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Study on the ecological analysis of genetic variation and ecological differentiation of Avicennia marina populations

白骨壤种群遗传变异及分化的生态分析研究



全 文 :第 9卷 第 1期
2 0 01年 3月
中 国 生 态 农 业 学 报
Chinese Journal of Eco-Agriculture
VoI.9 No.1
March, 20 01
白骨壤种群遗传变异及分化的生态分析研究
黎中宝 林 鹏 林益明
(厦门大学生命科学学院 厦门 361005)
摘 要 白骨壤( ㈣ice iamarina)为红村植物。采用垂直板型聚丙烯酰胺凝肢电竦测定了5个白骨壤种群遗传多
样性、遣传分化,分析了白骨壤种群的样地气候和土壤理化指标。研究结果表明,环境因子与白骨壤种群#~Aat一1A,
Aat-ID.Me一1B,Me一1C 4个尊位基因相关性显著.说明环境园子对这 4个尊位基目具有选择压力·他们的变化与环
境变量有*。
关奠词 生态分析 白骨壤 种群 遗传变异
Study OR the e0o 嘻I咖 analys】l of golctlc varla~on and ecological differentiation of Aviv~n~da marina populations·
LI Zhong—Bao.LIN Peng。LIN Yi—Ming(Colege of Life—Science,XiamenUniversity,Xiamen 361005)tCJEA,2001,
9(1):67~70
Abstract Avlce ia marina is mangrove plant.Genetic diversity and genetic differentiation were measured with
the assay of verfieM slab polyacrylamide ge l electrophoresis in Avicennia marina popula~ons.and climate and chem—
istrv physical a3 characteristic of softs were analyzed in sampling sites of 5 A~icennia ma rian popu~tions.The eco—
logical analyses of ge netic variation and ecological diferentiation of Avicenn~a marina populations were studied.
The environmental factors have a significant relation with 4 alleles including Aat一1A,Aat—ID,Me-IB,Me一1C,show—
ing that the environmental factors which relate with the aleles have selective pressure on the 4 alleles,and the 4 al—
Ieles varleel with the environmental factors.
Key words Ecological analysis,Avicennia marina ,PopulationtGene~e variation
白骨壤(Avicennia marina)为红树植物。白骨壤种群维持较高遗传变异和较低遗传分化,本文研究了其
维持较高遗传变异和较低遗传分化的原因.同时也研究了在不同的环境变量情况下对白骨壤种群的遗传变
异和遗传分化产生怎样的影响及其影响程度。
1 试验材料与方法
白骨壤种群样品采自福建省厦门市东屿(N24。28 ,Ell8。05 )、深圳市福Itl(N22 32 .ElI4。05 )、海南省
塔市(N19。58 ,E110"37 )、广西壮族 自治区大冠沙(N21。26 ,El09。14 )和钦州港(N21。37 ,El08。20 ),在选
定的种群样地中株与株间距离相隔 10m以上随机采集幼嫩的白骨壤叶片.保持叶片新鲜不变质,迅速携至
实验室内处理,在-20~冷冻贮藏,尽快测完,由于红树植物富台单宁“ .因此将提取酶缓i中液 进行改进,
以碑酸钾缓冲液代替 Tris—HCI缓冲液(25cm .n lmol/dm。磷酸钾缓冲液,pH7.5,内台 0.019gKCI,
0.05mgCl。.0.01gEDTANa2,5gPVP—K30.0.08g偏亚硫酸钠.1g四硼酸钠.0.25cm’琉基乙醇)。冰浴研成匀
浆,4000r/min冷冻离心 15min,弃击沉淀,上清液备用。电泳酶谱分析及计算方法,电泳采用垂直板型不连
续聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)电泳,浓缩胶和分离胶的浓度分别为2.5 和7.0 ,pH分别为6.7和8.9。昊验
共检测5个酶系统、10个酶位点、29个等位基因。数据分析则使用Biosys一1套装软件0 计算每1种群的等位
基因频率(A),平均每个位点的有效等位基因频率(A )、多态位点百分数(P)、观察杂合度( o)、预期杂合度
( )。土壤指标测试有机质采用重铬酸钾容量法;全N采用硫酸、过氧化氢氧化.纳氏比色}全 P采用硫酸、
高氯酸氧化,钼锑抗比色{总台盐量采用残渣烘干法;pH值采用水缦提,pHS采用 3c精密酸度计测定 。
2 结果与分析
2.1 环境变量与遗传变量
· 国家教育部博士学科点专项科研基盘项目(1999038410)资助
收稿日期 2000-11—21 改回日期:2000-12—06
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68 中 国 生 态 农 业 学 报 第 9卷
环境变量。本研究所涉及的环境变量包括土壤因素、地理因素和气候因素.结果见表 1。
衰 1 白骨壤种群的样地气候与土壤理化指标
Tab.1 Climat~condition and chem-physical indexes of soils in samp]e plots of Adce,mia maria~populations
s 盖 地pl。t。有机质(0r) 全N(n)蔑 毫豁 塞 嚣 箍 cpoHnd)it经on度a(n d)ch纬e度m-(p hy)sic年al均in气de祖x(e s)/℃牟雨量( )
Orsanic RIRte[ Tota[altzogeu Tota[phccphorus Total sah 口H Lo~itude LatMude Average tempcxatu№ Raiah[1
D口 喜爱 n蚰 2_9og 。l165 D.口52 34.29 .78 18—05 34啪, 81.1 Ⅲ6.口
Fut 墨 hen Ⅲ6 o7 ㈨91 80.55 5.38 l14 r 2.32 r 22.o 19孤7
T l }。.Il盏 3.13o 0.071 o.o27 85.61 4.5 10a3 19a5, 23.8 1697.8
要 2Ⅲ D.。28 D.口81 18.57 6.80 Ⅲ.14.21~36 2.4 16 6.9
Q 盛 2_259 。-。61 D.口3B 14_6l 6.65 1 20 r2 r37f 3. 15l2.o
遗传变量。用于分析的遗传变量主要有等位基因频率、多态位点百分数 (P)、平均每位点等位基因数
(d)、有效等位基因数(de)、期望杂合度(H )、观察杂合度(H。),结果见表 2。
· 爱 2 白骨疆种群蠢传变异性 描标 *
Tab.2 Indexes of genetic variability of Avlcennia marina populations
每位 ∽争蠢 器 . l籍 删
p0ImⅪ mult-pmtte~ 目 口 h o口口D嘶
軎 1 ¨) ∞ 1Ⅲ3 0.212(0㈣)o.30(0.Ⅲ)
n
2.o(。l5] 4o 1.526 o.214(0 ) 0.287(0_l51)
Fu 2.8(0.4) 8o 1.703 o.310(0.054) 0.400(0.158)
D 器 I 1.7(0.3) 50 1.5o8 o.353(0.D85)0.30(0.153】
qj : : :{ 1.9(n 4) 50 1.628 0.265(0.094)0.40o(o.163)
P怂 l 2.02 54 1.56 D.z51 3¨9
k 2.50 80 1l5g9 ㈣ 69 ¨ 40
*袁中括号内数据为标准差.
衰 3 环境变量之间的相关关系
Tab.3 Correlative relations among environmental variables
2.2 遗传变异与分化
的生j舂分析
环境变量之间相关
分析。环境变量相关分
析中(见表 3)土壤有机
质含量与土壤全 N、全
P的含量呈显著正相关
关系f土壤中全N与全
P呈极显著正相关关
系 纬度与年均气温呈
显著负相关关系。
裹4 白量曩种鼻鼍传壹异指标平均位之闻的相关性
Tab.4 CorrelatiOn analysis among the ITI∞n 0f genetic
variation indices 0{A~icennia ma~qna populations
遭传享异指标PIn “ “
1
黄传变异指耘 P 0.9339 1
hdic~sd Ae 0.5710 0.8575 1
,ration He 0.7965 0.9393 0.9035 1
Ho 0.6605 0.7064 0.9363 0.8308 1
等位基因频率之间的相关分析。白骨壤种群的等位
基因频率之间有 86对达到完全的线性关系,其中有 44
对为反比例线性关系,42对为正比倒线性关系;另有 2
对(Aat一1A与E 一1A,Mdh一3C与 Mdh一3B)呈极显著负
相关关系f另外还有 18对等位基因频率之间也达到显著
相关性。
遗传变异指标之间的相关性分析。白骨壤种群遗传
变异指标平均值之间的相关分析见表 4,平均每位点等位基因数目(d)和多态位点百分数(P)呈显著正相
关;多态位点百分数(P)和期望杂合度(H )也呈显著正相关;有效等位基因数 目( )和期望杂合度(He)PA
及观察杂和度(H。)呈显著正相关。但在各位点上有效等位基因数目和期望杂合度之间的相关性却较大(见
表5),在Aat一2,Est一2,Est一3,Adh一1位点上的期望杂合度(H )分别和Aat一2,Est一2,Est一3,Adh一1位点上的
有效等位基因数目呈线性关系;在另外的 12对位点上其有效等位基因数 目和期望杂合度呈极显著正相关。
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第 1期 黎中宝等:白骨壤种群遗传变异及分化的生态分析研究 69
囊 5 自t壤种群有效等位基因数与期望杂台度之问的相差性分析
Tab.5 Correlation analysis of number of effective alele and expected heterozpg~itp of Avicennia marina popu]ation
Aat-1 Aat-2 妻 醐率 ¨ 一。
A 一1 0.盼 9* 0.9659* 0 6728 0 9659** 0.9659* 0.9659** 0.4323 — 0.0493 — 0. 3 9
AⅡf 2 O.96 9** l** 0 7883 1** t** l** 0.5740 — 0.3417 — 0. 3 3
目 E st
f
: :9660 1 0.7236 0 9948 *0.7336 0.7236 0.7236 0.3572 —0.3322 —0.3 5
9** l * 0 7883 1** 1** 1** 0.5740 — 0.241 7 — 0. 3 3
All血 E“一3 0.96 9** l * 0.7883 1* 1** l** 0 5740 — 0.24l7 — 0. 3 3
Adh一1 6.96 9** l * 0.7883 1* 1** 1** 0 5740 一 m 241 7 — 0. 3 3
【 洲 ^ 1 0.39 7 0 4894 0 8109 0.4897 0.4894 0.4894 0.9948— 0.3337 — 0. 8 2
^ ^一1 0.00 3 —0 1659 —0 2599 —0.1659 一O.1659 — 0.1859 — 0.1584 0.9944— 0. 3 2
^^ 3 一O.68 r9 —0 5699 —0 3948 — 0.56鲫 一 0.5899 — 0.5699 — 0.3657 — 0.6338 — 0. 9 1*
环境变量与白骨壤种群的等位基因频率之间的相关分析 由表 6可知,Aat-1A与pH呈显著的正相关 ;
Aat一]D与有机质含量呈极显著正相关,与全 N和全盐量均呈显著正相关;Me-1B与气候因素中年均气温呈
显著相关性;Me-1C与全 N量呈显著相关性,与地理因素中经度呈显著正相关,与纬度相关性较大,但未达
显著水平。由此可知,与环境变量呈显著相关的等位基因有 Aat-lA,Aat-lD,Me-1B,Me-1C 4个等位基因。
裹 6 环境变量与白骨壤种群等位基因频率之闻的相关性分析
Tab.6 Correlation aⅡalysis between aLlelic frequency 0f Avicennia marina population and environmental variable
盎 ‘ “ n
— — o.370
— 0.122
0.122
0.984*
0.122
— 0.122
0.132
0.363
0.4l3
— — 0.560
— — 0.560
0.413
— 0.122
0.122
— 0.122
0.122
— 0.122
0.122
— 0.122
— — 0.369
0.863
— 0.375
— — 0 897
0.897
— — 0.897
0.897
— 0.122
— 0.238
O.35O
— — O.173
— — 0.274
— — 0.374
O.893
0.274
— — 0.274
0 274
0 l66
0.318
— — 0.418
— — 0.418
0.318
一 n 274
0.274
一 O,274
0 274
— 0.274
0.274
— 0.274
— 0.489
0.892
— 0.507
— 0.578
0.578
— — O.578
0.578
— 0.274
— 0.027
0.143
— 0.092 —0.586 0.926* 0.075 0.6l9 — 0.437 0 176
— 0.356 0 596 —0.729 —0.2l9 —0.709 0.583 —0.163
— 0.356 0.596 —0.729 —0.219 —0.709 0.583 —0.163
O.894* 一0.020 —0.393 0.287 0.182 一O.29l 一0.025
0.356 —0.596 0.729 0.219 0.709 — 0.583 0 163
— 0.356 0 996 —0.729 —0.219 — 0.709 0.583 —0.163
0.S56 —0 596 0.729 0.2l9 0.709 — 0.583 0.163
0.085 0 987 —0.925* 一0.078 —0.822 0.440 —0.176
0.347 —0.475 0.183 —0.083 0.231 — 0.374 0.071
— 0.420 0 307 0.146 0.120 —0.024 0.25l 一0.O13
— 0.420 0.307 O.145 0.120 —0.024 0.251 —0.Ol3
0.347 —0.478 0.183 —0.083 0.231 — 0.374 0.071
— 0.356 0.596 —0.729 一O.219 —0.709 0.583 —0.163
0.356 —0.596 0.729 0.2l9 0.709 — 0.583 0 163
— 0.356 0.596 —0.729 —0.2l9 —0.709 0.583 —0.163
0.356 —0 596 0.729 0.219 0.709 —0.583 0.163
— 0.389 0 896 —0.729 —0.2l9 —0.709 0 583 —0 163
0.356 — 0.596 0.729 0.2l9 0.709 一 吼 583 0 163
— 0.356 0.596 —0.729 —0.2l9 —0.709 0.583 —0.163
— 0.400 —0.225 —0.419 —0.808 —0.668 — 0.91l* 0.858
0.859 0.300 0.223 0.909* 0.811 — 0.790 —0.418
— 0.557 —0.144 0.218 —0.404 —0.203 — 0.068 —0.193
— 0.698 0 504 0.398 0.148 0.064 — 0.229 —0.627
0.698 —0 504 一O.398 ——0.145 —0.064 0.229 0 627
— 0.698 0 604 O.398 0.145 0.064 — 0.229 —0.827
0.698 —0.504 —0.399 —0.145 —0 064 0.229 0.827
— 0.356 0.596 —0.729 —0.2l9 —0.709 0.583 —0.163
— 0.0fi2 —0 l18 D.876 0.379 0.7l8 一O.785 —0.374
0.209 —0 078 一O.825 ——0.387 ——0.830 0.737 0 530
环境变量与白骨壤种群各位点期望杂合度的相关分析 由表 7可知,M 一1位点的期望杂合度与经度呈
显著负相关.与纬度和年均气温相关性较大.与土壤因素中全 N、全P相关性也较大.但均未达显著水平。
囊 7 环境变量与白骨奠种群各位点期望杂台度之闻的梧关性分析
Tab.7 Correlation anal between environmental~riable and expected heterozygosity of Av~cennia marina population
墨 ‘ T
Aat一1 0.1369 —0.0444 —0.1284 0. 0 , 一 0.8582 —0.1494 O.6844 0. 240 —0 1
Aat一2 — 0.1218 —0.3739 ——0.3560 0. 9 6 —0.7293 —0.219O —O.7096 O. 828 —0 1
B l 一 0.4115 — 0.9194 —0.3451 9. 8 7 一O.1875 0.07O7 — 0.2385 0. 884 一 O.O
B 2 — 0.1218 —0.2739 —0.3560 0. 9 6 一O.72郫 一n 2190 一 。.7096 O. 828 —0 l
Est一3 — 0.1218 一O.2739 —0.3560 0. 9 6 一O.7293 一O.219O — O.7O96 O. 828 —0.1
^ 一^1 一 O.1218 一 O.2739 —0.356O 0. 9 6 一O.7293 一O.219O — O.7O96 O. 828 一 O.1
一 1 一O.6437 一 O.87O9 一 U.8342 —0. 6 j 一0 2679 一O.9O0o* 一 0.85 0. 592 0 4
^d^ 1 O.6532 O.S259 0.B5O6 —0. 1 4 —0.4360 一 O.1929 一 O.1192 0.
^d^3 一O.3387 一 O 1324 —0.1959 0.08 4 0.82O2 O.3934 0.6327 一O. 441 一O 5
环境变量与白骨壤种群遗传变异指标平均值之间的相关分析。研究发现.平均每位点等位基因数目( )
与 pH值的大小呈显著负相关;有效等位基因数目( )与年均气温呈显著正相关}期望杂合度(H )与纬度
呈显著负相关,与年均气温呈显著正相关;观察杂合度(H。)与年均气温呈显著正相关(见表 8)。
m_Jm幄丛皿 m_Jm堰丛m啦姐¨邶mm m 蛐 加m锄rJ 玺嚣嚣嚣
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70 中 国 生 态 农 业 学 报 第 9卷
裹 8 环境变量与白骨壤种群遗传变异备指标均值之俩的相关性分斩
Tab.8 Corre1ation analysis between environmental varlab[e and genetic variadon index of Amcennia marina population
3 小结与讨论
在对白骨壤种群的研究中发现,白骨壤种群等位基因频率与土壤因素有一定的相关性。研究发现,
Aat一1A的等位基因频率与pH值呈显著正相关;Aat一1D与土壤中有机质含量呈极显著正相关,与全 N和全
P均呈显著正相关;Me一1C与全N含量呈显著正相关,我们发现在被研究的 30个等位基因中有 Aat一1A,
Aat一1D,Me一1C 3个等位基因与土壤因素有关,占1o 。同时发现平均每位点等位基因数目与pH值呈显著
负相关 Heywood T.S.和Levin D.A.口 在研究北美广布的天人菊(Gailardia pulchela fouger)时发现,等
位基因频率与土壤特征相关。Nero E. a1.口 在研究 Trlt;cum turgidum 口r.dicoccoides”时发现,生态因子
(尤其是土壤因子)对 Pgi一3A,Aat一1A,Aat一1B和Pgi一2B等等位基因或它们相连的基因组具有选择压力,
从而造成种群遗传结构在微地理或太范围的分化。
白骨壤种群的等位基因频率,期望杂合度的均值以及各位点的期望杂合度与地理因素有相关性。Me一1C
的频率与经度呈显著正相关(在研究的范围内),与纬度也有很太的相关性,但未达到显著水平;期望杂合度
的均值( )与纬度呈显著负相关;位点Me一1的期望杂台度与经度(被研究的白骨壤种群范围内)呈显著负
相关。Soler C.vt a1.” 在研究“Elytr pungens 时发现,Pgi一7,Pgm一8及Mdh一2与纬度呈显著负相关,而
Cpx一2,Cpx-4与纬度呈极显著正相关,在“Elytrigia repens”中的低纬度的种群遗传变异大。陈小勇(1卵5)发
现青冈种群中的Pod一1A与纬度呈正相关,Pod-2与纬度呈负相关。
白骨壤种群的等位基因频率,遗传变异指标(Ae、He、 )与气候因子中的年均气温相关性很大。研究发
现,Me一1B与年均气温呈显著正相关;同时还发现年均气温与有效等位基因数目(m )、期望杂和度( )、观
察杂舍度(H。)(种群均值)均呈显著正相关。陈小勇(1995)在研究青冈时发现,Pod—l与降雨量呈显著负相
关,与温度因子也呈负相关。Comps B.et a1.口’研究了欧洲水青冈 (Fagus sylratica)种群时发现,等位基因
Pob-I,Pob一2与气候变化相关,P。扣2与海拔高度相关 综上所述,环境因子与白骨壤种群的 Aat一1A,
Aat一1D,Me一1B,Me一1C 4个等位基因相关性显著,这说明环境因子对这 4个等位基因具有选择压力,他们的
变化与环境变量相关。
参 考 文 献
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