作 者 :武泽峰
期 刊 :西北农林科技大学 2015年 01期 页码:56
关键词:Helitron;转座子;小麦;多倍体;基因捕获;
摘 要 :Helitrons是一类以滚环复制的形式行进转座的DNA转座子,并且可以捕获基因片段,对基因、基因组的进化和物种多样性具有重要意义。小麦(AABBDD)是世界上广为种植的重要粮食作物之一,拥有一个庞大的异源六倍体基因组,这为研究Helitron元件在基因组多倍体化以及基因组扩张过程中所起的作用提供了理想的素材。六倍体小麦以及其两个二倍体祖先基因组序列的公布使得计算预测这些基因组中的Helitron元件成为可能。基于局部组合变量(LCV)算法,本研究利用改进的HelitronScanner程序,分别在六倍体小麦、乌拉尔图小麦以及粗山羊草基因组中预测出38546个、36362个和32636个Hel...