明参良种繁育基地 栽培 细叶 46 成都金堂淮口镇光荣村 6 组 栽培 宽叶
15 阆中峰占乡园宝岭村 4 组 栽培 宽叶 47 成都金堂淮口镇光荣村 6 组 栽培 宽叶
16 阆中峰占乡园宝岭村 7 组 栽培 宽叶 48 成都金堂淮口镇光荣村 6 组 野生 宽叶
17 阆中峰占乡大垭村 1 组 栽培 宽叶 49 成都金堂淮口镇光荣村 6 组 栽培 宽叶
18 阆中峰占乡红瓦村 3 组 栽培 宽叶 50 成都金堂淮口镇光荣村 6 组 栽培 宽叶
19 阆中鹤峰乡川主庙村 7 组 栽培 宽叶 51 成都青白江清泉镇牌坊村 3 组 栽培 宽叶
20 阆中三庙乡重石村 野生 宽叶 52 成都青白江清泉镇牌坊村 3 组 栽培 宽叶
21 阆中三庙乡重石村 野生 宽叶 53 成都青白江清泉镇红岩村 10 组 栽培 宽叶
22 阆中三庙乡重石村 野生 宽叶 54 成都青白江清泉镇红岩村 10 组 栽培 宽叶
23 阆中三庙乡罗汉山村 野生 宽叶 55 成都青白江清泉镇桔丰村 6 组 栽培 宽叶
24 广元苍溪分水岭村 栽培 细叶 56 成都青白江清泉镇桔丰村 6 组 栽培 宽叶
25 广元苍溪九镇乡 栽培 宽叶 57 成都青白江清泉镇桔丰村 6 组 半野生 细叶
26 广元苍溪九镇乡 野生 宽叶 58 成都青白江清泉镇桔丰村 6 组 半野生 细叶
27 广元苍溪龙山镇龙角村 3 组 栽培 细叶 59 成都青白江清泉镇桔丰村 6 组 半野生 细叶
28 广元苍溪龙山镇印池村 4 组 栽培 细叶 60 成都青白江人和乡三元村 16 组 栽培 细叶
29 广元苍溪龙山镇新场村 3 组 栽培 宽叶 61 成都青白江人和乡三元村 16 组 栽培 细叶
30 广元苍溪龙山镇真人庙 栽培 宽叶 62 成都青白江人和乡三元村 14 组 栽培 细叶
31 广元苍溪龙山镇文柏村 栽培 宽叶 63 成都青白江人和乡三元村 14 组 栽培 细叶
32 巴中巴州渔溪镇太吉村 栽培 宽叶
中草药 Chinese Traditional and Herbal Drugs 第 47 卷 第 11 期 2016 年 6 月

• 1945 •
1.2 DNA 提取
DNA 提取采用 CTAB 法[21]略加改动。同一居
群取多株鲜叶混合提取 DNA。
1.3 引物设计和筛选
参考 Li 等[15]已发表的引物并由上海生工生
物工程有限公司合成,所用引物序列见表 2。选
取 3 份具有代表性的材料(3、26 和 59 号)对 156
对引物组合进行筛选,从中选出 37 对多态性高、
条带清晰、扩增稳定的引物组合对全部材料进行
PCR 扩增。
1.4 反应体系和扩增程序
SRAP 反应体系:总体积 25 μL,内含 10×PCR
buffer 2.5 μL,MgCl2 2.0 mmol/L,dNTPs 200 μmol/L,
上、下游引物各 0.2 μmol/L,Taq DNA 聚合酶 1 U,模
板 DNA 40 ng,其余用 ddH2O 补足,1 滴矿物油覆
盖。SRAP 扩增程序:采用复性变温法,共 40 个循
环,即 94 ℃预变性 5 min;前 5 个循环:94 ℃变性
1 min,35 ℃退火 1 min,72 ℃延伸 1.5 min;后 35 个
循环:94 ℃变性 1 min,50 ℃退火 1 min,72 ℃延伸
1 min;循环结束后 72 ℃延伸 10 min,4 ℃保存。
1.5 扩增产物的检测
PCR 反应结束后向扩增产物中加入 6×loading
buffer,在含有 0.01%溴化乙锭(EB)的 2.5%琼脂
糖凝胶,1×TAE 的缓冲液中电泳(电压 5 V/cm)。
用 BIO-RAD 公司的凝胶成像系统对凝胶板检测并
照相、分析。
表 2 所用 SRAP 引物名称与序列
Table 2 Names and sequences of SRAP primers used in this study
名称 正向引物序列 (5’→3’) 名称 正向引物序列 (5’→3’) 名称 反向引物序列 (5’→3’)
Me1 TGAGTCCAAACCGGATA Me15 CAAATGTGAACCGGATA Me40 TGAGTCCAAACCGGTCT
Me2 TGAGTCCAAACCGGAGC Me17 TGAGTCCAAACCGGGTA Me41 AGCGAGCAAGCCGGTGG
Me3 TGAGTCCAAACCGGAAT Me18 TGAGTCCAAACCGGGGT Me42 TGAGTCCTTTCCGGTAA
Me4 TGAGTCCAAACCGGACC Me19 TGAGTCCAAACCGGCAG Me47 GACCAGTAAACCGGATG
Me5 TGAGTCCAAACCGGAAG Me21 CAGGACTAAACCGGATA Em1 GACTGCGTACGAATTAAT
Me6 TGAGTCCAAACCGGTAA Me24 CTTACTTAGACCGGAGT Em2 GACTGCGTACGAATTTGC
Me7 TGAGTCCAAACCGGTCC Me32 TGAGTCCAAACCGGAAA Em3 GACTGCGTACGAATTGAC
Me8 TGAGTCCAAACCGGTGC Me34 TGAGTCCAAACCGGCAC Em4 GACTGCGTACGAATTTGA
Me9 TGAGTCCAAACCGGTAG Me35 TGAGTCCAAACCGGAAC Em5 GACTGCGTACGAATTAAC
Me10 TGAGTCCAAACCGGTTG Me37 TGGGGACAACCCGGCTT Em6 GACTGCGTACGAATTGCA
Me12 TGAGTCCAAACCGGTCA Me38 CTGGCGAACTCCGGATG

1.6 数据处理
每份材料电泳条带按有或无记录,采取 0/1 赋
值,电泳条带清晰存在时赋值为“1”,否则赋值为
“0”,泳道缺失记为 9。用 NTSYS-PC(version 2.10)
软件系统计算材料间遗传相似系数(GS)。根据 GS
值按不加权成对群算术平均法( UPGMA ,
unweighted pair group method with arithmetic means
cluster analysis)进行遗传相似性聚类,绘制树状聚
类图。
2 结果与分析
2.1 川明参 SRAP 扩增结果
从 156 对引物组合中筛选出多态性好且条带丰
富的 37 对引物组合,对 63 份川明参种质进行 PCR
扩增,共产生 374 条清晰条带,其中多态性条带 283
条,多态性比率达到 75.67%(表 3),平均每对引
物组合产生 7.65条多态性带。引物组合Me5+Em1、
Me2+Em3 扩增带最多,均为 16 条,Me34+Em2
扩增带最少,仅为6条。扩增片段大小在 200~1 500
bp,图 1 为引物组合 Me38+Em2 对 63 份供试材料
的扩增结果。
2.2 供试材料的遗传多样性与遗传差异
利用 37 对引物组合所得的 374 条扩增条带,计
算供试材料间的 GS。结果表明,来自阆中五马川
明参良种繁育基地的 13、14 材料间 GS 值最大,为
0.923 9,遗传差异最小;来自阆中五马川明参选种
地的材料3与来自成都金堂淮口镇团结村12组的材
料 45 间 GS 值最小,为 0.726 7,遗传差异最大,
63 份材料的平均 GS 值为 0.815 0。
中草药 Chinese Traditional and Herbal Drugs 第 47 卷 第 11 期 2016 年 6 月

• 1946 •
表 3 37 对引物组合的 SRAP 扩增结果
Table 3 Amplified results of SRAP with 37 pairs of primers
引物组合 总带数 多态性带数 多态性比率/% 引物组合 总带数 多态性带数 多态性比率/%
Me5+Em1 16 16 100.00 Me41+Em2 10 9 90.00
Me6+Em1 15 12 80.00 Me42+Em2 7 5 71.43
Me7+Em1 8 7 87.50 Me47+Em2 12 10 83.33
Me9+Em1 10 9 90.00 Me2+Em3 16 12 75.00
Me10+Em1 12 7 58.33 Me8+Em3 9 9 100.00
Me15+Em1 9 6 66.67 Me9+Em3 11 7 63.64
Me17+Em1 9 7 77.78 Me10+Em3 12 12 100.00
Me18+Em1 7 4 57.14 Me1+Em4 8 4 50.00
Me19+Em1 8 7 87.50 Me2+Em4 10 7 70.00
Me21+Em1 8 5 62.50 Me6+Em4 8 4 50.00
Me24+Em1 9 7 77.78 Me9+Em4 9 3 33.33
Me32+Em1 8 6 75.00 Me4+Em5 12 10 83.33
Me28+Em2 14 12 85.71 Me6+Em5 10 8 80.00
Me32+Em2 10 6 60.00 Me12+Em5 12 11 91.67
Me34+Em2 6 5 83.33 Me3+Em6 10 7 70.00
Me35+Em2 13 11 84.62 Me5+Em6 10 7 70.00
Me37+Em2 11 7 63.64 Me6+Em6 7 5 71.43
Me38+Em2 10 4 40.00 Me7+Em6 8 6 75.00
Me40+Em2 10 9 90.00 合计 374 283 75.67


M-Marker 1~63-样品编号与表 1 相同,下同
M-Marker 1—63-numbers from 1 to 63 stand for the strains in Table 1, same as below
图 1 引物组合 Me38+Em2 对 63 份川明参的扩增结果
Fig. 1 SRAP amplification profiles of 63 C. violaceum with primer combinations of Me38 + Em2
2.2.1 不同产地材料的遗传差异 5 个产地内
和产地间 GS 的平均值见表 4。从表 4 可看出,
5 个产地内 GS 平均值的变化范围为 0.807 7~
0.857 4,平均值为 0.830 2。巴中材料平均 GS
值最大,阆中材料 G S 平均值最小,表明阆中
材料的遗传分化程度较大,遗传多样性较丰富,
3 000 bp
1 500 bp
1 000 bp
500 bp
400 bp
300 bp
200 bp
3 000 bp
1 500 bp
1 000 bp
500 bp
400 bp
300 bp
200 bp
3 000 bp
1 500 bp
1 000 bp
500 bp
400 bp
300 bp

M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24
M 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48
M 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63
中草药 Chinese Traditional and Herbal Drugs 第 47 卷 第 11 期 2016 年 6 月

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表 4 基于 SRAP 标记的川明参产地内和产地间 GS 的平均值
Table 4 Means of inter-different areas and intra-different areas GS of C. violaceum accessions based on SRAP marker
产地 阆中 苍溪 巴中 金堂 青白江
阆中 0.807 7
苍溪 0.813 2 0.825 8
巴中 0.816 3 0.830 8 0.857 4
金堂 0.810 3 0.819 4 0.832 0 0.829 3
青白江 0.802 2 0.811 2 0.823 8 0.819 2 0.830 9

巴中材料亲缘关系较近,遗传变异程度较小。5
个产地间 GS 平均值的变化范围为 0.802 2~
0.832 0,平均值为 0.817 8。除巴中-苍溪、巴中-
金堂材料间 GS 平均值较大外,其余各产地间
GS 平均值比较接近。其中,巴中-金堂材料间平
均 GS 值最大,阆中-青白江的最小,表明阆中-
青白江材料间遗传差异最大,巴中-金堂材料间
遗传差异最小。综合产地内和产地间 GS 分析发
现,各产地间 GS 的平均值均小于各产地内的
GS 平均值,说明各产地川明参产地间的遗传分
化程度大于产地内的。
2.2.2 不同资源类型和叶型材料的遗传差异 本实
验共收集到 63 份川明参种质资源,包括 54 份栽培
材料和 9 份野生或半野生材料;按照叶型又可分为
41 份宽叶型材料和 22 份细叶型材料。不同资源类
型和叶型材料的遗传差异。
分析结果表明,栽培川明参材料的 GS 平均值
为 0.812 6,低于野生或半野生材料的 0.834 8,而栽
培和野生或半野生材料间的 GS 平均值介于两者之
间,为 0.820 8。这一结果表明,栽培材料的遗传差
异较野生或半野生材料的大。宽叶和细叶材料间及
其材料内 GS 平均值接近,表明不同叶型材料的遗
传差异较小。
2.3 川明参居群的 UPGMA 聚类分析
基于 GS 矩阵,利用 UPGMA 法进行聚类分析
(图 2)。结果表明,利用 SRAP 标记能将 63 份材料
完全分开。以 GS 值 0.808 0 为阈值可将所有材料分
为 7 大类,第 1 类包括阆中的材料 1、金堂的材料
48 共 2 份材料。第 2 类全部来自青白江清泉镇桔丰
村 6 组,包括 55、56 及 59 等 5 份材料。第 3 类包
括材料 2、5 及 63 等 49 份,其中,阆中 19 份、苍
溪 7 份、巴中 7 份、金堂 10 份、青白江 6 份。其中
来自阆中五马川明参良种繁育基地的 13、14 遗传分
化最小,紧密地聚为一类。第 4 类包括苍溪九镇的
26、阆中五马川明参选种地的 11 共 2 份材料。第 5
类由青白江的 52、54 及金堂的 45 共 3 份材料组成。
来自阆中五马川明参选种地的 4、3 各成一类。
以 GS 值 0.082 2 为阈值又可将第 3 类分成 6 个
亚类。其中 III-1、III-2、III-3 和 III-6 除 24、25 来
自广元苍溪外,其余 13 份材料均来自阆中;III-4
由 7、12 及 63 等 33 份材料组成,其中,阆中 6 份、

图 2 基于 SRAP 遗传相似系数的聚类图
Fig. 2 Dendrogram of C. violaceum in study based on SRAP
genetic similarity
1
48
55
56
57
58
59
2
5
6
8
9
24
25
23
10
20
21
7
53
60
61
62
63
51
44
22
12
39
40
41
42
43
46
50
32
33
34
35
29
30
31
15
28
37
38
27
47
36
16
17
49
18
19
13
14
26
11
52
54
45
4
3
0.787 0.822 0.856 0.890 0.924
I
II
III-1
III-2
III-3

III-5
III-6
V
IV
VI
VII
III-4
III
中草药 Chinese Traditional and Herbal Drugs 第 47 卷 第 11 期 2016 年 6 月

• 1948 •
苍溪 5 份、巴中 7 份、金堂 9 份、青白江 6 份;来
自金堂的材料 49 自成一亚类。
从聚类图中还可以看出,许多来源相同的材料
聚在一起。如来自青白江清泉镇桔丰村 6 组的 5 份
材料、青白江人和乡三元村的 4 份材料、金堂赵镇
云顶的 5 份材料均先紧密结合在一起。但从材料来
源分析看,除第 2、5 类以外,阆中的 23 份材料在
各类中均有分布。苍溪的 8 份材料、巴中的 7 份材
料、金堂的 12 份材料及青白江的 13 份材料均在不
同大类中呈分散分布。9 份野生或半野生的材料分散
在不同大类中,宽叶和细叶亦呈分散状态,此结果
从另一角度证明了川明参的地理生态型确实存在。
3 讨论
3.1 SRAP分子标记研究川明参种质资源遗传多样
性的可靠性
前人对川明参遗传关系的研究仅限于对明党参
与川明参种间的遗传分化和系统关系的研究亦或是
对川明参属亲缘关系及其分类地位的研究[12-14],而
纯粹对川明参种质资源的遗传多样性及亲缘关系的
研究尚是空白。本研究采用 SRAP 标记对不同产地
有代表性的川明参种质资源进行研究,并从 37 对
SRAP引物组合共扩增出川明参多态性条带 283条,
平均每对引物 7.65 条,表明川明参的遗传多样性较
为丰富。由此表明,本研究建立的 SRAP 标记体系
是分析川明参种质资源多样性比较可靠的工具。本
研究结果表明川明参栽培种质资源的遗传差异较野
生或半野生材料的大,究其可能的原因,一是由于
川明参栽培历史悠久、栽培范围较广,且在栽培过
程中存在人为引进野生种质和各地之间相互引种等
现象。据《苍溪县志》(1783 年)《保宁府志》《巴
中县志》记载,川明参已有 300 多年的人工栽培历
史。在长期的生产实践中,药农们常常会在栽培群
体中人为地引入野生种,从而在很大程度上丰富了
川明参栽培群体的遗传多样性;当前川明参栽培过
程中普遍存在异地引种现象,各地间的相互引种也
可能是栽培川明参居群维持高水平遗传多样性的重
要原因。其次,由于过度采挖,野生川明参居群面
积缩小、个体数减少和生境退化造成个体间或居群
间基因交流障碍,形成基因隔离,同时也增加了遗
传漂变和近交机率,而小居群比大居群更易发生遗
传漂变和近交,引起遗传多样性的丢失,居群内近
交衰退,造成川明参野生或半野生居群遗传多样性
降低。再次,川明参传粉媒介主要是蜂类,而异交
和接触性传粉被认为是植物保持较高遗传多样性的
原因之一[22],而野生或半野生川明参主要生长在光
照较少的灌木丛中,并不利于传粉,这也可能导致
其遗传多样性水平比栽培居群的低。
3.2 川明参种质资源聚类结果与地理分布的关系
Wilson 等[23]认为种质的地理分布与分子标记
间存在相关性,在苜蓿[24]、狗牙根[25]、白三叶[26]
等草坪草和牧草上的遗传分析也证实了来自相似地
理环境的种质可以优先聚为一类。
从本实验的聚类分析看,SRAP 标记能将所有
供试材料完全区分,聚类结果能够在一定程度上反
映材料的地理来源,许多相同地理来源的材料能聚
在一起。如来自青白江清泉镇桔丰村的 5 份材料、
青白江人和乡三元村的 4 份材料、金堂赵镇云顶的
5 份材料均先紧密结合在一起。对 5 个不同地理区
域川明参群体间的遗传距离和遗传相似系数分析表
明,同一地域的川明参材料间遗传距离较小,亲缘
关系较近,而不同地域川明参资源群体间遗传变异
相对较大,遗传多样性较高,这可能与地区间气候
环境差异、物种的适应性变化及人为选择目标不同
有关。这亦说明川明参在某一生态环境下,经过长
期人工选择和改良后,在遗传结构上发生了能够区
别于其他地域的变异。这对以后制定川明参资源遗
传多样性的原位保护措施、保护范围、保护地点,
以及遗传多样性的考察收集提供了重要参考,也为
川明参品种改良及发掘新的优良基因提供了依据。
3.3 川明参叶型和 SRAP 遗传多样性的相关性
川明参从叶型上可分为宽叶和细叶 2 种类型。本
研究聚类结果表明,宽叶和细叶呈分散状态,聚类结
果与叶型并无明显的相关性。Zhang 等[27]的研究亦发
现杨梅种质资源的分类与果实大小、果实颜色等并无
明显的相关性,这亦表明从 DNA 角度进行的品种鉴
定相比于形态学角度更具有客观性和科学性。
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