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Authentication of Pinellia pedatisecta and their adulterants by AS-PCR

利用等位基因特异PCR鉴别虎掌南星及其部分混淆品



全 文 :·研究论文·
利用等位基因特异 PCR鉴别虎掌南星
及其部分混淆品
崔光红1,唐晓晶1,黄璐琦1,钱忠直2
(1.中国中医科学院 中药研究所,北京 100700;2.国家药典委员会,北京 100061)
[摘要] 目的:建立中药材虎掌南星的分子鉴定方法,为天南星药材质量控制提供依据。方法:GenBank中下
载半夏属、天南星属、犁头尖属物种的叶绿体rpl20基因序列,利用DNAMAN进行比对分析,发现半夏属和虎掌南
星的SNP位点,并设计鉴别引物 Ptrpl94F,Ptrpl708R和 Pprpl148F,Pprpl484R,采用等位基因特异 PCR方法对虎掌
南星、半夏、水半夏3个物种的10个样品进行扩增。结果:引物Pprpl148F和Pprpl484R仅对虎掌南星扩增333bp
条带,半夏、水半夏均无扩增,能准确鉴别虎掌南星。引物Ptrpl94F和Ptrpl708R对半夏、虎掌南星均扩增611bp条
带,水半夏无扩增。结论:本实验建立的等位基因特异PCR方法能准确区别出虎掌南星和半夏、水半夏,为虎掌南
星及半夏的正确用药提供了保障。
[关键词] 虎掌南星;半夏;水半夏;等位基因特异PCR
[中图分类号]R282.5 [文献标识码]A [文章编号]10015302(2008)10110903
[收稿日期] 20070831
[基金项目] 国家重点基础研究发展计划(2006CB504700)
[通讯作者]  黄璐琦,Tel:(010)640144112955,Email:
huangluqi@263.net
  虎掌南星是天南星科半夏属植物掌叶半夏
PineliapedatisectaSchot的干燥块茎,又称滇半夏、虎
掌、独角莲,具有祛风定惊、化痰散结的功能[1]。在河
南、陕西、山东、江苏等地均有大量栽培,是中药天南
星的主要来源之一[2,3]。天南星药材的来源复杂,种
类繁多,除虎掌南星及药典收载的天南星属的3种植
物[4]外,还有天南星属、犁头尖属以及半夏属(滴水珠
P.cordata、盾叶半夏P.peltata等)多种植物的块茎
作药用,个别地区还误用魔芋属植物的块茎[2]。同
时,由于半夏P.ternata(Thunb.)Breit.野生资源的急
剧减少以及栽培品种的变异,使得虎掌极易冒充半夏
出售[5]。因此,从药材来源上准确地鉴别虎掌南星对
于保证天南星和半夏的临床使用都具有重要的意义。
目前,已有薄层色谱鉴别[6]、制南星HPLC指纹图谱
的研究[7]。随着分子标记技术在中药材鉴定中的应
用,曹晖等应用18SrRNA基因测序技术已能正确地
鉴别出虎掌和半夏[8]。为了克服基因测序技术高成
本的缺陷,本实验通过寻找半夏属、天南星属、犁头尖
属叶绿体rpl20基因中相关的单核苷酸多态性位点
设计了虎掌南星的特异引物,利用等位基因特异PCR
方法(alelicspecificpolymerasechainreaction,AS
PCR)[9]得到了虎掌南星特异的分子标记,为半夏、虎
掌南星的准确入药提供保障。
1 材料
样品包括3批虎掌南星、5批不同产地半夏药
材及2批水半夏(表1)。所有样品均经中国中医科
学院中药研究所何希荣主管技师以及中国药品生物
制品检定所张继研究员鉴定。样品存放于中国中医
科学院中药研究所标本室。
2 方法
2.1 药材DNA的提取 采用改进的CTAB法提取
药材总DNA[10]。
2.2 虎掌南星叶绿体 rpl20基因中 SNP的发现和
鉴别引物的设计 GenBank下载半夏属虎掌南星
(AY279170)、半 夏 (AY248931)、滴 水 珠
(AY248930)、盾叶半夏(AY279171)以及天南星属
黄苞南星Arisaemaflavum(AY388620)、犁头尖属独
角莲Typhoniumgiganteum(AY248938)、马蹄犁头尖
T.trilobatum(AY248941)的叶绿体 rpl20基因序
列,经 DNAMAN软件比对分析,发现虎掌南星167
bp处为G,其他种均为 T;466bp处虎掌为 T,其他
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    中 国 中 药 杂 志
ChinaJournalofChineseMateriaMedica
       
Vol.33,Issue 10
May,2008
   表1 虎掌南星及半夏药材产地、收集人和收集时间
No. 药材 原植物 产地 收集人 收集时间
1 半夏   半夏 Pineliaternata 四川   马小军 200312
2 半夏   半夏 P.ternata 江苏   秦彩玲 200312
3 半夏   半夏 P.ternata 山东   马小军 200312
4 半夏   半夏 P.ternata 云南   秦彩玲 200312
5 半夏   半夏 P.ternata 安徽   秦彩玲 200312
6 虎掌南星 掌叶半夏 P.pedatisecta 安徽   肖苏萍 200409
7 虎掌南星 掌叶半夏 P.pedatisecta 河北   赫 炎 200210
8 虎掌南星 掌叶半夏 P.pedatisecta 陕西   崔光红 200412
9 水半夏  鞭檐犁头尖 Typhoniumflageliforme 广西玉林 魏建和 200410
10 水半夏  鞭檐犁头尖 T.flageliforme 河北安国 魏建和 200410
种均为A。同时,半夏属与天南星属、犁头尖属存在
9个属间SNP位点,如半夏属119,120bp处均为A,
G,而天南星属和犁头尖属的均为 T,A;708bp半夏
属为G,犁头尖属为 C(图1)。根据上述 SNP位点
设计虎掌南星鉴别引物 Pprpl148F和 Pprpl484R以
及半夏属鉴别引物 Ptrpl94F和 Ptrpl708R,原则为将
SNP位点置于引物的3′末端,其他要求与一般引物
设计一致(表2)。 图1 叶绿体rpl20基因中SNP位点及引物设计情况
表2 引物序列、目的产物长度及PCR循环参数
名称 序列 产物长度/bp PCR循环参数
Pprpl148F 5′TTCCCAACCACAATTTTTG3′ 333 94℃30s,65℃1min
Pprpl484R 5′ATGCCGTCACTGTATGGAA3′    
Ptrpl94F 5′CAGATTATTCCGATATATAAAATAAG3′ 611 94℃30s,62℃1min
Ptrpl708R 5′AAGATGTATCATATACCTTACCTC3′    
trnL(UAA) 5′GGTTCAAGTCCCTCTATCCC3′ 402 94℃30s,55℃30s,72℃1min
trnF(GAA) 5′ATTTGAACTGGTGACACGAG3′    
2.3 PCR扩增 PCR反应体系为25μL,其中10
mmol·L-1TrisHCl(pH83),50mmol·L-1KCl,
Mg2+15mmol·L-1,dNTP各015μmol·L-1,Taq
1U(TakaraExTaq),引物各015μmol·L-1,模板
DNA50ng。扩增在ABI9700上进行,程序为94℃
预变性5min,然后不同的引物按照各自的程序进行
40个循环后(表2),72℃延伸5min。同时,用叶绿
体trnL和trnF基因间隔区通用引物对所有样品进
行扩增,以扩增条带的有无检测模板DNA质量。取
5μL反应产物在含 EB的 15%琼脂糖凝胶上电
泳,在SYNGENE型凝胶成像系统下观察、拍照。
3 结果
3.1 模板DNA质量检测结果 以提取的不同产地
虎掌南星、半夏、水半夏药材DNA为模板,用通用引
物trnL(UAA)和 trnF(GAA)进行扩增,结果均得
到420bp左右的片段(图2),表明所用模板质量符
合下游实验要求。
3.2 等位基因特异 PCR扩增结果 引物 Ppr
pl148F和Pprpl484R仅对虎掌南星扩增 333bp条
带,半夏属半夏、犁头尖属水半夏均无扩增(图2),
表明该引物能特异性检出虎掌南星,可作为其分子
标记。
引物Ptrpl94F和Ptrpl708R对半夏属的半夏、虎
掌南星扩增611bp的条带,犁头尖属水半夏无扩增
(图2),表明该引物能特异性的检出半夏属植物,但
不能鉴别半夏及虎掌南星。
4 讨论
GenBank中注册的半夏属、犁头尖属、天南星属
植物DNA序列信息主要为叶绿体 NADH基因、rpl
20基因、trnL内含子和 trnLtrnF非编码区、核糖
体58SrRNA基因及 ITS间隔区。经过比对分析,
发现只有rpl20基因具有虎掌南星的单核苷酸多态
性位点,使得通过等位基因特异PCR能迅速快捷的
鉴别其真伪。但在该序列中却未能找到半夏的特异
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图2 虎掌南星及其混淆品PCR扩增电泳图谱
A.通用引物;B.虎掌南星鉴别引物;C.半夏属鉴别引物
M.DNA分子质量标准;N.阴性对照
位点,使用本实验设计的半夏属鉴别引物,能区分水
半夏等半夏属以外的混淆品,无法对半夏属内虎掌
南星、滴水珠、盾叶半夏等进行区分。而ITS序列中
则能找到半夏特异的位点,从而直接对半夏进行等
位基因特异 PCR鉴别[11],表明植物基因组因其结
构和功能上的差异,进化速率也有所不同,如何选择
  
在种内高度保守,而种间存在差异的单核苷酸多态
性位点是中药材分子鉴定成功的关键。
[参考文献]
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AuthenticationofPineliapedatisectaandtheiradulterantsbyASPCR
CUIGuanghong1,TANGXiaojing1,HUANGLuqi1,QIANZhongzhi2
(1.InstituteofChineseMateriaMedica,AcademyofTraditionalChineseMedicine,Beijing100700,China;
2.PharmacopoeiaCommisionofPeopleRepublicofChina,Beijing100061,China)
[Abstract] Objective:ToestablishamolecularmethodfortheauthenticationofPineliapedatisectaanditsadulterants.Meth
od:DNAsequencesofsomespeciesfromP.tenore,TyphoniumandArisaemaweredownloadedfromGenBank,thesequenceswerea
lignedusingDNAMAN.AlelespecificprimersforP.pedatisectaandP.tenoreweredesignedaccordingtotheirSNPsinrpl20se
quence.Thedesignedprimerswereusedtoamplify10samplesofP.pedatisecta,P.ternataandT.flageliforme.Result:A351bp
bandwasamplifiedfromP.pedatisectabutnotformP.ternataandT.flageliformebyprimerPprpl149FandPprpl484R.A630bp
bandwasamplifiedfromP.ternateandP.pedatisectabutnotfromT.flageliformebyprimerPtrpl94FandPtrpl699R.Conclution:
ASPCRhastheadvantagesofhighlyspecificandgoodreproducibility,bywhichP.pedatisectacanbeidentifiedfrompartofitsadul
terantsquickly.Itisapotentialmethodtobeusedinthemolecularidentificationofothermateriamedica.
[Keywords] Pineliapedatisecta;Pineliaternata;Typhoniumflageliforme;ASPCR
[责任编辑 张宁宁]
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