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泡桐属七种植物的RAPD分析



全 文 :广 西 植 物 Gu[haia ZI(4):335— 338 2001年 u 月
泡桐属七种植物的 RAPD分析
卢龙斗,谢龙旭,杜启艳,常重杰
(河南师范太学生命科学学院,河南新乡 453002)
摘 要 利用 1 3个 10mer的随机引物对中国泡桐属的 7个种进行了 RAPD分析 ,对扩增形成的谱带进行了
对 比.发现 7个种间存在较丰富的多态性带纹。经用 UPGMA法聚类结果说明可把研究的7个种分成 2个类
群 其中白花泡桐与JI泡桐亲缘关系最近 二者与揪叶泡桐 南方泡桐、山明泡桐归为 1个类群。毛泡桐与兰
考泡桐亲缘关系也较近 ,二者在系统演化上比较原始,归为 1个类群
关键词:RAPD分析 ;泡桐属;聚类分析
中囤分类号 :Q949.777.8 文献标识码:A 文章编号 :1000—314g(2001)04 0335—04
RAPD anal ysis of seven species in Paulownia
LU Long—dou,XIE Long—xu,DU Qi—yan,CHANG Zhong—jie
(College L Scie~b:e,Heaan Normal University,Xinxiang 453002,China )
Abstract:The~ nomm DNA of seven species in Paulownia was amplified with 13 primers of 1O met[ength
Abundant po]ymorphic DNA makers were detected among,9e%,en species,when compared the bands amplified
Tbe duster anatysis with UPGM A suggested that the sek~eN species studied belong to two lineages.Of which
the relationship between P.fortunei(Seem.)Hems1.and P Jargesii Franch.is the closest.These two species
along with P.am~tralis Gong Tong and P.1amprophylla.belong to one elade,P tontentosa(Thunb.)Steud
and P.elongata g.Y.Hu have closer relationshipt which are retatively primitive,be[ong to the other t rade.
Key words:RAPD analysis;Pautcfwnla}cluster analysis
泡桐属(Paulc~vnia)植物是重要速生经济林术,
原产我国,且多分布于河南中原地区。现有 9个种和
4个变种。由于其材质优良,叶、花、果、树皮又可入
药,因此,在国民经济中占有重要地位 ”。关于泡桐
属植物的栽培、育种以及依据外部形态指标进行的
种间亲缘关系探讨已有人做了比较深入的研究
但在分子 水平上进行泡桐 属植物的系统分类地位、
种与种间的亲缘关 系的研究还未见有报导。本文 旨
在利用 RAPD分子标记 ,在分子水平探讨该属植物
种间的亲缘关系,为该属植物的系统分类和遗传育
种提供理论基础和参考数据。
1 材料和方法
1.1材料
毛泡桐(Paulozvnia tcmwntosa(Thunb.)Steud.)、
兰考泡桐(Paut,m,nia ebmgata S.Y.Hu)、白花泡桐
(Paulutoni,*jbrtu,wi t Seem.)Hems1.)、川 泡 桐
(Paubywn~ rgesi Franch)、山明泡桐 (Paul#~vnia
[amprophylla)、揪 叶 泡 桐 (Paulownia cata印,folia
Gong Tong)、南 方 泡 桐 (PaM(mmia australis Gong
收稿 日期:2000—07—27
作者简升 卢龙斗(1 954) 男 .河南宜阳人 教授.从事遗传学教学与科研工作
基盎项 目:河南省科委自然科学基金资助项 日(批准号 324018000)
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Tong)7个种均采自河南农业大学泡桐研究基地 每
个种选取 3个个体幼嫩叶片,于冰壶中带回实验室
备用
1.2 DNA提取和纯化
每个种取 1.0 g新鲜幼嫩叶片,用液氮研磨成
粉末后加10 mL 60。C的CTAB分离缓冲液,保温 1
h,然后加等体 积的氯仿 异戊醇 ,混匀后 8 000 r/
rain离心 10 rain,在取 的上清液 中加 2/3体积的预
冷异丙醇 ,混合均匀沉淀出 DNA,用洗涤液处理 20
mln后挑后沉淀物干燥 ,最后溶于适量 TE液中。
I.3 RAPD检测
用于该实验的随机 引物为美 国 Operon Tech
nologies公司生产的s组 2O种寡聚核苷酸片断(引
物序列见表 1)。Taq酶和 dNTP均为华美生物工程
公司产品。反应混合物用 20 I 石蜡油覆盖。反应
体 系为 :引 物 1 I ,dNTP i00 vmol,MgCI 1.5
mmo]/I,,Taq酶 1u,基因组 DNA 2,00 ng。循环参
数为:94。C预变性 30 s,36。C退火 60 s,72。C延伸
0 l 2 3 4 S 6 7
60 s,扩增 45个循环,最后 72。C延伸 5 min,扩增产
物在 1.4 琼脂糖凝胶上电泳 ,经 EB染色后在紫外
灯上观察拍照 。
表 1 泡桐属植物 RAPD分析所用的 13个引物
Table 1 Thirteen primers used for RAPD
analysis of the plant of Paulowma
引物名称 Name ol【he N
—N(5~3’)N: 一N⋯umh⋯er⋯o~po-
quenc p¨ fied bands 【ymorphic bands
7 6 5 4 3 2 1 0
2 结 果
图 1 随机引物 $433、$494扩增产物
Fig.1 Amplification products of prime r$433、$424
2.1 RAPD遗传标记
从s组 2O个引物中筛选出了1 3个能扩增出清
晰的谱带的引物,并利用这些引物对泡桐属的 7个
种进行了RAPD扩增。同样条件的扩增重复一次,
得到了基本上相同的结果 .说 明有很好 的重复性
扩增片段的大小大约在 2.2~0.30 kh之间 对每一
个引物在 7个种扩增的谱带数的类型进行统计,并
对多态性带型数也进行了统计,得出表 1的结果 统
计 中对个别不太清晰和个别不稳定 的带型没有计
人统计结果 。
2 2各种间遗传距离和聚类结果
根据电泳谱带(图 1),分别统计 1 3个引物在各
个种扩增的 DNA谱带数 目以及种与种之间共有
DNA谱带数 目,再根据这些数据算出各个种之间的
遗传距离(表 2)。任意 2个种问 的遗传距离 尸一1一
F.F为 2个 种的共享 度.公 式为 F一2 /【 一4-
j,N 和 Ⅳ 分别为 、b两种各 自拥有的 RAPD
标记数,Ⅳ 为 一6两个种共同拥有的 RAPD标记数。
根据遗传距离P值再用 UPGMA法进行聚类,构建
树系图(图 2)。
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4期 卢龙斗等:泡桐属七种植物的RAPD分析 337
表 2 任意两个种间的遗传距离、RAPD图谱中
共同的片段数和扩增片段总数
TaMe 2 Genetic distances between any tow species t the
numbers of the shared fragments and the total rtutlbers
of fragmems amplifed in RAPD patterns
0 368 0.531 0.510 0.435 0,55[ 0 465
24,75 0 277 0 380 0 468 0 341 0 {77
1 9/81 30/83 0 200 0 394 0 312 0.334
24/98 31/1O0 42/105 0 259 0.257 0.310
26/92 2s194 30199 csll16 O-364 0 404
20/89 30./91 33./96 42/113 341]07 0 347
23/86 23/88 31/3s 38/11.0 3l/104 33/i0l
N — 、J
图 2 应用 UPGMA浩构建的树系图
Fig.2 Dendrogram generated using UPGM A algorithm
表2、图l、围 2中.0-marker;1毛泡桐;2兰考泡桐;3一白花抱桐;
{川泡桐;5一山明泡桐;6-揪叶泡桐;7-南方泡桐.
3.1 DNA多态性
从表 l可看到引物 $428对 7个种共扩增出 6
条DNA谱带,其中多态性谱带 6条,占1 00 引物
$433对 7个种共扩增出 1 2条DNA谱带,其中多态
性谱带就有 n 条 ,占 92 ,引物 $427对 7个种共
扩增出 9条 DNA谱带,其中多态性潜带有7条,占
78 每一个引物对 7个种扩增出的DNA谱带数
其多态性带型数都占50%以上。13个引物共扩增出
89条不同分子量的谱带,其中有 63条表现为多态
性谱带 ,占总数的 70.79 ,这些说明泡桐属植物不
同的种之间存在非常丰富的DNA多态性。泡桐属
植物外部形态相似,非专业人员很难正确区分开各
个种 最早人们主要以花冠颜色、叶背绒毛的稀疏
为依据,但这些特征又不稳定,应用上非常困难,以
致于有人把泡桐属植物分成 9个种 ,有的定为 7个
种,有的定为 5个种,也有人定为 3个种,其它的都
是一些变种。根据得到的种与种之间的遗传距离,
种与种之间存在的丰富的DNA多态性,我们认为
把泡桐属植物定为 9个种是有一定科学依据的。
3.2聚类结果与种间的亲缘关系分析
图 2显示了泡桐属 7个种的树系图 从中可看
到 7个种可以台成 2个类群 白花泡桐、川泡桐、南
方泡桐、揪叶泡桐、山明泡桐为一类群,其中白花泡
桐与川泡桐遗传距离最近,仅为0.200,所以二者在
0.200处首先聚类 ,说明二者亲缘关系最近 另一类
群包括毛泡桐、兰考泡桐,二者遗传距离为 0.368,
亲缘关系也较近 第一类群与第二类群在 0.444处
聚类 从表 2可看出毛泡桐与其它各个种问的遗传
距离都比较远,界于0.368~0.551问,因此,在分析
的 7个种中毛泡桐比较原始 这些与龚本海 1994年
的研究结果相一致。‘ 无论在传统的系统分类水平
的研究。“。 ,还是在同工酶水平的研究 ’,以及在细
胞水平上进行的研究 都认为毛泡桐比较原始,我
们在分子水平的研究结果也证明了这一点。关于兰
考泡桐是否也比较原始,各研究者有不同的看法,
有待于进一步研究。
3.3种同性状与遗传距离分析
泡桐属植物各个种问有很多相似的性状,如都
为落叶乔术,圆锥或伞形树冠,叶心脏形大而有柄,
无托叶,圆锥花序等。因此,较难从外部形态上区分
各个种之间的差别。各个种的染色体数目都为 4o
条,也都为小染色体 ,所以在染色体核型上也很难
鉴定各个种间的亲缘关系 中国植物志、河南植物
志根据各个种生殖器官的特征编制的检索表,可以
看到各个种问存在一些差异 我国著名的泡桐研究
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方面的专家蒋建平等认为台湾泡桐、白花泡桐、毛
泡桐 、川泡桐 分布较广,种 间差异较大 ,结籽力强,
而其它几个种分布区域小,种间差异小,外部形态
接近 .介于以上 4个种之间。 。从表 2中可看到白花
泡桐、毛泡桐、川泡桐相互之间遗传距离较大,如毛
泡桐与 白花泡桐间为 0.53l,毛泡桐与川泡桐 间为
0 510。而兰考泡桐、山明泡桐、揪叶泡桐 、南方泡桐
间遗传距离较小,介于0.341~0.477之间。这些分
子水平上的研究结果与各种问外部形态方面的相
似性是比较吻合的。但是,在表 2中可看到白花泡桐
和川泡桐的遗传距离仅 0.200,且在树系图中首先
聚类 ,这个结果与两个种问外部形态差异较大是不
吻合的,这也许是实验数据上的误差,不过 ,从这两
种泡橱都分布在南方区域,遗传距离较小也是正常
的。兰考泡桐与揪 叶泡桐 、南方泡桐与 白花泡桐在
外部形态上比较相似 ”,在表 2中可看到,兰考泡桐
与揪 叶泡桐 间遗传距离较小为 0.341,南方泡桐 与
白花泡桐间也比较小为 0.334。
1 995年熊金桥等分析了泡桐属植物的 38个性
状 、,并用数量分类的方法对所分析的 1 2个种或变
种进行了系统聚类分析,把该属植物分成三个组,
白花泡桐组 :白花泡桐、兰考泡桐 等;毛泡桐组 :毛
泡桐 、川泡桐 、南方泡桐等;揪叶泡桐组 :揪 叶泡桐、
山明泡桐等。在我们的研究结果中虽然白花泡桐与
兰考泡桶没有归入同一个组 中,但从表 2可 以看出
二者的遗传距离也比较近,仅 0.277,这与熊金桥等
人的研究结果基本相符 。揪叶泡桐与山明泡桶的遗
传距离 0、364,亲缘关系也较近 ,这与熊金桥等人的
研究也基本一致 。但毛泡桐与川泡桐,毛泡桐与南
方泡桐的遗传距离都相应较远,与熊金桥等人的研
究结果不一致。我们认 为个别外部形态上的一致不
能说明亲缘关系就近,而只有分子水平上的相似才
能代表亲缘关系的远近。当然,我们的研究仅用了
20种引物.还不足以从分子水平上说明问题。另外,
分析外部形态、指标得出的遗传距离与分析分子标
记得出的遗传距离二者 之间对 比的可靠性和科学
性也有 待 于进 一步 探索 。关 于 鄂 川泡桐 (尸.“
b~ph/oea)、台湾泡桐(尸.kawa~mi)以及其它几个变
种与所研究的 7个种的遗传距离、种间亲缘关系,由
于材料所限,我们设作研究,这些有待于进一步探
索和补充。
3.4种的地理分布与遗传距离分析
泡桐属植物在我国分布比较广泛,西起成都、
西安,东至沿海,北起辽宁、山东,南至云南边境。从
表 2中可以看到聚类在一大类群、分布在河南、河北
较靠近北方的毛泡桐与兰考泡桐的遗传距离最小,
仅 0.368。毛泡桐与仅分布在湖北襄阳一带的山明
泡桐间遗传距离为0.435,趋于中间。而毛泡桐与分
布在南方的几个种间遗传距离都较大,如毛泡桐与
白花泡桐间为 0.531,与川泡桐间为 0.510,与南方
泡桐问为 0.465。毛泡桐与分布在山东的揪叶泡桐
间为 0.551。从以上结果可以看出泡桐属各个种间
在地理分布上相距越远,遗传距离越大,种间差异
越明显。也证 明泡桐属植物从原始种演化到今天的
多个种的过程中地理环境条件起了很大的作用。
根据竺肇华的观点 认为南方泡桐可能是台湾
泡桐与白花泡桐的杂交种,兰考泡桐可能是毛泡桐
与白花泡桐的杂交种。从地理分布上看,台湾泡桐
与 白花泡桐有重叠 区,毛泡桐 与 白花泡 桐有重叠
区。南方泡桐、兰考泡桐又都是高度不育。在我们的
实验结果中南方泡桐与 白花泡桐的遗传距离较小 .
仅 0.334。毛泡桐与白花泡桐间遗传距离仅 0.277,
说明白花泡桐对兰考泡桐形成提供的遗传份额比
较大 。这些在分子水平的数 据支持 了竺肇华 的观
点 ,证 明在泡桐属植物演化过程中种 间杂交也是重
要因素之一。
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