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Effects of cotton stalk biochar on microbial community structure and function of continuous cropping cotton rhizosphere soil in Xinjiang, China.

施用棉秆炭对新疆连作棉花根际土壤微生物群落结构和功能的影响


以棉秆移除(NPK)和棉秆还田(NPKS)为对照,采用平板计数、Biolog和DGGE等3种方法,研究了棉秆移除基础上施用常量棉秆炭(22.50 t·hm-2,NPKB-1)和增量棉秆炭(45.00 t·hm-2,NPKB-2)对新疆连作棉花根际土壤微生物数量、群落功能和结构多样性的影响.结果表明:与NPK和NPKS处理相比,棉秆炭施用显著增加了连作棉田根际土壤中细菌和放线菌数量;NPKB-1处理真菌数量显著高于NPK处理,但增量棉秆炭NPKB-2处理与NPK处理差异不显著;2个棉秆炭处理的真菌数量均低于NPKS处理.棉秆炭处理AWCD值较高,显著提高了微生物丰富度指数,可促进利用糖类、氨基酸类和羧酸类碳源的微生物生长,尤其是利用与根系分泌物相关的酚酸类碳源的微生物.DGGE电泳结果表明,施用棉秆炭(尤其是增量棉秆炭)后,土壤细菌DGGE图谱条带数增多,增加了土壤中芽单胞菌门、酸杆菌门、变形菌门和放线菌门中一些菌群的丰度.UPGMC聚类分析表明,NPKB-2处理明显区别于其他处理,而NPKS、NPK和NPKB-1处理细菌群落结构相似.表明高量施用棉秆炭可显著提高棉花根际土壤微生物多样性,并明显改变土壤细菌群落结构,对连作棉田生态系统健康有改善作用.

In this study, field trials were conducted to examine the effects of cotton stalk biochar on microbial population, function and structural diversity of microorganisms in rhizosphere soil of continuous cotton cropping field in Xinjiang by plate count, Biolog and DGGE methods. The experiment was a factorial design with four treatments: 1) normal fertilization with cotton stalk removed (NPK); 2) normal fertilization with cotton stalk powdered and returned to field (NPKS); 3) normal fertilization plus cotton stalk biochar at 22.50 t·hm-2(NPKB-1); and 4) normal fertilization plus cotton stalk biochar at 45.00 t·hm-2(NPKB-2). The results showed that cotton stalk biochar application obviously increased the numbers of bacteria and actinomycetes in the rhizospheric soil.  Compared with NPK treatment, the number of fungi was significantly increased in the NPKB-1 treatment, but not in the NPKB-2 treatment. However, the number of fungi was generally lower in the biochar amended (NPKB-1, NPKB-2) than in the cotton stalk applied plots (NPKS). Application of cotton stalk biochar increased values of AWCD, and significantly improved microbial richness index, suggesting that the microbial ability of utilizing carbohydrates, amino acids and carboxylic acids, especially phenolic acids was enhanced. The number of DGGE bands of NPKB-2 treatment was the greatest, with some species of Gemmatimonadetes, Acidobacteria, Proteobacteria and Actinobacteria being enriched. UPGMC cluster analysis pointed out that bacterial communities in the rhizospheric soil of NPKB-2 treatment were different from those in the NPK, NPKS and NPKB-1 treatments, which belonged to the same cluster. These results indicated that application of cotton stalk biochar could significantly increase microbial diversity and change soil bacterial community structure in the cotton rhizosphere soil, thus improving the health of soil ecosystem.


全 文 :施用棉秆炭对新疆连作棉花根际土壤
微生物群落结构和功能的影响
顾美英1  唐光木2  刘洪亮3  李志强3  刘晓伟3  徐万里2∗
( 1新疆农业科学院微生物应用研究所 /新疆特殊环境微生物实验室 /绿洲养分与水土资源高效利用重点实验室, 乌鲁木齐
830091; 2新疆农业科学院土壤肥料与农业节水研究所, 乌鲁木齐 830091; 3石河子农业科学研究院, 新疆石河子 832000)
摘  要  以棉秆移除(NPK)和棉秆还田(NPKS)为对照,采用平板计数、Biolog 和 DGGE 等 3
种方法,研究了棉秆移除基础上施用常量棉秆炭(22. 50 t·hm-2,NPKB1)和增量棉秆炭
(45.00 t·hm-2,NPKB2)对新疆连作棉花根际土壤微生物数量、群落功能和结构多样性的影
响.结果表明:与 NPK和 NPKS处理相比,棉秆炭施用显著增加了连作棉田根际土壤中细菌和
放线菌数量;NPKB1处理真菌数量显著高于 NPK处理,但增量棉秆炭 NPKB2处理与 NPK处理
差异不显著;2个棉秆炭处理的真菌数量均低于 NPKS 处理.棉秆炭处理 AWCD 值较高,显著
提高了微生物丰富度指数,可促进利用糖类、氨基酸类和羧酸类碳源的微生物生长,尤其是利
用与根系分泌物相关的酚酸类碳源的微生物.DGGE 电泳结果表明,施用棉秆炭(尤其是增量
棉秆炭)后,土壤细菌 DGGE图谱条带数增多,增加了土壤中芽单胞菌门、酸杆菌门、变形菌门
和放线菌门中一些菌群的丰度.UPGMC 聚类分析表明,NPKB2处理明显区别于其他处理,而
NPKS、NPK和 NPKB1处理细菌群落结构相似.表明高量施用棉秆炭可显著提高棉花根际土壤
微生物多样性,并明显改变土壤细菌群落结构,对连作棉田生态系统健康有改善作用.
关键词  棉秆炭; Biolog; DGGE; 根际; 连作棉花
本文由国家自然科学基金项目(41261065,41261059)和新疆维吾尔自治区科技支撑计划项目(201431108)资助 This work was supported by the
National Natural Science Foundation of China (41261065,41261059) and the Science and Technology Support Project of the Xinjiang Uygur Autonomous
Region (201431108) .
2015⁃03⁃20 Received, 2015⁃10⁃12 Accepted.
∗通讯作者 Corresponding author. E⁃mail: wlxu2005@ 163.com
Effects of cotton stalk biochar on microbial community structure and function of continuous
cropping cotton rhizosphere soil in Xinjiang, China. GU Mei⁃ying1, TANG Guang⁃mu2, LIU
Hong⁃liang3, LI Zhi⁃qiang3, LIU Xiao⁃wei3, XU Wan⁃li2∗ ( 1 Institute of Microbiology, Xinjiang
Academy of Agricultural Sciences / Xinjiang Laboratory of Special Environmental Microbiology / Key
Laboratory of Nutrient and Water Resources Efficient Utilization of Oasis, Urumqi 830091, China;
2Institute of Soil and Fertilizer and Agricultural Sparing Water, Xinjiang Academy of Agricultural Sci⁃
ences, Urumqi 830091, China; 3Shihezi Academy of Agricultural Sciences, Shihezi 832000, Xin⁃
jiang, China) .
Abstract: In this study, field trials were conducted to examine the effects of cotton stalk biochar on
microbial population, function and structural diversity of microorganisms in rhizosphere soil of con⁃
tinuous cotton cropping field in Xinjiang by plate count, Biolog and DGGE methods. The experiment
was a factorial design with four treatments: 1) normal fertilization with cotton stalk removed
(NPK); 2) normal fertilization with cotton stalk powdered and returned to field (NPKS); 3) nor⁃
mal fertilization plus cotton stalk biochar at 22.50 t·hm-2 (NPKB1); and 4) normal fertilization
plus cotton stalk biochar at 45.00 t·hm-2 (NPKB2). The results showed that cotton stalk biochar
application obviously increased the numbers of bacteria and actinomycetes in the rhizospheric soil.
Compared with NPK treatment, the number of fungi was significantly increased in the NPKB1 treat⁃
ment, but not in the NPKB2 treatment. However, the number of fungi was generally lower in the
biochar amended (NPKB1, NPKB2) than in the cotton stalk applied plots (NPKS). Application of
cotton stalk biochar increased values of AWCD, and significantly improved microbial richness in⁃
应 用 生 态 学 报  2016年 1月  第 27卷  第 1期                                            http: / / www.cjae.net
Chinese Journal of Applied Ecology, Jan. 2016, 27(1): 173-181                    DOI: 10.13287 / j.1001-9332.201601.002
dex, suggesting that the microbial ability of utilizing carbohydrates, amino acids and carboxylic
acids, especially phenolic acids was enhanced. The number of DGGE bands of NPKB2 treatment
was the greatest, with some species of Gemmatimonadetes, Acidobacteria, Proteobacteria and Acti⁃
nobacteria being enriched. UPGMC cluster analysis pointed out that bacterial communities in the
rhizospheric soil of NPKB2 treatment were different from those in the NPK, NPKS and NPKB1 treat⁃
ments, which belonged to the same cluster. These results indicated that application of cotton stalk
biochar could significantly increase microbial diversity and change soil bacterial community structure
in the cotton rhizosphere soil, thus improving the health of soil ecosystem.
Key words: cotton stalk biochar; Biolog; DGGE; rhizosphere; continuous cropping cotton.
    2013年统计数据表明,新疆植棉面积和总产量
分别占全国的 38.9%和 53.9%[1],是我国最大和最
重要的商品棉生产基地.棉花占新疆耕地面积的三
分之一,主产棉区棉花面积占耕地总面积的 60􀆰 0%
以上,连作现象很普遍.就地粉碎还田是目前棉秆利
用的主要方式.棉秆还田虽能增加土壤有机质,提高
土壤保水保肥性能,但棉秆木质化程度高,腐解速度
缓慢[2],且带病菌棉秆长期还田导致棉田枯、黄萎
病加重[3],棉秆分解产生的化感物质在土壤中积累
的自毒效应[4-5]也进一步加重了连作障碍,这些都
严重影响新疆棉花产业健康可持续发展.
生物炭具有含碳量高、孔隙发达、比表面积大、
吸附性、抗氧化能力强等特性[6],能提升土壤稳定
碳库储量、改善土壤理化性质、促进作物生长、消除
秸秆上携带的病原菌及通过吸附土壤中化感自毒物
质,缓解作物连作障碍[7-9] .利用丰富的农作物秸秆、
果树枝条、豆渣及粪便等农业废弃生物质资源生产
的生物炭被认为是很有前景的土壤改良材料[10-12],
既有利于对废弃生物质的利用和管理,也有助于解
决废弃生物质弃置、焚烧、随意排放的环境污染问
题.目前的研究表明,生物炭对土壤物理、化学和生
物学性质的影响与其自身特性密切关系[13-15],而棉
秆炭化后形成的棉秆炭在农业生产中的应用刚刚起
步[16-18],还需进行深入研究.
微生物是土壤生态系统重要组成部分,增加土
壤微生物群落结构多样性对提高农田生产力、抑制
土传病害等具有重要意义[19] .目前,生物炭对土壤
微生物多样性的影响已有报道,但也存在一些争议,
这与生物炭的性质、施用量及土壤理化性质等关系
密切.何莉莉等[20]分析表明,秸杆还田带有大量营
养元素,短期内会促进分解纤维素的微生物生长;而
生物炭除适合作为微生物和养分的载体外,其含有
的一些低分子易分解有机化合物还可以作为微生物
碳源.因此,秸秆炭化还田与秸秆还田均可改善土壤
微生物丰富度,但秸秆炭化还田细菌丰富度更高,细
菌种群较多.侯亚红等[21]和刘鸿骄等[22]研究表明,
秸秆生物炭还田的土壤有机碳含量显著高于秸秆直
接还田土壤,但秸秆炭高度芳香化的碳组分具有生
物化学稳定性,难以被土壤微生物快速分解.因此,
生物炭还田对土壤微生物总量和活性无显著的促进
作用,反而有一定的抑制作用.Wu 等[23]研究表明,
与秸秆还田相比,小麦生物炭还田土壤中脲酶活性
增加,β⁃糖苷酶和脱氢酶活性显著下降.Zhang 等[10]
对 3种秸秆生物炭进行比较发现,花生壳和稻草秸
秆生物炭增加了土壤微生物生物量碳,而油菜生物
炭则没有作用.Jin[24]对施用不同量木材生物炭的农
田研究发现,随着生物炭施用量的增加,土壤微生物
组成出现明显差异,尤其是高生物炭施用量的根际
土壤与对照差异明显.
本文利用平板计数法、Biolog 碳源利用和 PCR⁃
DGGE 分子生物学技术,比较常规施肥条件下棉秆
移除、棉秆还田和炭化还田处理下新疆连作棉花根
际土壤微生物多样性的变化,揭示棉秆直接还田和
炭化还田对棉田土壤微生物多样性的影响,为棉秆
的有效利用、连作棉花土壤质量演变及其生产能力
的提高提供科学依据.
1  材料与方法
1􀆰 1  试验设计
试验于 2013年在新疆石河子农业科学研究院
连作棉田中进行.该试验田地处 44°20′ N、86°03′ E,
属典型温带大陆性气候.棉花为覆膜滴灌栽培模式,
土壤为灌耕灰漠土,其中砂粒、粉粒和黏粒含量分别
为 26.5%、45.6%、27.9%.土壤的基本理化性质为有
机碳 12.50 g·kg-1,速效氮 28.31 mg·kg-1,速效磷
12.45 mg·kg-1,速效钾 286.37 mg·kg-1,pH 8.32,
电导率 0.20 mS·cm-1 .
棉秆炭由新疆农业科学院土壤肥料与农业节
水研究所提供,其基本理化性质为有机碳 771􀆰 80
g·kg-1,全氮 15.72 g·kg-1,全磷 15.31 g·kg-1,全
471 应  用  生  态  学  报                                      27卷
钾 25.04 g·kg-1,pH 10.27,电导率 4.38 mS·cm-1 .
热解温度 400~700 ℃,裂解时间 1~2 h.将生物炭磨
碎并过 2 mm 筛.试验设 4 个处理:1) NPK:常规化
肥+棉秆移除;2)NPKS:常规化肥+棉秆全量粉碎耕
层混匀还田;3)NPKB1:常规化肥+棉秆移除+常量
棉秆炭(施用量 22. 50 t·hm-2,为耕层土质量的
1%);4)NPKB2:常规化肥+棉秆移除+增量棉秆炭
(施用量 45.00 t·hm-2,为耕层土质量的 2%).每处
理 3 次重复,随机排列.棉花播种前划分小区,添加
生物炭处理将棉秆炭撒匀后人工翻地,在 20 cm 深
度处混匀.试验处理水肥管理相同,基肥为磷酸二铵
75 kg·hm-2和尿素 225 kg·hm-2,播种前地表撒施
翻耕;生育期随水滴肥 7 ~ 8 次,每次滴水 120 ~ 180
m3·hm-2,每次随水滴施尿素 60~120 kg·hm-2 .
1􀆰 2  土样采集
于 2013年 9月采用 5 点法采集不同处理棉花
根际土壤.根际土壤采用抖土法采集,挖取 0-20 cm
土层棉花完整根系,并除去根围附近较大的土壤团
块,轻轻抖下棉花根表面的土壤作为根际土壤.将每
个处理所有土样混匀后作为该施肥处理的 1个土壤
样品.将样品混匀后分成 2份,1份鲜样于 4 ℃保存,
进行微生物计数和土壤微生物群落碳源利用测定,
另外 1份于-70 ℃保存,用于 PCR⁃DGGE分析.
1􀆰 3  土壤微生物数量测定
采用稀释平板涂抹培养计数法分析.细菌采用
牛肉膏蛋白胨琼脂培养基,放线菌采用改良的高氏
一号培养基(每 300 mL 培养基中加 3%重铬酸钾 1
mL),真菌采用 PDA 培养基(每 100 mL 培养基加
1%链霉素溶液 0.3 mL) [25] .
1􀆰 4  土壤微生物群落碳源代谢利用测定
采用 Biolog⁃Eco微平板法进行.称取 10 g 鲜土
加入 100 mL灭菌的生理盐水(0.85%)中,摇匀,静
止片刻,然后将土壤样品稀释至 10-3 .取 150 μL 菌
悬液接种到生态板的每一个孔中,25 ℃恒温培养,
每隔 24 h分别在 590 nm波长下读数,连续培养 7 d.
取 120 h的平均光密度值进行多样性分析[25] .
1􀆰 5  土壤细菌群落结构多样性的 DGGE分析
1􀆰 5􀆰 1 16S rRNA V3区 PCR扩增  采用生工 SK8233
土壤基因组快速抽提试剂盒提取土壤样品总 DNA.以
样品总 DNA 为模板,采用引物 F357(5′⁃CCTACGG⁃
GAGGCAGCAG⁃3′)和 R518 (5′⁃ATTACCGCGGCTGCT⁃
GG⁃3′),GC 发卡结构(5′⁃CGCCCGCCGCGCCCCGCGC⁃
CCGGCCCGCCGCCCCCGCCCC⁃3′)对细菌 16S rRNA
V3高变区进行扩增.PCR扩增反应体系(50 μL): 超
纯水(ddH2O) 41.25 μL,10×缓冲液(含 2.0 mmol·
L-1MgCl2) 5 μL,dNTP (10 mmol·L
-1) 1 mL,F357⁃
GC(10 mmol·L-1)1 mL,R518(10 mmol·L-1)1 mL,
Taq酶(5 U·mL-1)0.25 mL,模板 DNA 0.5 mL.反应
程序:94 ℃4 min预变性;94 ℃0.5 min;56 ℃ 1 min;
72 ℃0.5 min;30个循环,72 ℃延伸 7 min.扩增完成
后用 1.5%琼脂糖凝胶电泳检测产物特异性.
1􀆰 5􀆰 2变性梯度凝胶电泳和条带序列分析  取样品
各 400 ng的 V3区 PCR产物,采用 DCode 突变检测
系统对样品进行 DGGE 分析.所用的聚丙烯酰胺凝
胶浓度为 8%(丙稀酰胺 ∶ 双丙稀酰胺= 37.50 ∶ 1),
变性剂浓度为 30% ~ 60% ( 100%的变性剂为 7
mol·L-1尿素,40%甲酰胺).在 60 V 电压下,60 ℃
恒温,1×TAE中电泳 16 h.电泳完毕后,用超纯水冲
洗胶,然后将胶放进含 EB 的染液中,置于摇床上染
色 30 min后,在 UVI成像系统拍照.
1􀆰 5􀆰 3 DGGE部分条带序列分析  将 DGGE 图谱中
优势和特异条带分别切下并装入 1.5 mL离心管中,
按生工 SK8131试剂盒方法回收后进行 PCR扩增并
回收.PCR反应体系与程序同 1.5.1. PCR 产物纯化
后进行感受态细胞连接转化并克隆测序(上海生工
生物工程股份有限公司).
1􀆰 6  数据处理
微平板孔中溶液吸光值的平均颜色变化率
(AWCD)用于描述土壤微生物代谢活性,计算公式
如下:
AWCD =∑(C i - R i) / n
式中:C i为每个有培养基孔的吸光值;R i为对照孔的
吸光值;n为培养基孔数,Biolog⁃Eco板 n值为 31.
采用 Simpson、Shannon 和 McIntosh 3 个指数表
征土壤微生物群落功能多样性.其中,Simpson 指数
(D)用于评估某些最常见种的优势度,Shannon 指数
(H)用于评估物种的丰富度,McIntosh 指数(U)用
于评估群落物种均匀度.计算公式如下:
D = 1 - ∑ ni(ni
- 1)
N(N - 1)
H =- ∑P i lnP i
U =
N - ∑ni
N - N
式中:P i为第 i 孔的相对吸光值与整个微平板的相
对吸光值总和的比值(C i-R i) / ∑(C i-R i);ni为第
i孔的相对吸光值(C i-R i);N 为相对吸光值的总和.
5711期                顾美英等: 施用棉秆炭对新疆连作棉花根际土壤微生物群落结构和功能的影响         
采用 DPS 9.50 软件对数据进行分析.采用单因
素方差分析 ( one⁃way ANOVA)、最小显著差数法
(LSD)进行多重比较和差异显著性检验(α = 0.05).
DGGE图谱聚类分析采用非加权组平均法(UPG⁃
MA).
系统进化树分析:将 DGGE 条带测序所得序列
用 Blast程序与 NCBI 基因库中的序列进行比对,获
取最相近标准菌株的 16S rRNA 基因序列,利用
MEGA 4.0软件包采用邻接法进行系统进化树的构
建及多样性分析.
2  结果与分析
2􀆰 1  棉秆炭对连作棉花根际土壤可培养微生物数
量的影响
从图 1可以看出,棉秆移除、棉秆还田和棉秆炭
施用条件下,连作棉田根际土壤可培养微生物数量
差异显著.与 NPK 和 NPKS 处理相比,棉秆炭处理
细菌数量显著升高,常量棉秆炭处理(NPKB1)分别
升高 32.3%和 377.8%,增量棉秆炭处理(NPKB2)分
别升高 107.1%和 647.8%.放线菌数量也显著升高,
NPKB1处理分别升高 133.3%和 12.8%,NPKB2处理
分别升高 236. 8%和 62. 8%.与 NPK 处理相比,
NPKB1处理真菌数量显著升高,增幅为 88.7%,但
NPKB2处理与其差异不显著;与 NPKS 处理相比,两
者真菌数量均显著下降,NPKB1和 NPKB2处理分别
下降了 75.9%和 87.5%.
2􀆰 2  棉秆炭对连作棉花根际土壤微生物功能多样
性的影响
2􀆰 2􀆰 1 平均颜色变化率  平均颜色变化率(AWCD)
图 1  不同处理连作棉花根际土壤可培养微生物数量
Fig.1   Culturable microbial quantities in continuous cropping
cotton rhizosphere soil under different treatments.
Ⅰ: 细菌 Bacteria ( × 106 CFU· g-1 ); Ⅱ: 放线菌 Actinomycetes
(×105 CFU·g-1); Ⅲ: 真菌 Fungi (×104 CFU·g-1).
反映微生物对碳源的利用率,AWCD 值越大,表明
土壤微生物活性越强.从图 2 可知,不同处理土壤微
生物群落 AWCD值存在一定的差异,说明其群落能
利用单一碳源的微生物数量和种类不同.总体表现
为 AWCD值随培养时间的延长而不断升高.接种培
养后,土壤微生物在 24 h 内增长比较缓慢,之后进
入对数增长期直至 120 h,然后生长减缓逐渐趋于稳
定.在培养 7 d 内,NPKB1和 NPKS 处理 AWCD 值均
明显高于 NPK 处理,其中 NPKB1处理 AWCD 值最
高.而 NPKB2处理在 120 h 以前均低于 NPK 处理,
120 h 才高于 NPK 处理,但较 NPKB1和 NPKS 处
理低.
2􀆰 2􀆰 2根际微生物群落多样性指数分析  为了进一
步确定棉秆炭对土壤微生物功能多样性的影响,利
用 144 h 的 AWCD 值计算了 Simpson 优势度指数、
Shannon 丰富度指数、和 McIntosh 均匀度指数.由表
1可见,在培养 144 h 时,各处理 AWCD 值顺序为
NPKB1>NPKS>NPKB2 >NPK.各处理间优势度指数
和均匀度指数差异不显著.丰富度指数以棉秆炭处
图 2  不同处理连作棉花根际土壤微生物群落平均颜色变
化率
Fig.2   AWCD of microbial community in continuous cropping
cotton rhizosphere soil under different treatments.
表 1  不同处理连作棉花根际土壤微生物群落功能多样性
指数
Table 1  Microbial community functional diversity indices
in continuous cropping cotton rhizosphere soil under dif⁃
ferent treatments
处理
Treatment
平均颜色变化率
AWCD
优势度指数
Simpson index
丰富度指数
Shannon index
均匀度指数
McIntosh index
NPK 1.11±0.06c 0.98±0.01a 3.20±0.11b 0.95±0.01a
NPKS 1.35±0.15b 0.98±0.00a 3.25±0.20a 0.94±0.00a
NPKB1 1.47±0.13a 0.98±0.00a 3.28±0.07a 0.94±0.01a
NPKB2 1.19±0.02c 0.99±0.01a 3.27±0.08a 0.95±0.01a
同列不同字母表示差异显著(P<0.05)Different letters in same column
meant significant difference at 0.05 level.
671 应  用  生  态  学  报                                      27卷
理最高,其次是棉秆还田处理,且与棉秆移除差异显
著.说明棉秆炭处理下利用 Biolog 微平板上碳源的
微生物种类增多.
2􀆰 2􀆰 3根际微生物对不同类型碳源利用强度的差异
  将 Biolog⁃Eco板上的 31种碳源分为 6 类,不同处
理土壤微生物对这 6类碳源的利用情况见图 3.由图
3可知,不同处理对 6 类碳源利用情况差异显著.与
NPK处理相比,NPKS 处理对聚合物类和胺类碳源
的利用程度很高;对糖类、氨基酸类和羧酸类碳源的
利用程度高于 NPK 处理,但较常量棉秆炭处理
(NPKB1)低;对酚酸类碳源的利用程度差异不明显.
与 NPK 和 NPKS 处理相比,除 NPKB2处理对糖类、
NPKB1和 NPKB2对胺类碳源的利用程度显著降低
外,NPKB1和 NPKB2处理对这 6 类碳源的利用均呈
显著升高趋势.其中,NPKB1处理对糖类、氨基酸类、
羧酸类和酚酸类碳源的利用程度最高.
2􀆰 3  棉秆炭对连作棉花根际土壤细菌群落结构多
样性的影响
本试验通过 PCR⁃DGGE 方法对不同处理棉花
根际土壤细菌群落特点进行了进一步测定,来直观
反映各处理对应的条带数目及迁移距离等信息.如
图 4所示,DGGE图谱中,不同处理均可分离得到 30
条以上的电泳条带,表现为不同处理之间一些条带
的消失与增加及一些共有条带亮度的差异,表明不
同处理棉花根际土壤中细菌群落构成在 DNA 水平
上发生了明显的变化.NPK、NPKS 和 NPKB1处理的
DGGE图谱具有一定的相似性,有很多相同的条带;
图 3  不同处理连作棉花根际土壤微生物对六类碳源的利
用强度
Fig.3  Utilization intensity of microbial community to six types
of carbon source in continuous cropping cotton rhizosphere soil
under different treatments.
Ⅰ: 糖类 Carbohydrates; Ⅱ: 氨基酸类 Amino acids; Ⅲ: 羧酸类 Car⁃
boxylic acids; Ⅳ:酚酸类 Phenolic acids; Ⅴ:多聚物类 Polymers; Ⅵ:
胺类 Amines / amides.
图 4  不同处理 16S rRNA PCR⁃DGGE 图谱及 UPGMA 聚类
分析
Fig.4  16S rRNA PCR⁃DGGE profile and UPGMA cluster ana⁃
lysis under different treatments.
但 NPKB2处理条带数量明显增多,个别条带明显增
亮.基于 UPGMA 对 DGGE 条带聚类分析结果可以
看出,不同处理土壤的细菌群落可聚为 3 类,首先
NPKB2处理单独聚为一类,且明显区别于其他处理;
其次 NPKS处理聚为一类,最后 NPK处理和 NPKB1
处理聚为一类,但 NPKS、NPK和 NPKB1处理差距不
大.表明施用增量棉秆炭明显改变了土壤细菌群落
结构.
    选择 DGGE 图谱中表现出有差异的优势条带
进行切胶分离,基于条带位置和亮度,选择性切取
24条带.对这 24条带进行测序,系统进化树见图 5.
结果表明,这些条带与 GeneBank数据库中已知的变
形菌门(Proteobacteria)、芽单胞菌门(Gemmatimona⁃
detes)、酸杆菌门(Acidobacteria)、厚壁菌门(Firmi⁃
cutes)、放线菌门(Actinobacteria)、绿弯菌门(Chlo⁃
roflexi)、浮霉菌门 ( Planctomycetes ) 和疣微菌门
(Verrucomicrobia)的菌种以及分类地位未确定的菌
种有 92%~ 100%的相似性.对条带进行分析表明,
所有处理共有条带 6 条,分别为条带 1、2、4、19、20
和 24,但亮度上有差异;条带 6、9、10、13、14、15 和
23为 NPKB2 处理特有条带;条带 3和 7为 NPKS处
理特有条带;条带 8为 NPK处理特有条带;条带 11、
12、17、21和 22为 NPKS 处理缺失条带;条带 18 为
NPKB2处理缺失条带;其余,条带 5 为 NPKB1和
NPKB2处理共有条带;条带 16为 NPKS 和 NPKB2处
理共有条带.可见,在短期内棉秆炭改变了土壤细菌
群落结构,棉秆还田表现为多条条带的缺失,而棉秆
炭则增加了土壤中特有菌群的数量.
3  讨    论
研究表明,生物炭中含有易于腐解的脂肪族和
7711期                顾美英等: 施用棉秆炭对新疆连作棉花根际土壤微生物群落结构和功能的影响         
图 5  16S rRNA 序列的系统进化树
Fig.5  Phylogenetic tree of 16S rRNA sequences.
Band 1-24: 条带 1~24.
氧化态碳物质[26],及氮、氧、硫和无机碳酸盐等营养
成分[18],为微生物提供可利用的组分.同时,生物炭
极大地增强了对营养元素(如 NH4
+、NO3
-)的吸附
能力和养分的有效性[27],也改变了土壤 pH、可溶性
盐浓度(EC)及阳离子交换量(CEC)和保水性,因此
大量的生物炭施入可为土壤微生物生长与繁殖提供
良好的环境,会对土壤微生物组成和功能产生重要
影响[28-29] .
本研究表明,与棉秆移除相比,随着棉秆炭带入
的营养物质增加,土壤吸附养分能力增强,连作棉田
土壤中细菌和放线菌数量随施用量增加而升高;真
菌数量在 NPKB1处理增高,但 NPKB2处理与对照差
异不显著,说明增量棉秆炭没有增加土壤真菌数量.
目前,生物炭对真菌影响的报道较少,虽然真菌丰富
的菌丝能促使其生长于生物炭孔隙中[30],但土壤
pH升高[27]及土壤中有益微生物数量增加[9]也可能
导致土壤中真菌数量降低.谷思玉等[31]对连作大豆
施用生物炭的研究表明,土壤有向“细菌型”发展的
趋势.谢国雄等[32]研究也表明,施用生物炭可增加
退化菜地土壤中放线菌和细菌数量,降低土壤真菌
数量,优化了土壤微生物区系.而棉秆炭施用对细菌
和真菌数量及种类产生的影响,是否能降低真菌病
害发生的风险,还需结合分子生物学手段进行判断.
而棉秆还田则表现出细菌数量减少,放线菌数量高
于棉秆移除,真菌数量最高的情况.棉秆还田真菌数
量的增高,一方面可能是土壤中促进纤维素分解的
真菌数量增加,另外是否是棉秆上病原菌还田造成
的数量增加,还需做进一步研究.
生物炭不仅影响根际土壤微生物数量,还可调
节微生物群落结构和功能多样性[33] .本试验中,
Biolog土壤微生物功能多样性分析表明,与棉秆移除
相比,棉秆还田和棉秆炭处理均有效提高了土壤微
生物活性和丰富度指数,但两处理间差异不显著,增
量棉秆炭丰富度指数有所降低.原因可能是棉秆炭
施用促使一些特殊菌群大量繁殖,进而提高了微生
物活性,但微生物菌群多样性降低[34-35] .本研究对
碳源利用情况也表明,棉秆炭可促进利用糖类、氨基
酸类和羧酸类碳源的微生物生长.尤其是利用与根
系分泌物相关的酚酸类碳源的微生物,常量棉秆炭
的促进作用明显,而棉秆还田则没有促进作用,这与
871 应  用  生  态  学  报                                      27卷
小麦秸秆炭对连作棉花的研究结果一致[36] .由于
Biolog技术只能分析微平板上 31 种碳源利用微生
物活性特征,而全面分析微生物群落结构还需结合
分子生物学手段.
本研究发现,施用棉秆炭后土壤细菌 DGGE 图
谱条带增多,聚类分析表明,NPKB2 处理明显区别
于其他处理,而 NPKS、NPK 和 NPKB1处理差距不
大.增量棉秆炭施用明显改变了土壤细菌群落结构,
提高了土壤细菌丰富度指数,但优势度指数和均匀
度指数显著下降.乌英嘎等[37]推测,生物炭施用在
一定程度上改善了土壤微环境,为某类细菌生长提
供有利条件,引起细菌群落个体大小或数量差异增
大,群落均匀度降低,进而导致多样性指数减少.Hu
等[28]研究表明,添加生物炭可促进土壤中一些特定
的微生物类群如放线菌、木霉、拟青霉等的富集.
Graber等[38]从施用生物质炭的辣椒根际分离的真
菌和细菌大部分具有促生和生物防治功能,如木霉
属(Trichoderma).Kolton等[39]发现,施用生物炭的辣
椒根际土壤中具生防功能的 Flavobacterium 属细菌
数量大幅度增加.从本研究 DGGE 分析结果来看,棉
秆炭尤其是增量棉秆炭促进了土壤中芽单胞菌门、
酸杆菌门、变形菌门和放线菌门中一些菌群的生长,
而这些菌群在维持土壤生态系统健康中起着相
当重要的作用,其中变形菌门中 Lysobacter[40]、放线
菌[41]、酸杆菌的一些菌属[42]等均具有拮抗、促生作
用.而棉秆还田则使土壤中一些有益细菌种群消失,
如 Lysobacter、红螺菌科(Rhodospirillales) [43]等.是否
棉秆还田中这些有益微生物的缺失,及棉秆炭的施
用为土壤中具有促生、拮抗等功能的细菌生长提供
有利条件,改变了连作棉花根际土壤微生物生存的
根际微域环境,从而影响了微生物组成及活性,还需
进行长期定位试验.同时,由于 PCR⁃DGGE 技术采
用 V3区的 PCR产物进行微生物组成分析,只能反
映土壤菌群中的优势菌群,而弱势菌群则不能检测
到,存在高估物种丰度以及低估微生物群落大小和
多样性的可能.因此,还需采用更为全面和准确的分
子生物学手段,如高通量测序等进行深入研究.
综上所述,棉秆还田和棉秆炭施用增加了连作
棉田土壤微生物活性,但由于提供的营养物质成分
的差异、棉秆炭的吸附作用及采用不同的检测方法,
均会对土壤微生物群落结构和功能多样性产生影
响.Biolog和 PCR⁃DGGE分析表明,棉秆还田和常量
棉秆炭施用下微生物多样性指数差异不明显,而增
量棉秆炭则明显改变了微生物群落多样性.随着施
用量的增加,棉秆炭特殊的成分和吸附性能对土壤
理化性质产生了明显的改变,促使土壤中一些微生
物类群的生长,进而导致 Biolog 碳源利用的丰富度
指数有所降低,PCR⁃DGGE 分析表明其显著提高了
土壤微生物丰富度指数,但优势度指数和均匀度指
数显著下降.
参考文献
[1]  Mao S⁃C (毛树春), Li Y⁃B (李亚兵), Feng L (冯
璐), et al. Study on the development of Xinjiang cotton
production. Agricultural Outlook (农业展望), 2014,
10(11): 43-51 (in Chinese)
[2]  Li W (李  为), Xue H⁃L (薛红蕾), Wang J⁃L (王
江丽), et al. Construction of a composite microbial sys⁃
tem with high efficient cotton stalk degradation and its
degradation characteristics. Xinjiang Agricultural Sci⁃
ences (新疆农业科学), 2009, 46(1): 72 - 77 ( in
Chinese)
[3]  Wang L (王   兰), Feng H⁃Z (冯宏祖), Gong M⁃F
(龚明福), et al. Effect of various tillage measures on
cotton verticillium wilt in drip irrigation cotton field un⁃
der film. Transactions of the Chinese Society of Agricul⁃
tural Engineering (农业工程学报), 2011, 27 ( 5):
31-36 (in Chinese)
[4]   Li Y⁃B (李彦斌), Liu J⁃G (刘建国), Cheng X⁃R
(程相儒), et al. The allelopathic effects of returning
cotton stalk to soil on the growth of succeeding cotton.
Acta Ecologica Sinica (生态学报), 2009, 29 ( 9):
4942-4948 (in Chinese)
[5]  Zhang Q (张  琴), Li Y⁃B (李艳宾), Teng L⁃P (滕
立平 ), et al. Allelopathy of different decomposed
liquids of cotton stalk on Fusarium oxysporum and Verti⁃
cillium dahlia. Journal of Agro⁃Environment Science (农
业环境科学学报), 2012, 31(9): 1696 - 1701 ( in
Chinese)
[6]  Hu YL, Wu FP, Zeng DH, et al. Wheat straw and its
biochar had contrasting effects on soil C and N cycling
two growing seasons after addition to a Black Chernoze⁃
mic soil planted to barley. Biology and Fertility of Soils,
2014, 50: 1291-1299
[7]  Wu C⁃C (武春成), Li T⁃L (李天来), Cao X (曹
霞), et al. Physicochemical properties of nutrition
medium and cucumber growth under continuous crop⁃
ping. Journal of Nuclear Agricultural Sciences (核农学
报), 2014, 28(8): 1534-1539 (in Chinese)
[8]  Prayogo C, Jones JE, Baeyens J, et al. Impact of bio⁃
char on mineralisation of C and N from soil and willow
litter and its relationship with microbial community bio⁃
mass and structure. Biology and Fertility of Soils, 2014,
50: 695-702
[9]  Ma Y (马  艳), Wang G⁃F (王光飞). Review of bio⁃
char utilization on soil⁃borne disease control. Soil and
Fertilizer Sciences in China (中国土壤与肥料), 2014
(6): 14-20 (in Chinese)
[10]  Zhang Y, Tan QL, Hu CX, et al. Differences in respon⁃
9711期                顾美英等: 施用棉秆炭对新疆连作棉花根际土壤微生物群落结构和功能的影响         
ses of soil microbial properties and trifoliate orange seed⁃
ling to biochar derived from three feedstocks. Journal of
Soils and Sediments, 2015, 15: 541-551
[11]  Yanardagˇ l̇H, Zornoza R, Cano AF, et al. Evaluation of
carbon and nitrogen dynamics in different soil types
amended with pig slurry, pig manure and its biochar by
chemical and thermogravimetric analysis. Biology and
Fertility of Soils, 2015, 51: 183-196
[12]  Li P⁃P (李培培), Han Y⁃L (韩燕来), Jin X⁃K (金
修宽), et al. Effects of biochar application on soil nu⁃
trients and maize yield of sandy soil. Chinese Journal of
Soil Science (土壤通报), 2014, 45(5): 1164-1169
(in Chinese)
[13]  Qi R⁃P (齐瑞鹏), Zhang L (张  磊), Yan Y⁃H (颜
永毫), et al. Effects of biochar addition into soils in
semiarid land on water infiltration under the condition of
the same bulk density. Chinese Journal of Applied Eco⁃
logy (应用生态学报), 2014, 25(8): 2281-2288 (in
Chinese)
[14]  Baiamonte G, Pasquale CD, Marsala V, et al. Structure
alteration of a sandy⁃clay soil by biochar amendments.
Journal of Soils and Sediments, 2015, 15: 816-824
[15]  Li M (李  明), Li Z⁃P (李忠佩), Liu M (刘  明),
et al. Effects of different straw biochar on nutrient and
microbial community structure of a red paddy soil. Scien⁃
tia Agricultura Sinica (中国农业科学), 2015, 48(7):
1361-1369 (in Chinese)
[16]  Yao H⁃Y (姚红宇), Tang G⁃M (唐光木), Ge C⁃H
(葛春辉), et al. Characteristics and elementary compo⁃
sition of cotton stalk⁃char in different carbonization tem⁃
perature and time. Transactions of the Chinese Society of
Agricultural Engineering (农业工程学报), 2013, 29
(7): 199-206 (in Chinese)
[17]  Li Q (李   琦), Liao N (廖   娜), Zhang N (张
妮), et al. Effects of cotton stalk and its biochar on am⁃
monia volatilization from a drip irrigated cotton field.
Journal of Agro⁃Environment Science (农业环境科学学
报), 2014, 33(10): 1987-1994 (in Chinese)
[18]  Ma Y⁃R (马彦茹), Yang X⁃H (杨新华), Ge C⁃H
(葛春辉), et al. Study on activating effect of soil avai⁃
lable P and K through application of cotton stalk biochar.
Xinjiang Agricultural Sciences (新疆农业科学), 2014,
51(4): 660-666 (in Chinese)
[19]  Miransari M. Soil microbes and the availability of soil
nutrients. Acta Physiologiae Plantarum, 2013, 35:
3075-3084
[20]  He L⁃L (何莉莉), Yang H⁃M (杨慧敏), Zhong Z⁃K
(钟哲科), et al. PCR⁃DGGE analysis of soil bacterium
community diversity in farmland influenced by biochar.
Acta Ecologica Sinica (生态学报), 2014, 34(15):
4288-4294 (in Chinese)
[21]  Hou Y⁃H (侯亚红), Wang L (王  磊), Fu X⁃H (付
小花), et al. Response of soil respiration to straw and
straw biochar returning and its microbial mechanism.
Industrial Microbiology (工业微生物), 2014, 44(5):
7-13 (in Chinese)
[22]  Liu H⁃J (刘鸿骄), Hou Y⁃H (侯亚红), Wang L (王
磊). Amelioration effect of reed straw biochar returning
to salty soil in the view of low carbon point. Environmen⁃
tal Science & Technology (环境科学与技术), 2014,
37(1): 75-80 (in Chinese)
[23]  Wu FP, Jia ZK, Wang SG, et al. Contrasting effects of
wheat straw and its biochar on greenhouse gas emissions
and enzyme activities in a Chernozemic soil. Biology and
Fertility of Soils, 2013, 49: 555-565
[24]  Jin H. Characterization of Microbial Life Colonizing Bio⁃
char and Biochar⁃amended Soils. PhD Thesis. Ithaca,
NY: Cornell University, 2010
[25]  Yao H⁃Y (姚槐应), Huang C⁃Y (黄昌勇). Soil Mic⁃
robial Ecology and Experimental Technique. Beijing:
Science Press, 2006 (in Chinese)
[26]  Schmidt MWI, Noack AG. Black carbon in soils and
sediments: Analysis, distribution, implications, and
current challenges. Global Biogeochemical Cycles, 2000,
14: 777-793
[27]  Ding Y⁃L (丁艳丽), Liu J (刘  杰), Wang Y⁃Y (王
莹莹). Effects of biochar on microbial ecology in agri⁃
culture soil: A review. Chinese Journal of Applied Eco⁃
logy (应用生态学报), 2013, 24(11): 3311- 3317
(in Chinese)
[28]  Hu L, Cao LX, Zhang RD. Bacterial and fungal taxon
changes in soil microbial community composition in⁃
duced by short⁃term biochar amendment in red oxidized
loam soil. World Journal of Microbiology and Biotechno⁃
logy, 2014, 30: 1085-1092
[29]  Li S⁃H (李松昊), He D⁃H (何冬华), Shen Q⁃L (沈
秋兰), et al. Effects of bamboo charcoal on the growth
of Trifolium repens and soil bacterial community struc⁃
ture. Chinese Journal of Applied Ecology (应用生态学
报), 2014, 25(8): 2334-2340 (in Chinese)
[30]  Yao L⁃D (姚玲丹), Cheng G⁃H (程广焕), Wang L⁃X
(王丽晓), et al. Effects of biochar application to
microorganisms in soil. Environmental Chemistry (环境
化学), 2015, 34(4): 697-704 (in Chinese)
[31]  Gu S⁃Y (谷思玉), Li X⁃J (李欣洁), Wei D (魏
丹), et al. Effects of biochar on soil nutrient contents
and microorganism of soybean rhizosphere. Soybean
Science (大豆科学), 2014, 33(3): 393-397 (in Chi⁃
nese)
[32]  Xie G⁃X (谢国雄), Wang D⁃Z (王道泽), Wu Y (吴
耀), et al. Ameliorating effects of biochar application
on degraded vegetable soil. Journal of Southern Agricul⁃
ture (南方农业学报), 2014, 45(1): 67-71 (in Chi⁃
nese)
[33]  Chen W (陈  伟), Zhou B (周  波), Su H⁃R (束怀
瑞), et al. Effects of organic fertilizer and biochar on
root system and microbial functional diversity of Malus
hupehensis Rehd. Scientia Agricultura Sinica (中国农业
科学), 2013, 46(18): 3850-3856 (in Chinese)
[34]  Huang J (黄   建), Zhang Q⁃Z (张庆忠), Du Z⁃L
(杜章留), et al. Research advances in effects of bio⁃
char application on agroecosystem. Chinese Journal of
Agrometeorology (中国农业气象), 2012, 33 ( 2):
232-239 (in Chinese)
081 应  用  生  态  学  报                                      27卷
[35]  Khodadad CLM, Zimmermanb AR, Greenc SJ, et al.
Taxa⁃specific changes in soil microbial community com⁃
position induced by pyrogenic carbon amendments. Soil
Biology and Biochemistry, 2011, 43: 385-392
[36]  Gu M⁃Y (顾美英), Liu H⁃L (刘洪亮), Li Z⁃Q (李
志强), et al. Impact of biochar application on soil nu⁃
trients and microbial diversities in continuous cultivated
cotton fields in Xinjiang. Scientia Agricultura Sinica (中
国农业科学), 2014, 47(20): 4128- 4138 ( in Chi⁃
nese)
[37]  Wu Y⁃G (乌英嗄), Zhang G⁃L (张贵龙), Lai X (赖
欣), et al. Effects of biochar applications on bacterial
diversity in fluvor⁃aquic soil of North China. Journal of
Agro⁃Environment Science (农业环境科学学报 ),
2014, 33(5): 965-971 (in Chinese)
[38]  Graber ER, Harel YM, Kolton M, et al. Biochar impact
on development and productivity of pepper and tomato
grown in fertigated soilless media. Plant and Soil, 2010,
337: 481-496
[39]  Kolton M, Meller HY, Pasternak Z, et al. Impact of
biochar application to soil on the root⁃associated bacte⁃
rial community structure of fully developed greenhouse
pepper plants. Applied and Environmental Microbiology,
2011, 77: 4924-4930
[40]  Wei L⁃F (魏兰芳), Zhou L⁃H (周丽洪), Ji G⁃H (姬
广海), et al. Control of rice bacterial leaf blight by an⁃
tibacterial substances from Lysobacter antibioticus strain
13⁃1. Microbiology China (微生物学通报), 2014, 40
(2): 274-280 (in Chinese)
[41]  Valliappan K, Sun W, Li ZY. Marine actinobacteria as⁃
sociated with marine organisms and their potentials in
producing pharmaceutical natural products. Applied
Microbiology and Biotechnology, 2014, 98: 7365-7377
[42]  Zhang W (张  薇), Hu Y⁃G (胡跃高), Huang G⁃H
(黄国和), et al. Soil microbial diversity of artificial
peashrub plantation on North Loess Plateau of China.
Acta Microbiologica Sinica (微生物学报), 2007, 47
(5): 751-756 (in Chinese)
[43]  Qiu H⁃D (邱宏端), Xu S⁃N (徐姗楠), Cai Y⁃C (蔡
玉婵), et al. Antagonistic effects of four strains of Rho⁃
dospirillaceae and factors affecting inhibitory function.
Transactions of the Chinese Society of Agricultural Engi⁃
neering (农业工程学报), 2008, 24(2): 194-198 (in
Chinese)
作者简介  顾美英,女,1974年生,副研究员. 主要从事土壤
微生物生态学研究. E⁃mail: gmyxj2008@ 163.com
责任编辑  肖  红
顾美英, 唐光木, 刘洪亮, 等. 施用棉秆炭对新疆连作棉花根际土壤微生物群落结构和功能的影响. 应用生态学报, 2016, 27
(1): 173-181
Gu M⁃Y, Tang G⁃M, Liu H⁃L, et al. Effects of cotton stalk biochar on microbial community structure and function of continuous crop⁃
ping cotton rhizosphere soil in Xinjiang, China. Chinese Journal of Applied Ecology, 2016, 27(1): 173-181 (in Chinese)
1811期                顾美英等: 施用棉秆炭对新疆连作棉花根际土壤微生物群落结构和功能的影响