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Genetic diversity and genetic structure in Sassafras tsumu populations along altitudinal gra-dients in Tianmushan Mountain, China.

天目山不同海拔檫木群体遗传多样性和遗传结构


采用13对SSR引物,运用Bioptic Qsep100全自动核酸分析系统,分析了天目山5个海拔檫木群体的遗传多样性和遗传结构及其在不同海拔下的变化模式.结果表明: 天目山檫木群体具有较高的遗传多样性水平,其中期望杂合度和观察杂合度分别为0.84和0.61.根据Shannon指数,天目山檫木中海拔(500~800 m)群体的遗传多样性水平大于低海拔(200 m)和高海拔(1100~1400 m)群体的遗传多样性水平.由基因分化系数和AMOVA分析可知,檫木种群的遗传变异主要存在于群体内.STRUCTURE分析和UPGMA聚类分析表明,中、低海拔被划为一个群体,而高海拔被划为另一个群体.低海拔和中海拔檫木群体遗传距离的差异表明,人为干扰对物种多样性具有负面效应,而自然保护区对物种多样性的保护起到了积极作用.
 

To analyze the genetic diversities and structures of Sassafras tsumu and to explore their changing patterns at five different altitudes, Bioptic Qsep 100 DNA fragment analyzer combined with 13 SSR primers was applied. The results showed that S. tsumu in Tianmushan Mountain had a relatively high genetic diversity, with the expected heterozygosity (He) and observed heterozygosity (Ho) being 0.84 and 0.61, respectively. According to Shannon index (I), the diversity of S. tsumu at middle altitude (500-800 m) was higher than that at low (200 m) and high altitudes (1100-1400 m). The coefficient of genetic differentiation and AMOVA results indicated that the genetic variation of S. tsumu was mainly distributed within populations. UPGMA cluster analysis and STRUCTURE analysis showed that S. tsumu populations at the middle and lower altitudes were similar, but different from that at higher altitude. The differences in genetic distance of S. tsumu populations at middle and low altitudes revealed that human disturbance posed a negative effect on the diversity, whereas, natural reserve played a significant positive role in protecting species diversity.


全 文 :天目山不同海拔檫木群体遗传多样性和遗传结构
蒋艾平  姜景民  刘  军∗
(中国林业科学研究院亚热带林业研究所, 浙江富阳 311400)
摘  要  采用 13对 SSR引物,运用 Bioptic Qsep100全自动核酸分析系统,分析了天目山 5 个
海拔檫木群体的遗传多样性和遗传结构及其在不同海拔下的变化模式.结果表明: 天目山檫
木群体具有较高的遗传多样性水平,其中期望杂合度和观察杂合度分别为 0.84 和 0.61.根据
Shannon指数,天目山檫木中海拔(500~800 m)群体的遗传多样性水平大于低海拔(200 m)和
高海拔(1100~1400 m)群体的遗传多样性水平.由基因分化系数和 AMOVA分析可知,檫木种
群的遗传变异主要存在于群体内.STRUCTURE分析和 UPGMA聚类分析表明,中、低海拔被划
为一个群体,而高海拔被划为另一个群体.低海拔和中海拔檫木群体遗传距离的差异表明,人
为干扰对物种多样性具有负面效应,而自然保护区对物种多样性的保护起到了积极作用.
关键词  檫木; 海拔; 遗传多样性; 遗传结构
Genetic diversity and genetic structure in Sassafras tsumu populations along altitudinal gra⁃
dients in Tianmushan Mountain, China. JIANG Ai⁃ping, JIANG Jing⁃min, LIU Jun∗ (Research
Institute of Subtropical Forestry, Chinese Academy of Forestry, Fuyang 311400, Zhejiang, China) .
Abstract: To analyze the genetic diversities and structures of Sassafras tsumu and to explore their
changing patterns at five different altitudes, Bioptic Qsep 100 DNA fragment analyzer combined
with 13 SSR primers was applied. The results showed that S. tsumu in Tianmushan Mountain had a
relatively high genetic diversity, with the expected heterozygosity (He) and observed heterozygosity
(Ho) being 0.84 and 0.61, respectively. According to Shannon index ( I), the diversity of S. tsumu
at middle altitude (500-800 m) was higher than that at low (200 m) and high altitudes (1100-
1400 m). The coefficient of genetic differentiation and AMOVA results indicated that the genetic
variation of S. tsumu was mainly distributed within populations. UPGMA cluster analysis and
STRUCTURE analysis showed that S. tsumu populations at the middle and lower altitudes were simi⁃
lar, but different from that at higher altitude. The differences in genetic distance of S. tsumu popula⁃
tions at middle and low altitudes revealed that human disturbance posed a negative effect on the di⁃
versity, whereas, natural reserve played a significant positive role in protecting species diversity.
Key words: Sassafras tsumu; altitude; genetic diversity; genetic structure.
本文由国家林业局公益性行业科研专项项目(201404104)和中央级
公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目(6140101002)资助
This work was supported by the Forestry Industry Research Special Funds
for Public Welfare Projects of State Forestry Administration of China
(201404104), and the Special Fund for Basic Scientific Research Busi⁃
ness of Central Public Research Institutes (6140101002) .
2015⁃11⁃25 Received, 2016⁃03⁃08 Accepted.
∗通讯作者 Corresponding author. E⁃mail: ywliu2005@ 163.com
    遗传结构和遗传多样性分别指遗传变异在群体
中的分布格局和总和,是群体遗传变异的两个方
面[1] .繁殖策略、基因流、基因漂变和环境选择压等
因素均会影响群体遗传结构和遗传多样性的形
成[2-4] .此外,环境变化导致的生境片断化也逐渐成
为影响物种遗传结构和遗传多样性的重要因素,生
境片断化引起连续分布的物种碎裂成间隔小群体,
降低遗传多样性水平,阻碍基因交流,使近交系数增
大[5-7] .对物种群体遗传结构和遗传多样性的研究,
有助于了解物种在群体间和群体内的分布情况以及
群体的维持机制,同时可以揭示物种进化历史及其
生态适应潜力的基础.探究影响物种群体遗传结构
和遗传多样性变化的因素是为了更好地保护物种在
自然界的生存.
海拔梯度上产生的环境异质阻碍了花粉和种子
传播,从而限制基因流[8] .同时,海拔尺度上的环境
差异影响植物开花、结实等繁殖策略,进而限制各海
拔群体间的基因交流.例如,同一物种低海拔和高海
应 用 生 态 学 报  2016年 6月  第 27卷  第 6期                                            http: / / www.cjae.net
Chinese Journal of Applied Ecology, Jun. 2016, 27(6): 1829-1836                  DOI: 10.13287 / j.1001-9332.201606.012
拔的开花时间存在差异,因此受花粉调控的基因流
会受到限制[9] .与此同时,高山地带的山脊和山谷形
成生境片段打破了物种的连续分布,从空间上阻隔
同一物种之间的基因交流.由海拔形成的环境异质
和空间障碍,导致低海拔和高海拔之间物种表型特
征存在巨大差异,说明同一物种间具有较大的遗传
变异[10-12] .因为不同海拔在气温、光照、地形、地貌
等方面存在着差异,所以群体遗传多样性在海拔梯
度上的变化形式也是多样的.遗传多样性在海拔尺
度上存在 4种不同的变异模式:1)遗传多样性在海
拔尺度上没有变化,即 L =M =H(L、M、H 分别为低
海拔、中海拔和高海拔);2)从低海拔到高海拔遗传
多样性逐渐增加,即 L<M<H;3)随着海拔增加遗传
多样性水平下降,即 L>M>H;4)中海拔群体的遗传
多样性水平大于低海拔和高海拔群体的遗传多样性
水平,即 L<M>H[13] .因此,不同海拔山体的地理环
境差异及丰富的遗传变异模式为研究物种遗传变异
与海拔差异之间的关系提供了理想的条件.
檫木(Sassafras tsumu)隶属樟科檫木属,是多年
生落叶乔木.除本种外,檫木属还有美洲檫木(S. al⁃
bidum)和台湾檫木(S. randaiense)2 个种[14] .檫木广
泛分布于长江流域以南各地,海拔 150 ~ 1900 m,常
生于疏林或密林中[15] .檫木早春开花,花两性,主要
通过花蓟马、蜜蜂等昆虫传粉.由于胚囊只有少数发
育正常以及早春严寒霜冻的影响,檫木结实率极
低[16-17] .檫木浆果状核果近球形,初为绿色,成熟时
呈紫黑色或蓝黑色,由鸟类啄食后进行种实传播.由
于秋季鲜红的叶色、多变的叶型及优良的材质,檫木
不仅是良好的秋季观赏树种,也是优良的用材树种.
目前,对檫木群体遗传结构和遗传多样性的研
究主要集中在以同工酶手段对檫木群体遗传多样性
进行分析,以及分离开发檫木微卫星位点[18-19] .目
前,檫木在海拔尺度上的遗传多样性和遗传结构呈
现的规律尚不清楚.为此,本文以浙江天目山不同海
拔的檫木群体为材料,利用微卫星分子标记对其遗
传结构和遗传多样性进行研究,探讨天目山檫木天
然群体遗传多样性沿海拔的变化模式,以及檫木天
然群体遗传变异分布模式形成的原因,为种质资源
的收集和保护提供科学依据.
1  材料与方法
1􀆰 1  样品采集
天目山位于浙江省西北部, 隶属临安市
(29°56′—30°25′ N,119°24′—119°28′ E),最高海拔
1506 m.由侏罗系流纹斑岩形成的悬崖陡壁、深沟峡
谷位于海拔 450 m 以上,海拔 450 m 以下以寒武系
的灰岩、白云岩构成的低山地形为主[20] .天目山气
候属于亚热带季风气候,温和湿润、雨量充沛,受地
形变化和海拔高低的影响,形成复杂多样的小气候.
年平均气温仙人顶 8.7 ℃,山麓 14 ℃;年均降水量
仙人顶 1766 mm,山麓 1470 mm[21] .檫木在天目山主
要以自然分布为主,从海拔 200 m到 1400 m均有生
长,常见于光线条件良好的向阳面,河谷山坳等区域
分布较少.2014年 5 月根据檫木在天目山的分布情
况,将檫木野生资源分为 Pop1、Pop2、Pop3、Pop4 和
Pop5等 5个海拔群体(表 1),檫木在 5 个海拔群落
中均处于林冠层的上层.其中,Pop1 位于天目山核
心保护区外,遭受到一定的人为干扰;Pop2 ~ Pop5 4
个群体位于核心保护区内,檫木资源同其他野生资
源和古树名木一样得到了相应的保护.从低海拔到
高海拔各群体间的间距分别为 2、3、2.5 和 5 km,群
体内取样单株间距>50 m,每个群体取样单株数量
19~21株,共取样单株 100 个(表 1).利用高枝剪采
集每个单株顶部叶片,迅速放入硅胶中进行干燥,
表 1  5个不同海拔檫木群体地理位置和采样数量
Table 1  Geographic place and individuals sampled for five different altitudinal populations of Sassafras tsumu
群体
Population
经纬度
Longitude and latitude
海拔
Altitude
(m)
采样数
Sampled
number
坡向
Slope
gradient
坡度
Slope degree
(℃)
群落类型
Community type
Pop1 30°16′16.1″ —30°17′05.4″ N
119°27′10.5″ —119°28′13.4″ E
200 20 东南 10~15 毛竹 Phyllostachys heterocycla+山核桃 Carya
cathayensis+檫木 Sassafras tsumu
Pop2 30°19′30.5″—30°23′33.3″ N
119°27′29.8″—119°29′39.6″ E
500 21 南 13~20 毛竹+枫香 Liquidambar formosana+檫木
Pop3 30°19′30.0″—30°22′44.6″ N
119°27′31.8″—119°28′50.4″ E
800 20 西南 19~28 枫香+青钱柳 Cyclocarya paliurus+檫木
Pop4 30°22′00.5″—30°23′43.3″ N
119°25′46.2″—119°29′41.3″ E
1100 19 南 32~35 金钱松 Pseudolarix amabilis +香果树 Emme⁃
nopterys henryi +檫木
Pop5 30°19′37.7″—30°23′52.4″ N
119°27′34.5″—119°30′00.5″ E
1400 20 东南 27~33 茅栗 Castanea seguinii+短柄枹 Quercus glan⁃
dulifera +檫木
0381 应  用  生  态  学  报                                      27卷
硅胶和叶片比例为 20 ∶ 1,带回实验室置于 4 ℃冰
箱中保存,待提取基因组 DNA.
1􀆰 2  DNA提取
樟科植物叶片富含多酚、多糖和蛋白质等次生
物质,所以较难提取高质量的基因组 DNA.本研究以
CTAB法[22]为基础,结合多种樟科植物基因组 DNA
的提取方法,并加以改良[23-24],提取檫木基因组
DNA.其步骤如下:1)将 0.1 g 左右的硅胶干燥叶放
入酒精消毒后的玛瑙研钵中,加入少量石英砂,再倒
入少许液氮,待液氮快挥发完时迅速用力研磨.然
后,将研磨好的叶片粉末倒入装有 3000 μL 预热至
65 ℃的提取缓冲液(2×CTAB)的 5 mL离心管中,并
把离心管置于 65 ℃的水槽中水浴 1 h,期间每过 10
min将离心管颠倒摇动一次. 2)加入 600 μL 7. 5
mol·L-1醋酸铵溶液,混匀后冰浴 30 min.3)将离心
管在高速离心机(12000 r·min-1)离心 20 min,用移
液枪吸取上清液至新的离心管.4)加入 500 μL酚︰
氯仿︰异戊醇(25 ∶ 24 ∶ 1),混匀后离心 15 min,吸
取上清液至新的离心管.5)在新的离心管中,加入等
体积氯仿︰异戊醇(24︰1)混合试剂,摇匀后离心
15 min,吸取上清液至新的离心管.6)重复步骤 5,并
把上清液转移至 2 个 1.5 mL 的离心管中. 7)加入
0.1 mL 100 mg·L-1RNase, 37 ℃放置 30 ~ 60 min.
8)在新的离心管中,加入 2 倍体积的预冷无水乙
醇,轻轻混匀后静置 5 min.9)试管再次于离心机中
离心 10 min.10)弃去上清液,加入 500 μL 70%乙醇
溶液,轻轻震荡使 DNA 从试管底部弹起,离心 5
min,清晰看到絮状 DNA 沉淀.11)重复步骤(9)一
次,然后再用冰冻的无水乙醇洗涤一次.12)弃去上
清液,将离心管放在无菌操作台风干约 30 min.13)
加入 50 μL 1×TE 缓冲液(或者蒸馏水),轻轻摇动
试管以溶解 DNA沉淀,溶液置于 4 ℃恒温冰箱保存
过夜,待检测.用 NanoDrop2000 紫外分光光度计
(Thermo Fisher 公司生产)检测 DNA 浓度和纯度,
以 1%琼脂糖凝胶电泳检测 DNA质量.
1􀆰 3  微卫星标记分析
从已开发的台湾檫木 27 对 SSR 引物中筛选出
9对清晰多态引物用于群体内所有个体的 PCR 扩
增(表 2) [19] .从已开发的樟树(Cinnamomum cam⁃
phora)22对 SSR 引物中筛选出 4 对清晰多态引物
用于群体内所有个体的 PCR扩增(表 2) [25] .扩增反
应在 PCR Thermal Cycler Dice PCR扩增仪(Takara,
日本)上进行.15 μL反应体系含有:50~100 ng 模板
DNA 1.5 μL,10×缓冲液( buffer) 1.5 μL,Taq 酶(2
U·μL-1)0.3 μL,dNTP(2.5 mmol·L-1)1 μL,引物
(10 mmol·L-1)2 μL,MgCl2(1.5 mmol·L
-1)1 μL,
蒸馏水 7. 7 μL. PCR 反应程序为:94 ℃预变性 3
min,94 ℃变性 30 s,退火 30 s(表 2),72 ℃延伸 30
s,共 35个循环,最后在 72 ℃延伸 7 min.
采用 Bioptic Qsep100 全自动核酸分析系统
(Bioptic, Inc.,台湾)对 PCR 产物进行检测.利用
Bioptic Qsep100 软件对微卫星条带进行判读和分
析.Bioptic Qsep100全自动核酸分析系统操作简单,
其结果直接以荧光信号的形式显示(图 1).
1􀆰 4  数据处理
利用遗传分析软件 POPGENE 1.31[26]估算群体
表 2  檫木基因组 13个微卫星位点的 PCR扩增引物
Table 2  PCR primers for amplifying 13 polymorphic microsatellite loci in Sassafras tsumu
位点
Loci
基因登录编号
GenBank
accession No.
引物序列
Primer sequence (5′-3′)
退火温度
Annealing
temperature
(℃)
等位基因大小
Allele size
(bp)
Cc⁃A54 AB616693 F:ACACACACACACAGAGAGAGAG R:TTCAGGAAAAATAGTAACCAAT 49.4 73~165
Cc⁃B25 AB616697 F:ACACACACACACAGAGAGAGAG R:ATCTACTATCTGGGTTCATTGG 49.9 97~141
Cc⁃B89 AB616698 F:ACACACACACACAGAGAGAGAG R:AGCTGCACAATGCTTAGGAA 54.5 64~95
Cc⁃C1 AB616702 F:ACACACACACACTCTCTCTCTC R:AAGACTAAAAACCAGGACAAAG 48.2 124~161
Sr6 JF345221 F:AGGACTGTAGGAGGGATGTG R:GGGGCCCAGATGGAGATG 59.0 208~258
Sr7 JF345222 F:ATGGCTGGCCCACAAGATG R:CGAGGTCCCTAAGACCACC 56.4 201~271
Sr8 JF345223 F:GCCTGATTGTAAAAGCTTGCTTAC R:TCGTTTCTCTGTTTTGCAGGG 58.0 196~241
Sr15 JF345228 F:TCCAAATGGAGCATAGGTGG R:GGGAGGAGGGTTGTAGCTC 56.4 181~202
Sr19 JF345231 F:AAGCACCAAGACATCCTATGC R:TGAGAAATGTCTATTGTTTCTCACG 57.0 189~231
Sr23 JF345234 F:GCTCCTCTCCATTCGTTTCC R:CCTATCCCCAAATAGAGCACAC 55.0 176~228
Sr31 JF345238 F:CGTTGCCATCTGCAAAGGAG R:CCTCTTCTCTTCATTCGGTGAG 59.6 217~287
SrM9 JF345240 F:GGGTTCAACGATCGGCAAG R:AGGGCCAAAGTTTCATCCAC 61.0 161~277
SrM16 JF345243 F:GATCCTCGTTCTTGCGTGG R:AGCGATTGCGATTTGAGGAC 61.0 104~197
13816期                        蒋艾平等: 天目山不同海拔檫木群体遗传多样性和遗传结构           
图 1  PCR产物的荧光信号
Fig.1  Fluorescent signal of PCR products.
遗传多样性参数:每个位点的平均等位基因数(Na)
及有效等位基因数(Ne)、观察杂合度(Ho)、期望杂
合度(He)、Shannon 指数( I)等[27] .群体间遗传分化
程度由杂合性基因多样度比率(Fst)估算,群体间的
基因流(Nm)由公式 Nm = 0.25(1-Fst) / Fst计算.利用
ARLEQUIN 3.11 软件[28]对不同海拔檫木群体的遗
传变异进行分子方差分析(AMOVA).
为了有效地鉴别群体内隐蔽的群体结构,运用
STRUCTURE软件的贝叶斯方法根据每个个体的遗
传背景进行分组[29] .选用混合祖先模型,设置分组
数目 K= 1~10,每个 K值运行 5次,利用马尔可夫链
(Markov’ s chain Monte Carlo)的统计方法,设置
burn⁃in长度 30000 次,run⁃length 100000 次迭代,每
次计算得到一个可能性的对数值 L(K).选取最佳 K
值,并利用 Distruct 1.1 软件[30]做图.基于遗传距离
按非加权组对算数平均方差法 ( UPGMA),利用
MEGA 5.1软件对不同海拔檫木群体进行聚类分析.
2  结果与分析
2􀆰 1  不同海拔檫木群体内遗传多样性水平
13个微卫星位点在天目山檫木群体 100 株个
体中共检测到 166个等位基因,其中 Sr15 位点等位
基因数最少(5个),Cc⁃B25位点等位基因数最多(9
个),所有位点等位基因的平均数为 12.76.有效等位
基因数(Ne)从 Sr15的 2.09到 SrM16的 12.18,平均
有效等位基因数为 7.29(表 3).由表 3 可以看出,观
察杂合度(Ho)的变化范围为 0.29 ~ 0.89,平均值为
0.60;期望杂合度(He)的波动范围为 0.52 ~ 0.92,平
均值为 0.84.
从表 4 可以看出,海拔为 1400 m 的 Pop5 群体
的遗传多样性最低( I= 1.67),反映群体遗传多样性
的关键指标,I 值越大群体遗传多样性越高.该群体
的平均等位基因数为 8.15,有效等位基因数为 4.98,
表 3  天目山檫木天然群体遗传多样性和 F统计量
Table 3   Genetic diversity and F statistics of Sassafras
tsumu populations in Tianmushan Mountain
位点 Locus Na Ne Fst He Ho Nm
Cc⁃A54 17 8.51 0.025 0.89 0.29 9.76
Cc⁃B25 19 9.79 0.037 0.90 0.78 6.52
Cc⁃B89 9 5.85 0.033 0.83 0.65 7.29
Cc⁃C1 15 7.49 0.056 0.87 0.37 4.22
Sr6 12 6.25 0.15 0.84 0.40 1.44
Sr7 12 6.09 0.13 0.84 0.75 1.68
Sr8 12 9.31 0.043 0.90 0.85 5.64
Sr15 5 2.09 0.030 0.52 0.38 8.18
Sr19 9 4.20 0.11 0.77 0.66 1.99
Sr23 13 7.59 0.029 0.87 0.89 8.30
Sr31 12 5.70 0.13 0.83 0.34 1.72
SrM9 15 9.68 0.030 0.90 0.78 8.08
SrM16 16 12.18 0.041 0.92 0.62 5.79
平均数 Mean 12.76 7.29 0.064 0.84 0.60 3.63
Na: 平均每个位点的等位基因 Average number of alleles for each lo⁃
cus; Ne: 平均每个位点的有效等位基因 Effective number of alleles
per locus; Fst:基因分化系数 Coefficient of gene differentiation; He:期
望杂合度 Expected heterozygosity; Ho: 观察杂合度 Observed heterozy⁃
gosity; Nm: 基因流 Gene flow. 下同 The same below.
表 4  天目山 5个海拔檫木群体的遗传多样性
Table 4  Genetic diversity of Sassafras tsumu populations at
five altitudes in Tianmushan Mountain
群体
Population
Na Ne He Ho I
Pop1 9.23 5.73 0.78 0.52 1.82
Pop2 9.62 6.11 0.83 0.60 1.94
Pop3 9.54 6.33 0.84 0.61 1.96
Pop4 9.39 5.50 0.81 0.63 1.86
Pop5 8.15 4.98 0.75 0.62 1.67
观察杂合度和期望杂合度分别为 0.62 和 0.75.海拔
为 800 m 的 Pop3 群体的遗传多样性最高 ( I =
1􀆰 96),该群体平均等位基因数为 9.54,有效等位基
因数为 6. 33,观察杂合度为 0. 61,期望杂合度是
0􀆰 84.根据 Shannon 指数( I),不同海拔檫木群体的
遗传多样性排序为:Pop3>Pop2>Pop4>Pop1>Pop5.
2􀆰 2  不同海拔檫木群体的遗传分化系数和基因流
根据 Nei (1987)的 F 统计量(Fst)对群体的遗
传变异进行分析.从表 3 可知,Fst从 0.025 到 0􀆰 15,
平均值为 0.064,说明有 6.4%的遗传变异存在于各
海拔群体之间,而有 93.6%的遗传变异存在于群体
内.遗传变异分子方差分析表明,不同海拔檫木群体
间遗传变异差异达到极显著水平(P<0.001).以 Fst
为基础估算檫木群体间的基因流(Nm)为 3.63.
2􀆰 3  不同海拔檫木群体的遗传结构
从表5可以看出,5个海拔梯度檫木群体间的
2381 应  用  生  态  学  报                                      27卷
表 5  檫木群体间遗传相似性(Gi)和遗传距离(Gd)
Table 5  Genetic identity (Gi) and genetic distance (Gd)
among Sassafras tsumu populations
Gi
Pop1 Pop2 Pop3 Pop4 Pop5
Gd Pop1 0.78 0.78 0.63 0.52
Pop2 0.25 0.82 0.77 0.64
Pop3 0.25 0.20 0.66 0.63
Pop4 0.46 0.26 0.41 0.81
Pop5 0.66 0.45 0.46 0.21
遗传距离分布范围为 0.20~0.66,其中海拔 500 m的
Pop2群体与海拔 800 m的 Pop3群体间的遗传距离
最小,海拔 200 m 的 Pop1 群体与海拔 1400 m 的
Pop5群体间的遗传距离最大.
    STRUCTURE分析表明,当 K = 2 时,ΔK 得到最
大值为 12.70(图 2),很明显檫木 5个群体的所有个
体最合理的组群数为 2.每株个体分配到各组群的后
验概率结果显示:Pop4 和 Pop5 群体的绝大部分个
体分配到组群Ⅰ;Pop1、Pop2和 Pop3 一半左右的个
体分配到组群Ⅰ,另一半檫木个体分配到组群Ⅱ.当
K= 6时,L(K)得到最大值为-4778.66,所有檫木个
体合理的组群数为 6. Pop4 和 Pop5 的绝大部分个
体分配到组群 1 和组群 2;Pop1、Pop2 和 Pop3 的个
体主要分配到组群 3、组群 4、组群 5和组群 6中.
    由图 3可以看出,海拔 1400 m 的 Pop5 和海拔
1100 m的 Pop4聚为一组,海拔分别为 200、500 和
800 m的 Pop1、Pop2和 Pop3聚为另一组.
图 2  基于 13对 SSR引物的檫木天目山群体 STRUCTURE分析
Fig.2  STRUCTURE analysis based on Sassafras tsumu populations in Tianmushan Mountain using 13 polymorphic microsatellite loci.
图 3  5个海拔檫木群体 Nei遗传距离的 UPGMA聚类
Fig.3  UPGMA cluster based on Nei’s genetic distance of Sas⁃
safras tsumu populations for five altitudes.
3  讨    论
3􀆰 1  檫木天然群体遗传多样性
群体遗传多样性水平与物种对环境的适应能力
相辅相成,遗传多样性高的物种对环境适应潜力较
大.然而遗传多样性受环境选择压、花粉传播和种子
散播等诸多因素的影响.天目山檫木群体遗传多样
性的研究结果,与同为樟科植物的思茅木姜子(Lit⁃
sea szemaois)、红楠(Machilus thunbergii)等物种均具
有较高的遗传多样性水平[31-32] .这与檫木的生活史
和繁殖策略有密切关系,樟科植物倾向于异交,具有
雌雄蕊同步异熟的开花机制,种子主要靠鸟类和重
力散布[33] .作为樟科植物的檫木同样具有雌雄蕊同
步异熟的开花机制、鸟类传播果实和昆虫传粉的生
物学特性[16-17] .雌雄蕊同步异熟的开花机制有效防
止了檫木自花授粉的发生,鸟类传播果实和昆虫传
粉则在群体间形成较强的基因流,天目山檫木群体
的基因流达到 3.63.群体间的基因流>1,基因流有效
地抵消了遗传漂变带来的遗传多样性下降[34] .因
此,尽管有环境选择压的影响,但是檫木天目山群体
还是具有较高的遗传多样性水平.由鸟类等脊椎动
物传播种子和昆虫散播花粉的物种,在群体间通常
具有较强的基因流[35],而基因流能使新的遗传多样
性流向局部群体,并且减少群体间的遗传分化,是决
33816期                        蒋艾平等: 天目山不同海拔檫木群体遗传多样性和遗传结构           
定群体内和种群间遗传多样性的根本.
物种遗传多样性沿海拔的变化模式比较复杂,
天目山檫木群体遗传多样性沿海拔的变化模式为中
海拔檫木群体的遗传多样性高于低海拔和高海拔群
体.野外调查发现,随着海拔增加坡度逐渐增加,因
此天目山海拔 400 m以上的地区多以陡峭的山坡和
峡谷地形为主,温度、水分和光照等生态条件也发生
着急剧的变化.所以,海拔 800 m 以上的高海拔地区
的环境条件要比海拔 400 ~ 800 m 的中海拔地区的
环境条件恶劣.由于环境选择压的影响,中海拔地区
Pop2和 Pop3 群体的遗传多样性要比高海拔地区
Pop4和 Pop5群体的遗传多样性高.从海拔 400 m左
右的禅源寺到海拔 1500 m 左右的仙人顶是天目山
保护区的核心地带,物种多样性和生态环境都得到
了良好的保护.而 Pop1取样群体位于天目山海拔
400 m以下的地区,相对平缓的低山地形、自然资源
和经济发展等原因使这一地区未划入天目山自然保
护区的核心地带.此外,平坦的地理环境、便利的交
通,当地农民在这一地区建起了大量的农家乐.与此
同时,经济利益的驱使也让当地村民在山坡上种上
了毛竹 ( Phyllostachys heterocycla)、山核桃 ( Carya
cathayensis)和香榧(Torreya grandis )等经济作物.所
以,与中海拔的 Pop2和 Pop3群体相比,位于低海拔
的 Pop1地区受到了较为严重的人为干扰和破坏,遗
传多样性因此受到了影响.Lesica等[36]研究认为,地
理位置居于中心地带的群体拥有更优越的环境条
件,而外围群体的环境条件则相对恶劣.高海拔的恶
劣环境和低海拔的人为干扰,使外围群体受到基因
流的限制及群体缩小带来的遗传漂变,导致遗传多
样性降低.
3􀆰 2  檫木天然群体的遗传结构
遗传结构揭示了遗传多样性在群体内的分布模
式,反映了物种对环境的适应潜力[37-38] .檫木群体
间的遗传分化系数为 0.064,明显低于多年生林木
(Gst = 0.25) [39],同时檫木的遗传分化系数远低于具
有相近生物学特性的红楠(Gst = 0.29)和思茅木姜子
(Gst = 0.45) [31
-32] .由基因分化系数和 AMOVA 分析
可知,檫木的遗传变异主要存在于群体内,这与大多
数多年生植物的研究结果一致[40] .
无论是 UPGMA 聚类分析,还是基于贝叶斯的
STRUCTURE 分析,均表明天目山檫木群体并非单
一群体,而是存在 2个遗传组分异质的亚群体.野外
调查显示,海拔 200~800 m的中、低海拔群体,不仅
在地形、地势等地理因子上具有相似性,而且气温、
降水和光照等气候因子也非常相近.因此,中、低海
拔的 Pop1、 Pop2、 Pop3 群体聚为一类,高海拔的
Pop4、Pop5群体聚为一类.这表明檫木天然群体遗
传变异的分布模式与天目山不同海拔的地理生态格
局一致.花粉和种子是调控基因流的重要途径,而群
体遗传结构直接受到花粉和种子传播模式的影
响[7,35] .地形和气候因子的变化影响花粉和种子对
基因流的调控,从而改变群体遗传结构.例如,地形
异质从空间尺度阻隔花粉和种子的传播,降低各群
体之间的基因交流.各海拔之间的温度差异导致植
物开花时间不一致,影响同一物种之间的花粉传播
和交流[41] .天目山檫木群体形成 2 个遗传组分异质
的亚群体,可能是由于天目山地形和气温等环境因
子的差异形成了现阶段檫木的群体遗传结构.而在
中、低海拔群体中,Pop2群体与 Pop3 群体的遗传距
离最近,其主要原因可能是人为干扰使 Pop1群体与
Pop2和 Pop3群体之间的环境存在异质性,造成遗
传变异在群体中的分布格局出现微小的差异.
3􀆰 3  保护生物学意义
天目山檫木群体在物种水平具有较高的遗传多
样性,遗传变异主要存在于群体内.这意味着檫木作
为我国亚热带地区的广布种现在还未处于濒危状
态,仍然是天目山生物多样性的重要组成部分.SSR
分析也揭示,中海拔地区檫木的遗传多样性要高于
低海拔和高海拔地区.这表明中海拔地区的生态环
境和生物多样性均优于低海拔和高海拔地区.因此,
对檫木种质资源的收集和保护应该以天目山中海拔
地区为主,兼顾低海拔和高海拔的部分种质资源,以
避免资源的盲目收集和保护.此外,对天目山自然保
护区其他植物资源的保护和收集,也应该先了解植
物资源多样性的分布情况,对植物资源做到有的放
矢的保护和收集.
人类活动对物种的遗传结构和遗传多样性具有
重要的影响.例如,Sjölund等[42]研究发现,人类对矮
冠林的经营会影响欧洲山毛榉(Fagus sylvatica)的
遗传结构.而 Moreira 等[5]研究也发现,人为干扰影
响风铃木(Tabebuia ochracea)物种的遗传多样性.
Pop1群体处于天目山核心保护区之外.在这一地区,
具有较高经济价值的毛竹、山核桃等遍布山坡地头.
此外,天目山属于江浙地区为数不多的高山,素有
‘大树华盖闻九州’的美誉,物种丰富、景色秀美,吸
引了不少游客前来.而 Pop1地区成为农家乐的主要
集中地和游客集散地.人为干扰导致群体之间出现
环境异质,使 Pop1与 Pop2和 Pop3之间的遗传距离
4381 应  用  生  态  学  报                                      27卷
存在差异.这说明自然保护区对生物多样性起到了
良好的保护作用,而人为干扰已开始对天目山檫木
群体的遗传多样性和遗传结构产生影响.因此,在兼
顾经济利益的同时,应该加强当地人的保护意识.这
也是保护檫木和其他珍贵植物资源的一个重要
措施.
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作者简介  蒋艾平,男,1989年生,硕士研究生. 主要从事林
木遗传育种研究. E⁃mail: japsassafras@ 163.com
责任编辑  孙  菊
蒋艾平, 姜景民, 刘军. 天目山不同海拔檫木群体遗传多样性和遗传结构. 应用生态学报, 2016, 27(6): 1829-1836
Jiang A⁃P, Jiang J⁃M, Liu J. Genetic diversity and genetic structure in Sassafras tsumu populations along altitudinal gradients in Tian⁃
mushan Mountain, China. Chinese Journal of Applied Ecology, 2016, 27(6): 1829-1836 (in Chinese)
6381 应  用  生  态  学  报                                      27卷