免费文献传递   相关文献

加拿大披碱草45S rDNA定位



全 文 :华北农学报·2013,28 ( 1 ) : 67 -69
收稿日期:2012 - 11 - 11
基金项目:2010 年教育部科学研究重点项目(210043) ;内蒙古自治区自然基金博士基金项目(2010BS0402)
作者简介:李景环(1972 -) ,女,内蒙古赤峰人,副教授,博士,主要从事植物分子生物学的教学与科研工作和牧草育种科研工作。
通讯作者:云锦凤(1941 -) ,女,内蒙古土默特左旗人,教授,博士生导师,主要从事牧草育种的科研与教学工作。
加拿大披碱草 45S rDNA定位
李景环1,何慧敏1,云锦凤2
(1.内蒙古师范大学 生命科学与技术学院,内蒙古 呼和浩特 010022;2.内蒙古农业大学 生态环境学院,内蒙古 呼和浩特 010019)
摘要:以加拿大披碱草为材料,通过染色体原位杂交的方法,确定加拿大披碱草的 45S rDNA在染色体上的位置,
旨在为加拿大披碱草育种提供依据。结果表明,45S rDNA在加拿大披碱草的染色体上检测出 4 个位点(绿色) ,它们
分别位于第 2 对染色体短臂末端和第 5 对染色体短臂次缢痕上,即核仁组织区(NOR) ,且杂交信号强弱较一致。
关键词:加拿大披碱草;荧光原位杂交;核型分析;45S rDNA
中图分类号:Q78 文献标识码:A 文章编号:1000 - 7091(2013)01 - 0067 - 03
Karyotype Analysis and Physical Location of 45S rDNA in Elymus canadensis
LI Jing-huan1,HE Hui-min1,YUN Jin-feng2
(1. College of Life Science and Technology,Inner Mongolia Normal University,Huhhot 010022,China;
2. College of Ecology Environment,Inner Mongolia Agricultural University,Huhhot 010019,China)
Abstract:Localization of 45S rDNA on Elymus canadensis chromosome was studied by fluorescence in situ hy-
bridization(FISH)of chromosome on root tip. The results showed that four hybridization sites were detected at the
end of short arm of E. canadensis chromosome 2 and in secondary constriction(nucleolar organizing region)on chro-
mosome 5,which were the location of 45S rDNA. And the signal of hybridization were the same intensity.
Key words:E. canadensis;Chromosome karyotyping;FISH;45S rDNA
加拿大披碱草(Elymus canadensis)属禾本科
(Poaeeae)小麦族(Tritice-ae)披碱草属(Elymus) ,多
年生草本植物,集中分布于美国落基山脉以东和北
美地区,云锦凤教授 1984 年从北美洲引进,在内蒙
古农业大学牧草实验站进行引种栽培试验[1 - 4]。加
拿大披碱草具有适应性强,耐盐碱、抗旱、抗寒、抗风
沙,适口性好等优良特性[5],在草原植被恢复,控制
侵蚀和提供野生动物栖息地等方面也具有重要作
用[6],对环境胁迫和生物胁迫均具有很强的适应
性,综合性能好,是牧草遗传改良的重要资源[7 - 8]。
为了科学利用加拿大披碱草,培育牧草新品种,本研
究通过染色体原位杂交的方法检测 45S rDNA 在加
拿大披碱草染色体上的位置,以便在细胞和分子水
平上为加拿大披碱草的分类提供依据,为杂交亲本
的选择提供证据,为牧草新品种的培育奠定基础。
1 材料和方法
1. 1 材料和试验地概况
披碱草种子 2008 年采集于内蒙古农业大学牧
草试验地。试验地为沙壤质暗栗钙土,pH 值 7. 8 ~
8. 2,肥力适中,具有灌溉条件。45S rDNA 探针由南
京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室细
胞研究所赠送。
1. 2 试验方法
1. 2. 1 染色体标本的制备材料培养及处理 将加
拿大披碱草种子置于 25 ℃的培养箱内萌发,待根尖
长到 1. 5 ~ 2 cm 时,取其根尖放在盛有冰水混合物
的小离心管中,放于 4 ℃冰箱内 24 h,然后在卡诺固
定液中固定 24 h,再置于 4 ℃冰箱内备用。
染色体压片将加拿大披碱草根尖经过一定的预
处理(用冰水混合物)、固定(卡诺固定液)、软化(用
45%醋酸)、染色(用 1%醋酸洋红染液)之后,置于
载玻片中央,盖上盖玻片,用解剖针或镊子轻敲盖玻
片,直至染色体分散良好。
镜检(电子显微镜 40 倍观察) ,并选择染色体分
散良好的玻片,置于 - 20 ℃冰箱。第 2 天(约 24 h
后)冰冻揭片,之后将玻片浸在无水乙醇中脱水
20 ~ 30 min,常温晾干,备用。
68 华 北 农 学 报 28 卷
1. 2. 2 45S rDNA探针的标记 本试验中采用缺刻
平移法标记探针,即采用切口平移法标记探针。这
一方法是利用 DNA 聚合酶Ⅰ的 5→3的聚合酶活
性,5→3的外切酶活性以及 DNaseⅠ的水解活性相
结合进行的[9]。
45S rDNA 探针的标记反应体系为:灭菌双蒸
水,10 × DNA酶 Buffer,DNaseⅠ,45S rDNA,绿荧光,
dNTP,DNA 聚合酶Ⅰ,共 50 μL。在 16 ℃下反应
2 h,加 EDTA终止反应,放到 - 20 ℃冰箱,备用。
1. 2. 3 原位杂交 ①探针变性(探针由双链变为
单链) :将探针配制成杂交液:即甲酰胺 7. 5 μL、20
× SSC 1. 5 μL、鲑鱼精 DNA 0. 5 μL、45S rDNA探针
3 μL、50% DS 3 μL 等,将含有 45S rDNA 杂交液于
105 ℃下变性 13 min 后立即放到 - 20 ℃冰箱 10
min以上,备用。
②玻片上染色体变性(染色体 DNA 变成单
链) :将含有制好的加拿大披碱草根尖染色体标本
放到盛有 70%甲酰胺的脱水缸里,于 78 ℃水浴下
变性 70 s;立即用 - 20 ℃的梯度乙醇溶液脱水,即
依次是 70%乙醇、95%乙醇和 100%乙醇,将样品洗
涤脱水,每次洗涤 5 min;标本在空气中干燥 30 min
以上。
③原位杂交:将步骤①中准备好的杂交液吸取
15 μL,加到步骤②中准备好的玻片上,盖上盖玻片,
放在 37 ℃培养箱过夜(至少 6 h)。
1. 2. 4 漂洗 将杂交后的染色体制片脱去盖玻片,
在 42 ℃ 2 × SSC溶液中洗涤 2 次,每次洗涤 5 min;
之后在常温 1 × PBS溶液中洗涤 1 次,5 min,洗去未
杂交的探针DNA。最后,将玻片置于空气中自然干燥。
1. 2. 5 染色封片镜检 用 PI(碘化丙啶)染染色体
底色,用树胶封片。并在荧光显微镜下观察,选择染
色体清晰的细胞照相[10]。
2 结果与分析
从图 1,2 可知,加拿大披碱草共有 28 条染色
体,其中 4 条染色体有荧光标记(图 1,2 染色体上发
亮的记号) ;染色体参数见表 1,最长染色体的长度
为 16. 82 μm;最短染色体长度为 5. 01 μm;染色体
组的平均长度为 10. 90 μm;从染色体的臂率分析得
知,其中 m类型的染色体有 11 对,sm类型的染色体
有 3 对,其核型公式为:2n = 4x = 28 = 22m(2SAT)+
6sm;45S rDNA在加拿大披碱草的染色体上检出 4
个位点,它们分别位于第 2 对染色体短臂末端和第
5 对染色体短臂上,即核仁组织区(NOR) ,且杂交信
号强弱较一致。
图 1 加拿大披碱草 45S rDNA原位杂交图
Fig. 1 Fluorescence in situ hybridization
of 45S rDNA in E. canadensis
表 1 加拿大披碱草染色体核型参数
Tab. 1 Karyotype parameters of E. canadensis
染色体序号
No. of chromosome
绝对长度 /μm
Absolute length
相对长度 /%
Relative length
臂比
Ratio of arm
染色体类型
Type of chromosome
01 5. 68 + 11. 14 = 16. 82 11. 02 1. 96 sm
02 6. 59 + 7. 96 = 14. 55 9. 53 1. 21 m
03 5. 45 + 8. 87 = 14. 32 9. 38 1. 63 m
04 5. 01 + 8. 19 = 13. 20 8. 65 1. 63 m
05 4. 78 + 7. 73 = 12. 51 8. 20 1. 62 m
06 5. 46 + 6. 59 = 12. 08 7. 92 1. 21 m
07 5. 45 + 6. 14 = 11. 59 7. 59 1. 13 m
08 5. 00 + 6. 14 = 11. 14 7. 30 1. 23 m
09 3. 87 + 6. 14 = 10. 01 6. 56 1. 59 m
10 3. 87 + 5. 00 = 8. 87 5. 81 1. 29 m
11 2. 96 + 5. 23 = 8. 19 5. 37 1. 77 sm
12 3. 18 + 4. 09 = 7. 27 4. 76 1. 29 m
13 1. 82 + 5. 23 = 7. 05 4. 62 2. 87 sm
14 2. 05 + 2. 96 = 5. 01 3. 28 1. 44 m
1 期 李景环等: 加拿大披碱草 45S rDNA定位 69
图 2 加拿大披碱草核型图
Fig. 2 The karyotype of E. canadensis chromosome
3 结论与讨论
本研究结果表明,加拿大披碱草染色体核型公
式为 2n = 4x = 28 = 22m(2SAT)+ 6sm;45S rDNA 在
加拿大披碱草的染色体上检出 4 个位点(亮点) ,它
们分别位于第 2 对染色体短臂末端和第 5 对染色体
短臂次缢痕上。
探针标记的成败主要在于控制 DnaseⅠ的量。
DnaseⅠ活性太低则不能在 DNA 上有效地打开切
口,使荧光标记的碱基掺入不充分;DnaseⅠ活性太
高则会将 DNA 模板切碎,使其不能进行标记反应。
一般按 1:10 000 稀释 DnaseⅠ就可以得到平均长度
约为 600 bp 的探针。细胞染色体杂交常用较长的
探针以增加杂交信号。
45S rDNA在很多植物中序列保守性很强,但是
其所在染色体的位置却有所不同。
本研究通过荧光原位杂交、核型分析等技术确
定了加拿大披碱草染色体数目以及 45S rDNA 所在
的染色体位置。即 45S rDNA 在加拿大披碱草的染
色体上检出 4 个位点(亮点) ,它们分别位于第 2 对
染色体短臂末端和第 5 对染色体短臂次缢痕上,且
杂交信号强弱较一致。
本研究结果有助于在细胞水平上以及分子水平
上对加拿大披碱草进行更系统的研究,为加拿大披碱
草栽培管理、繁殖与育种提供更科学和直观的依据,
同时也为禾本科小麦族牧草的遗传育种奠定基础。
参考文献:
[1] 刘锦川,云锦凤. 加拿大披碱草研究进展[J]. 种子,
2011,(30)5:53.
[2] 李景环,云锦凤,王慈航,等. 加拿大披碱草 ×老芒麦
杂种加倍一代群体的聚类分析[J]. 华北农学报,
2010,25(2) :106 - 111.
[3] 李景环,云锦凤,吕天池,等. 加拿大披碱草与老芒麦
及其杂种后代同工酶和 RAPD 遗传分析[J]. 华北农
学报,2009,24(6) :38 - 45.
[4] 李景环,云锦凤,邵丽华,等. 加拿大披碱草和老芒麦
及其杂种 F1、F2 的 RAPD分析[J].华北农学报,2007,
22(6) :77 - 80.
[5] 许圣德,云锦凤,赵彦等.加拿大披碱草生长锥分化的
观察[J].草地学报,2011,19(2) :227 - 228.
[6] Voge K P,Hopkins A,Moore K J,et al. Genetic variation
among Canada W ildrye Acces-sions from midwest USA
remnant prairies for biomass yield and other traits[J].
Crop Sci,2006,46:2348 - 2353.
[7] Mujeeb-Kaz A,Rodriguez R J. Cytogenetics of hybrids of
Elymus canadensis × Hordeum vulgare[J]. Jan,1982,73
(1) :77 - 79.
[8] Vinton M A,Katho E S,Voge K P,et al. Endophytic fungi
in Canada wildrye in natural grasslands[J]. Range Man-
age,2001,54:390 - 395.
[9] 赵晓瑜,李继刚. 实用分子生物学技术[M]. 北京:化
学工业出版社,2006,4:93 - 94.
[10] 穆 平,乔利仙.遗传试验教程[M].北京:高等教育
出版社,2010,9:14 - 16.