全 文 ：Mycosystema
菌 物 学 报 15 November 2008, 27(6): 863-872

jwxt@im.ac.cn
ISSN1672-6472 CN11-5180Q
©2008 Institute of Microbiology, CAS, all rights reserved.






禾本科植物内生真菌研究 5. 中国产部分 epichloë
内生真菌的遗传多样性
陈永敢 纪燕玲 亢燕 孙相辉 詹漓晖 于汉寿 王志伟∗
南京农业大学生命科学学院 南京 210095


摘 要：Epichloë 内生真菌（epichloë endophytes）是禾本科植物的共生真菌，开展其多样性研究对菌株
的生物学特性和进化规律的了解以及开发利用都有着十分重要的意义。本研究筛选了 12 条随机引物对 24
株 epichloë 内生真菌进行 RAPD 扩增，探讨真菌种类、宿主种类、采集地和菌株间的遗传多样性。结果
表明，宿主为拂子茅 Calamagrostis sp.、雀麦 Bromus sp.、披碱草 Elymus sp.、小颖羊茅 Festuca parvigluma
Steud.的菌株分别独立聚为一个分枝；而宿主为鹅观草 Roegneria spp.的 Neotyphodium 属菌株聚类情况较
为复杂；宿主为早熟禾 Poa spp.的菌株分别在三个不同的分枝，表现出丰富的遗传多样性。以上结果反应
了我国具有丰富的 epichloë 内生真菌资源，它们和其宿主之间有着比较明显的相互关系。本研究还显示，
采集于南京的拂子茅与其内生真菌共生可能发生在较久远的年代。
关键词：RAPD，Neotyphodium 属真菌，Epichloë 属真菌，禾本科植物

Grass endophyte researches 5. Genetic diversity in some
Chinese epichloë endophytes
CHEN Yong-Gan JI Yan-Ling KANG Yan SUN Xiang-Hui ZHAN Li-Hui
YU Han-Shou WANG Zhi-Wei*
College of Life Science, Nanjing Agricultural University, Nanjing 210095, China
Abstract: Mutualistic associations between epichloë endophytes and gramineous plants are receiving more and
more attention. Investigations of the endophytes’ diversity are facilitative to understand their biological

基金项目：国家自然科学基金资助项目（No. 30070009 和 No. 30670008）
*Corresponding author. E-mail: zwwang@njau.edu.cn
收稿日期：2008-01-11，接受日期：2008-04-30
DOI:10.13346/j.mycosystema.2008.06.004
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properties and evolutionary relationships. Random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers were used to
investigate genetic diversity and evolutionary characteristics of 24 endophytic fungal isolates. Isolates from
Calamagrostis sp., Bromus sp., Elymus sp. and Festuca parvigluma Steud. significantly clustered respectively;
clusters for Neotyphodium isolates obtained from Roegeria spp. showed comparatively complicated, while
isolates obtained from Poa spp. tended to be divided into three groups. It could be concluded that the genetic
relationship among the epichloë endophytes native to China is quite diverse. The results also indicated the
mutualistic relationship between Calamagrostis sp. collected from Nanjing and its endophyte could be traced
back to ancient time.
Key words: RAPD, Neotyphodium spp., Epichloë spp., gramineous plants


内生真菌是指在植物体内完成其全部或部分生活史，但又不引起任何病症的微生物
（Bacon & Siegel 1988）。作为一种新型微生物资源，植物内生真菌特别是禾本科植物
epichloë 内生真菌具有提高宿主植物抗旱抗热、抗病虫害能力及促进 N、P 吸收等作用，
因此受到国内外的普遍关注（Rudgers et al. 2005；Spiering et al. 2005）。目前，研究最广泛、
深入的内生真菌是冷季型禾本科植物中 Neotyphodium 属和 Epichloë 属真菌（Schardl &
Leuchtmann 2005）。
Neotyphodium 属是从 Acremonium 属中独立出来的，现有 17 个种，其成员能与 8 个属
以上的禾本科植物共生（Li & Nan 2004；Moon et al. 2007）；它们随着植物的种子进行垂
直传播，且至今不能在植物体外分离得到（Schardl & Leuchtmann 2005）。在经典分类学研
究中，Epichloë 属真菌被认为是 Neotyphodium 属真菌的有性世代（Morgan-Jones & Gams
1982；White & Morgan-Jones 1987）。截止 2006 年底，已发现有 11 个种的 Epichloë 属内生
真菌（Schardl & Leuchtmann 2005；Li et al. 2006a）。运用 tubB、tefA 序列的系统发育学研
究显示，N. lolii (Latch et al.) Glenn et al.和 N. aotearoae Moon et al.被认为是从 Epichloë 属
中相应的种直接进化而来（Moon et al. 2004），而 Neotyphodium 属中其它更多的种则被认
为是由两到三个不同的 Epichloë 属种间杂交而来，例如：N. coenophialum (Morgan-Jones et
Gams) Glenn et al.、N. siegelii Craven et al.等（Schardl & Craven 2003；Craven et al. 2001）。
基于 Epichloë 属真菌和 Neotyphodium 属真菌之间的密切关系，它们被统称为“epichloë
endophyte”（Schardl et al. 2004）。在以国外菌株为材料的研究中，人们发现 epichloë 内生
真菌和宿主植物有着比较密切的联系，除 E. typhina (Pers.) Tul.和 N. typhinum (Morgan-Jones
et Gams) Glenn et al.以外，其它都有着十分严格的宿主特异性，它们和宿主有一定的共进
化趋势（Schardl et al. 2004）。但是，关于亚洲地区的禾本科植物内生真菌，这方面的信息
还很缺乏。同时，epichloë 内生真菌的生物学特性及其与宿主植物形成共生体的生物学特
性都分别受到植物、内生真菌多样性和真菌宿主特异性的影响（Schardl et al. 2004；Schardl
& Leuchtmann 2005）。因此，研究我国禾本科植物内生真菌的遗传多样性及其进化特征，
对更好地认识和利用这些真菌资源有重要的意义。
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微生物遗传多样性及分子进化特征的研究方法主要有 RAPD、RFLP、SSR 以及特定的
DNA 片段序列等（Atienza & Jha 2006；De et al. 2003；Kelemu et al. 2003）。利用特定 DNA
片段进行系统发育学分析重复性好，但所选序列往往小于整个基因组的千分之一，因此数
据不足以反映整个基因组的特点。RAPD 技术由于其引物随机性正好弥补上述不足，但重
复性差往往为人们所诟病。RFLP 技术和 SSR 技术利用 DNA 片段的同源性，使数据的可
靠性显著增加，但是数据量往往显著减少，而且操作复杂，费用增加。由于 RAPD 技术对
DNA 序列不要求了解、灵敏度高、样品用量少，操作简单，快速，因此已成为物种分类
鉴定、遗传作图、基因定位、病原微生物检测等方面广泛使用的手段（尹燕妮等 2005；蒋
曹德等 2003）。此外，通过反复试验，选择重复性好的条带录入数据，即可克服重复性差
的弱点，从而充分发挥 RAPD 技术的优势，利于从整个基因组水平上研究物种间遗传结构
差异。
在南美洲，Gentile 等（2005）曾利用 tubB、tefA 序列对产自阿根廷的 epichloë 内生真
菌进行遗传多样性、起源及进化研究；采用 RAPD 及 rDNA-ITS 序列的方法，李伟等（2006
b）进行了中国产鹅观草 Roegneria spp.和翦股颖 Agrostis spp.植物内生真菌的遗传多样性分
析，从这些植物内生真菌中发现了和国外未确定进化起源的 Neotyphodium 属真菌的聚类；
Wei 等（2007）也进行了来自内蒙古草原的醉马草 Achnatherum sibiricum (Linn.) Keng 内生
真菌菌落形态多样性分析。我国产各种 epichloë 内生真菌的资源十分丰富，但是，关于不
同草种、不同地域间内生真菌遗传多样性的比较和分析，特别是关于菌群之间的相互关系，
至今未见报道。
本研究采用 RAPD 技术，对部分中国产 4 族（Tribe）6 属禾本科植物中的 Neotyphodium
属及 Epichloë 属内生真菌进行随机扩增，考察了它们的遗传多样性及菌群、菌株间的相互
关系，为今后进一步的资源探索，及其和宿主植物的共进化研究提供信息。
1 材料和方法
1.1 供试菌株的种类、来源及其保藏
供试 24 个菌株于 2002 年至 2006 年采集自我国 7 省和欧洲的 4 族 6 属禾本科植物（表
1），其中 20 株为 Neotyphodium 属真菌，4 株为 Epichloë 属真菌；E. bromicola B9338 菌株
为 Leuchtmann 教授（瑞士 Geobotanisches Institut ETH）惠赠，这些菌株全部于 PDA 斜面
培养基 4℃保藏。除拂子茅外，其它宿主植物的大部分植株都能正常抽穗、开花和结果。
1.2 菌株培养和 DNA 的提取
菌株的培养：从菌种斜面上挑取菌丝接种至 30mL GY（1L：Glucose 5g，Yeast extract
2g，MgSO4·7H2O 0.5g，KH2PO4 3g，K2HPO4·3H2O 2g，pH 6.5）液体培养基中，28℃摇床
培养 21d，收集菌丝用于 DNA 提取。DNA 的提取参照 Li et al.（2006 a）的方法。



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表 1 供试菌株及其种类和来源
Table 1 Fungal isolates used in this study and their sources
编号
No.
菌株号码
Name of strain
分类
Taxon
宿主植物
Host
采集地
Geographic origin
采集日期
Collection date
1 Bhs6811 Neotyphodium sp. Bromus sp. 安徽省黄山市 Huangshan 2006.07.09
2 Bhs6849 Neotyphodium sp. Bromus sp. 安徽省黄山市 Huangshan 2006.07.09
3 EH5 Neotyphodium sp. Elymus sp. 黑龙江省哈尔滨市 Harbin 2005.09.21
4 Rdy4302 Neotyphodium sp. Roegneria sp. 山东省东营市 Dongying 2004.08.13
5 Rsx6103 Neotyphodium sp. Roegneria sp. 山西省孝义市 Xiaoyi 2006.07.25
6 Rfz2101 Neotyphodium sp. Roegneria sp. 福建省福州市 Fuzhou 2002.04.28
7 Rxm4102 Neotyphodium sp. Roegneria sp. 福建省厦门市 Xiamen 2004.04.25
8 Cnj6608 Neotyphodium sp. Calamagrostis sp. 江苏省南京市 Nanjing 2006.06.14
9 Cnj6611 Neotyphodium sp. Calamagrostis sp. 江苏省南京市 Nanjing 2006.06.14
10 Cnj6617 Neotyphodium sp. Calamagrostis sp. 江苏省南京市 Nanjing 2006.06.29
11 Cnj6620 Neotyphodium sp. Calamagrostis sp. 江苏省南京市 Nanjing 2006.06.29
12 Pnj6104 Neotyphodium sp. Poa sp. 江苏省南京市 Nanjing 2006.03.28
13 Pnj6107 Neotyphodium sp. Poa sp. 江苏省南京市 Nanjing 2006.03.28
14 Pnj6601 Neotyphodium sp. Poa sp. 江苏省南京市 Nanjing 2006.04.15
15 Pnj6603 Neotyphodium sp. Poa sp. 江苏省南京市 Nanjing 2006.04.15
16 Rnj6105 Neotyphodium sp. Roegneria sp. 江苏省南京市 Nanjing 2006.05.07
17 Rnj6107 Neotyphodium sp. Roegneria sp. 江苏省南京市 Nanjing 2006.03.27
18 Fnj4201 Neotyphodium sp. Festuca parvigluma 江苏省南京市 Nanjing 2004.05.20
19 Fnj4602 Neotyphodium sp. F. parvigluma 江苏省南京市 Nanjing 2004.04.10
20 Fnj4603 Neotyphodium sp. F. parvigluma 江苏省南京市 Nanjing 2004.04.10
21 B9338 Epichloë bromicola Bromus erectus 欧洲 Europe Leuchtmann 惠赠
22 Rcs4203 E. yangzii Roegneria kamoji 湖南省长沙市 Changsha 2004.05.12
23 Rnj4301 E. yangzii R. kamoji 江苏省南京市 Nanjing 2004.06.17
24 Ryz5202 E. yangzii R. kamoji 江苏省扬州市 Yangzhou 2005.05.03

1.3 引物筛选、RAPD 扩增及产物检测
引物的筛选：首先根据引物设计基本原理挑选 20 条随机引物，将 24 个菌株的 DNA
等体积混合，形成 DNA 混合池，利用 DNA 混合池作为模板筛选出具有多态性扩增的引物。
引物购自上海生工生物工程技术服务有限公司。
RAPD 扩增及产物检测：利用筛选出的每条引物对 24 个菌株的基因组 DNA 进行 PCR
扩增。20µL 反应体系：3.0mmol/L Mg2+、1.0µmol/L primer、2.0µL 10 × buffer（100mmol/L
KCl，80mmol/L (NH4)2SO4，100mmol/L Tris-HCl，pH 8.4）、10ng template、2U Taq polymerase、
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0.33mmol/L dNTP（each），加 ddH2O 至 20µL。扩增反应在 MyGeneTM热循环仪（LongGene，
杭州）上进行，反应程序：94℃预变性 4min；94℃变性 1min，37℃退火 1min，72℃延伸
1min 进行 35 个循环；再进行 72℃延伸 10min。取扩增产物 6µL，以 D2000 为 Marker，进
行琼脂糖凝胶（1.5%）电泳，染色后于紫外灯下观察并拍照。PCR 试剂及 Marker 分别购
自申能博彩生物科技有限公司和天为时代科技有限公司。
1.4 数值分析
选择电泳图谱中带型清晰、重复性好的条带作为数据进行采集。根据条带的有无，分
别赋值“1”和“0”，将 24 个菌株扩增的多态性片段资料转化成二进制数据。采用 SPSS 15.0
软件，用 Furthest neighbor 法进行聚类分析，生成树状图。
2 结果和分析
2.1 引物筛选、RAPD 扩增及数值分析
设计 DNA 混合池，从初筛出的 20 条随机引物中进一步筛选出 S22、S71、S160、S238、
S290、S350 、S477、S1350、S1451、S1454、S1520、S2076 共 12 条具有多态性扩增的引
物，其序列分别为（5′—3′）：TGCCGAGCTG；AAAGCTGCGG；AACGGTGACC；TGGT
GGCGTT；CAAACGTGGG；AAGCCCGAGG；TGACCCGCCT；CAAGGCCCCT；CAAT
CGGGTC；GAACGAGGGT；TGCGCTCCTC；GAACTCCCAG。利用这 12 条引物对 24
个供试菌株分别进行 RAPD 扩增，获得了扩增图谱（图 1）。根据清晰度和可重复性的原
则，在 0.1-2kb 之间共采集了 983 条条带用于数据分析。


图 1 引物 S22 的扩增部分菌株图谱 M：分子量标记；其它数字：菌株编号，同表 1.
Fig. 1 RAPD profile of some isolates based on amplification with primer S1454. M: marker; 4, 6, 7…24: number of each
isolate listed in Table 1.

树状图聚类（图 2）分析显示，截取阈值 20.25 时，24 个菌株分为 5 个分枝：A 分枝
包括所有宿主为拂子茅、雀麦、披碱草的全部中国菌株以及 2 个来自早熟禾的菌株和 3 个
来自鹅观草的菌株；B 分枝仅包括 2 个宿主为早熟禾的菌株（Pnj6601、Pnj6603）；C 分枝
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仅包括两个宿主为鹅观草的菌株（Rdy4302、Rxm4102）；D 分枝包括 3 个宿主为鹅观草的
菌株（Rcs4203、Rnj4301、Ryz5202） 和 1 个欧洲菌株（B9338）；E 分枝包括宿主为 Festuca
parvigluma 的全部菌株 Fnj4201、Fnj4602、Fnj4603 和 1 个宿主为鹅观草的菌株（Rfz2101）。
其中，B、C 分枝只含有宿主为一种植物的菌株；D 分枝则全为 Epichloë sp.菌株（图 2）。
A 分枝较复杂，由五种宿主植物的菌株组成，截取阈值 16.25 时，被分为 A1、A2、
A3 三个亚枝。A1 亚枝由所有宿主为拂子茅、披碱草的菌株和 1 个宿主为早熟禾的菌株
（Pnj6104）组成。A2 亚枝包含宿主为雀麦的黄山菌株和 1 个宿主为早熟禾的南京菌株
（Pnj6107）。A3 亚枝由三个宿主为鹅观草的菌株组成（Rnj6105、Rnj6107、Rxy6103）（图
2）。
2.2 Epichloë 属真菌和 Neotyphodium 属真菌间的差异
四个 Epichloë 属菌株分别采自 4 个不同地点的雀麦和鹅观草，但在聚类上，其亲缘关
系较近，独立成为一枝（图 2），说明 Epichloë 属菌株即使来自不同的宿主植物和不同的
地域，它们依然是遗传差异较小的菌群，这种差异在电泳图中得到表现（图 3-A）。

图 2 供试 24 个菌株聚类树状图 菌株编号同表 1
Fig. 2 The RAPD dendrogram of 24 strains. Species and source of each isolate are listed in Table 1.

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与此不同，Neotyphodium 属菌株聚类相对复杂，截取阈值 20.25 时，被分为 4 个分枝。
A、E 分枝分别包含了不同宿主的菌株，而分枝 B 和 C 中的都是分别来自早熟禾及鹅观草
的菌株。这些说明中国产 Neotyphodium 属菌株中存在很大的差异。
2.3 不同宿主植物菌株之间的差异
宿主为雀麦、拂子茅、小颖羊茅的我国产菌株聚类情况类似，最先独立成为一枝，暗
示了每一种植株中共生的真菌可能分别形成一个分类群（图 3-B、C、D）。与此相反，宿
主为早熟禾、鹅观草的菌株聚类较为分散，截取阈值 20.25 时，早熟禾菌株处在 2 个分枝
上；而鹅观草菌株则处在 4 个分枝上，说明了其共生的真菌存在差异（图 3-E）。
2.4 不同地域采集菌株之间的差异
供试菌株来源于 10 个不同的采集地，采自江苏南京的菌株数量最多，宿主种类最丰
富，因此，聚类情况也较为复杂。截取阈值 20.25 时，除 C 分枝外，在不同的分枝上均有
菌株与异地菌株聚类（图 2）。其中，四个采自南京宿主为拂子茅的菌株及南京的早熟禾中
的 Pnj6104 最先与哈尔滨的披碱草中的 EH5 聚类；而另一菌株 Pnj6107 与安徽黄山的雀麦
中的菌株关系最接近；南京小颖羊茅的三个菌株则与采自福建福州的菌株首先进行聚类；
另两个菌株 Rnj6105、Rnj6107 则与采自山西的菌株亲缘关系最为接近。
2.5 Calamagrostis 属植物内生真菌菌株之间的差异
从图 2 可以看出，来自拂子茅的 4 菌株相对聚类，成为 A 分支 A1 亚枝的主要部分。
而这 4 个菌株之间，在整体类似的主流下也存在着一定的差异，显示了这些菌株中也存在
一定的遗传多样性（图 2，图 3-B）。
2.6 Festuca parvigluma 属植物内生真菌菌株及 Epichloë yangzii 扩增条带的比较
引物 S1454 对 Fnj4603 扩增出 5 条条带，对 Rcs4203 和 Rnj4301（E. yangzii）扩增出 4
条条带，这些条带全部为 Fnj4603 的条带所包含（图 3-F）。这说明本研究使用的来自小
颖羊茅菌株和来自鹅观草的 E. yangzii 之间可能有一定的关联。


图 3 我国 epichloë 内生真菌丰富的遗传多样性特征
Fig. 3 The abundant genetic diversity of epichloë endophyte in China.
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3 讨论
本研究筛选出 12 条随机引物，从 23 个我国产 epichloë 内生真菌菌株获得了 900 多条
重复性好的 RAPD 条带，展示了我国 epichloë 内生真菌具有丰富的多样性（图 1，图 3）。
通过分析，发现 23 个我国产 Neotyphodium 属及 Epichloë 属内生真菌分为 5 大群。首先，
Epichloë 属的全部菌株聚为一枝，而 Neotyphodium 属菌株聚类较为分散，显示出它们间的
差异；其次，宿主为雀麦、拂子茅和小颖羊茅全部菌株又分别聚为一枝且相对独立，显示
了这些菌株的特异性；相反，宿主为鹅观草和早熟禾的菌株则部分聚为一枝，其余分布在
另外的类群中，反映了这些宿主菌株的复杂性（图 2，图 3）。以上结果表明我国有着丰富
的“epichloë endophyte”资源，特别是 Neotyphodium 属真菌具有丰富的遗传多样性。同时
也说明了 RAPD 技术可作为研究禾本科植物内生真菌遗传多样性的有效方法。
除上述属间以及宿主植物间的差异以外，我国 epichloë 内生真菌遗传特征在样品采集
地间也有一定的差异。宿主为鹅观草的 6 个菌株中，同样来自南京的两个菌株首先高度聚
类，和山西菌株 Rxy6103 一起形成 A 分枝中的 A3 亚枝，而来自福建的厦门和山东的东营
（高度盐碱环境）以及福州（我国鹅观草分布的南端）的菌株则分布在分枝 C 和分枝 E，
远离南京菌株的 A3 亚枝。这些说明了即使来自同一种宿主植物，植物的分布区域和生存
环境也使内生真菌造成一定的遗传分化（图 2，图 3-E）。宿主为早熟禾的 4 个南京菌株
中，同样来自南郊的 Pnj6601 和 Pnj6603 高度聚类形成 B 分枝，而来自东郊的 Pnj6104 和
Pnj6107 则属于 A 分枝中的不同亚枝（A1 和 A2）。宿主为雀麦的菌株 B9338 与 Bhs6811
和 Bhs6849 之间的差异很大，除物种的差异以外，可能还存在着采集地的差异（欧洲和中
国黄山），在聚类上分别处于不同的分枝（图 2）。这些结果都显示，我国禾本科植物内
生真菌资源中有着丰富的遗传多样性。
在本研究中，来自拂子茅的 Neotyphodium 属菌株相对聚类，形成一个高度类似的菌群
（图 2）。它们的宿主全部来自南京郊外的无性型植株，不抽穗，没有种子形成，通过丰富
的地下茎进行营养繁殖。由于 Neotyphodium 属内生真菌随植物进行垂直传播，而且至今不
能在植物体外分离得到（Schardl & Leuchtmann 2005），本研究中来自拂子茅的
Neotyphodium 属菌株也只能通过宿主植物的无性繁殖来传播。因此，可认为这类拂子茅的
Neotyphodium 属菌株的起源是相对单一而稳定的。这一点在我们的另一项研究中也得到了
证实（詹漓晖等，未发表）。本研究中 4 个分离菌株之间也有差异（图 2，图 3-B），虽然
差异比较小，但这显示了本研究中的拂子茅与其 Neotyphodium 属菌株共生体的形成已经有
了相当长的时间（Xu et al. 2000）。营养繁殖的拂子茅及其 Neotyphodium 属内生菌株的共
生体的形成和进化将是今后研究中一个十分有趣的问题。
宿主为小颖羊茅的 Neotyphodium 属菌株与 Epichloë 属菌株亲缘关系最近，其中 2 条
引物扩增出菌株 Fnj4603 的条带包含了相应这些引物扩增出所有 E. yangzii 的条带。图 3-F
显示，小颖羊茅菌株 5 条条带包含了 E. yangzii 菌株全部 4 条条带，表明供试宿主为小颖
羊茅的菌株具备了引物 S1454 扩增出 E. yangzii 菌株的性状。另外，所有宿主为小颖羊茅
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的 Neotyphodium 属菌株聚类的分枝 E 与所有 Epichloë 属菌株聚类的分枝 D 又直接聚为一
枝，它们的采集地在南京发生重叠。因此，本研究使用的宿主为小颖羊茅的 Neotyphodium
属菌株可能来源于鹅观草的 E. yangzii 的部分菌株和其它菌株间的杂交。这一点已经在另
一项研究中得到证实（陈永敢等 未发表）。这个结果与之前对 Neotyphodium spp.菌株起源
的报道相符合（Craven et al. 2001；Cabral et al. 1999；Moon et al. 2002）。
来自江苏南京的菌株聚类情况最为复杂。宿主为拂子茅、小颖羊茅、鹅观草的
Neotyphodium 属菌株都分别最先独立聚成一枝，表明各枝的内生真菌可能具有单一的起
源；与此不同，宿主为早熟禾的菌株则分别处于三个分枝，这暗示早熟禾菌株间有起源差
异，可能杂交时间的差异，也可能来自不同的有性型间的杂交，与分离自多年生黑麦草
Lolium perenne Linn.的 N. uncinatum (Gams et al.) Glenn et al.和 N. siegelii 起源相似 （Moon
et al. 2004；Craven et al. 2001）。来自拂子茅和小颖羊茅的内生真菌采集地相同，但聚类上
却相差很远，分别处在 A 和 E 分枝；同样，来自南京东郊的早熟禾和鹅观草内生真菌也表
现出不同的特点，处在 A1、A2 及 A3 分枝（图 2）。同一地点的不同宿主植物中的内生真
菌在聚类上存在明显的差异，充分显示了 epichloë 内生真菌的宿主特异性 （Schardl et al.
2004）。
以上结果说明，我国有着丰富的 epichloë 内生真菌资源，其遗传多样性和宿主特异性
及地理分布多样性等又有着密切的关系，而且各菌群间可能也存在着一定的进化关联。这
些现象，以及我国产植物和其内生真菌共生体的形成、生物学特性等均有待于今后进一步
研究。

致谢：感谢瑞士 Geobotanisches Institute 的 Leuchtmann 教授提供菌株材料。

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