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AFLP在芒果品种鉴定中的应用



全 文 :广 西 植 物 Guihaia 21(3):281— 283 2001年 8 月
AFLP在芒果品种鉴定中的应用
房经贵,乔玉山,章 镇
(南京农业大学园艺学院,江苏南京 210095)
摘 要:利用 AFI P分子标记技术对 l6个芒果(Mangifera indica L.)品种以及 7个芒果砧术材料进行了初步
研究,6对AFI P选择性引物共产生 204条清晰谱带。同时利用品种闻共有谱带率(Band—sharing)对某些品种问
的遗传关系进行了分析。16个栽培品种间的平均共有谱带率为 83 ,变异幅度为7O ~94 .7个砧术间的平
均共有谱带率则为 8O ,变异幅度为53 ~96 。
关键词:芒果 ;AFI P;品种鉴定
中圈分类号 :Q75 文献标识码:A 文章编号:i000 3142(2001)03 0281—03
Appl ication of AFLP in the cul tivar
identification of mango
FANG Jing—gui,QIAO Yu—shan,ZHANG Zhen
(Colege of Horticulture,Nan加g Agricultwrat University,Nanjing 210095t China)
Abstract:AFI P was first used to StUdy 16 mango cuhivars and 7 mango rootstocks,and 6 AFLP selective primer
pairs devoted 204 clear bands.The genetic relationships of some mango cuitlvar pairs an d those of$ome mango root—
stock pairs were studied by tha[r Band Sharing.The Band Sharing average of the mango cultivars was 83 ,and
their variant rangewas 70 ~ 94 .Forthe rootstocks,theBand Sharing average andthe variant rangewere 80
and 53 ~ 96 ,respectively.
Key words:Mango;AFI P;cuhivar identification
尽管形态性状标记与同工酶等均可用于果树的
品种鉴定与标记辅助选择等“ ,然而这些标记的不
足(如标记数量有限、多态性水平低等),往往限制了
它们的应用。而正是由于DNA分子标记在这些方面
所表现出的优势 ,使其应用为果树遗传育种学开辟
了崭新的研究和应用领域。它有助于直接从分子水平
上了解果树品种间的差异,也使育种过程更直观,目
的性更强,对于选择合适的杂交组合以保持或获得更
好的重组优良品种显得极为有效与准确。
芒果是热带重要果树树种之一,为进一步开展芒
收翦 日期1 2000—05—30
作者简介:房经贵(1968一),博士.副教授 ,主要从事果树学研究。
基金项目;国家留学基叠资助项目(G200002)
果分子遗传学的研究,加快 DNA分子标记技术在芒
果育种实践中的利用,达到育种水平的提高,人们已
成功地将 RAPD(随机扩增多态 DNA)、SSR(简单序
列重复)技术应用于芒果的遗传关系、品种鉴定等方
面的研究 ,这不仅提供了进一步利用某些芒果品
种材料的理论依据,而且建立了新的技术系统及获得
了应用这些技术的经验。尽管如此,利用 AFLP(扩增
片段长度多态性)技术对芒果的研究报道尚不多。由
于AFI P技术具有可同时对多位点进行检测、重复性
好、信息量大、符合孟德尔遗传的特点,因此,开展
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AFI P技术在芒果领域的应用,对于芒果分子遗传学
的深入研究将具有积极的推动作用。根据杂种优势显
性假说和超显性假说的基本点是参与杂交的双亲具
备一定的遗传差异的理论 ,结合实际研究工作的需
要,我们首次利用AFI P技术有针对性地对部分芒果
栽培品种以及砧木材料彼此间的遗传关系进行了尝
试性研究,以期为芒果遗传关系、品种鉴定提供更多
的方法,同时也为进一步构建芒果品种的杂种优势群
提供一定的理论准备。
l 材料与方法
1.1材料
研究中所用的 l6个芒果品种为:Austin、Caraba。
Haden lrvin,Edward, Keltt, Langra,Kensington,
Mabruka,Manzanilo,Maya,Navmi,Palmer,Tango,
Shely、Tommy;7个砧木材料为:Gumera 1、Colombo
Kidney、Gumera 3、Gumera 4、Sabre、7/32、1 3/1。取其
嫩叶供提取叶片基因组DNA所用。
1.2方法
1.2,1 DNA提取 参照Muray和Thompson方法。 。
1.2.2 AFI P技术 参照Vos和Hogers法“ 。具体技
术路线、所用 的接头、引物等如同以前 的研究报
道。 。本实验中共随机选用了 6对 AFI P选择性引
物:E—AAG/M—CTG、E—AGG/M—CAT、E—AAc/M—
CTG、E—AAG/M—CAT、E—AAC/M—CTA、E—Aco/M—
CAC,其中E、M 分别表示 EcoRI与Msel引物的共同
序列;E、M 后的3个碱基为选择性碱基。
1.2.3资料分析 随机选取了 1 4对芒果品种组合和
6对砧木组合的 AFI P标记资料进行分析。在统计标
记资料时,为确保准确性与可靠性,只计清晰谱带。共
有谱带率(BS—Band sharing)的计算公式 为:
Bs
Ⅳ 表示 A与 B两品种的共同谱带数量, 、M
则分别表示 A与B两品种各自的总谱带数。
2 结果与分析
2.1 AFLP技术的效果
本实验选用 6对 AFI P选择性 l物对 16个芒果
品种及 7个砧木材料进行的 AFI P分析,都得到了清
晰的指纹,并且所有品种表现出多态性,这可从引物
组合(E—AAG/M—CAT)的指纹(图 1)情况得到反映,
说明了AFI P技术在芒果品种鉴定中的可行性。6对
引物共获得了 204条清晰谱带。
图 1 十六个芒果品种的 AFI P指纹图谱
Fig.1 The AFLP fingerprinting 0f 16 mango cultivars
2.2AFLP指纹的分析
2.2.1十六个芒果品种的分析 根据 6对 引物的指
纹情况以及研究所需,在确保差异最大的2个品种
(Mubruka,Edward)和差异最小 的2个品种(Maya,
Kelt)被选择的前提下,又随机选择了 1 2个品种组合
进行比较。14对芒果品种间 BS值大小的分析结果
(表 1)表明,这些芒果品种间 BS大小的变化范围为
7O ~94 ,平均为 83%。其中,Mabruka与 Edward
的BS为 70 ;Maya与 Keit间的BS则为 94 。根
据以往的报道,应该说 BS越大则其遗传关系越近,
而BS越小则遗传关系越远。遗传差异大的品种更适
于作为育种亲本材料。该实验结果证明了AF[ P筛选
芒果亲本的有效性。
2.2.2砧木材料的分析 根据实际研究的需要,从 7
个芒果砧木材料中选择了 6对进行 BS值大小的分
析,其结果(表 2):BS的变化范围为 53 ~96 ,平
均值为 8o 。其 中Sabre与 7/32的 BS值最低,为
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3期 房经贵等:AFI P在芒果品种鉴定中的应用 283
j3 ,而13/1与Sabre的BS值最高,为96 与前面
1 6个芒果品种的分析结果相比,芒果砧木材料 BS的
变化范围较大,BS平均值较小,表明芒果砧木材料的
亲缘关系偏远,进行遗传改良的潜力更大
表 1 14对芒果品种(共 16个品种)间的共有谱带率
Table 1 Band—Sharing values of 14 pairs of
mango cultivars(16 mango cultivars)
品种组台
Cuhivar pMrs
A B
总带
tge o

f bAvera ands l二二 :
—__—了 bands
共有谱
带率
Band
sha~ng
表 2 六对芒果砧术(7种砧木)问的共有谮带率
Table 2 Band—Sharing values among six pairs of
mango rootstocks(7 various rootstocks)
3 讨 论
由于受方法本身某些因素、技术条件、环境等的
影响“ ,形态学、同工酶技术、RAPD标记对芒果品种
进行鉴定的结果尚存在不少的歧义问题,从而影响到
对芒果材料的进一步利用与研究 AFI P技术的应用
有望能解决芒果品种鉴定中某些遗留的问题。本宴验
的成功尝试为此提供了可靠的技术方法
杂种优势与育种亲本间的遗传距离有关,遗传距
离越大,则杂种优势的效果越明显 迄今,已有很多利
用 DNA标记来辅助亲本选择以提高后代杂种优势
的报道 ,如 Dunnington等。 和HilM 等“ 利用 DNA
指纹资料计算个体或 品种间的 BS,以此估 计它们之
间的遗传距离,作为育种亲本选择的参考。本研究的
初步分析结果表明,不同芒果栽培品种间及砧木间
AFI P指纹的 BS值存在明显差异,因此,有望借此分
析路线和分析资料进行芒果杂交优势群的构建以及
辅助杂交亲本的选择。
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(下转第 286页 Continue on page 286)
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2.3纯度鉴定
z.3.1紫外光谱法 辣椒索样品和标准品的紫外光
谱特征及文献值。 见表 3,结果和标准品及文献值基
本一致。
10 0 20 0 30.0
T[ME《 ,瑚intlte)
图 2 辣椒素的 HPI C图谱
Fig.2 HPLC of capsaicin
f从左至右 3十蜂分别为辟二蠹辣|茸素,薄糍亲和=氢擗般亲)
peaks(1eft to right)l r,ordih~xlroeapeaiein.ca~aiein and dIhydr0cnp lcin
2.3.2 HPI C法 经柱层析和结晶纯化的辣椒索样
(上接第 283页 Continue from page 283)
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品,HPLC保留时间与标准品及文献值 一致(图 2),
样品中辣椒索的含量为标准品的 94.6 ,可满足药
用辣椒索的纯度要求。
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