全 文 ：第 36 卷 第 3 期 浙 江 林 业 科 技 Vol. 36 No.3
2 0 1 6年 5月 JOUR. OF ZHEJIANG FOR. SCI. & TECH. May， 2 0 1 6

文章编号：1001-3776（2016）03-0019-05

人工绘制品种鉴别图法鉴定榧树属植物

于华平 1，赵 鹂 1，程晓建 1，王燕飞 2，徐伟军 2
（1. 浙江广播电视大学农学院，浙江 杭州 310030；2. 浙江省龙泉市林场，浙江 龙泉 323700）

摘要：以 19个榧树属植物的嫩叶为试验材料，采用改良 CTAB法进行 DNA提取，选用 11个碱基组成的随机引
物并筛选退火温度对其进行随机扩增的 DNA多态性（RAPD）分析，根据特异性谱带构建相应的图谱关系，通过
人工绘制品种鉴别图法（MCID），快速、准确鉴别这 19个榧树属植物。
关键词：MCID；榧属；RAPD；鉴定
中图分类号：S718.46 文献标识码：A

Identification of Torreya Arn. by MCID Method

YU Hua-ping1，ZHAO Li1，CHENG Xiao-jian1，WANG Yan-fei2，XU Wei-jun2
（1. College of Agriculture, Zhejiang Radio & Television University, Hangzhou 310030, China;
2. Longquan Forest Farm of Zhejiang, Longquan 323700, China）

Abstract： Random primers with the composition of 11 bases were selected for RAPD amplification of 19 species and cultivars of Torreya Arn., and
corresponding map relationships were built according to the specific bands. Species were identified quickly and efficiently through drawing the
diagram manual cultivar identification diagram (MCID).
Key words：MCID method; Torreya Arn.; RAPD；identification

榧树属（Torreya）植物分布于北半球，北美产 2种，日本 1种，中国 4种。榧树（T. grandis）为我国特有
树种，其栽培种香榧（T. grandis cv. Merrillii）更是重要的经济树种，具有很高的观赏价值和综合利用价值。近
年来，随着各地快速发展，它的产量和经济效益也明显提高，在不断的栽培和引种过程中，优良品种和性状也
越来越多，这使得良种的区分也更加困难。因此，快速有效的鉴别榧树属植物对于它的生产经营、品种选育以
及良种进化都有着重要的意义。
对于榧树属植物品种的研究，经历了从宏观的传统形态学研究到微观的细胞学鉴定再到比较精确的分子标
记鉴定。传统的形态学品种鉴定方法由于受到环境条件和自身发育的影响不适于众多品种的区分鉴定；而在细
胞水平上主要研究香榧的染色体组成、性别早期鉴定以及雌雄株的核型等方面。DNA分子标记由于具有标记数
量众多、简单、快速、不受时空和环境影响等特点，在品种鉴定方面有着无可比拟的优势[1~3]。谭晓风等[4]利用
RAPD技术对 8个香榧栽培品种进行系统的聚类分析，结果与传统形态学分类基本吻合；张党权[5]同样也对主栽
的 8个品种进行了系统聚类，并进行品种划分；戴正等[6]利用筛选出的 12条引物分析多个实生品种和优良无性
系的遗传关系。李红等[7]从 RAPD 技术入手构建了香榧的分子遗传图谱。这些研究仅对品种的遗传关系进行了
分析，并没有直接区分大量的品种，而且利用计算机聚类分析获得的进化树无法将多态性标记与品种的区分建
收稿日期：2016-01-22；修回日期：2016-04-18
基金项目：浙江省教育厅科研项目“基于 DNA标记的人工示意图法鉴定香榧品种”（Y201328649）
作者简介：于华平（1986－），女，山东威海人，讲师，从事果树应用基因组学研究，Email:yuhuaping@zjtvu.edu.cn。

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立直接的联系。
人工绘制品种鉴别示意图法[8~9]（manual cultivar identification diagram， MCID）是基于 DNA标记的新方法，
不仅可以利用较少的引物将品种区分开来，而且还可以快速的从品种鉴别示意图上利用不同的引物和谱带的有
无鉴定不同品种，能够将丰富的 DNA 标记信息转化成可用于鉴定大量品种资源的有效信息。该方法在枇杷
（Eriobotrya japonica）、杏（Armeniaca vulgaris）、梅（Armeniaca mume）、葡萄（Vitis vinifera）等果树上已
经适用。Zhang等[9]用了 6个随机引物成功鉴定 25个枇杷品种，并建立了MCID图。Wang等[8]利用MCID法将
54 个花梅品种区分开来，而且仅用了 17 对杏与果梅的 EST-SSR 引物。张晓莹等[10]用 7 次 PCR 就能够将 191
个葡萄品种区分开来。王玉娟等[11]利用MCID法鉴定了 72个葡萄品种。
人工绘制品种鉴别示意图法，操作简便，实用性强，应用在榧树属上，对今后苗木早期鉴定、品种权利保
护[12]、生产中品种的区分、命名等研究都可以提供技术性指导。
1 材料与方法
1.1 材料的选取
在香榧胚乳、幼果、老叶和嫩叶上对 DNA提取进行比较试验，结果表明嫩叶上提取的效果较好[13]。因此，
本研究以榧树属植物嫩叶为试验材料，试验材料均采于浙江农林大学香榧资源圃，共 19个榧树属植物，材料编
码与名称见表 1。
表 1 实验所用榧属植物名称
Table 1 Plants for test
编号 树种和品种 编号 树种和品种
1 香榧 6号 Torreya. grandis‘Xiangfei 6’ 11 新昌 1号 T. grandis‘Xinchang 3’
2 舌叶榧 T. grandis ‘Sheyefei’ 12 香榧 14号 T. grandis‘Xiangfei 14’
3 九龙山榧 T. grandis var. jiulongshanensis 13 香榧 4号 T. grandis‘Xiangfei 4’
4 浦江 4号 T. grandis‘Pujiang 4’ 14 珍珠榧 T. grandis ‘Zhenzhufei’
5 巴山榧 T. fargesii 15 芝麻榧 T. grandis ‘Zhimafei’
6 象牙榧 T. grandis ‘Xiangyafei’ 16 香榧 11号 T. grandis‘Xiangfei 11’
7 香榧 29号 T. grandis‘Xiangfei 29’ 17 新昌 3号 T. grandis‘Xinchang 3’
8 香榧 12号 T. grandis‘Xiangfei 12’ 18 榧树雄株 T. grandis（♂）
9 龙凤香榧 T. grandis ‘Longfengxiangfei’ 19 巴山榧雄株 T. fargesii（♂）
10 浦江 5号 T. grandis‘Pujiang 5’
1.2 方法
1.2.1 榧树属植物嫩叶 DNA的提取 采用改良 CTAB法[14]进行 DNA提取。
1.2.2 引物及退火温度筛选 根据引物长度对 RAPD扩增效果影响的研究结果，在众多果树树种上 11个碱基的
引物要比 9和 10个碱基的引物的扩增效果好[15]。因此，本试验采用 11个碱基的引物用于榧树属植物的品种鉴
定。同时，在 35～45℃设置温度梯度，对随机引物进行退火温度筛选，从中筛选出了 5个引物（见表 2）。通
过琼脂糖凝胶检测，把谱带重复出现、清晰、杂带较少的温度作为退火温度。
1.2.3 用 MCID 法快速鉴定品种 对 19个榧树属植物的 PCR扩增结果进行分析，根据特异性谱带的有无建立品
种区分图谱，快速鉴别品种。
2 结果与分析
2.1 榧树属植物嫩叶 DNA的提取
采用改良的 CTAB 法提取的嫩叶的 DNA
质量较好，可用于日后的扩增，见图 1。
2.2 引物筛选
根据引物的筛选条件即选择 11 个碱基且
梯度 PCR 扩增条带稳定清晰的温度作为退火
从左到右依次为 1~19个榧树属植物
图 1 19个榧树属植物 DNA电泳示意图
Figure 1 DNA electrophoresis patterns of tested plants

3期 于华平，等：人工绘制品种鉴别图法鉴定榧树属植物 21

温度，从 36个随机引物中筛选出 5条 11个碱
基的引物，见表 2。从表 2 可知，这些引物扩
增的结果稳定性和多态性都较好，符合后期品
种鉴定的扩增要求。
2.3 DNA 指纹图谱统计以及品种鉴别的人工
绘图

图 2 用引物 Y3扩增的榧树属的 19个榧树属植物的指纹图谱
Figure 2 Banding patterns of tested plants amplified by primer Y3

根据所筛选的某一条引物对所有榧树属植物的扩增结果，把具有相同扩增谱带的品种划分在一组，不相同
的划分为另一组；如果其中某一品种单独具有或不具有某一特征谱带，该品种就可以被单独区分鉴别出来。 利
用更多的引物将每一组的品种按照上述的方法逐步进行鉴定，直至每个品种都被单独区分出来[11]。最后，将所
利用的引物和多态性谱带的大小（bp）绘制成榧树属植物鉴定图（图 3）。
从图 3可以看出，利用引物 Y3对 19个榧树属植物进行扩增，根据 800 bp的特征性谱带的有无将所测植物
分成 2组。第一组象牙榧、香榧 12号、芝麻榧、香榧 11号都没有 800 bp（-）特征谱带；第二组香榧 6号、舌
叶榧、九龙山榧、浦江 4号、巴山榧、香榧 29号、龙凤香榧、浦江 5号、新昌 1号、香榧 14号、香榧 4号、
珍珠榧、新昌 3号、榧树雄株、巴山榧雄株有 800 bp（+）特征谱带；其中第一组的 4个种再利用引物 Y10进
行区分，象牙榧和香榧 12号根据在 1 200 bp和 500 bp上多态性谱带的有无被区分出来，芝麻榧和香榧 11号由
于谱带一致被分为一组。芝麻榧和香榧 11号用引物 Y6在 750 bp上谱带的有无区分开来。第二组的 15个种利
用 1 300 bp、1 500 bp、800 bp、600 bp和 750 bp谱带的有无分成七 7个亚组：香榧 6号具有单独的谱带 600 bp、
浦江 4号具有单独的谱带 750 bp被单独区分开来，舌叶榧、巴山榧、新昌 1号在 1 500 bp、1 300 bp和 800 bp
谱带上的有无被单独区分。九龙山榧、龙凤香榧、香榧 14号、香榧 4号、新昌 3号、榧树雄株、巴山榧雄株被
分为一个组，香榧 29号、浦江 5号、珍珠榧为一个组，这两个亚组都具有 500 bp和 700 bp两个谱带，但在 800
bp和 1 500 bp两个谱带上的差异使两组区分开来。其次用相同的方法用引物 Y57将两个亚组区分开来，最后利
用引物 Y60将香榧 14号、巴山榧雄株和香榧 4号、新昌 3号分别区分开来。
3 结论与讨论
在以前的研究中，针对 RAPD 技术存在稳定性低的缺点，主要是从镁离子浓度、模板浓度、PCR 循环[16]
条件等方面对体系进行优化。部分研究了引物浓度的影响了。本研究通过引物碱基数量的增加和退火温度的筛
选来优化 RAPD体系，建立一套稳定性好、扩增性强的体系。一般情况下，引物越短，模板序列两端与引物互
补的位点数量越多，也会引起模板互补配对稳定性低的问题。根据引物长度对 RAPD扩增效果影响的研究，在
很多果树树种上 11个碱基的引物要比 9和 10个碱基的引物的扩增效果好，本研究筛选了榧树属的 11个碱基的
随机引物用于 PCR扩增。其次，在 35～45℃设置温度梯度进行退火温度筛选，将重复性好、条带一致的温度作
为退火温度。综上两点，碱基数量和退火温度的选择优化了 RAPD反应体系，在很大程度上克服了 RAPD技术
稳定性差的缺点，提高了品种鉴定的可靠性。
MCID 法虽然在葡萄、枇杷等果树上进行应用，有效的区分了大量品种，但在榧树属上还是首次通过优化
RAPD反应体系，利用 5条引物将 19个种的标记信息转化为实用性的有效信息。之前很多学者对于榧树品种的
鉴定只是针对少数主栽品种，而且使用的引物数量也较多，在引物的碱基数量上大多采用 9~10个碱基的引物。
表 2 引物及其退火温度
Table 2 RAPD primers and annealing temperature
引物编号 引物序列（5’→3’） 退火温度/℃
Y-3 GTTTCGCTCCA 44.3
Y-6 GTTTCGCTCCC 43.7
Y-10 CTGCTGGGACT 42.8
Y-57 ACCCCCGACTA 44.3
Y-60 ACCCCCGACTC 44.8

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1200(+) 6
500(-)
800(-) 6,8,15,16 Y10 500(+) 8
1200(+) 750(-) 15
1200(-) 15，16 Y6
500(+) 750(+) 16

600(+) 1

19 个榧树
属植物
Y3 1300(+) 2
1500(-)
750(+) 4

1500(+) 5
800(-)
1500(+) 11
1,2,3,4,5,7,
9,10,11,12,
13,14,17,
18,19
1300(+)
800(+) Y6 350(-) 7
450(+)
800(-) 7,10,14 Y57 450(-) 10
1500(-) 350(-)
14
350(+)

750(+) 3

800(+) 3,9,12,13,
17,18,19
Y57 600(-) 9
1500(+) 550(-)
600(+) 18
550(-) 1200(+) 12
600(+) 12,19 Y60
550(+) 1200(-) 19


1600(-) 13
600(-) 13,17 Y60
550(+) 1600(+) 17

图 3 5个引物区分 19个榧树属植物的图谱关系示意图
Figure 3 Relationship of schematic map for identifying tested plants by 5 random primers

MCID 法只需要很少的引物就可以将品种区分开来，大大提高了引物的利用效率，同时该方法对实际生产也起
了重要的指导作用。该方法还可以用在其他树种的大量品种的鉴定上，是行之有效的方法，可以真正服务于榧
树属植物的种苗企业、种质资源管理、品种产权保护等各个方面。

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