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发掘Internet上的中草药信息资源



全 文 :· 新药开发纵谈 ·
发掘 In te r n et 上的中草药信息资源
天津大学材料科学与工程学院 (30 0 7 2)崔元璐 .沈 锋 姚康德
摘 要 介绍 了 In t er n et 上 中草药专业网站指南 ,与中草药有关的数据库 ,专业期刊 网络版 和专
业软件 , 并通过在 Int er n et 上解析红外光谱和蛋白质及核酸序列 分析 ,介绍 了网 上辅助中草药鉴
定的方法 。
关祖词 Int er n et 中草药 信息资源
中药研究手段的进步是 中药现代化最重
要的组成部分 。 19 世纪 50 年代以来计算机
技术迅猛地发展 ,并交叉渗透到各学科领域 ,
成为科学研究现代化的重要工具之一 。 Int er -
n et 网络的发展 , 更加快 了信 息传递的速度 ,
它不仅为全球范围内快速传递信息提供了手
段 , 而且其本身已经构成了人类有史 以来最
大的资源和信息系统 。 我国 I nt er en t 人网数
已经超过 了 2 80 万 , 而且仍在迅速地增长着 。
nI et r n et 上有极其 丰富的 中草药相关 资源 ,
中草药研究工作者不仅可 以联网检索各种数
据库获得丰富的文献资料 , 还可 以进行有关
中草药学问题讨论 、 网上中药鉴定 、 网上核酸
与蛋 白质序列分析等工作 。 但是 , I nt er en t 上
的信息资源浩如烟海 , 怎样才能够快速有效
地找到我们所需要的资源呢 ? 笔者拟简要介
绍 I nt er n et 上的中草药相关信息资源及查找
方法 ,并给出各网站的网址 U R L , 以 便上网
查询 。
1 I n t e r n e t 上的专业网站指南
在 I nt er en t 上很多医药专业 网站都提供
了指南性的网页 ,搜集了大量 的相关专业网
址链接提供给读者 , 中草药工作者可 以很方
便地通过这些专业网站指南访问感兴趣的网
络资源 ,不再需要借助于搜 索引攀和其它软
件 , 节省了时间和网络资源 。 主要的中草药网
站指南有 :
1
.
1 中 国 中 医 药 信 息 网 ( h t t p : / / w w w .
ic n ct m
.
a c
.
c n )
: 中国中医 药信 息网是一个 指
南性的网站 , 主要栏 目有 : 科 研机构 、 学术团
体 、 数据库 、 电子刊物 、 图书馆 、 国内传统医学
院校 、 国外传统 医学院校 、 中药生产厂家等 ,
各栏 目中提供 了丰富 的与中草药有 关的链
接 ,可 以方便地找到需要的网页 。
x
.
2 新健康网络 ( h t t p : / / w w w . n e w h e a l t h ·
e o m
. 。 n / f r a m l
.
h t m )
: 新健 康网络是 深圳市
卫生局与深圳市医学信息所共同创办的医药
专业 网站 ,每 天更新 。 其 中与 中草药相关的
有 : 卫生行 政 、 政策 法规 、 医 药行业 、 医学 刊
物 、 医科大学 、 医学组织等栏 目 , 在这些栏 目
中提供 了许多与中医药有关的链接 , 访问速
度也非常快 。 另外 ,其 中的 G M P 栏 目 , 提供
了有关 G M P 认证的内容 , 都是近期的资料 。
1
.
3 刘 伯 宇 的 医 药 资 料 大 全 ( ht tP : / /
w w w
.
n e t e a s e
. 。 o m /一 l i u b o y u八n d e x . h t m ) :
这是一个非常有专业水平 的个人主页 , 其 中
的栏 目有管理机构 、 专业协会 、 政策法规 、 资
源查找 、 图书馆 、 文献检索 、 医药期刊 、 医学专
业 、 医药信息 、 研究所 、 医科大学等 , 分门别类
地介绍了许多与 中草药和医药相关 的网址 ,
很有参考价值 。
2 nI et
r n et 上与中草药相关 的数据库
, 崔元璐 男 , 1 9 9 5 年毕业于天津中医学院中药系 , 获医学学士学位 。现在 天津大学材料科学与工程学院生物医学 工程
专业攻读硕士学位 。
《中草药 》 1 9 9 9 年第 3。 卷第 8 期 · 附 3 ·
In t e mt e上有许 多大型 的专业数 据库 ,
可通过网络免 费使用 , 这为我们从事中草药
研究工作提供 了极大的方便 。 我们可在 Web
上进行查询 , 提 出自己感兴趣的一个或几个
关键词 , 并使用逻辑检索方法 ,通过逻辑运算
符 a n d 、 o r 、 n ot 等对关键词进行 限制与组合 ,
从而获得令人满意的返回结果 。 下面将介绍
几个 比较权威并可免费使用的数据库系统 。
2
.
1 科 学数 据库 系统 ( ht tP : 刀 w w w . s d .b
a c
.
c n )
: 科学数据库 系统 ( SD B ) 是在 中科 院
“ 七 . 五 ” , “ 八 · 五 ” 和 “ 九 · 五 ” 期间的重点
工程项 目 “ 科学数据库及其信息系统工程 ” 的
指导下建设的 , 由二十几个学科 , 近百个子库
所组成 , 与 中草药相关的数据库有 中国植物
中草药数据库 、 植物基本信息数据库 、 植物异
名数据库 、 中药信息数据库 、 中药有效成分数
据库 、 中成药数据库等 。该数据库系统分类详
细 、 内容丰富 ,非常便于专业人员使用 。 目前
这个系统可以免费查询 。
2
.
2 中国生 物 医 学 文献 数 据 库 ( h t p : 刀
f l o w e r
·
im i e a m s
.
a e
.
e n )
: 中国生物医学文献
数据库是中国 医学科学院医学信息研究所开
发研制的面向生物医学领域的检索系统 。 这
个数据库收录了 1 9 8 3 年以来近千种 中国生
物 医学期刊以及会议论文 的文献题录 , 总计
约 1 0 8 万篇 ; 内容涉及基础 医学 、 临床医 学 、
预 防医学 、 药学 、 中医学及 中药学 , 以及医院
管理等生物医学的各个领域 。 中国生物医学
文献数据库 目前可 通过 Web 界 面免费进行
查询 。
2
.
3 万 方 数 据 ( h t t p : / / w w w . c h i n a i n f o .
g o v
.
e n )
: 万方数据 系统 ( C h i n a l n f o ) 目前有
6 0 多个数据库供用户检索 , 一部分数据库是
免费的 ,另外一部分数据库收费 ,非授权用户
可以 检索收费数据库全库 , 也可 以 看到所有
检出的记录 ,但看到 的只是这些 记录的部分
字段 , 如果想查 询它的全部 , 可 以交 费注册 ,
取得授权 。 与中草药研究有关的数据库有如
下几个 : 1) 中国科技成果数据库 ,收录数据记
录 1 4 万条 , 是国家指定的科研成果查新数据
. 附 4 .
库 , 它包含中央部委和各省市 申报 的重大成
果适用技术及星火计划成果 。 2) 中国学术会
议论文数据库 , 收录数据记录 17 万条 , 内容
为在国家级学术会议上发表的学术论文 。 3)
中国学位论文数据库 ,收录数据记录 14 . 5 万
条 , 内容为我国博士 、 博士后及硕士研究生论
文 。 4) 中国科技论文与引文数据库 ,收录数据
记录 90 万条 ,是 中国科技信息研究所历年在
开展科技论文统计的基础上开发的大型数据
库 。 数据来源于国内 1 25 0 种主要科技期刊 。
2
.
4 金纬 达 网络 信息 检 索系 统 ( ht tP : / /
g w .d .51
n et
·
cn )
: 由福建省海峡信息科技 中
心制作的金纬达网络信息检索系统拥有非常
丰富的数据库资源 , 目前 已上网的大型中文
数据库有 60 多个 。 其中 ,科技类共有 39 个数
据库 , 与中草药研究相关的有中国专利库 、 学
术会议文库 、 学位 论文数据库 、 生物学文献
库 、 生物医学文献库 、 医学文献库 、 中文科技
期刊库 、 科技论文库 、 科技论文与引文库 、 科
技成果库 、 农林文献库 、 种植业文献库等 。 台
湾系列共 25 个数据库 , 与中草药研究相关的
是 台湾制药产业库 、 台湾医 药卫生文献数据
库 、 台湾中医药教育库 、 台湾 中医药 图书库 、
台湾中医药科研库 、 台湾中医药学位论文库 、
台湾中医药期刊库等 。 这些数据库的数据类
型多样 ,来源权威 , 既有文本数据 , 又有多媒
体和超文本数据 ,具有相当高的学术参考价
值 。 目前海峡信息向用户提供免费服务 , 只需
在 “ 新用户登记 ” 中认真填写有关各项 , 就可
得到一个免费帐号 , 进行各类数据库查询 。
2
.
5 M E D L IN E 数据库 : M E D L I N E 数据库
是美 国国家医学 图书馆 M E D L A R S 系统 中
规模最大 、 权威性最高的著名医药学数据库 ,
它收录了 1 9 6 6 年至今全世界 70 多个 国家出
版的 医学相关期 刊 3 8 0 多种 , 另外还有 图
书专 著等其 它 文献 , 目前 已有 9 2 0 万条 文
献川 。 其中收录的中草药相关文献虽然不多 ,
但都是一些较有影响的刊物上刊登 的文章 ,
很有参考价值 。 M E D L I N E 数据库可 以通过
许多网站进行免费查询 , 向用户提供英文文
摘 。 可免费访 问 M E D L I N E的网站网址为 :
h t t p
:
/ /i g m
.
n l m
.
n ih
.
g o v ;
l、 t t p : / /w w w
.
n e b i
.
n lm
.
n ih
.
g o v ;
h t t P
:
/ /w w w
.
h e a l t h w o r ld
.
e o m

2
.
6化学文摘 (h t t p : / /w w w· e a s .o r g /w e b -
s e a r e h
.
h t m l )[
2〕 :这是美国化学 会的化 学文
摘 (C h e m ie a l A b s t r a e t s S e r v i e e o f t h e A m e r -
i c a n C h e m i e a l S o e i e t y )网站 , 化学文摘 对药
学工作者来说都非常熟悉 。
2
.
7 日 本特 许 厅 ( h t t p : / / 2 1 0 . 1 4 1 . 2 3 6 .
1 9 5 / i n d e x e
.
h t m l )
: 中草药研究工作者经常
会检索 日本专科信息 , 日本特许厅在网站上
提供 日语和英语两种语言的网页 , 在这里读
者可 以方便地获得 日本专利的文摘 。
3 专业期刊网络版
为了适应科学技术的高速发展和快速传
递信息的需求 ,越来越多的专业期刊都在 In -
et r n et 上向读者提供网络版和电子版免费阅
读和查询 ,影响比较大的有如下几个 :
3
.
1 万方数据 ( C h i n a l n f o )的网上科技期刊
(h t t p
:
/ / w w w
.
e h i n a i n f o
.
g o v
.
e n )
: 在这个网
页上收录了包涵 10 多个科技 门类的 1 0 0 多
种核心期刊 , 同步报道公开发行的期刊全文
内容 。 在其中的医药卫生栏 目中 , 收录了全部
的中华医学系列刊物 ,以及中国药学杂志 、 中
草药 、 中国药师 、 中国药物依赖性通报 、 中国
中西医结合杂志等医药专业刊物 。 另外 , 网页
还配有高效的文章查询检索系统 , 可 以 检索
1 9 9 5 年至今所收录期刊上发表的论文文摘 。
3
.
2 科学 ( S e i e n e e ) 杂志 ( h t t p : / / e h i n a . s e i-
en ce m ag
·
Or g )
: 《科学 》是一个世界性 的刊物 ,
每周发表来自世界各地最重要的原始研究论
文 , 以及科学界普遍感兴趣的新 闻报道和新
闻分析 , 其中与医药相关的内容 占有很大 比
例 。 《科学 》电子版已经在中国设立服务器 ,并
提供一些中文导航和文摘 。 除了印刷版上的
全部 内容 以外 ,读者还可 以用关键字或作者
姓名来检索 1 9 9 5 年 1 0 月以来 的期刊 , 浏览
过刊 ,或浏览按主题分类的论文集 。参考文献
在 M ed h en 中收录的文章 ,可以联通查询 。
《中草药 》 1 9 9 9 年第 3 0 卷第 8 期
3
.
3 自然 ( N a t u r e ) 杂志 ( h t t p : / / w w w . n a -
ut er
·
c o
m )
: 《自然 》也是一个影响很大的生物
医学方面的杂志 , 有很多关于医 药方 面的论
文报道 , 它的电子版经过 注册之后也可免费
阅读全文 ,并提供查询服务 。
4 nI et rn et 上可供免费使用的专业软件
在 I nt er en t 上有许多专业软件可提供免
费下载使用 ,令 中草药研究工作者的 日常工
作变得轻松 。
4
.
1 绘制化学结构式样 的帮手 A C D / C h e m
S k e t e h ( 下 载 网 址 : h t t P : / / w w w . a e d l a b s .
c o m )
: 这个软件可绘制非常复杂的化学结构
式 ,并提供丰富的模板 ,包括链模板 、 环模板 、
基团模板和常见基团表 ,使用十分方便 。
4
,
2 观察分子结构 的窗 口 R as M ol (下载 网
址 : h t t p : / / w w w . u m a s s . e d u /m i e r o b io / r a s -
m ol / )
:
R as M ol 是用来显示分子三维结构的
软件 , 可以用来阅读从 P B D 检索得到的分子
坐标文件 ,更加直观地了解蛋 白质 、 核酸与糖
的三维结构 。
4
.
3 数据分析 、 科技绘 图的必备工具 M i -
e r o e a l O r ig i n
:
M i e r o e a l o r i g i n 是 W i n d o w s
平台下用于数据分析 、 工程绘图的软件 。 它的
功能强大 , 在各国科技工作者中使用较为普
遍 。 大 家 可 以 在 M icr oc al 公 司 的 主 页
( h t t p
:
/ / w w w
.
m i e r o e a l
.
c o
m ) 下载 其 D e m o
版 。
5 网上辅助中草药鉴定
随着仪器分析 、 分子生物学等现代研究
方法被引人到中草药 的研究之中 ,传统 的中
药鉴定向定量化和准确化迈进了一大步 。 I n -
et rn et 的发展 , 使 网上化合物谱图解析和蛋
白质及核酸序列分析成 为可能 , 这为网上辅
助 中草药鉴定提供了极大的方便 。
5
.
1 解析红外光谱 : 未知成分结构解析在 中
草药研究中有极其重要的作 用 ,不管是基础
研 究还是应 用研究都需 要鉴定未知 物的结
构 。作为中草药研究工作者 ,经常会遇到各种
未知成分的样品需要进行分析 。 由于中草药
的成分复杂或研究者缺乏经验 , 谱图的识别
· 附 5 ·
比较困难 。 中国科学院上海有机化学研究所
( h t t p
:
/ / w w w
.
s i o e
.
a 。 . e n )的红外光谱 数据
库和 天然产物数据库都可以通过 I n t er n et 进
行网上未知化合物结构解析 。 研究工作者只
需取样测定红外谱图 , 通过有机所提供的格
式转换软件 (在网页上可以免费下载 )转换成
红外光谱数据库所需的提 问 , 通过红外光谱
数据库的匹配检索 ,找到 了谱型基本一致的
候选化合物 , 再从文献 中找到这一候选化合
物的其它谱图 ,分析谱图的一致性 ,很快就可
确定未知物的结构 。
5
.
2 进行蛋 白质及核酸序列分析 : 当一个新
的蛋白质或核酸序列被测定 出来后 ,通 常要
作 的第一件 事是对序列数 据库 的类 似性检
索 , 以发现是否有与之相同或相似的序列存
在 ,这是研究新鉴定基 因及其编码蛋白质的
功能 、 结构和进化的强有力的方法 。 因此 , 进
行序列数据库的类似检索成为 I n t e r n et 在分
子生物学中的第一项应用 。 在 I nt er n et 上有
许多网站和服务器都 可直接或间接地进行几
乎所有的蛋白质 与核酸的序列分析作业 , 包
括理化特性分析 、 氨基酸组成和分子量分析 、
序列统计学分析 、 序列类似性检索 、 双重和多
重序列对排 、 模式和位点分析 、 多重算法对二
级结构的预测以及跨膜区和蛋白质定 向的预
测 等 。 此 外 , 还 可 以 进 行 二 维 凝 胶 电 泳
( ZD P A G E ) 图分析和蛋白质结构 同源性模建
等复杂的预测分析 。 这里介绍两个相关的网
站 :
5
.
2
.
1 E x P A S y M o l e e u l a r B i o l o g y eS
r v e r
(h t t p
:
/ / w w w
.
e x p a s y
.
e h / )
: 瑞 士 日内瓦大
学开发的分子生物学服 务器 , 拥有最全面 的
分析蛋 白质与核酸序列和结构的软件工具 。
5
.
2
.
2 P r o t e i n D a t a B a n k ( h t t p
:
/ / w w w
.
p d b
.
b n l
.
g o v )
: 由美国 B r o o k h a v e n 国家实验
室维护的收集生物大分 子 (蛋 白质 、 核 酸和
糖 )三维结构的数据库 。 中国镜象站点位于北
京大学 , 网址 h t t p : /八p e . p k u . e d u · c n 。
6 结语
I n et r n et 的重要特征之一就是它的动 态
性 , 其信息资源 日见更新 。 中草药工作者应该
充分利用这个特点 , 及时了解新的信息 , 把握
现代医 药学发展的方向和研究热点 。 I nt er n et
的另一个重要特征就是 它的交互性 , 用户 不
仅是信息的使用者 , 也是信息的提供者 。 希望
中草药工作者能够将更多的信息资源充实到
nI et m et 上 ,让全 球的药学 工作 者都 了解 中
草药 , 共同发掘这个 巨大的宝库 。 相信随着
nI et r n et 在中国的普及发展 , 一定会使 中草
药学这个古老的学科焕发新出的青春光彩 。
参 考 文 献
l 陈荔 子 , 等 . 实用医学文献 检索 . 北京 : 北 京医科大 学
中国协 和医科大学联合出版社 , 19 97 : 1 94
2 李晓霞 , 等 . 化工进展 , 19 96 , 3 : 28
3 夏 云 , 等 . I nt er ne t 实用技术与生物 医学 应用 . 北京 :
军事 医学科学 出版社 , 19 97 : 3 41
( 1 9 9 9

0 2
一 0 9 收稿 )
中药材 G A P 起草小组扩大会议在天津召开
由国家药品监督管理局 主持召开的 中药材 G A P 起草小组扩大会议于 1 9 9 9 年 5 月 9 日 ~ 10 日在天津市
举行 , 会议 由天士力制药集 团有 限公司承办 。 国家药品监督管理 局副局长任德权出席会议并作重要讲话 , 国
家科技部 、 农业部 、 中医药局都 派员参加会议 。 中药材 G A P 起草专家组全体成 员和来 自全 国 49 个单位的 75
名代表参加 了会议 。 天士力制药集团有限公 司 、 康莱特药业集 团公 司和江苏银杏生化集团公司等企业代表作
了大会发言 。 与会代表对 《中药材 G A P 》初稿逐章逐条地进行 了讨论和修改 , 提出了许多宝贵意见 。 最后 周荣
汉教授作了总结发言 。
( 轰荣海 )
第四届全国动物药学术研究会将于 1 9 9 9 年 10 月在上海召开
由中国药学会动物药专业组主办 ,第二军 医大学药学院 、 全军中药 及天然药物专业组承办的 “ 第四届全国
动物药学术研讨会 ”将于 19 9 9 年 10 月 23 日~ 10 月 26 日在上海市第二军医大学招待所召开 。 欲参会者请与
长春 中医学 院动物药教研室张辉 、 李建平两 同志联系 (联系 电话 : 0 4 3 1 一 5 9 6 8 2 27 邮编 : 1 3 0 0 2 1 )
附 《、